清水透 SHIMIZU Toru

研究者番号	40118956
外部サイト
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2001年度 – 2009年度: 東北大学, 多元物質科学研究所, 教授 1995年度 – 2000年度: 東北大学, 反応化学研究所, 教授 1999年度: 東北大学, 反応科学研究所, 教授 1991年度 – 1992年度: 東北大学, 非水研, 助教授 1991年度: 東北大学, 反応化学研究所, 助教授 1989年度 – 1990年度: 東北大学, 非水溶液化学研究所, 助教授 1985年度: 東北大学, 非水研, 助手
審査区分/研究分野	研究代表者環境保全 / 環境影響評価(含放射線生物学) / 機能生物化学 / 放射線・化学物質影響科学研究代表者以外生物物理学 / 広領域
キーワード	研究代表者一酸化窒素 / 遺伝子工学 / シグナル伝達 / ヘム / 環境汚染物質 / P450 / アルギニン / シトクロム / 電子移動 / 酸素活性化 … もっと見る / Signal transduction / Sensor enzyme / cAMP / センサー酵素 / 分子スイッチ / シトクロムP450 / 薬物代謝 / 環境ホルモン / チトクロムP450 / Heme / Cytochrome / 遺伝子操作 / 赤血球 / 環境汚染 / 転写因子 / NO / 蛋白合成 / ヘム酵素 / 一酸化窒素合成酵素 / プテリン / 自動酸化速度 / ダイナミックス / 部位特異的変異 / Transcription factor / Circadian rhythms / Environmental pollutants / NO synthase / synthesis / Protein translation / ポルフィリン / キナーゼ / 軸配位子 / 蛋白翻訳・合成 / センサー / 生物時計 / NO合成酵素 / 蛋白質翻訳・合成 / redox states / Protein-protein interaction / Protein microarray / Heme sensor / Molecular switch / キメラ / シグナル / 蛋白-蛋白相互作用 / 酸化還元状態 / タンパク-タンパク相互作用 / プロテイン・マイクロアレイ / ヘムセンサー / MOLECULAR SWITCH / AZO COMPOUNDS / ELECTRON TRANSFER / MUTATIONS / CYTOCHROME P450 / DEHALOGENATIONS / HEME ENZYMES / HALOETHANES / アゾ色素 / NADPH-シトクロムP450還元酵素 / トリクロロエチレン / 環境汚染化学物質 / 重子移動 / 脱ハロゲン化 / ハロエタン / 窒素ラジカル / アゾ化合物 / Mooxygenase / Site-directed Mutagenesis / p450 / Dynamics / Nitric Oxide / フラッシュ・ホトリシス / ダイナミクス / 蛋白質工学 / シトクローム / Halogenated Compounds / Bioreactor / Bioremediation / Environment / Recombinant DNA / バイオレメディエーション / バイオリアクター / ハロゲン化合物 / CD / NMR / カルモデュリン / プロテインマイクロアレイ / PASドメイン / NOガス / 水銀イオン / DNA結合 / 体内時計 / 蛋白質合成 / ガスセンサー / ヘム制御酵素・蛋白質 / 水銀 / ヘム鉄 / 時計遺伝子 / NO,ヘム / フラッシュホトリシス / ヘムとCOとの結合 / キラル識別 / シトクロムP450とNOとの反応 / NOの合成と反応 … もっと見る研究代表者以外機能・構造相関 / X線結晶解析 / チトクロムPー450 / Conformational change / X-ray crystal structure analysis / Motional fluctuation of the amino acid side chains / Stabilization of helices / Electron transfer in proteins / Structure-function relationship of enzyme / Membrane-bound protein / Cytochrome P450 / タンパク質間相互作用 / 遺伝子組換え / 基質受容性変化 / 電子伝達系 / 哺乳類チトクロムPー450 / コンホメ-ション変化 / アミノ酸残基のゆらぎ / ヘリックス安定化 / タンパク質間電子移動 / 酵素の機能・構造相関 / 膜結合性タンパク質 / Recombinant DNA / Amino acid substitutions / Heme-protein / Fuction-structure relationship / Computer graphics / Site-directed mutagenesis / X-ray crystallography / Cytochrome P-450 / 組換えDNA / アミノ酸置換 / ヘムタンパク質 / コンピュ-タグラフィクス / 点変異 / イメージング / 近視野原子間力顕微鏡 / 共焦点レーザー顕微鏡 / 細胞情報変換 / 時間分解分光計測 / チトクロ-ム Pー450 / 光応答 / 薬物代謝応答 / ホルモン合成 / 電子スイッチング / 機能性人工細胞 / レセプター / Ca / タンパク質運動 / 顕微動画計測 / ロドプシン / チトクロムP-450 / 時間分解計測 / 人工細胞 / 遺伝子発現 / ミクロソーム / ミトコンドリア / 細胞内局在性 / 分子多様性 / 薬物の酸化的代謝 / 脂溶性生理活性物質 / ヘム蛋白質隠す

