大浪修一 Onami Shuichi

研究者番号	50348843
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所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームディレクター
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームディレクター 2018年度 – 2024年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー 2017年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, チームリーダー 2009年度: 発生システムモデル化研究チーム, チームリーダー 2008年度 – 2009年度: 独立行政法人理化学研究所, 発生システムモデル化研究チーム, チームリーダー 2006年度 – 2007年度: 独立行政法人理化学研究所, 合成ゲノミクス研究チーム, 上級研究員 2005年度: 慶應義塾大学, 大学院理工学研究科, 助教授
審査区分/研究分野	研究代表者複合領域研究代表者以外中区分64:環境保全対策およびその関連分野 / 知能情報学 / 生物系
キーワード	研究代表者ライブイメージング / 画像認識 / バイオイメージ・インフォマティクス / データ統合 / ビッグデータ / 深層学習 / データプラットフォーム / バイオイメージインフォマティクス研究代表者以外表現型 / 線虫 … もっと見る / 一分子型生物発光プローブ / ルシフェラーゼ / 一分子型生物発光プローブ / 生理活性物質 / セレンテラジン / バイオアッセイ / 生理活性 / アルブミン / 可視化 / 生物発光 / リスク評価 / 化学物質 / イメージング / 生物発光プローブ / Global BioImaging (GBI) / 科研費課題 / 科研費取得者 / 支援活動 / トレーニング / 画像解析 / 磁気共鳴画像 / 電子顕微鏡 / 光学顕微鏡 / 画像解析支援 / 磁気共鳴画像支援 / 電子顕微鏡支援 / 光学顕微鏡支援 / バイオイメージング / 知識抽出 / 知識モデル / 生命科学 / 科学データ / 生命科学データ / 知識の相互利用 / 計測データ / ロール概念 / 視点転換 / 大規模データ / オープンデータ / 分野横断 / 相互利用 / オントロジー / 情報統合 / 胚発生 / 細胞分裂 / RNAi / バイオイメージインフォマティクス / 画像処理 / ライブイメージング / モデル化 / 発生・分化 / 遺伝子 / ゲノム隠す

先端バイオイメージング支援プラットフォーム
- 研究代表者
  
  伊佐正, 鍋倉淳一
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2027
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成)
- 研究機関
  生理学研究所
虹色発光線虫に基づく生きた総合病院・環境診断センターの創成
- 研究代表者
  
  金誠培
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分64:環境保全対策およびその関連分野
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所
シンギュラリティ細胞の同定と解析のためのインフォマティクス技術の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  大浪修一
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2022
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
生命科学の計測・観察データ相互利用のための情報技術の高度化
- 研究代表者
  
  桝屋啓志
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  知能情報学
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
線虫ゲノム機能解析情報に基づく発生メカニズムの解析
- 研究代表者
  
  杉本亜砂子
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2009
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所

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すべて雑誌論文学会発表図書産業財産権

[図書] 実験医学別冊　最強のステップUPシリーズ空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド2022
- 著者名/発表者名
  京田耕司、大浪修一
- 総ページ数
  6
- 出版者
  羊土社
- ISBN
  9784758122610
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[図書] 実験医学2021年12月号　Vol.39 No.192021
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 総ページ数
  6
- 出版者
  羊土社
- ISBN
  9784758125505
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[図書] 可視化学会学会誌 Vol.40, No.1562020
- 著者名/発表者名
  京田耕司, ホーケネス, 糸賀裕弥, 遠里由佳子, 大浪修一
- 総ページ数
  3
- 出版者
  社団法人可視化情報学会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[図書] イメージングの選び方・使い方100＋2018
- 著者名/発表者名
  大浪修一（分担執筆）
- 総ページ数
  2
- 出版者
  羊土社
- ISBN
  9784758103756
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[図書] DBRF-MEGN method: an algorithm for inferring gene regulatory networks from large-scale gene expression profiles, "Introduction to Systems Biology"2007
- 著者名/発表者名
  Kyoda, K., and Onami, S.
- 総ページ数
  14
- 出版者
  Humana Press
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[図書] DBRF-MEGN method: An algorithm for inferring gene regulatory networks from large-scale gene expression profiles.2007
- 著者名/発表者名
  Onami, S., Kyoda, K.
- 出版者
  Humana Press
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[図書] 蛋白質核酸酵素(コンピュータシミュレーションを利用した核の配置のダイナミクス解析, 51)2006
- 著者名/発表者名
  木村暁、大浪修一
- 出版者
  共立出版
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[図書] 蛋白質核酸酵素(発生のシステムバイオロジー, 50)2005
- 著者名/発表者名
  大浪修一、北野宏明
- 出版者
  共立出版
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] Homeostasis Imbalance Process Ontology: a Study on COVID-19 Infectious Processes2023
- 著者名/発表者名
  Yamagata Yuki、Kushida Tatsuya、Onami Shuichi、 Masuya Hiroshi
- 雑誌名
  
  BMC bioinformatics
  
  巻: -
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Ontology for Cellular Senescence Mechanisms2023
- 著者名/発表者名
  Yamagata Yuki、Fukuyama Tsubasa、Onami Shuichi、Masuya Hiroshi
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: -
- DOI
  10.1101/2023.03.09.531883
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Systematic analysis of cell morphodynamics in C. elegans early embryogenesis2023
- 著者名/発表者名
  Azuma Yusuke、Okada Hatsumi、Onami Shuichi
- 雑誌名
  
  Frontiers in Bioinformatics
  
  巻: 3
- DOI
  10.3389/fbinf.2023.1082531
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12270, KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Single‐molecule tracking of Nanog and Oct4 in living mouse embryonic stem cells uncovers a feedback mechanism of pluripotency maintenance2023
- 著者名/発表者名
  Okamoto Kazuko、Fujita Hideaki、Okada Yasushi、Shinkai Soya、Onami Shuichi、Abe Kuniya、Fujimoto Kenta、Sasaki Kensuke、Shioi Go、Watanabe Tomonobu M
- 雑誌名
  
  The EMBO Journal
  
  巻: 42 号: 18
- DOI
  10.15252/embj.2022112305
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K06201, KAKENHI-PUBLICLY-23H04297, KAKENHI-PROJECT-22H04926, KAKENHI-PROJECT-21H03599
[雑誌論文] Phenotype Anomaly Detection for Biological Dynamics Data Using a Deep Generative Model2022
- 著者名/発表者名
  Ito Eisuke、Ueda Takaya、Takano Ryo、Tohsato Yukako、Kyoda Koji、Onami Shuichi、Nishikawa Ikuko
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 31st International Conference on Artificial Neural Networks (ICANN 2022)
  
  巻: - ページ: 432-444
- DOI
  10.1007/978-3-031-15931-2_36
- ISBN
  9783031159305, 9783031159312
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Single-nucleosome imaging reveals steady-state motion of interphase chromatin in living human cells2022
- 著者名/発表者名
  Iida Shiori、Shinkai Soya、Itoh Yuji、Tamura Sachiko、Kanemaki Masato T.、Onami Shuichi、Maeshima Kazuhiro
- 雑誌名
  
