新井田厚司 Niida Atsushi

研究者番号	00772493
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京大学, 医科学研究所, 講師
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2019年度 – 2024年度: 東京大学, 医科学研究所, 講師 2016年度 – 2018年度: 東京大学, 医科学研究所, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 生命・健康・医療情報学研究代表者以外小区分50010:腫瘍生物学関連 / 小区分55010:外科学一般および小児外科学関連 / 小区分50020:腫瘍診断および治療学関連 / 小区分55020:消化器外科学関連 / 小区分52040:放射線科学関連 / 放射線科学 / 複合領域
キーワード	研究代表者進化 / がん / シミュレーション / 深層学習 / 癌 / 可視化 / スーパーコンピュータ研究代表者以外大腸がん / シミュレーション / dPCR … もっと見る / シングルセル解析 / 共局在 / VISIUM / がん微小環境 / 食道癌 / 早期診断 / DNAメチル化 / MRD / メチル化ctDNA / クロストーク / scRNA / 空間的シングルセル解析 / クロストーク遺伝子 / MSI-H大腸癌 / 空間的転写産物解析 / 共局在細胞 / 抗原提示機構 / MSI-H大腸がん / 前がん病変 / 免疫寛容 / 空間的シングルセルトランスクリプトーム解析 / 転移・再発 / 患者由来オルガノイド / リキッドバイオプシー / 大腸癌 / ctDNA / マルチターゲット / 再発 / メチル化 / モニタリング / コピー数変異 / がん進化 / CMS分類 / 陥凹型大腸がん / 選択圧 / 大腸発がん / VISIUM解析 / 腫瘍免疫応答 / 中立進化 / ダーウイン進化 / 免疫応答 / サイトカイン / SPP1+マクロファージ / spatial transcriptome / 多領域シーケンス / 個別化治療 / 膵癌 / 膵癌の数理モデル / 数理モデル / 数理腫瘍学 / 免疫ゲノミクス / 遺伝子変異 / 化学放射線療法 / クローン進化 / 放射線治療 / 放射線腫瘍額 / 化学放射線治療耐性 / 放射線腫瘍学 / 腫瘍内不均一性 / エピゲノム / ゲノム / 化学放射線耐性 / 人工知能 / バイオインフォマティクス / 統計的モデリング / システム生物学 / がん隠す

メチル化ctDNAによる大腸がん根治術後再発早期診断の実装的モニタリング法の開発
- 研究代表者
  
  大村洋文
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
- 研究機関
  九州大学
大腸がん細胞との共局在により悪性度と免疫寛容を獲得するがん微小環境の解明
- 研究代表者
  
  三森功士
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分50010:腫瘍生物学関連
- 研究機関
  九州大学
大腸がんの転移・再発における細胞多様性の役割
- 研究代表者
  
  八尾良司
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分50010:腫瘍生物学関連
- 研究機関
  公益財団法人がん研究会
ctDNAメチル化検出を実装する新たなアプローチによる大腸癌再発早期診断法の確立
- 研究代表者
  
  大津甫
- 研究期間 (年度)
  2020
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分55010:外科学一般および小児外科学関連
- 研究機関
  九州大学
化学放射線耐性を生む食道癌ゲノム・免疫応答のクローン進化の解明
- 研究代表者
  
  平田秀成
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分52040:放射線科学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人国立がん研究センター
   九州大学
数理学的解析による膵癌個別化治療の提案
- 研究代表者
  
  山本君代 (中村)
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分55020:消化器外科学関連
- 研究機関
  大阪医科薬科大学
超並列がん進化シミュレーションによる腫瘍内不均一性生成機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  新井田厚司
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  東京大学
大腸初期病変から進行がんへの真の進化様式解明と治療法の確立
- 研究代表者
  
  三森功士
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分55010:外科学一般および小児外科学関連
- 研究機関
  九州大学
腫瘍内不均一性解明のための超並列がん進化シミュレーションデータ解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  新井田厚司
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2018
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  東京大学
食道癌ゲノム・エピゲノムの腫瘍内不均一性解析による化学放射線療法耐性機構の解明
- 研究代表者
  
