梶谷嶺 Kajitani Rei

研究者番号	40756706
その他のID
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2016年度 – 2023年度: 東京工業大学, 生命理工学院, 助教 2015年度: 東京工業大学, 生命理工学研究科, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者合同審査対象区分:小区分45010:遺伝学関連、小区分45020:進化生物学関連 / 小区分45020:進化生物学関連 / 小区分45010:遺伝学関連 / 小区分43050:ゲノム生物学関連 / 小区分43010:分子生物学関連 / ゲノム生物学研究代表者以外小区分17050:地球生命科学関連 / 小区分49050:細菌学関連 / 細菌学(含真菌学) / ゲノム生物学
キーワード	研究代表者ゲノム / ハプロタイプ / de novoアセンブリ / 高ヘテロ接合性 / ゲノム多様性 / 多様性 / NGS / ヘテロ接合性 / メタゲノム / ヘテロ接合度 … もっと見る / バイオインフォマティクス / ハプロタイプ配列 / アレル特異的現象 / アレル特異的 / 遺伝子構造アノテーション / アルゴリズム / de novo アセンブリ / 多倍体 … もっと見る研究代表者以外ゲノム / 進化 / メタゲノム / 病原性 / 腸管出血性大腸菌 / ３型分泌装置 / 志賀毒素 / 海洋堆積物 / 微生物群集構造 / 16S RNA / 微生物生態 / 極限環境 / DNA / 16S rRNA / 適応 / 微生物 / 海底下堆積物 / 適応・進化 / 微生物群集 / 堆積物 / 海底下生命圏 / ゲノムアノテーション / ゲノム多型 / ゲノムアッセンブル / スーパーコンピューター / メタゲノム解析 / 1細胞解析 / RNA-Seq / エピゲノム / リシーケンシング / 新規ゲノム配列決定 / 次世代DNAシーケンサー / 原生生物 / ファージ / 腸管病原性大腸菌 / 志賀毒素産生性大腸菌 / アセンブラ / ゲノム解析 / ハプロタイプ / ゲノム構築 / 次世代シークエンサー / ゲノムアセンブル / ヘテロ接合性 / ゲノムアセンブラ隠す

プログラム済みゲノム再構成　複数系統調査から探るその進化的意義研究代表者
- 研究代表者
  
  梶谷嶺
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分45010:遺伝学関連
   小区分45020:進化生物学関連
   合同審査対象区分:小区分45010:遺伝学関連、小区分45020:進化生物学関連
- 研究機関
  東京工業大学
海底下の「静かな」微生物進化
- 研究代表者
  
  星野辰彦
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分17050:地球生命科学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人海洋研究開発機構
多個体ハプロタイプ解析による超高ヘテロ接合性生物圏の実態解明研究代表者
- 研究代表者
  
  梶谷嶺
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2023
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分43050:ゲノム生物学関連
- 研究機関
  東京工業大学
腸管出血性大腸菌の出現機構の全容解明ー制御法開発のための基盤構築
- 研究代表者
  
  小椋義俊
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分49050:細菌学関連
- 研究機関
  久留米大学
ハプロタイプ配列群に基づくアレル特異的ゲノム動態解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  梶谷嶺
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分43010:分子生物学関連
- 研究機関
  東京工業大学
大規模比較ゲノム解析による腸管出血性大腸菌出現プロセスの解明
- 研究代表者
  
  小椋義俊
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  細菌学(含真菌学)
- 研究機関
  九州大学
ハプロタイプを区別する新規ゲノムアセンブラの開発および超多様化ゲノム領域の解析
- 研究代表者
  
  伊藤武彦
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  東京工業大学
先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 研究代表者
  
  小原雄治
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2021
- 研究種目
  
  新学術領域研究（研究領域提案型）『学術研究支援基盤形成』
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
多倍体生物の全ゲノム配列構築手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  梶谷嶺
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2016
- 研究種目
  