  Science Advances
  
  巻: 8 号: 22
- DOI
  10.1126/sciadv.abn5626
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-21H05763, KAKENHI-PROJECT-21H02453, KAKENHI-PLANNED-18H05412, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-20H05936
[雑誌論文] The PAF1 complex cell autonomously promotes oogenesis in Caenorhabditis elegans2022
- 著者名/発表者名
  Kubota Yukihiro、Ota Natsumi、Takatsuka Hisashi、Unno Takuma、Onami Shuichi、Sugimoto Asako、Ito Masahiro
- 雑誌名
  
  Genes to Cells
  
  巻: 27 号: 6 ページ: 409-420
- DOI
  10.1111/gtc.12938
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Single-molecule tracking of Nanog and Oct4 in mouse embryonic stem cells2022
- 著者名/発表者名
  Okamoto Kazuko、Fujita Hideaki、Okada Yasushi、Shinkai Soya、Onami Shuichi、Abe Kuniya、Fujimoto Kenta、Watanabe Tomonobu M
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: －
- DOI
  10.1101/2022.08.08.503148
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K06201, KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] An atlas and database of neuropeptide gene expression in the adult zebrafish forebrain2022
- 著者名/発表者名
  Towako Hiraki-Kajiyama, Nobuhiko Miyasaka, Reiko Ando, Noriko Wakisaka, Hiroya Itoga, Shuichi Onami, Yoshihiro Yoshihara
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: N/A
- DOI
  10.1101/2023.03.29.534505
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16304, KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] PHi-C2: interpreting Hi-C data as the dynamic 3D genome state2022
- 著者名/発表者名
  Shinkai Soya、Itoga Hiroya、Kyoda Koji、Onami Shuichi
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 38 号: 21 ページ: 4984-4986
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btac613
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-21H05763, KAKENHI-PLANNED-18H05412, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[雑誌論文] The centromere/kinetochore is assembled through CENP-C oligomerization2022
- 著者名/発表者名
  Hara Masatoshi、Ariyoshi Mariko、Sano Tomoki、Nozawa Ryu-suke、Shinkai Soya、Onami Shuichi、Jansen Isabelle、Hirota Toru、Fukagawa Tatsuo
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: -
- DOI
  10.1101/2022.08.17.504347
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Statistical image processing quantifies the changes in cytoplasmic texture associated with aging in Caenorhabditis elegans oocytes2021
- 著者名/発表者名
  Momoko Imakubo, Jun Takayama, Hastumi Okada, Shuichi Onami
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: 22 号: 1 ページ: 73-73
- DOI
  10.1186/s12859-021-03990-3
- NAID
  120007006688
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] NeuroGT: A brain atlas of neurogenic tagging CreER drivers for birthdate-based classification and manipulation of mouse neurons2021
- 著者名/発表者名
  Hirata Tatsumi、Tohsato Yukako、Itoga Hiroya、Shioi Go、Kiyonari Hiroshi、Oka Sanae、Fujimori Toshihiko、Onami Shuichi
- 雑誌名
  
  Cell Reports Methods
  
  巻: 1 号: 3 ページ: 100012-100012
- DOI
  10.1016/j.crmeth.2021.100012
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412, KAKENHI-PROJECT-20H03345, KAKENHI-PROJECT-16H06280, KAKENHI-PROJECT-21K19281
[雑誌論文] A global view of standards for open image data formats and repositories2021
- 著者名/発表者名
  Swedlow Jason R.、Kankaanpaa Pasi、Sarkans Ugis、Goscinski Wojtek、Galloway Graham、Malacrida Leonel、Sullivan Ryan P.、Hartel Steffen、Brown Claire M.、Wood Christopher、Keppler Antje、Paina Federica、Loos Ben、Zullino Sara、Longo Dario Livio、Aime Silvio、Onami Shuichi
- 雑誌名
  
  Nature Methods
  
  巻: 18 号: 12 ページ: 1440-1446
- DOI
  10.1038/s41592-021-01113-7
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] C. elegans spermatozoa lacking spe-45 are incapable of fusing with the oocyte plasma membrane2021
- 著者名/発表者名
  Jun Takayama, Tasuya Tajima, Shuichi Onami, Htoshi Nishimura
- 雑誌名
  
  microPublication Biology
  
  巻: -
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Texture-based screening to identify genes involved in reproductive aging in Caenorhabditis elegans2021
- 著者名/発表者名
  Imakubo Momoko、Kyoda Koji、Itoga Hiroya、Takayama Jun、Onami Shuichi
- 雑誌名
  
  International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  巻: 11 号: 3 ページ: 40-49
- DOI
  10.17706/ijbbb.2021.11.3.40-49
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Improvement in image quality via the pseudo confocal effect in multidirectional digital scanned laser light-sheet microscopy2021
- 著者名/発表者名
  Kaneshiro Junichi、Shioi Go、Okamoto Kazuko、Onami Shuichi、Watanabe Tomonobu M.
- 雑誌名
  
  Optics Express
  
  巻: 29 号: 15 ページ: 24278-24278
- DOI
  10.1364/oe.423783
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05409, KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Texture-based screening of genes involved in reproductive aging in Caenorhabditis elegans2021
- 著者名/発表者名
  Momoko Imakubo, Koji Kyoda, Hiroya Itoga, Jun Takatama, Shuichi Onami
- 雑誌名
  
  International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  巻: -
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Toward understanding the dynamic state of 3D genome2020
- 著者名/発表者名
  Shinkai S, Onami S, Nakato R.
- 雑誌名
  
  Computational and Structural Biotechnology Journal
  
  巻: 18 ページ: 2259-2269
- DOI
  10.1016/j.csbj.2020.08.014
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06331, KAKENHI-PLANNED-18H05412, KAKENHI-PUBLICLY-20H05550, KAKENHI-PROJECT-19K22679
[雑誌論文] BD5: An open HDF5-based data format to represent quantitative biological dynamics data2020
- 著者名/発表者名
  Koji Kyoda, Kenneth H. L. Ho, Yukako Tohsato, Hiroya Itoga, Shuichi Onami
- 雑誌名
  
  PLOS ONE
  
  巻: 15 号: 8 ページ: e0237468-e0237468
- DOI
  10.1371/journal.pone.0237468
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12226, KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] PHi-C: deciphering Hi-C data into polymer dynamics2020
- 著者名/発表者名
  Shinkai Soya、Nakagawa Masaki、Sugawara Takeshi、Togashi Yuichi、Ochiai Hiroshi、Nakato Ryuichiro、Taniguchi Yuichi、Onami Shuichi
- 雑誌名
  
  NAR Genomics and Bioinformatics
  
  巻: 2 号: 2
- DOI
  10.1093/nargab/lqaa020
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K06612, KAKENHI-PROJECT-17K15050, KAKENHI-PLANNED-17H06331, KAKENHI-PUBLICLY-18H04720, KAKENHI-PLANNED-18H05412, KAKENHI-PROJECT-20K20458, KAKENHI-PLANNED-18H05531, KAKENHI-PROJECT-19H02567
[雑誌論文] Microrheology for Hi-C Data Reveals the Spectrum of the Dynamic 3D Genome Organization2020
- 著者名/発表者名
  Soya Shinkai, Takeshi Sugawara, Hisashi Miura, Ichiro Hiratani, Shuichi Onami
- 雑誌名
  
