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沖 真弥  Oki Shinya

研究者番号 90452713
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0002-4767-3259
所属 (現在) 2025年度: 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2024年度: 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 教授
2019年度 – 2023年度: 京都大学, 医学研究科, 特定准教授
2018年度 – 2019年度: 九州大学, 医学研究院, 講師
2017年度: 九州大学, 医学研究院, 助教
2011年度 – 2015年度: 九州大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教
2013年度: 九州大学, 医学研究院, 助教
2009年度 – 2010年度: 九州大学, 医学研究院, 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
発生生物学 / 小区分48040:医化学関連 / 小区分56040:産婦人科学関連 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 複雑系疾病論
研究代表者以外
発生生物学 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 小区分40020:木質科学関連 / 小区分57070:成長および発育系歯学関連 / 複合領域 / 生物系
キーワード
研究代表者
エピゲノム / 空間トランスクリプトーム / Noncoding SNP / GWAS / ChIP-seq / 多分化能 / エピブラスト / Nodal / 転写制御機構 / 環境因子 … もっと見る / 一塩基多型 / ゲノム多型 / 空間オミクス解析 / 制御機構 / 遺伝子発現 / ATAC-seq / 空間オミクス / 転写因子 / SNP / 原条形成 / 中胚葉誘導 / マウス初期発生 / 多能性 / マウスエピブラスト / 動物 / 発生・分化 / シグナル伝達 / 細胞・組織 / 再生医学 … もっと見る
研究代表者以外
ゲノム / 転写因子 / 左右軸形成 / 遺伝 / 染色体 / 生殖細胞 / 生殖 / 壁層形成 / フェルラ酸 / 壁層 / 植物細胞壁 / S2層 / ヘミセルロース / S2層 / 二次壁 / 細胞壁 / 疾患モデル / 遺伝子変異 / 口唇口蓋裂 / Gata3 / レチノイン酸シグナル / ゲノム解析 / 動物モデル / 希少疾患 / 顎顔面形成不全 / ソフトウェア / 次世代シークエンス / ChIPシークエンス / 発生・分化 / 胚発生 / データーベース / 遺伝子発現 / ChIP-seq / データベース / 左右軸 / タンパク質-DNA相互作用 / 発現制御 / PLA法 / ゲノムDNA / 基盤・社会脳科学 / 社会脳科学 脳計測科学 / 脳科学 基盤 / 脳計測科学 / 基板・社会脳科学 / 基盤 / 脳科学 / 母仔分離超音波発声 / 神経発生 / REST / ヒストン修飾 / DNAメチル化 / エピジェネティクス / 精子形成 / 父加齢 / ダウンレギュレーション / リソソーム / 細胞シグナル / オルガネラ酸性化 / Wntシグナル / 小胞輸送 / エンドサイトーシス / 多能性幹細胞 / 原腸胚形成 / 細胞外シグナル 隠す
  • 研究課題

    (15件)
  • 研究成果

    (184件)
  • 共同研究者

    (47人)
  •  生殖ライフスパンにおける空間オミクス解析研究代表者

    • 研究代表者
      沖 真弥
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2027
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅲ)
    • 研究機関
      熊本大学
      京都大学
  •  動的な生殖ライフスパン:変動する生殖細胞の機能と次世代へのリスク

    • 研究代表者
      北島 智也
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2027
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅲ)
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  微小領域に限定した高深度オミクス技術による催奇形性因子の作用機序解析研究代表者

    • 研究代表者
      沖 真弥
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2024
    • 研究種目
      特別研究員奨励費
    • 審査区分
      小区分56040:産婦人科学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  ゲノム多型に起因する疾患の発症プロセスの解明研究代表者

    • 研究代表者
      沖 真弥
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2024
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分48040:医化学関連
    • 研究機関
      熊本大学
      京都大学
  •  植物細胞壁S2層形成の制御メカニズム

    • 研究代表者
      津山 濯
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2022
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分40020:木質科学関連
    • 研究機関
      宮崎大学
  •  顎顔面形成不全を伴う未診断稀少疾患の遺伝的原因の究明

    • 研究代表者
      黒坂 寛
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分57070:成長および発育系歯学関連
    • 研究機関
      大阪大学
  •  遺伝子発現の空間的制御を測定する研究代表者

    • 研究代表者
      沖 真弥
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分48040:医化学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  Non-coding領域に存在する疾患原因SNPの同定と機能解析研究代表者

    • 研究代表者
      沖 真弥
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2020
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      複雑系疾病論
    • 研究機関
      京都大学
      九州大学
  •  「個性」創発に至る次世代継承エピゲノム修飾とその脳内表現

    • 研究代表者
      大隅 典子
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2020
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      東北大学
  •  核内のゲノムDNAとタンパクの相互作用をin situで可視化する技術の開発

    • 研究代表者
      目野 主税
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2017
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      発生生物学
    • 研究機関
      九州大学
  •  マウス胚ノードにおける初期左右軸形成の分子機構の解析

    • 研究代表者
      目野 主税
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2017
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      発生生物学
    • 研究機関
      九州大学
  •  Nodalシグナルによるepiblastの未分化維持機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      沖 真弥
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      発生生物学
    • 研究機関
      九州大学
  •  着床直後のマウス胚におけるNodal/FGFシグナル標的遺伝子の探索研究代表者

    • 研究代表者
      沖 真弥
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2012
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      発生生物学
    • 研究機関
      九州大学
  •  初期胚細胞コミュニティーにおける細胞外シグナルの解析

    • 研究代表者
      目野 主税
    • 研究期間 (年度)
      2009 – 2013
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州大学
  •  体軸情報を備えた胚様体の作製研究代表者

    • 研究代表者
      沖 真弥
    • 研究期間 (年度)
      2009 – 2010
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      発生生物学
    • 研究機関
      九州大学

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014 2013 2012 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 学会発表 図書 産業財産権

  • [図書] ChIP-Atlas ~転写制御ランドスケープの歩き方~2023

    • 著者名/発表者名
      鄒 兆南, 沖 真弥
    • 出版者
      JSBi Bioinformatics Review
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KF0048
  • [図書] 概論―空間トランスクリプトーム技術の最前線2021

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥、大川恭行
    • 総ページ数
      11
    • 出版者
      実験医学(羊土社)
    • ISBN
      9784758125475
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [図書] ChIP-Atlas2021

    • 著者名/発表者名
      S. Oki、T. Ohta
    • 総ページ数
      22
    • 出版者
      Practical Guide to Life Science Databases (Springer)
    • ISBN
      9789811658129
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [図書] Photo-Isolation Chemistry:光照射による高解像度かつ高感度なトランスクリプトーム技術2021

    • 著者名/発表者名
      本田瑞季、沖 真弥
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      実験医学(羊土社)
    • ISBN
      9784758125475
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [図書] 局所的かつ高深度の空間トランスクリプトーム技術ーPhoto-Isolation Chemistry2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 本田瑞季
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758122481
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [図書] 局所的かつ高深度の空間トランスクリプトーム技術ーPhoto-Isolation Chemistry2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 本田瑞季
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      未土社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [図書] 実験医学 372019

