肥後順一 Higo Junichi

研究者番号	80265719
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 兵庫県立大学, 情報科学研究科, 特任教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2023年度: 兵庫県立大学, 情報科学研究科, 特任教授 2022年度: 立命館大学, 総合科学技術研究機構, プロジェクト研究員 2021年度: 立命館大学, 総合科学技術研究機構, 教授 2018年度 – 2019年度: 兵庫県立大学, シミュレーション学研究科, 特任教授 2017年度: 大阪大学, 蛋白質研究所, 特任教授 … もっと見る 2016年度 – 2017年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 特任教授(常勤) 2013年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 特任研究員(客員教授) 2013年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 研究員 2013年度: 大阪大学, 蛋白質研究所, 特任研究員 2012年度 – 2013年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 特任研究員 2012年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 招聘研究員 2009年度 – 2011年度: 大阪大学, 蛋白質研究所, 特任研究員 2010年度: 大阪大学, 蛋白質研究所, 特任研究員(客員教授) 2007年度 – 2008年度: 大阪大学, 臨床医工学融合研究教育センター, 特任研究員隠す
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43020:構造生物化学関連 / 生物物理・化学物理・ソフトマターの物理 / 生物系 / 生物物理学研究代表者以外生物物理学 / 生物系
キーワード	研究代表者自由エネルギー地形 / 全原子モデル / フォールディング / 膜蛋白質 / 効率的立体構造探索 / 阻害効果 / conformational selection / 自由エネルギー障壁 / orientation selection / fly-casting … もっと見る / 結合過程 / エンドセリンリセプター / ボセンタン / GPCR / MD シミュレーション / 分子間結合 / 速度論 / 平衡論 / 分子動力学 / 生物物理一般 / enhanced sampling / generalized ensemble / 構造サンプリング / アダプティブアンブレラ / 平衡定数 / カノニカルサンプリング / 効率的サンプリング / 自由エネルギー / 仮装系 / 遷移確率 / 速度定数 / 構造変化 / 生体高分子 / GA / AI / 多次元 / 反応座標 / 状態遷移 / 自由エネルギー計算 / 分子動力学シミュレーション / 粗視化モデル / 計算機シミュレーション / ドッキング / ヒューマニン / WWドメイン / マルチカノニカル … もっと見る研究代表者以外蛋白質間相互作用 / 分子シミュレーション / バイオインフォマティクス / プロテオーム / 蛋白質相互作用 / 天然変性 / 理論生物学 / 蛋白質 / 構造・機能予測 / タンパク質のダイナミクス / ハブタンパク質 / ダイナミクス / タンパク質のゆらぎ / X線小角散乱 / 核内タンパク質 / NMR / 高速AFM / Ｘ線小角散乱 / 天然変性タンパク質 / データベース / 分子動力学 / 生体分子 / 蛋白質の構造・機能予測 / 生物物理隠す

膜蛋白質 GPCR と薬剤化合物ボセンタンの結合自由エネルギー地形研究代表者
- 研究代表者
  
  肥後順一
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43020:構造生物化学関連
- 研究機関
  兵庫県立大学
   立命館大学
蛋白質-リガンド複合体の会合・解離の速度定数を平衡論から導く研究代表者
- 研究代表者
  
  肥後順一
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理・化学物理・ソフトマターの物理
- 研究機関
  兵庫県立大学
   大阪大学
翻訳後修飾された蛋白質天然変性領域におけるマルチステリーの計算科学研究
- 研究代表者
  
  中村春木
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2017
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  大阪大学
動的構造に基づく定量的な蛋白質間相互作用システムの計算・情報科学研究
- 研究代表者
  
  中村春木
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2013
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  大阪大学
天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現
- 研究代表者
  
  佐藤衛
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2013
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  横浜市立大学
計算科学による核内タンパク質天然変性状態の構造多型解析研究代表者
- 研究代表者
  
  肥後順一
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2013
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  大阪大学
構造インタラクトームの計算・情報科学による研究
- 研究代表者
  
  中村春木
- 研究期間 (年度)
  2008 – 2010
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  大阪大学
α/βの両二次構造を含む50残基の蛋白質の自由エネルギー地形を求める研究代表者
- 研究代表者
  