  Biophysical Journal
  
  巻: 118 号: 9 ページ: 2220-2228
- DOI
  10.1016/j.bpj.2020.02.020
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15050, KAKENHI-PUBLICLY-18H04720, KAKENHI-PLANNED-18H05412, KAKENHI-PLANNED-18H05530, KAKENHI-PROJECT-20K08698
[雑誌論文] On Bringing Bioimaging Data into the Open(-World)2019
- 著者名/発表者名
  Josh Moore, Norio Kobayashi, Susanne Kunis, Shuichi Onami and Jason R. Swedlow
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 12th International SWAT4HCLS Conference
  
  巻: -
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Improvement and Evaluation of a Mathematical Model for Fertilization Calcium Waves in <i>Caenorhabditis Elegans</i>2018
- 著者名/発表者名
  Imakubo Momoko、Takayama Jun、Onami Shuichi
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics
  
  巻: 11 号: 0 ページ: 24-30
- DOI
  10.2197/ipsjtbio.11.24
- NAID
  130007402844
- ISSN
  1882-6679
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] Development of an Integrated Visualization System for Phenotypic Character Networks2018
- 著者名/発表者名
  Onoue Yosuke、Kyoda Koji、Kioka Miki、Baba Kazutaka、Onami Shuichi、Koyamada Koji
- 雑誌名
  
  IEEE Pacific Visualization Symposium (PacificVis 2018)
  
  巻: - ページ: 21-25
- DOI
  10.1109/pacificvis.2018.00012
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[雑誌論文] A system for measuring cell division patterns of early Caenorhabditis elegans embryos by using image processing and object tracking.2007
- 著者名/発表者名
  Hamahashi, S., Kitano, H., and Onami, S.
- 雑誌名
  
  Systems and Computers in Japan 38(11)
  
  ページ: 12-24
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] A system for measuring cell division patterns of early Caenorhabditis elegans embryos by using image processing and object tracking2007
- 著者名/発表者名
  Hamahashi, S., Kitano, H., Onami, S.
- 雑誌名
  
  Systems and Computers in Japan 38(11)
  
  ページ: 12-24
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] 線虫Caenorhabditis elegans初期胚の細胞分裂パターン計測システムのリコンフィギャラブルシステムによる高速化2007
- 著者名/発表者名
  大浪修一(6名中5番目)
- 雑誌名
  
  電子情報通信学会論文誌D J90-D
  
  ページ: 2970-2980
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] Local cortical pulling-force repression switches centrosomal centration and posterior displacement in C. elegans2007
- 著者名/発表者名
  Kimura, A., Onami, S.
- 雑誌名
  
  J. Cell Biol. 179
  
  ページ: 1347-1354
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] Local cortical pulling-force repression switches centrosomal centration and posterior displacement in C. elegans2007
- 著者名/発表者名
  Kimura, A., and Onami, S.
- 雑誌名
  
  The Journal of Cell Biology 179
  
  ページ: 1347-1354
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] 線虫Caenorhabditis elegans初期胚の細胞分裂パターン計測システムのリコンフィギャラブルシステムによる高速化2007
- 著者名/発表者名
  福島知紀, 大浪修一, 他4名
- 雑誌名
  
  電子情報通信学会論文誌D J90-D
  
  ページ: 2970-2980
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] Genome-wide prediction of genetic interactions in a metazoan2006
- 著者名/発表者名
  Onami, S., Kitano, H.
- 雑誌名
  
  Bioessays 28
  
  ページ: 1087-1090
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] 画像処理とオブジェクトトラッキングを用いた線虫の初期胚の細胞分裂パターン計測システム2006
- 著者名/発表者名
  濱橋秀互, 北野宏明, 大浪修一
- 雑誌名
  
  電子情報通信学会論文誌 D, J89-D
  
  ページ: 1248-1259
- NAID
  110007385841
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] 画像処理とオブジェクトトラッキングを用いた線虫の初期胚の細胞分裂パターン計測システム2006
- 著者名/発表者名
  濱橋秀互, 北野宏明, 大浪修一
- 雑誌名
  
  電子情報通信学会論文誌D J89-D
  
  ページ: 1248-1259
- NAID
  110007385841
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] Genome-wide prediction of genetic interactions in a metazoan.2006
- 著者名/発表者名
  Onami, S., Kitano, H.
- 雑誌名
  
  Bioessays 28
  
  ページ: 1087-1090
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] Computer simulations and image processing reveal length-dependent pulling force as the primary mechanism for C.elegans male pronuclear migration.2005
- 著者名/発表者名
  Kimura, A., Onami, S.
- 雑誌名
  
  Dev Cell 8
  
  ページ: 765-775
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] Objective measurement of spindle orientation in early Caenorhabditis elegans embryos.2005
- 著者名/発表者名
  Hamahashi, S., Onami, S.
- 雑誌名
  
  Genome Inform 16
  
  ページ: 86-93
- NAID
  130003997415
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] Computer simulations and image processing reveal length-dependent pulling force as the primary mechanism for C. elegans male pronuclear migration.2005
- 著者名/発表者名
  Kimura, A., Onami, S.
- 雑誌名
  
  Dev Cell 8
  
  ページ: 765-75
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[雑誌論文] Detection of nuclei in 4D Nomarski DIC microscope images of early Caenorhabditis elegans embryos using local image entropy and object tracking.2005
- 著者名/発表者名
  Hamahashi, S., Onami, S., Kitano, H.
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics 6
  