    • 著者名/発表者名
      沖真弥, 大田達郎
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      羊土社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [図書] ChIP-Atlas:既報のChIP-seqデータをフル活用するためのウェブサービス2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田達郎
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      羊土社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [図書] THE LUNG perspectives 272019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田達郎
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      メディカルレビュー社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [図書] ChIP-Atlas:公共 ChIP-seq データを統合的に活用するためのウェブサービス2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田達郎
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      メディカルレビュー社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] Elucidating disease-associated mechanisms triggered by pollutants via the epigenetic landscape using large-scale ChIP-Seq data2023

    • 著者名/発表者名
      Zou, Z., Yoshimura, Y., Yamanishi, Y., Oki, S
    • 雑誌名

      Epigenetics & Chromatin

      巻: 16 号: 1 ページ: 34-34

    • DOI

      10.1186/s13072-023-00510-w

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KF0048
  • [雑誌論文] Ras signaling and RREB1 are required for the dissociation of medial edge epithelial cells in murine palatogenesis2022

    • 著者名/発表者名
      Inubushi Toshihiro、Fujiwara Ayaka、Hirose Takumi、Aoyama Gozo、Uchihashi Toshihiro、Yoshida Naoki、Shiraishi Yuki、Usami Yu、Kurosaka Hiroshi、Toyosawa Satoru、Tanaka Susumu、Watabe Tetsuro、Kogo Mikihiko、Yamashiro Takashi
    • 雑誌名

      Disease Models & Mechanisms

      巻: 15 号: 2

    • DOI

      10.1242/dmm.049093

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03858, KAKENHI-PROJECT-21K10137, KAKENHI-PROJECT-21K17159
  • [雑誌論文] Photo-isolation chemistry for high-resolution and deep spatial transcriptome with mouse tissue sections2022

    • 著者名/発表者名
      Honda Mizuki、Kimura Ryuichi、Harada Akihito、Maehara Kazumitsu、Tanaka Kaori、Ohkawa Yasuyuki、Oki Shinya
    • 雑誌名

      STAR Protocols

      巻: 3 号: 2 ページ: 101346-101346

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2022.101346

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K09522, KAKENHI-PROJECT-22K19275, KAKENHI-PLANNED-21H05292, KAKENHI-PUBLICLY-21H05755, KAKENHI-PUBLICLY-22H05594, KAKENHI-PROJECT-20H00456, KAKENHI-PUBLICLY-21H00232, KAKENHI-PUBLICLY-22H04676, KAKENHI-PUBLICLY-22H04696, KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] ChIP-Atlas 2021 update: a data-mining suite for exploring epigenomic landscapes by fully integrating ChIP-seq, ATAC-seq?and Bisulfite-seq data2022

    • 著者名/発表者名
      Zou Zhaonan、Ohta Tazro、Miura Fumihito、Oki Shinya
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: - 号: W1 ページ: W175-W182

    • DOI

      10.1093/nar/gkac199

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] TRANSDIRE: data-driven direct reprogramming by a pioneer factor-guided trans-omics approach2022

    • 著者名/発表者名
      Eguchi Ryohei、Hamano Momoko、Iwata Michio、Nakamura Toru、Oki Shinya、Yamanishi Yoshihiro
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 38 号: 10 ページ: 2839-2846

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btac209

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K18327, KAKENHI-PROJECT-22K18173, KAKENHI-PLANNED-20H05797, KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] Epigenetic landscape of drug responses revealed through large-scale ChIP-seq data analyses2022

    • 著者名/発表者名
      Zou Zhaonan、Iwata Michio、Yamanishi Yoshihiro、Oki Shinya
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 23 号: 1 ページ: 51-51

    • DOI

      10.1186/s12859-022-04571-8

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H04915, KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] Prior secondary cell wall formation is required for gelatinous layer deposition and posture control in gravi‐stimulated aspen2021

    • 著者名/発表者名
      Takata Naoki、Tsuyama Taku、Nagano Soichiro、Baba Kei'ichi、Yasuda Yuko、Sakamoto Shingo、Mitsuda Nobutaka、Taniguchi Toru
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 108 号: 3 ページ: 725-736

    • DOI

      10.1111/tpj.15466

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03022, KAKENHI-PROJECT-20H03049
  • [雑誌論文] High-depth spatial transcriptome analysis by photo-isolation chemistry.2021

    • 著者名/発表者名
      Honda M, Oki S, Kimura R, Harada A, Maehara K, Tanaka K, Meno C, Ohkawa Y.
    • 雑誌名

      Nat Commun.

      巻: 12 号: 1 ページ: 4416-4416

    • DOI

      10.1038/s41467-021-24691-8

    • NAID

      120007141968

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21398, KAKENHI-PUBLICLY-20H04846, KAKENHI-PUBLICLY-20H05368, KAKENHI-PUBLICLY-20H05393, KAKENHI-PUBLICLY-21H00232, KAKENHI-PUBLICLY-21H00430, KAKENHI-PROJECT-20H00456, KAKENHI-PROJECT-19H03158, KAKENHI-PROJECT-19H03211, KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] Paternal age affects offspring via an epigenetic mechanism involving REST/NRSF.2021

    • 著者名/発表者名
      Yoshizaki Kaichi, Kimura Ryuichi, Kobayashi Hisato, Oki Shinya, Kikkawa Takako, Mai Lingling, Koike Kohei, Mochizumi Kentaro, Inada Hitoshi, Matsui Yasuhisa, Kono Tomohiro, Osumi Noriko
    • 雑誌名

      EMBO Reports

      巻: 22(2) 号: 2

    • DOI

      10.15252/embr.202051524

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K08060, KAKENHI-PROJECT-20K07237, KAKENHI-PROJECT-19K18627, KAKENHI-INTERNATIONAL-16K21734, KAKENHI-ORGANIZER-16H06524, KAKENHI-PLANNED-16H06530, KAKENHI-PROJECT-19H03424, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] Detection of <scp>REST</scp> expression in the testis using epitope‐tag knock‐in mice generated by genome editing2021

    • 著者名/発表者名
      Kimura Ryuichi、U. Inoue Yukiko、Kikkawa Takako、Tatehana Misako、Morimoto Yuki、Inada Hitoshi、Oki Shinya、Inoue Takayoshi、Osumi Noriko
    • 雑誌名

      Developmental Dynamics

      巻: 251 号: 3 ページ: 525-535

    • DOI

      10.1002/dvdy.417

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K18627, KAKENHI-INTERNATIONAL-16K21734, KAKENHI-PUBLICLY-19H04922, KAKENHI-WRAPUP-21H00447, KAKENHI-PROJECT-19H03318, KAKENHI-PROJECT-20J22054, KAKENHI-PROJECT-20K06467, KAKENHI-PROJECT-20K07237, KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] A defined glycosylation regulatory network modulates total glycome dynamics during pluripotency state transition2021

    • 著者名/発表者名
      Pecori Federico、Yokota Ikuko、Hanamatsu Hisatoshi、Miura Taichi、Ogura Chika、Ota Hayato、Furukawa Jun-ichi、Oki Shinya、Yamamoto Kazuo、Yoshie Osamu、Nishihara Shoko
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 1276-1276

