西川建 NISHIKAWA Ken

… 別表記

西川健 NISHIKAWA Kwn

研究者番号	10093288
その他のID
外部サイト
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2007年度 – 2009年度: 前橋工科大学, 工学部・生命情報学科, 教授 2001年度 – 2006年度: 国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJ研究センター, 教授 2002年度: 国立遺伝学研究所, DDBJ研究センター, 教授 1997年度 – 2000年度: 国立遺伝学研究所, 教授 1997年度 – 2000年度: 国立遺伝学研究所, 生命情報センター, 教授 1996年度 – 2000年度: 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授
審査区分/研究分野	研究代表者生物系 / 応用ゲノム科学 / 生物物理学研究代表者以外生物系 / 遺伝 / 生物物理学 / 進化生物学
キーワード	研究代表者真核生物 / 転写因子 / 蛋白質 / ゲノム / 不規則領域 / 情報解析 / 構造ドメイン / モデリング / 分子進化 / 立体構造 … もっと見る / タンパク質 / sampling theory / molecular dynamics / modeling / protein / Biophysics / 統計ポテンシャル / 力場 / マルチカノニカル法 / 構造サンプリング / 分子動力学シミュレーション / 最適化問題 / 分子動力学 / 生物物理 / protein three-dimensional structure / assembly PCR method / chimera protein / folding pattern / evolutionary protein engineering / design of artificial protein / molecular evolution / periplasmic binding protein / アセンフーリーPCR法 / タンパク質立体構造 / アセンブリーPCR法 / キメラタンパク質 / 折れたたみパターン / 進化工学 / 人工タンパク質デザイン / ペリプラズム結合タンパク質 / 膜タンパク質 / 天然タンパク質 / 細胞内局在 / 構造未知ドメイン / スプライシング / 天然変性タンパク質 / 比較ゲノム解析 / 古細菌 / 真正細菌 / アノテーション / 転写因子ファミリー / タンパク質分類 / 機能予測 / 偽遺伝子 / 立体構造予測 / データベース構築 / ホモロジー検索 / 局所構造 / ドメイン / 選択的スプライシング / ゲノム情報解析 … もっと見る研究代表者以外 DDBJ / タンパク質 / FAMSBASE / GenBank / 立体構造 / EMBL / DNA / ゲノム / GTOP / FAMS / CAFASP / CASP / ホモロジーモデリング / タンパク質立体構造予測 / INSDB / NCBI / 膜タンパク質 / 立体構造予測 / bioinformatics / protein / Gen Bank / 生命情報学 / データベース / プロテオーム / 計算生物学 / data standardization / human genes / evolutionary information / annotation / genome / biological database / International visit / 国際DNAデータバンク実務者会議 / 非タンパク質遺伝子 / チンパンジー染色体 / ヒト発現遺伝子 / イネゲノム / マイクロアレイデータ / Annotation / UniProt / DNA配列データベース / ヒト遺伝子 / アノテーション / 進化情報 / 多国籍 / 国際情報交換 / prediction / structure / 機能進化解析 / タンパク質データベ-ス / 遺伝子 / バイオインフォマティックス / FAMS、FAMSBASE / アライメント / コンピュータ解析 / 予測 / Molecular simulation / Homology modeling / Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction / Protein structure prediction / Genome function prediction / Bioinformatics / Computational biology / 3Dキーノート / 国際予測コンテストCASP4 / らん藻ゲノム / SOSUI / Gtop / 予測生物学 / アブイニシオ / シミュレーション / CASP5 / 分子シミュレーション / 構造予測国際コンテストCASP / ゲノム機能予測 / 生命情報科学 / Human genome / 分子進化 / ヒトゲノム / stabilization factors of proteins / prediction of tertiary structure / X-ray analysis / hydrophobic interaction / hydrogen bond / DSC / lysozyme / stability of proteins / 熱測定 / リゾチーム / 安定性 / Module / Threading / principal variety of protein folds / Structural prediction / Structural comparison / Principle of architecture / Three-dimensional structure / Protein / 膜蛋白質 / 相同蛋白質 / タンパク質デザイン / モデリング / 構造分類 / 蛋白質 / リゾチウム / キメラタンパク / ファージディスプレイ / 立体構造比較 / スレッティング / モジュール / スレッディング / 立体構造基本型 / 構造予測 / 構造比較 / 構築原理 / EBI / database / プロテオミックス / 機能ゲノミックス / 構造ゲノミックス / タンパク質立体構造 / ゲノム情報 / 構造生物学隠す

