小林祐次 Kobayashi Yuji

… 別表記

小林裕次コバヤシユウジ

小林ゆう次コバヤシユウジ

研究者番号	20127228
その他のID
外部サイト
所属 (現在)	2024年度: 大阪大学, 大学院工学研究科, 招へい教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2018年度 – 2019年度: 大阪大学, 工学研究科, 招へい教授 2017年度: 大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), その他 2014年度: 大阪大学, 工学研究科(研究院), 特任教授 2011年度: 大阪薬科大学, 薬学部, 客員教授 2010年度 – 2011年度: 大阪薬科大学, 薬学部, 教授 … もっと見る 2009年度: 大阪薬科大学, 薬学部, 客員教授 2008年度: 大阪薬科大学, 薬学部, 教授 2007年度: 大阪薬科大学, 薬学研究科, 客員教授 2005年度 – 2006年度: 大阪薬科大学, 薬学部, 客員教授 2002年度 – 2004年度: 大阪大学, 薬学研究科, 教授 2002年度: 名古屋大学, 大学院・薬学研究科, 教授 2001年度: 大阪大学, 大学院・薬学研究科, 教授 1998年度 – 2000年度: 大阪大学, 薬学研究科, 教授 1996年度 – 1999年度: 大阪大学, 薬学部, 教授 1990年度 – 1995年度: 大阪大学, 蛋白質研究所, 助教授 1994年度: 大坂大学, 蛋白質研究所, 助教授 1994年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 助教授 1990年度 – 1991年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 助教授 1986年度: 阪大, 蛋白質研究所, 助手隠す
審査区分/研究分野	研究代表者生体物性学 / 物理系薬学 / 医薬分子機能学 / 物理系薬学 / 生物系 / 生物物理学 / 構造生物化学研究代表者以外眼科学 / 生物分子化学 / 物理化学 … もっと見る / 医薬分子機能学 / 化学系薬学 / 構造生物化学 / 環境関連化学 / 生物物理学隠す
キーワード	研究代表者 NMR / BMP / 分子間相互作用 / RRF / レセプター / 複合体 / 立体構造 / 水和 / リボソーム / receptor … もっと見る / 熱安定性 / トリプルヘリックス構造 / 多量体形成 / アディポネクチン / 翻訳終結 / 蛋白質生合成 / 複合体形成 / 分子動力学計算 / 多核多次元NMR / ヒドロキシプロリン / hydration / partial molar volume / entropy / enthalpy / 4-fluoroproline / 4-hydroxyproline / triple helical structure / collagen model peptides / トリプルヘリックス / コラーゲンモデルペブチド / フルオロプロリン / 部分モル体積 / エントロピー / エンタルピー / 4-フルオロプロリン / 4-ヒドロキシプロリン / コラーゲンモデルペプチド / Drug design / Antibiotics / Interaction / Ribosome / ドラッグデザイン / 抗菌剤 / 相互作用 / structure / 立体構造解析 / intrinsic compriessibility / intrinsic volume / volumetric study / thermodynamics / Protein-Ligand intenaction / 偏比容 / 示差熱測定 / 蛋白質-蛋白質の相互作用 / 密度測定 / 熱分析 / 蛋白質-リガンド相互作用 / tertiary structure / complex / IGF / 蛋白質複合体 / 構造活性相関 / BMPレセプター / 心房性ナトリウム利尿ポリペプチド(hANP) / アンジオテンシン変換阻害剤アンコベニン / ディスタンスジオメトリー法 / 高次構造 / 核オーバーハウザー効果(NOE) / 核磁気共鳴(NMR) / リガンド / 糖尿病血管合併症 / 合理的創薬 / 超遠心分析 / 超遠心分析用蛍光測定装置 / 糖尿病合併症 / 終末糖化産物 / 等温滴定型熱量計 / PPARγ / AGE-RAGE相互作用 / AGE受容体 / 合理的薬物設計 / バーチャルスクリーニング / SBDD / RAGE / AGE / 最終糖化産物 / 糖尿病 / 創薬 / 非共有結合 / S-S結合 / 三本鎖構造 / 超分子 / 解離会合平衡 / コラーゲン様ドメイン / IGF-I / ネオカルチノスタチン / 大量発現系 / S26 / S-モジュリン / ミリストイル基 / Ca^<2+>濃度センサー / Ca^<2+>イオン / 視細胞内 / S-モジュリンファミリー / CCDビデオカメラ / Rayleigh干渉法 / 可視紫外吸光法 / モデルE / 解離会合 / 超遠心法 / 結合蛋白質BP-3 / ^<15>N核 / インスリン様成長因子 / 解離会合系 / 異様多次元法 / 1H二次元NMR法 / 15N標識 / 多次元NMR法 / 複合法 / 結合蛋白質 / インスリン様成長因子(IGF-1) / 構造の安定化 / モデルペプチド / コラーゲン / ディスタンスジオメトリ- / 二次元NMR / サラホトキシン / エンドセリン / CSHモチ-フ / 三次元構造 / 超遠心分析装置のオンライン化 / ディスタンスジオメトリ-法 / ソマトメジンC / インシュリン様成長因子 … もっと見る研究代表者以外炭酸脱水酵素 / NMR / ヒスチジン / (Pro-Pro-Gly)_<10> / Anti-HIV Activity / Enzyme Inhibitor / Peptide Synthesis / Substrate Transition State / AIDS Therapeutics / Molecular Recognition / 抗HIV活性 / 酵素阻害剤 / ペプチド合成 / HIVプロテアーゼ阻害剤 / 基質遷移状態 / エイズ治療薬 / 分子認識 / HIVプロテアーゼ / 質量分析 / ^<13>C-edited NOESY / Histidine / Nuclear magnetic resonance / Acetazolamide / 核磁気共鳴 / アセタゾラミド / タンパク質 / 環境化学分析 / 古代技術 / エジプト / 古代文明 / 環境分析化学 / 動物骨 / タンパク質考古学 / 文化財科学 / 翻訳後修飾 / 有機化学 / 構造生物科学 / 考古学 / 分子古生物学 / 西アジア / 動物考古学 / 質量分析学 / タンパク質科学 / タンパク質の分解 / 旧石器時代 / 新石器時代 / アミノ酸配列解析 / コラーゲン / denature conformation / low temperature state / alcohol / conformational change / tansition temperature / proline / 部分モル体積 / イソプロパノール / 溶液内相転移 / 3本鎖 / トリプルヘリックス / 溶液内構造 / (Pro-Pro-Gly)10 / UPとDOWN / プロリンリングの挙動 / 低温転移 / UpとDown / プロリン還の挙動 / 転移温度 / アルコールの効果 / 最小転移温度 / コラーゲンモデル物質 / Double Drug / HIV protease inhibitor / 酵素・阻害剤複合体 / 薬剤耐性 / ドラッグデザイン / 抗ウイルス薬 / ペプチドミメティック / HIV Protease Inhibitor / HIV Protease / Domain / Three-dimensional structure / Tissue factor / Blood coagulation / ドメイン / 立体構造 / 組織因子 / 血液凝固 / Sulfonamide / Carbonic anhydrase II / グリシン / 変異源処理 / His-64 / 安定同位元素標識 / HSQC法 / ^<13>Cや^<15>Nで標識 / His64 / 二重標識法 / 多次元NMR法 / スルフォンアミド / 炭酸脱水酵素II / Molecular mechanic calculation / Ocular hypotensive agent / Carbonic anhydrase / 炭酸脱水酵素阻害剤 / 眼圧降下剤 / 分子力学計算 / 眼圧降下薬 / ＣＣＳ / CCS / ナクレイン / 固体炭酸 / 二酸化炭素 / 地球温暖化 / バイオミメティクス / 構造機能相関 / 触媒機構 / MM / QM / プロトン移動 / 反応機構 / 触媒 / 互変異性 / 機能 / 酵素隠す

