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2016: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 名誉教授
2015: 東京大学, 農学生命科学研究科, 名誉教授
2014: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 名誉教授
2013: 東京大学, 農学生命科学研究科, 名誉教授
2010 – 2012: 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 名誉教授
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2009: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, バイオメディシナル情報研究センター, 招聘研究員
2006: 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物情報解析研究センター研究, センター長
2004 – 2006: 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物情報解析研究センター, 研究センター長
2005: 東京大学, 生物情報解析研究センター, センター長(研究職)
2004: 生物情報解析研究センター, センター長(研究職)
1999 – 2003: 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授
2002: The University of Tokyo, Graduate School of Engineering, Professor, 大学院・工学研究科, 教授
1999: 東京大学, 大学院・工学系研究所, 教授
1995 – 1998: 東京大学, 大学院・工学系研究科, 教授
1997: 東京大学大学院, 工学系研究科, 教授
1995: The University of Tokyo, School of Engineering, Professor, 大学院・工学系研究科
1991 – 1994: 東京大学, 工学部, 教授
1990 – 1991: 東京工業大学, 生命理工学部, 教授
1989: 東京工業大学, 総合理工学研究科, 教授
1988: 東京工業大学, 大学院総合理工学研究科, 教授
1986 – 1987: 東京大学, 工学部, 助教授
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