タンパク質の不規則領域と選択的スプライシングに関するヒトプロテオーム情報解析研究代表者
- 研究代表者
  
  西川建
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2009
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用ゲノム科学
- 研究機関
  前橋工科大学
転写因子の比較ゲノム情報解析:原核型との対比における真核型転写因子の差異と特性研究代表者
- 研究代表者
  
  西川建
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2007
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  前橋工科大学
   国立遺伝学研究所
微生物ゲノムを対象とした機能アノテーション全自動化システムの開発研究代表者
- 研究代表者
  
  西川建
- 研究期間 (年度)
  2005
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
タンパク質の高精度モデリング計算システムの開発研究代表者
- 研究代表者
  
  西川建
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2006
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  応用ゲノム科学
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
現地共同体制による進化基礎情報の収集と調査
- 研究代表者
  
  舘野義男
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2007
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  進化生物学
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
ホモロジーモデリングによるゲノム規模の蛋白質構造データベースの構築と機能推定
- 研究代表者
  
  梅山秀明
- 研究期間 (年度)
  2003 – 2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  北里大学
ゲノム情報からのタンパク質構造の分類と予測研究代表者
- 研究代表者
  
  西川建
- 研究期間 (年度)
  2002
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
タンパク質高次構造情報の整備・流通と予測情報の評価(調整班)
- 研究代表者
  
  郷通子
- 研究期間 (年度)
  2000 – 2002
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  名古屋大学
タンパク質立体構造の進化過程を実験的に検証する研究代表者
- 研究代表者
  
  西川建
- 研究期間 (年度)
  2000 – 2002
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
プロテオーム時代の計算情報生物学
- 研究代表者
  
  郷通子
- 研究期間 (年度)
  1999
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  名古屋大学
塩基配列データベースをはじめとする生物学データベースの構築と利用に関する研究
- 研究代表者
  
  五條堀孝 (五條掘孝)
- 研究期間 (年度)
  1998 – 2000
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  遺伝
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
蛋白質の立体構造安定性マップ作製のための基盤研究
- 研究代表者
  
  油谷克英
- 研究期間 (年度)
  1997 – 1999
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  大阪大学
DNAデーターベースを中心とする生命情報学データベースの構築に関する研究
- 研究代表者
  
  五條堀孝 (五條掘孝)
- 研究期間 (年度)
  1995 – 1997
- 研究種目
  
  国際学術研究
- 研究分野
  
  遺伝
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
タンパク質立体構造の比較・予測・デザイン
- 研究代表者
  
  郷信広, 野口俊之
- 研究期間 (年度)
  1995 – 1999
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  京都大学
   名古屋大学

すべて 2010 2009 2008 2007 2006 2005 2004 2003 2002 2001 2000

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Development of an accurate classification system of proteins into stru ctured and unstructured regions that uncovers novel structural domains : Its application to human transcription factors2009
- 著者名/発表者名
  S.Fukuchi, K.Homma, Y.Minezaki, T.Gojobori, K.Nishikawa
- 雑誌名
  
  BMC Structural Biology 9:26
  
  ページ: 1-13
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[雑誌論文] Development of an accurate classification system of proteins into structured and unstructured regions that uncovers novel structural domains: Its application to human transcription factors.2009
- 著者名/発表者名
  Fukuchi, S., Homma, K., Minezaki, Y., Gojobori, T., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  BMC Struct. Biology
  
  ページ: 1-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[雑誌論文] 天然変性タンパク質とは何か?2009
- 著者名/発表者名
  西川建
- 雑誌名
  