環境汚染物質による体内時計の破壊:ヘム-NO-蛋白質合成-時計遺伝子のクロストーク研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2009
- 研究種目
  
  基盤研究(S)
- 研究分野
  
  放射線・化学物質影響科学
- 研究機関
  東北大学
環境汚染物質によるポルフィリン症の解析・ヘム合成と蛋白質合成の協奏とテンポ研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  2002 – 2004
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  環境影響評価(含放射線生物学)
- 研究機関
  東北大学
触媒反応を光スイッチや分子スイッチで制御できる環境修復酵素の構築研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  2001 – 2004
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  環境保全
- 研究機関
  東北大学
部位特異的変異法によるNO合成酵素の電子移動機構と酸素分子活性化機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  1999
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 研究機関
  東北大学
部位特異的変異法によるNO合成酵素の電子移動機構と酸素分子活性化機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  1998
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 研究機関
  東北大学
部位特異的変異法によるNO合成酵素の電子移動機構と酸素分子活性化機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  1997
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  東北大学
人工変異により高度に活性化されたP450導入酵母による毒物特異的分子変換システム研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  1997 – 2000
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  環境保全
- 研究機関
  東北大学
部位特異的変異法によるNO合成酵素の電子移動機構と酸素分子活性化機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  1996
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  東北大学
分子可視化解析:受信から送信への細胞情報フロー
- 研究代表者
  
  川戸佳
- 研究期間 (年度)
  1995
- 研究種目
  
  総合研究(B)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  東京大学
遺伝子組換えP450導入酵母によるハロゲン化合物分子変換システムの開発と性能評価研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  1995 – 1996
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  環境保全
- 研究機関
  東北大学
分子設計されたNO合成酵素の機能発現及び生体内NOのダイナミックス研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  1995 – 1996
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  機能生物化学
- 研究機関
  東北大学
機能性人工細胞の設計・製作と時間分解計測による解析
- 研究代表者
  
  川戸佳
- 研究期間 (年度)
  1992
- 研究種目
  
  総合研究(A)
- 研究分野
  
  広領域
- 研究機関
  東京大学
哺乳類チトクロムPー450の電子伝達に伴うコンホメ-ションと基質受容性の変化の研究
- 研究代表者
  
  籏野昌弘 (旗野昌弘)
- 研究期間 (年度)
  1990 – 1991
- 研究種目
  
  国際学術研究
- 研究機関
  東北大学
チトクロームPー450の分子生物学:発現の分子機構
- 研究代表者
  
  藤井義明
- 研究期間 (年度)
  1989
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  東北大学
哺乳類チトクロムPー450変異種、野生種のX線結晶解析,コンピュ-タグラフィクス
- 研究代表者
  