  肥後順一
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  大阪大学

[図書] Protein Conformational Dynamics, Advances in Experimental Medicine and Biology2014
- 著者名/発表者名
  J. Higo, K. Umezawa
- 総ページ数
  21
- 出版者
  Springer
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[図書] Protein Conformational Dynamics in Advances in Experimental Medicine and Biology Vol.8052014
- 著者名/発表者名
  Higo J., Umezawa K.
- 総ページ数
  21
- 出版者
  Springer
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[図書] “Protein Conformational Dynamics” in “Advances in Experimental Medicine and Biology” Vol. 8052014
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo, Koji Umezawa
- 総ページ数
  21
- 出版者
  Springeｒ
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[図書] Free-energy landscape of Intrinsically disordered proteins investigated by all-atom multicanonical molecular dynamics, Chapter 14 in "Protein Conformational Dynamics" (Han, K., Zhang, X., and Yang, M.eds.) Advances in Experimental Medicine and Biology 8052014
- 著者名/発表者名
  Higo, J., Umezawa, K
- 出版者
  Springer
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[図書] 全原子コンピュータシミュレーションで解き明かす、天然変成タンパク質の分子認識機構2013
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 総ページ数
  5
- 出版者
  生物物理学会会誌「生物物理」
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[図書] 生物物理学会会誌「生物物理」2013
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 総ページ数
  5
- 出版者
  全原子コンピュータシミュレーションで解き明かす、天然変成タンパク質の分子認識機構
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[図書] Protein Conformational Dynamics (Springer)2013
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo
- 総ページ数
  10
- 出版者
  Free-energy landscape of Intrinsically disordered proteins investigated by all-atom multicanonical molecular dynamics
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[図書] "Prediction of Protein-Protein Complex Structures" in Biomolecular Forms and Functions : A Celebration of 50 years of the Ramachandran Map(Eds. Manju Bansal & N. Srinivasan)2013
- 著者名/発表者名
  Kanamori E, Murakami Y, Sarmiento J, Liang S, Standley DM, Shirota M, Kinoshita K, Tsuchiya Y, Higo J, Nakamura H
- 出版者
  World Scientific Publishing
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370071
[図書] Protein Conformational Dynamics: Free-energy landscape of Intrinsically disordered proteins investigated by all-atommulticanonical molecular dynamics2012
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo
- 総ページ数
  10
- 出版者
  Springer
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[図書] Protein conformational dynamics : Free-energy land scope of intrinsically disordered proteins investigated by all-atom multicanonical molecular dynamics2012
- 著者名/発表者名
  Higo J.
- 総ページ数
  10
- 出版者
  Springer
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[図書] タンパク質計算科学2009
- 著者名/発表者名
  神谷成敏・肥後順一・福西快文・中村春木
- 総ページ数
  251
- 出版者
  共立出版
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20370061
[図書] 蛋白質の水和とフォールディング2008
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 出版者
  「物性研究」(物性研究刊行会)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[図書] 物性研究2008
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 総ページ数
  4
- 出版者
  京都大学物性研究刊行会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[雑誌論文] Binding mechanism of riboswitch to natural ligand elucidated by McMD-based dynamic docking simulations.2024
- 著者名/発表者名
  Bekker, G.-J. Fukunishi, Y., Higo, J., Kamiya, N
- 雑誌名
  
  ACS Omega
  
  巻: 10 ページ: 3412-3422
- DOI
  10.1021/acsomega.3c06826
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06052
[雑誌論文] Molecular mechanisms of functional modulation of transcriptional coactivator PC4 via phosphorylation on its intrinsically disordered region.2023
- 著者名/発表者名
  Qilin Xie, Kota Kasahara, Junichi Higo, Takuya Takahashi.
- 雑誌名
  
  ACS Omega
  
  巻: 8 号: 16 ページ: 14572-14582
- DOI
  10.1021/acsomega.3c00364
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06052
[雑誌論文] Binding free-energy landscapes of small molecule binder and non-binder to FMN riboswitch: All-atom molecular dynamics2023
- 著者名/発表者名
  3.Junichi Higo, Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Ikuo Fukuda and Yoshifumi Fukunishi.
- 雑誌名
  
  Biophysics and Physicobiology
  
  巻: 20 号: 4 ページ: n/a
- DOI
  10.2142/biophysico.bppb-v20.0047
- ISSN
  2189-4779
- 言語
  英語
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06052
[雑誌論文] A cutoff-based method with charge-distribution-data driven pair potentials for efficiently estimating electrostatic interactions in molecular systems.2023
- 著者名/発表者名
  Ikuo Fukuda, Kei Moritsugu, Junichi Higo, Yoshifumi Fukunishi.
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys.
  
  巻: 159 号: 23 ページ: 234116-234116
- DOI
  10.1063/5.0172270
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06052, KAKENHI-PROJECT-23K03344, KAKENHI-PROJECT-23K11134, KAKENHI-PROJECT-20K03883, KAKENHI-PROJECT-20K11854
[雑誌論文] Fly-casting with ligand-sliding and orientational selection to support the complex formation of a GPCR and a middle-sized flexible molecule.2022
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo, Kota Kasahara, et al.
- 雑誌名
  
  BioRxiv
  
  巻: -
- DOI
  10.1101/2022.02.28.482421
- オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06052
[雑誌論文] Computer simulation of molecular recognition in biomolecular system: from in silico screening to generalized ensembles2022
- 著者名/発表者名
  Fukunishi Yoshifumi、Higo Junichi、Kasahara Kota
- 雑誌名
  
  Biophysical Reviews
  
  巻: 14 号: 6 ページ: 1423-1447
- DOI
  10.1007/s12551-022-01015-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06052
[雑誌論文] Fly casting with ligand sliding and orientational selection supporting complex formation of a GPCR and a middle sized flexible molecule.2022
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo, Kota Kasahara, Gert-Jan Bekker, Benson Ma, Shun Sakuraba, Shinji Iida, Narutoshi Kamiya, Ikuo Fukuda, Hidetoshi Kono, Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 13792-13792
- DOI
  10.1038/s41598-022-17920-7
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06052, KAKENHI-PLANNED-18H05534
[雑誌論文] Mutual population-shift driven antibody-peptide binding elucidated by molecular dynamics simulations.2020
- 著者名/発表者名
  98.Gert-Jan Bekker, Ikuo Fukuda, Junichi Higo, Narutoshi Kamiya.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 1406-1406
- DOI
  10.1038/s41598-020-58320-z
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] GA-based mD-VcMD: A genetic-algorithm-based method for multi-dimensional virtual-system coupled molecular dynamics.2020
- 著者名/発表者名
  14.Higo, J.; Kusaka, A.; Kasahara, K.; Kamiya, N.; Fukuda, I.; Mori, K.; Hata, Y.; Fukunishi, F.
- 雑誌名
  