  生物物理 49
  
  ページ: 4-10
- NAID
  110007044740
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[雑誌論文] Natively unfolded proteins: an overview.2009
- 著者名/発表者名
  Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Biophysics 5
  
  ページ: 53-58
- NAID
  130000119936
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[雑誌論文] The GTOP database in 2009: updated content and novel features to expand and deepen insights into protein structures and functions.2009
- 著者名/発表者名
  Fukuchi, S., Homma, K., Sakamoto, S., Sugawara, H., Tateno, Y., Gojobori, T., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Nucl. Acids Res. 37
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[雑誌論文] Natively unfolded proteins : An overview2009
- 著者名/発表者名
  K.Nishikawa
- 雑誌名
  
  Biophysics 5
  
  ページ: 53-58
- NAID
  130000119936
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[雑誌論文] 天然変性タンパク質とは何か?2009
- 著者名/発表者名
  西川建
- 雑誌名
  
  生物物理 Vol.49
  
  ページ: 4-10
- NAID
  110007044740
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[雑誌論文] 植物転写因子のゲノム情報解析2008
- 著者名/発表者名
  細田和男、西川建
- 雑誌名
  
  前橋工科大学研究紀要 11
  
  ページ: 5053-5053
- NAID
  110007124339
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18017025
[雑誌論文] Intrinsically disordered regions of human plasma membrane proteins preferentially occur in the cytoplasmic segment.2007
- 著者名/発表者名
  Minezaki, Y., Homma, K., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol. 368
  
  ページ: 902-913
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[雑誌論文] タンパク質の常識を覆す不定形の鎖2007
- 著者名/発表者名
  西川建
- 雑誌名
  
  日経サイエンス 37
  
  ページ: 2837-2837
- NAID
  140000294095
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18017025
[雑誌論文] 長大な不規則領域をもつ蛋白質 : ヒト転写因子を例として2006
- 著者名/発表者名
  西川建
- 雑誌名
  
  蛋白質・核酸・酵素 51(13)
  
  ページ: 1827-1835
- NAID
  40015148971
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18017025
[雑誌論文] Intrinsically disordered loops inserted into the structural domains of human proteins.2006
- 著者名/発表者名
  Fuuchi, S., Homma, K., Minezaki, Y., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol. 355
  
  ページ: 845-857
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] Human transcription factors contain a high fraction of intrinsically disordered regions essential for transcriptional regulation.2006
- 著者名/発表者名
  Minezaki, Y., Homma, K., Kinjo, A.R., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol. 359
  
  ページ: 1137-1149
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] Stabilization of E. coli ribonuclease HI by the 'stability profile of mutant protein'(SPMP)-inspired random and non-random mutagenesis.2006
- 著者名/発表者名
  Haruki, M., Saito, Y., Ota, M., Nishikawa, K., Kanaya, S.
- 雑誌名
  
  J. Biotech. 124
  
  ページ: 512-522
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] Analysis of amino acid residues involved in the catalysis of polyethylene glycol dehydrogenase from sphingomonas terrae using three-dimensional molecular modeling-based kinetic characterization of mutants.2006
- 著者名/発表者名
  Ohta, T, Kawabata, T, Nishikawa, K, Tani, A, Kimbara, K, Kawai, F.
- 雑誌名
  
  Appl. Environ. Microbiol. 72
  
  ページ: 4388-4396
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] Predicting secondary structures, contact numbers and residue-wise contact orders of native protein structure from amino acid sequence using critical random networks c2005
- 著者名/発表者名
  Kinjo, A.R., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Biophysics 1
  
  ページ: 67-74
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] Predicting absolute contact numbers of native protein structure from amino acid sequence c2005
- 著者名/発表者名
  Kinjo, A.R., Horimoto, K., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Proteins 58
  
  ページ: 158-165
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] Predicting absolute contact numbers of native protein structure from amino acid sequence.2005
- 著者名/発表者名
  Kinjo, A.R., Horimoto, K., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Proteins 58
  