  研究活動スタート支援
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  東京工業大学

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Integrated Population Genomic Analysis and Numerical Simulation to Estimate Larval Dispersal of Acanthaster cf. solaris Between Ogasawara and Other Japanese Regions2022
- 著者名/発表者名
  Horoiwa Mizuki、Nakamura Takashi、Yuasa Hideaki、Kajitani Rei、Ameda Yosuke、Sasaki Tetsuro、Taninaka Hiroki、Kikuchi Taisei、Yamakita Takehisa、Toyoda Atsushi、Itoh Takehiko、Yasuda Nina
- 雑誌名
  
  Frontiers in Marine Science
  
  巻: 8 ページ: 688139-688139
- DOI
  10.3389/fmars.2021.688139
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19J21342, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Genomic Signatures for Species-Specific Adaptation in Lake Victoria Cichlids Derived from Large-Scale Standing Genetic Variation2021
- 著者名/発表者名
  Nakamura Haruna、Aibara Mitsuto、Kajitani Rei、Mrosso Hillary D J、Mzighani Semvua I、Toyoda Atsushi、Itoh Takehiko、Okada Norihiro、Nikaido Masato
- 雑誌名
  
  Molecular Biology and Evolution
  
  巻: in press 号: 8 ページ: 3111-3125
- DOI
  10.1093/molbev/msab084
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20KK0167, KAKENHI-PROJECT-20J13861, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Elucidation of the speciation history of three sister species of crown-of-thorns starfish (Acanthaster spp.) based on genomic analysis2021
- 著者名/発表者名
  Hideaki Yuasa, Rei Kajitani, Yuta Nakamura, Kazuki Takahashi, Miki Okuno, Fumiya Kobayashi, Takahiro Shinoda, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Nalinee Thongtham, Zac Forsman, Omri Bronstein, Davide Seveso, Enrico Montalbetti, Coralie Taquet, Gal Eyal, Nina Yasuda, Takehiko Itoh
- 雑誌名
  
  DNA Research
  
  巻: 28 号: 4
- DOI
  10.1093/dnares/dsab012
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03206, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] MetaPlatanus: a metagenome assembler that combines long-range sequence links and species-specific features2021
- 著者名/発表者名
  Rei Kajitani, Hideki Noguchi, Yasuhiro Gotoh, Yoshitoshi Ogura, Dai Yoshimura, Miki Okuno, Atsushi Toyoda, Tomomi Kuwahara, Tetsuya Hayashi, Takehiko Itoh
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 49 号: 22 ページ: e130-e130
- DOI
  10.1093/nar/gkab831
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03206, KAKENHI-PROJECT-20H04125, KAKENHI-PROJECT-21K19211, KAKENHI-PROJECT-20K15769, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Insights into the genomic evolution of insects from cricket genomes2021
- 著者名/発表者名
  Guillem Ylla, Taro Nakamura, Takehiko Itoh, Rei Kajitani, Atsushi Toyoda, Sayuri Tomonari, Tetsuya Bando, Yoshiyasu Ishimaru, Takahito Watanabe, Masao Fuketa, Yuji Matsuoka, Austen A. Barnett, Sumihare Noji, Taro Mito & Cassandra G. Extavour
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 4 号: 1 ページ: 733-733
- DOI
  10.1038/s42003-021-02197-9
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06184, KAKENHI-PROJECT-19K06691, KAKENHI-PROJECT-21K06121, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Comparative genomics of Glandirana rugosa using unsupervised AI reveals a high CG frequency2021
- 著者名/発表者名
  Katsura Y, Ikemura T, Kajitani R, Toyoda A, Itoh T, Ogata M, Miura I, Wada K, Wada Y, and Satta Y
- 雑誌名
  
  Life Science Alliance
  
  巻: - 号: 5 ページ: e202000905-e202000905
- DOI
  10.26508/lsa.202000905
- NAID
  120007153083
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K06788, KAKENHI-PROJECT-18K14766, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] A ubiquitous subcuticular bacterial symbiont of a coral predator, the crown-of-thorns starfish, in the Indo-Pacific2020
- 著者名/発表者名
  Wada Naohisa、Yuasa Hideaki、Kajitani Rei、Gotoh Yasuhiro、Ogura Yoshitoshi、Yoshimura Dai、Toyoda Atsushi、Tang Sen-Lin、Higashimura Yukihiro、Sweatman Hugh、Forsman Zac、Bronstein Omri、Eyal Gal、Thongtham Nalinee、Itoh Takehiko、Hayashi Tetsuya、Yasuda Nina
- 雑誌名
  