  ページ: 125-125
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[産業財産権] 光シート照射装置、光シート顕微鏡、光シート照射方法、および光シート照射プログラム2020
- 発明者名
  渡邉朋信, 金城純一, 大浪修一
- 権利者名
  渡邉朋信, 金城純一, 大浪修一
- 産業財産権種類
  特許
- 出願年月日
  2020
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 画像処理による細胞動態の定量解析2023
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  新学術領域研究「シンギュラリティ生物学」成果報告シンポジウム・領域会議
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] バイオイメージングデータの次世代フォーマット開発と解析ワークフロー基盤の開発構想2023
- 著者名/発表者名
  京田耕司, 糸賀裕弥, 大浪修一
- 学会等名
  新学術領域「シンギュラリティ生物学」成果報告シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Image data-driven modeling of developmental systems and open bioimaging DX2023
- 著者名/発表者名
  Onami Shuichi
- 学会等名
  IPR x RIKEN (BDR) Symposium 2023 Dive into Data of Life
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database, SSBD:repository, Data platform and Data portal for Singularity Biology - シンギュラリティ生物学のためのSSBD、データプラットフォーム、データポータルの取り組み2023
- 著者名/発表者名
  糸賀裕弥, 王放放, 山縣友紀, 京田耕司, Miranda Miguel Miranda., 山本春菜, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  新学術領域「シンギュラリティ生物学」成果報告シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:repository/database:バイオイメージングデータのグローバルなデータ共有2023
- 著者名/発表者名
  京田耕司, 糸賀裕弥, 王放放, 山縣友紀, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  第64回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 理研オープンライフサイエンスプラットフォームの紹介および活動報告2023
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  理研シンポジウム: 理研オープンライフサイエンスプラットフォーム研究課題成果報告会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Ontology Development for Knowledge Organization of Cellular Senescence Processes.2023
- 著者名/発表者名
  Yamagata Yuki, Masuya Hiroshi, Onami Shuichi
- 学会等名
  RIKEN BDR Symposium 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Functions of the eggshell in C.elegans development: Effects on starvation resistance and body-surface structure2023
- 著者名/発表者名
  Hatakeyama Akiko, Onami Shuichi
- 学会等名
  RIKEN BDR Symposium 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] シンギュラリティ生物学のためのデータサイエンスプラットフォーム：現状と今後の展望2023
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  新学術領域「シンギュラリティ生物学」成果報告シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database / SSBD:repository - global sharing of bioimaging data2023
- 著者名/発表者名
  糸賀裕弥, 王放放, 山縣友紀, 京田耕司, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  日本生理学会第100回記念大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database and SSBD:repository - Global sharing of bioimaging data -2023
- 著者名/発表者名
  Itoga Hiroya, Wang Fangfang, Yamagata Yuki, Kyoda Koji, Tohsato Yukako, Onami Shuichi
- 学会等名
  RIKEN BDR Symposium 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database / SSBD:repository バイオイメージングデータのグローバルなデータ共有2023
- 著者名/発表者名
  糸賀裕弥, 王放放, 山縣友紀, 京田耕司, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  第14回光塾
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 線虫初期胚において胚性致死遺伝子が示す時空間的発現パターンの分類2022
- 著者名/発表者名
  岡田初美、古島理恵、京田耕司、大浪修一
- 学会等名
  線虫研究の未来を創る会2022
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H04948
[学会発表] CENP-Cの自己多量体化はセントロメアクロマチンおよびキネトコアの形成に必須である2022
- 著者名/発表者名
  原昌稔, 有吉眞理子, 佐野智基, 野澤竜介, 新海創也, 大浪修一, Isabelle Jansen, 広田亨, 深川竜郎
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Individual behavioral differences in C. elegans2022
- 著者名/発表者名
  Onoue Shiori, Kyoda Koji, Onami Shuichi
- 学会等名
  C. elegans Topic Meeting: neuronal development, synaptic function and behavior
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Comparative analysis of cellular dynamics of C. inopinata and C. elegans zygotes2022
- 著者名/発表者名
  Oomura Shun, Onami Shuichi, Kyoda Koji, Haruta Nami, Sugimoto Asako
- 学会等名
  Evolutionary Biology of Caenorhabditis and Other Nematodes
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBDデータベースによるグローバルなバイオイメージングデータの共有2022
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] General overview of Image Data Management WG2022
- 著者名/発表者名
  Onami Shuichi
- 学会等名
  Exchange of Experience VII
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 画像関連データの公開と共有について2022
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  CREST多細胞領域第3回領域会議
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 線虫の行動個体差を生み出すメカニズムの解明2022
- 著者名/発表者名
  尾上詩織, 京田耕司, 大浪修一
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] An image processing and deep learning-based pipeline for quantitative analysis of cellular (morpho)dynamics2022
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  日本発生生物学会第55回大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] データベースSSBD、データ共有プラットフォームOMEROが開くオープンサイエンス2022
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  日本学術会議　公開シンポジウム「異なるモダリティを統合するバイオ計測の最前線と展望」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 長期間ライブイメージングを可能にする光損傷を軽減する撮影条件の最適化2022
- 著者名/発表者名
  塩井剛, 渡邉朋信, 金城純一, 東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 次世代SPIM：マウス胚まるごとのライブイメージングと全細胞トラッキングに向けて2022
- 著者名/発表者名
  塩井剛, 渡邉朋信, 金城純一, 東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] A global view of standards for open image data formats and repositories2022
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  The BINA January Community Conversation
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] BD-zarr: 生命現象の時空間動態データを記述するための次世代フォーマットの開発2022
- 著者名/発表者名
  京田耕司, ホーケネス, 糸賀裕弥, 大浪修一
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2022
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] バイオイメージングデータのグローバルなデータ共有システムの構築2022
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2022
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database/repository バイオイメージングデータのグローバルなデータ共有2022
- 著者名/発表者名
  糸賀裕弥, 王放放, 山縣友紀, 京田耕司, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  第31回日本バイオイメージング学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] BD5: an open data format for representing quantitative biological dynamics data2022
- 著者名/発表者名
  Kyoda Koji, Ho Kenneth H.L. ., Itoga Hiroya, Tohsato Yukako, Onami Shuichi
- 学会等名
  2022 European HDF5 Users Group (HUG)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] データ駆動型および仮説検証型アプローチによる細胞形態変化の定量解析2022
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Polymer physics for Hi-C data reveals rheological features of chromatin2022
- 著者名/発表者名
  Shinkai Soya, Onami Shuichi
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 先端バイオイメージングデータのデータ駆動解析とオープンサイエンス2022
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  第31回日本バイオイメージング学会学術集会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] The Role of the Eggshell in Starvation Resistance during L1 arrest in Caenorhabditis elegans2022
- 著者名/発表者名
  Hatakeyama Akiko, Onami Shuichi
- 学会等名
  2022 International C. elegans Topic Meeting on Metabolism, Aging, Pathogenesis, Stress, and Small RNAs
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Data-driven modeling of animal embryogenesis2022
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  BDR Symposium 2022
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Single nucleosome imaging reveals “steady-state” motion of interphase chromatin in living human cells2022
- 著者名/発表者名
  Iida Shiori, Shinkai Soya, Itoh Yuji, Tamura Sachiko, Kanemaki Masato, Onami Shuichi, Maeshima Kazuhiro
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Next Generation SPIM towards live imaging and all-cells tracking of a whole mouse embryo2022
- 著者名/発表者名
  塩井剛, 渡邉朋信, 金城純一, 東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  日本発生生物学会第55回大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 細胞のセグメンテーションデータ作成と公開2022
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第25回情報論的学習理論ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database and SSBD:repository - Open Resources for Bioimages and Quantitative Data for Biosystems Dynamics2022
- 著者名/発表者名
  Hiroya Itoga, Fangfang Wang, Koji Kyoda, Yukako Tohsato, Shuichi Onami
- 学会等名
  BDR Symposium 2022
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] オントロジーに基づく細胞老化プロセスの知識記述モデリング2022
- 著者名/発表者名
  山縣友紀, 大浪修一, 桝屋啓志
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 線虫初期胚において胚性致死遺伝子が示す時空間的発現パターンの分類2022
- 著者名/発表者名
  岡田初美、古島理恵、京田耕司、大浪修一
- 学会等名
  線虫研究の未来をつくる会2022
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] ヒト生細胞の局所クロマチン動態は細胞周期を通して一定である2022
- 著者名/発表者名
  Iida Shiori, Shinkai Soya, Itoh Yuji, Tamura Sachiko, Kanemaki Masato, Onami Shuichi, Maeshima Kazuhiro
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] バイオイメージングデータの標準化・共有化の国際情勢2022
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  ABiS Symposium イメージングデータ解析が拓く生命科学の新時代
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Knowledge Systematization for Cellular Senescence Processes by Homeostasis Imbalance Process Ontology2022
- 著者名/発表者名
  山縣友紀, 大浪修一, 桝屋啓志
- 学会等名
  ICBO 2022: International Conference on Biomedical Ontology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database/repository: バイオイメージングデータのグローバルなデータ共有2022
- 著者名/発表者名
  京田耕司, 糸賀裕弥, 王放放, 山縣友紀, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] BD-zarr: a zarr-based format for representing quantitative data of biosystems dynamics2022
- 著者名/発表者名
  Kyoda Koji, Ho Kenneth H.L.., Itoga Hiroya, Onami Shuichi
- 学会等名
  I2K 2022 From Images to Knowledge
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 流体力学的相互作用が駆動する３次元ゲノム組織化2022
- 著者名/発表者名
  新海創也, 大浪修一
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 先端バイオイメージングのオープンサイエンスとDXプラットフォーム2022
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  第127回日本解剖学会総会・全国学術集会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database/repository バイオイメージングデータのグローバルなデータ共有2022
- 著者名/発表者名
  糸賀裕弥, 王放放, 山縣友紀, 京田耕司, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2022
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] イメージングデータ解析が拓く生命科学の新時代2022
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  ソニー先端技術講演会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Phenotype anomaly detection for biological dynamics data using a deep generative model2022
- 著者名/発表者名
  Ito Eisuke, Ueda Takaya, Takano RYo, Yukako Tohsato, Kyoda Koji, Onami Shuichi, Nishikawa Ikuko
- 学会等名
  The 31st International Conference on Artificial Neural Networks
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] バイオイメージングデータの解析、管理、公開に関する情報科学技術の現状と将来展望2022
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 線虫の行動個体差を生み出すメカニズムの解明2021
- 著者名/発表者名
  尾上詩織, 大浪修一
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database/repository 生命画像情報と生命動態情報の統合データベース・レポジトリ2021
- 著者名/発表者名
  糸賀裕弥, 王放放, 京田耕司, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2021
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Worm Developmental Dynamics Database 2 - an open database with visualization for biological dynamics of large-scale RNAi experiments on C. elegans embryos2021
- 著者名/発表者名
  糸賀裕弥, 京田耕司, 大浪修一
- 学会等名
  線虫研究の未来を創る会2021
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 線虫C. elegansの胚発生における細胞形態変化の定量解析2021
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] BDZ: Zarr-based format of quantitative biological dynamics data for object storage and cloud computing2021
- 著者名/発表者名
  Koji Kyoda, Ho Kenneth HL, Hiroya Itoga, Yukako Tohsato, Shuichi Onami
- 学会等名
  OME 2021 Community Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] イメージングデータ駆動型生命科学と理研のオープンライフサイエンス2021
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  CSRSインフォマティクス・データ科学推進プログラム成果報告会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Individual behavioral differences in C. elegans2021
- 著者名/発表者名
  Shiori Onoue, Shuichi Onami
- 学会等名
  The 23rd International C. elegans Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Single molecule measurement of core-transcription factors for pluripotency maintenance, Nanog and Oct4, in living nuclei of mouse embryonic stem cells2021
- 著者名/発表者名