  ページ: 158-165
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] A complete set of Escherichia coli open reading frames in mobile plasmids facilitating genetic studies c2005
- 著者名/発表者名
  Saka, K., Tadenuma, M., Nakade, S., Tanaka, N., Sugawara, H., Nishikawa, K., Ichiyoshi, N., Kitagawa, M., Mori, H., Ogasawara, N., Nishimura, A.
- 雑誌名
  
  DNA Res. 12
  
  ページ: 63-68
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] The map-based sequence of the rice genome.2005
- 著者名/発表者名
  (International Rice Genome Sequencing Project : Annotation and Analysis) Iwama, H., Gojobori, T., Itoh, T., Niimura, Y., Fujii, Y., Habara T., Sakai, H., Sato, Y., Wilson, G., Kumar, K., McCouch, S., Juretic, N., Hoen, D., Wright, S., Bruskiewich, R., Bureau T., Miyao, A., Hirochika, H., Nishikawa, T., Kadowaki, K., Sugiura, M.
- 雑誌名
  
  Nature 436
  
  ページ: 793-800
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] Recoverable one-dimensional encoding of three-dimensional protein structures c2005
- 著者名/発表者名
  Kinjo, A.R., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics 21(10)
  
  ページ: 2167-2170
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] Integrative annotation of 21,037 human genes validated by full-length cDNA clones.2004
- 著者名/発表者名
  著者多数、その中に西川健
- 雑誌名
  
  PLoS Biology 2
  
  ページ: 856-875
- NAID
  120004667172
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] Estimation of the number of authentic orphan genes in bacterial genomes.2004
- 著者名/発表者名
  Fukukuchi, S., Nishikawa K.
- 雑誌名
  
  DNA Res. 11
  
  ページ: 219-231
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] タンパク質から見た極限微生物の環境適応戦略2004
- 著者名/発表者名
  吉宗一晃, 福地佐斗志, 森口光瞭, 西川健
- 雑誌名
  
  バイオサイエンスとインダストリー
  
  ページ: 6-6
- NAID
  10016213588
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] Estimation of the number of authentic orphan genes in bacterial genomes.2004
- 著者名/発表者名
  Fukukuchi, S., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  DNA Res. 11
  
  ページ: 219-231
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] Eigenvalue analysis of amino acid substitution matrices reveals a sharp transition of the mode of sequence conservation in proteins.2004
- 著者名/発表者名
  Kinjo, A.R., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics 20(16)
  
  ページ: 2504-2508
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] Estimation of the number of authentic orphan genes in bacterial genomes.2004
- 著者名/発表者名
  Fukuchi, S., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  DNA Research 11
  
  ページ: 219-231
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16255006
[雑誌論文] Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain.2004
- 著者名/発表者名
  Homma, K., Kikuno, R.F., Nagase, T., Ohara, O., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  J.Mol.Biol. 343
  
  ページ: 1207-1220
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] Estimation of the number of authentic orphan genes in bacterial genomes2004
- 著者名/発表者名
  Fukuchi, S., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  DNA Res. 11
  
  ページ: 219-231
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] Unique amino acid composition of proteins in halophilic bacteria2003
- 著者名/発表者名
  Fukuchi, S., Yoshimune, K., Wakayama, M., Moriguchi, M., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol. 327(2)
  
  ページ: 347-357
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Compositional changes in RNA, DNA and proteins for bacterial adaptation to higher and lower temperatures.2003
- 著者名/発表者名
  Nakashima, H., Fukuchi, S., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  J. Biochem. 133
  
  ページ: 507-513
- NAID
  130003534527
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] Compositional changes in RNA, DNA and proteins for bacterial adaptation to higher and lower temperatures2003
- 著者名/発表者名
  Nakashima, H., Fukuchi, S., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  J. Biochem. 133(4)
  
  ページ: 507-513
- NAID
  130003534527
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Compositional changes in RNA, DNA and proteins for bacterial adaptation to higher and lower temperatures2003
- 著者名/発表者名
  Nakashima, H., Fukuchi, S., Nishikawa.K.
- 雑誌名
  