  旗野昌弘, 籏野昌弘
- 研究期間 (年度)
  1989
- 研究種目
  
  国際学術研究
- 研究機関
  東北大学
カルモデュリンによるオピオイドペプチドの分子認識研究代表者
- 研究代表者
  
  清水透
- 研究期間 (年度)
  1985
- 研究種目
  
  特定研究
- 研究機関
  東北大学

すべて 2010 2009 2008 2007 2006 2005

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] 他のヘムーチオレートタンパク質の構造と機能2009
- 著者名/発表者名
  五十嵐城太郎, 清水透 (分担執筆)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Thiolate with alpha-lipoic acid remediates depressive behavior of mice induced by methyl-mercury2010
- 著者名/発表者名
  K. Kitanishi, J. Igarashi, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  Current Topic in Toxicology (in press)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Thiolate with α-lipoic acid remedies depressive behavior of mice2010
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  Current Topics in Toxicology (印刷中)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] The FG loop of a heme-based gas sensor enzyme, Ec DOS, functions in heme binding, autoxidation and catalysis2009
- 著者名/発表者名
  S. Ito, J. Igarashi, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  J.Inorg.Biochem. 103
  
  ページ: 1380-1385
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] The FG loop of a heme-based gas sensor enzyme, Ec DOS, functions2009
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  J.Inorg.Biochem. 103
  
  ページ: 1380-1385
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Role of Phe113 at the distal side of the heme domain of an oxygen-sensor (Ec DOS) in the characterization of the heme environment2009
- 著者名/発表者名
  S. Ito, Y. Araki, A. Tanaka, J. Igarashi, T. Wada, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  J.Inorg.Biochem. 103
  
  ページ: 989-996
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Role of Phe113 at the distal side of heme domain of an oxygen-sensor2009
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  J.Inorg.Biochem 103
  
  ページ: 989-996
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文]2009
- 著者名/発表者名
  清水透(分担執筆)
- 雑誌名
  
  P450の分子生物学第2版(講談社)
  
  ページ: 77-83
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Ligand binding to the Fe(III)-protoporphyrin IX complex of pho snhodiesterase from Escherichia coli (Ec DOS) markedly2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  Biochemistry 47
  
  ページ: 13438-13446
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Arg97 at the heme distal side of the isolated heme-bound PAS domain of a heme-based oxygen sensor from Escherichia coli (Ec DOS) plays critical roles in auto-oxidation and binding to gases, particularly O_22008
- 著者名/発表者名
  Y. Ishitsuka, Y. Araki, A. Tanaka, J. Igarashi, O. Ito, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  Biochemistry 47
  
  ページ: 8874-8884
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Elucidation of the heme-binding site of heme-regulated eIF2alpha kinase (HRI) and the role of the regulatory motif in heme sensing by spectroscopic and catalytic studies of mutant proteins2008
- 著者名/発表者名
  J. Igarashi, M. Murase, A. Iizuka, F. Pichierri, M. Martinkova, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  J.Biol.Chem. 283
  
  ページ: 18782-18791
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Heme binding characteristics of the isolated PAS-A domain of mouse Per2, a transcriptional regulatory factor associated with circadian rhythms2008
- 著者名/発表者名
  K. Kitanishi, J. Igarashi, K. Hayasaka, N. Hikage, I. Saiful, S. Yamauchi, T. Uchida, K. Ishimori, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  Biochemistry 47
  
  ページ: 6157-6168
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Roles of Arg97 and Phel13 in regulation of distal ligand binding to heme in the sensor domain of Ec DOS protein2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  J. Biol. Chem 283
  
  ページ: 19200-19210
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Resonance Raman investigation of redox-induced structural changes of protein and heme in the sensor domain of Ec DOS2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  J. Raman Spectrosc. 39
  
  ページ: 1614-1626
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Resonance Raman investigation of redox-induced structural changes of protein and heme in the sensor domain of Ec DOS protein2008
- 著者名/発表者名
  S. F. El-Mashtoly, H. Takahashi, H. Kurokawa, A. Sato, T. Shimizu, T. Kitagawa
- 雑誌名
  
