深谷肇一 Fukaya Keiichi

研究者番号	30708798
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 主任研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2024年度: 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 主任研究員 2020年度: 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物・生態系環境研究センター, 特別研究員 2017年度: 統計数理研究所, データ科学研究系, 特別研究員(PD) 2015年度 – 2017年度: 統計数理研究所, データ科学研究系, 外来研究員(JSPS特別研究員) 2015年度: 統計数理研究所, データ科学研究系, 日本学術振興会特別研究員
審査区分/研究分野	研究代表者小区分39060:生物資源保全学関連 / 合同審査対象区分:小区分39060:生物資源保全学関連、小区分39070:ランドスケープ科学関連 / 小区分39070:ランドスケープ科学関連 / 生態・環境 / 生態・環境研究代表者以外生態・環境 / 小区分45040:生態学および環境学関連
キーワード	研究代表者群集動態 / サイト占有モデル / 環境DNAメタバーコーディング / 観測誤差 / 空間構造 / 統計モデリング / 岩礁潮間帯 / 遺伝的多様性 / 階層モデル / 推移確率 … もっと見る / 空間平滑化 / 多状態動的サイト占有モデル / 魚類群集 / 調査設計 … もっと見る研究代表者以外長期変動 / 生態系 / 安定性 / 岩礁潮間帯 / 群集動態 / 生物地理学 / 生物多様性情報学 / 生物多様性 / マクロ生態学 / 生物多様性の緯度勾配 / ガンマ多様性 / 群集生態学 / 生物多様性の標高勾配 / 生物多様性の経度勾配 / アルファ多様性 / ベータ多様性 / 古生態学 / 植物生態学 / 植物多様性 / 個体群統計 / 推移行列モデル / ビッグデータ / 植物 / 生態学隠す

検出誤差に対して頑健な環境DNAメタバーコーディングの進展研究代表者
- 研究代表者
  
  深谷肇一
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分39060:生物資源保全学関連
   小区分39070:ランドスケープ科学関連
   合同審査対象区分:小区分39060:生物資源保全学関連、小区分39070:ランドスケープ科学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人国立環境研究所
人新世における生態系変化とその予測可能性の評価：岩礁潮間帯での25年実証研究
- 研究代表者
  
  野田隆史
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分45040:生態学および環境学関連
- 研究機関
  北海道大学
環境DNA分析による検出誤差を踏まえた種多様性評価手法の開発と検証研究代表者
- 研究代表者
  
  深谷肇一
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分39060:生物資源保全学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人国立環境研究所
野外群集動態を定量する新規な統計的手法の開発とその適用による多様性維持機構の検証研究代表者
- 研究代表者
  
  深谷肇一
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  特別研究員奨励費
- 研究分野
  
  生態・環境
- 研究機関
  統計数理研究所
野外群集動態を定量する新規な統計的手法の開発とその適用による多様性維持機構の検証研究代表者
- 研究代表者
  
  深谷肇一
- 研究期間 (年度)
  2015
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生態・環境
- 研究機関
  統計数理研究所
生活史行列ビッグデータを用いた植物個体群の比較統計解析
- 研究代表者
  
  高田壮則
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生態・環境
- 研究機関
  北海道大学
東アジア島嶼の植物多様性の起源と維持：群集形成プロセスの階層的作用機構を探る
- 研究代表者
  
  久保田康裕
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生態・環境
- 研究機関
  琉球大学

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すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] サンプリングって何だろう : 統計を使って全体を知る方法2018
- 著者名/発表者名
  深谷肇一、稲垣佑典、廣瀬雅代
- 総ページ数
  128
- 出版者
  岩波書店
- ISBN
  400029671X
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04418
[図書] サンプリングってなんだろうー統計を使って全体を知る方法2018
- 著者名/発表者名
  廣瀬雅代・稲垣佑典・深谷肇一
- 総ページ数
  128
- 出版者
  岩波書店
- ISBN
  9784000296717
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16J07614
[図書] BUGSで学ぶ階層モデリング入門―個体群のベイズ解析―2016
- 著者名/発表者名
  Marc Kery, Michael Schaub著　飯島勇人，伊東宏樹，深谷肇一，正木隆訳
- 総ページ数
  660
- 出版者
  共立出版
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K18617
[雑誌論文] マクロ生物調査のための環境DNA分析―種の検出と定量およびその他の応用における可能性と課題―2022
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 雑誌名
  