  平田秀成
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  放射線科学
- 研究機関
  九州大学
スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索
- 研究代表者
  
  宮野悟
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2019
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  東京大学

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すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Implementable assay for monitoring minimum residual disease after radical treatment for colorectal cancer.2024
- 著者名/発表者名
  Nakano T, Takao S, Dairaku K, Uno N, Low SA, Hashimoto M, Tsuda Y, Hisamatsu Y, Toshima T, Yonemura Y, Masuda T, Eto K, Ikegami T, Fukunaga Y, Niida A, Nagayama S, Mimori K.
- 雑誌名
  
  Cancer Sci.
  
  巻: - 号: 6 ページ: 1989-2001
- DOI
  10.1111/cas.16149
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K08894, KAKENHI-PROJECT-22K09006, KAKENHI-PROJECT-21K07179, KAKENHI-PROJECT-23K24164
[雑誌論文] Spatial and single-cell transcriptomics decipher the cellular environment containing HLA-G+ cancer cells and SPP1+ macrophages in colorectal cancer2023
- 著者名/発表者名
  Ozato Y, Mimori K(28番目）,他26名
- 雑誌名
  
  Cell Reports
  
  巻: 42 号: 1 ページ: 111929-111929
- DOI
  10.1016/j.celrep.2022.111929
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K08908, KAKENHI-PROJECT-22K19464, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-19K07659, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839, KAKENHI-PROJECT-23K24164, KAKENHI-PROJECT-22K08894, KAKENHI-PROJECT-22K09006, KAKENHI-PROJECT-23K06662, KAKENHI-PROJECT-23K08128, KAKENHI-PROJECT-21K07179
[雑誌論文] Subclonal accumulation of immune escape mechanisms in microsatellite instability-high colorectal cancers2023
- 著者名/発表者名
  Kobayashi Y, Niida A, Nagayama S, Saeki K, （中略）, Mizuno S, Kawazu M, Kohsaka S, Ueno T, Mano H, Ishihara S, Uemura M, Mori M, Doki Y, Eguchi H, Oshima M, Suzuki Y, Shibata T, Mimori K.
- 雑誌名
  
  Br J Cancer
  
  巻: 129 号: 7 ページ: 1105-1118
- DOI
  10.1038/s41416-023-02395-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K07153, KAKENHI-PROJECT-21K12117, KAKENHI-PROJECT-22K08894, KAKENHI-PROJECT-22K09006, KAKENHI-PROJECT-23K06662, KAKENHI-PROJECT-23K08128, KAKENHI-PROJECT-21K07179, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-21H02772, KAKENHI-PROJECT-21H02795, KAKENHI-PROJECT-23K24164
[雑誌論文] Convergent genomic diversity and novel BCAA metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma2023
- 著者名/発表者名
  Kitagawa A, Osawa T,Noda M,Kobayashi Y, Aki S,Nakano Y,Saito T,Shimizu D,Komatsu H,Sugaya M,Takahashi J,...Mimori K.
- 雑誌名
  
  Br J Cancer
  
  巻: - 号: 12 ページ: 22068-22068
- DOI
  10.1038/s41416-023-02256-4
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K08826, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K07260, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839, KAKENHI-PROJECT-23K18234, KAKENHI-PROJECT-22K07774, KAKENHI-PROJECT-22K09006, KAKENHI-PROJECT-21K08745, KAKENHI-PLANNED-23H04938, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-23K24164
[雑誌論文] Agent-Based Modeling and Analysis of Cancer Evolution2022
- 著者名/発表者名
  Niida Atsushi、M. Iwasaki Watal
- 雑誌名
  
  Simulation Modeling (IntecOpen)
  
  巻: なし
- DOI
  10.5772/intechopen.100140
- ISBN
  9781839696831, 9781839696848
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12214
[雑誌論文] Modeling colorectal cancer evolution2021
- 著者名/発表者名
  Niida Atsushi、Mimori Koshi、Shibata Tatsuhiro、Miyano Satoru
- 雑誌名
  
