三上文三 MIKAMI Bunzo

研究者番号	40135611
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所属 (現在)	2025年度: 京都大学, 生存圏研究所, 研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2019年度 – 2023年度: 京都大学, 生存圏研究所, 研究員 2015年度 – 2018年度: 京都大学, 農学研究科, 教授 2016年度: 京都大学, 大学院農学研究科, 教授 2014年度: 京都大学, 大学院農学研究科, 教授 2012年度 – 2014年度: 京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 … もっと見る 2013年度: 京都大学, 大学院・農学研究科, 教授 2006年度 – 2013年度: 京都大学, 農学研究科, 教授 2011年度: 京都大学, 大学院・農学研究科, 教授 2010年度: 京都大学, 農学研究科 2001年度 – 2005年度: 京都大学, 農学研究科, 助教授 1993年度 – 2000年度: 京都大学, 食糧科学研究所, 助教授 1988年度: 京都大学, 食糧科学研究所, 助手 1987年度: 京都大学, 食料科学研究所, 助手 1986年度: 京都大学, 食糧科学研究所, 助手隠す
審査区分/研究分野	研究代表者応用微生物学・応用生物化学 / 応用生物化学 / 小区分38030:応用生物化学関連研究代表者以外応用微生物学 / 小区分38060:応用分子細胞生物学関連 / 応用微生物学・応用生物化学 / 応用生物化学・栄養化学 / 応用分子細胞生物学 / 生物物理学 / 食生活学 … もっと見る / 極限環境生物学 / 食品科学・製品科学 / 水産化学 / 理工系隠す
キーワード	研究代表者 X線結晶構造解析 / タンパク質工学 / β-アミラーゼ / protein engineering / 構造生物学 / 酵素反応機構 / beta-amylase / β-amylase / X-ray crystal analysis / x-ray crystal analysis … もっと見る / X-ray crystallography / タンパク質結晶構造解析 / 酵素工学 / 酵素反応 / フレキシブルループ / タンパク質構造変化 / 酵素 / 応用構造生物学 / 非凍結結晶 / 結晶内酵素反応 / 酵素のpHによる構造変化 / 常温Ｘ線結晶構造解析 / 非凍結X線結晶構造解析 / 酵素基質複合体のpH変化 / キャピラリーＸ線構造解析 / 常温X線結晶構造解析 / 食糧関連酵素のＸ線結晶構造解析 / 食糧関連酵素のタンパク質工学 / 食糧関連酵素の構造生物学 / x線結晶構造解析 / 糖転移酵素 / トランスグルタミナーゼ / 食糧関連酵素・タンパク質 / 糖質関連酵素 / プロテイングルタミナーゼ / プルラナーゼ / アミラーゼ / mobile loop / protein eneineering / enzyme / nanobio / 可動ループ / ナノバイオ / starch binding domain / optimum pH / 至適pHの変換 / デンプン吸着ドメイン / 至適pH / starch-binding domain / starch binding / 澱粉吸着ドメイン / 澱粉吸着 / thermostability / 生デンプン分解 / enzyme-substrate complex / enzyme mechanism / 酵素基質複合体 / 食品関連酵素 … もっと見る研究代表者以外 X線結晶構造解析 / アルギン酸 / Sphingomonas / グリコサミノグリカン / Sphingomonas属細菌 / X線結晶構造 / ABCトランスポーター / ムチン / プロバイオティクス / 常在機構 / 微生物叢 / X-ray crystallography / Bacillus / Alginate / アルギン酸リアーゼ / 蛋白質 / neuroserpin / drug design / neurodegeneration / dementia / serpin / スフィンゴモナス属細菌 / 細菌細胞表層構造 / 鞭毛 / フラジェリン / 細胞外マトリックス / 連鎖球菌 / 体腔 / ABCタンパク質 / オボトランスフェリン / γ-アミノ酪酸 / Bacteroides / 膜小胞 / 相利共生 / 動物宿主 / 腸内細菌叢 / 感染機構 / alzheimer / inhibitor / tPA / 種子 / 植物 / 食物 / アレルギー / 食品 / エピトープ / 小麦 / アレルゲン / 分解酵素 / 輸送体 / 酵素 / 動物細胞外マトリクス / 代謝酵素 / 宿主細胞外マトリクス / 輸送系 / 分解系 / 細菌 / 連鎖桿菌 / 遺伝子クラスター / 分解・代謝酵素 / フォスフォトランスフェラーゼ系 / 細胞外マトリクス / 病原性細菌 / Catalase activity / Myeloperoxidase, structure of / ヒト白血球 / カタラーゼ活性 / ミエロペルオキシダーゼの構造 / hydrophobic interaction / X-ray structural analysis / phosphatase / cold-active enzyme / low temperature environment / 変異体ライブラリー / 高分解能X線結晶構造解析 / 変異型酵素解析 / 低温活性機構 / 疎水性相互作用 / フォスファターゼ / 低温活性酵素 / 低温環境 / T4 phage / Pit / Receptor / Flagellum / Flagellin / 襞構造 / 細胞表層 / 鞭毛進化 / 鞭毛タンパク質 / フィンガードメイン / T4ファージ / レセプター / Protein module / Primary structure / function relationship of protein / Structure / Structural biology / Polysaccharide lyase / キサンタンリアーゼ / タンパク質・遺伝子の進化 / オートプロセシング / 翻訳後修飾 / エピメラーゼ / ヒドロラーゼ / 翻訳後修飾機構 / 糖質エピメラーゼ / 糖質加水分解酵素 / Bacillus属細菌 / タンパク質構造機能相関 / 構造生物学 / 多糖リアーゼ / Alginate lyase / X-ray diffraction / Pseudomonas aeruginosa / Bacterial infection / 緑膿菌 / 難治性細菌感染症 / Serum albumin / Ovotransferrin / Ovalbumin / Food functionality / Molten globule / Food proteins / タンパク質フラグメント / タンパク構造変換 / モルテングロビュール / 血清アルブミン / オボアルブミン / 食品機能特性 / モンテングロビュール / 食品蛋白質 / ヘムタンパク質 / ミエロペルオキシダーゼ / タンパク質X線構造解析 / ペルオキシダーゼ / フェリチン / キチナーゼ / フェノールオキシダーゼ / メタロプロテイン / リガンド / 金属 / 立体構造 / コンフォメーション病 / 神経変性 / フォールディング / 痴呆 / 生物物理 / 脳神経疾患 / Serpin / Conformational Diseases / Protein Folding / Dementia / Protein folding / serpins / ovalbumin / folding / conformational diseases / アルギン酸結合タンパク質 / 高分子輸送 / ヘテロ多糖 / プロテオリポソーム再構成系 / 基質結合タンパク質 / 輸送体分子進化 / Ｘ線結晶構造 / 酸性多糖輸送 / フラジェリン進化 / ペプチドグリカン分解酵素 / ペプチドグリカン構造 / 超チャネル / ペプチドグリカン加水分解楮 / 体腔形成細菌 / メタロペプチダーゼ / ペプチドグリカン加水分解酵素 / 外套膜 / カルシウム / バイオミネラリゼーシ / クモ系 / ペプチド / クモ糸様タンパク / 貝殻 / 凝集沈殿剤 / クモ糸様タンパク質 / 石灰化 / 炭酸カルシウム / マガキ / バイオミネラリゼーション / 反応機構 / 水和反応 / 不飽和グルクロニルヒドロラーゼ / ヒアルロン酸リアーゼ / ビニルエーテル結合 / 水和 / ラムノガラクツロナン / 不飽和ガラクツロニルヒドロラーゼ / 侵入・感染機構 / 植物細胞壁 / 枯草菌 / スフィンゴモナス / 結合タンパク質 / 高分子膜輸送 / 鉄イオン / 高次構造変換 / 分子スイッチ / トランスフェリン隠す

非凍結X線結晶構造解析による酵素機能の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  三上文三
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分38030:応用生物化学関連
- 研究機関
  京都大学
動物細胞外粘液物質を介した腸内優占菌と宿主との相利共生機構の解明
- 研究代表者
  
  橋本渉
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分38060:応用分子細胞生物学関連
- 研究機関
  京都大学
動物細胞外マトリックスを標的とする微生物叢の動態と定着機構の解明及びその応用展開
- 研究代表者
  
  橋本渉
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分38060:応用分子細胞生物学関連
- 研究機関
  京都大学
食糧関連タンパク質・酵素の機能解明研究代表者
- 研究代表者
  
  三上文三
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
動物の細胞外マトリクスを標的とする病原性細菌の定着・感染機構に関する構造生命科学
- 研究代表者
  
  橋本渉
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用分子細胞生物学
- 研究機関
  京都大学
重篤なアレルギー症状を引き起こす小麦タンパク質の分子構造の解明
- 研究代表者
  
  丸山伸之
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  食生活学
- 研究機関
  京都大学
構造生物学的手法による神経変性病治療薬開発のための新しい戦略
- 研究代表者
  
  恩田真紀
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  大阪府立大学
食品関連酵素の可動ループ機能の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  三上文三
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
新規金属集積蛋白質の分子設計と環境浄化への応用
- 研究代表者
  
  増田太郎
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  応用分子細胞生物学
- 研究機関
  京都大学
基質結合タンパク質と巨大分子特異的ＡＢＣインポーターとの複合体の構造と機能
- 研究代表者
  
  村田幸作
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2013
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用微生物学
- 研究機関
  摂南大学
   京都大学
構造生物学的手法によるセルピン病治療薬開発のための新しい戦略
- 研究代表者
  