  Microbiome
  
  巻: 8 号: 1 ページ: 123-123
- DOI
  10.1186/s40168-020-00880-3
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04996, KAKENHI-PROJECT-18J23317, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Platanus-allee is a de novo haplotype assembler enabling a comprehensive access to divergent heterozygous regions.2019
- 著者名/発表者名
  Kajitani R, Yoshimura D, Okuno M, Minakuchi Y, Kagoshima H, Fujiyama A, Kubokawa K, Kohara Y, Toyoda A, Itoh T
- 雑誌名
  
  Nat Commun
  
  巻: - 号: 1 ページ: 1702-1702
- DOI
  10.1038/s41467-019-09575-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-INTERNATIONAL-15K21761, KAKENHI-ORGANIZER-15H05970, KAKENHI-PLANNED-15H05979, KAKENHI-PROJECT-16H04719, KAKENHI-PROJECT-17K01019, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Evaluation of SNP calling methods for closely related bacterial isolates and a novel high-accuracy pipeline: BactSNP2019
- 著者名/発表者名
  Yoshimura Dai、Kajitani Rei、Gotoh Yasuhiro、Katahira Katsuyuki、Okuno Miki、Ogura Yoshitoshi、Hayashi Tetsuya、Itoh Takehiko
- 雑誌名
  
  Microbial Genomics
  
  巻: 5 号: 5
- DOI
  10.1099/mgen.0.000261
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-15H05970, KAKENHI-PLANNED-15H05979, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Repeated inversions within a pannier intron drive diversification of intraspecific colour patterns of ladybird beetles2018
- 著者名/発表者名
  Ando Toshiya、Matsuda Takeshi、Goto Kumiko、Hara Kimiko、Ito Akinori、Hirata Junya、Yatomi Joichiro、Kajitani Rei、Okuno Miki、Yamaguchi Katsushi、Kobayashi Masaaki、Takano Tomoyuki、Minakuchi Yohei、Seki Masahide、Suzuki Yutaka、Yano Kentaro、Itoh Takehiko、Shigenobu Shuji、Toyoda Atsushi、Niimi Teruyuki
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 9 号: 1 ページ: 3843-3843
- DOI
  10.1038/s41467-018-06116-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05848, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Next-generation sequencing analysis of lager brewing yeast strains reveals the evolutionary history of interspecies hybridization2016
- 著者名/発表者名
  Miki Okuno, Rei Kajitani, Rie Ryusui, Hiroya Morimoto, Yukiko Kodama and Takehiko Itoh
- 雑誌名
  
