平瀬祥太朗 Hirase Shotaro

研究者番号	90635559
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2016年度 – 2024年度: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 2017年度: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 助教 2015年度: 東京大学, 農学生命科学研究科, 助教 2014年度: 東京大学, 大気海洋研究所, 研究員
審査区分/研究分野	研究代表者小区分39060:生物資源保全学関連 / 小区分45030:多様性生物学および分類学関連 / 森林圏科学、水圏応用科学およびその関連分野 / 水圏生命科学研究代表者以外小区分45030:多様性生物学および分類学関連 / 中区分40:森林圏科学、水圏応用科学およびその関連分野 / 水圏生産科学
キーワード	研究代表者交雑 / 集団ゲノミクス / 交雑帯 / SNP / 日本列島 / 生殖隔離 / アワビ / 次世代シーケンサー / 絶滅危惧種 / 大型アワビ … もっと見る / 貝殻 / 種分化逆転 / 表現型 / Mito-nuclear discordance / de novo genome assembly / シロウオ / アゴハゼ / mito-nuclear discordance / 核ゲノム / 系統地理 / 東シナ海 / 日本海 / ミトコンドリアゲノム / 全ゲノム / 雑種種分化 / ゲノム不和合 / 二次的接触帯 / 近縁種群 / 集団ゲノミクス解析 / 全ゲノム解析 / GRAD-Di / コピー数多型 / 集団遺伝 / 集団動態モデリング / 大型アワビ類 / 保全 / GRAS-Di / ゲノムシーケンス / 種分化 / ミトコンドリアDNA / ボトルネック / RADシーケンス / クラスタリング分析 / 集団構造 / 侵入種 / RAD-seq / 遺伝的撹乱 / 分子系統地理 / マハゼ … もっと見る研究代表者以外縄張り行動 / 行動ゲノミクス / 行動内分泌学 / 進化機構 / 生態ゲノミクス / 魚類 / 本能行動 / 行動遺伝 / 行動生態 / 行動遺伝学 / 行動生態学 / 適応進化 / 繁殖戦略 / 魚 / 貝 / 性決定遺伝子 / 性染色体 / 性決定 / 地域適応遺伝子 / ゲノム解析 / 遺伝資源 / 遺伝的多様性 / 水産学隠す

幻の「マダカアワビ」における種分化逆転仮説の検証研究代表者
- 研究代表者
  
  平瀬祥太朗
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分39060:生物資源保全学関連
- 研究機関
  東京大学
急速な進化を逆利用して水産生物の性決定遺伝子をとらえる
- 研究代表者
  
  菊池潔
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分40:森林圏科学、水圏応用科学およびその関連分野
- 研究機関
  東京大学
トゲウオ科魚類をモデルとした繁殖行動形質の適応的多様化のゲノム基盤
- 研究代表者
  
  小北智之
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分45030:多様性生物学および分類学関連
- 研究機関
  九州大学
交雑起源の新規集団のゲノム進化に関する包括的研究研究代表者
- 研究代表者
  
  平瀬祥太朗
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分45030:多様性生物学および分類学関連
- 研究機関
  東京大学
日本列島のアワビ類における種分化遺伝子の探索研究代表者
- 研究代表者
  
  平瀬祥太朗
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 研究分野
  
  森林圏科学、水圏応用科学およびその関連分野
- 研究機関
  東京大学
全ゲノムリシーケンスによる高効率な海産魚遺伝資源管理技術の開発
- 研究代表者
  
  菊池潔
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2017
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  水圏生産科学
- 研究機関
  東京大学
沿岸生物種において遺伝的撹乱は起こっているか：マハゼの大規模DNA分析からの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  平瀬祥太朗
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  水圏生命科学
- 研究機関
  東京大学

すべて 2024 2023 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] 1. 集団ゲノミクス:SNP 検出と解析2024
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗
- 雑誌名
  
  日本水産学会誌
  
  巻: 90 ページ: 141-141
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K05267
[雑誌論文] 6. 日本産大型アワビ類における種分化と適応進化の遺伝基盤2024
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗
- 雑誌名
  
  日本水産学会誌
  
  巻: 90 ページ: 146-146
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K05267
[雑誌論文] 集団ゲノミクス:SNP 検出と解析2024
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗
- 雑誌名
  
