• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

曽 超  Zeng Chao

研究者番号 80822460
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0002-6130-2438
所属 (現在) 2025年度: 早稲田大学, 理工学術院総合研究所(理工学研究所), 主任研究員(研究院准教授)
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2021年度 – 2025年度: 早稲田大学, 理工学術院総合研究所(理工学研究所), 次席研究員(研究院講師)
2020年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 産総研特別研究員
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分43060:システムゲノム科学関連
研究代表者以外
中区分62:応用情報学およびその関連分野 / 中区分50:腫瘍学およびその関連分野
キーワード
研究代表者
chromatin / TF / repetitive element / repeat / database / R-loop / NMD / RNA decay / lncRNA / Genetic compensation … もっと見る / RNA degradation / RNA-chromatin / 遺伝子補償応答 / genetic compensation / GCR … もっと見る
研究代表者以外
分子シミュレーション / RNA結合タンパク質 / 分子ネットワーク解析 / バイオインフォマティクス / RNA-タンパク質相互作用 / ノンコーディングRNA / RNA相互作用 / RNA / 相分離 / TP53 / ロングリード解析 / イントロン-エクソン化RNA / 大腸癌 / NEAT1 / hnRNP H1 / EXOSC4 / hnRNPK / hnRNPH1 / KeXT body / 3XT / 異常RNA / MTR4 / RNAエキソソーム複合体 / RNA品質管理機構 隠す
  • 研究課題

    (4件)
  • 研究成果

    (27件)
  • 共同研究者

    (6人)
  •  RNAを中心とした分子ネットワークに基づく生物学的相分離の俯瞰的・体系的理解

    • 研究代表者
      浜田 道昭
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2025
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分62:応用情報学およびその関連分野
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  Identification of repetitive elements involving genome regulation研究代表者

    • 研究代表者
      曽 超
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2025
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分43060:システムゲノム科学関連
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  RNA品質管理機構によるイントロン-エクソン化RNA生成と癌維持機構への関与

    • 研究代表者
      谷上 賢瑞
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2023
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 審査区分
      中区分50:腫瘍学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京大学
  •  Identification and characterization of lncRNAs involved in genetic compensation研究代表者

    • 研究代表者
      曽 超
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2022
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分43060:システムゲノム科学関連
    • 研究機関
      早稲田大学
      国立研究開発法人産業技術総合研究所

すべて 2025 2024 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Involvement of lncRNA MIR205HG in idiopathic pulmonary fibrosis and IL-33 regulation via Alu elements2025

    • 著者名/発表者名
      Takashima T, Zeng C, Murakami E, Fujiwara N, Kohara M, Nagata H, Feng Z, Sugai A, Harada Y, Ichijo R, Okuzaki D, Nojima S, Matsui T, Shintani Y, Kawai G, Hamada M, Hirose T, Nakatani K, Morii E.
    • 雑誌名

      JCI Insight .

      巻: 10 号: 5

    • DOI

      10.1172/jci.insight.187172

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K19433, KAKENHI-PROJECT-22KJ2201, KAKENHI-PROJECT-23K27391, KAKENHI-PROJECT-22K15093, KAKENHI-PROJECT-24K18055
  • [雑誌論文] The MTR4/hnRNPK complex surveils aberrant polyadenylated RNAs with multiple exons.2024

    • 著者名/発表者名
      Taniue K., Sugawara A., Zeng C., Han H., Gao X., Shimoura Y., Ozeki A, Onoguchi-Mizutani R., Seki M., Suzuki Y., Hamada M., Akimitsu N.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 15 号: 1 ページ: 8684-8684

    • DOI

      10.1038/s41467-024-51981-8

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01353, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-22K06578, KAKENHI-PROJECT-22K15093
  • [雑誌論文] Identification of a novel RNA transcript TISPL upregulated by stressors that stimulate ATF42024