古代文化と文明の指標となる考古学資料に残存するタンパク質の海外調査研究
- 研究代表者
  
  中沢隆
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生物分子化学
- 研究機関
  奈良女子大学
炭酸脱水酵素を利用した選択的二酸化炭素捕捉水和触媒の開発と固体炭酸への転換
- 研究代表者
  
  島原秀登
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  環境関連化学
- 研究機関
  北陸先端科学技術大学院大学
終末糖化産物の受容体(RAGE)を標的とする糖尿病合併症の予防・治療薬の探索研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  物理系薬学
- 研究機関
  大阪薬科大学
NMR・MM法による炭酸脱水酵素機能に重要なHis残基の挙動解析と触媒機構解明
- 研究代表者
  
  島原秀登
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  北陸先端科学技術大学院大学
アディポネクチンの超分子構造・相互作用研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2007
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  大阪薬科大学
アディポネクチンの超分子構造・相互作用解析研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2005
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  大阪薬科大学
   大阪大学
コラーゲンの構造安定化機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2005
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  物理系薬学
- 研究機関
  大阪薬科大学
   大阪大学
リボソーム再生系を標的としたNMRによる相互作用解析法と新規抗菌剤の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  2002 – 2003
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  医薬分子機能学
- 研究機関
  大阪大学
溶液中のトリプルヘリックスのコイルへの相転移温度の溶液内決定機構の実験的解明
- 研究代表者
  