  Journal of Human Genetics
  
  巻: 66 号: 9 ページ: 869-878
- DOI
  10.1038/s10038-021-00930-0
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12214, KAKENHI-PUBLICLY-20H05039, KAKENHI-PROJECT-19H03715
[雑誌論文] Pan-cancer methylome analysis for cancer diagnosis and classification of cancer cell of origin.2021
- 著者名/発表者名
  Shimizu D, Taniue K, Matsui Y, Haeno H, Araki H, Miura F, Fukunaga M, Shiraishi K, Miyamoto Y, Tsukamoto S, Komine A, Kobayashi Y, Kitagawa A, Yoshikawa Y, Sato K, Saito T, Ito S, Masuda T, Niida A, Suzuki M, Baba H, Ito T, Akimitsu N, Kodera Y, Mimori K.
- 雑誌名
  
  Cancer Gene Ther.
  
  巻: Epub 号: 5 ページ: 1-1
- DOI
  10.1038/s41417-021-00401-w
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K09176, KAKENHI-PROJECT-18K18151, KAKENHI-PROJECT-19K16868, KAKENHI-PUBLICLY-20H05039, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-19H03715, KAKENHI-PROJECT-20K20657, KAKENHI-PROJECT-21K19402, KAKENHI-PROJECT-21K07179, KAKENHI-PROJECT-22K09006, KAKENHI-PROJECT-23K20389, KAKENHI-PROJECT-23K24164, KAKENHI-PROJECT-21H02758
[雑誌論文] Genetic landscape of external auditory canal squamous cell carcinoma2020
- 著者名/発表者名
  Sato Kuniaki、Komune Noritaka、Hongo Takahiro、Koike Kensuke、Niida Atsushi、Uchi Ryutaro、Noda Teppei、Kogo Ryunosuke、Matsumoto Nozomu、Yamamoto Hidetaka、Masuda Muneyuki、Oda Yoshinao、Mimori Koshi、Nakagawa Takashi
- 雑誌名
  
  Cancer Science
  
  巻: 111 号: 8 ページ: 3010-3019
- DOI
  10.1111/cas.14515
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K18300, KAKENHI-PROJECT-18H02951, KAKENHI-PROJECT-19H03715
[雑誌論文] A unified simulation model for understanding the diversity of cancer evolution.2020
- 著者名/発表者名
  Niida A, Hasegawa T, Innan H, Shibata T, Mimori K, Miyano S
- 雑誌名
  
  PeerJ
  
  巻: 8 ページ: e8842-e8842
- DOI
  10.7717/peerj.8842
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12214, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H05097, KAKENHI-PROJECT-15H05707, KAKENHI-PROJECT-19H03715
[雑誌論文] Variant analysis of prostate　cancer in Japanese patients and a new attempt to predict related biological　pathways2020
- 著者名/発表者名
  Kasajima R, Yamaguchi R, Shimizu E, Tamada Y, Niida A, Tremmel G, Kishida T,Aoki I, Imoto S, Miyano S, Uemura H, Miyagi Y
- 雑誌名
  
  Oncol Rep.
  
  巻: 43(3) ページ: 943-952
- DOI
  10.3892/or.2020.7481
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912
[雑誌論文] Sensitivity analysis of agent-based simulation utilizing massively parallel computation and interactive data visualization2019
- 著者名/発表者名
  Niida A, Hasegawa T, Miyano S
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 14(3) 号: 3 ページ: e0210678-e0210678
- DOI
  10.1371/journal.pone.0210678
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-17K12773
[雑誌論文] Novel oncogene 5MP1 reprograms c-Myc translation initiation to drive malignant phenotypes in colorectal cancer.2019
- 著者名/発表者名
  Sato K, Masuda T, Hu Q, Tobo T, Gillaspie S, Niida A, Thornton M, Kuroda Y, Eguchi H, Nakagawa T, Asano K, Mimori K.
- 雑誌名
  
  EBioMedicine.
  