    • DOI

      10.1038/s41598-020-79666-4

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K15597, KAKENHI-PROJECT-18K06139, KAKENHI-PROJECT-19H03424, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] Genetic loss of importin α4 causes abnormal sperm morphology and impacts on male fertility in mouse2020

    • 著者名/発表者名
      Miyamoto Yoichi、Sasaki Mitsuho、Miyata Haruhiko、Monobe Yoko、Nagai Masahiro、Otani Mayumi、Whiley Penny A. F.、Morohoshi Akane、Oki Shinya、Matsuda Junichiro、Akagi Ken‐ichi、Adachi Jun、Okabe Masaru、Ikawa Masahito、Yoneda Yoshihiro、Loveland Kate L.、Oka Masahiro
    • 雑誌名

      The FASEB Journal

      巻: 34 号: 12 ページ: 16224-16242

    • DOI

      10.1096/fj.202000768rr

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K06455, KAKENHI-PROJECT-20H03444, KAKENHI-PROJECT-19H03424, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] Chromatin integration labeling for mapping DNA-binding proteins and modifications with low input.2020

    • 著者名/発表者名
      Tetsuya Handa, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Shoko Sato, Masaru Nakao, Naoki Goto, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura.
    • 雑誌名

      Nat Protoc.

      巻: 15 号: 10 ページ: 3334-3360

    • DOI

      10.1038/s41596-020-0375-8

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21398, KAKENHI-PLANNED-18H05534, KAKENHI-PUBLICLY-19H04970, KAKENHI-PUBLICLY-19H05244, KAKENHI-PUBLICLY-19H05425, KAKENHI-PUBLICLY-20H04846, KAKENHI-PUBLICLY-20H05368, KAKENHI-PUBLICLY-20H05393, KAKENHI-PROJECT-17H01417, KAKENHI-PROJECT-20H00456, KAKENHI-PROJECT-19H03158, KAKENHI-PROJECT-19H03211, KAKENHI-PROJECT-17K17719, KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] FTO Demethylates Cyclin D1 mRNA and Controls Cell-Cycle Progression2020

    • 著者名/発表者名
      Hirayama Mayumi、Wei Fan-Yan、Chujo Takeshi、Oki Shinya、Yakita Maya、Kobayashi Daiki、Araki Norie、Takahashi Nozomu、Yoshida Ryoji、Nakayama Hideki、Tomizawa Kazuhito
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 31 号: 1 ページ: 107464-107464

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2020.03.028

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H03005, KAKENHI-PROJECT-20H03187, KAKENHI-PROJECT-19H03424, KAKENHI-PROJECT-19H03772, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] Dystrobrevin alpha gene is a direct target of the vitamin D receptor in muscle2020

    • 著者名/発表者名
      Tsoumpra Maria K、Sawatsubashi Shun、Imamura Michihiro、Fukumoto Seiji、Takeda Shin’ichi、Matsumoto Toshio、Aoki Yoshitsugu
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Endocrinology

      巻: 64 号: 3 ページ: 195-208

    • DOI

      10.1530/jme-19-0229

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K07544, KAKENHI-PROJECT-18K19518, KAKENHI-PROJECT-18K16236, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] DDBJ Data Analysis Challenge: a machine learning competition to predict <i>Arabidopsis</i> chromatin feature annotations from DNA sequences2020

    • 著者名/発表者名
      Eli Kaminuma, Yukino Baba, Masahiro Mochizuki, Hirotaka Matsumoto, Haruka Ozaki, Toshitsugu Okayama, Takuya Kato, Shinya Oki, Takatomo Fujisawa, Yasukazu Nakamura, Masanori Arita, Osamu Ogasawara, Hisashi Kashima, Toshihisa Takagi
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 95 号: 1 ページ: 43-50

    • DOI

      10.1266/ggs.19-00034

    • NAID

      130007834264

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 年月日
      2020-02-01
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H01704, KAKENHI-PROJECT-18KT0024, KAKENHI-PROJECT-18H03580, KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] High resolution spatial transcriptome analysis by photo-isolation chemistry2020

    • 著者名/発表者名
      Honda Mizuki、Oki Shinya、Harada Akihito、Maehara Kazumitsu、Tanaka Kaori、Meno Chikara、Ohkawa Yasuyuki
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2020.03.20.000984

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K22398, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] Direct reprogramming of human umbilical vein- and peripheral blood-derived endothelial cells into hepatic progenitor.2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Inada, Miyako Udono , Kanae Matsuda-Ito, Kenichi Horisawa, Yasuyuki Ohkawa, Shizuka Miura, Takeshi Goya, Junpei Yamamoto, Masao Nagasaki, Kazuko Ueno, Daisuke Saitou, Mikita Suyama, Yoshihiko Maehara, Wataru Kumamaru, Yoshihiro Ogawa, Sayaka Sekiya, Atsushi Suzuki.
    • 雑誌名

      cellsNat Commun.

      巻: 11 号: 1 ページ: 5292-5292

    • DOI

      10.1038/s41467-020-19041-z

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21398, KAKENHI-PUBLICLY-19H05244, KAKENHI-PUBLICLY-20H04846, KAKENHI-PUBLICLY-20H04949, KAKENHI-PROJECT-19H01054, KAKENHI-PROJECT-20H00456, KAKENHI-PROJECT-19H01177, KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] Update of the FANTOM web resource: expansion to provide additional transcriptome atlases2019

    • 著者名/発表者名
      Lizio Marina、Abugessaisa Imad、Noguchi Shuhei、Kondo Atsushi、Hasegawa Akira、Hon Chung Chau、de Hoon Michiel、Severin Jessica、Oki Shinya、Hayashizaki Yoshihide、Carninci Piero、Kasukawa Takeya、Kawaji Hideya
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 47 号: D1 ページ: D752-D758

    • DOI

      10.1093/nar/gky1099

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02902, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] Cis-control of Six1 expression in neural crest cells during craniofacial development2019

    • 著者名/発表者名
      Wu Zhaoming, Rao Yanxia, Zhang Sushan, Kim Eun-Jung, Oki Shinya, Harada Hidemitsu, Cheung Martin, Jung Han-Sung
    • 雑誌名

      Developmental Dynamics

      巻: 248 号: 12 ページ: 1264-1272

    • DOI

      10.1002/dvdy.109

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024, KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] Paternal age affects offspring’s behavior possibly via an epigenetic mechanism recruiting a transcriptional repressor REST2019

    • 著者名/発表者名
      Yoshizaki, K., Koike, T., Kimura, R., Kikkawa, T., Oki, S., Koike, K., Mochizuki, K., Inada, H., Kobayashi, H., Matsui, Y., Kono, T., Osumi, N.
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/550095

    • オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K14999, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] Sustained expression of HeyL is critical for the proliferation of muscle stem cells in overloaded muscle.2019