  冨山徹夫
- 研究期間 (年度)
  2001 – 2002
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  物理化学
- 研究機関
  名古屋大学
情報伝達機構の解明を目指した骨形成因子(BMP)とそのレセプターの構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1999 – 2000
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  物理系薬学
- 研究機関
  大阪大学
蛋白質生合成の最終過程を司るリボソーム再生因子(RRF)の立体構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1998
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 研究機関
  大阪大学
抗エイズ薬の変異ウイルスに対する耐性克服戦略に関する共同研究
- 研究代表者
  
  木曽良明
- 研究期間 (年度)
  1998 – 1999
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  医薬分子機能学
- 研究機関
  京都薬科大学
蛋白質-リガンド複合体の熱力学的研究研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1998 – 1999
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  物理系薬学
- 研究機関
  大阪大学
蛋白質生合成の最終過程を司るリボソーム再生因子(RRF)の立体構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1997
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  大阪大学
多核多次元NMR法で見る生体超分子形成の機構-サイトカインレセプター複合体の動的構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1997 – 1998
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  医薬分子機能学
- 研究機関
  大阪大学
抗腫瘍性抗生物質ネオカルチノスタチンの蛋白質とクロモフォアの相互作用研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1996
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  大阪大学
HIVプロテアーゼの分子認識を基盤としたエイズ治療薬開発に関する共同研究
- 研究代表者
  
  木曽良明
- 研究期間 (年度)
  1996 – 1997
- 研究種目
  
  国際学術研究
- 研究分野
  
  化学系薬学
- 研究機関
  京都薬科大学
インスリン様成長因子とその結合蛋白質との複合体の構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1995
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  大阪大学
分析用超遠心機の光学系の改良と自動測定化研究代表者
- 研究代表者
  
  小林ゆう次
- 研究期間 (年度)
  1995
- 研究種目
  
  試験研究(B)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  大阪大学
カルシウムセンサー(S-モヂュリンとS26)の構造とN-末端ミリスチン酸基の役割研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1995
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  大阪大学
インスリン様成長因子とその結合蛋白質との複合体の構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1994
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  大阪大学
ヒドロキシプロリンによるコラーゲン構造の安定化研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1993
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  大阪大学
ヒト組織因子の立体構造の解析
- 研究代表者
  
  宮田敏行
- 研究期間 (年度)
  1993 – 1994
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  国立循環器病センター
スルフォンアミド系眼圧降下薬と炭酸脱水酵素との複合体の構造
- 研究代表者
  
  岸田健一
- 研究期間 (年度)
  1992 – 1994
- 研究種目
  
  一般研究(B)
- 研究分野
  
  眼科学
- 研究機関
  大阪府立看護大学
   大阪大学
生理活性ペプチドに見いだされた新しいヘリックス形成のモチ-フに関する構造的研究研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1991
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  生体物性学
- 研究機関
  大阪大学
蛋白質の溶液構造決定法の開発とペプチド性成長因子(IGFー1)への応用研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1990
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  生体物性学
- 研究機関
  大阪大学
眼圧降下剤アセタゾラミドの炭酸脱水酵素阻害作用の分子薬理学研研究
- 研究代表者
  
  岸田健一
- 研究期間 (年度)
  1990 – 1991
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  眼科学
- 研究機関
  大阪大学
ディスタンスジオメトリー法による溶液中の生理活性ペプチドの高次構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  小林祐次
- 研究期間 (年度)
  1986
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  生体物性学
- 研究機関
  大阪大学

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すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Spatiotemporal regulation of PEDF signaling by type I collagen remodeling2020
- 著者名/発表者名
  Kawahara Kazuki, Yoshida Takuya, Maruno Takahiro, Oki Hiroya, Ohkubo Tadayasu, Koide Takaki, Kobayashi Yuji
- 雑誌名
  
  Proceedings of the National Academy of Sciences
  
  巻: 117 号: 21 ページ: 11450-11458
- DOI
  10.1073/pnas.2004034117
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H05656
[雑誌論文] N-terminal HCV core protein fragment decreases 20S proteasome activity in the presence of PA28γ2019
- 著者名/発表者名
  Zheng Yang、Shimamoto Shigeru、Maruno Takahiro、Kobayashi Yuji、Matsuura Yoshiharu、Kawahara Kazuki、Yoshida Takuya、Ohkubo Tadayasu
- 雑誌名
  