  恩田真紀
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2013
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  大阪府立大学
食糧関連酵素のループ機能の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  三上文三
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
細菌鞭毛フラジェリンの構造機能相関と細胞表層局在化機構
- 研究代表者
  
  村田幸作
- 研究期間 (年度)
  2008 – 2010
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用微生物学
- 研究機関
  京都大学
タンパク質の「揺らぎ」と機能発現における水分子の役割
- 研究代表者
  
  村田幸作
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2007
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  京都大学
クモ糸様タンパク質に注目した貝殻作りの分子機構の解明
- 研究代表者
  
  豊原治彦
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2008
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  水産化学
- 研究機関
  京都大学
食糧関連酵素・タンパク質のループ工学研究代表者
- 研究代表者
  
  三上文三
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2007
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
鞭毛タンパク質フラジェリンの機能解析による細菌細胞表層構造の構築原理と鞭毛進化
- 研究代表者
  
  村田幸作
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2007
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用微生物学
- 研究機関
  京都大学
低温で高い触媒効率を発揮する低温活性酵素の構造要因の解明
- 研究代表者
  
  鶴田宏樹
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2006
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  極限環境生物学
- 研究機関
  神戸大学
酵素リアーゼの共通機能を規定する非共通アミノ酸配列の生物学的意義
- 研究代表者
  
  村田幸作
- 研究期間 (年度)
  2002 – 2004
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用微生物学・応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
細菌細胞表層における体腔の高次空間構造と高分子輸送機構
- 研究代表者
  
  村田幸作
- 研究期間 (年度)
  2000
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 研究機関
  京都大学
β-アミラーゼのドメイン工学研究代表者
- 研究代表者
  
  三上文三
- 研究期間 (年度)
  2000 – 2001
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  応用微生物学・応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
β-アミラーゼのドメイン工学研究代表者
- 研究代表者
  
  三上文三
- 研究期間 (年度)
  1998 – 1999
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  応用微生物学・応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
鉄イオンによるトランスフェリンの分子スイッチ機構:高次構造変換過程のX線結晶構造解析
- 研究代表者
  
  広瀬正明
- 研究期間 (年度)
  1997
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  京都大学
β-アミラーゼのタンパク質工学研究代表者
- 研究代表者
  
  三上文三
- 研究期間 (年度)
  1996 – 1997
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  応用微生物学・応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
細菌アルギン酸リアーゼX線結晶構造解析と反応機構
- 研究代表者
  
  村田幸作
- 研究期間 (年度)
  1995 – 1996
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  応用微生物学・応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
β-アミラーゼのX線結晶構造解析による触媒機構の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  三上文三
- 研究期間 (年度)
  1994
- 研究種目
  
  国際学術研究
- 研究機関
  京都大学
β-アミラーゼのタンパク質工学研究代表者
- 研究代表者
  
  三上文三
- 研究期間 (年度)
  1994 – 1995
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  応用微生物学・応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
食品蛋白質の分子構造変換による機能特性の発現機構-モルテングロビュールの役割
- 研究代表者
  
  広瀬正明
- 研究期間 (年度)
  1993 – 1995
- 研究種目
  
  一般研究(B)
- 研究分野
  
  食品科学・製品科学
- 研究機関
  京都大学
ペルオキシダーゼのX線結晶構造解析と機能に関する研究
- 研究代表者
  
  森田雄平
- 研究期間 (年度)
  1988
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  応用生物化学・栄養化学
- 研究機関
  京都大学
ヒト正常白血球結晶ミエロペルオキシダーゼの構造と機能に関する研究
- 研究代表者
  
  森田雄平
- 研究期間 (年度)
  1986 – 1987
- 研究種目
  
  一般研究(B)
- 研究分野
  
  応用生物化学・栄養化学
- 研究機関
  京都大学

[図書] 第4章2節グロブリンタンパク質2010
- 著者名/発表者名
  三上文三、丸山伸之、内海成、大豆のすべて(喜多村啓介他編集)
- 出版者
  サイエンスフォーラム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[雑誌論文] Activity-stability trade-off observed in variants at position 315 of the GH10 xylanase XynR2024
- 著者名/発表者名
  Nakamura Tomoka、Takita Teisuke、Kuwata Kohei、Mizutani Kimihiko、Mikami Bunzo、Nakamura Satoshi、Yasukawa Kiyoshi
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 14 号: 1
- DOI
  10.1038/s41598-024-57819-z
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K05441
[雑誌論文] Subatomic structure of orthorhombic thaumatin at 0.89?? reveals that highly flexible conformations are crucial for thaumatin sweetness2024
- 著者名/発表者名
  Masuda Tetsuya、Suzuki Mamoru、Yamasaki Masayuki、Mikami Bunzo
- 雑誌名
  
  Biochemical and Biophysical Research Communications
  
  巻: 703 ページ: 149601-149601
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2024.149601
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K05441
[雑誌論文] Structure-Based Characterization and Improvement of an Enzymatic Activity of <i>Acremonium alcalophilum</i> Feruloyl Esterase2024
- 著者名/発表者名
  Phienluphon Apisan、Kondo Keiko、Mikami Bunzo、Teo Kenneth Sze Kai、Saito Kaori、Watanabe Takashi、Nagata Takashi、Katahira Masato
- 雑誌名
  
  ACS Sustainable Chemistry & Engineering
  
  巻: 12 号: 9 ページ: 3831-3840
- DOI
  10.1021/acssuschemeng.3c08222
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K05441
[雑誌論文] Insights into the catalytic mechanism of <i>Grimontia hollisae</i> collagenase through structural and mutational analyses2023
- 著者名/発表者名
  Ueshima Saori、Yasumoto Mizuki、Kitagawa Yuto、Akazawa Kaho、Takita Teisuke、Tanaka Keisuke、Hattori Shunji、Mizutani Kimihiko、Mikami Bunzo、Yasukawa Kiyoshi
- 雑誌名
  
  FEBS Letters
  
  巻: 597 号: 19 ページ: 2473-2483
- DOI
  10.1002/1873-3468.14732
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K05441
[雑誌論文] Structure of thaumatin under acidic conditions: Structural insight into the conformations in lysine residues responsible for maintaining the sweetness after heat-treatment2022
- 著者名/発表者名
  Masuda Tetsuya、Okubo Kyohei、Baba Seiki、Suzuki Mamoru、Tani Fumito、Yamasaki Masayuki、Mikami Bunzo
- 雑誌名
  
  Food Chemistry
  
  巻: 389 ページ: 132996-132996
- DOI
  10.1016/j.foodchem.2022.132996
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06238, KAKENHI-PROJECT-22K05441, KAKENHI-PROJECT-20H02932, KAKENHI-PROJECT-20K05875
[雑誌論文] Crystal structure of Grimontia hollisae collagenase provides insights into its novel substrate specificity toward collagen2022
- 著者名/発表者名
  Ikeuchi Takeaki、Yasumoto Mizuki、Takita Teisuke、Tanaka Keisuke、Kusubata Masashi、Hayashida Osamu、Hattori Shunji、Mizutani Kimihiko、Mikami Bunzo、Yasukawa Kiyoshi
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 298 号: 8 ページ: 102109-102109
- DOI
  10.1016/j.jbc.2022.102109
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K05441, KAKENHI-PROJECT-18KK0285, KAKENHI-PROJECT-23K24590
[雑誌論文] Crystal structures of N-myristoylated lipopeptide-bound HLA class I complexes indicate reorganization of B-pocket architecture upon ligand binding2022
- 著者名/発表者名
  Minori Asa, Daisuke Morita, Jin Kuroha, Tatsuaki Mizutani, Naoki Mori, Bunzo Mikami, Masahiko Sugita
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 298 号: 7 ページ: 102100-102100
- DOI
  10.1016/j.jbc.2022.102100
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K07078, KAKENHI-PROJECT-22K05441, KAKENHI-PROJECT-21H02968, KAKENHI-PROJECT-20J23335, KAKENHI-PROJECT-20K21615
[雑誌論文] The role of calcium binding to the EF-hand-like motif in bacterial solute-binding protein for alginate import2021
- 著者名/発表者名
  Okumura Kenji、Maruyama Yukie、Takase Ryuichi、Mikami Bunzo、Murata Kousaku、Hashimoto Wataru
- 雑誌名
  
  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
  
  巻: 85 号: 12 ページ: 2410-2419
- DOI
  10.1093/bbb/zbab170
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H02156
[雑誌論文] Bacterial inducible expression of plant cell wall-binding protein YesO through conflict between Glycine max and saprophytic Bacillus subtilis2020
- 著者名/発表者名
  Sugiura Haruka、Nagase Ayumi、Oiki Sayoko、Mikami Bunzo、Watanabe Daisuke、Hashimoto Wataru
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 18691-18691
- DOI
  10.1038/s41598-020-75359-0
- NAID
  120006951777
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02166
[雑誌論文] High-resolution crystal structures of the glycoside hydrolase family 45 endoglucanase EG27II from the snail Ampullaria crossean.2019
- 著者名/発表者名
  Nomura T, Iwase H, Saka N, Takahashi N, Mikami B, Mizutani K.
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr D Struct Biol.
  