  J.Raman Spectrosc. 39
  
  ページ: 1614-1626
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Ligand binding to the Fe(III)-protoporphyrin IX complex of phosphodiesterase from Escherichia coli (Ec DOS) markedly enhances catalysis of cyclic di-GMP : Roles of Met95, Arg97, and Phe113 of the putative heme distal side in catalytic regulation and ligand binding2008
- 著者名/発表者名
  A. Tanaka, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  Biochemistry 47
  
  ページ: 13438-13446
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Arg97 at the heme distal side of the isolated heme-bound PAS domain of a heme-based oxygen sensor from Escherichia coli2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  Biochemistry 47
  
  ページ: 8874-8884
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Elucidation of the heme-binding site of heme-regulated eIF2 a kinase (HRII and the role of the regulatory motif in heme2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  J. Biol. Chem 283
  
  ページ: 18782-18791
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Roles of Arg97 and Phe113 in regulation of distal ligand binding to heme in the sensor domain of Ec DOS protein : resonance Raman and mutation study2008
- 著者名/発表者名
  S. F. El-Mashtoly, S. Nakashima, A. Tanaka, T. Shimizu, T. Kitagawa
- 雑誌名
  
  J.Biol.Chem. 283
  
  ページ: 19200-19010
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Thermodynamic analysis of l-arginine and Nω-hydroxy-1-arginine binding to nitric oxide synthase2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  Biochim. Biophys. Acta 1745
  
  ページ: 806-810
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Heme binding characteristics of the isolated PAS-A domain of mouse Per2, a transcriptional regulatory factor associated with2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  Biochemistry 47
  
  ページ: 6157-6168
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] The roles of thiolate-heme proteins, other than the P450 cytochromes, in the regulation of heme-sensor proteins2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  Acta Chim. Slov 55
  
  ページ: 67-74
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Reactive complexes in myoglobin and nitric oxide synthase2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 雑誌名
  
  Inorg. Chim. Acta 361
  
  ページ: 831-843
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] The roles of thiolate-heme proteins, other than the P450 cytochromes, in the regulation of heme-sensor proteins2008
- 著者名/発表者名
  J. Igarashi, K. Kitanishi, M. Martinkova, M. Murase, A. Iizuka, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  Acta Chim.Slov. 55
  
  ページ: 67-74
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Ultraviolet Resonance Raman Evidence for Utilization of the Heme 6-Propionate Hydrogen-Bond Network of the Ec DOS Protein2007
- 著者名/発表者名
  清水透, 他
- 雑誌名
  
  Journal of American Chemical Society 129・12
  
  ページ: 3556-3563
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Ultraviolet resonance Raman evidence for utilization of the heme 6-propionate hydrogen-bond network in signal transmission from heme to protein in EcDOS protein2007
- 著者名/発表者名
  S. F. El-Mashtoly, H. Takahashi, T. Shimizu, T. Kitagawa
- 雑誌名
  
  J.Am.Chem.Soc. 129
  
  ページ: 3556-3563
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Critical role of the heme axial ligand, Met95, in locking catalysis of the phosphodiesterase from Escherichia coli (Ec DOS) toward cyclic diGMP2007
- 著者名/発表者名
  A. Tanaka, H. Takahashi, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  J.Biol.Chem. 282
  
  ページ: 21301-21307
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Eukaryotic initiation factor 2alpha kinase is a nitric oxide-responsive mercury sensor enzyme : Potent inhibition of catalysis by the mercury cation and reversal by nitric oxide2007
- 著者名/発表者名
  M. Martinkova, J. Igarashi, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  FEBS Lett. 581
  
  ページ: 4109-4114
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Phosphodiesterase activity of EcDOS, a heme-regulated enzyme from Escherichia coli, toward 3', 5'-cyclic diguanylic acid is obviously enhanced by O_2 and CO binding2006
- 著者名/発表者名
  H. Takahashi, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  Chem.Lett. 35
  