  Biochemical and Biophysical Research Communications
  
  巻: 509 号: 2 ページ: 590-595
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2018.12.167
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K07110, KAKENHI-PROJECT-16H05656, KAKENHI-INTERNATIONAL-16K21723, KAKENHI-ORGANIZER-16H06429
[雑誌論文] Stabilization of mesophilic Allochromatium vinosum cytochrome c′ through specific mutations modeled by a thermophilic homologue.2018
- 著者名/発表者名
  Yamane-Koshizawa, D., Fujii, S., Maruno, T., Kobayashi, Y., Yamanaka, M., Wakai, S., Sambongi, Y
- 雑誌名
  
  Biosci. Biotech. Biochem.
  
  巻: 82 号: 2 ページ: 304-311
- DOI
  10.1080/09168451.2017.1419856
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07692, KAKENHI-PROJECT-16H05656
[雑誌論文] Interplay of a secreted protein with type IVb pilus for efficient enterotoxigenicEscherichia colicolonization2018
- 著者名/発表者名
  Oki H, Kawahara K, Maruno T, Imai T, Muroga Y, Fukakusa S, Iwashita T, Kobayashi Y, Matsuda S, Kodama T, Iida T, Yoshida T, Ohkubo T, Nakamura S
- 雑誌名
  
  Proceedings of the National Academy of Sciences
  
  巻: 115 号: 28 ページ: 7422-7427
- DOI
  10.1073/pnas.1805671115
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K08828, KAKENHI-PROJECT-17K08829, KAKENHI-PROJECT-18K07110, KAKENHI-PROJECT-16H05656, KAKENHI-PROJECT-17J06388
[雑誌論文] An Approach to Water Molecule Dynamics Associated with Motion of Catalytic Moiety2013
- 著者名/発表者名
  Hideto Shimahara*, Kimikazu Sugimori, Muhmad Koyimatu, Hidemi Nagao, Tadayasu Ohkubo, and Yuji Kobayashi
- 雑誌名
  
  AIP Conf. Proc.
  
  巻: 1518 ページ: 610-613
- DOI
  10.1063/1.4794643
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24550173
[雑誌論文] Conformational preferences of 4-chloroproline residues2012
- 著者名/発表者名
  Park HS, Byun BJ, Motooka D, Kawahara K, Doi M, Nakazawa T, Kobayashi Y, Kang YK
- 雑誌名
  
  Biopolymers
  
  巻: 97 号: 8 ページ: 629-641
- DOI
  10.1002/bip.22054
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013, KAKENHI-PROJECT-22650218, KAKENHI-PROJECT-22820042, KAKENHI-PROJECT-24510296
[雑誌論文] Polymorphism of Collagen Triple Helix Revealed by (19)F NMR of Mode 1 Peptide [Pro-4(R)-Hydroxyprolyl-Gly](3)-[Pro-4(R)-Fluoroprolyl-Gly]-[Pro-4(R)-Hydroxyprolyl-Gly](3)2012
- 著者名/発表者名
  Kawahara K, Nemoto N, Motooka D, Nishi Y, Doi M, Uchiyama S, Nakazawa T, Nishiuchi Y, Yoshida T, Ohkubo T, Kobayashi Y
- 雑誌名
  
  J Phys Chem B.
  
  巻: 116 号: 23 ページ: 6908-6915
- DOI
  10.1021/jp212631q
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013, KAKENHI-PROJECT-21510225, KAKENHI-PROJECT-22650218, KAKENHI-PROJECT-22820042, KAKENHI-PROJECT-24510296
[雑誌論文] Increasing the hydrolysis constant of the reactive site upon introduction of an engineered Cys14-Cys39 bond into the ovomucoid third domain from silver pheasant2011
- 著者名/発表者名
  Hemmi H, Kumazaki T, Kojima S, Yoshida T., Ohkubo, T, Yokosawa H, Miura K, and Kobayashi Y
- 雑誌名
  
  J. Peptide Science
  
  巻: 8 号: 8 ページ: 595-600
- DOI
  10.1002/psc.1381
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Assembly states of the nucleosome assembly protein 1 (NAP-1) revealed by sedimentation velocity and non-denaturing MS2011
- 著者名/発表者名
  Noda M, Uchiyama S, McKay AR, Morimoto A, Misawa S, Yoshida A, Shimahara H, Takinowaki H, Nakamura S, Kobayashi Y, Matsunaga S, Ohkubo T, Robinson CV, Fukui K
- 雑誌名
  
  Biochem J.
  