  巻: 75 号: 4 ページ: 426-436
- DOI
  10.1107/s2059798319003000
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[雑誌論文] Substrate recognition by bacterial solute-binding protein is responsible for import of extracellular hyaluronan and chondroitin sulfate from the animal host2019
- 著者名/発表者名
  Oiki Sayoko、Sato Masahiro、Mikami Bunzo、Murata Kousaku、Hashimoto Wataru
- 雑誌名
  
  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
  
  巻: 83 号: 10 ページ: 1946-1954
- DOI
  10.1080/09168451.2019.1630250
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02166
[雑誌論文] Structure of a serine-type glutathione S-transferase of Ceriporiopsis subvermispora and identification of the enzymatically important non-canonical residues by functional mutagenesis2019
- 著者名/発表者名
  Wan Osman Wan Hasnidah、Mikami Bunzo、Saka Naoki、Kondo Keiko、Nagata Takashi、Katahira Masato
- 雑誌名
  
  Biochemical and Biophysical Research Communications
  
  巻: 510 号: 1 ページ: 177-183
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2019.01.076
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07307, KAKENHI-PROJECT-16H04909, KAKENHI-PROJECT-18K14636
[雑誌論文] The microenvironment surrounding FAD mediates its conversion to 8-formyl-FAD in Aspergillus oryzae RIB40 formate oxidase.2019
- 著者名/発表者名
  Doubayashi D, Oki M, Mikami B, Uchida H.
- 雑誌名
  
  J Biochem.
  
  巻: 印刷中号: 1 ページ: 67-75
- DOI
  10.1093/jb/mvz009
- NAID
  40021952190
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[雑誌論文] Streptococcal phosphotransferase system imports unsaturated hyaluronan disaccharide derived from host extracellular matrices2019
- 著者名/発表者名
  Oiki Sayoko、Nakamichi Yusuke、Maruyama Yukie、Mikami Bunzo、Murata Kousaku、Hashimoto Wataru
- 雑誌名
  
  PLOS ONE
  
  巻: 14 号: 11 ページ: e0224753-e0224753
- DOI
  10.1371/journal.pone.0224753
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02166
[雑誌論文] Identification of key residues for activities of atypical glutathione S-transferase of Ceriporiopsis subvermispora, a selective degrader of lignin in woody biomass, by crystallography and functional mutagenesis2019
- 著者名/発表者名
  Osman Wan Hasnidah Wan、Mikami Bunzo、Saka Naoki、Kondo Keiko、Lin Meng-I、Nagata Takashi、Katahira Masato
- 雑誌名
  
  International Journal of Biological Macromolecules
  
  巻: 132 ページ: 222-229
- DOI
  10.1016/j.ijbiomac.2019.03.199
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07307, KAKENHI-PROJECT-16H04909, KAKENHI-PROJECT-18K14636
[雑誌論文] Structural and thermodynamic characterization of endo-1,3-β-glucanase: Insights into the substrate recognition mechanism2018
- 著者名/発表者名
  M. Oda, S. Inaba, N. Kamiya, G.-J. Bekker, B. Mikami
- 雑誌名
  
  Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics
  
  巻: 1866 号: 3 ページ: 415-425
- DOI
  10.1016/j.bbapap.2017.12.004
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07331, KAKENHI-PROJECT-16H04909
[雑誌論文] Elucidation of the mechanism of interaction between Klebsiella pneumoniae pullulanase and cyclodextrin.2018
- 著者名/発表者名
  Saka N, Iwamoto H, Malle D, Takahashi N, Mizutani K, Mikami B
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr D Struct Biol.
  
  巻: 74 号: 11 ページ: 1115-1123
- DOI
  10.1107/s2059798318014523
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[雑誌論文] Crystal structure of an aldehyde oxidase from Methylobacillus sp. KY44002018
- 著者名/発表者名
  Uchida H., Mikami B., Yamane-Tanabe A., Ito A., Hirano K., Oki M.
- 雑誌名
  
  J. Biochem.
  
  巻: 163 号: 4 ページ: 321-328
- DOI
  10.1093/jb/mvy004
- NAID
  40021524060
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[雑誌論文] Role of the Tyr270 residue in 2-methyl-3-hydroxypyridine-5-carboxylic acid oxygenase from Mesorhizobium loti.2017
- 著者名/発表者名
  Kobayashi J., Yoshida H., Yagi T., Kamitori S., Hayashi H., Mizutani K., Takahashi N., Mikami B.
- 雑誌名
  
  J. Biosci. Bioeng.
  
  巻: 123 号: 2 ページ: 154-162
- DOI
  10.1016/j.jbiosc.2016.07.022
- NAID
  40021112404
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909, KAKENHI-PROJECT-15K05573
[雑誌論文] A bacterial ABC transporter enables import of mammalian host glycosaminoglycans2017
- 著者名/発表者名
  Oiki Sayoko、Mikami Bunzo、Maruyama Yukie、Murata Kousaku、Hashimoto Wataru
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 7 号: 1 ページ: 1069-1069
- DOI
  10.1038/s41598-017-00917-y
- NAID
  120006223605
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629
[雑誌論文] A solute-binding protein in the closed conformation induces ATP hydrolysis in a bacterial ATP-binding cassette transporter involved in the import of alginate2017
- 著者名/発表者名
  Kaneko Ai、Uenishi Kasumi、Maruyama Yukie、Mizuno Nobuhiro、Baba Seiki、Kumasaka Takashi、Mikami Bunzo、Murata Kousaku、Hashimoto Wataru
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 292 号: 38 ページ: 15681-15690
- DOI
  10.1074/jbc.m117.793992
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07701, KAKENHI-PROJECT-15H04629
[雑誌論文] Alternative substrate-bound conformation of bacterial solute-binding protein involved in the import of mammalian host glycosaminoglycans2017
- 著者名/発表者名
  Oiki Sayoko、Kamochi Reiko、Mikami Bunzo、Murata Kousaku、Hashimoto Wataru
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 7 号: 1 ページ: 17005-17005
- DOI
  10.1038/s41598-017-16801-8
- NAID
  120006369452
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629, KAKENHI-PROJECT-16H04909
[雑誌論文] "Silent" Amino Acid Residues at Key Subunit Interfaces Regulate the Geometry of Protein Nanocages.2016
- 著者名/発表者名
  Zhang S., Zang J., Zhang X., Chen H., Mikami B., Zhao G.
- 雑誌名
  
  ACS Nano
  
  巻: 10 号: 11 ページ: 10382-10388
- DOI
  10.1021/acsnano.6b06235
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[雑誌論文] Conformational change in the active site of Streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase through site-directed mutagenesis at Asp-1152016
- 著者名/発表者名
  Yusuke Nakamichi, Sayoko Oiki, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto
- 雑誌名
  
  The Protein Journal
  
  巻: 35 号: 4 ページ: 300-309
- DOI
  10.1007/s10930-016-9673-y
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629, KAKENHI-PROJECT-16H04909
[雑誌論文] Preliminary X-ray analysis of the binding domain of the soybean vacuolar sorting receptor complexed with a sorting determinant of a seed storage protein.2015
- 著者名/発表者名
  Maruyama, N., Goshi, T., Sugiyama, S., Niiyama, M., Adachi, H., Takano, K., Murakami, S., Inoue, T., Mori, Y., Matsumura, H., Mikami, B.
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr. F Struct. Biol. Commun.
  
  巻: 71 号: 2 ページ: 132-135
- DOI
  10.1107/s2053230x14027484
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054, KAKENHI-PROJECT-25286051
[雑誌論文] Crystal structure of class III chitinase from pomegranate provides the insight into its metal storage capacity.2015
- 著者名/発表者名
  Masuda, T., Zhao, G., Mikami, B..
- 雑誌名
  
  Biosci. Biotechnol. Biochem.
  
  巻: 79 ページ: 45-50
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[雑誌論文] Metabolic fate of unsaturated glucuronic/iduronic acids from glycosaminoglycans: molecular identification and structure determination of streptococcal isomerase and dehydrogenase.2015
- 著者名/発表者名
  Maruyama Y., Oiki S., Takase R., Mikami B., Murata K., Hashimoto, W.
- 雑誌名
  
  J. Biol. Chem.
  
  巻: 290 号: 10 ページ: 6281-6292
- DOI
  10.1074/jbc.m114.604546
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[雑誌論文] Crystal structure of class III chitinase from pomegranate provides the insight into its metal storage capacity.2015
- 著者名/発表者名
  Masuda T., Zhao G. & Bunzo Mikami
- 雑誌名
  
  Biosci., Biotechnol. Biochem.
  
  巻: 79 号: 1 ページ: 45-50
- DOI
  10.1080/09168451.2014.962475
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24658287
[雑誌論文] Crystal structure of 5-formyl-3-hydroxy-2-methylpyridine 4-carboxylic acid 5-dehydrogenase, an NAD⁺-dependent dismutase from Mesorhizobium loti.2015
- 著者名/発表者名
  Mugo, A.N,. Kobayashi, J., Mikami, B., Yoshikane, Y., Yagi, T., Ohnishi, K.
- 雑誌名
  
  Biochem. Biophys. Res. Commun.
  