  巻: 44 ページ: 387-402
- DOI
  10.1016/j.ebiom.2019.05.058
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K08649, KAKENHI-PROJECT-19K09176, KAKENHI-PROJECT-19K09220, KAKENHI-PROJECT-15H05791, KAKENHI-PROJECT-19H03715
[雑誌論文] A clinical trial of somatic and germline analyses for healthy longevity in a postoperative cancer patient.2019
- 著者名/発表者名
  Hayashi N, Kuroda Y, Saito T, Tsuruda Y, Niida A, Otsu H, Eguchi H, Masuda T, Suzuki Y, Natsugoe S, Mimori K.
- 雑誌名
  
  Surg Today.
  
  巻: Epub 号: 9 ページ: 738-747
- DOI
  10.1007/s00595-019-01789-7
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K15323, KAKENHI-PROJECT-16K07177, KAKENHI-PROJECT-16K10543, KAKENHI-PROJECT-17K19608, KAKENHI-PROJECT-18K08649, KAKENHI-PROJECT-19K09176, KAKENHI-PROJECT-19K09220, KAKENHI-PROJECT-19H03715
[雑誌論文] A temporal shift of the evolutionary principle shaping intratumor heterogeneity in colorectal cancer2018
- 著者名/発表者名
  Saito T, Niida A, Uchi R, Hirata H, Kodama M, Okimoto T, Murakami K, Suzuki Y, Ogawa S, Miyano S, Mimori K, et al.
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 9 号: 1 ページ: 2884-2884
- DOI
  10.1038/s41467-018-05226-0
- NAID
  120006551763
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K08695, KAKENHI-PROJECT-18K07946, KAKENHI-PROJECT-18K08009, KAKENHI-PROJECT-18K08649, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-16K07177, KAKENHI-PROJECT-16K10543, KAKENHI-PROJECT-17K19608, KAKENHI-PROJECT-15H05707
[雑誌論文] Understanding intratumor heterogeneity by combining genome analysis and mathematical modeling2018
- 著者名/発表者名
  Niida Atsushi、Nagayama Satoshi、Miyano Satoru、Mimori Koshi
- 雑誌名
  
  Cancer science
  
  巻: 109 号: 4 ページ: 884-892
- DOI
  10.1111/cas.13510
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K12773, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-17K19608
[雑誌論文] Combined mutation of Apc, Kras and Tgfbr2 effectively drives metastasis of intestinal cancer2018
- 著者名/発表者名
  Sakai, E., Nakayama, M., Oshima, H., Kouyama, Y., Niida, A., Fujii, S., Ochiai, A., Nakayama, K. I., Mimori, K., Suzuki, Y., Hong, C. P., Ock, C. Y., Kim, S. J. and Oshima, M.
- 雑誌名
  
  Cancer reserach
  
  巻: in press
- NAID
  120006452378
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K12773
[雑誌論文] Cancer evolution and heterogeneity2018
- 著者名/発表者名
  Mimori K, Saito T, Niida A, Miyano S
- 雑誌名
  
  Ann Gastroenterol Surg
  
  巻: 2(5) 号: 5 ページ: 332-338
- DOI
  10.1002/ags3.12182
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-17K19608
[雑誌論文] Interaction-based feature selection for uncovering cancer driver genes through copy number-driven expression level2017
- 著者名/発表者名
  Park H, Niida A, Imoto S, Miyano S
- 雑誌名
  
  J Comput Biol
  
  巻: 24(2) 号: 2 ページ: 138-152
- DOI
  10.1089/cmb.2016.0140
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912
[雑誌論文] Impediment of Replication Forks by Long Non-coding RNA Provokes Chromosomal Rearrangements by Error-Prone Restart2017
- 著者名/発表者名
  Watanabe Takaaki、Marotta Michael、Suzuki Ryusuke、Diede Scott J.、Tapscott Stephen J.、Niida Atsushi、Chen Xiongfong、Mouakkad Lila、Kondratova Anna、Giuliano Armando E.、Orsulic Sandra、Tanaka Hisashi
- 雑誌名
  