  J.Biochem. 133 (4)
  
  ページ: 507-513
- NAID
  130003534527
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Parallel Evolution of Ligand Specificity Between LacI/GalR Family Repressors and Periplasmic Sugar-Binding Proteins.2003
- 著者名/発表者名
  Fukami-Kobayashi K., Tateno, Y., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Mol. Biol. Evol. 20
  
  ページ: 267-277
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] Parallel Evolution of Ligand Specificity Between LacI/GalR Family Repressors and Periplasmic Sugar-Binding Proteins.2003
- 著者名/発表者名
  Fukami-Kobayashi K., Tateno, Y., Nishikawa K.
- 雑誌名
  
  Mol.Biol.Evol. 20
  
  ページ: 267-277
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] Unique amino acid composition of proteins in halophilic bacteria2003
- 著者名/発表者名
  Fukuchi, S., Yoshimune, K., Wakayama, M..Moriguchi, M., Nishikawa.K.
- 雑誌名
  
  J.Mol.Biol. 327(2)
  
  ページ: 347-357
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Compositional changes in RNA, DNA and proteins for bacterial adaptation to higher and lower temperatures.2003
- 著者名/発表者名
  Nakashima, H., Fukuchi, S., Nishikawa K.
- 雑誌名
  
  J.Biochem. 133
  
  ページ: 207-513
- NAID
  130003534527
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15013251
[雑誌論文] ゲノム情報からタンパク質立体構造予測へ : GTOPデータベーズの構築とそれを利用した応用研究2002
- 著者名/発表者名
  西川建
- 雑誌名
  
  生物物理 42(5)
  
  ページ: 224-229
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] KdsA mutations affect FtsZ-ring formation in Escherichia coli K-122002
- 著者名/発表者名
  Fujishima, H., Nishimura, A., Wachi, M., Takagi, H., Hirasawa, T.Teraoka, H., Nishimori, K., Kawabata, T., Nishikawa, K., Nagai, K.
- 雑誌名
  
  Microbiology 148(pt1)
  
  ページ: 103-112
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] GTOP : from genomic information to a prediction for protein tertiary structure-building a database and utilize it for an applied research2002
- 著者名/発表者名
  Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Seibutsu Butsuri 42(5)
  
  ページ: 224-229
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] A systematic investigation identifies a significant number of probable pseudogenes in the Escherichia coli genome2002
- 著者名/発表者名
  Homma, K., Fukuchi, S., Kawabata, T., Ota, M., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Gene. 294 (1-2)
  
  ページ: 25-33
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] GTOP : A database of protein structures predicted from genome sequences2002
- 著者名/発表者名
  Kawabata.T., Fukuchi, S., Homma, K., Ota, M., Araki, J., Ito, T., Ichiyoshi, N., Nishikawa.K.
- 雑誌名
  
  Nucl.Acids Res. 30(1)
  
  ページ: 294-298
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] A systematic investigation identifies a significant number of probable pseudogenes in the Escherichia coli genome2002
- 著者名/発表者名
  Homma, K., Fukuchi, S., Kawabata, T., Ota, M., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Gene 294(1-2)
  
  ページ: 25-33
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] 蛋白質立体構造予測データベースGTOP2001
- 著者名/発表者名
  川端猛, 西川建
- 雑誌名
  
  蛋白質核酸酵素増刊号「ゲノムサイエンスの新たなる挑戦」 46
  
  ページ: 2592-2597
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] GTOP : a database of protein 3D structure prediction2001
- 著者名/発表者名
  Kawabata, T., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Tanpakushitsu Kakusan Kouso, Extra Issue "A new challenge for genome science". 46
  
  ページ: 2592-2597
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Knowledge-based potential defined for a rotamer library to design prote in sequences2001
- 著者名/発表者名
  Ota, M., Isogai, Y., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Protein Engineer 14(8)
  