    • 著者名/発表者名
      Fukuda S, Kaneshige A, Kaji T, Noguchi YT, Takemoto Y, Zhang L, Tsujikawa K, Kokubo H, Uezumi A, Maehara K, Harada A, Ohkawa Y, Fukada SI.
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 8

    • DOI

      10.7554/elife.48284

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K19740, KAKENHI-PUBLICLY-18H04802, KAKENHI-PUBLICLY-18H04904, KAKENHI-PUBLICLY-19H04970, KAKENHI-PUBLICLY-19H05244, KAKENHI-PUBLICLY-19H05425, KAKENHI-PROJECT-17H03608, KAKENHI-PROJECT-19H03158, KAKENHI-PROJECT-19H03211, KAKENHI-PROJECT-19H04000, KAKENHI-PROJECT-18K19432, KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [雑誌論文] LSD1 mediates metabolic reprogramming by glucocorticoids during myogenic differentiation2018

    • 著者名/発表者名
      K. Anan, S. Hino, N. Shimizu, A. Sakamoto, K. Nagaoka, R. Takase, K. Kohrogi, H. Araki, Y. Hino, S. Usuki, S. Oki, H. Tanaka, K. Nakamura, F. Endo, and M. Nakao
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 18 号: 11 ページ: 5441-5454

    • DOI

      10.1093/nar/gky234

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04707, KAKENHI-PROJECT-17K09876, KAKENHI-PROJECT-15KK0332, KAKENHI-PROJECT-18KT0017, KAKENHI-PROJECT-17K10055, KAKENHI-PROJECT-18K19479, KAKENHI-PROJECT-16H05330, KAKENHI-PROJECT-18H02618, KAKENHI-PROJECT-16K07215, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data.2018

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Hideki Hatanaka, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideya Kawaji, Ryo Nakaki, Jun Sese, Chikara Meno
    • 雑誌名

      EMBO reports

      巻: 19 号: 12

    • DOI

      10.15252/embr.201846255

    • NAID

      120006649027

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06469, KAKENHI-PROJECT-15H05713, KAKENHI-PROJECT-17H01571, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] Repression of somatic genes by selective recruitment of HDAC3 by BLIMP1 is essential for mouse primordial germ cell fate determination2018

    • 著者名/発表者名
      Mochizuki Kentaro, Hayashi Yohei, Sekinaka Tamotsu, Otsuka Kei, Ito-Matsuoka Yumi, Kobayashi Misato, Oki Shinya, Takehara Asuka, Kono Tomohiro, Osumi Noriko, Matsui Yasuhisa
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 24 号: 10 ページ: 2682-2693

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2018.07.108

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K17594, KAKENHI-PLANNED-16H06530, KAKENHI-PROJECT-17J02039, KAKENHI-PROJECT-17K19372, KAKENHI-PROJECT-15H05579, KAKENHI-PUBLICLY-18H04875, KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [雑誌論文] ChIP-seq analysis of genomic binding regions of five major transcription factors highlights a central role for ZIC2 in the mouse epiblast stem cell gene regulatory network2017

    • 著者名/発表者名
      Matsuda Kazunari、Mikami Tomoyuki、Oki Shinya、Iida Hideaki、Andrabi Munazah、Boss Jeremy M.、Yamaguchi Katsushi、Shigenobu Shuji、Kondoh Hisato
    • 雑誌名

      Development

      巻: 144 ページ: 1948-1958

    • DOI

      10.1242/dev.143479

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26251024, KAKENHI-PLANNED-16H06530, KAKENHI-PROJECT-17H03688
  • [雑誌論文] Chd2 regulates chromatin for proper gene expression toward differentiation in mouse embryonic stem cells2017

    • 著者名/発表者名
      Semba Yuichiro、Harada Akihito、Maehara Kazumitsu、Oki Shinya、Meno Chikara、Ueda Jun、Yamagata Kazuo、Suzuki Atsushi、Onimaru Mitsuho、Nogami Jumpei、Okada Seiji、Akashi Koichi、Ohkawa Yasuyuki
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 45 号: 15 ページ: 8758-8772

    • DOI

      10.1093/nar/gkx475

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K15668, KAKENHI-PROJECT-17K19356, KAKENHI-PROJECT-17K19603, KAKENHI-PROJECT-26291051, KAKENHI-PUBLICLY-16H01219, KAKENHI-PUBLICLY-16H01550, KAKENHI-PUBLICLY-16H01577, KAKENHI-PLANNED-16H06530, KAKENHI-ORGANIZER-25112001, KAKENHI-PLANNED-25116010, KAKENHI-PROJECT-16H06391, KAKENHI-PROJECT-17H01571, KAKENHI-PROJECT-16H05450, KAKENHI-PROJECT-17H03608, KAKENHI-PROJECT-16K18479, KAKENHI-PUBLICLY-16H01319, KAKENHI-PROJECT-16K07099, KAKENHI-PROJECT-16H01850, KAKENHI-PUBLICLY-17H05623
  • [雑誌論文] Hyperglycemia impairs left-right axis formation and thereby disturbs heart morphogenesis in mouse embryos.2015

    • 著者名/発表者名
      Hachisuga M, Oki S, Kitajima K, Ikuta S, Sumi T, Kato K, Wake N, Meno C.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      巻: 112 号: 38 ページ: 5300-5307

    • DOI

      10.1073/pnas.1504529112

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26461637, KAKENHI-PROJECT-15K15608, KAKENHI-PUBLICLY-15H01517, KAKENHI-PROJECT-25670491, KAKENHI-PROJECT-25840087, KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [雑誌論文] Chd5 Regulates MuERV-L/MERVL Expression in Mouse Embryonic Stem Cells Via H3K27me3 Modification and Histone H3.1/H3.2.2015

    • 著者名/発表者名
      Hayashi M, Maehara K, Harada A, Semba Y, Kudo K, Takahashi H, Oki S, Meno C, Ichiyanagi K, Akashi K, Ohkawa Y.
    • 雑誌名

      J Cell Biochem

      巻: 117 号: 3 ページ: 780-792

    • DOI

      10.1002/jcb.25368

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K15365, KAKENHI-PROJECT-15K18457, KAKENHI-PLANNED-24118002, KAKENHI-PLANNED-25116010, KAKENHI-PROJECT-13J04024, KAKENHI-PROJECT-25503003, KAKENHI-PROJECT-26670130, KAKENHI-PROJECT-25840087, KAKENHI-PROJECT-26290064, KAKENHI-PROJECT-26291051, KAKENHI-PROJECT-15H04701
  • [雑誌論文] SraTailor: graphical user interface software for processing and visualizing ChIP-seq data.2014

    • 著者名/発表者名
      Oki S, Maehara K, Ohkawa Y, Meno C
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 19 号: 12 ページ: 919-926

    • DOI

      10.1111/gtc.12190

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25670491, KAKENHI-PROJECT-25840087, KAKENHI-PROJECT-26290064, KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [雑誌論文] Self-regulated left-right asymmetric expression of Pitx2c in the developing limb2014

    • 著者名/発表者名
      Shiratori, H., Yashiro, Iwai, N., Oki, S., Ikawa, Y., Kanata, K., and Hamada, H.
    • 雑誌名

      Dev. Biol.