  Cell report
  
  巻: 21 号: 8 ページ: 2223-2235
- DOI
  10.1016/j.celrep.2017.10.103
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K12773
[雑誌論文] Addiction to the IGF2-ID1-IGF2 circuit for maintenance of the breast cancer stem-like cells2017
- 著者名/発表者名
  Tominaga K, Shimamura T, Kimura N, Murayama T, Matsubara D, Kanauchi H, Niida A, Shimizu S, Nishioka K, Tsuji EI, Yano M, Sugano S, Shimono Y, Ishii H, Saya H, Mori M, Akashi K, Tada KI, Ogawa T, Tojo A, Miyano S, Gotoh N
- 雑誌名
  
  Oncogene
  
  巻: 36(9) 号: 9 ページ: 1276-1286
- DOI
  10.1038/onc.2016.293
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H05791, KAKENHI-PROJECT-16H06391, KAKENHI-PROJECT-15H04294, KAKENHI-PROJECT-16J40231, KAKENHI-PROJECT-15K14381, KAKENHI-PROJECT-16K08672, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Japanese genome-wide association study identifies a significant colorectal cancer susceptibility locus at chromosome 10p14.2017
- 著者名/発表者名
  Takahashi Y, Sugimachi K, Yamamoto K, Niida A, Shimamura T, Sato T, Watanabe M, Tanaka J, Kudo S, Sugihara K, Hase K, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Moriya Y, Suzuki Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
- 雑誌名
  
  Cancer Sci.
  
  巻: 108(11) 号: 11 ページ: 2239-2247
- DOI
  10.1111/cas.13391
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K19608, KAKENHI-PROJECT-17K12773, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-15K05577, KAKENHI-PROJECT-15K10168, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] phyC: Clustering cancer evolutionary trees.2017
- 著者名/発表者名
  Matsui Y, Niida A, Uchi R, Mimori K, Miyano S, Shimamura T:
- 雑誌名
  
  PLoS Comput Biol.
  
  巻: 13(5) 号: 5 ページ: 1005509-1005509
- DOI
  10.1371/journal.pcbi.1005509
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K19608, KAKENHI-PROJECT-16K16146, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Genomic Landscape of Esophageal Squamous Cell Carcinoma in a Japanese Population.2016
- 著者名/発表者名
  G. Sawada (他43名, 山本21番目)
- 雑誌名
  
  Gastroenterology
  
  巻: 150 号: 5 ページ: 1171-1182
- DOI
  10.1053/j.gastro.2016.01.035
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K05577, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-14J10908, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-26670608, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26861003, KAKENHI-PROJECT-25290043, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-15H05791, KAKENHI-PROJECT-16H04692, KAKENHI-PROJECT-26293303, KAKENHI-PROJECT-26461994, KAKENHI-PROJECT-15K15496
[雑誌論文] Integrated Multiregional Analysis Proposing a New Model of Colorectal Cancer Evolution.2016
- 著者名/発表者名
  R. Uchi (他40名, 山本36番目)
- 雑誌名
  
  PLoS Genetics
  
  巻: 12 号: 2 ページ: 1-24
- DOI
  10.1371/journal.pgen.1005778
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K05577, KAKENHI-PROJECT-15K10150, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H05707, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-25462038, KAKENHI-PROJECT-25462070, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521, KAKENHI-PROJECT-26861003, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-26461994, KAKENHI-PROJECT-15K19899, KAKENHI-PROJECT-15K10170, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] 8q24 Polymorphisms and Diabetes Mellitus Regulate Apolipoprotein A-IV in Colorectal Carcinogenesis2016
- 著者名/発表者名
  Sugimachi K, Yamaguchi R, Eguchi H, Ueda M, Niida A, Sakimura S, Hirata H, Uchi R, Shinden Y, Iguchi T, Morita K, Yamamoto K, Miyano S, Mori M, Maehara Y, Mimori K
- 雑誌名
  