  全国環境研会誌
  
  巻: 47 ページ: 159-165
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[雑誌論文] Multispecies site occupancy modelling and study design for spatially replicated environmental DNA metabarcoding2022
- 著者名/発表者名
  K. Fukaya, N. I. Kondo, S. S. Matsuzaki, T. Kadoya
- 雑誌名
  
  Methods in Ecology and Evolution
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 183-193
- DOI
  10.1111/2041-210x.13732
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102, KAKENHI-PROJECT-20H03010
[雑誌論文] The influence of time since introduction on the population growth of introduced species and the consequences for management2017
- 著者名/発表者名
  Yokomizo Hiroyuki、Takada Takenori、Fukaya Keiichi、Lambrinos John G.
- 雑誌名
  
  Population Ecology
  
  巻: 59 号: 2 ページ: 89-97
- DOI
  10.1007/s10144-017-0581-6
- NAID
  40021252170
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04418
[雑誌論文] Seasonal changes in community structure along a vertical gradient: pattern and processes in rocky intertidal sessile assemblages2017
- 著者名/発表者名
  Y. Kanamori, K. Fukaya and T. Noda
- 雑誌名
  
  Population Ecology
  
  巻: 59 号: 4 ページ: 301-313
- DOI
  10.1007/s10144-017-0596-z
- NAID
  40021399155
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16J07614, KAKENHI-PROJECT-15K07208
[雑誌論文] The influence of time since introduction on the population growth of introduced species and the consequences for management.2017
- 著者名/発表者名
  Yokomizo H., Takada T., Fukaya K., Lambrinos J.
- 雑誌名
  
  Population Ecology
  
  巻: 印刷中
- NAID
  40021252170
- 査読あり / 謝辞記載あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04418
[雑誌論文] A multistate dynamic site occupancy model for spatially aggregated sessile communities.2017
- 著者名/発表者名
  Fukaya, K., Royle, J.A., Okuda, T., Nakaoka, M. and Noda, T.
- 雑誌名
  
  Methods in Ecology and Evolution
  
  巻: 印刷中号: 6 ページ: 757-767
- DOI
  10.1111/2041-210x.12690
- NAID
  120006470973
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K07208, KAKENHI-PROJECT-16J07614
[雑誌論文] 状態空間モデルによる時系列解析とその生態学への応用2016
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 雑誌名
  
  日本生態学会誌
  
  巻: 66 号: 2 ページ: 375-389
- DOI
  10.18960/seitai.66.2_375
- NAID
  130005406178
- ISSN
  0021-5007, 2424-127X
- 言語
  日本語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16J07614
[雑誌論文] 動的サイト占有モデルー状態の不確実性を考慮したサイト占有動態の統計的推測2016
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 雑誌名
  
  統計数理
  
  巻: 64 ページ: 3-22
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16J07614
[雑誌論文] 動的サイト占有モデルー状態の不確実性を考慮したサイト占有動態の統計的推測2016
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 雑誌名
  