  水産育種
  
  巻: 53 ページ: 25-34
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K05267
[雑誌論文] 日本産大型アワビ類における種分化と適応進化の遺伝基盤2024
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗
- 雑誌名
  
  水産育種
  
  巻: 53 ページ: 55-62
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K05267
[雑誌論文] Genomic and phenotypic consequences of two independent secondary contact zones between allopatric lineages of the anadromous ice goby Leucopsarion petersii2020
- 著者名/発表者名
  Hirase S, Kokita T, Nagano JA, Kikuchi K
- 雑誌名
  
  Heredity
  
  巻: 124 号: 1 ページ: 223-235
- DOI
  10.1038/s41437-019-0239-6
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[雑誌論文] Integrative genomic phylogeography reveals signs of mitonuclear incompatibility in a natural hybrid goby population2020
- 著者名/発表者名
  Shotaro Hirase, Ayumi Tezuka, Atsushi J. Nagano, Mana Sato, Sho Hosoya, Kiyoshi Kikuchi, Wataru Iwasaki
- 雑誌名
  
  Evolution
  
  巻: 75 号: 1 ページ: 176-194
- DOI
  10.1111/evo.14120
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Genetic isolation by distance in the yellowfin goby populations revealed by RAD sequencing2020
- 著者名/発表者名
  Hirase S, Tezuka A, Nagano JA, Kikuchi K, Iwasaki W
- 雑誌名
  
  Ichthyological Research
  
  巻: 67 号: 1 ページ: 98-104
- DOI
  10.1007/s10228-019-00709-6
- NAID
  40022132569
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Complex phylogeographic patterns in the intertidal goby Chaenogobius annularis around Kyushu Island as a boundary zone of three different seas2020
- 著者名/発表者名
  Shuya Kato, Seiji Arakaki, Kiyoshi Kikuchi, Shotaro Hirase
- 雑誌名
  
  Ichthyological Research
  
  巻: 68 号: 1 ページ: 86-100
- DOI
  10.1007/s10228-020-00772-4
- NAID
  40022462082
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[雑誌論文] Phylogeography of the yellowfin goby Acanthogobius flavimanus in native and non-native distributions2017
- 著者名/発表者名
  Hirase S, Chambers S, Hassell K, Carew M, Pettigrove V, Soyano K, Nagae M, Iwasaki W.
- 雑誌名
  
  Marine Biology
  
  巻: -
- 査読あり / 謝辞記載あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26850131
[雑誌論文] Mitogenome Sequencing Alleviates Random Rooting Effect in Phylogeography.2016
- 著者名/発表者名
  Shotaro Hirase, Hirohiko Takeshima, Mutsumi Nishida, Wataru Iwasaki
- 雑誌名
  
  Genome Biology and Evolution
  
  巻: - 号: 4 ページ: 1267-1278
- DOI
  10.1093/gbe/evw063
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K07538, KAKENHI-PROJECT-15J06937, KAKENHI-PROJECT-25340063, KAKENHI-PROJECT-26850131, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Stability of genetic diversity in an intertidal goby against tsunami disturbances2016
- 著者名/発表者名
  Hirase S, Ikeda M, Hayasaka S, Iwasaki W, Kijima A.
- 雑誌名
  