  巻: 436 号: 1 ページ: 101-112
- DOI
  10.1042/bj20102063
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013, KAKENHI-PROJECT-23370029
[雑誌論文] Assembly states of the nucleosome assembly protein 1(NAP-1) revealed by sedimentation velocity and non-denaturing MS2011
- 著者名/発表者名
  Noda M, Uchiyama S, McKay AR, Morimoto A, Misawa S, Yoshida A, Shimahara H, Takinowaki H, Nakamura S, Kobayashi Y, Matsunaga S, Ohkubo, T, Robinson CV, Fukui K
- 雑誌名
  
  Biochem. J
  
  巻: 436 ページ: 101-112
- URL
  http://www.biochemj.org/bj/436/0101/bj4360101.htm
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] The triple helical structure and stability of collagen model peptide with 4(S)-hydroxyprolyl-pro-gly units2011
- 著者名/発表者名
  Motooka D, Kawahara K, Nakamura S, Doi M, Nishi Y, Nishiuchi Y, Kee Kang Y, Nakazawa T, Uchiyama S, Yoshida T, Ohkubo T, Kobayashi Y
- 雑誌名
  
  Biopolymers
  
  巻: 98 号: 2 ページ: 111-121
- DOI
  10.1002/bip.21730
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013, KAKENHI-PROJECT-21510225, KAKENHI-PROJECT-22650218, KAKENHI-PROJECT-22820042, KAKENHI-PROJECT-24510296
[雑誌論文] Thermal effects of added propanol on the helix-coil transition of(Pro-Pro-Gly)10 in D2O solution : An NMR study2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi, et al.
- 雑誌名
  
  Chemical Physics Letters
  
  巻: 491 ページ: 208-221
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Structure and Reaction Mechanism of Human Nicotinamide Phosphoribosyltransferase2010
- 著者名/発表者名
  Takahashi R, Nakamura S, Nakazawa T, Minoura K, Yoshida T, Nishi Y, Kobayashi Y, Ohkubo T
- 雑誌名
  
  J. Biochem
  
  巻: 147 ページ: 95-107
- NAID
  10027873352
- URL
  http://jb.oxfordjournals.org/content/147/1/95.long
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Structure-activity relationship of marinostatin, a serine protease inhibitor isolated from a marine organism2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi, et al.
- 雑誌名
  
  J Pept Sci.
  
  巻: 16 ページ: 329-336
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Characterization of HIV-1 resistance to a fusion inhibitor, N36, derived from the gp41 amino-terminal heptad repeat.2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi, et al.
- 雑誌名
  
  Antiviral Res.
  
  巻: 87 ページ: 179-186
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Structural and dynamic features of the MutT protein in the recognition of nucleotides with the mutagenic 8-oxoguanine base.2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi, et al.
- 雑誌名
  
  J Biol Chem.
  
  巻: 285 ページ: 444-452
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Structure and reaction mechanism of human nicotinamide phosphoribosyl-transferase.2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi, et al.
- 雑誌名
  
  J Biochem.
  
  巻: 147 ページ: 95-107
- NAID
  10027873352
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Structural and dynamic features of the MutT protein in the recognition of nucleotides with the mutagenic 8-oxoguanine base2010
- 著者名/発表者名
  T. Nakamura, S. Meshitsuka, S. Kitagawa, N. Abe, J. Yamada, T. Ishino, H. Nakano, T. Tsuzuki, T. Doi, S. Fujii, Y. Kobayashi, M. Sekiguchi, Y. Yamagata J
- 雑誌名
  
  Biol. Chem
  
  巻: 285 ページ: 444-452
- URL
  http://www.jbc.org/content/285/1/444.long
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Cloming, expression, crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of a human condensin SMC2 hinge domain with short coiled coils.2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi, et al.
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun.
  
  巻: 66 ページ: 1067-1070
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Effect of antibody affinity and antigen valence on molecular forms of immune complexes2009
- 著者名/発表者名
  Oda M, Uchiyama S, Noda M, Nishi Y, Koga M, Mayanagi K, Robinson C. V., Fukui K, Kobayashi Y, Morikawa K, Azuma T
- 雑誌名
  
  Mol. Immunol
  
  巻: 47 ページ: 357-364
- URL
  http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0161589009007111
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] The Solution Structure of Variable-type Domain of Receptor for Advanced Glycation Endproducts : Identification of the AGE-binding Site2008
- 著者名/発表者名
  S. Matsumoto, T. Yoshida, H. Murata, S. Nakamura, Y. Yamamoto, T. Watanabe, H. Yonekura, H. Yamamoto, T. Ohkubo and Y. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Biochemistry
  