  統計数理
  
  巻: 64 ページ: 3-22
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04418
[学会発表] 岩礁潮間帯２種系における種間相互作用の環境依存性2024
- 著者名/発表者名
  姚遠，深谷肇一，野田隆史
- 学会等名
  日本生態学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K27237
[学会発表] Towards even more efficient biodiversity monitoring through eDNA metabarcoding: an approach based on site occupancy modeling2024
- 著者名/発表者名
  K. Fukaya, N. I. Kondo, S. S. Matsuzaki, T. Kadoya
- 学会等名
  ISM Symposium on Environmental Statistics 2024
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K26933
[学会発表] 環境DNAメタバーコーディングデータの統計解析のためのRパッケージの開発と適用2024
- 著者名/発表者名
  深谷肇一, 長谷部勇太
- 学会等名
  第71回日本生態学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K26933
[学会発表] Site occupancy modeling for environmental DNA metabarcoding2023
- 著者名/発表者名
  K. Fukaya
- 学会等名
  Quantitative Ecological Modeling for Biodiversity, Conservation, and Management
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K26933
[学会発表] occumb：多種サイト占有モデルを用いた環境DNAメタバーコーディングデータ解析のためのRパッケージ2023
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  第6回環境DNA学会九州大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K26933
[学会発表] 生物多様性観測：蓄積されたデータの活用と観測手法の発展2023
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  GBIFワークショップ21世紀の生物多様性研究（通算第18回）「今、必要とされている生物多様性観測」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K26933
[学会発表] 状態空間モデリング：個体群モニタリングにおける方法と話題2023
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  第39回個体群生態学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K26933
[学会発表] Environmental DNA metabarcoding of benthic invertebrates in riverine environments: a model-based assessment of species detectability for optimized study design2023
- 著者名/発表者名
  K. Fukaya, Y. Hasebe
- 学会等名
  The eDNA Society International Meeting 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K26933
[学会発表] 環境DNA分析による生態系評価の高度化：統計モデリングによるアプローチ2022
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  統計数理研究所共同利用研究集会「生物統計と数理生物：似ているようで異なる生物へのアプローチ」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] 環境DNAメタバーコーディングによる種多様性評価のモデル化：不完全な検出を考慮した統計推測と調査デザイン2022
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  統計数理研究所共同利用研究集会「諸科学における統計思考」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] A hierarchical modeling approach for environmental DNA metabarcoding: inference of species detection process, site occupancy, and study design2022
- 著者名/発表者名
  K. Fukaya, N. I. Kondo, S. S. Matsuzaki and T. Kadoya.
- 学会等名
  International Statistical Ecology Conference (ISEC) 2022
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] 多種サイト占有モデルを用いた環境DNA分析における調査デザインの最適化2022
- 著者名/発表者名
  松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 沖津二朗, 稲川崇史, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文
- 学会等名
  第69回日本生態学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] 生態学的ビッグデータと統計モデリングによる生物多様性評価の高度化2022
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  第69回日本生態学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] 環境DNAによる生物多様性評価のための階層モデルとベイズ決定分析2021
- 著者名/発表者名
  深谷肇一, 今藤夏子, 松崎慎一郎, 角谷拓
- 学会等名
  予測モデリングの理論と応用. 科学研究費シンポジウム（基盤研究（A）20H00576）「大規模複雑データの理論と方法論の革新的展開」
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] 階層モデリングをデータ解析と調査設計に活用する2021
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  第68回日本生態学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] 生態学における観測・推測・予測と統計モデリング2021
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  第68回日本生態学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] 環境DNAメタバーコーディングにおける種検出誤差を考慮した階層モデリングとその実践2021
- 著者名/発表者名
  深谷肇一, 今藤夏子, 松崎慎一郎, 角谷拓
- 学会等名
  環境DNA学会第4回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] ダム湖の魚類調査における環境DNAメタバーコーディング分析の実装に向けて2021
- 著者名/発表者名
  松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 沖津二朗, 稲川崇史, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文
- 学会等名
  環境DNA学会第4回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] ダム湖において環境DNAメタバーコーディング手法を用いる際の最適採水地点数の検討2021
- 著者名/発表者名
  松本岳大, 深谷肇一, 坂田雅之, 稲川崇史, 沖津二朗, 平岡康介, 一柳英隆, 源利文
- 学会等名
  第68回日本生態学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] 生物多様性の理解におけるプレストン不備の解決に向けて2020
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  環境DNA学会第3回大会第36回個体群生態学会大会合同大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06102
[学会発表] Flow matrices describing inter-stage flows of individuals: Application to comparative demographic analysis of introduced and native plant populations.2018
- 著者名/発表者名
  H. Yokomizo, T. Takada, K. Fukaya, J. Lambrinos
- 学会等名
  5-th Annual meeting of Evolutionary Demography Society
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04418
[学会発表] 個体の流れと弾性度に着目した在来種と外来種の比較2018
- 著者名/発表者名
  横溝裕行,高田壮則, 深谷肇一, John G. Lambrino
- 学会等名
  第65回日本生態学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04418
[学会発表] Inference of community dynamics using a spatial hierarchical model: accounting for misclassification errors and local interactions2017
- 著者名/発表者名
  K. Fukaya
- 学会等名
  Mini-Symposium: Future of Statistical Fisheries Science and Ecology
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16J07614
[学会発表] 空間相関と観測誤差を考慮した固着性生物群集のための多状態動的サイト占有モデル2017
- 著者名/発表者名
  深谷肇一, J. A. Royle, 奥田武弘, 仲岡雅裕, 野田隆史
- 学会等名
  第64回日本生態学会大会
- 発表場所
  早稲田大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16J07614
[学会発表] Accounting for misclassification errors in the estimation of transition probabilities: a spatial multistate dynamic site occupancy model2016
- 著者名/発表者名
  K. Fukaya, J. A. Royle, T. Okuda, M. Nakaoka, T. Noda
- 学会等名
  ANU-UC-ISM Joint Symposium on Environmental Statistics 2016
- 発表場所
  キャンベラ大学
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16J07614
[学会発表] 生態学における階層モデル：その概念と利点2016
- 著者名/発表者名
  深谷肇一，飯島勇人，伊東宏樹，正木隆
- 学会等名
  第63回日本生態学会仙台大会
- 発表場所
  仙台国際センター
- 年月日
  2016-03-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K18617
[学会発表] A multistate dynamic occupancy model for spatially aggregated sessile communities2016
- 著者名/発表者名
  K. Fukaya, J. A. Royle, T. Okuda, M. Nakaoka, T. Noda
- 学会等名
  International Conference of Statistical Ecology (ISEC) 2016
- 発表場所
  ワシントン大学
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16J07614
[学会発表] Testing the influence of time since introduction on population growth and optimal management.2016
- 著者名/発表者名
  Yokomizo H., Takada T., Fukaya K., Lambrinos J.
- 学会等名
  4-th Annual meeting of Evolutionary Demography Society.
- 発表場所
  Charlottesville(USA)
- 年月日
  2016-10-04
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04418
[学会発表] 状態空間モデルによる時系列解析とその生態学への応用2015
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  JaLTER公開シンポジウム2015 生物・生態系情報の統合と時系列データの解析～生物や生態系の変化を読み解く～
- 発表場所
  国立環境研究所大山記念ホール
- 年月日
  2015-09-15
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K18617
[学会発表] 生態学における状態空間モデルの応用2015
- 著者名/発表者名
  深谷肇一
- 学会等名
  感察工学研究会・パーティクルフィルタ研究会合同合宿研究会
- 発表場所
  休暇村讃岐五色台
- 年月日
  2015-09-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K18617