  Marine Ecology
  
  巻: 37 号: 5 ページ: 1161-1167
- DOI
  10.1111/maec.12377
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26850131
[学会発表] 日本産大型アワビ類における種分化と適応進化の遺伝基盤2023
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗
- 学会等名
  令和5年度日本水産学会秋季大会：ミニシンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K05267
[学会発表] 集団パラロガスゲノミクスで迫る日本産アワビ類の種分化と適応進化2023
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗
- 学会等名
  日本進化学会第 25 回沖縄大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K05267
[学会発表] 集団ゲノミクス:SNP 検出と解析2023
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗
- 学会等名
  令和5年度日本水産学会秋季大会：ミニシンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K05267
[学会発表] Mito-nuclear discordanceを示すアゴハゼ東シナ海系統の形成史2021
- 著者名/発表者名
  加藤柊也、新垣誠司、永野惇、菊池潔、平瀬祥太朗
- 学会等名
  令和3年度日本水産学会春季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] シロウオ日本海系統における緯度適応と集団ゲノミクス解析2021
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗、菊池潔、永野惇、小北智之
- 学会等名
  令和3年度日本水産学会春季大会（ウェブ大会）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] 日本産大型アワビ類3種の種分化プロセスの推定と遺伝子コピー数多型の検出2020
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗, 山崎曜, 關野正志, 池田実, 原素之, 菊池　潔
- 学会等名
  令和2年度日本水産学会春季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K19280
[学会発表] シロウオ日本海系統における遺伝子流動下での局所適応2020
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗、菊池潔、永野惇、小北智之
- 学会等名
  第53回日本魚類学会年会（ウェブ大会）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] 九州沿岸に着目したドロメとアゴハゼの比較集団ゲノミクス解析2020
- 著者名/発表者名
  加藤柊也、新垣誠司、永野惇、菊池潔、平瀬祥太朗
- 学会等名
  第53回日本魚類学会年会（ウェブ大会）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] ゲノムワイドSNP解析による日本産大型アワビ類3種の遺伝的類縁関係2019
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗・關野正志・池田実・原素之・菊池　潔
- 学会等名
  平成31年度日本水産学会春季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K19280
[学会発表] Population genomics of Pacific abalone species complex in early phase of marine speciation2019
- 著者名/発表者名
  Shotaro Hirase, Masashi Sekino, Minoru Ikeda, Motoyuki Hara, Kiyoshi Kikuchi
- 学会等名
  Evolution2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K19280
[学会発表] アゴハゼ2グループの交雑集団の全ゲノム解析2019
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗
- 学会等名
  第66回　日本生態学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] シロウオの五島集団の高い遺伝的固有性2019
- 著者名/発表者名
  佐藤耕平・小北智之・永野惇・菊池潔・平瀬祥太朗
- 学会等名
  平成31年度日本水産学会春季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] 九州周辺におけるアゴハゼの分子系統地理2019
- 著者名/発表者名
  加藤柊也, 新垣誠司, 菊池　潔, 平瀬祥太朗
- 学会等名
  第52回魚類学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] 主成分分析による地域適応遺伝子の探索2018
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗・手塚あゆみ・永野惇・菊池潔・岩崎渉
- 学会等名
  平成30年度日本水産学会春季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14966
[学会発表] Mitonuclear incompatibilities promoted mitogenome evolution2018
- 著者名/発表者名
  Shotaro Hirase, Ayumi Tezuka, Atsushi J. Nagano, Mana Sato, Sho Hosoya, Kiyoshi Kikuchi, Wataru Iwasaki
- 学会等名
  Stickleback2018
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] 主成分分析による地域適応遺伝子の探索2018
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗, 手塚あゆみ, 永野惇, 菊池潔, 岩崎渉
- 学会等名
  平成30年日本水産学会春季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K19280
[学会発表] Mitonuclear incompatibilities promoted mitogenome evolution in a hybrid population2018
- 著者名/発表者名
  Shotaro Hirase, Ayumi Tezuka, Atsushi J. Nagano, Mana Sato, Sho Hosoya, Kiyoshi Kikuchi, Wataru Iwasaki
- 学会等名
  Evolution2018
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] “進化の実験場”としての日本列島：魚類の交雑集団のゲノミクス2018
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗
- 学会等名
  第51回魚類学会年会　創立50周年記念シンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] Mitonuclear incompatibilities promoted mitogenome evolution in a hybrid population2018
- 著者名/発表者名
  Shotaro Hirase, Ayumi Tezuka, Atsushi J. Nagano, Mana Sato, Sho Hosoya, Kiyoshi Kikuchi, Wataru Iwasaki
- 学会等名
  The 46th Naito Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02493
[学会発表] Footprints of selection around the sex determining gene in fugu2017
- 著者名/発表者名
  Kabir Ahammad, Risa Ieda, Shotaro Hirase, Takashi Koyama, Satoshi Tasumi, Sho Hosoya, Kiyoshi Kikuchi
- 学会等名
  International symposium, Fisheries Science for Future Generations
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14966
[学会発表] RAD-seqによるシロウオ太平洋型と日本海型の交雑集団の遺伝解析2017
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗，小北智之，永野惇，菊池潔
- 学会等名
  平成29年度日本水産学会春季大会
- 発表場所
  東京海洋大学品川キャンパス（東京都港区）
- 年月日
  2017-03-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26850131
[学会発表] RAD-seqによるシロウオ太平洋型と日本海型の交雑集団の遺伝解析2017
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗・小北智之・永野惇・菊池潔
- 学会等名
  平成29年度日本水産学会春季大会
- 発表場所
  東京海洋大学（東京・品川）
- 年月日
  2017-03-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14966
[学会発表] マハゼの在来地域および侵入地域の分子系統地理2016
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗・Sherrie Chambers・Kathryn Hassell・Melissa Carew・Vincent Pettigrove・征矢野清・長江真樹・岩崎渉
- 学会等名
  平成28年度日本水産学会春季大会
- 発表場所
  東京海洋大学　品川キャンパス
- 年月日
  2016-03-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26850131
[学会発表] RAD-Seq analysis of an intertidal goby Chaenogobius annularis uncovered stable hybrid population with novel genomic composition2016
- 著者名/発表者名
  Hirase S, Tezuka A, Nagano A, Iwasaki W.
- 学会等名
  The 2016 annual meeting of the Society for the Study of Evolution, the Society of Systematic Biologists, and the American Society of Naturalists
- 発表場所
  Austin（United States of America）
- 年月日
  2016-06-17
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26850131
[学会発表] 新たなゲノム構成を有する交雑集団の形成：アコハゼのRAD-seq解析2016
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗，手塚あゆみ，永野惇，岩崎渉
- 学会等名
  日本進化学会第18回大会
- 発表場所
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都目黒区）
- 年月日
  2016-08-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26850131
[学会発表] How is a novel genetic group generated through hybridization? A RAD-seq analysis of an intertidal goby Chaenogobius annularis (Agohaze)2016
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗，手塚あゆみ，永野惇，岩崎渉
- 学会等名
  第16回東京大学生命科学シンポジウム
- 発表場所
  東京大学駒場キャンパス（東京都目黒区）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26850131
[学会発表] 日本列島におけるマハゼの分子系統地理および侵入集団の起源の検討2015
- 著者名/発表者名
  平瀬祥太朗・岩崎渉
- 学会等名
  2015年度日本魚類学会年会
- 発表場所
  近畿大学　奈良キャンパス
- 年月日
  2015-09-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26850131