  arXiv
  
  巻: 未配布
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Molecular interaction mechanism of 14-3-3e protein with phosphorylated Myeloid leukemia factor 1 revealed by an enhanced conformational sampling2020
- 著者名/発表者名
  13.Junichi Higo, Takeshi Kawabata, Ayumi Kusaka, Kota Kasahara, Narutoshi Kamiya, Ikuo Fukuda, Kentaro Mori, Yutaka Hata, Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: 未配布
- DOI
  10.1101/2020.05.24.113209
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Effects of number of parallel runs and frequency of bias-strength replacement in generalized ensemble molecular dynamics simulations.2019
- 著者名/発表者名
  97.Takuya Shimato, Kota Kasahara, Junichi Higo, Takuya Takahashi
- 雑誌名
  
  PeerJ Phys. Chem.
  
  巻: 1 ページ: e4-e4
- DOI
  10.7717/peerj-pchem.4
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Free-energy landscape of molecular interactions between endothelin 1 and human endothelin type B receptor: Fly-casting mechanism.2019
- 著者名/発表者名
  96.Junichi Higo, Kota Kasahara, Mitsuhito Wada, Bhaskar Dasgupta, Narutoshi Kamiya, Tomonori Hayami, Ikuo Fukuda, Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura
- 雑誌名
  
  Protein Engineering, Design & Selection
  
  巻: 32 号: 7 ページ: 297-308
- DOI
  10.1093/protein/gzz029
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Multimodal Structural Distribution of the p53 C-Terminal Domain upon Binding to S100B via a Generalized Ensemble Method: From Disorder to Extradisorder2019
- 著者名/発表者名
  Iida Shinji、Kawabata Takeshi、Kasahara Kota、Nakamura Haruki、Higo Junichi
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Theory and Computation
  
  巻: 15 号: 4 ページ: 2597-2607
- DOI
  10.1021/acs.jctc.8b01042
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517, KAKENHI-PROJECT-17J07112, KAKENHI-PROJECT-16K18526
[雑誌論文] Studies on molecular dynamics of intrinsically disordered proteins and their fuzzy complexes: a mini-review2019
- 著者名/発表者名
  12.Kota Kasahara, Hiroki Terazawa, Takuya Takahashi, Junichi Higo
- 雑誌名
  
  Computational and Structural Biotechnology Journal
  
  巻: 17 ページ: 712-720
- DOI
  10.1016/j.csbj.2019.06.009
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Multidimensional virtual-system coupled canonical molecular dynamics to compute free-energy landscapes of peptide multimer assembly.2019
- 著者名/発表者名
  95.Tomonori Hayami, Junichi Higo, Haruki Nakamura, Kota Kasahara
- 雑誌名
  
  J Comput. Chem.
  
  巻: 40 号: 28 ページ: 2453-2463
- DOI
  10.1002/jcc.26020
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Phosphorylation of an intrinsically disordered region of Ets1 shifts a multi-modal interaction ensemble to an out-inhibitory state.2018
- 著者名/発表者名
  Kota Kasahara, Masaaki Shiina, Junichi Higo, Kazuhiro Ogata, Haruki Nakamura.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 46 号: 5 ページ: 2243-2251
- DOI
  10.1093/nar/gkx1297
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517, KAKENHI-PROJECT-16K18526, KAKENHI-PROJECT-16K14711, KAKENHI-PROJECT-18K19305, KAKENHI-PROJECT-16H03293
[雑誌論文] 理論と実験の連携による蛋白質天然変性領域の機能解析2018
- 著者名/発表者名
  21.笠原浩太，椎名政昭，肥後順一，緒方一博，中村春木
- 雑誌名
  
  分子シミュレーション研究会会誌「アンサンブル」
  
  巻: 20 ページ: 253-259
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Molecular dynamics coupled with a virtual system for effective conformational sampling.2018
- 著者名/発表者名
  Tomonori Hayami, Kota Kasahara, Haruki Nakamura, Junichi Higo
- 雑誌名
  
  J Comput Chem
  
  巻: 1 号: 19 ページ: 1-1
- DOI
  10.1002/jcc.25196
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517, KAKENHI-PROJECT-16K18526
[雑誌論文] Multi-dimensional virtual system introduced to enhance canonical sampling.2017
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo, Kota Kasahara, Haruki Nakamura.
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys.
  
  巻: 147 号: 13 ページ: 134102-134102
- DOI
  10.1063/1.4986129
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517, KAKENHI-PROJECT-16K18526, KAKENHI-PROJECT-16K14711
[雑誌論文] Enhancement of canonical sampling by virtual-state transitions2017
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo, Kota Kasahara, Bhaskar Dasgupta, Haruki Nakamura
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys.
  
  巻: 146 号: 4 ページ: 44104-44104
- DOI
  10.1063/1.4974087
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-16K14711, KAKENHI-PROJECT-16K18526, KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] myPresto/omegagene: a GPU-accelerated molecular dynamics simulator tailored for enhanced conformational sampling methods with a non-Ewald electrostatic scheme2016
- 著者名/発表者名
  Kota Kasahara, Benson Ma, Kota Goto, Bhaskar Dasgupta, Junichi Higo, Ikuo Fukuda, Tadaaki Mashimo, Yutaka Akiyama, Haruki Nakamura
- 雑誌名
  
  Biophysics and Physicobiology
  
  巻: 13 号: 0 ページ: 209-216
- DOI
  10.2142/biophysico.13.0_209
- NAID
  130007041560
- ISSN
  2189-4779
- 言語
  英語
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-16K05517, KAKENHI-PROJECT-16K18526
[雑誌論文] Enhanced conformational sampling to visualize a free-energy landscape of protein complex formation.2016
- 著者名/発表者名
  Sinji Iida, Haruki Nakamura, Junichi Higo.
- 雑誌名
  
  Biochemical J.
  