  巻: 456 号: 1 ページ: 35-40
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2014.11.028
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[雑誌論文] Structure-based conversion of the coenzyme requirement of a short-chain dehydrogenase/reductase involved in bacterial alginate metabolism.2015
- 著者名/発表者名
  Takase, R., Mikami, B., Kawai, S., Murata, K., Hashimoto, W.
- 雑誌名
  
  J. Biol. Chem.
  
  巻: 289 号: 48 ページ: 33198-33214
- DOI
  10.1074/jbc.m114.585661
- NAID
  120005690199
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054, KAKENHI-PROJECT-26292044, KAKENHI-PROJECT-26660062
[雑誌論文] Structure of a bacterial ABC transporter involved in the import of an acidic polysaccharide alginate2015
- 著者名/発表者名
  Yukie Maruyama, Takafumi Itoh, Ai Kaneko, Yu Nishitani, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata
- 雑誌名
  
  Structure
  
  巻: 23 号: 9 ページ: 1643-1654
- DOI
  10.1016/j.str.2015.06.021
- NAID
  120005627618
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26660062, KAKENHI-PROJECT-26292044, KAKENHI-PROJECT-15H04629
[雑誌論文] Structural determinants in bacterial 2-keto-3-deoxy-D-gluconate dehydrogenase KduD for dual-coenzyme specificity.2015
- 著者名/発表者名
  Ryuichi Takase, Yukie Maruyama, Sayoko Oiki, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto.
- 雑誌名
  
  Proteins, In press (Prot-00467-2015)
  
  巻: - 号: 7 ページ: 934-947
- DOI
  10.1002/prot.25042
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26292044, KAKENHI-PROJECT-15H04629
[雑誌論文] Crystal structure of a bacterial unsaturated glucuronyl hydrolase with specificity for heparin2014
- 著者名/発表者名
  Yusuke Nakamichi, Bunzo Mikami, Kousaku Murata. and Wataru Hashimoto
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 289 号: 8 ページ: 4787-4797
- DOI
  10.1074/jbc.m113.522573
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12J02291, KAKENHI-PROJECT-23580112, KAKENHI-PROJECT-24380054
[雑誌論文] The crystal structure of a crustacean prophenoloxidase provides a clue to understanding the functionality of the type 3 copper proteins.2014
- 著者名/発表者名
  Masuda, T., Momoji, K., Hirata, T., Mikami, B.
- 雑誌名
  
  FEBS J.
  
  巻: 281 号: 11 ページ: 2659-2673
- DOI
  10.1111/febs.12812
- NAID
  120005646484
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054, KAKENHI-PROJECT-24658287
[雑誌論文] Structure of 4-pyridoxolactonase from Mesorhizobium loti2014
- 著者名/発表者名
  Kobayashi J, Yoshikane Y, Yagi T, Baba S, Mizutani K, Takahashi N, Mikami B
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr F Struct Biol Commun.
  
  巻: 70 号: 4 ページ: 424-432
- DOI
  10.1107/s2053230x14003926
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[雑誌論文] Atomic structure of recombinant thaumatin II reveals flexible conformations in two residues critical for sweetness and three consecutive glycine residues.2014
- 著者名/発表者名
  Masuda, T., Mikami, B., Tani, F.
- 雑誌名
  
  Biochimie.
  
  巻: 106 ページ: 33-38
- DOI
  10.1016/j.biochi.2014.07.016
- NAID
  120005682566
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054, KAKENHI-PROJECT-25450167
[雑誌論文] Purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of soybean mature glycinin A1bB22013
- 著者名/発表者名
  Prak K, Mikami B, Itoh T, Fukuda T, Maruyama N, Utsumi S
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun.
  
  巻: 69 号: 8 ページ: 937-941
- DOI
  10.1107/s1744309113019684
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[雑誌論文] Induced-fit motion of a lid loop involved in catalysis in alginate lyase A1-III2012
- 著者名/発表者名
  B.Mikami, M.Ban, S.Suzuki, H.-J.Yoon, O.Miyake, M.Yamasaki, K.Ogura, Y.Maruyama, W.Hashimoto & K.Murata
- 雑誌名
  
  Acta Cryst
  
  巻: 68 ページ: 1207-1216
- NAID
  120004920434
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[雑誌論文] Induced fit motion of a lid loop involved in catalysis of alginate lyase A1 III2012
- 著者名/発表者名
  Mikami B., Ban M., Suzuki S., Yoon HY., Miyake O, Yamasaki M., Maruyama Y., Hashimoto W., Murata K
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr. Sect D Biol. Cryst
  
  巻: (in press)
- NAID
  120004920434
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate importer from Sphingomonas sp. A12012
- 著者名/発表者名
  Y.Maruyama, T.Itoh, Y.Nishitani, B. Mikami, W.Hashimoto & K.Murata
- 雑誌名
  
  Acta Cryst
  
  巻: F68 ページ: 317-320
- NAID
  120004025601
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[雑誌論文] Recognition of heteropolysaccharide alginate by periplasmic solute-binding proteins of a bacterial ABC transporter2012
- 著者名/発表者名
  Y.Nishitani, Y.Maruyama, T.Itoh, B.Mikami, W.Hashimoto & K.Murata
- 雑誌名
  
  Biochemistry
  
  巻: 51(17) ページ: 3622-3633
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[雑誌論文] Crystal structure of a major seed storage protein, llS proglobulin, from Amaranthus hypochondriacus : insight into its physico-chemical properties2012
- 著者名/発表者名
  Tandang-Silvas MR. Cabanos CS. Carrazco Pena LD. De la Rosa AP, 0suna-Castro JA. Utsumi S. Mikami B, Maruyama N.
- 雑誌名
  
  Food Chem
  
  巻: 135 号: 2 ページ: 819-826
- DOI
  10.1016/j.foodchem.2012.04.135
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[雑誌論文] Induced-fit motion of a lid loop involved in catalysis in alginate lyase Al-III.2012
- 著者名/発表者名
  Mikami B.
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr D Biol Crystallogr
  
  巻: 68 号: 9 ページ: 1207-1216
- DOI
  10.1107/s090744491202495x
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-11J40009, KAKENHI-PROJECT-23380049, KAKENHI-PROJECT-23580112, KAKENHI-PROJECT-24380054
[雑誌論文] Structure of β-1, 4-mannanase from the common sea hare Aplysia kurodai at 1.05 Å resolution2012
- 著者名/発表者名
  Kimihiko Mizutani, Sae Tsuchiya, Mayuko Toyoda, Yuko Naobu, Keiko Tomilaga, Keizo Yuasa, Nobuyuki Takahashi, Akihlko Tsuji and Bunzo Mikmi
- 雑誌名
  
  Acta Crystallographica Section F
  
  巻: 68 号: 10 ページ: 1164-1168
- DOI
  10.1107/s1744309112037074
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12J04074, KAKENHI-PROJECT-24380054
[雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate importer from Sphingomonas sp2012
- 著者名/発表者名
  Maruyama Y., Itoh T., Nishitani Y., Mikami B., Hashimoto W., Murata K
- 雑誌名
  
  A1. Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun
  
  巻: 68 号: 3 ページ: 317-320
- DOI
  10.1107/s1744309112001893
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[雑誌論文] The extension peptide of plant ferritin from sea lettuce contributes to shell stability and surface hydrophobicity2012
- 著者名/発表者名
  Masuda T., Morimoto S., Mikami B. & Toyohara H.
- 雑誌名
  
  Protein Sci
  
  巻: 21 号: 6 ページ: 786-796
- DOI
  10.1002/pro.2061
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22780303, KAKENHI-PROJECT-24658287
[雑誌論文] Crystal structures of protein glutaminase and its pro forms converted into enzyme-substrate complex2011
- 著者名/発表者名
  Hashizume R., Maki Y., Mizutani K., Takahashi N., Matsubara H., Sugita A., Sato K., Yamaguchi S., Mikami B
- 雑誌名
  
  J. Biol. Chem
  
  巻: 286 号: 44 ページ: 38691-38702
- DOI
  10.1074/jbc.m111.255133
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[雑誌論文] X-ray structures of transferrins and related proteins2011
- 著者名/発表者名
  Mizutani K., Toyoda M., Mikami B
- 雑誌名
  
  Biochim Biophys Acta
  
  巻: 1820 号: 3 ページ: 203-211
- DOI
  10.1016/j.bbagen.2011.08.003
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[雑誌論文] Crystal structure of bacterial cell-surface alginate-binding protein with an M_75 peptidase motif.2011
- 著者名/発表者名
  Yukie Maruyama, Akihito Ochiai, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata
- 雑誌名
  
  Biochem. Biophys. Res.Commun 405(3)
  
  ページ: 411-416
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20380049
[雑誌論文] Structural determinants of discrimination of NA + from NADH in yeast mitochondrial NADH kinase Pos52011
- 著者名/発表者名
  T.Ando, K.Ohashi, A.Ochiai, B, Mikami, S.Kawai & K.Murata
- 雑誌名
  
  J.Biol.Chem
  
  巻: 286(34) ページ: 29984-29992
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[雑誌論文] The crystal structure of SDR-type pyridoxal 4-dehydrogenase of Mesorhizobium loti.2011
- 著者名/発表者名
  Chu H.N., Mikami B., 他2名
- 雑誌名
  
  Biosci.Biotechnol.Biochem.
  
  巻: 75 ページ: 388-390
- NAID
  10027898248
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[雑誌論文] Crystal structure of bacterial cell-surface alginate-binding protein with an M_75 peptidase motif2011
- 著者名/発表者名
  Y.Maruyama, A.Ochiai, B.Mikami, W. Hashimoto & K.Murata
- 雑誌名
  
  Biochem.Biophys.Res.Commun
  
  巻: 405(3) ページ: 411-416
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[雑誌論文] Heterosubunit composition and crystal structures of a novel bacterial M16B metallopeptidase.2011
- 著者名/発表者名
  Yukie Maruyama, Asako Chuma, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata
- 雑誌名
  
  J.Mol.Biol. 407(1)
  
  ページ: 180-192
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20380049
[雑誌論文] Heterosubunit composition and crystal structures of a novel bacterial M16B metallopeptidase2011
- 著者名/発表者名
  Y.Maruyama, A.Chuma, B.Mikami, W. Hashimoto & K.Murata
- 雑誌名
  
  J.Mol.Biol
  
  巻: 407(1) ページ: 180-192
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[雑誌論文] Expression, purification and preliminary crystallization of amaranth 11S proglobulin seed storage protein from Amaranthus hypochondriacus L.2010
- 著者名/発表者名
  Tandang-Silvas M.R., Mikami B., 他5名
- 雑誌名
  
  Acta Cryatallogr.Sect.F
  
  巻: 66 ページ: 919-922
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[雑誌論文] High-throughput construction of expression system using yeast Pichia pastoris, and its application to membrane proteins.2010
- 著者名/発表者名
  Mizutani K., Mikami B., 他3名
- 雑誌名
  
  Protein Expr.Purif.
  
