神藤平三郎 SHINDO Heisaburo

研究者番号	80138966
その他のID
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2009年度: 独立行政法人農業生物資源研究所, タンパク質機能研究ユニット, 外来研究員 2007年度: 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 植物科学研究領域タンパク質機能研究ユニット, 特別研究員 1999年度 – 2005年度: 東京薬科大学, 薬学部, 教授 1994年度 – 1998年度: 東京薬科大学, 薬学部, 助教授 1990年度 – 1992年度: 東京薬科大学, 薬学部, 助教授 1986年度 – 1987年度: 東京薬科大学, 薬学部, 助教授 1986年度: 東京薬大, 薬学部, 助教授
審査区分/研究分野	研究代表者生物系 / 生体物性学 / 物理系薬学 / 物理系薬学研究代表者以外機能生物化学 / 構造生物化学 / 生体物性学
キーワード	研究代表者 NMR / ヌクレオソーム / 転写抑制機構 / クロマチン / Ume6p / CD / Siz1 / PIASy / PIAS1 / Helix dipole … もっと見る / Charge interaction / CD-melting / 熱測定 / Rme1p / Dynamics of DNA / Structure of bulge loop / Structure of hairpin loop / cro repressor / HU protein / Structure and function of tRNA / Structures of DNA / Hu-DNA複合体 / Croリプレッサー / ヘアピンループ / 制限酵素 / tRNA / DNA / X線回析 / DNAの分子運動 / バルジループの構造 / Cro蛋白質ヘアピンループの構造 / Hu蛋白質 / tRNAの構造と機能 / DNA構造の多形 / conformational change / oligonucleotide / Structure and Dynamics of DNA / ^2H NMR / ^1H NMR / ^<31>P NMR / 重水素NMR / 分子運動 / オリゴ核酸 / DNA繊維 / 化学シフト / オリゴヌクレオチド / プロトンNMR / 運動 / DNAの構造 / transcription factor Lef-1 / NMR structure / Tumor seppresor p53 / SUMO ligase / DNA結合蛋白質 / SAPドメイン / SUMOリガーゼ / 転写因子Lef-1 HMG / NMR構造 / 癌抑制因子p53 / SUMO リガーゼ / Guanidine hydrochloride / Urea denaturation / Point mutant / Yhhp protein / N-キャッピング / 点変異体 / YhhP蛋白質 / 塩酸グアニジン / 尿素 / CD melting / 塩酸グアニジン変性 / 尿素変性 / Point mutants / YhhP / Chemical modifications / Nucleosome / Chromatin / Thermal property / Triplet repeat / Structural morphorism / DNA triplex / 熱安定性 / トリプレットリピート / 化学修飾 / トリプレットリート / 構造多形 / 三重鎖DNA / non-βDNA / ヒストンHH01 / Rme1 / Yhhp / SNF2 / SWI / ブロモドメイン / 構造 / DNA結合タンパク質 / Zm-finger / Zn-finger … もっと見る研究代表者以外 NMR / DNA / X線結晶解析 / 立体構造 / タンパク質 / 塩基配列 / 核磁気共鳴(NMR) / コンホメーション / 核酸ドメイン / 構造生物学 / 分子認識 / 蛋白質 / Myb / がん遺伝子産物 / Mybタンパク質 / 高次構造 / Antisense / Computer simulation / Thermodynamics / Triplex DNA / アンチセンス / 計算機シミュレーション / 熱力学 / 三重鎖DNA / Molecular Biology / RNA-binding Proteins / DNA-binding Proteins / Transcription Factors / X-ray Crystallography / Structural Biology / X線結晶 / 転写因子 / 構造生理学 / ヒストン認識 / DNA結合 / SUMOリガーゼ / SUMO化翻訳後修飾 / 生物物理 / DNA結合ドメイン / がン遺伝子産物 / DNA給合ドメイン / 転写調節 / DNA結合蛋白質 / OmpR / DNAの湾曲 / ラマン分光 / DNA結合タンパク質隠す

SUMOリガーゼPIAS/Sizファミリーのドメイン構造と分子認識機構の解明
- 研究代表者
  
  山崎俊正
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2009
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  独立行政法人農業生物資源研究所
SUMOリガーゼPIASのドメイン構造とその標的蛋白質p53との特異的相互作用研究代表者
- 研究代表者
  
  神藤平三郎
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2005
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  物理系薬学
- 研究機関
  東京薬科大学
YhhP蛋白質の構造の安定性に及ぼす新規N-キャップモチーフCPxPの配列効果研究代表者
- 研究代表者
  
  神藤平三郎
- 研究期間 (年度)
  2002 – 2003
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  物理系薬学
- 研究機関
  東京薬科大学
転写不活性因子-クロマチンの相互作用ネットワークの構造基盤研究代表者
- 研究代表者
  