  巻: 473 号: 12 ページ: 1651-1662
- DOI
  10.1042/bcj20160053
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Flexible binding simulation by a novel and improved version of virtual-system coupled adaptive umbrella sampling.2016
- 著者名/発表者名
  Bhaskar Dasgupta, Haruki Nakamura, Junichi Higo.
- 雑誌名
  
  Chem. Phys. Lett.
  
  巻: 662 ページ: 327-332
- DOI
  10.1016/j.cplett.2016.09.059
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Intrinsic disorder accelerates dissociation rather than association2016
- 著者名/発表者名
  K. Umezawa, J. Ohnuki, J. Higo, and M. Takano
- 雑誌名
  
  Proteins: Structure, Function and Bioinformatics
  
  巻: - 号: 8 ページ: 1489-1501
- DOI
  10.1002/prot.25057
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13J07605, KAKENHI-PROJECT-16K05517, KAKENHI-PROJECT-16K14715
[雑誌論文] Dynamics of the Extended String-Like Interaction of TFIIE with the p62 Subunit of TFIIH.2016
- 著者名/発表者名
  Masahiko Okuda, Junichi Higo, Tadashi Komatsu, Tsuyoshi Konuma, Kenji Sugase, Yoshifumi Nishimura.
- 雑誌名
  
  Biophysical J.
  
  巻: 111 号: 5 ページ: 950-962
- DOI
  10.1016/j.bpj.2016.07.042
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Enhanced sampling simulations to construct free energy landscape of protein-partner substrate interaction.2016
- 著者名/発表者名
  Jinzen Ikebe, Koji Umezawa, Junichi Higo
- 雑誌名
  
  Biophysical Rev.
  
  巻: 8 号: 1 ページ: 45-62
- DOI
  10.1007/s12551-015-0189-z
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] Variation of Free-Energy Landscape of the p53 C-terminal Domain Induced by Acetylation: Enhanced Conformational Sampling2016
- 著者名/発表者名
  Shinji Iida, Tadaaki Mashimo, Takashi Kurosawa, Hironobu Hojo, Hiroya Muta, Yuji Goto, Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura, Junichi Higo
- 雑誌名
  
  J. Comput. Chem.
  
  巻: 37 号: 31 ページ: 2687-2700
- DOI
  10.1002/jcc.24494
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-16H04180, KAKENHI-PROJECT-16K05517
[雑誌論文] 全原子コンピュータシミュレーションで解き明かす、天然変成タンパク質の分子認識機構2014
- 著者名/発表者名
  肥後順一、梅澤公二
- 雑誌名
  
  生物物理学会会誌「生物物理」
  
  巻: 54 ページ: 96-99
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] High-resolution modeling of antibody structures by a combination of bioinformatics, expert knowledge, and molecular simulations.2014
- 著者名/発表者名
  Hiroki Shirai, Kazuyoshi Ikeda, Kazuo Yamashita, Yuko Tsuchiya, Jamica Sarmiento, Shide Liang, Tatsuaki Morokata, Kenji Mizuguchi, Junichi Higo, Daron M. Standley, Haruki Nakamura
- 雑誌名
  
  Proteins
  
  巻: 印刷中号: 8 ページ: 1624-1635
- DOI
  10.1002/prot.24591
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-25430186
[雑誌論文] High-resolution modeling of antibody structures by a combination of bioinformatics, expert knowledge, and molecular simulations2014
- 著者名/発表者名
  H. Shirai, K. Ikeda, K. Yamashita, Y. Tsuchiya, J. Sarmiento, S. Liang, T. Morokata, K. Mizuguchi, J. Higo, D. M. Standley, H. Nakamura
- 雑誌名
  
  Proteins
  
  巻: 未定
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] Local representation of N-body Coulomb energy with path integrals2014
- 著者名/発表者名
  T. Sugihara, J. Higo, H. Nakamura
- 雑誌名
  
  J. Phys. Soc. Jpn.
  
  巻: 未定
- NAID
  40020091368
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] A virtual-system coupled multicanonical molecular dynamics simulation: Principle and its application to free-energy landscape of protein-protein interaction with an all-atom model in explicit solvent2013
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys.
  
  巻: 未定
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] Gas-phase structure of the histone multimers characterized by ion mobility mass spectrometry and molecular dynamics simulation2013
- 著者名/発表者名
  Saikusa K, Fuchigami S, Takahashi K, Asano Y, Nagadoi A, Tachiwana H, Kurumizaka H, Ikeguchi M, Nishimura Y, Akashi S
- 雑誌名
  
  Anal Chem
  
  巻: 85 号: 8 ページ: 4165-4171
- DOI
  10.1021/ac400395j
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20227009, KAKENHI-ORGANIZER-21113001, KAKENHI-PLANNED-21113003, KAKENHI-PROJECT-22570120
[雑誌論文] A virtual-system coupled multicanonical molecular dynamics simulation: Principles and applications to free-energy landscape of protein–protein interaction with an all-atom model in explicit solvent2013
- 著者名/発表者名
  Higo, J., Umezawa, K., Nakamura, H.
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics
  