  Ann Surg Oncol
  
  巻: 23(Suppl 4) 号: S4 ページ: 546-551
- DOI
  10.1245/s10434-016-5374-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-15K10168, KAKENHI-PROJECT-16K07177, KAKENHI-PROJECT-16K19197
[雑誌論文] Integrated Molecular Profiling of Human Gastric Cancer Identifies DDR2 as a Potential Regulator of Peritoneal Dissemination.2016
- 著者名/発表者名
  Kurashige J, Hasegawa T, Niida A, Sugimachi K, Deng N, Mima K, Uchi R, Sawada G, Takahashi Y, Eguchi H, Inomata M, Kitano S, Fukagawa T, Sasako M, Sasaki H, Sasaki S, Mori M, Yanagihara K, Baba H, Miyano S, Tan P, Mimori K.
- 雑誌名
  
  Sci Rep.
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 22371-22371
- DOI
  10.1038/srep22371
- NAID
  120006352400
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K19337, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-26670608, KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15K19899, KAKENHI-PROJECT-15K10168, KAKENHI-PROJECT-16K07177
[雑誌論文] Somatic mutations in plasma cell-free DNA are diagnostic markers for esophageal squamous cell carcinoma recurrence2016
- 著者名/発表者名
  Ueda M, Iguchi T, Masuda T, Nakahara Y, Hirata H, Uchi R, Niida A, Momose K, Sakimura S, Chiba K, Eguchi H, Ito S, Sugimachi K, Yamasaki M, Suzuki Y, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K
- 雑誌名
  
  Oncotarget
  
  巻: 7(38) 号: 38 ページ: 62280-62291
- DOI
  10.18632/oncotarget.11409
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-15K10168, KAKENHI-PROJECT-16K07177, KAKENHI-PROJECT-16K10543, KAKENHI-PROJECT-16K19197
[雑誌論文] A likelihood-free filtering method via approximate Bayesian computation in evaluating biological simulation models2015
- 著者名/発表者名
  Hasegawa T, Niida A, Mori T, Shimamura T, Yamaguchi R, Miyano S, Akutsu T, Imoto S
- 雑誌名
  
  Computational Statistics & Data Analysis
  
  巻: 94 ページ: 63-74
- DOI
  10.1016/j.csda.2015.08.003
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H06008, KAKENHI-PROJECT-25730173
[雑誌論文] Binary Contingency Table Method for Analyzing Gene Mutation in Cancer Genome2015
- 著者名/発表者名
  Ayada E, Niida A, Hasegawa T, Miyano S, Imoto S
- 雑誌名
  