  巻: 47 号: 47 ページ: 12299-12311
- DOI
  10.1021/bi800910v
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Crystal Structure of Human Ribosomal Protein L10 Core Domain Reveals Eukaryote-Specific Motifs in Addition to the Conserved Fold2008
- 著者名/発表者名
  Nishimura M, Kaminishi T, Takemoto C, Kawazoe M, Yoshida T, Tanaka A, Sugano S, Shirouzu M, Ohkubo T, Yokoyama S, Kobayashi Y
- 雑誌名
  
  J Mol Biol
  
  巻: 377 ページ: 421-430
- URL
  http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S002228360800020X
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[雑誌論文] Tautomerism of histidine 64 associated with proton transfer in catalysis of Carbonic Anhydrase2008
- 著者名/発表者名
  島原秀登, 吉田卓也, 水上卓, 中沢隆, 長尾秀実, 大久保忠恭, 小林祐次, (他2名, 1番目)
- 雑誌名
  
  FASEB Journal 22巻
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770128
[雑誌論文] Tautomerism of histidine 64 associated with proton-transfer in catalysis of carbonic anhydrase2007
- 著者名/発表者名
  島原秀登, 吉田卓也, 中沢隆, 大久保忠恭, 小林祐次, (他10名,1番目)
- 雑誌名
  
  J Biol Chem 282巻
  
  ページ: 9646-56
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770128
[雑誌論文] Stabilization of Triple Helical Structure of Collagen Molecule2004
- 著者名/発表者名
  Kobayashi, Y. et al.
- 雑誌名
  
  Peptide Science 2003
  
  ページ: 25-28
- NAID
  10012653774
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16390016
[雑誌論文] Stabilization of Triple Helical Structure of Collagen Molecule2004
- 著者名/発表者名
  Kobayashi, Y. et al.
- 雑誌名
  
  Peptide Science 2003
  
  ページ: 25-28
- NAID
  10012653774
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16046213
[雑誌論文] Polymorphism of Collagen Triple Helix Revealed by(19) F NMR of Model Peptide [Pro-4(R)-Hydroxyprolyl-Gly](3)-[Pro-4(R)-Fluoroprolyl-Gly]-[Pro-4(R)-Hydroxyprolyl-Gly](3)
- 著者名/発表者名
  Kawahara K, Nemoto N, Motooka D, Nishi Y, Doi M, Uchiyama S, Nakazawa T, Nishiuchi Y, Yoshida T, Ohkubo T, Kobayashi Y
- 雑誌名
  