  DNA Research
  
  巻: 23 ページ: 67-80
- DOI
  10.1093/dnares/dsv037
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H06209
[学会発表] Mechanism of community assembly in the subseafloor biosphere2023
- 著者名/発表者名
  Tatsuhiko Hoshino, Rei Kajitani
- 学会等名
  Japan Geoscience Union Meeting 2023
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K22618
[学会発表] GreenHill: A De Novo Chromosome-Level Scaffolding and Phasing Tool Using Hi-C2023
- 著者名/発表者名
  Shun Ouchi, Rei Kajitani, Takehiko Itoh
- 学会等名
  Plant and Animal Genome Conference / PAG 30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15769
[学会発表] 免疫システムがもたらしたシクリッドの唇肥大化平行進化2022
- 著者名/発表者名
  畑島諒, 待井長敏, 豊田敦, 梶谷嶺, 長澤竜樹, 伊藤武彦, 二階堂雅人
- 学会等名
  第2回日本遺伝学会春の分科会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] RNA polymerase Ⅱによる転写とヒストン修飾の安定性制御2021
- 著者名/発表者名
  梶谷卓也
- 学会等名
  第14回日本エピジェネティクス研究会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Hi-Cデータを用いたビニングツールの開発2021
- 著者名/発表者名
  服部拓海、梶谷嶺、伊藤武彦
- 学会等名
  第11回生命医薬情報学連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15769
[学会発表] 転写装置RNA polymerase II CTD-Ser7リン酸化は転写一時停止とヘテロクロマチン形成を促進する。2021
- 著者名/発表者名
  梶谷卓也
- 学会等名
  第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 東アフリカ産シクリッドで見られる唇肥大化平行進化の分子メカニズム2021
- 著者名/発表者名
  畑島諒, 豊田敦, 梶谷嶺, 伊藤武彦, 二階堂雅人
- 学会等名
  第23回日本進化学会年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 細胞周期が遺伝子発現不均質性を生み出す可能性の検証2021
- 著者名/発表者名
  梶谷卓也
- 学会等名
  日本生化学会北陸支部例会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] A key factor for parallel evolution of hypertrophied lips in East African cichlid fishes2021
- 著者名/発表者名
  Hatashima, R., Toyoda, A., Kajitani, R. Itoh, T. and Nikaido, M.
- 学会等名
  The 2nd AsiaEvo Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 細胞周期が遺伝子発現不均質性を生み出す可能性の検証2021
- 著者名/発表者名
  梶谷卓也
- 学会等名
  日本生化学会北陸支部第39回大会例会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 遺伝子発現と細胞周期の相関関係について2021
- 著者名/発表者名
  梶谷卓也
- 学会等名
  日本遺伝学会第93回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 細胞周期とクロマチン構造の関係性の検証2021
- 著者名/発表者名
  梶谷卓也
- 学会等名
  酵母遺伝学フォーラム第54回研究報告会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 東アフリカ産シクリッドで見られる唇肥大化平行進化の分子メカニズム2021
- 著者名/発表者名
  畑島諒, 豊田敦, 梶谷嶺, 伊藤武彦, 二階堂雅人
- 学会等名
  The 2nd AsiaEvo Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] RNA polymerase IIリン酸化による転写一時停止はエピジェネティクス情報不均一さを抑制する2020
- 著者名/発表者名
  梶谷卓也
- 学会等名
  日本生化学会北陸支部例会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Update of Platanus-allee, a de novo haplotype assembler, and its application to the organisms with highly divergent haplotypes2020
- 著者名/発表者名
  Rei Kajitani, Miki Okuno, Hiroyuki Tanaka, Atsushi Toyoda, Takehiko Itoh
- 学会等名
  Plant & animal genome conference XXVIII
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] シクリッドにおける唇肥大化の平行進化メカニズム2020
- 著者名/発表者名
  畑島諒、豊田敦、梶谷嶺、伊藤武彦、二階堂雅人
- 学会等名
  日本動物学会第91回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ロングリードを活用したゲノムアセンブリ用新規スキャフォールディングツールの開発2020
- 著者名/発表者名
  石井裕太、梶谷嶺、伊藤武彦
- 学会等名
  第９回生命医薬情報学連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15769
[学会発表] Whole-genome sequencing and comparative analysis of emu provides insights into sex chromosome evolution of the Palaeognathae clade2020