  ページ: 970-971
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Critical roles of Leu99 and Leu115 at the heme distal side in auto-oxidation and the redox potential of a heme-regulated phosphodiesterase from Escherichia coli2006
- 著者名/発表者名
  N. Yokota, Y. Araki, H. Kurokawa, O. Ito, J. Igarashi, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  FEBS J. 273
  
  ページ: 1210-1223
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Phosphodiesterase Activity of Ec DOS toward 3, 5-Cyclic di-GMP Is Obviously Enhanced by 02 and CO Binding2006
- 著者名/発表者名
  清水透, 他
- 雑誌名
  
  Chemistry Letters 35・8
  
  ページ: 970-971
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Structure-Function Relationships of EcDOS, a Heme-Regulated Phosphodiesterase from Escherichia coli2006
- 著者名/発表者名
  清水透, 他
- 雑誌名
  
  Account of Chemical Research 39・1
  
  ページ: 37-43
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Spectroscopic and DNA-binding characterization of the isolated heme-bound basic helix-loop-helix-PAS-A domain of neuronal PAS protein 2 (NPAS2), a transcription activator protein associated with circadian rhythms2006
- 著者名/発表者名
  Y. Mukaiyama, T. Uchida, E. Sato, A. Sasaki, Y. Sato, J. Igarashi, H. Kurokawa, I. Sagami, T. Kitagawa, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  FEBS J. 273
  
  ページ: 2528-2539
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Characterization of heme-regulated eIF2 alpha kinase : Roles of the N-terminal domain in the oligomeric state, heme binding, catalysis, and inhibition2006
- 著者名/発表者名
  M. Miksanova, J. Igarashi, M. Minami, I. Sagami, S. Yamauchi, H. Kurokawa, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  Biochemistry 45
  
  ページ: 9894-9905
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Spectroscopic and DNA-binding characterization of the isolated heme-bound bHLH-PAS-A domain of NPAS22006
- 著者名/発表者名
  清水透, 他
- 雑誌名
  
  FEBS Journal 273・11
  
  ページ: 2528-2539
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Critical roles of Leu99 and Leu115 at the heme distal side in auto-oxidation and the redox potential of Ec DOS2006
- 著者名/発表者名
  清水透, 他
- 雑誌名
  
  FEBS Journal 273・5
  
  ページ: 1210-1223
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Characterization of Heme-Regualted eIF2α Kinase : Roles of the N-Terminal Domain in the Oligomerin State, and Catalvsis.2006
- 著者名/発表者名
  清水透, 他
- 雑誌名
  
  Biochemistry 45・32
  
  ページ: 9849-9905
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Structure-function relationships of EcDOS, a heme-regulated phosphodiesterase from Escherichia coli2006
- 著者名/発表者名
  Y. Sasakura, T. Yoshimura-Suzuki, H. Kurokawa, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  Acc.Chem.Res. 39
  
  ページ: 37-43
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Investigation of the relationship between protein-protein interaction and catalytic activity of a heme-regulated phosphodiesterase from Escherichia coli (EcDOS) by protein microarray2005
- 著者名/発表者名
  Y. Sasakura, K. Kanda, T. Yoshimura-Suzuki, T. Matsui, S. Fukuzono, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  Biochemistry 44
  
  ページ: 9598-9605
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Investigation of the Relationship between Protein-Protein Interaction and Catalytic Activity of a Heme-Regulated Phosphodiesterase2005
- 著者名/発表者名
  清水透他
- 雑誌名
  
  Biochemistry 44・28
  
  ページ: 9598-9605
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] CO-dependent activity-controlling mechanism of heme-containing CO-sensor protein, neuronal PAS domain protein 22005
- 著者名/発表者名
  T. Uchida, E. Sato, A. Sato, I. Sagami, T. Shimizu, T. Kitagawa
- 雑誌名
  