  J Phys Chem B
  
  巻: (in press)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 溶液NMR法を用いた炭酸脱水酵素の亜鉛結合水のpKaの決定―H/D交換によるHis-溶媒接触の可能性―2012
- 著者名/発表者名
  島原秀登，杉森公一，Koyimatu Muhamad，吉田卓也，長尾秀実，中澤隆，大久保忠恭，小林祐次
- 学会等名
  第12回蛋白質科学会年会
- 発表場所
  名古屋
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24550173
[学会発表] Hydrogen-bonding Network and His64 in Carbonic Anhydrase，炭酸脱水酵素の水素結合ネットワークとHis62012
- 著者名/発表者名
  Muhamad Koyimatu，島原秀登，杉森公一，岩山将士，杉森哲也，川口一朋，齊藤大明，吉田卓也，中沢隆，大久保忠恭，小林祐次，長尾秀実
- 学会等名
  第6回分子科学討論会
- 発表場所
  東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24550173
[学会発表] An Approach to Water Molecule Dynamics Associated with Motion of Catalytic Moiety2012
- 著者名/発表者名
  Hideto Shimahara, Kimikazu Sugimori, Muhmad Koyimatu, Hidemi Nagao, Tadayasu Ohkubo, and Yuji Kobayashi
- 学会等名
  The 4th International Symposium on Slow Dynamics in Complex Systems
- 発表場所
  Sendai
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24550173
[学会発表] 絹蛋白質の物理化学的基礎2011
- 著者名/発表者名
  小林祐次
- 学会等名
  奈良女子大学古代史・環境史プロテオミクス研究創成事業本部主催シンポジウム
- 発表場所
  奈良県奈良市
- 年月日
  2011-11-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 合理的創薬を目指した構造解析と熱力学的解析2011
- 著者名/発表者名
  小林祐次
- 学会等名
  第47回熱測定討論会
- 発表場所
  群馬県桐生市
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素の酵素反応機構の解明2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次, 他
- 学会等名
  日本薬学会近畿支部大会
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2010-10-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] Molecular interaction of PPARγ with its ligand2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi
- 学会等名
  12th Naples Workshop on Bioactive Peptides
- 発表場所
  イタリア
- 年月日
  2010-06-06
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 毒素原性大腸菌の線毛形成蛋白質CofAの結晶化2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次、西村光広, 他
- 学会等名
  日本結晶学会年会
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2010-12-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] The Crystal Structure of the Collagen Model Peptide containing 4(S)-hydroxyproline-proline-glycine Repeats2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi, et al.
- 学会等名
  5th International Peptide Symposium in conjyunction with 47th Japanese Peptide Symposium
- 発表場所
  京都
- 年月日
  2010-12-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 立体構造に基づく終末糖化産物AGE受容体とリガンド間の相互作用解析2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次
- 学会等名
  第57回日本生化学会近畿支部例会
- 発表場所
  奈良
- 年月日
  2010-05-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 真正細菌由来シャペロンとその阻害分子の相互作用解析2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次, 他
- 学会等名
  日本薬学会近畿支部大会
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2010-10-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素の基質認識機構2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次, 他
- 学会等名
  蛋白質科学会年会
- 発表場所
  北海道
- 年月日
  2010-06-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] Structural insights into the activation of PPARγ by organotin compounds2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi
- 学会等名
  The 5th Seoul-Kyoto-Osaka Joint Symposium on Pharmaceutical Sciences for Young Scientists
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2010-05-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] Thermodynamic and structural analysis of PPARγ-ligand interaction2010
- 著者名/発表者名
  M.Nishimura, Y Kobayashi
- 学会等名
  5th International Peptide Symposium in conjyunction with 47th Japanese Peptide Symposium
- 発表場所
  京都
- 年月日
  2010-12-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] Inter-molecular Interactions between Adiponectin and AdipoRs2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi, et al.
- 学会等名
  5th International Peptide Symposium in conjyunction with 47th Japanese Peptide Symposium
- 発表場所
  京都
- 年月日
  2010-12-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 分子動力学法によるコンデンシンヒンジドメインの構造解析2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次, 他
- 学会等名
  第24回分子シミュレーション討論会
- 発表場所
  福井
- 年月日
  2010-11-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] PPARγ-リガンド複合体の分子間相互作用解析2010
- 著者名/発表者名
  西村光広、小林祐次, 他
- 学会等名
  熱測定学会
- 発表場所
  三重
- 年月日
  2010-09-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] C 型肝炎ウイルス(HCV)のコア蛋白質とヒトプロテアソーム活性化因子PA28γの相互作用をターゲットとしたC型肝炎治療薬の探索2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次, 他
- 学会等名
  日本薬学会近畿支部大会
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2010-10-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] Identification of conformational heterogeneity of Collagen Model Peptide by19 F-NMR2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi, et al.
- 学会等名
  5th International Peptide Symposium in conjyunction with 47th Japanese Peptide Symposium
- 発表場所
  京都
- 年月日
  2010-12-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] PPARγ-LBD/FK-614複合体のX線結晶構造解析2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次, 他
- 学会等名
  日本結晶学会年会
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2010-12-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 病原性大腸菌腸管付着因子CofJのX 線結晶構造解析2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次, 他
- 学会等名
  蛋白質科学会年会
- 発表場所
  北海道
- 年月日
  2010-06-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] PPARγ-リガンド複合体の結晶構造解析及び熱力学的相互作用解析2010
- 著者名/発表者名
  西村光広、小林祐次, 他
- 学会等名
  Biophysical Interaction Analysis symposium 2010
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2010-07-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] Structural and thermodynamic analyses on complex of PPAR γ and its ligand2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次
- 学会等名
  The 13th Akabori Conference : German-Japanese Symposium on Peptide Science
- 発表場所
  ドイツ
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 炭酸脱水酵素の触媒反応におけるプロトントランスファの量子化学的解析のためのモデル-互変異性が変化する状態にあるHis64のスウィング運動の関与について2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次, 他
- 学会等名
  日本結晶学会年会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2010-12-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 終末糖化産物受容体(RAGE)リガンド結合領域の結晶化2010
- 著者名/発表者名
  鬼頭万里子、小林祐次, 他
- 学会等名
  日本結晶学会年会
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2010-12-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素の立体構造決定とリガンド認識様式の解明2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次, 他
- 学会等名
  第57回日本生化学会近畿支部例会
- 発表場所
  奈良
- 年月日
  2010-05-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] Structural and thermodynamic analyses on complex of PPARγ and its ligand2010
- 著者名/発表者名
  Y.Kobayashi
- 学会等名
  The 13th Akabori Conference : German-Japanese Symposium on Peptide Science
- 発表場所
  ドイツ
- 年月日
  2010-09-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] Molecular interaction of PPAR□with its ligand2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次
- 学会等名
  12th Naples Workshop on Bioactive Peptides
- 発表場所
  イタリア
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 立体構造情報を用いた終末糖化産物AGE受容体とHMGB1間の相互作用解析2010
- 著者名/発表者名
  小林祐次, 他
- 学会等名
  日本結晶学会年会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2010-12-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 立体構造に基づく終末糖化産物AGE受容体とリガンド間の相互作用解析2010
- 著者名/発表者名
  藤田直子, 小林祐次, ほか
- 学会等名
  日本薬学会第130回年会
- 発表場所
  岡山
- 年月日
  2010-03-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 合理的薬物設計を目指したタンパク質の構造と相互作用解析2009
- 著者名/発表者名
  小林祐次
- 学会等名
  ハイペップ研究所沖縄国際ワークショップ
- 発表場所
  沖縄県うるま市
- 年月日
  2009-07-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] 構造情報に基づく合理的薬剤設計―RAGEアンタゴニスト薬の探索2009
- 著者名/発表者名
  小林祐次, ほか
- 学会等名
  第19回日本メイラード学会
- 発表場所
  金沢
- 年月日
  2009-11-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390013
[学会発表] NMR Approach to His-64 Involved in Proton-Transfer Mechanism in Catalysis of Carbonic Anhydrase2007
- 著者名/発表者名
  島原秀登, Shimahara, H., Yoshida, T., Nakazawa, T., Ohkubo, T., & Kobayashi, Y.
- 学会等名
  12th European Conference on the Spectroscopy of Biological Molecules
- 発表場所
  Paris, France
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770128
[学会発表] Structure Properties of Adiponectin2007
- 著者名/発表者名
  Y. Kobayashi, 他
- 学会等名
  American Peptide Symposium
- 発表場所
  Montreal, CANADA
- 年月日
  2007-06-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18052020