  巻: 77 ページ: 1-8
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[雑誌論文]2010
- 著者名/発表者名
  三上文三, 丸山伸之, 内海成
- 雑誌名
  
  大豆のすべて (喜多村啓介他編集) 第4章2節2 グロブリンタンパク質(サイエンスフォーラム)
  
  ページ: 115-121
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[雑誌論文] Crystal structure of the glycosidase family 73 peptidoglycan hydrolase FlgJ.2009
- 著者名/発表者名
  Wataru Hashimoto, Akihito Ochiai, Keiko Momma, Takafumi Itoh, Bunzo Mikami, Yukie Maruyama, Kousaku Murata
- 雑誌名
  
  Biochem.Biophys.Res.Commun. 381
  
  ページ: 16-21
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20380049
[雑誌論文] Crystal structure of a novel bacterial cell-surface flagellin binding to polysaccharide2008
- 著者名/発表者名
  Journal, Publications, Yukie, Maruyama, Misato, Momma, Bunzo, Mikami, Wataru, Hashimoto, Kousaku, Murata
- 雑誌名
  
  Biochemstry 47
  
  ページ: 1393-1402
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[雑誌論文] Crystal structure of a novel bacterial cell-surface flagellin binding to polysaccharide.2008
- 著者名/発表者名
  Yukie Maruyama, Misato Momma, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata
- 雑誌名
  
  Biochemstry 47(5)
  
  ページ: 1393-1402
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20380049
[雑誌論文] Crystal structure of UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase from Haemophilus influenzae in complex with UDP-N-acetylglucosamine and fosfomycin2008
- 著者名/発表者名
  H.-J., Yoon, S.-J., Lee, B., Mikami, H.-J., Park, J., Yoon, S.-W Suh
- 雑誌名
  
  Proteins 71(2)
  
  ページ: 1032-1037
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Crystal structure of UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase from Haemophilus influenzae in complex with2008
- 著者名/発表者名
  H. -J. Yoon, S. -J. Lee, B. Mikami, H. -J. Park, J. Yoon, S. -W. Suh
- 雑誌名
  
  Proteins 71
  
  ページ: 1032-1037
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Superchannel of bacteria : biological significance and new horizons2008
- 著者名/発表者名
  Kousaku, Murata, Shigeyuki, Kawai, Bunzo, Mikami, Wataru, Hashimoto
- 雑誌名
  
  Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 72
  
  ページ: 265-277
- NAID
  10027523626
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[雑誌論文] Superchannel of bacteria : biological significance and new horizons.2008
- 著者名/発表者名
  Kousaku Murata, Shigeyuki Kawai, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto
- 雑誌名
  
  Biosci. Biotechnol. Biochem. 72(2)
  
  ページ: 265-277
- NAID
  10027523626
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20380049
[雑誌論文] Crystal structure of glycoside hydrolase family 78 alpha-L-Rhamnosidase from Bacillus sp. GL1.2007
- 著者名/発表者名
  Z. Cui, Y. Maruyama, B. Mikami, W. Hashimoto, K. Murata
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol. 374
  
  ページ: 384-398
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] A structural factor responsible for substrate recognition by Bacillus sp. GL1 xanthan lyase that acts specifically on pyruvated side chains of xanthan2007
- 著者名/発表者名
  Y., Maruyama, B., Mikami, W., Hashimoto, K., Murata
- 雑誌名
  
  Biochemistry 46(3)
  
  ページ: 781-791
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Preliminary crystallographic analysis of L-2-keto-3-deoxyarabonate dehydratase, an enzyme involved in an2007
- 著者名/発表者名
  N. Shimada, B. Mikami, S. Watanabe, K. Makino
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr. F 63
  
  ページ: 393-395
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Crystal Structure of Glycoside Hydrolase Family 78 alpha-L-Rharnnosidase from Bacillus sp. GL12007
- 著者名/発表者名
  Z., Cui, Y., Maruyama, B., Mikami, W., Hashimoto, K., Murata
- 雑誌名
  
  J., Mol. Biol 374(2)
  
  ページ: 384-398
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Preliminary crystallographic analysis of L-2-keto-3-deoxyarabonate dehydratase, an enzyme involved in an alternative bacterial pathway of L-arabinose metabolism2007
- 著者名/発表者名
  N., Shimada, B., Mikami, S., Watanabe, K., Makino
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr., F 63(5)
  
  ページ: 393-395
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] A structural factor responsible for substrate recognition by Bacillus sp. GL1 xanthan lyase that acts specifically on pyruvated side chains of xanthan.2007
- 著者名/発表者名
  Y.Maruyama, B.Mikami, W.Hashimoto, K.Murata
- 雑誌名
  
  Biochemistry 46(3)
  
  ページ: 781-791
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Sequence and analysis of the 46.6-kb plasmid pAl from Sphingomonas sp. Al that corresponds to the typical IncP-113 plasmid backbone without any accessory gene2006
- 著者名/発表者名
  Karen, Mine, Harada, Yuji, Aso, Wataru, Hashimoto, Bunzo, Mikami, Kousaku, Murata
- 雑誌名
  
  Plasmid 56
  
  ページ: 11-23
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[雑誌論文] Crystal structure of pullulanase : Evidence for parallel binding of oligosaccharides in the active site.2006
- 著者名/発表者名
  B.Mikami, H.Iwamoto, M.Dominggus, H.J.Yoon, E.Demirkan-Sarikaya, Y.Mezaki, Y.Katsuya
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol. 359(3)
  
  ページ: 690-707
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Engineered membrane superchannel improves bioremediation potential of dioxin-degrading bacteria2006
- 著者名/発表者名
  Yuji, Aso, Yukiko, Miyamoto, Karen, Mine Harada, Keiko, Momma, Shigeyuki, Kawai, Wataru, Hashimoto, Bunzo, Mikami, Kousaku, Murata
- 雑誌名
  
  Nature Biotechnot 24
  
  ページ: 188-189
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[雑誌論文] Crystal structure of pullulanase : Evidence for parallel binding of oligosaccharides in the active site2006
- 著者名/発表者名
  B., Mikami, H., Iwamoto, M., Dominggus, H.-J., Yoon, E., Demirkan-Sarikaya, Y., Mezaki, Y., Katsuya
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol 359(3)
  
  ページ: 690-707
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Crystal structure of pullulanase: Evidence for parallel binding of oligosaccharides in the active site.2006
- 著者名/発表者名
  B. Mikami
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol. 359(3)
  
  ページ: 690-707
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Structure of 8Salpha globulin, the major seed storage protein of mung bean2006
- 著者名/発表者名
  T., Itoh, R.N., Garcia, M., Adachi, Y., Maruyama, E.M., Tecson-Mendoza, B., Mikami, S., Utsumi
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr., D 62(7)
  
  ページ: 824-832
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Structure of 8Salpha globulin, the major seed storage protein of mung bean.2006
- 著者名/発表者名
  T.Itoh, R.N.Garcia, M.Adachi, Y.Maruyama, E.M.Tecson-Mendoza, B.Mikami, S.Utsumi
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr. D 62(7)
  
  ページ: 824-832
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate lyases Al-II and Al-II' from Sphingomonas sp. Al2005
- 著者名/発表者名
  Masayuki, Yamasaki, Kohei, Ogura, Satoko, Moriwaki, Wataru, Hashimoto, Kousaku, Murata, Bunzo, Mikami
- 雑誌名
  
  Acta Crystallographica section 61
  
  ページ: 288-290
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[雑誌論文] Direct evidence for Sphingomonas sp. Al periplasmic proteins as macromolecule-binding proteins associated with the ABC transporter : molecular insights into alginate transport in the periplasm2005
- 著者名/発表者名
  Keiko, Momma, Yumiko, Mishima, Wataru, Hashimoto, Bunzo, Mikami, Kousaku, Murata
- 雑誌名
  
  Biochemistry 44
  
  ページ: 5053-5064
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[雑誌論文] Proteomics-based identification of outer-membrane proteins responsible for import of macromolecules in Sphingomonas sp. Al : alginate-binding flagellin on the cell surface2005
- 著者名/発表者名
  Wataru, Hashimoto, Jinshan, He, Yushin, Wada, Hirokazu, Nankai, Bunzo, Mikami, Kousaku, Murata
- 雑誌名
  
  Biochemistry 44
  
  ページ: 13783-13794
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[雑誌論文] A structural basis for depolymerization of alginate by polysaccharide lyase family-72005
- 著者名/発表者名
  Masayuki, Yamasaki, Kohei, Ogura, Wataru, Hashimoto, Bunzo, Mikami, Kousaku, Murata
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Biology 352
  
  ページ: 11-21
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[雑誌論文] Structure and function of bacterial super-biosystem responsible for import and depolymerization of macromolecules2005
- 著者名/発表者名
  Wataru, Hashimoto, Keiko, Mamma, Yukie, Maruyama, Masayuki, Yamasaki, Bunzo, Mikami, Kousaku, Murata
- 雑誌名
  
  Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 69
  
  ページ: 673-692
- NAID
  130000030348
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[雑誌論文] Structure, function and industrial application of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase from porcine kidney.2004
- 著者名/発表者名
  Isafumi Maru, Jyun Ohnishi, Yasuhiro Ohta, Takafumi Itoh, Wataru Hashimoto, Bunzo Mikami, Kousaku Murata
- 雑誌名
  
  Applied Microbiology 2(1)
  
  ページ: 12-21
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-14360052
[雑誌論文] Structure and function of a hypothetical Pseudomonas aeruginosa protein PA1167 classified into family PL-7.2004
- 著者名/発表者名
  Masayuki, Yamasaki, Satoko Moriwaki, Susumu Miyake, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata, Bunzo Mikami
- 雑誌名
  
  J.Biol.Chem. 279(30)
  
  ページ: 31863-31872
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-14360052
[雑誌論文] Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase, responsible for degradation of glycosaminoglycan, from Bacillus sp.GL1 at 1.8Å resolution.2004
- 著者名/発表者名
  Takafumi Itoh, Sae Akao, Wataru Hashimoto, Bunzo Mikami, Kousaku Murata
- 雑誌名
  
  J.Biol.Chem. 279(30)
  
  ページ: 31804-31812
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-14360052
[雑誌論文] Posttranslational processing of polysaccharide lyase : maturation route for gellan lyase in Bacillus sp.GL1.2002
- 著者名/発表者名
  Susumu Miyake, Eiko Kobayashi, Hirokazu Nankai, Wararu Hashimoto, Bunzo Mikami, Kousaku Murata
- 雑誌名
  