      巻: 395 号: 2 ページ: 331-341

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2014.09.002

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24113001, KAKENHI-PLANNED-24113004, KAKENHI-PROJECT-25251029, KAKENHI-PROJECT-25840087, KAKENHI-PROJECT-26440124
  • [雑誌論文] SraTailor: 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール2014

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 19 ページ: 3101-06

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [雑誌論文] Wnt signaling regulates left-right axis formation in the node of mouse embryos2013

    • 著者名/発表者名
      Kitajima K, Oki S, Ohkawa Y, Sumi T, Meno C.
    • 雑誌名

      Dev Biol.

      巻: 15;380(2) ページ: 222-32

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770254
  • [雑誌論文] Epiblast ground state is controlled by canonical Wnt/β-catenin signaling in the postimplantation mouse embryo and epiblast stem cells2013

    • 著者名/発表者名
      Sumi T, Oki S, Kitajima K, Meno C.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 14;8(5)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770254
  • [雑誌論文] Wnt signaling regulates left-right axis formation in the node of mouse embryos2013

    • 著者名/発表者名
      Kitajima, Oki, Ohkawa, Sumi, Meno
    • 雑誌名

      Dev Biol

      巻: 380 号: 2 ページ: 222-32

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2013.05.011

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002, KAKENHI-PROJECT-23310134, KAKENHI-PROJECT-23570233, KAKENHI-PROJECT-23770254, KAKENHI-PLANNED-25116010, KAKENHI-PROJECT-25670491, KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [雑誌論文] Epiblast ground state is controlled by canonical Wnt/ β-catenin signaling in the postimplantation mouse embryo and epiblast stem cells2013

    • 著者名/発表者名
      Sumi, Oki, Kitajima, Meno
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8 号: 5 ページ: e63378-e63378

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0063378

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002, KAKENHI-PROJECT-23570233, KAKENHI-PROJECT-23770254, KAKENHI-PROJECT-25670491, KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [雑誌論文] Restriction of Wnt signaling in the dorsal otocyst determines semicircular canal formation in the mouse embryo2012

    • 著者名/発表者名
      T.Noda, et al
    • 雑誌名

      Developmental Biology

      巻: 362 号: 1 ページ: 83-93

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2011.11.019

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-10J01348, KAKENHI-PLANNED-21116002, KAKENHI-PROJECT-23770254
  • [雑誌論文] Restriction of Wnt signaling in the dorsal otocyst determines semicircular canal formation in the mouse embryo2012

    • 著者名/発表者名
      Noda T, Oki S, Kitajima K, Harada T, Komune S, Meno C.
    • 雑誌名

      Dev Biol.

      巻: 1;362(1) ページ: 83-93

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770254
  • [雑誌論文] Fate maps of ventral and dorsal pancreatic progenitor cells in early somite stage mouse embryos.2012

    • 著者名/発表者名
      Miki R, Yoshida T, Murata K, Oki S, Kume K, Kume S.
    • 雑誌名

      Mech. Dev.

      巻: 128 号: 11-12 ページ: 597-609

    • DOI

      10.1016/j.mod.2011.12.004

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23592616, KAKENHI-PROJECT-23770254
  • [雑誌論文] Fate maps of ventral and dorsal pancreatic progenitor cells in early somite stage mouse embryos2012

    • 著者名/発表者名
      Miki R, Yoshida T, Murata K, Oki S, Kume K, Kume S.
    • 雑誌名

      Mech Dev.

      巻: 128(11-12) ページ: 597-609

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770254
  • [雑誌論文] マウス初期発生における硫酸化グリコサミノグリカンの役割2010

    • 著者名/発表者名
      沖真弥, 目野主税
    • 雑誌名

      福岡医学雑誌

      巻: 101-8 ページ: 157-64

    • NAID

      120002646785

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21657059
  • [雑誌論文] Dissecting the role of Fgf signaling during gastrulation and left-right axis formation in mouse embryos using chemical inhibitors.2010

    • 著者名/発表者名
      Oki, et al.
    • 雑誌名

      Developmental Dynamics.

      巻: 239 ページ: 1768-1778

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [雑誌論文] Dissecting the Role of Fgf Signaling During Gastrulation and Left-Right Axis Formation in Mouse Embryos Using Chemical Inhibitors2010

    • 著者名/発表者名
      Oki, et al
    • 雑誌名

      Developmental Dynamics

      巻: 239-6 ページ: 1768-78

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21657059
  • [雑誌論文] Dissecting the role of Fgf signaling during gastrulation and left-right axis formation in mouse embryos using chemical inhibitors2010

    • 著者名/発表者名
      Oki, Kitajima, Meno
    • 雑誌名

      Dev Dyn

      巻: 239 号: 6 ページ: 1768-1778

    • DOI

      10.1002/dvdy.22282

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [雑誌論文] Dissecting the Role of Fgf Signaling During Gastrulation and Left-Right Axis Formation in Mouse Embryos Using Chemical Inhibitors2010

    • 著者名/発表者名
      Oki, et al
    • 雑誌名

      Developmental Dynamics (in press)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21657059
  • [雑誌論文] Reversal of left-right asymmetry induced by aberrant Nodal signaling in the node of mouse embryos2009

    • 著者名/発表者名
      Oki, et al
    • 雑誌名

      Development 136

      ページ: 3917-3925

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21657059
  • [雑誌論文] Reversal of left-right asymmetry induced by aberrant Nodal signaling in the node of mouse embryos.2009

    • 著者名/発表者名
      Oki, et al.
    • 雑誌名

      Development 136

      ページ: 3917-3925

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [産業財産権] 核酸断片及びその使用2021

    • 発明者名
      大川恭行, 沖 真弥, 原田哲仁
    • 権利者名
      大川恭行, 沖 真弥, 原田哲仁
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2021-025468
    • 出願年月日
      2021
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [産業財産権] 核酸断片及びその使用2021

    • 発明者名
      大川恭行, 沖 真弥, 原田哲仁
    • 権利者名
      大川恭行, 沖 真弥, 原田哲仁
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2021-025468
    • 出願年月日
      2021
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [産業財産権] オリゴヌクレオチド、オミクス解析方法及びオミクス解析用キット2019

    • 発明者名
      沖真弥, 大川恭行
    • 権利者名
      沖真弥, 大川恭行
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2019-094216
    • 出願年月日
      2019
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [産業財産権] オリゴヌクレオチド、オミクス解析方法及びオミクス解析用キット2019

    • 発明者名
      沖真弥, 大川恭行
    • 権利者名
      沖真弥, 大川恭行
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2019-094216
    • 出願年月日
      2019
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 大規模ChIP-seq データを活用し環境汚染物質による疾患誘発機序に迫る2023

    • 著者名/発表者名
      鄒 兆南, 吉村侑花, 山西芳裕, 沖 真弥
    • 学会等名
      第12回生命医薬情報学連合大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KF0048
  • [学会発表] 光単離化学(PIC)による高解像度かつ高深度の空間オミクス解析2022