  Lecture Notes in Computer Science
  
  巻: 9096 ページ: 12-23
- DOI
  10.1007/978-3-319-19048-8_2
- ISBN
  9783319190471, 9783319190488
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912
[雑誌論文] An Integrative Analysis to Identify Driver Genes in Esophageal Squamous Cell Carcinoma2015
- 著者名/発表者名
  Sawada G, Niida A, Hirata H, Komatsu H, Uchi R, Shimamura T, Takahashi Y, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Takano Y, Ueda M, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Yamasaki M, Tanaka F, Tachimori Y, Kajiyama Y, Natsugoe S, Fujita H, Tanaka Y, Calin G, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 10(10) 号: 10 ページ: e0139808-e0139808
- DOI
  10.1371/journal.pone.0139808
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-26670608, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26861003
[学会発表] MSI-H大腸がんの免疫回避にむけたゲノム進化機構.2023
- 著者名/発表者名
  三森功士, 小林雄太, 新井田厚司,高橋数冴, 長山聡, 増田隆明.
- 学会等名
  第82回日本癌学会学術総会
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K24164
[学会発表] 化学放射線治療耐性を生む食道癌ゲノムのクローン進化2021
- 著者名/発表者名
  平田秀成、新井田厚司、塩山義之、三森功士
- 学会等名
  第１回日本癌学会若手の会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08123
[学会発表] The evolving genomic landscape of esophageal squamous cell carcinoma resistant to chemoradiotherapy2021
- 著者名/発表者名
  Hirata H, Niida A, Sugimachi K, Masuda T, Kageyama SI, Motomura Y, Akimoto T, Mimori K.
- 学会等名
  第80回日本癌学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08123
[学会発表] ゲノム解析による化学放射線治療時の食道扁平上皮癌の進展機構の解明2021
- 著者名/発表者名
  新井田厚司、平田秀成、三森功士
- 学会等名
  第80回日本癌学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03715
[学会発表] Clonal evolution in relapsed esophageal cancer following chemoradiotherapy2019
- 著者名/発表者名
  平田秀成, 新井田厚司, 塩山善之, 三森功士
- 学会等名
  第78回日本癌学会学術総会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08123
[学会発表] Mutational dynamics and clonal evolution in esophageal cancer following chemoradiotherapy2019
- 著者名/発表者名
  Hirata H, Niida A, Shioyama Y, Mimori K.
- 学会等名
  日本放射線影響学会第62回大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08123
[学会発表] 超並列シミュレーションと対話的可視化を組み合わせたパラメータ感受性解析手法の開発2019
- 著者名/発表者名
  新井田厚司
- 学会等名
  2019年度　統計関連学会連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12214
[学会発表] 化学放射線治療後の再発食道癌におけるクローン進化2019
- 著者名/発表者名
  平田秀成、新井田厚司、塩山善之、三森功士
- 学会等名
  第77回日本癌学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03715
[学会発表] がんの多様な進化様式を統一的に記述するシミュレーションモデル2019
- 著者名/発表者名
  新井田厚司
- 学会等名
  第8回生命医薬情報学連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12214
[学会発表] 化学放射線治療耐性を生む食道扁平上皮癌ゲノムのクローン進化の解析2019
- 著者名/発表者名
  平田秀成、新井田厚司、増田隆明、塩山善之、森田勝、本田浩、藤也寸志、三森功士
- 学会等名
  第73回日本食道学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03715
[学会発表] 化学放射線治療耐性を生む食道扁平上皮癌ゲノムのクローン進化の解析2019
- 著者名/発表者名
  平田秀成, 新井田厚司, 増田隆明, 塩山善之, 森田勝, 本田浩, 藤也寸志, 三森功士
- 学会等名
  第73回日本食道学会学術集会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08123
[学会発表] 食道癌に対する化学放射線療法症例における再発クローンの検討2018
- 著者名/発表者名
  平田秀成、新井田厚司、大賀才路、吉武忠正、浅井佳央里、松本圭司、中島孝彰、鶴丸大介、野元諭、三森功士、本田浩
- 学会等名
  第56回日本放射線腫瘍学会生物部会学術大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K10397
[学会発表] Somatic Copy Number Alterations Associate with Chemoradiotherapy Response in Esophageal Squamous Cell Carcinoma2018
- 著者名/発表者名
  Hirata H, Ohga S, Niida A, Saito T, Tsurumaru D, Mimori K, Honda H.
- 学会等名
  第77回日本癌学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K10397
[学会発表] 全エクソームシーケンスが明らかにした食道癌の化学放射線耐性にかかわる体細胞変異2018
- 著者名/発表者名
  平田秀成、大賀才路、新井田厚司、吉武忠正、浅井佳央里、松本圭司、中島孝彰、鶴丸大介、西牟田雄祐、村木俊夫、佐々木智成、野元諭、三森功士、本田浩
- 学会等名
  日本放射線腫瘍学会第31回学術大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K10397
[学会発表] Mutational Dynamics of Primary and Recurrent Esophageal Squamous Cell Carcinoma Treated with Chemoradiotherapy2018
- 著者名/発表者名
  Hirata H, Ohga S, Niida A, Yoshitake T,Asai K, Nakashima T,Tsurumaru D, Nishimuta Y, Muraki T, Sasaki T, Nomoto S, Mimori K, Honda H
- 学会等名
  60th American Society for Radiation Oncology Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K10397
[学会発表] Multiregional sequencing unveiled temporal dynamics of intratumor heterogeneity during colorectal cancer evolution2017
- 著者名/発表者名
  Atsuahi Niida
- 学会等名
  International Conference on Translational Cancer Medicine held in cooperation with the Latin American Cooperative Oncology Group (LACOG)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K12773
[学会発表] がんの進化シミュレーション2017
- 著者名/発表者名
  新井田厚司
- 学会等名
  第6回生命医薬情報学連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K12773
[学会発表] 大腸がんの進化と腫瘍内不均一性2017
- 著者名/発表者名
  新井田厚司
- 学会等名
  2017年度生命科学系学会合同年次大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K12773
[学会発表] Genome-wide Copy Number Analysis of Chemoradiotherapy Response in Esophageal Squamous Cell Carcinoma.2016
- 著者名/発表者名
  Hirata H, Niida A, Ito S, Uchi R, Saito T, Terashima K, Ohga S, Sakamoto K, Hirakawa M, Honda H, Mimori K.
- 学会等名
  The 1st Meeting of the Federaion of Asian Organization for Radiation Oncology
- 発表場所
  Kyoto
- 年月日
  2016-11-25
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K10397
[学会発表] Genomic correlates of response to chemoradio-therapy in esophageal squamous cell carcinoma.2016
- 著者名/発表者名
  Hirata H, Ito S, Niida A, Uchi R, Saito T, Masuda T, Hayashi N, Kuroda Y, Eguchi H, Hirakawa M, Honda H, Mimori K
- 学会等名
  第75回日本癌学会学術総会
- 発表場所
  横浜市
- 年月日
  2016-10-06
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K10397