  Kazuko Okamoto, Hideaki Fujita, Soya Shinkai, Shuichi Onami, Yasushi Okada, Kuniya Abe, Tomonobu M. Watanabe
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] データ駆動型モデリングによる生命動態の理解と予測2021
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  理化学研究所・熊本大学合同生命科学領域DXシンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Data-driven analysis of the mechanism of animal development2021
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  ERCIM-JST Joint Symposium on Big Data and Artificial Intelligence
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Development of bioimage informatics methods for Singularity Biology2021
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  Pacifichem 2021
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Worm Developmental Dynamics Database 2 - an open database with visualization for biological dynamics of large-scale RNAi experiments on C. elegans embryos2021
- 著者名/発表者名
  Hiroya Itoga, Koji Kyoda, Shuichi Onami
- 学会等名
  The 23rd International C. elegans Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 流体力学的相互作用化の動的3次元ゲノム組織化2021
- 著者名/発表者名
  新海創也, 大浪修一
- 学会等名
  第39回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Comparative analysis of cellular dynamics of C. inopinata and C. elegans zygotes2021
- 著者名/発表者名
  Shun Oomura, Shuichi Onami, Koji Kyoda, Nami Haruta, Asako Sugimoto
- 学会等名
  The 23rd International C. elegans Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 胚発生における細胞形態変化の定量解析2021
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  線虫研究の未来を創る会2021
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SBD:databaseとSSBD:repositoryを核とした生命画像と生命動態のオープンデータ駆動による研究ライフサイクルの実現2021
- 著者名/発表者名
  糸賀裕弥, 王放放, 京田耕司, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  バイオDXの最前線　- JST戦略的創造研究推進事業 CREST「データ駆動・AI駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新[バイオDX]」キックオフシンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Data-driven analysis of the mechanism of animal development2021
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  CREST International Symposium on Big Data Application
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Comparative analysis of cellular dynamics of C. elegans and C. inopinata zygotes2021
- 著者名/発表者名
  大村駿, 大浪修一, 京田耕司, 春田奈美, 杉本亜砂子
- 学会等名
  線虫研究の未来を創る会2021
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] バイオDXを推進する生命現象の時空間動態データを解析する基盤の構築2021
- 著者名/発表者名
  京田耕司，糸賀裕弥，遠里由佳子，大浪修一
- 学会等名
  バイオDXの最前線　- JST戦略的創造研究推進事業 CREST「データ駆動・AI駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新[バイオDX]」キックオフシンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 生命科学領域知識統合に向けたオントロジー開発とCOVID-19機序解明に向けた取り組み2021
- 著者名/発表者名
  山縣友紀, 櫛田達矢, 大浪修一, 桝屋啓志
- 学会等名
  2021年度人工知能学会全国大会(第35回)
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Quantitative analysis of cell morphology dynamics in C. elegans embryogenesis2021
- 著者名/発表者名
  Yusuke Azuma, Shuichi Onami
- 学会等名
  Bioimage Informatics 2021
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Homeostasis Imbalance Process Ontology: a Study on COVID-19 Infectious Processes2021
- 著者名/発表者名
  Yuki Yamagata, Tatsuya Kushida, Shuichi Onami, Hiroshi Masuya
- 学会等名
  10th International Workshop on Vaccine and Drug Ontology Studies (VDOS-2021)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 理研オープンライフサイエンスプラットフォーム2021
- 著者名/発表者名
  大浪修一, 粕川雄也, 桝屋啓志
- 学会等名
  理研ハッカソンオープンシンポジウム　―理研が進めるオープンサイエンスの実践―
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 時空間レジストレーションに基づく分子間相互作用の自動抽出2021
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  2020年度AIPチャレンジ成果報告会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Launching NeuroGT: a brain atlas of neurogenic tagging CreER drivers for birthdate-based classification and manipulation of mouse neurons2021
- 著者名/発表者名
  Tasumi Hirata, Yukako Tohsato, Hiroya Itoga, Go Shioi, Hiroshi Kiyonari, Sanae Oka, Toshihiko Fujimori, Shuichi Onami
- 学会等名
  Neuroscience 2021, 50th Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] シンギュラリティ生物学を実現する大量データの解析・保存・標準化2021
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  新学術三領域合同勉強会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SBD:database and SSBD:repository - Online open resources for bioimages and quantitative data for biosystems dynamics2021
- 著者名/発表者名
  Hiroya Itoga, Ho Kenneth Hunglit, Koji Kyoda, Yukako Tohsato, Shuichi Onami
- 学会等名
  RIKEN BDR Symposium 2021 - Structuring Biosystems: Functions Emerging from Molecules -
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] NeuroGT:神経細胞の誕生日タグづけ用CreERドライバーマウスの脳アトラス2021
- 著者名/発表者名
  平田たつみ, 遠里由佳子, 糸賀裕弥, 塩井剛, 清成寛, 岡早苗, 藤森俊彦, 大浪修一
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database and SSBD:repository - an added-value database and archive service for bioimages and quantitative data of biological dynamics -2021
- 著者名/発表者名
  Hiroya Itoga, Fangfang Wang, Koji Kyoda, Yukako Tohsato, Shuichi Onami
- 学会等名
  OME 2021 Community Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] NeuroGT: A brain atlas of neurogenic tagging CreER drivers for birthdate-based classification and manipulation of mouse neurons2021
- 著者名/発表者名
  平田たつみ, 遠里由佳子, 糸賀裕弥, 塩井剛, 清成寛, 岡早苗, 藤森俊彦, 大浪修一
- 学会等名
  第54回日本発生生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] NeuroGT：神経細胞の誕生日タグづけ用CreERドライバーマウスの脳アトラス2021
- 著者名/発表者名
  平田たつみ, 遠里由佳子, 糸賀裕弥, 塩井剛, 清成寛, 岡早苗, 藤森俊彦, 大浪修一
- 学会等名
  第44回日本神経科学大会 / CJK第1回国際会議
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Toward understanding the dynamic state of 3D genome by polymer modeling of Hi-C data2020
- 著者名/発表者名
  Soya Shinkai, Ryuichiro Nakato, Shuichi Onami
- 学会等名
  Cell Bio Virtual 2020
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 大規模イメージングデータを用いた生命システムのデータ駆動モデリング2020
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  ゲノム創薬・創発フォーラム　第4回シンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Global BioImaging: Scope, planned activities and its work on image data2020
- 著者名/発表者名
  Federica Paina, Jason Swedlow, Shuichi Onami
- 学会等名
  Global Bioimaging Exchange of Experience V
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database and SSBD:repository - Online open resources for bioimages and quantitative data for biosystems dynamics2020
- 著者名/発表者名
  Hiroya Itoga, Ho Kenneth Hunglit, Koji Kyoda, Yukako Tohsato, Shuichi Onami
- 学会等名
  Biological Data Science
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Toward a physical understanding of the dynamic 3D genome organization2020
- 著者名/発表者名
  Soya Shinkai, Shuichi Onami, Nakato Ryuichiro
- 学会等名
  第58回日本生物物理学会年会
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Pre-publication image data: Management and processing in Japan2020
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  Global Bioimaging Exchange of Experience V
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Texture-based screening to identify genes involved in reproductive aging in Caenorhabditis elegans.2020
- 著者名/発表者名
  Momoko Imakubo, Koji Kyoda, Hiroya Itoga, Jun Takayama, Shuichi Onami
- 学会等名
  The 2020 Asia Digital Image Processing Conference　(ADIP2020)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] バイオ計測と画像解析技術2020
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  公開シンポジウム「次世代統合バイオイメージングと数理の協働の展望」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:細胞・発生画像情報と生命動態情報の統合データベース・レポジトリ2020
- 著者名/発表者名
  糸賀裕弥, ホーケネス, 京田耕司, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2020
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 線虫C. elegans の発生動態の定量解析2020
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  CREST「ビッグデータ応用」第７回若手研究者合宿
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Deep learning based image restoration with efficient training data acquisition2020
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  ABiS Symposium Forefront and Future of Electron Microscopic Imaging
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SBD:database and SSBD:repository for sharing quantitative biosystems dynamics data and bioimaging data2020
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  2020 OME Community Meeting
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] RIKEN Open Life Science Platform2020
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  RIKEN Hackathon FY2019 Open Symposium
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Data-driven analysis of the mechanism of animal development2020
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  CREST Big Data Joint Research Area-NSF-DATAIA Joint Meeting
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Data-driven modeling of animal development2020
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  CREST International Symposium of Big Data Application
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] シンギュラリティ細胞の同定と解析のためのインフォマティクス技術2020
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  シンギュラリティ生物学×細胞ダイバース　合同ワークショップ
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Data-driven analysis of female pronuclear migration by image-processing embryonic movies in Phenobank2019
- 著者名/発表者名
  Yukako Tohsato, Hatsumi Okada, Koji Kyoda, Shuichi Onami
- 学会等名
  22nd International C. elegans Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Deep learning based image restoration with efficient training data acquisition2019
- 著者名/発表者名
  Yusuke Azuma, Shuichi Onami
- 学会等名
  BioImage Informatics 2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Quantitative analysis of cell shape features in C. elegans embryos2019
- 著者名/発表者名
  Yusuke Azuma, Shuichi Onami
- 学会等名
  52nd Annual Meeting of JSDB
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] OME Core Ontology: An OWL-based Life Science Imaging Data Model2019
- 著者名/発表者名
  Norio Kobayashi, Josh Moore, Shuichi Onami, Jason R. Swedlow
- 学会等名
  12th International SWAT4HCLS Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Mechanical functions of eggshell in C. elegans development.2019
- 著者名/発表者名
  Akiko Hatakeyama, Asako Sato, Yo Tanaka, Shuichi Onami
- 学会等名
  22nd International C.elegans Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Microrheology for Hi-C data reveals the spectrum of the dynamic 3D genome organization2019
- 著者名/発表者名
  新海創也, 菅原武志, 三浦尚, 平谷伊智朗, 大浪修一
- 学会等名
  研究会「理論と実験」２０１９
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD:database バイオイメージングデータベースの使い方2019
- 著者名/発表者名
  京田耕司, ホー・ケネス, 糸賀裕弥, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  第十一回光塾
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Explorative Visualization for Phenotypic-Genotypic Network2019
- 著者名/発表者名
  Hiroaki Natsukawa, Shungo Ishino, Yosuke Onoue, Koji Kyoda, Shuichi Onami and Koji Koyamda
- 学会等名
  IEEE VIS 2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 先人に学べ？！～科学者として生きてきた中での、出会い、決断、失敗、たまに成功～2019
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  第十一回光塾
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 顕微鏡ビッグデータを用いた胚発生のデータ駆動モデリング2019
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  第44回レーザ顕微鏡研究会＆シンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] データベース→データ駆動→AI駆動2019
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  勉強会「人類の健康と生存圏拡大のためのAI駆動型生命科学～自律的に知識を発見するロボットでノーベル賞級の発見を目指す～」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] バイアスフリーライフサイエンスに関して思うこと2019
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD: an open public database of microscopy images and quantitative data of biological dynamics facilitating the reuse and reanalyze of biological data.2019
- 著者名/発表者名
  Ho Kenneth H.L., Yukako Tohsato, Koji Kyoda, Hiroya Itoga, Shuichi Onami
- 学会等名
  The 20th International Conference on Systems Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD: 細胞・発生画像情報と生命動態情報の統合データベース2019
- 著者名/発表者名
  糸賀裕弥, ホーケネス, 京田耕司, 遠里由佳子, 大浪修一
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2019～バイオデータベース：つないで使う～;