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      JST-CRDS 俯瞰ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 時空間的な遺伝子発現制御のしくみを探る2022

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      東京大学 理学系研究科 生物情報科学科・黒田研セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Photo-isolation chemistryによる局所的高深度トランスクリプトーム解析2022

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第127回日本解剖学会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Photo-Isolation-Chemistry (PIC):局所的な高深度トランスクリプトーム解析2022

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      基礎生物学研究所・新規モデル生物開発センター・テクニカルワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Prior secondary cell wall formation is required for gelatinous layer deposition and posture control in gravi-stimulated aspen2022

    • 著者名/発表者名
      Naoki Takata, Taku Tsuyama, Soichiro Nagano, Kei’ichi Baba, Yuko Yasuda, Shingo Sakamoto, Nobutaka Mitsuda and Toru Taniguchi
    • 学会等名
      第63回植物生理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H03049
  • [学会発表] ChIP-Atlas update: Bisulfite-seqとATAC-seqデータを統合2021

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 時空間的な遺伝子発現制御のしくみを探る2021

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      JST・理研共催 バイオDXシンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 空間的な遺伝子発現制御のしくみを探る2021

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第85回日本循環器学会学術集会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 空間的な遺伝子発現制御のしくみを探る2021

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第85回日本循環器学会学術集会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation2021

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      奈良先端大学院大学講義「バイオサイエンスにおけるビッグデータ」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Prior secondary cell wall formation is required for gelatinous layer deposition and posture control in gravi-stimulated aspen2021

    • 著者名/発表者名
      Naoki Takata, Taku Tsuyama, Soichiro Nagano, Kei’ichi Baba, Yuko Yasuda, Shingo Sakamoto, Nobutaka Mitsudae Toru Taniguchi
    • 学会等名
      7th International Conference on Plant Cell Wall Biology
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H03049
  • [学会発表] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation2021

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      京都大学医学研究科・神経科学教育コース
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation2021

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      熊本大学リエゾンラボ研究会・HIGO最先端研究セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Prior secondary cell wall formation is required for gelatinous layer deposition and posture control in gravi-stimulated aspen.2021

    • 著者名/発表者名
      Naoki Takata, Taku Tsuyama, Soichiro Nagano, Kei’ichi Baba, Yuko Yasuda, Shingo Sakamoto, Nobutaka Mitsuda, Toru Taniguchi
    • 学会等名
      7th International Conference on Plant Cell Wall Biology
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H03049
  • [学会発表] 時空間的な遺伝子発現制御のしくみを探る2021

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      日本生物工学会東日本支部 生物工学フォーラム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 空間的な遺伝子発現制御のしくみを探る2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第9回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2020)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas の使い方と使われ方2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第9回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2020)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      RIKEN BDR seminar in Kobe
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 遺伝子発現の時空間的な制御のしくみ2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      KBC第4回勉強会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      WPI-IIIS Seminar
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      WPI-IIIS Seminar
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 空間的な遺伝子発現制御のしくみを探る2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第9回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2020)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      BDR seminar in Kobe
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas の使い方と使われ方2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第9回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2020)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-seqビッグデータを統合解析し、薬剤の作用機序解明に迫る2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      京都大学「医学領域」産学連携推進機構/一般社団法人芝蘭会 産学情報交流会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] ChIP-Atlas: 公共 ChIP-seq データを利活用できる2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] ChIP-Atlas: 公共 ChIP-seq データを利活用できる2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 遺伝子発現の時空間的な制御のしくみ2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      KBC第4回勉強会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] ChIP-seqビッグデータを統合解析し、薬剤の作用機序解明に迫る2020

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      京都大学「医学領域」産学連携推進機構/一般社団法人芝蘭会 産学情報交流会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas: 既報ChIP-seqデータの統合データベース2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      統合データベース講習会:AJACS番町3
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas: 公共 ChIP-seq データを利活用できる2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas: 既報ChIP-seqデータの統合データベース2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2019年大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 位置情報と遺伝子発現とその仕組み2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      新学術領域「個性創発脳」若手の会・技術支援講習会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータの利活用術2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      全薬工業 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas の使い方とその応用2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      資生堂 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータの利活用術2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      創価大学 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータの利活用術2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      新潟大学 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      北里大学 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータの利活用術2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      国立精神・神経医療研究センター セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータの統合解析2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      京都大学 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 位置情報と遺伝子発現とその仕組み2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      新学術領域「個性創発脳」若手の会・技術支援講習会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 薬効の作用点となる転写因子の特定と創薬への応用2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      日本たばこ医薬総合研究所 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] ChIP-Atlas: 公共 ChIP-seq データを利活用できる2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータの利活用術2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      東京理科大学 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] High resolution spatial transcriptomics method by photo-isolation chemistry2019

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Mizuki Honda, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Kaori Tanaka, and Yasuyuki Ohkawa
    • 学会等名
      EMBO/EMBL Symposium: Multiomics to Mechanisms - Challenges in Data Integration
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明や創薬に挑む2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      次世代脳プロジェクト冬のシンポジウム2019
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータの統合解析2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      京都大学 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] High resolution spatial transcriptomics method by photo-isolation chemistry2019

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Mizuki Honda, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Kaori Tanaka, and Yasuyuki Ohkawa
    • 学会等名
      EMBO/EMBL Symposium: Multiomics to Mechanisms - Challenges in Data Integration
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] ChIP-Atlasをつないで使う2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      トーゴーの日シンポジウム2019
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data2019

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki
    • 学会等名
      Lecture in College of Dentistry, Yonsei University
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明や創薬に挑む2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      質量分析インフォマティクス研究会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 薬効の作用点となる転写因子の特定と創薬への応用2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      日本たばこ医薬総合研究所 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas: 既報ChIP-seqデータの統合データベース2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      統合データベース講習会:AJACS番町3
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data2019

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki
    • 学会等名
      Lecture in College of Dentistry, Yonsei University
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 特定領域の発現情報を光照射で取り出す技術2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      JST新技術説明会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas の使い方とその応用2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      資生堂 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Altasにおけるサンプルメタデータのキュレーションと、その爆速化2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      Annotathon 2019
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] Annotathon 20192019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      Annotathon 2019
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータの利活用術2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      国立精神・神経医療研究センター セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 特定領域の発現情報を光照射で取り出す技術2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      JST新技術説明会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03424
  • [学会発表] ChIP-Atlasをつないで使う2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      トーゴーの日シンポジウム2019
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas: 既報ChIP-seqデータの統合データベース2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      日本プロテオーム学会2019年大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータの利活用術2019

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      産総研 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータと疾患関連SNPの統合解析2018

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む2018

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      第16回JCGGシンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 医工学研究ビッグデータのデーターベース構築と活用2018

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      東京大学 工学系研究科 医工学概論
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data2018

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki
    • 学会等名
      Research collaborating meeting on "Molecular mechanism of tooth development and regeneration"
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-Atlas: 既報のChIP-seqデータをフル活用できる2018