  J.Biol.Chem. 280
  
  ページ: 21358-21368
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Dual Effects of the Substrate and Pterins on the Kinetics of CO Binding to Neuronal Nitric Oxide Synthase : A Laser Flash Photolysis2005
- 著者名/発表者名
  清水透他
- 雑誌名
  
  Chemistry Letters 34・6
  
  ページ: 752-753
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] CO-dependent Activity-controlling Mechanism of Heme-containing CO-sensor Protein, Neuronal PAS Domain Protein 22005
- 著者名/発表者名
  清水透他
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Chemistry 280・22
  
  ページ: 21358-21368
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Spectroscopic Characterization of the Isolated Heme-bound PAS-B Domain of Neuronal PAS Domain 2 Associated with Circadiam Rhythms2005
- 著者名/発表者名
  清水透他
- 雑誌名
  
  FEBS Journal 272・16
  
  ページ: 4153-4162
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] DOSEc, a Heme-Regulated Phosphodiesterase, Plays an Important Role in Regulation of the Cyclic AMP Level in Escherichia coli2005
- 著者名/発表者名
  清水透他
- 雑誌名
  
  Journal of Bacteriology 187・19
  
  ページ: 6678-6682
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[雑誌論文] Spectroscopic characterization of the isolated heme-bound PAS-B domain of neuronal PAS domain protein 2 associated with circadian rhythms2005
- 著者名/発表者名
  R. Koudo, H. Kurokawa, E. Sato, J. Igarashi, T. Uchida, I. Sagami, T. Kitagawa, T. Shimizu
- 雑誌名
  