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Quantitative analysis of cellular dynamics in C. elegans embryos2019
- 著者名/発表者名
  Yusuke Azuma, Shuichi Onami
- 学会等名
  The 20th International Conference on Systems Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD: an open database for sharing quantitative data and microsccopy images of biosystems dynamics2019
- 著者名/発表者名
  Koji Kyoda, Ho Kenneth H.L., Yukako Tohsato, Hiroya Itoga, Shuichi Onami
- 学会等名
  International Conference on Systems Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Data-driven modeling of C. elegans development2019
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  CREST International Symposium on Big Data Application
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 胚発生における細胞動態の定量解析2019
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  線虫研究の未来を創る会 2019
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Data-driven analysis of the mechanism of animal development2019
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  CREST Big Data Application Symposium
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] The 4DN-OME Ontology: an OME-OWL Extension with Emphasis on Usability, Minimum Information Guidelines and Quality Control for Super-Resolution Fluorescence Microscopy2019
- 著者名/発表者名
  Mathias Hammer, Maximiliaan Huisman, Norio Kobayashi, Josh Moore, Alessandro Rigano, Shuichi Onami, Jason Swedlow, David Grunwald, Caterina Strambio-De-Castillia
- 学会等名
  The 2019 4DN-ASCB Satellite Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] ゲノム構造データから読み解く階層的でダイナミックなゲノムレオロジー特性2019
- 著者名/発表者名
  新海創也, 菅原武志, 三浦尚, 平谷伊智朗, 大浪修一
- 学会等名
  第37回染色体ワークショップ・第18回核ダイナミクス研究会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Microrheology of 3D genome organization by polymer modeling2019
- 著者名/発表者名
  新海創也, 菅原武志、大浪修一
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] RIKEN Open Life Science Platform2019
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  The 6th RIKEN-KI SciLifeLab Symposium: Biomedical Data for Artificial Intelligence
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 線虫の胚発生画像を対象としたSeq-VAEに基づく時間的超解像2019
- 著者名/発表者名
  田村壮, 河合新, 延原肇, 東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第22回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS 2019)
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Development of bioimage informatics technologies for singularity biology2019
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  The 20th International Conference on Systems Biology (ICSB2019), Workshop “Singularity Biology: small elements change the function of the whole systems”
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] New design and Improvement of Worm Developmental Dynamics Database (WDDD).2019
- 著者名/発表者名
  Hiroya Itoga, Koji Kyoda, Shuichi Onami
- 学会等名
  22nd International C. elegans Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD: an open public database of microscopy images and quantitative data of biological dynamics2019
- 著者名/発表者名
  Kenneth Ho, Yukako Tohsato, Koji Kyoda, Hiroya Itoga, Shuichi Onami
- 学会等名
  The 52nd Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 表現型特徴-遺伝子ネットワークの横断的探索を支援する可視化ツール2019
- 著者名/発表者名
  夏川浩明, 石野隼伍、尾上洋介、京田耕司、大浪修一、小山田耕二
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] On Bringing Bioimaging Data into the Open(-World)2019
- 著者名/発表者名
  Josh Moore, Norio Kobayashi, Susanne Kunis, Shuichi Onami, Jason R. Swedlow
- 学会等名
  12th International SWAT4HCLS Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 線虫C. elegans胚発生後期における卵殻の機械的機能と性質2019
- 著者名/発表者名
  畠山明子, 佐藤麻子, 田中陽, 大浪修一
- 学会等名
  第十一回光塾
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 線虫C. elegans の胚発生における細胞体積の定量解析2019
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD: an open database for sharing quantitative data and microscopy images of biosystems dynamics2019
- 著者名/発表者名
  Koji Kyoda, Kenneth Ho, Yukako Tohsato, Hiroya Itoga, Shuichi Onami
- 学会等名
  BioImage Informatics 2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 表現型特徴―遺伝子ネットワークの横断的探索を支援する視覚的分析2019
- 著者名/発表者名
  夏川浩明, 石野隼伍, 尾上洋介, 京田耕司, 大浪修一, 小山田耕二
- 学会等名
  可視化情報シンポジウム2019
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 画像処理による線虫C. elegans の発生動態の定量解析2019
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第十一回光塾
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Public Data Resources for the Global Bioimaging Community2019
- 著者名/発表者名
  Jason Swedlow, Shuichi Onami
- 学会等名
  Global Bioimaging Exchange of Experience IV
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] シンギュラリティ細胞の同定と解析のためのインフォマティクス技術の開発2019
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  第19回日本蛋白質科学会年会第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Deciphering Hi-C data into polymer dynamics. Biophysical Society Thematic Meetings, Multiscale Modeling of Chromatin2019
- 著者名/発表者名
  Soya Shinka, Masaki Nakagawa, Takeshi Sugawara, Yuichi Togashi, Hiroshi Ochiai, Ryuichiro Nakato, Yuichi Taniguchi, Shuichi Onami
- 学会等名
  Biophysical Society Thematic Meetings, Multiscale Modeling of Chromatin: Bridging Experiment with Theory
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 顕微鏡画像の自動取得と深層学習による画像修復2019
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第22回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS 2019)
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] ゲノム構造データから読み解く階層的でダイナミックなゲノムレオロジー特性2019
- 著者名/発表者名
  新海創也, 菅原武志, 三浦尚, 平谷伊智朗, 大浪修一
- 学会等名
  第十一回光塾
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 公共データベースの顕微鏡画像を用いた細胞核分裂の定量計測と表現型解析2018
- 著者名/発表者名
  遠里由佳子, 岡田初美, 京田耕司, 大浪修一
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会(IIBMP2018)
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Data-driven analysis of the mechanism of animal development2018
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  CREST「Big Data Application」Symposium
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] 受精と胚発生のシステムバイオロジーからオルガノイドの４Dデザイン・プラットフォームの構築へ2018
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  理研―農研機構連携キックオフワークショップ
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Quantitative analysis of cell shape dynamics in C. elegans embryogenesis2018
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD: 細胞・発生画像情報と生命動態情報の統合データベース2018
- 著者名/発表者名
  京田耕司、遠里由佳子、ホーケネス、糸賀裕弥、大浪修一
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2018
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Quantitative analysis of cellular dynamics in C. elegans embryo2018
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  The 56th Annual Meeting of The Biophysical Society of Japan
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Quantitative analysis of cell shape dynamics in C. elegans embryogenesis2018
- 著者名/発表者名
  東裕介, 大浪修一
- 学会等名
  第56回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] SSBD: 細胞・発生画像情報と生命動態情報の統合データベース2018
- 著者名/発表者名
  ホーケネス，遠里由佳子，京田耕司，糸賀裕弥，大浪修一
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Integration of big image and omics data for modeling of animal development2018
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  The 5th RIKEN-KI/SciLifeLab Joint Symposium Artificial Intelligence Meets Life Sciences
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05412
[学会発表] Genome-wide collection of quantitative information about cell division dynamics in RNAi-treated C. elegans embryo.2010
- 著者名/発表者名
  Onami, S.
- 学会等名
  Sino-Japan Workshop, Systems Biology and Complex Diseases
- 発表場所
  Shanghai, China.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] 画像解析を活用した細胞・発生生物学研究の可能性2010
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  定量生物学の会第二回年会
- 発表場所
  大阪府吹田市大阪大学
- 年月日
  2010-01-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] Live cell imaging and image-processing enable quantitative and computational analysis of the development2009
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  第32回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  Yokohama, Kanagawa
- 年月日
  2009-12-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] Quantitative cell division dynamics analysis and prediction of the mechanisms of development in C. elegans.2009
- 著者名/発表者名
  Onami, S.
- 学会等名
  The 2nd RIKEN-University of Edinburgh Joint Workshop.
- 発表場所
  British Embassy, Tokyo, Japan.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] 定量・計算解析による発生ダイナミクスの理解2009
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  日本機械学会計算力学講演会
- 発表場所
  金沢大学角間キャンパス, 金沢.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] 細胞・発生生物学の超ペタフロップス級コンピュータへの展開2009
- 著者名/発表者名
  大浪修一
- 学会等名
  超ペタフロップス級コンピュータと実験生物学の連携による生命現象への挑戦
- 発表場所
  理化学研究所横浜研究所, 横浜
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] Quantitative cell division dynamics analysis and prediction of the mechanism of development in C.elegans2009
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  The 9th NIBB-EMBL Symposium
- 発表場所
  Okazaki Conference Center, Okazaki, Japan
- 年月日
  2009-04-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] 定量・計算解析による発生ダイナミクスの理解2009
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  日本機械学会第22回計算力学講演会CMD2009
- 発表場所
  石川県金沢市金沢大学
- 年月日
  2009-12-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] 細胞・発生生物学の超ペタフロップス級コンピュータへの展開2009
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  超ペタフロップス級コンピュータと実験生物学の連携による生命現象への挑戦
- 発表場所
  理化学研究所横浜研究所
- 年月日
  2009-02-06
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] Quantitative cell division dynamics analysis and prediction of the mechanisms of development in C. elegans.2009
- 著者名/発表者名
  Onami, S.
- 学会等名
  The 9th NIBB-EMBL Symposium, Functional Imaging from Atoms to Organisms.
- 発表場所
  Okazaki Conference Center, Okazaki, Japan.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] Computational analysis of quantitative information of cell division dynamics of early embryos.2009
- 著者名/発表者名
  Kyoda, K., Adachi, E., Shimada, K., Kuramochi, J., Onami, S.
- 学会等名
  17th International C. elegans Meeting.
- 発表場所
  LA, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] 線虫C. elegans初期胚の細胞分裂ダイナミクスの定量解析2009
- 著者名/発表者名
  京田耕司、足立絵瑠、倉持順子、島田久美子、大浪修一
- 学会等名
  第19回日本数理生物学会大会
- 発表場所
  東京大学駒場キャンパス, 東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] Live cell imaging and image-processing enable quantitative and computational analysis of the development.2009
- 著者名/発表者名
  Onami, S.
- 学会等名
  第32回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] Quantitative cell division dynamics analysis and prediction of the mechanism of development in C. elegans.2009
- 著者名/発表者名
  Onami, S.
- 学会等名
  International Symposium on System Biology and Proteomics in Biomedical Science
- 発表場所
  Kolkata, India.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] Quantitative and computational cell division pattern analysis of early embryos2008
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  C. elegans Genomics and Systems Biology Workshop
- 発表場所
  Cambridge, MA, USA
- 年月日
  2008-07-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] 初期胚の構造と形態のダイナミクスに対する定量的計算科学的アプローチ2008
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  細胞・発生研究への数理科学的アプローチ-先端研究から探るアクションプラン-
- 発表場所
  理化学研究所神戸研究所
- 年月日
  2008-09-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] A quantitative and computational approach to dynamic nuclear positioning in C. elegans embryos2008
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  BMB2008
- 発表場所
  神戸ポートアイランド
- 年月日
  2008-12-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038
[学会発表] 画像処理を活用した線虫C. elegans胚の定量的計算科学的解析2008
- 著者名/発表者名
  Shuichi Onami
- 学会等名
  第3回 NIBB バイオイメージングフォーラム
- 発表場所
  岡崎コンファレンスセンター
- 年月日
  2008-09-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017038