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      統合データベース講習会:AJACS町田
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] ChIP-seqとプロテオーム:公共データをつないで使う2018

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥、石濱泰
    • 学会等名
      トーゴーの日シンポジウム2018
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む2018

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      JSBi 九州部会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions2018

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Hideki Hatanaka, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideya Kawaji, Ryo Nakaki, Jun Sese, Chikara Meno
    • 学会等名
      Keystone Symposium; Gene Control in Development and Disease
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions2018

    • 著者名/発表者名
      Oki S, Ohta T, Shioi G, Hatanaka H, Ogasawara O, Okuda Y, Kawaji H, Nakaki R, Sese J, Meno C
    • 学会等名
      Keystone Symposium; Gene Control in Development and Disease
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06530
  • [学会発表] 公共 ChIP-seq データをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む2018

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      九州工業大学 セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0024
  • [学会発表] Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions2017

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Hideki Hatanaka, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideya Kawaji, Ryo Nakaki, Jun Sese, Chikara Meno
    • 学会等名
      50th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充2017

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      トーゴーの日シンポジウム2017
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06530
  • [学会発表] Trans-generational transmission of ASD-like phenotypes possibly via sperm epigenetic alteration caused by paternal age2017

    • 著者名/発表者名
      Kimura R, Yoshizaki K, Koike T, Oki S, Aoki N, Mochizuki K, Kobayashi H, Kikkawa T, Inada H, Matsui Y, Kono T, Osumi N
    • 学会等名
      国際自閉症カンファレンス東京2017
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06530
  • [学会発表] 生命科学のデータベース活_法フォーラム :ChIP-Atlas2017

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      ConBio 2017
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06530
  • [学会発表] The transcription factor landscape decodes the enhancers and risk variants in non-coding regions2017

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Hideki Hatanaka, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideya Kawaji, Ryo Nakaki, Jun Sese, Chikara Meno
    • 学会等名
      Keystone Symposium; Epigenetics and Human Disease: Progress from Mechanisms to Therapeutics
    • 発表場所
      Seattle
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] 高齢の精子にみられるDNAメチル化異常と子孫の表現型異常との関連2017

    • 著者名/発表者名
      木村龍一、吉崎嘉一、小池佐、沖真弥、青木七菜、望月健太郎、小林久人、吉川貴子、稲田仁、松居靖久、河野友宏、大隅典子
    • 学会等名
      第40回日本神経科学大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06530
  • [学会発表] Paternal age affects offspring’s behavior possibly via sperm epigenetic alteration established by a transcriptional repressor REST2017

    • 著者名/発表者名
      Kimura R, Yoshizaki K, Koike T, Oki S, Aoki N, Mochizuki K, Kobayashi H, Kikkawa T, Inada H, Matsui Y, Kono T, Osumi N
    • 学会等名
      The International Research Symposium on Regulation of Germ Cell Development in vivo and in vitro in vitro
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06530
  • [学会発表] Trans-generational transmission of ASD-like phenotypes possibly2017

    • 著者名/発表者名
      木村龍一、吉崎嘉一、小池佐、沖真弥、青木七奈、望月研太郎、小林久人、吉川貴子、稲田仁、河野友宏、松居靖久、大隅典子
    • 学会等名
      次世代脳プロジェクト 冬のシンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06530
  • [学会発表] Trans-generational transmission of ASD-like phenotypes possibly via sperm epigenetic alteration caused by paternal age2017

    • 著者名/発表者名
      Kimura R., Yoshizaki K., Koike T., Oki S., Aoki N., Mochizuki K., Kobayashi H., Kikkawa T., Inada H., Matsui Y., Kono T., Osumi N.
    • 学会等名
      国際自閉症カンファレンス東京2017
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06530
  • [学会発表] Paternal aging-induced differential DNA methylation in sperm: possible effects on gene expression and behavior in offspring2017

    • 著者名/発表者名
      Osumi N, Kimura R, Yoshizaki K, Koike T, Oki S, Mochizuki K, Kikkawa T, Inada H, Matsui Y, Kono T
    • 学会等名
      Neuroscience 2017(USA)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06530
  • [学会発表] 既報の ChIP-seq データの利活用術2017

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田 達郎, 塩井 剛, 畠中 秀樹, 小笠原 理, 奥田 喜広, 川路 英哉, 仲木 竜, 瀬々 潤, 目野 主税
    • 学会等名
      第4回 発生における代謝を考える会
    • 発表場所
      京都大学
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] 父加齢が次世代の行動に影響を与えるエピジェネティックなメカニズム: 新たな自閉スペクトラム症モデルの提案2017

    • 著者名/発表者名
      吉崎 嘉一、小池 佐、木村 龍一、吉川 貴子、沖 真弥、稲田 仁、松居 靖之、河野 友宏、大隅 典子
    • 学会等名
      第122回日本解剖学会総会・全国学術集会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06530
  • [学会発表] ChIP-Atlas: Comprehensive and integrative database for visualizing and mining all published ChIP-seq data.2016

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Ryo Nakaki, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideki Hatanaka, Chikara Meno
    • 学会等名
      SYSTEMS BIOLOGY: GLOBAL REGULATION OF GENE EXPRESSION
    • 発表場所
      Cold spring harbor laboratory, USA
    • 年月日
      2016-03-17
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] 網羅的かつ統合的な ChIP-seq データの解析2016

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田 達郎, 塩井 剛, 畠中 秀樹, 小笠原 理, 奥田 喜広, 川路 英哉, 仲木 竜, 瀬々 潤, 目野 主税
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] 妊娠前糖尿病における左右軸形成異常2016

    • 著者名/発表者名
      蜂須賀 正紘、北島 桂子 、沖 真弥、生田 智美、目野 主税
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] ChIP-Atlas: Comprehensive and integrative database for visualizing and mining all published ChIP-seq data2016

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Ryo Nakaki, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideki Hatanaka, Chikara Meno
    • 学会等名
      SYSTEMS BIOLOGY: GLOBAL REGULATION OF GENE EXPRESSION
    • 発表場所
      Cold spring harbor laboratory
    • 年月日
      2016-03-17
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] 既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田 達郎, 塩井 剛, 仲木 竜, 目野 主税
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2015-12-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] ChIP-seq データベースのためのメタ情報アノテーション2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      Annotathon 2015
    • 発表場所
      三島市
    • 年月日
      2015-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] ChIP-Atlas: Comprehensive database for visualizing all published ChIP-seq data2015

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Chikara Meno
    • 学会等名
      48th Annual Meeting of JSDB
    • 発表場所
      つくば市
    • 年月日
      2015-06-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] ChIP-seq SRA を利活用するための統合データベース2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田 達郎, 塩井 剛, 目野 主税
    • 学会等名
      NGS現場の会第四回研究会
    • 発表場所
      つくば市
    • 年月日
      2015-07-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] 既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田 達郎, 塩井 剛, 仲木 竜, 目野 主税
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2015-12-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] ChIP-Atlas: Comprehensive database for visualizing all published ChIP-seq data2015