1. 三森功士 (50322748)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 18件
2. 長山聡 (70362499)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 1件
3. 平田秀成 (90721267)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 11件
4. 鈴木穣 (40323646)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
5. 宮野悟 (50128104)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 8件
6. 山本君代 (70611078)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 八尾良司 (80291095)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 島村徹平 (00623943)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
9. 白石友一 (70516880)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. PARK HEEWON (70756642)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
11. 山口類 (90380675)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
12. 片山琴絵 (40581195)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 張耀中 (60817138)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 井元清哉 (10345027)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
15. 玉田嘉紀 (80435495)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
16. 平川雅和 (20380454)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
17. 吉武忠正 (40452750)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 松本圭司 (40467907)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 浅井佳央里 (40635471)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 鶴丸大介 (90419565)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 西牟田雄祐 (10635220)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 塩山善之 (10323304)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
23. 内山和久 (80232867)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. 岩嵜航 (30838959)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
25. 工藤進英 (70161643)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. 大津甫 (50827227)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
27. 宇野直輝 (60624781)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
28. 丸山玲緒 (60607985)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
29. 小嶋泰弘 (00881731)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
30. 大村洋文 (60767375)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
31. LOW SIEWKEE (40634720)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
32. 水野晋一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
33. 戸島剛男

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
34. 増田隆明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
35. 村上和成

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
36. 兒玉雅明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
37. 山本健

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
38. 高橋純一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
39. 吉住朋晴

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
40. 佐藤晋彰

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
41. 黒田陽介

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
42. 鶴田祐介

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

新井田 厚司 Niida Atsushi

研究課題

研究成果

共同研究者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

超並列がん進化シミュレーションによる腫瘍内不均一性生成機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

腫瘍内不均一性解明のための超並列がん進化シミュレーションデータ解析手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Implementable assay for monitoring minimum residual disease after radical treatment for colorectal cancer.2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Spatial and single-cell transcriptomics decipher the cellular environment containing HLA-G+ cancer cells and SPP1+ macrophages in colorectal cancer2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Subclonal accumulation of immune escape mechanisms in microsatellite instability-high colorectal cancers2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Convergent genomic diversity and novel BCAA metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

新井田厚司 Niida Atsushi

[雑誌論文] Variant analysis of prostate　cancer in Japanese patients and a new attempt to predict related biological　pathways2020