  巻: 138
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370071
[雑誌論文] A virtual-system coupled multicanonical molecular dynamics simulation : Principles and applications to free-energy landscape of protein-protein interaction with an all-atom model in explicit solvent2013
- 著者名/発表者名
  J. Higo, K. Umezawa, H. Nakamura
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics
  
  巻: 138 号: 18 ページ: 184106-184106
- DOI
  10.1063/1.4803468
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13J07605, KAKENHI-ORGANIZER-21113001, KAKENHI-PLANNED-21113006, KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008
[雑誌論文] A virtual-system coupled multicanonical molecular dynamics simulation: Principle and its application to free-energy landscape of protein-protein interaction with an all-atom model in explicit solvent2013
- 著者名/発表者名
  J. Higo, K. Umezawa, H. Nakamura
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys.
  
  巻: 138 ページ: 184106-184106
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] A virtual-system coupled multicanonical molecular dynamics simulation: Principle and its application to free-energy landscape of protein-protein interaction with an all-atom model in explicit solvent2013
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys.
  
  巻: 138
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[雑誌論文] Conformational Ensembles of an Intrinsically Disordered Protein pKID with and without a KIX Domain in Explicit Solvent Investigated by All-Atom Multicanonical Molecular Dynamics2012
- 著者名/発表者名
  Umezawa, K., Ikebe, J., Takano, M., Nakamura, H., Higo, J
- 雑誌名
  
  Biomolecules
  
  巻: 2 号: 1 ページ: 104-121
- DOI
  10.3390/biom2010104
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006, KAKENHI-PROJECT-23370071
[雑誌論文] Virtual states introduced for overcoming entropic barriers in conformational space2012
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo
- 雑誌名
  
  Biophysics
  
  巻: 8 ページ: 104-121
- NAID
  130002061588
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] Enhanced and effective conformational sampling of protein molecular systems for their free energy landscapes2012
- 著者名/発表者名
  J.Higo, J.Ikebe, N.Kamiya, H.Nakamura
- 雑誌名
  
  Biophysical Rev.
  
  巻: 4 ページ: 27-44
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] Enhanced and effective conformational sampling of protein molecular systems for their free energy landscapes2012
- 著者名/発表者名
  Higo, J., Ikebe, J., Kamiya, N., Nakamura, H
- 雑誌名
  
  Biophysical Rev
  
  巻: 4 号: 1 ページ: 27-44
- DOI
  10.1007/s12551-011-0063-6
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006, KAKENHI-PROJECT-22570160, KAKENHI-PROJECT-23370071
[雑誌論文] Virtual states introduced for overcoming entropic barriers in conformational space2012
- 著者名/発表者名
  Higo, J., Nakamura, H
- 雑誌名
  
  BIOPHYSICS
  
  巻: 8 号: 0 ページ: 139-144
- DOI
  10.2142/biophysics.8.139
- NAID
  130002061588
- ISSN
  1349-2942
- 言語
  英語
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006, KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[雑誌論文] Theory for trivial trajectory parallelization of multicanonical molecular dynamics and application to a polypeptide in water.2011
- 著者名/発表者名
  J.Ikebe, K.Umezawa, N.Kamiya, T.Sugihara, Y.Yonezawa, Y.Takano, H.Nakamura, J.Higo
- 雑誌名
  
  J.Comput.Chem. 32
  
  ページ: 1286-1297
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20370061
[雑誌論文] Theory for Trivial Trajectory Parallelization of Multicanonical Molecular Dynamics and Application to a Polypeptide in Water2011
- 著者名/発表者名
  Ikebe, J., Umezawa, K., Kamiya, N., Sugihara, T., Yonezawa, Y., Takano, Y., Nakamura, H., Higo J.
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: 32 ページ: 1286-1297
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] A Free-energy Landscape for Coupled Folding and Binding of an Intrinsically Disordered Protein in Explicit Solvent from Detailed All-atom Computations2011
- 著者名/発表者名
  J.Higo, Y.Nishimura, H.Nakamura
- 雑誌名
  
  J.Am.Chem.Soc.
  
  巻: 133 ページ: 10448-10458
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] Ab initio simulation of a 57-residue protein in explicit solvent reproduces the native conformation in the lowest free-energy cluster2011
- 著者名/発表者名
  Ikebe, J., Standley, D.M., Nakamura, H., Higo J.
- 雑誌名
  
  Protein Science
  
  巻: 20 ページ: 187-196
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] Free-energy Landscape for Coupled Folding and Binding of an Intrinsically Disordered Protein in Explicit Solvent from Detailed All-atom Computations2011
- 著者名/発表者名
  Higo J, Nishimura Y, Nakamura H
- 雑誌名
  
  J Am Chem Soc
  
  巻: 133 号: 27 ページ: 10448-10458
- DOI
  10.1021/ja110338e
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20227009, KAKENHI-PLANNED-21113003, KAKENHI-PLANNED-21113006, KAKENHI-PROJECT-23370071
[雑誌論文] Ab initio simulation of a 57-residue protein in explicit solvent reproduces the native conformation in the lowest free-energy cluster.2011
- 著者名/発表者名
  J.Ikebe, D.M.Standley, H.Nakamura, J.Higo
- 雑誌名
  
  Protein Science 20
  
  ページ: 187-196
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20370061
[雑誌論文] Theory for Trivial Trajectory Parallelization of Multicanonical Molecular Dynamics and Application to a Polypeptide in Water2011
- 著者名/発表者名
  Ikebe, J., Umezawa, K., Kamiya, N., Sugihara, T., Yonezawa, Y., Takano, Y., Nakamura, H., Higo, J
- 雑誌名
  
  J. Comput. Chem.
  
  巻: 32 号: 7 ページ: 1286-1297
- DOI
  10.1002/jcc.21710
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] 単純軌跡和マルチカノニカル分子動力学法2010
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 雑誌名
  
  アンサンブル(分子シミュレーション研究会会誌)
  
  巻: 12 ページ: 8-10
- NAID
  130004566659
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] Theory for Trivial Trajectory Parallelization of Multicanonical Molecular Dynamics and Application to a Polypeptide in Water2010
- 著者名/発表者名
  Ikebe, J., Higo, J.
- 雑誌名
  
  Journal Computational Chemistry
  
  巻: (in press 現在未定)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[雑誌論文] Verifying trivial parallelization of multicanonical molecular dynamics for conformational sampling of a polypeptide in explicit water2009
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo
- 雑誌名
  
  Chem.Phys.Lett. 473
  
  ページ: 326-329
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20370061
[雑誌論文] arXiv2009
- 著者名/発表者名
  Takanori Sugihara, Junichi Higo, Haruki Nakamura
- 雑誌名
  
  0812
  
  ページ: 2964-2964
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[雑誌論文] Verifying trivial parallelization of multicanonical molecular dynamics for conformational sampling of a polypeptide in explicit water2009
- 著者名/発表者名
  J. Higo, N. Kamiya, T. Sugihara, Y.Yonezawa, H. Nakamur
- 雑誌名
  
  Chem. Phys. Lett 473
  
  ページ: 326-329
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[雑誌論文] Parallelization of Markov chain generation and its application to the multicanonical method2009
- 著者名/発表者名
  T. Sugihara, J. Higo, H. Nakamura
- 雑誌名
  
  J. Phys. Soc. Jpn. (in press)
- NAID
  10025962130
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[雑誌論文] Structure dependency of a 24-residue peptide humanin on solvent and preferential solvation by trifluoroethanol studied by multicanonical sampling2008
- 著者名/発表者名
  R. Yagisawa, N. Kamiya, J. Ikebe, K.Umezawa, J. Higo
- 雑誌名
  
  Chem. Phys. Lett. 455
  
  ページ: 293-296
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] 膜に埋もれたヒトエンドセリン受容体に結合するボセンタンの結合メカニズム：スライドするフライ・キャストィングと配向選択メカニズム2021
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  第５９回日本生物物理学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06052
[学会発表] AIで効率化されたMD法による、蛋白質-リガンドの結合・解離自由エネルギー地形の算出2021
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  第8回HPCIシステム利用研究課題成果報告会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06052
[学会発表] Oct4の2つのDNA結合サブドメインを結ぶLinker領域の構造多様性2017
- 著者名/発表者名
  速水智教、高田彰二、笠原浩太、中村春木、肥後順一
- 学会等名
  第55回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14711
[学会発表] Oct4の2つのDNA結合サブドメインを結ぶLinker領域の構造多様性2017
- 著者名/発表者名
  速水智教、高田彰二、笠原浩太、中村春木、肥後順一
- 学会等名
  第17回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14711
[学会発表] Oct4の2つのDNA結合サブドメインを結ぶ柔軟なlinker領域の自由エネルギー地形2016
- 著者名/発表者名
  速水智教、高田彰二、中村春木、肥後順一
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場（茨城県、つくば市）
- 年月日
  2016-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14711
[学会発表] Free-energy Landscape of Coupled Folding and Binding of IDP-partner Systems in an Explicit Solvent Investigated by All-atom Multicanonical Molecular Dynamics2013
- 著者名/発表者名
  Junichi Higo, Koji Umezawa, Haruki Nakamura
- 学会等名
  Protein Society the 27th Annual Symposium
- 発表場所
  Boston Marriott, Boston, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370071
[学会発表] 全原子シミュレーションによる天然変性蛋白質の自由エネルギー地形2011
- 著者名/発表者名
  肥後　順一
- 学会等名
  第49回日本生物物理学会
- 発表場所
  兵庫県立大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370071
[学会発表] 天然変死蛋白質NRSFとそのパートナー蛋白質mSin3の結合／折れ畳みの詳細な自由エネルギー地形2011
- 著者名/発表者名
  肥後　順一
- 学会等名
  第11回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  大阪千里
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370071
[学会発表] Free Energy Landscape: the road map for protein conformational changes2011
- 著者名/発表者名
  肥後　順一
- 学会等名
  第34回日本分子生物学会年会シンポジウム
- 発表場所
  パシフィコ横浜
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370071
[学会発表] Free-energy landscape : the road map for protein conformational changes2011
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  第34回に本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜(横浜)(招待講演)
- 年月日
  2011-12-13
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[学会発表] 天然変性蛋白質NRSFとパートナー蛋白質Sin3の結合/折り畳みの自由エネルギー地形2010
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  第10回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「タンパク質間相互作用の計算・情報科学」
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[学会発表] 単純並列化によるマルチカノニカル分子動力学法のサンプリング効率の向上2010
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  第10回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター・札幌
- 年月日
  2010-06-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20370061
[学会発表] 天然変性蛋白質pKIDのKIXドメインとの結合に共役したフォールディングのマルチカノニカル分子動力学計算による解析2010
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  第10回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター・札幌
- 年月日
  2010-06-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20370061
[学会発表] 天然変性蛋白質NRSFはパートナー蛋白質Sin3の存在下のみでヘリックス構造をとる-全原子マルチカノニカル計算-2010
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  文科省「新学術領域研究(天然変性蛋白質)」第1回公開シンポジウム
- 発表場所
  理化学研究所横浜研究所
- 年月日
  2010-01-19
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[学会発表] 天然変性タンパク質NRSFとパートナー蛋白質Sin3の結合/折れ畳みの自由エネルギー地名2010
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  第10回蛋白質科学会年会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター(札幌)(招待講演)
- 年月日
  2010-06-16
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21113006
[学会発表] 天然変性蛋白質NRSF とパートナー蛋白質Sin3 の結合/折り畳みの自由エネルギー地形2010
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  第10回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[学会発表] マルチカノニカル分子動力学シミュレーションによる天然変性蛋白質の自由エネルギー地形2009
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  第82回日本生化学会年会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21113001
[学会発表] アルツハイマーβアミロイドペプチド構造の分子シミュレーション2009
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  物理学会年会(春)
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2009-03-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Disordered proteinである水中アルツハイマーβアミロイドペプチドAβ(12-36)の自由エネルギー地形2008
- 著者名/発表者名
  池部仁善、神谷成敏、伊東純一、神藤平三郎、肥後順一
- 学会等名
  蛋白質科学会年会
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2008-06-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] 蛋白質周辺における水分子の協調的挙動の分子動力学シミュレーションによる解析2008
- 著者名/発表者名
  梅澤公二、肥後順一、中村春木、田代櫻子、神藤平三郎
- 学会等名
  物理学会年会(秋)
- 発表場所
  山形
- 年月日
  2008-09-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] アルファ/ベータ両二次構造を含む40残基蛋白質の立体構造サンプリング2008
- 著者名/発表者名
  肥後順一、池部仁善、神谷成敏、中村春木
- 学会等名
  蛋白質科学会年会
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2008-06-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] アルファ/ベーダ両方の二次構造要素を含む40残基蛋白質のフォールディングシミュレーション2008
- 著者名/発表者名
  肥後順一
- 学会等名
  日本物理学会2008年秋期大会
- 発表場所
  岩手大学上田キャンパス
- 年月日
  2008-09-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Structure variation of a 24-residue peptide on solvent, and preferential solvation by trifluroethanol by multicanonical sampling2008
- 著者名/発表者名
  R. Yagisawa, N. Kamiya, A. Yamagishi, J.Higo
- 学会等名
  生物物理学会年会
- 発表場所
  福岡
- 年月日
  2008-12-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] An enhanced conformational sampling of a 40-residue protein consisting of alpha and beta secondary structures in explicit solvent2008
- 著者名/発表者名
  J. Higo, N. Kamiya
- 学会等名
  The Joint 2nd Pacific Rim International Conference on Protein Science and 4th Asian-Oceania Human Proteome Organization
- 発表場所
  ケアンズ、オーストラリア
- 年月日
  2008-06-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Two types universality of a fold universe of 50-residue segment2008
- 著者名/発表者名
  J. Ito, Y. Sonobe, K. Ikeda, K. Tomii, A.Yamagishi, J. Higo
- 学会等名
  生物物理学会年会
- 発表場所
  福岡
- 年月日
  2008-12-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] 蛋白質周辺における水の協調的な流れの分子動力学シミュレーションによる解析2008
- 著者名/発表者名
  梅澤公二、肥後順一、山岸明彦、中村春木、田代櫻子、神藤平三郎
- 学会等名
  蛋白質科学会年会
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2008-06-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Brownian dynamics simulation of hERG potassium ion channel and development of an accurate molecular docking method for protein and ligand2008
- 著者名/発表者名
  N. Kamiya, J. Higo
- 学会等名
  The 3rd MEI International Symposium
- 発表場所
  San Francisco, USA.
- 年月日
  2008-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] マルチカノニカル分子動力学法によるアミロイドペプチド4本鎖の会合シミュレーション2008
- 著者名/発表者名
  神谷成敏、米澤康滋、中村春木、肥後順一
- 学会等名
  蛋白質科学会年会
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2008-06-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] アルファ/べータ両方の二次構造要素を含む40残基蛋白質のフォールディングシミュレーション2008
- 著者名/発表者名
  肥後順一、池部仁善、神谷成敏、中村春木
- 学会等名
  物理学会年会(秋)
- 発表場所
  山形
- 年月日
  2008-09-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Fair current, vortex, and drying/wetting water flow around lysozyme investigated by molecular dynamics simulation2008
- 著者名/発表者名
  K. Umezawa, R. Morikawa, H. Nakamura, J.Higo
- 学会等名
  生物物理学会年会
- 発表場所
  福岡
- 年月日
  2008-12-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Multicanonical molecular dynamics simulation of a protein with 57 residues in explicit water2008
- 著者名/発表者名
  J, Ikebe, J. Higo, H. Nakamura
- 学会等名
  生物物理学会年会
- 発表場所
  福岡
- 年月日
  2008-12-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Identification of essential variables for medium-size protein-segment and application to structural class assignment2008
- 著者名/発表者名
  K. Ikeda, J. Higo, K. Tomii
- 学会等名
  生物物理学会年会
- 発表場所
  福岡
- 年月日
  2008-12-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Assembly simulation of four peptide chains in explicit water by multicanonical molecular dynamics2008
- 著者名/発表者名
  N. Kamiya, Y. Yonezawa, H. Nakamura, J.Higo
- 学会等名
  The Joint 2nd Pacific Rim International Conference on Protein Science and 4th Asian-Oceania Human Proteome Organization
- 発表場所
  ケアンズ、オーストラリア
- 年月日
  2008-06-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] マルチカノニカル分子動力学シミュレーションによって描かれるdisordered protein (水中アミロイドβ 12-36 残基断片)の自由エネルギー地形2008
- 著者名/発表者名
  池部仁善、神谷成敏、伊東純一,神藤平三郎、中村春木、肥後順一
- 学会等名
  物理学会年会(秋)
- 発表場所
  山形
- 年月日
  2008-09-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] マルチカノニカル分子動力学法によるアミロイドペプチドの会合シミュレーション2008
- 著者名/発表者名
  神谷成敏,米澤康滋、中村春木、肥後順一
- 学会等名
  物理学会年会(秋)
- 発表場所
  山形
- 年月日
  2008-09-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Collective water flows around a protein : a novel insight into explicit solvent characteristics2007
- 著者名/発表者名
  K. Umezawa, J. Higo, A. Yamagishi, S.Tashiro, H. Shindo
- 学会等名
  情報計算化学生物学会2007年大会
- 発表場所
  広島
- 年月日
  2007-10-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Free-energy landscapes of humanin in water and in TFE/water using multicanonical molecular dynamics2007
- 著者名/発表者名
  R. Yagisawa, N. Kamiya, A. Yamagishi, J.Higo
- 学会等名
  情報計算化学生物学会2007年大会
- 発表場所
  広島
- 年月日
  2007-10-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Structure universe of 50-residue protein segments constructed by residue-residue native contacts2007
- 著者名/発表者名
  Y. Sonobe, J. Ito, A. Yamagishi, K. Tomii, J.Higo
- 学会等名
  情報計算化学生物学会2007年大会
- 発表場所
  広島
- 年月日
  2007-10-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Prediction of protein structure from the free-energy landscapes2007
- 著者名/発表者名
  J. Higo, N. Kamiya
- 学会等名
  The 2nd MEI International Symposium
- 発表場所
  Osaka
- 年月日
  2007-12-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] A process of protein-ligand approach mediated by solvent-dipole field2007
- 著者名/発表者名
  N. Takano, N. Hamasaki, H. Miyagawa, A.Yamagishi, J. Higo
- 学会等名
  情報計算化学生物学会2007年大会
- 発表場所
  広島
- 年月日
  2007-10-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Conformational sampling of a 40-residue protein consisting of alpha and beta secondary-structure elements in explicit solvent2007
- 著者名/発表者名
  J. Higo, J. Ikebe, N. Kamiya, H. Nakamura,H. Shindo
- 学会等名
  情報計算化学生物学会2007年大会
- 発表場所
  広島
- 年月日
  2007-10-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156
[学会発表] Free-energy landscape of the disordered state of an Altzheimer's beta amyloid peptide in water studied by multicanonical molecular dynamics2007
- 著者名/発表者名
  J. Ikebe, N. Kamiya, J. Ito, H. Shindo, A.Yamagishi, J, Higo
- 学会等名
  情報計算化学生物学会2007年大会
- 発表場所
  広島
- 年月日
  2007-10-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19570156

1. 中村春木 (80134485)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 12件
2. 神谷成敏 (80420462)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
3. 木下賢吾 (60332293)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 佐藤衛 (60170784)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 柴田武彦 (70087550)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 太田元規 (40290895)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 明石知子 (10280728)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
8. 石野良純 (30346837)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 西村善文 (70107390)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
10. 藤井義明 (00098146)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 石川冬木 (30184493)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 森川耿右 (80012665)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 高野光則 (40313168)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
14. 菊池誠 (50195210)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 金城玲 (30370117)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 米澤康滋 (40248753)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 笠原浩太 (90634965)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
18. 石井俊輔

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
19. 長土居有隆

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

肥後 順一 Higo Junichi

研究課題

研究成果

共同研究者

膜蛋白質 GPCR と薬剤化合物ボセンタンの結合自由エネルギー地形研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

蛋白質-リガンド複合体の会合・解離の速度定数を平衡論から導く研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

翻訳後修飾された蛋白質天然変性領域におけるマルチステリーの計算科学研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

動的構造に基づく定量的な蛋白質間相互作用システムの計算・情報科学研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

計算科学による核内タンパク質天然変性状態の構造多型解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

構造インタラクトームの計算・情報科学による研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

α/βの両二次構造を含む50残基の蛋白質の自由エネルギー地形を求める研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] Protein Conformational Dynamics, Advances in Experimental Medicine and Biology2014

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] Protein Conformational Dynamics in Advances in Experimental Medicine and Biology Vol.8052014

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] “Protein Conformational Dynamics” in “Advances in Experimental Medicine and Biology” Vol. 8052014

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] Free-energy landscape of Intrinsically disordered proteins investigated by all-atom multicanonical molecular dynamics, Chapter 14 in "Protein Conformational Dynamics" (Han, K., Zhang, X., and Yang, M.eds.) Advances in Experimental Medicine and Biology 8052014

著者名/発表者名

出版者

データソース

[図書] 全原子コンピュータシミュレーションで解き明かす、天然変成タンパク質の分子認識機構2013

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] 生物物理学会会誌「生物物理」2013

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

肥後順一 Higo Junichi