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Chikara Meno
    • 学会等名
      48th Annual Meeting of JSDB
    • 発表場所
      つくば市
    • 年月日
      2015-06-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] 既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      生命情報科学若手の会 第7回研究会
    • 発表場所
      鶴岡市
    • 年月日
      2015-10-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] ChIP-seq SRA を利活用するための統合データベース2015

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 大田 達郎, 塩井 剛, 目野 主税
    • 学会等名
      NGS現場の会第四回研究会
    • 発表場所
      つくば市
    • 年月日
      2015-07-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] SraTailor: GUI software for visualizing high-throughput sequence read archives2014

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno
    • 学会等名
      47th Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists
    • 発表場所
      名古屋市 ウインクあいち
    • 年月日
      2014-05-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] SraTailor: 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール2014

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 前原 一満, 大川 恭行, 目野 主税
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜市 パシフィコ横浜
    • 年月日
      2014-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] SraTailor: GUI software for visualizing high-throughput sequence read archives2014

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno
    • 学会等名
      47th Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists
    • 発表場所
      名古屋市
    • 年月日
      2014-05-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] Development of a GUI software to visualize high through-put sequence read archives2013

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [学会発表] 既報の次世代シーケンサ解析データを可視化するための簡易ソフトウェア2013

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      定量生物学の会 第六回年会
    • 発表場所
      大阪大学吹田キャンパス 銀杏会館
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [学会発表] Development of a Mac GUI Application to Visualize Published Raw ChIP-seq data2013

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki and Chikara Meno
    • 学会等名
      The 61st NIBB Conference "Cellular Community in Mammalian Embryogenesis"
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770254
  • [学会発表] Wnt signaling regulates the left-right axis formation in the node of mouse embryos2013

    • 著者名/発表者名
      Kitajima, Oki, Sumi, Meno
    • 学会等名
      第46回発生生物学会
    • 発表場所
      松江
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [学会発表] Development of a GUI software to visualize high through-put sequence read archives2013

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770254
  • [学会発表] Development of a GUI software to visualize high through-put sequence read archives2013

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] Development of a Mac GUI Application to Visualize Published Raw ChIP-seq data2013

    • 著者名/発表者名
      Shinya Oki and Chikara Meno
    • 学会等名
      The 61st NIBB Conference "Cellular Community in Mammalian Embryogenesis"
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] Wnt signaling regulates the left-right axis formation in the node2013

    • 著者名/発表者名
      Kitajima, Oki, Sumi, Meno
    • 学会等名
      Mouse Molecular Genetics
    • 発表場所
      Cambridge, UK
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [学会発表] 既報の次世代シーケンサ解析データを可視化するための簡易ソフトウェア2013

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      定量生物学の会 第六回年会
    • 発表場所
      大阪大学吹田キャンパス 銀杏会館
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] Wnt signaling regulates the left-right axis formation in the node of mouse embyors2013

    • 著者名/発表者名
      Keiko Kitajima, Shinya Oki, Tomoyuki Sumi, Chikara Meno
    • 学会等名
      第46回発生生物学会
    • 発表場所
      松江
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [学会発表] 既報の次世代シーケンサ解析データを可視化するための簡易ソフトウェア2013

    • 著者名/発表者名
      沖真弥
    • 学会等名
      定量生物学の会第六回年会
    • 発表場所
      大阪大学吹田キャンパス銀杏会館
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770254
  • [学会発表] 既報の次世代シーケンサ解析データを可視化するための簡易ソフトウェア2013

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      定量生物学の会 第六回年会
    • 発表場所
      大阪大学吹田キャンパス 銀杏会館
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770254
  • [学会発表] マウス初期発生におけるFgfシグナルの役割-化学的阻害剤を用いた高時間分解能解析-2010

    • 著者名/発表者名
      沖真弥 ,目野主税
    • 学会等名
      第43回日本発生生物学会年会
    • 発表場所
      京都市
    • 年月日
      2010-06-21
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [学会発表] マウス初期発生におけるFgfシグナルの役割2010

    • 著者名/発表者名
      沖真弥, ら
    • 学会等名
      第43回日本発生生物学会年会
    • 発表場所
      京都国際会館
    • 年月日
      2010-06-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21657059
  • [学会発表] Reversal of left-right asymmetry induced by aberrant Nodal signaling in the node of mouse embryos2009

    • 著者名/発表者名
      Oki et al.
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [学会発表] Reversal of left-right asymmetry induced by aberrant Nodal signaling in the node of mouse embryos.2009

    • 著者名/発表者名
      Oki, et al.
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21116002
  • [学会発表] Reversal of left-right asymmetry induced by aberrant Nodal signaling in the node of mouse embryos2009

    • 著者名/発表者名
      Oki, et al
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2009-12-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21657059
  • [学会発表] 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥
    • 学会等名
      定量生物学の会 第7回年会
    • 発表場所
      春日市 九州大学筑紫キャンパス
    • 年月日
      2015-01-11 – 2015-01-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840087
  • [学会発表] 高血糖症はマウス胚の左右軸形成を阻害することで心臓形態形成を撹乱する

    • 著者名/発表者名
      蜂須賀 正紘、沖 真弥、北島 桂子、角 智行、目野 主税
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • [学会発表] SraTailor: 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール

    • 著者名/発表者名
      沖 真弥, 前原 一満, 大川 恭行, 目野 主税
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26291051
  • 1.  目野 主税 (20311764)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 30件
  • 2.  北島 桂子 (00332784)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 9件
  • 3.  大川 恭行 (80448430)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 7件
  • 4.  竹本 龍也 (30443899)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  沢津橋 俊 (70535103)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  和田 洋 (50212329)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  大隅 典子 (00220343)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  黒坂 寛 (20509369)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 9.  津山 濯 (40786183)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 10.  原 塑 (70463891)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 11.  犬伏 俊博 (30550941)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 12.  中谷 明弘 (60301149)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 13.  山城 隆 (70294428)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 14.  真下 知士 (80397554)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 15.  雉子谷 佳男 (10295199)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  光田 展隆 (80450667)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 17.  高田 直樹 (90605544)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 18.  北島 智也 (00376641)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 19.  林 陽平 (00588056)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 20.  林 克彦 (20287486)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 21.  中馬 新一郎 (20378889)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 22.  秋光 信佳 (40294962)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 23.  吉田 松生 (60294138)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 24.  加藤 譲 (60570249)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 25.  井上 貴美子 (70360500)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 26.  ZOU ZHAONAN
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 27.  川路 英哉
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 28.  吉崎 嘉一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 29.  中山 秀樹
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 30.  岡田 誠司
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 31.  中尾 光善
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 32.  山下 典子
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 7件
  • 33.  永野 聡一郎
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 34.  宮本 洋一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 35.  瀬々 潤
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 36.  吉川 貴子
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 37.  木村 龍一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 38.  望月 研太郎
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 39.  近藤 寿人
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 40.  吉田 哲
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 41.  青木 吉嗣
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 42.  濱田 博司
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 43.  本田 瑞季
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 44.  山西 芳裕
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 45.  赤司 浩一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 46.  花松 久寿
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 47.  深田 宗一朗
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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