  Arch.Biochem.Biophys. 422
  
  ページ: 211-220
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-14360052
[産業財産権] 海洋バイオマスからのエタノール生産2009
- 発明者名
  村田幸作, 橋本渉, 河井重幸, 織田浩司, 庵原啓司, 三上文三, 竹田浩之, 米山史紀, 落合秋人
- 権利者名
  国立大学法人京都大学, 株式会社マルハニチロホールディングス
- 出願年月日
  2009-08-28
- 取得年月日
  2011-10-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[学会発表] 走化性発現に関わる細菌由来ペクチン結合タンパク質のドメインダイナミクス2021
- 著者名/発表者名
  穴水康太郎、髙瀬隆一、日尾守、渡辺大輔、三上文三、橋本渉
- 学会等名
  日本農芸化学会2021年度大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02166
[学会発表] 走化性発現に関わる細菌由来ペクチン認識タンパク質の立体構造2020
- 著者名/発表者名
  穴水康太郎、髙瀬隆一、日尾守、渡辺大輔、三上文三、橋本渉
- 学会等名
  第93回日本生化学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02166
[学会発表] プロバイオティクス性乳酸菌由来不飽和ウロン酸代謝の初発酵素KduIのX線結晶構造解析2020
- 著者名/発表者名
  山本雄大、髙瀬隆一、岩瀬久夢、渡辺大輔、三上文三、橋本渉
- 学会等名
  日本応用糖質科学会第46回近畿支部会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02166
[学会発表] フソバクテリアによる宿主動物由来細胞外グリコサミノグリカンの認識2019
- 著者名/発表者名
  老木紗予子、藪内駿、三上文三、高瀬隆一、橋本渉
- 学会等名
  第92回日本生化学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02166
[学会発表] 結晶構造解析によるアミラーゼの反応機構の解明2019
- 著者名/発表者名
  三上文三、坂直樹、森湖太郎、水谷公彦、高橋延行
- 学会等名
  日本農芸化学会2019年度大会（東京）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[学会発表] 細菌の金属輸送に関るEfeUOB系構成アルギン酸結合タンパク質のレアメタル結合性2019
- 著者名/発表者名
  奥村憲史、三上文三、橋本　渉、村田幸作
- 学会等名
  日本農芸化学会2019年度大会（東京）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[学会発表] 非凍結結晶を用いたβーアミラーゼ（E380A）と基質との複合体のpH変化の解析2018
- 著者名/発表者名
  三上文三、安達基泰、姜　有那、水谷公彦、高橋延行
- 学会等名
  日本農芸化学会2018年度大会（名古屋）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[学会発表] pH dependent conformational changes of β-amylase/glucose complex crystal measured at room temperature.2018
- 著者名/発表者名
  Bunzo Mikami, Xueni Hou, Kotaro Mori, Motoyasu Adachi, Youna Kang, Kimihiko Mizutani and Nobuyuki Takahashi
- 学会等名
  31st European Crystallographic Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[学会発表] Sphingomonas属細菌A1株由来アルギン酸結合タンパク質：EFハンド様モチーフに結合するカルシウムが構造を安定化する2018
- 著者名/発表者名
  奥村憲史、丸山如江、三上文三、村田幸作、橋本渉
- 学会等名
  第91回日本生化学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02166
[学会発表] X線結晶構造解析と部位特異的変異に基づくプロテイングルタミナーゼの機能解明2018
- 著者名/発表者名
  田中智紀、高橋延行、水谷公彦、山口庄太郎、三上文三
- 学会等名
  日本農芸化学会関西支部例会（第502回講演会）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[学会発表] Klebsiella pneumoniae pullulanase とcyclodextrinとの相互作用様式の解明2018
- 著者名/発表者名
  坂　直樹、田中啓一郎、山野小波、水谷公彦、高橋延行、岩本博行、三上文三
- 学会等名
  日本農芸化学会2018年度大会（名古屋）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[学会発表] ヘパリンの分解と代謝に関わる乳酸菌酵素系の構造・機能解析2018
- 著者名/発表者名
  岩瀬久夢、山田章文、河合桂吾、老木紗予子、三上文三、村田幸作、橋本　渉
- 学会等名
  日本農芸化学会関西支部第502回講演会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629
[学会発表] グリコサミノグリカンの輸送に関わる細菌タンパク質は二種類の基質結合型closed構造をとる2018
- 著者名/発表者名
  老木紗予子、佐藤賢宏、蒲地玲子、三上文三、村田幸作、橋本　渉
- 学会等名
  日本農芸化学会2018年度大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629
[学会発表] cis-ヒノキレジノール合成酵素による酵素反応の分子機構解明に向けたβサブユニットの X線結晶構造解析2018
- 著者名/発表者名
  東　篤志、坂　直樹、鈴木　史朗、山村　正臣、三上　文三、梅澤　俊明
- 学会等名
  第68回日本木材学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[学会発表] グリコサミノグリカンの輸送に関わる細菌由来基質結合タンパク質のドメインダイナミクス2017
- 著者名/発表者名
  老木紗予子、蒲地玲子、三上文三、村田幸作、橋本　渉
- 学会等名
  日本農芸化学会2017年度大会
- 発表場所
  京都女子大学（京都市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629
[学会発表] 非凍結結晶を用いたβ‐アミラーゼ／基質複合体のpHによる構造変化の解析2017
- 著者名/発表者名
  三上文三、河村和広。安達基泰、姜有那、水谷公彦、高橋延行
- 学会等名
  日本農芸化学会
- 発表場所
  京都女子大学
- 年月日
  2017-03-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[学会発表] 酸性多糖の輸送に関わる基質結合タンパク質とABCトランスポーターとの相互作用様式2017
- 著者名/発表者名
  金子あい、老木紗予子、丸山如江、三上文三、村田幸作、橋本　渉
- 学会等名
  2017年度生命科学系学会合同年次大会（第90回日本生化学会大会）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629
[学会発表] 貝類由来セルラーゼEG27IIのX線結晶構造解析および機能解析2017
- 著者名/発表者名
  野村泰介、水谷公彦、岩瀬久夢、高橋延行、三上文三
- 学会等名
  日本農芸化学会
- 発表場所
  京都女子大学
- 年月日
  2017-03-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[学会発表] pH Dependent conformational change of bound maltose observed in the crystal of β-amylase at room temperature2016
- 著者名/発表者名
  Bunzo Mikami, Youna Kang, Kimihiko Mizutani, Nobuyuki Takahashi
- 学会等名
  30th Meeting of the European Crystallographic Association
- 発表場所
  Basel, Switzerland
- 年月日
  2016-08-28
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04909
[学会発表] 病原性連鎖桿菌による動物細胞外マトリックス（グリコサミノグリカン）の分解2016
- 著者名/発表者名
  老木紗予子、三上文三、村田幸作、橋本　渉
- 学会等名
  第89回日本生化学会大会（2016年度）
- 発表場所
  仙台国際センター（仙台市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629
[学会発表] 酸性多糖の代謝に関わる還元酵素の補酵素要求性に関わる構造要因2016
- 著者名/発表者名
  高瀬隆一、丸山如江、老木紗予子、三上文三、村田幸作、橋本　渉
- 学会等名
  日本農芸化学会2016年度大会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター（札幌市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629
[学会発表] 動物細胞外マトリックス（グリコサミノグリカン）を基質とする病原性細菌ABCトランスポーター2016
- 著者名/発表者名
  老木紗予子、丸山如江、三上文三、村田幸作、橋本　渉
- 学会等名
  日本農芸化学会2016年度大会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター（札幌市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629
[学会発表] 甘味タンパク質ソーマチンの連続フェムト秒結晶構造解析2015
- 著者名/発表者名
  桝田哲哉、南後恵理子、菅原道泰、鈴木守、登野健介、城地保昌、亀島敬、PARK Jaehyun、SongChangyong、初井宇記、矢橋牧名、大久保喬平、三上文三、北畠直文、谷史人、岩田想
- 学会等名
  日本農芸化学会2015年度大会
- 発表場所
  岡山大学
- 年月日
  2015-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] β-アミラーゼ／マルトース不幸剛体結晶構造のpH変化2015
- 著者名/発表者名
  三上文三、河村和広、安達基泰、水谷公彦、高橋延行
- 学会等名
  日本農芸化学会2015年度大会
- 発表場所
  岡山大学
- 年月日
  2015-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] グリコサミノグリカン輸送に関わる連鎖桿菌由来基質結合タンパク質のX線結晶構造解析2015
- 著者名/発表者名
  老木紗予子、丸山如江、三上文三、村田幸作、橋本　渉
- 学会等名
  日本農芸化学会2015年度中部・関西支部合同大会
- 発表場所
  富山県立大学（射水市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04629
[学会発表] 麹菌Aspergillus oryzae由来グルコアミラーゼのX線構造解析2015
- 著者名/発表者名
  永吉恵美、水谷公彦、高橋延行、三上文三、瀧井幸男
- 学会等名
  日本農芸化学会2015年度大会
- 発表場所
  岡山大学
- 年月日
  2015-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] 連鎖球菌による哺乳類細胞外マトリクス（グルコサミノグリカン）の分解：不飽和グルクニルヒドロラーゼの反応機構2015
- 著者名/発表者名
  中道優介、老木紗予子、三上文三、村田幸作、橋本渉
- 学会等名
  日本農芸化学会2015年度大会
- 発表場所
  岡山大学
- 年月日
  2015-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] 市街吸収分光法とX線結晶構造解析によるリジル‐tRNA合成酵素とL‐リジンの結合の解析およびその融合適合機構に対する洞察2015
- 著者名/発表者名
  滝田禎亮、三上文三、井上國世
- 学会等名
  日本農芸化学会2015年度大会
- 発表場所
  岡山大学
- 年月日
  2015-03-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] イネにおけるジベレリン代謝酵素の構造と機能解析2015
- 著者名/発表者名
  竹原清日、三上文三、樫尾徹、松岡信、上口美弥子
- 学会等名
  日本農芸化学会2015年度大会
- 発表場所
  岡山大学
- 年月日
  2015-03-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] ダイズβ-アミラーゼのSer297及びIl299変異体の酵素化学的性質と結晶構造2014
- 著者名/発表者名
  河村和広、水谷公彦、高橋延行、三上文三
- 学会等名
  2014年度日本農芸化学会関西支部大会（第486回講演会）
- 発表場所
  ・奈良先端科学技術大学院大学
- 年月日
  2014-09-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] 新規フェノールオキシダーゼの立体構造が示唆するタイプ3銅蛋白質の機能分化について2014
- 著者名/発表者名
  増田太郎、百次恭祐、平田孝、三上文三
- 学会等名
  日本農芸化学会2014年度大会
- 発表場所
  明治大学生田キャンパス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24658287
[学会発表] N-末端ドメインが関与する植物型フェリチンの鉄放出機構2013
- 著者名/発表者名
  増田太郎、森本晋一郎、三上文三、豊原治彦
- 学会等名
  日本農芸化学会大会
- 発表場所
  東北大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24658287
[学会発表] X線結晶構造解析によるダイズβ-アミラーゼの反応機構の解明2013
- 著者名/発表者名
  三上文三、姜有那、安達基泰、河村和広、水谷公彦、高橋延行
- 学会等名
  日本農芸化学2013年度大会
- 発表場所
  東北大学川内北キャンパス(宮城県仙台市)
- 年月日
  2013-03-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] 細菌由来アルギン酸 ABC トランスポーターの立体構造と基質輸送2013
- 著者名/発表者名
  丸山如江, 金子あい, 三上文三, 橋本渉, 村田幸作 (京大院・農)
- 学会等名
  日本農芸化学会2013年度大会
- 発表場所
  東北大学・仙台市
- 年月日
  2013-03-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[学会発表] 体腔依存多糖取り込み ABC トランスポーターの構造機能相関とその応用2013
- 著者名/発表者名
  橋本渉, 丸山如江, 三上文三, 村田幸作 (京大院・農)
- 学会等名
  日本農芸化学会2013年度大会 (シンポジウム)
- 発表場所
  東北大学・仙台市
- 年月日
  2013-03-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[学会発表] 多糖アルギン酸の取り込みに関わる細菌由来 ABC トランスポーターの X 線結晶構造解析2012
- 著者名/発表者名
  丸山如江, 伊藤貴文, 西谷悠, 三上文三, 橋本渉, 村田幸作 (京大院・農)
- 学会等名
  日本農芸化学会2012年度大会
- 発表場所
  京都女子大学・京都市
- 年月日
  2012-03-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[学会発表] X線結晶構造解析によるダイズβ-アミラーゼの反応機構の解明2012
- 著者名/発表者名
  三上文三, 他5名
- 学会等名
  2012年度農芸化学会大会
- 発表場所
  京都女子大学
- 年月日
  2012-03-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[学会発表] 結晶構造から生化学へ-X線結晶構造解析による酵素機能の解明-機能解析における問題点2012
- 著者名/発表者名
  三上文三
- 学会等名
  第59回日本生化学会近畿支部例会シンポジウム
- 発表場所
  京都大学宇治キャンパス(京都府宇治市)
- 年月日
  2012-05-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] 細菌 ABC トランスポーターと連携する基質結合タンパク質によるヘテロ多糖アルギン酸の認識機構2012
- 著者名/発表者名
  西谷悠, 丸山如江, 伊藤貴文, 三上文三, 橋本渉, 村田幸作(京大院・農)
- 学会等名
  2012年度日本農芸化学会関西支部大会
- 発表場所
  京都学園大学・亀岡市
- 年月日
  2012-09-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[学会発表] 高等植物型フェリチンのN-末端領域の構造と機能2012
- 著者名/発表者名
  増田太郎、森本晋一郎、三上文三、豊原治彦
- 学会等名
  日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  名古屋国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24658287
[学会発表] X線結晶構造解析によるダイズβ-アミラーゼの反応機構の解明2012
- 著者名/発表者名
  三上文三、奥村覚二、山田壮介、安達基泰、水谷公彦、高橋延行
- 学会等名
  日本農芸化学会2012年度大会
- 発表場所
  京都女子大学
- 年月日
  2012-03-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[学会発表] X線結晶構造解析による酵素機能の解明2012
- 著者名/発表者名
  三上文三
- 学会等名
  日本農芸化学会関西支部第477回講演会
- 発表場所
  神尸大学大農学部(兵庫県神戸市)(招待講演)
- 年月日
  2012-12-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] Crystal Structure of Protein-Glutaminase and Its Pro-Structures Similar to Enzyme- Substrate Complex2012
- 著者名/発表者名
  Mikami B., Hashizume R., Mizutani K., Takahashi N., Matsubara H., Matsunaga A., Yamaguchi S.
- 学会等名
  27th European Crystallographic Meetings
- 発表場所
  Bergen, Norway
- 年月日
  2012-08-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] 結晶構造に基づくβ-アミラーゼの活性部位ループの機能解析2011
- 著者名/発表者名
  三上文三, 他3名
- 学会等名
  2011年度農芸化学会大会
- 発表場所
  京都女子大学
- 年月日
  2011-03-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[学会発表] 多糖アルギン酸を取り込む細菌由 ABC トランスポーターと基質結合タンパク質の相互作用に関する構造機能解析2011
- 著者名/発表者名
  西谷悠, 丸山如江, 伊藤貴文, 三上文三, 橋本渉, 村田幸作(京大院・農)
- 学会等名
  2011年度日本農芸化学会関西・中部支部合同大会
- 発表場所
  京都大学・京都市
- 年月日
  2011-10-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[学会発表] Sphingomonas属細菌A1株由来細胞表層に局在するアルギン酸結合タンパク質の遺伝子発現とX線結晶構造解析2010
- 著者名/発表者名
  橋本渉、丸山如江、落合秋人、三上文三、村田幸作
- 学会等名
  日本農芸化学会関西支部大会
- 発表場所
  奈良(口頭発表)
- 年月日
  2010-10-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20380049
[学会発表] 結晶構造に基づいたアミラーゼの触媒機能の解明2010
- 著者名/発表者名
  三上文三
- 学会等名
  第11回関西グライコサイエンスフォーラム
- 発表場所
  大阪市立大学
- 年月日
  2010-05-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[学会発表] ダイズβ-アミラーゼのフレキシブルループ変異体の結晶構造2010
- 著者名/発表者名
  三上文三, 他3名
- 学会等名
  2010年度農芸化学会大会
- 発表場所
  東京大学
- 年月日
  2010-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[学会発表] 結晶構造に基づいたアミラーゼの触媒機能の解明2010
- 著者名/発表者名
  三上文三
- 学会等名
  第11回関西グライコサイエンスフォーラム
- 発表場所
  大阪市立大学学術情報総合センター
- 年月日
  2010-05-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21380064
[学会発表] Sphingomonas属細菌A1株由来ペプチドグリカン分解酵素の立体構造に基づく触媒機構解析2010
- 著者名/発表者名
  丸山如江、落合秋人、三上文三、橋本渉、村田幸作
- 学会等名
  日本農芸化学会関西支部大会
- 発表場所
  奈良(口頭発表)
- 年月日
  2010-10-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20380049
[学会発表] ファミリーGH73ペプチドグリカン分解酵素のX線結晶構造2009
- 著者名/発表者名
  橋本渉、落合秋人、門間敬子、丸山如江、伊藤貴文、三上文三、村田幸作
- 学会等名
  日本農芸化学会2009年度大会
- 発表場所
  福岡(口頭発表)
- 年月日
  2009-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20380049
[学会発表] Crystal structure of $v β-amylase with mutated residues on flexible loop2008
- 著者名/発表者名
  B., Mikami, A., Tanabe, T., Saito, Y., Toyoda, S., Utsumi
- 学会等名
  The Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
- 発表場所
  Meijo University, Nagoya
- 年月日
  2008-03-28
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[学会発表] 大豆β-アミラーゼのフレキシブルループ変異体の結晶構造2008
- 著者名/発表者名
  三上文三
- 学会等名
  日本農芸化学会2008年度大会
- 発表場所
  名城大学
- 年月日
  2008-03-28
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[学会発表] ダイズβ-アミラーゼのフレキシブルループ変異体の結晶構造2008
- 著者名/発表者名
  三上文三、田邊愛子、斉藤友宏、豊田康明、内海成
- 学会等名
  日本農芸化学会
- 発表場所
  名城大学
- 年月日
  2008-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[学会発表] Al flagellin based on the crystal structure and Kousaku Murata. Polysaccharide-binding ability and cell surface localization of Sphingomonas sp2007
- 著者名/発表者名
  Yukie, Maruyama, Misato, Momma, Asako, Chuma, Bunzo, Mikami, Wataru, Hashimoto
- 学会等名
  Regular Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and, Agrochemistry, Kansai Branch
- 発表場所
  Kyoto Prefectural University
- 年月日
  2007-05-26
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[学会発表] X-ray crystallography and functional conversion of proteins2007
- 著者名/発表者名
  B., Mikami
- 学会等名
  The Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
- 発表場所
  Tokyo University, Tokyo
- 年月日
  2007-03-27
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[学会発表] タンパク質の結晶構造解析と機能変換2007
- 著者名/発表者名
  三上文三
- 学会等名
  日本農芸化学会2007年度大会
- 発表場所
  東京農業大学
- 年月日
  2007-03-27
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[学会発表] Structure and function relationship of plant seed storage proteins2007
- 著者名/発表者名
  T., Fukuda, T., Itoh, Y., Maruyama, N., Maruyama, B., Mikami, S., Utsumi
- 学会等名
  The Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
- 発表場所
  Tokyo Yniversity, Tokyo
- 年月日
  2007-03-25
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18380067
[学会発表] Structural factors for substrate specificity of alginate lyases belonging to polysaccharide Ivase families 5 and 72007
- 著者名/発表者名
  Kohei, Ogura, Masayuki, Yamasaki, Wataru, Hashimoto, Bunzo, Mikami, Kousaku, Murata
- 学会等名
  Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
- 発表場所
  Tokyo University of Agriculture
- 年月日
  2007-03-26
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[学会発表] Crystallographic study on structure and function relationship of flagellin on the cell surface of Sphingomonas sp. Al2007
- 著者名/発表者名
  Yukie, Maruyama, Misato, Momma, Bunzo, Mikami, Wataru, Hashimoto, Kousaku, Murata
- 学会等名
  Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
- 発表場所
  Tokyo University of Agriculture
- 年月日
  2007-03-25
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[学会発表] Catalytic reaction mechanism and substrate specificity of PL7 alginate lyase2006
- 著者名/発表者名
  Kohei, Ogura, Masayuki, Yamasaki, Wataru, Hashimoto, Bunzo, Mikami, Kousaku, Murata
- 学会等名
  Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
- 発表場所
  Kyoto Women's University
- 年月日
  2006-03-27
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[学会発表] Crystallization of alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens C582005
- 著者名/発表者名
  Akihito, Ochiai, Wataru, Hashimoto, Bunzo, Mikami, Kousaku, Muratra
- 学会等名
  Annual Meeting of The Society for Biotechnology
- 発表場所
  Tsukuba International Congress Center, Japan
- 年月日
  2005-11-16
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[学会発表] Structural and functional analyses of PL-7 alginate lyase2005
- 著者名/発表者名
  Kohei, Ogura, Masayuki, Yamasaki, Wataru, Hashimoto, Bunzo, Mikami, Kousaku, Murata
- 学会等名
  Annual Meeting of The Society for Biotechnology
- 発表場所
  Tsukuba International Congress Center, Japan
- 年月日
  2005-11-16
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[学会発表] Similarity in catalytic reaction mechanism of alginate lyases with different structural scaffold2005
- 著者名/発表者名
  Masayuki, Yamasaki, Kohei, Ogura, Wataru, Hashimoto, Kousaku, Murata, Bunzo, Mikami
- 学会等名
  Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry, Kansai Branch
- 発表場所
  Osaka University
- 年月日
  2005-09-30
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17380053
[学会発表] Ｘ線結晶構造解析によるダイズβ-アミラーゼの反応機構の解明
- 著者名/発表者名
  三上文三、姜有那、安達基泰、河村和広、水谷公彦、高橋延行
- 学会等名
  日本農芸化学２０１４年度大会
- 発表場所
  明治大学生田キャンパス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] 立体構造が示唆する甲殻類フェノールオキシダーゼとヘモシアニンの機能的差異
- 著者名/発表者名
  増田太郎、百次恭祐、平田孝、三上文三
- 学会等名
  日本水産学会2014年度秋期大会
- 発表場所
  九州大学
- 年月日
  2014-09-24 – 2014-09-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24658287
[学会発表] 結晶構造から探る食品関連酵素の機能
- 著者名/発表者名
  三上文三
- 学会等名
  アグリバイオシンポジウム２０１３
- 発表場所
  近畿大学農学部
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] 細菌由来アルギン酸ABCトランスポーターの立体構造と基質輸送
- 著者名/発表者名
  ○丸山如江、金子あい、三上文三、橋本　渉、村田幸作（京大院・農）
- 学会等名
  日本農芸化学会2013年度大会
- 発表場所
  東北大学（仙台市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[学会発表] 体腔依存多糖取り込みABCトランスポーターの構造機能相関とその応用
- 著者名/発表者名
  ○橋本　渉、丸山如江、三上文三、村田幸作（京大院・農）
- 学会等名
  日本農芸化学会2013年度大会（シンポジウム）
- 発表場所
  東北大学（仙台市）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23380049
[学会発表] Crystal structure of a crustacean prophenoloxidase elucidates the functional difference of the type 3 copper proteins.
- 著者名/発表者名
  Taro Masuda, Kyosuke Momoji, Takashi Hirata, Bunzo Mikami
- 学会等名
  欧州生物無機化学会(EUROBIC12)
- 発表場所
  チューリッヒ大学
- 年月日
  2014-08-24 – 2014-08-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24658287
[学会発表] Structure and Function Analysis of Geobacillus Starch Antistaling Enzyme (SAS)
- 著者名/発表者名
  Bunzo Mikami, Hirotaka Bitoh, Yurie Anzai, Kimihiko Mizutani, Nobuyuki Takahashi, Masamichi Okada, Shotaro, Yamaguchi
- 学会等名
  23rd Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
- 発表場所
  Montreal, Canada
- 年月日
  2014-08-05 – 2014-08-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] 微生物由来トランスグルタミナーゼの活性部位とプロ領域ペプチドとの相互作用
- 著者名/発表者名
  森光平、小林淳、吉村　卓也、水谷公彦、高橋延行、星由起子、山口庄太郎、三上文三
- 学会等名
  日本農芸化学会関西支部第 479 回講演会
- 発表場所
  京都府立大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24380054
[学会発表] 甲殻類由来新規フェノールオキシダーゼの立体構造が示唆するタイプ3銅蛋白質の機能的際に関する分子基盤
- 著者名/発表者名
  増田太郎、百次恭祐、平田孝、三上文三
- 学会等名
  日本蛋白質科学会2014年度年会
- 発表場所
  ワークピア横浜
- 年月日
  2014-06-25 – 2014-06-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24658287