  ページ: 557-564
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Protein surface amino-acid compositions distinctively differ between thermophilic and mesophilic bacteria2001
- 著者名/発表者名
  Fukuchi, S., Nishikawa.K.
- 雑誌名
  
  J.Mol.Biol. 309(4)
  
  ページ: 835-843
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Knowledge-based potential defined for a rotamer library to design protein sequences2001
- 著者名/発表者名
  Ota.M., Isogai, Y., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Protein Engineer. 14(8)
  
  ページ: 557-564
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Protein surface amino-acid compositions distinctively differ between thermophilic and mesophilic bacteria2001
- 著者名/発表者名
  Fukuchi, S., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol. 309(4)
  
  ページ: 835-843
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] On prediction for protein 3D structure2001
- 著者名/発表者名
  Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Computer Today 18
  
  ページ: 10-15
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Directional gene distributions of two mycoplasma species exhibited in the nucleotide composition space2001
- 著者名/発表者名
  Nakashima, H., Yamashita, S., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Res.Comm.In Biochem., Cell ＆ Mol.Biol. 5
  
  ページ: 27-35
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Directional gene distributions of two mycoplasma species exhibited in the nucleotide composition space2001
- 著者名/発表者名
  Nakashima, H., Yamashita, S., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Res. Comm. In Biochem., Cell ＆ Mol. Biol. 5
  
  ページ: 27-35
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Protein structure comparison using the Markov transition model of evolution.2000
- 著者名/発表者名
  Kawabata, T., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  PROTEINS 41(1)
  
  ページ: 108-122
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Structural/functional assignment of unknown bacteriphage T4 proteins by iterative database searches.2000
- 著者名/発表者名
  Kawabata, T., Arisaka, F., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  GENE 259(1-2)
  
  ページ: 223-233
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Structural/functional assignment of unknown bacteriphage T4 proteins by iterative database searches.2000
- 著者名/発表者名
  Kawabata, T., Arisaka, F., Nishikawa.K.
- 雑誌名
  
  GENE 259(1-2)
  
  ページ: 223-233
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] The genomic DNA sequences of various species are distinctively distributed in nucleotide composition space.2000
- 著者名/発表者名
  Nakashima, H., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Res.Comm.Biochem.Cell ＆ Mol.Biol. 4
  
  ページ: 25-45
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Protein structure comparison using the Markov transition model of evolution.2000
- 著者名/発表者名
  Kawabata, T., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  PROTEINS 41 (1)
  
  ページ: 108-122
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Prediction for protein 3D structure : from genome information to 3D structure2000
- 著者名/発表者名
  Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Seibutsu Butsuri 40 (5)
  
  ページ: 307-308
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Redesign of artificial globins. Effects of residue replacements at hydrophobic sites on the structural properties.2000
- 著者名/発表者名
  Isogai, Y., Ishii, A., Fujisawa, T., Ota, M., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Biochemistry 39(19)
  
  ページ: 5683-5690
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] The genomic DNA sequences of various species are distinctively distributed in nucleotide composition space.2000
- 著者名/発表者名
  Nakashima, H., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Res. Comm. Biochem. Cell ＆ Mol. Biol. 4
  
  ページ: 25-45
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] Redesign of artificial globins. Effects of residue replacements at hydrophobic sites on the structural properties.2000
- 著者名/発表者名
  Isogai, Y., Ishii A., Fujisawa, T., Ota, M., Nishikawa, K.
- 雑誌名
  
  Biochemistry 39 (19)
  
  ページ: 5683-5690
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[雑誌論文] タンパク質の立体構造予測 : ゲノム情報からの立体構造予測2000
- 著者名/発表者名
  西川建
- 雑誌名
  
  生物物理 40(5)
  