1. 吉田卓也 (00294116)

共同の研究課題数: 6件

共同の研究成果数: 3件
2. 大久保忠恭 (90272997)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 7件
3. 冨山徹夫 (20155576)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
4. 西義則 (70397727)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
5. 島原秀登 (40313704)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 7件
6. 中沢隆 (30175492)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
7. 長尾秀実 (30291892)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 5件
8. 杉森公一 (40581632)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 4件
9. 岸田健一 (80028563)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
10. 木曽良明 (40089107)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
11. 木村徹 (70204980)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
12. 藤原洋一 (60199396)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
13. 赤路健一 (60142296)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
14. 梶山康一

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
15. 山崎俊正

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
16. 崎山文夫 (40029947)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 水上卓 (50270955)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
18. 山田剛司 (20278592)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
19. 西村光広 (40510285)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
20. 宮田敏行 (90183970)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 西川淳一 (90218131)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 松尾武清 (50029691)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 三方裕司 (10252826)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. 河原一樹 (60585058)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
25. 鈴木孝仁 (60144135)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. 林良雄

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
27. 永田順一

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
28. USSERY Micha

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
29. TORCHIA Denn

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
30. YARCHOAN Rob

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
31. 満屋裕明

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
32. 松田重輝

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
33. 三本木至宏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

小林 祐次 Kobayashi Yuji

小林 裕次 コバヤシ ユウジ

小林 ゆう次 コバヤシ ユウジ

研究課題

研究成果

共同研究者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

終末糖化産物の受容体(RAGE)を標的とする糖尿病合併症の予防・治療薬の探索研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

アディポネクチンの超分子構造・相互作用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

アディポネクチンの超分子構造・相互作用解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

コラーゲンの構造安定化機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

リボソーム再生系を標的としたNMRによる相互作用解析法と新規抗菌剤の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

情報伝達機構の解明を目指した骨形成因子(BMP)とそのレセプターの構造解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

蛋白質生合成の最終過程を司るリボソーム再生因子(RRF)の立体構造解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

蛋白質-リガンド複合体の熱力学的研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

蛋白質生合成の最終過程を司るリボソーム再生因子(RRF)の立体構造解析研究代表者

研究代表者

小林祐次 Kobayashi Yuji

小林裕次コバヤシユウジ

小林ゆう次コバヤシユウジ