1. 村田幸作 (90142299)

共同の研究課題数: 8件

共同の研究成果数: 52件
2. 橋本渉 (30273519)

共同の研究課題数: 8件

共同の研究成果数: 63件
3. 山下穂波 (90252519)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 0件
4. 広瀬正明 (60026523)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
5. 高橋延行 (20252520)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
6. 恩田真紀 (60311916)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
7. 多田俊治 (70275288)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
8. 森田雄平 (50027174)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
9. 相原茂夫 (20027197)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
10. 丸山如江 (90397563)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 9件
11. 高瀬隆一 (10842156)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
12. 豊原治彦 (90183079)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 増田太郎 (40395653)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 8件
14. 鶴田宏樹 (20346282)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 丸山伸之 (90303908)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 木下誉富 (90405340)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 鈴木徹 (70344330)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 井上広滋 (60323630)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 山崎正幸 (80397562)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 小倉康平 (00586612)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 老木紗予子 (40843090)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 渡辺大輔 (30527148)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. HEHRE Edwaed

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. SACCHETTINI ジェイムズシイ

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
25. SACCHETTINI James c.

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. Lomas David A.

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
27. Miranda Elena

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
28. 永田崇

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
29. 神谷成敏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
30. 鈴木守

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
31. 森田大輔

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

三上 文三 MIKAMI Bunzo

研究課題

研究成果

共同研究者

非凍結X線結晶構造解析による酵素機能の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

食糧関連タンパク質・酵素の機能解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

食品関連酵素の可動ループ機能の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

食糧関連酵素のループ機能の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

三上文三 MIKAMI Bunzo