  FEBS J. 272
  
  ページ: 4153-4162
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Heme-regulated Eukaryotic Initiation Factor 2α Kinase2010
- 著者名/発表者名
  Jotaro Igarashi, Toru Shimizu
- 学会等名
  Gordon Research Conference on Protein Cofactors, Radicals and Quinones
- 発表場所
  U.S.A., Ventura, CA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Cysteine Thiolate is the Heme Binding Site of Heme-regulated Transcription Regulatory Factors Associated with Circadian Rhythms2010
- 著者名/発表者名
  Kenichi Kitanishi, Jotaro Igarashi, Toru Shimizu
- 学会等名
  Gordon Research Conference on Protein Cofactors, Radicals and Quinones
- 発表場所
  U.S.A., Ventura, CA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Cysteine thiolate is the heme sensing site in heme-sensor proteins2009
- 著者名/発表者名
  Jotaro Igarashi, Kenichi Kitanishi, Toru Shimizu
- 学会等名
  XXII International Conference on Coordination and Bioinorganic Chemistry
- 発表場所
  Slovakia, Smolenice
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Mechanisms of gas-sensing and intra-molecular signal transduction2009
- 著者名/発表者名
  清水透
- 学会等名
  Symposium Adv.Biol.Inorg.Chem.
- 発表場所
  インド、ムンバイ
- 年月日
  2009-11-06
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Emerging Roles of Heme as the Signal and the Gas-sensing Site : Heme-sensor and Gas-sensor Proteins2009
- 著者名/発表者名
  Toru Shimizu
- 学会等名
  Biochemistry Seminar, Department of Medical Biotechnology
- 発表場所
  Jagielloninan University, Poland, Krakow
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] The Critical Role of the Thiolate-Heme Complex in the Functioning2009
- 著者名/発表者名
  Jotaro Igarashi, Kenichi Kitanishi, Motohiko Murase, Marketa Martinkova, Toru Shimizu
- 学会等名
  16th International Conference on Cytochrome P450, Biochemistry, Biophysics, Biotechnology
- 発表場所
  Japan, Nago, Okinawa
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Emerging roles of heme as the signal and the gas-sensing site2009
- 著者名/発表者名
  清水透
- 学会等名
  Biochemistry Seminar, Jagiellonian Univ.
- 発表場所
  ポーランド、クラコフ
- 年月日
  2009-06-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Heme-sensing mechanisms of heme-sensor proteins2009
- 著者名/発表者名
  清水透
- 学会等名
  14th Int.Conf.Biol.Inorg.Chem.
- 発表場所
  愛知県・名古屋市
- 年月日
  2009-07-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Heme-sensing Mechanisms of Heme-sensor Proteins Associated with Protein Synthesis and Circadian Rhythms2009
- 著者名/発表者名
  Jotaro Igarashi, Motohiko Murase, Marketa Martinkova, Kenichi Kitanishi, Toru Shimizu
- 学会等名
  14th International Conference on Biological Inorganic Chemistry
- 発表場所
  Japan, Nagoya
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] The critical role of the thiolate-heme complex in the functioning2009
- 著者名/発表者名
  清水透
- 学会等名
  16th Int.Conf.Cyt.P450, Biochem.Biophys.
- 発表場所
  沖縄、名護市
- 年月日
  2009-06-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Cysteine thiolate is the heme sensing site in heme-sensor proteins2009
- 著者名/発表者名
  清水透
- 学会等名
  XXII Int.Conf.Coord.Bioinorg.Chem.
- 発表場所
  スロバキア、スモレニス
- 年月日
  2009-06-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Mechanisms of Gas-sensing and Intra-molecular Signal Transduction of a Heme-based Oxygen-sensor Enzyme, Ec DOS2009
- 著者名/発表者名
  Atsunari Tanaka, Yukako Ishitsuka, Jotaro Igarashi, Toru Shimizu
- 学会等名
  Symposium on Avanced Biological Inorganic Chemistry (SABIC-2009)
- 発表場所
  India, Mumbai
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Molecular mechanism of NO-induced activation of a heme-sensor, eIF2a kinase (Invited)2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 学会等名
  First National Congress for Biological Aspect of Nitric Oxide
- 発表場所
  イタリア、リミニ
- 年月日
  2008-10-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Molecular machanism of NO-induced activation of a heme-sensor, eIF2α kinase2008
- 著者名/発表者名
  Toru Shimizu
- 学会等名
  Convegno Nazionale, Gli Aspetti Biologici dell'Ossido Nitrico (Italia National Congress for Biological Aspect of Nitric Oxide)
- 発表場所
  Italia, Rimini
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Heme-binding proteins associated with transcription of circadian rhythms (Invited)2008
- 著者名/発表者名
  清水透
- 学会等名
  Gordon Research Conference on the Chemistry & Biology of Tetrapyrroles
- 発表場所
  アメリカ合衆国、ニューポート
- 年月日
  2008-07-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] NO-induced activation of a heme-sensor, eIF2α kinase, in association with binding to cysteine and heme2008
- 著者名/発表者名
  Jotaro Igarashi, Motohiko Murase, Jun Iwashita, Takehiko Sasaki, Toru Shimizu
- 学会等名
  Fifth International Conference, Biology, Chemistry, and Therapeutic Applications of Nitric Oxide
- 発表場所
  Austria, Bregenz
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Heme-binding proteins associated with transcription of circadian rhythms2008
- 著者名/発表者名
  Toru Shimizu
- 学会等名
  Gordon Research Conference on the Chemistry & Biology of Tetrapyrroles
- 発表場所
  U.S.A., Newport, RI
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Heme-sensing Mechanism of Heme-sensor Proteins Associated with Circadian Rhythms and Protein Synthesis2008
- 著者名/発表者名
  Toru Shimizu
- 学会等名
  Biochemistry Meeting at the Department of Morphological-Biomedical Science
- 発表場所
  University of Verona, Italy, Verona
- 年月日
  2008-10-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Structure-function relationships of eIF2α kinase, HRI, associated with…2007
- 著者名/発表者名
  清水透
- 学会等名
  VIII National Congress of Pharmacology, Therapeutic and Clinical Toxicoloty
- 発表場所
  Tirgu-Mure, Romania
- 年月日
  2007-06-06
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Structure-function relationships of eIF2α kinase (heme-regulated inhibitor, HRI), associated with protein synthesis2007
- 著者名/発表者名
  Toru Shimizu
- 学会等名
  VIIIth National Congress of Pharmacology, Therapeutics and Clinical Toxicology
- 発表場所
  Romania, Tirgu-Mure
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Structure-function relationships of a thiol-coordinating heme protein, HRI, associated with protein synthesis2007
- 著者名/発表者名
  Marketa Martinkova, Jotaro Igarashi, Toru Shimizu
- 学会等名
  15th International Conference on Cytochrome P450, Biochemistry, Biophysics, Functional Genomics
- 発表場所
  Slovenia, Bled
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Intramolecular Signal Transduction and Signal Switching of Heme-sensor Proteins through NO and CO Binding2006
- 著者名/発表者名
  Toru Shimizu
- 学会等名
  20th International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB
- 発表場所
  Japan, Kyoto
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002
[学会発表] Role of the N-terminal Domain in the Structure and Catalysis of Heme-regualted Eukaryotic Initiation Factor 2α Kinase, a Heme-sensor Enzyme2006
- 著者名/発表者名
  Marketa Miksanova, Hirofumi Kurokawa, Jotaro Igarashi, Toru Shimizu
- 学会等名
  Biochemistry and Molecular Biology of Sensor Enzymes and Proteins : Satellite Meeting of the 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
- 発表場所
  Japan, Sendai
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17101002