  神藤平三郎
- 研究期間 (年度)
  2001
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京薬科大学
転写不活性因子-クロマチンの相互作用ネットワークの構造基盤研究代表者
- 研究代表者
  
  神藤平三郎
- 研究期間 (年度)
  2000
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京薬科大学
転写不活性因子-クロマチンの相互作用ネットワークの構造基盤研究代表者
- 研究代表者
  
  神藤平三郎
- 研究期間 (年度)
  1999
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京薬科大学
転写不活性因子ークロマチンの相互作用ネットワークの構造基盤研究代表者
- 研究代表者
  
  神藤平三郎
- 研究期間 (年度)
  1998
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京薬科大学
三重鎖DNAの構造多形とトリプレットリピート配列研究代表者
- 研究代表者
  
  神藤平三郎
- 研究期間 (年度)
  1998 – 1999
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  物理系薬学
- 研究機関
  東京薬科大学
三重鎖DNA形成のメカニズムとアンチセンスとしての応用
- 研究代表者
  
  皿井明倫
- 研究期間 (年度)
  1997 – 2000
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  機能生物化学
- 研究機関
  理化学研究所
蛋白質高次構造のDNA シグナル認識における役割
- 研究代表者
  
  西村善文
- 研究期間 (年度)
  1994 – 1997
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  横浜市立大学
蛋白質が認識するDNA構造
- 研究代表者
  
  西村善文
- 研究期間 (年度)
  1992
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  横浜市立大学
遺伝子調節機構の立体構造とダイナミクスの研究調査
- 研究代表者
  
  西村善文
- 研究期間 (年度)
  1992
- 研究種目
  
  総合研究(B)
- 研究分野
  
  生体物性学
- 研究機関
  横浜市立大学
蛋白質が認識するDNA構造
- 研究代表者
  
  西村善文
- 研究期間 (年度)
  1991
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  横浜市立大学
蛋白質が認識するDNA構造
- 研究代表者
  
  西村善文
- 研究期間 (年度)
  1990
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  横浜市立大学
核酸構造の多様性とその識別研究代表者
- 研究代表者
  
  神藤平三郎
- 研究期間 (年度)
  1986 – 1987
- 研究種目
  
  総合研究(A)
- 研究分野
  
  生体物性学
- 研究機関
  東京薬科大学
核酸ドメインのコンホメーション解析
- 研究代表者
  
  大井龍夫
- 研究期間 (年度)
  1985 – 1986
- 研究種目
  
  特定研究
- 研究機関
  京都大学
核酸ドメインのコンホメーション解析
- 研究代表者
  
  大井龍夫
- 研究期間 (年度)
  1985 – 1987
- 研究種目
  
  特定研究
- 研究機関
  京都大学
塩基配列に依存するオリゴ核酸の構造、運動性および熱力学的性質研究代表者
- 研究代表者
  
  神藤平三郎
- 研究期間 (年度)
  1984 – 1986
- 研究種目
  
  一般研究(B)
- 研究分野
  
  生体物性学
- 研究機関
  東京薬科大学

すべて 2009 2007 2005 2004

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Solution structures and DNA binding properties of the N-terminal SAP domains of SUMO E3 ligases from Saccharomyces cerecisiae and Oryza sativa2009
- 著者名/発表者名
  Suzuki R, Shindo H, Tase A, Kikuchi Y, Shimizu M, Yamazaki T
- 雑誌名
  
  Proteins 75(2)
  
  ページ: 336-347
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570115
[雑誌論文] Solution structures and DNA binding properties of the N-terminal SAP domains of SUMO E3 ligases from Saccharomyces cervisiae and Oryza sativa.2009
- 著者名/発表者名
  Suzuki R, Shindo H, Tase A, Kikuchi Y, Shimizu M, Yamazaki T
- 雑誌名
  
  PROTEINS 75(2)
  
  ページ: 336-347
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570115
[雑誌論文] Mitochondria-specific RNA-modifying Enzymes Respongible for the Biosynthesis of the Wobble Base in Mitochondrial tRNAs2005
- 著者名/発表者名
  N.Umeda, T.Suzuki, M.Yukawa, Y.Ohya, H.Shindo, K.Watanabe, T.Suzuki
- 雑誌名
  
  J.Biol.Chem. 280
  
  ページ: 1613-1624
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16590034
[雑誌論文] Mitochondria-specific RNA-modifying Enzymes Respongible for the Biosynthesis of the Wobble Base in Mitochondrial tRNAs2005
- 著者名/発表者名
  N.Umeda, T.Suzuki, M.Yukawa, Y.Ohya, H.Shindo, K.Watanabe, T.Suzuki
- 雑誌名
  