  ページ: 307-308
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12207002
[学会発表] Development of an order/disorder assignment method for protein molecules and its application to the human proteome2010
- 著者名/発表者名
  K. Nishikawa
- 学会等名
  PepCon-2010
- 発表場所
  Beijing, China
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[学会発表] 天然変性タンパク質のゲノム情報解析2009
- 著者名/発表者名
  西川建
- 学会等名
  第9回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  熊本市
- 年月日
  2009-05-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[学会発表] 天然変性タンパク質のゲノム情報解析2009
- 著者名/発表者名
  西川建
- 学会等名
  第9回日本蛋白質科学会
- 発表場所
  熊本
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[学会発表] ミトコンドリア蛋白質は天然変性領域をもつか?2009
- 著者名/発表者名
  細田和男、福地佐斗志、西川建
- 学会等名
  第9回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  熊本市
- 年月日
  2009-05-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[学会発表] ヒト全タンパク質の未知領域を対象とした構造予測2009
- 著者名/発表者名
  富井健太郎、福地佐斗志、西川建
- 学会等名
  第9回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  熊本市
- 年月日
  2009-05-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[学会発表] ヒト・タンパク質の構造ドメイン/天然変性領域への区分2008
- 著者名/発表者名
  福地佐斗志, 細田和男, 西川建
- 学会等名
  第31回日本分子生物学
- 発表場所
  神戸
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[学会発表] ヒトタンパク質の構造ドメイン・天然変性領域への区分2008
- 著者名/発表者名
  福地佐斗志, 細田和男, 西川建
- 学会等名
  第31回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2008-12-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[学会発表] 天然変性蛋白質の特性:情報解析からわかったこと2008
- 著者名/発表者名
  西川建
- 学会等名
  第8回日本蛋白質科学会
- 発表場所
  東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133
[学会発表] 真核生物タンパク質のドメイン・不規則領域の推定2007
- 著者名/発表者名
  福地佐斗志、西川建
- 学会等名
  第30回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜、横浜市
- 年月日
  2007-12-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18017025
[学会発表] Intrinsic disorder of membrane proteins in the human proteome2007
- 著者名/発表者名
  K. Nishikawa, Y. Minezaki
- 学会等名
  The 21st Symposium of The Protein Society
- 発表場所
  ボストン
- 年月日
  2007-07-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310133

1. 梅山秀明 (20050619)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 0件
2. 小林薫(深海薫) (20225494)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 2件
3. 美宅成樹 (10107542)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
4. 木寺紹紀 (00186280)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
5. 舘野義男 (00202424)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
6. 五條堀孝 (50162136)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 1件
7. 斎藤成也 (30192587)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 1件
8. 菅原秀明 (80231372)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 1件
9. 池尾一穂 (20249949)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
10. 郷通子 (70037290)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
11. 輪湖博 (60158607)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
12. 福地佐斗志 (70360336)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 8件
13. 郷信広 (50011549)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
14. 今西規 (80270461)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 由良敬 (50252226)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 四方哲也 (00222399)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 石森浩一郎 (20192487)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 油谷克英 (90089889)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 芝清隆 (40196415)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 岩舘満雄 (10327447)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 金城玲 (30370117)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 大久保公策 (40233069)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 中村春木 (80134485)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. 太田元規 (40290895)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
25. 北上始 (50234240)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. 磯野克己 (70011640)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
27. 野口俊之 (90172775)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
28. 森島績 (50026093)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
29. 熊谷泉 (10161689)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
30. 諏訪牧子 (30242241)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
31. BRYANT Steve

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
32. SIMON Eastea

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
33. MAKHATADZE G

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

西川 建 NISHIKAWA Ken

西川 健 NISHIKAWA Kwn

研究課題

研究成果

共同研究者

タンパク質の不規則領域と選択的スプライシングに関するヒトプロテオーム情報解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

転写因子の比較ゲノム情報解析:原核型との対比における真核型転写因子の差異と特性研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

微生物ゲノムを対象とした機能アノテーション全自動化システムの開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

タンパク質の高精度モデリング計算システムの開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ゲノム情報からのタンパク質構造の分類と予測研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

タンパク質立体構造の進化過程を実験的に検証する研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

西川建 NISHIKAWA Ken

西川健 NISHIKAWA Kwn

[雑誌論文] 長大な不規則領域をもつ蛋白質 : ヒト転写因子を例として2006