1. 杉本亜砂子 (80281715)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 木村暁 (10365447)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
3. 京田耕司 (30415145)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
4. 桝屋啓志 (40321814)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 真下知士 (80397554)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 高田豊行 (20356257)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 古崎晃司 (00362624)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 溝口理一郎 (20116106)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 伊佐正 (20212805)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 鍋倉淳一 (50237583)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 根本知己 (50291084)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 山中めぐみ (80346379)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 藤森俊彦 (80301274)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 真野昌二 (20321606)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 甲本真也 (30812151)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 野中茂紀 (90435529)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 今村健志 (70264421)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 平岡泰 (10359078)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 青木一洋 (80511427)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 洲崎悦生 (10444803)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 稲葉一男 (80221779)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 菅谷佑樹 (00625759)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 澤田和明 (40235461)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. 佐藤良勝 (30414014)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
25. 三上秀治 (60754976)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. 岡田康志 (50272430)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
27. 大野伸彦 (10432155)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
28. 安永卓生 (60251394)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
29. 太田啓介 (00258401)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
30. 小池正人 (80347210)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
31. 宮澤淳夫 (60247252)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
32. 深澤有吾 (60343745)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
33. 山崎美和子 (10431305)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
34. 豊岡公徳 (10360596)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
35. 片岡洋祐 (40291033)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
36. 福永雅喜 (40330047)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
37. 青木茂樹 (80222470)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
38. 岡田直大 (40797122)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
39. 林拓也 (50372115)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
40. 東島眞一 (80270479)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
41. 備瀬竜馬 (00644270)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
42. 桧垣匠 (90578486)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
43. 木森義隆 (10585277)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
44. 舟橋啓 (70324548)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
45. 小田祥久 (30583257)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
46. 上野直人 (40221105)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
47. 渡辺雅彦 (70210945)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
48. 内田誠一 (70315125)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
49. 松田道行 (10199812)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
50. 定藤規弘 (00273003)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
51. 金誠培 (60470043)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
52. チッテリオダニエル (00458952)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
53. 牧昌次郎 (20266349)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
54. 中戸隆一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
55. 新海創也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
56. 岡本和子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
57. 梶山十和子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
58. 遠里由佳子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
59. 東裕介