  J. Biol. Chem 280
  
  ページ: 1613-1624
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16590034
[雑誌論文] Hydrogen-bond patterns in the hydration structure of a protein2005
- 著者名/発表者名
  T.Yokomizo, M.Nakasako, T.Yamazaki, H.Shindo, J.Higo
- 雑誌名
  
  Chem.Phys.Lett. 401
  
  ページ: 332-336
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16590034
[雑誌論文] NMR structure of the N-termnal domain of SUMO ligase PIAS1 and its interaction with tumor supressor p53 and A/T-rich DNA oligomers2004
- 著者名/発表者名
  S.Okubo, F.Hara, Y.Tsuchida, S.Shimotakahara, S.Suzuki, H.Hatanaka, S.Yokoyama, H.Tanaka, H.Yasuda, H.Shindo
- 雑誌名
  
  J.Biol.Chem. 279(30)
  
  ページ: 31455-31461
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16590034
[学会発表] Structure and function of the N-terminal domains of SUMO ligase Siz/PIAS family2007
- 著者名/発表者名
  Yamazaki T, Suzuki R, Tase A, Nishiuchi Y, Shindo H
- 学会等名
  The 4th International Peptide Symposium
- 発表場所
  Cairns, Australia
- 年月日
  2007-10-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570115
[学会発表] N-terminal SAP and PHD-finger domains of SUMO ligase Siz1 from Oryza sativa are essential for recognition of methylated histone as well as DNA binding2007
- 著者名/発表者名
  Yamazaki T, Suzuki R, Tase A, Nishiuchi Y, Shindo H
- 学会等名
  第47回NMR討論会
- 発表場所
  札幌
- 年月日
  2007-09-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570115
[学会発表] NMR structures and self-sumoylation of the N-terminal SAP domains of SUMO ligase PIAS/Siz family2007
- 著者名/発表者名
  Suzuki R, Shindo H, Tase A Yamazaki T
- 学会等名
  第47回NMR討論会
- 発表場所
  札幌
- 年月日
  2007-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570115
[学会発表] Structure and function of the N-terminal domains of SUMO ligase Siz/PIAS family2007
- 著者名/発表者名
  Yamazaki T, Suzuki R, Tase A, Nishiuchi Y, Shindo H
- 学会等名
  The 4^<th> International Peptide Symposium
- 発表場所
  Cairns,Australia
- 年月日
  2007-10-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570115
[学会発表] NMR structures and self-sumoylation of the N-terminal SAP domains of SUMO PIAS/Siz family2007
- 著者名/発表者名
  Suzuki R, Shindo H, Tase A, Yamazaki T
- 学会等名
  第47回NMR討論会
- 発表場所
  札幌
- 年月日
  2007-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570115

1. 京極好正 (90012632)

共同の研究課題数: 7件

共同の研究成果数: 0件
2. 西村善文 (70107390)

共同の研究課題数: 6件

共同の研究成果数: 0件
3. 水野猛 (10174038)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 0件
4. 上杉晴一 (70028851)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 0件
5. 清水光弘 (80231364)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 0件
6. 西川一八 (60109262)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
7. 横山茂之 (00159229)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
8. 箱嶋敏雄 (00164773)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
9. 甲斐荘正恒 (20137029)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
10. 藤井敏 (10107104)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
11. 磯野克己 (70011640)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
12. 山崎俊正 (40360458)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 7件
13. 白木原康雄 (20150287)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 山崎俊夫 (60273710)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 石井俊輔 (00124785)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 皿井明倫 (20221286)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 鳥越秀峰 (80227678)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 横山一成 (80182707)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 月向邦彦 (10023467)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 陶山明 (90163063)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 今川正良 (20136823)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 大井龍夫 (00027012)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 大井龍夫 (00027004)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. PICHIERRI Fabio

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
25. PICHIERRI Fa

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

神藤 平三郎 SHINDO Heisaburo

研究課題

研究成果

共同研究者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

SUMOリガーゼPIASのドメイン構造とその標的蛋白質p53との特異的相互作用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

YhhP蛋白質の構造の安定性に及ぼす新規N-キャップモチーフCPxPの配列効果研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

転写不活性因子-クロマチンの相互作用ネットワークの構造基盤研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

転写不活性因子-クロマチンの相互作用ネットワークの構造基盤研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

転写不活性因子-クロマチンの相互作用ネットワークの構造基盤研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

転写不活性因子ークロマチンの相互作用ネットワークの構造基盤研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

三重鎖DNAの構造多形とトリプレットリピート配列研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

核酸構造の多様性とその識別研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

神藤平三郎 SHINDO Heisaburo