    • 著者名/発表者名
      Wakabayashi Yutaro、Shimono Aika、Terauchi Yuki、Zeng Chao、Hamada Michiaki、Semba Kentaro、Watanabe Shinya、Ishikawa Kosuke
    • 雑誌名

      Gene

      巻: 917 ページ: 148464-148464

    • DOI

      10.1016/j.gene.2024.148464

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15093
  • [雑誌論文] Landscape of semi-extractable RNAs across five human cell lines2023

    • 著者名/発表者名
      Zeng Chao、Chujo Takeshi、Hirose Tetsuro、Hamada Michiaki
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 51 号: 15 ページ: 7820-7831

    • DOI

      10.1093/nar/gkad567

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15093, KAKENHI-PROJECT-20H00624, KAKENHI-PLANNED-21H05276, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-20H03187
  • [雑誌論文] Long Non-Coding RNA CRNDE Is Involved in Resistance to EGFR Tyrosine Kinase Inhibitor in EGFR-Mutant Lung Cancer via eIF4A3/MUC1/EGFR Signaling2021

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Satoshi、Noro Rintaro、Seike Masahiro、Zeng Chao、Matsumoto Masaru、Yoshikawa Akiko、Nakamichi Shinji、Sugano Teppei、Hirao Mariko、Matsuda Kuniko、Hamada Michiaki、Gemma Akihiko
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 号: 8 ページ: 4005-4005

    • DOI

      10.3390/ijms22084005

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784, KAKENHI-PROJECT-16H05879, KAKENHI-PROJECT-17K20032, KAKENHI-PROJECT-20K17200, KAKENHI-PROJECT-17KK0177
  • [雑誌論文] Impact of human gene annotations on RNA-seq differential expression analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Hamaguchi Yu、Zeng Chao、Hamada Michiaki
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 22 号: 1 ページ: 730-730

    • DOI

      10.1186/s12864-021-08038-7

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H05879, KAKENHI-PROJECT-17K20032, KAKENHI-PROJECT-20K15784, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] Binding patterns of RNA-binding proteins to repeat-derived RNA sequences reveal putative functional RNA elements2021

    • 著者名/発表者名
      Onoguchi Masahiro、Zeng Chao、Matsumaru Ayako、Hamada Michiaki
    • 雑誌名

      NAR Genomics and Bioinformatics

      巻: 3 号: 3

    • DOI

      10.1093/nargab/lqab055

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H05879, KAKENHI-PROJECT-21K06133, KAKENHI-PROJECT-17K20032, KAKENHI-PROJECT-20K15784, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] Association analysis of repetitive elements and R-loop formation across species2021

    • 著者名/発表者名
      Zeng Chao、Onoguchi Masahiro、Hamada Michiaki
    • 雑誌名

      Mobile DNA

      巻: 12 号: 1 ページ: 3-3

    • DOI

      10.1186/s13100-021-00231-5

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-16H05879, KAKENHI-PROJECT-17K20032
  • [雑誌論文] Detection and Characterization of Ribosome-Associated Long Noncoding RNAs2020

    • 著者名/発表者名
      Zeng Chao、Hamada Michiaki
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2254 ページ: 179-194

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1158-6_11

    • ISBN
      9781071611579, 9781071611586
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784, KAKENHI-PROJECT-16H05879, KAKENHI-PROJECT-17K20032
  • [雑誌論文] RNA-Seq Analysis Reveals Localization-Associated Alternative Splicing across 13 Cell Lines2020

    • 著者名/発表者名
      Zeng Chao、Hamada Michiaki
    • 雑誌名

      Genes

      巻: 11 号: 7 ページ: 820-820

    • DOI

      10.3390/genes11070820

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [学会発表] Comprehensive Database for RNA-Targeting Drug Discovery2024

    • 著者名/発表者名
      Chao Zeng, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      第25回日本RNA学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15093
  • [学会発表] Identify the effect of R-loop on transcriptional regulatory mechanisms2024