1. 菊池潔 (20292790)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
2. 細谷将 (60526466)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
3. 小北智之 (60372835)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 4件
4. 關野正志 (90371799)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
5. 片町太輔 (60443371)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 鈴木重則 (60463105)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 岩崎渉 (50545019)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
8. 小山喬 (40749701)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 竹内裕 (70418680)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 佐々木猛智 (70313195)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 武島弘彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

平瀬 祥太朗 Hirase Shotaro

研究課題

研究成果

共同研究者

幻の「マダカアワビ」における種分化逆転仮説の検証研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

急速な進化を逆利用して水産生物の性決定遺伝子をとらえる

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

トゲウオ科魚類をモデルとした繁殖行動形質の適応的多様化のゲノム基盤

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

交雑起源の新規集団のゲノム進化に関する包括的研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

日本列島のアワビ類における種分化遺伝子の探索研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

全ゲノムリシーケンスによる高効率な海産魚遺伝資源管理技術の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

沿岸生物種において遺伝的撹乱は起こっているか：マハゼの大規模DNA分析からの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] 1. 集団ゲノミクス:SNP 検出と解析2024

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] 6. 日本産大型アワビ類における種分化と 適応進化の遺伝基盤2024

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] 集団ゲノミクス:SNP 検出と解析2024

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] 日本産大型アワビ類における種分化と 適応進化の遺伝基盤2024

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Genomic and phenotypic consequences of two independent secondary contact zones between allopatric lineages of the anadromous ice goby Leucopsarion petersii2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Integrative genomic phylogeography reveals signs of mitonuclear incompatibility in a natural hybrid goby population2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Genetic isolation by distance in the yellowfin goby populations revealed by RAD sequencing2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Complex phylogeographic patterns in the intertidal goby Chaenogobius annularis around Kyushu Island as a boundary zone of three different seas2020

著者名/発表者名

平瀬祥太朗 Hirase Shotaro

[雑誌論文] 6. 日本産大型アワビ類における種分化と適応進化の遺伝基盤2024

[雑誌論文] 日本産大型アワビ類における種分化と適応進化の遺伝基盤2024

[学会発表] 日本産大型アワビ類における種分化と適応進化の遺伝基盤2023