1. 佐上郁子 (10143033)

共同の研究課題数: 9件

共同の研究成果数: 0件
2. 佐藤秀明 (60271996)

共同の研究課題数: 6件

共同の研究成果数: 0件
3. 伊藤攻 (30006332)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 0件
4. ダフサイモン (50292298)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 0件
5. 旗野昌弘 (50006293)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 0件
6. 藤井義明 (00098146)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
7. 小波秀雄 (40186713)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
8. 黒河博文 (80359546)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 7件
9. 五十嵐城太郎 (80375162)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 22件
10. 松井敏高 (90323120)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
11. 川戸佳 (50169736)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
12. 中西守 (90090472)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
13. 小南思郎 (10106776)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
14. 木下一彦 (30124366)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
15. 石村巽 (40025599)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
16. POULOS Thomas L.

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
17. 田中敦成 (20431471)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
18. 廣谷功 (70192721)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 船江良彦 (00047268)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 田代裕 (40077558)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 楠瀬正道 (10046766)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 川尻要 (50142112)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 大村恒雄 (80029933)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. THOMAS L Pou

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
25. POULOU Thoma

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. POULOS Thoma

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

清水 透 SHIMIZU Toru

研究課題

研究成果

共同研究者

環境汚染物質による体内時計の破壊:ヘム-NO-蛋白質合成-時計遺伝子のクロストーク研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

環境汚染物質によるポルフィリン症の解析・ヘム合成と蛋白質合成の協奏とテンポ研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

触媒反応を光スイッチや分子スイッチで制御できる環境修復酵素の構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

部位特異的変異法によるNO合成酵素の電子移動機構と酸素分子活性化機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

部位特異的変異法によるNO合成酵素の電子移動機構と酸素分子活性化機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

部位特異的変異法によるNO合成酵素の電子移動機構と酸素分子活性化機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

人工変異により高度に活性化されたP450導入酵母による毒物特異的分子変換システム研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

部位特異的変異法によるNO合成酵素の電子移動機構と酸素分子活性化機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

分子可視化解析:受信から送信への細胞情報フロー

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

遺伝子組換えP450導入酵母によるハロゲン化合物分子変換システムの開発と性能評価研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

分子設計されたNO合成酵素の機能発現及び生体内NOのダイナミックス研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

機能性人工細胞の設計・製作と時間分解計測による解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

哺乳類チトクロムPー450の電子伝達に伴うコンホメ-ションと基質受容性の変化の研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

チトクロームPー450の分子生物学:発現の分子機構

研究代表者

研究期間 (年度)

清水透 SHIMIZU Toru