1. 今藤夏子 (10414369)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 5件
2. 角谷拓 (40451843)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 5件
3. 高田壮則 (80206755)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
4. 久保田康裕 (50295234)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 横溝裕行 (30550074)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
6. 大原雅 (90194274)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 金子有子 (90280817)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 楠本聞太郎 (90748104)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 鈴木健大 (00748999)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 松崎慎一郎 (40548773)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
11. 辻冴月 (80867656)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 野田隆史 (90240639)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
13. 岩崎藍子 (00826076)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 和田葉子 (00865420)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 山田勝雅 (80569195)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 仲岡雅裕 (90260520)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

深谷 肇一 Fukaya Keiichi

研究課題

研究成果

共同研究者

検出誤差に対して頑健な環境DNAメタバーコーディングの進展研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

人新世における生態系変化とその予測可能性の評価：岩礁潮間帯での25年実証研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

環境DNA分析による検出誤差を踏まえた種多様性評価手法の開発と検証研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

野外群集動態を定量する新規な統計的手法の開発とその適用による多様性維持機構の検証研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

野外群集動態を定量する新規な統計的手法の開発とその適用による多様性維持機構の検証研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

生活史行列ビッグデータを用いた植物個体群の比較統計解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

東アジア島嶼の植物多様性の起源と維持：群集形成プロセスの階層的作用機構を探る

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] サンプリングって何だろう : 統計を使って全体を知る方法2018

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] サンプリングってなんだ ろうー統計を使って全体を知る方法2018

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] BUGSで学ぶ階層モデリング入門―個体群のベイズ解析―2016

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] マクロ生物調査のための環境DNA分析―種の検出と定量およびその他の応用における可能性と課題―2022

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Multispecies site occupancy modelling and study design for spatially replicated environmental DNA metabarcoding2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] The influence of time since introduction on the population growth of introduced species and the consequences for management2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Seasonal changes in community structure along a vertical gradient: pattern and processes in rocky intertidal sessile assemblages2017

著者名/発表者名

深谷肇一 Fukaya Keiichi

[図書] サンプリングってなんだろうー統計を使って全体を知る方法2018