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
60. 渡邉朋信

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
61. 落合博

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
62. 菅原武志

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

大浪 修一 Onami Shuichi

研究課題

研究成果

共同研究者

先端バイオイメージング支援プラットフォーム

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

虹色発光線虫に基づく生きた総合病院・環境診断センターの創成

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

シンギュラリティ細胞の同定と解析のためのインフォマティクス技術の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

生命科学の計測・観察データ相互利用のための情報技術の高度化

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

線虫ゲノム機能解析情報に基づく発生メカニズムの解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] 実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ 空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド2022

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] 実験医学2021年12月号 Vol.39 No.192021

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] 可視化学会学会誌 Vol.40, No.1562020

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] イメージングの選び方・使い方100＋2018

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] DBRF-MEGN method: an algorithm for inferring gene regulatory networks from large-scale gene expression profiles, "Introduction to Systems Biology"2007

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] DBRF-MEGN method: An algorithm for inferring gene regulatory networks from large-scale gene expression profiles.2007

著者名/発表者名

出版者

データソース

[図書] 蛋白質核酸酵素(コンピュータシミュレーションを利用した核の配置のダイナミクス解析, 51)2006

著者名/発表者名

出版者

データソース

[図書] 蛋白質核酸酵素(発生のシステムバイオロジー, 50)2005

著者名/発表者名

出版者

データソース

[雑誌論文] Homeostasis Imbalance Process Ontology: a Study on COVID-19 Infectious Processes2023

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Ontology for Cellular Senescence Mechanisms2023

著者名/発表者名

雑誌名

大浪修一 Onami Shuichi

[図書] 実験医学別冊　最強のステップUPシリーズ空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド2022

[図書] 実験医学2021年12月号　Vol.39 No.192021