    • 著者名/発表者名
      Ryotaro Yanoshita , Eito Ichihashi, Mai Kubota, Chao Zeng, Michiaki Hamada, Masayuki Sakurai
    • 学会等名
      第25回日本RNA学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15093
  • [学会発表] RNA標的創薬のための統合データベース2024

    • 著者名/発表者名
      Chao Zeng
    • 学会等名
      NGS EXPO
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15093
  • [学会発表] 小胞体ストレスに応答する新規lncRNA TISPLの転写メカニズムおよび機能の解明2023

    • 著者名/発表者名
      若林佑太郎, 下野愛夏, 石川公輔, 曽超, 浜田道昭, 渡辺慎哉, 仙波憲太郎
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15093
  • [学会発表] Landscape of semi-extractable RNAs across five human cell lines2023

    • 著者名/発表者名
      Chao Zeng, Takeshi Chujo, Tetsuro Hirose, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      第24回日本RNA学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15093
  • [学会発表] 血清飢餓ストレスによって誘導される新規難溶性architectural RNA SISTの解析2023

    • 著者名/発表者名
      金子修士, 藤原奈央子, 曽超, 浜田道昭, 廣瀬哲郎, 中條岳志
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15093
  • [学会発表] Integrated database for RNA-targeting drug discovery2023

    • 著者名/発表者名
      Chao Zeng, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Asia Conference: The Now and Future of RNA Therapeutics
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15093
  • [学会発表] Identify the effect of R-loop on transcriptional regulatory mechanisms2022

    • 著者名/発表者名
      Eito Ichihashi, Mai Kubota, Chao Zeng, Michiaki Hamada, Kazuko Nisikura, Yusuke Siromoto, Masayuki Sakurai
    • 学会等名
      第23回日本RNA学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15093
  • [学会発表] De novo assembly and characterization of semi-extractable RNAs2022

    • 著者名/発表者名
      Chao Zeng, Takeshi Chujo, Tetsuro Hirose, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      第23回日本RNA学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784
  • [学会発表] Searching for Repeat-derived Functional Elements in RNAs2021

    • 著者名/発表者名
      Chao Zeng, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      第22回日本RNA学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784
  • [学会発表] リピート配列由来の機能エレメントの探索2021

    • 著者名/発表者名
      曽 超、浜田 道昭
    • 学会等名
      第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784
  • [学会発表] Binding patterns of RNA binding proteins to repeat-derived RNA sequences reveal putative functional RNA elements2021

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Onoguchi, Chao Zeng, Yukiteru Ono, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      Noncoding RNAs: Biology and Applications (Keystone Symposia)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784
  • [学会発表] 転写因子結合部位として働く反復配列の発見とその機能の解明2021

    • 著者名/発表者名
      Ryo Niwa, Chao Zeng and Michiaki Hamada
    • 学会等名
      第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784
  • [学会発表] Binding Patterns of RNA Binding Proteins To Repeat-Derived RNA Sequences Reveal Putative Functional RNA Elements2021

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Onoguchi, Chao Zeng, Yukiteru Ono, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      第22回日本RNA学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784
  • [学会発表] ヒト遺伝子アノテーションがRNA-seq解析に与える影響の評価2021

    • 著者名/発表者名
      Yu Hamaguchi, Chao Zeng and Michiaki Hamada
    • 学会等名
      第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784
  • [学会発表] Sequence characterization of R-loop-forming RNAs in mammals2020

    • 著者名/発表者名
      Chao Zeng, Masahiro Onoguchi, Risa Maemura, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      Transposable Elements
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784
  • [学会発表] Bioinformatic approaches for understanding RNA reincarnation2020

    • 著者名/発表者名
      Chao Zeng, Masahiro Onoguchi, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15784
  • 1.  谷上 賢瑞 (90648627)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 2.  浜田 道昭 (00596538)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 3.  小野口 真広 (30645297)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  栗崎 以久男 (50583340)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  森井 英一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 6.  水谷 玲菜
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

URL: 

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi