Kawakami Eiryo 川上英良

Researcher Number	30725338
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Affiliation *help	2018 : 国立研究開発法人理化学研究所, 科学技術ハブ推進本部, ユニットリーダー 2018 : 国立研究開発法人理化学研究所, 科技ハブ産連本部, ユニットリーダー 2016 – 2017 : 国立研究開発法人理化学研究所, 科学技術ハブ推進本部, 上級研究員 2015 : 国立研究開発法人理化学研究所, その他部局等, 研究員 2015 : 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 特別研究員
Review Section/Research Field	Principal Investigator Dermatology / System genome science / Complex Systems Disease Theory Except Principal Investigator Complex systems / Constructive Systems Biology
Keywords	Principal Investigator マイクロRNA / 遺伝子制御ネットワーク / 状態遷移モデル / 転写因子 / 疾患予測 / 多階層ネットワーク / 分岐現象 / Gene set enrichment解析 / 時系列解析 / アトピー性皮膚炎 / バイオマーカー … More Except Principal Investigator … More

生命システムの破綻にひそむ秩序を解明するPrincipal InvestigatorOngoing
- Principal Investigator
  
  川上英良
- Project Period (FY)
  2016 – 2018
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  Complex Systems Disease Theory
- Research Institution
  Institute of Physical and Chemical Research
出芽酵母の人工進化系構築　―生命の適応的機能創出をデザインする―Ongoing
- Principal Investigator
  
  中岡慎治
- Project Period (FY)
  2015 – 2017
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  Constructive Systems Biology
- Research Institution
  The University of Tokyo
Comprehensive identification of microRNAs that control atopic dermatitis using a gene regulatory networkPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Kawakami Eiryo
- Project Period (FY)
  2015 – 2016
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- Research Field
  
  System genome science
  Dermatology
- Research Institution
  Institute of Physical and Chemical Research
遺伝統計学とビッグデータの邂逅がもたらす新たながんゲノム創薬Ongoing
- Principal Investigator
  
  岡田随象
- Project Period (FY)
  2015 – 2019
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
- Review Section
  
  Complex systems
- Research Institution
  Osaka University
  Tokyo Medical and Dental University

All 2017 2016 2015

All Journal Article Presentation Book

[Book] 実験医学増刊2017
- Author(s)
  川上英良、大田達郎
- Total Pages
  8
- Publisher
  羊土社
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15KT0147
[Journal Article] 公共ハイスループットChIPデータを用いた遺伝子制御ネットワークの構築とその活用法2017
- Author(s)
  川上英良、大田達郎
- Journal Title
  
  実験医学増刊
  
  Volume : Vol. 35 Pages : 112-118
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K21631
[Journal Article] アトピー性皮膚炎のリバーストランスレーショナルリサーチ2017
- Author(s)
  川崎洋、川上英良、天谷雅行、古関明彦
- Journal Title
  
  実験医学
  
  Volume : Vol. 35 Pages : 33-39
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16KT0196
[Journal Article] Weighted Enrichment Method for Prediction of Transcription Regulators from Transcriptome and Global Chromatin Immunoprecipitation data2016
- Author(s)
  Eiryo Kawakami, Shinji Nakaoka, Tazro Ohta and Hiroaki Kitano
- Journal Title
  
  Nucleic Acids Research
  
  Volume : 印刷中 Pages : 5010-5021
- DOI
  10.1093/nar/gkw355
- Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K21631, KAKENHI-PROJECT-15KT0147, KAKENHI-PROJECT-16KT0196
[Journal Article] Network analyses based on comprehensive molecular interaction maps reveal robust control structures in yeast stress response pathways.2016
- Author(s)
  Eiryo Kawakami, Vivek K Singh, Kazuko Matsubara, Takashi Ishii, Yukiko Matsuoka, Takeshi Hase,Priya Kulkarni, Kenaz Siddiqui, Janhavi Kodilkar, Nitisha Danve, Indhupriya Subramanian, Manami Katoh, Yuki Shimizu-Yoshida, Samik Ghosh, Abhay Jere & Hiroaki Kitano
- Journal Title
  
  npj Systems Biology and Applications
  
  Volume : 2 Pages : 15018-15018
- DOI
  10.1038/npjsba.2015.18
- Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15KT0147, KAKENHI-PROJECT-15K21631, KAKENHI-ORGANIZER-22136001
[Journal Article] Significant impact of miRNA-target gene networks on genetics of human complex traits2016
- Author(s)
  Okada Y, Muramatsu T, Suita N, Kanai M, Kawakami E et al.
- Journal Title
  
  Scientific Reports
  
  Volume : 6 Pages : 22223-22223
- DOI
  10.1038/srep22223
- Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Open Access / Acknowledgement Compliant
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K14429, KAKENHI-PROJECT-15K21631, KAKENHI-PLANNED-15H05908, KAKENHI-PLANNED-15H05911, KAKENHI-PROJECT-25250019, KAKENHI-PROJECT-15H05670
[Presentation] ウイルス・細菌感染における宿主転写制御2017
- Author(s)
  川上英良
- Organizer
  第90回日本細菌学会総会
- Place of Presentation
  仙台国際センター（宮城県・仙台市）
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K21631
[Presentation] ウイルス・細菌感染における宿主転写制御2017
- Author(s)
  川上英良
- Organizer
  第90回日本細菌学会総会
- Place of Presentation
  仙台国際センター（宮城県・仙台市
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16KT0196
[Presentation] ウイルス・細菌感染における宿主転写制御2017
- Author(s)
  川上英良
- Organizer
  第90回日本細菌学会総会
- Place of Presentation
  仙台国際センター
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15KT0147
[Presentation] 生物ネットワークに潜む情報を探る：タンパク質相互作用ネットワークに基づくシグナル伝達パスウェイ網羅的再構成2016
- Author(s)
  川上英良
- Organizer
  第89回日本生化学会大会
- Place of Presentation
  仙台国際センター（宮城県・仙台市）
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K21631
[Presentation] 公共ChIPデータを活用した遺伝子制御ネットワーク構築と転写因子予測2016
- Author(s)
  川上英良
- Organizer
  トーゴーの日シンポジウム2016
- Place of Presentation
  東京大学（東京都・文京区）
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K21631
[Presentation] 複合体が生み出すシグナル伝達確率的ダイナミクスの制御機構2016
- Author(s)
  川上英良, 古関恵太, 中岡慎治
- Organizer
  第39回日本分子生物学会年会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15KT0147
[Presentation] 複合体が生み出すシグナル伝達確率的ダイナミクスの制御機構2016
- Author(s)
  川上英良, 古関恵太, 中岡慎治
- Organizer
  第39回日本分子生物学会年会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16KT0196
[Presentation] 公共ChIPデータを活用した遺伝子制御ネットワーク構築と転写因子予測2016
- Author(s)
  川上英良
- Organizer
  トーゴーの日シンポジウム2016
- Place of Presentation
  東京大学
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15KT0147
[Presentation] 生物ネットワークに潜む情報を探る:タンパク質相互作用ネットワークに基づくシグナル伝達パスウェイ網羅的再構成2016
- Author(s)
  川上英良
- Organizer
  日本生化学会大会
- Place of Presentation
  仙台国際センター（宮城県・仙台市）
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16KT0196
[Presentation] 生物ネットワークに潜む情報を探る：タンパク質相互作用ネットワークに基づくシグナル伝達パスウェイ網羅的再構成2016
- Author(s)
  川上英良
- Organizer
  日本生化学会大会
- Place of Presentation
  仙台国際センター
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15KT0147
[Presentation] 公共ChIPデータを活用した遺伝子制御ネットワーク構築と転写因子予測2016
- Author(s)
  川上英良
- Organizer
  トーゴーの日シンポジウム2016
- Place of Presentation
  東京大学（東京都・文京区）
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16KT0196
[Presentation] 遺伝子発現から転写制御因子を予測する確率的Gene Set Enrichment解析2015
- Author(s)
  川上英良、中岡慎治、北野宏明
- Organizer
  BMB2015 (第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会　合同大会）
- Place of Presentation
  神戸ポートアイランド
- Year and Date
  2015-12-04
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15KT0147
[Presentation] 遺伝子発現から転写制御因子を予測する確率的Gene Set Enrichment解析2015
- Author(s)
  川上英良、中岡慎治、北野宏明
- Organizer
  BMB2015 (第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会　合同大会）
- Place of Presentation
  神戸ポートアイランド（兵庫・神戸市）
- Year and Date
  2015-12-04
- Int'l Joint Research / Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K21631
[Presentation] Impaired balance between antagonistic transcriptional modules during the progression of inflammatory skin disease2015
- Author(s)
  Eiryo Kawakami, Hisahiro Yoshida, Takuwa Yasuda, Shinji Nakaoka, Hiroaki Kitano, Haruhiko Koseki
- Organizer
  Functional Genomics and Systems Biology: From Model Organisms to Human Health
- Place of Presentation
  Welcome Trust Sanger Institute（United Kingdom)
- Year and Date
  2015-10-29
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K21631
[Presentation] Impaired balance between antagonistic transcriptional modules during the progression of inflammatory skin disease2015
- Author(s)
  Eiryo Kawakami, Hisahiro Yoshida, Takuwa Yasuda, Shinji Nakaoka, Hiroaki Kitano
- Organizer
  Functional Genomics and Systems Biology: From Model Organisms to Human Health
- Place of Presentation
  Welcome Trust Sanger Institute
- Year and Date
  2015-10-29
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15KT0147

1. 中岡慎治 (30512040)

# of Collaborated Projects : 2results

# of Collaborated Products : 5results
2. 細田一史 (30515565)

# of Collaborated Projects : 1results

# of Collaborated Products : 0results
3. 岡田随象 (70727411)

# of Collaborated Projects : 1results

# of Collaborated Products : 1results
4. 鎌谷洋一郎 (00720880)

# of Collaborated Projects : 1results

# of Collaborated Products : 0results
5. 浦山ケビン (60726850)

# of Collaborated Projects : 1results

# of Collaborated Products : 0results
6. 藤本明洋 (30525853)

# of Collaborated Projects : 1results

# of Collaborated Products : 0results
7. 北野宏明

# of Collaborated Projects : 0results

# of Collaborated Products : 1results
8. 稲澤譲治

# of Collaborated Projects : 0results

# of Collaborated Products : 1results
9. 村松智輝

# of Collaborated Projects : 0results

# of Collaborated Products : 1results

Kawakami Eiryo 川上 英良

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

生命システムの破綻にひそむ秩序を解明するPrincipal InvestigatorOngoing

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

出芽酵母の人工進化系構築 ―生命の適応的機能創出をデザインする―Ongoing

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Comprehensive identification of microRNAs that control atopic dermatitis using a gene regulatory networkPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

遺伝統計学とビッグデータの邂逅がもたらす新たながんゲノム創薬Ongoing

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

[Book] 実験医学増刊2017

Author(s)

Total Pages

Publisher

Data Source

[Journal Article] 公共ハイスループットChIPデータを用いた 遺伝子制御ネットワークの構築と その活用法2017

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] アトピー性皮膚炎のリバーストランスレーショナルリサーチ2017

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Weighted Enrichment Method for Prediction of Transcription Regulators from Transcriptome and Global Chromatin Immunoprecipitation data2016

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Network analyses based on comprehensive molecular interaction maps reveal robust control structures in yeast stress response pathways.2016

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Significant impact of miRNA-target gene networks on genetics of human complex traits2016

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Presentation] ウイルス・細菌感染における宿主転写制御2017

Author(s)

Organizer

Place of Presentation

Data Source

[Presentation] ウイルス・細菌感染における宿主転写制御2017

Author(s)

Organizer

Place of Presentation

Data Source

[Presentation] ウイルス・細菌感染における宿主転写制御2017

Author(s)

Organizer

Place of Presentation

Data Source

[Presentation] 生物ネットワークに潜む情報を探る：タンパク質相互作用ネットワークに基づくシグナル伝達パスウェイ網羅的再構成2016

Author(s)

Organizer

Place of Presentation

Data Source

[Presentation] 公共ChIPデータを活用した遺伝子制御ネットワーク構築と転写因子予測2016

Author(s)

Organizer

Place of Presentation

Kawakami Eiryo 川上英良

出芽酵母の人工進化系構築　―生命の適応的機能創出をデザインする―Ongoing

[Journal Article] 公共ハイスループットChIPデータを用いた遺伝子制御ネットワークの構築とその活用法2017

[Presentation] 生物ネットワークに潜む情報を探る:タンパク質相互作用ネットワークに基づくシグナル伝達パスウェイ網羅的再構成2016