- 著者名/発表者名
  Miki Okuno, Rei Kajitani, Hiroyuki Tanaka, Shuhei Mizushima, Asato Kuroiwa, Takehiko Itoh
- 学会等名
  Plant & animal genome conference XXVIII
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Hi-C法による染色体レベルのscaffolding、ハプロタイプ構築手法の開発と高ヘテロ接合性サンプル (イトマキヒトデ) への応用2020
- 著者名/発表者名
  大内俊、梶谷嶺、伊藤武彦
- 学会等名
  日本動物学会第91回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14624
[学会発表] ドラフトゲノムの不完全性が遺伝子構造アノテーションに及ぼす影響の解析2019
- 著者名/発表者名
  小林史弥、梶谷嶺、中村優太、奥野未来、湯淺英知、伊藤武彦
- 学会等名
  第８回生命医薬情報学連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14624
[学会発表] ドラフトゲノムに対応した遺伝子構造アノテーション自動構築パイプラインの開発2019
- 著者名/発表者名
  中村優太、梶谷嶺、小林史弥、湯淺英知、伊藤武彦
- 学会等名
  第８回生命医薬情報学連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14624
[学会発表] エミューゲノムの構築と比較解析による古顎類の性染色体進化の解明2019
- 著者名/発表者名
  奥野未来, 梶谷嶺, 田中裕之, 水島秀成, 黒岩麻里, 伊藤武彦
- 学会等名
  第90回日本動物学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] イトマキヒトデのモデル生物化に向けて～イトマキヒトデのゲノム構築～2019
- 著者名/発表者名
  伊藤武彦, 梶谷嶺, 奥野未来, 田中裕之, 豊田敦, 立花和則, 岸本健雄
- 学会等名
  第90回日本動物学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 網羅的遺伝子構造予測自動アノテーションパイプラインの開発2018
- 著者名/発表者名
  篠田恭寛、梶谷嶺、小林史弥、髙橋和希、中村優太、湯淺英知、伊藤武彦
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14624
[学会発表] Y染色体をもたないアマミトゲネズミの遺伝子配列を用いた進化学的解析2018
- 著者名/発表者名
  岡野真佑, 奥野未来, 梶谷嶺, 黒岩麻里, 伊藤武彦
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 網羅的遺伝子構造予測自動アノテーションパイプラインの開発2018
- 著者名/発表者名
  篠田恭寛, 梶谷嶺, 小林史弥, 高橋和希, 中村優太, 湯淺英知, 伊藤武彦
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] インドー太平洋のオニヒトデから見つかった未知の菌のゲノム解析2018
- 著者名/発表者名
  湯淺英知, 梶谷嶺, 後藤恭宏, 和田直久, 吉村大, 小椋義俊, 林哲也, 安田仁奈, 伊藤武彦
- 学会等名
  第21回日本サンゴ礁学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 10X-Linked-reads、Mate-pairを活用したメタゲノムアセンブリ手法の開発2018
- 著者名/発表者名
  梶谷嶺, 小椋義俊, 後藤恭宏, 林哲也, 伊藤武彦
- 学会等名
  第12回ゲノム微生物学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] オニヒトデから見つかった謎の共在菌について2018
- 著者名/発表者名
  和田直久, 湯淺英知, 梶谷嶺, 後藤恭弘, 小椋義俊, 吉村大, 豊田敦, Sen-Lin TANG, 東村幸浩, Hugh SWEATMAN, Zac FORSMAN, Omri BRONSTEIN, Gal EYAL, Nalinee THONGTHAM, 林哲也, 伊藤武彦, 安田仁奈
- 学会等名
  第21回日本サンゴ礁学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] イトマキヒトデの卵成熟前後におけるmRNA3'末端の網羅的解析2017
- 著者名/発表者名
  野川駿, 岩永紗弥, 梶谷嶺, 越智洋絵, 鈴木穣, 千葉和義, 伊藤武彦
- 学会等名
  日本動物学会第88回富山大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] メタゲノムショットガンデータからの株ハプロタイプ配列構築手法の開発2017
- 著者名/発表者名
  梶谷嶺，小椋義俊，後藤恭宏，吉村大，奥野未来，林哲也，伊藤武彦
- 学会等名
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- 発表場所
  慶応義塾大学　湘南藤沢キャンパス
- 年月日
  2017-03-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04719
[学会発表] メタゲノムショットガンデータからの株ハプロタイプ配列構築手法の開発2017
- 著者名/発表者名
  梶谷嶺、小椋義俊、後藤恭宏、吉村大、奥野未来、林哲也、伊藤武彦
- 学会等名
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- 発表場所
  慶應義塾大学　湘南藤沢キャンパス
- 年月日
  2017-03-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H06209
[学会発表] ショートリードを用いたりピート配列のde novo検出法の開発2017
- 著者名/発表者名
  田中良樹, 梶谷嶺, 豊田敦, 後藤友二, 久保田宗一郎, 伊藤武彦
- 学会等名
  日本動物学会第88回富山大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Examining genetic divergence of closely related Crown-of-Thorns starfish species between Indian and Pacific Ocean using whole genome data.2017
- 著者名/発表者名
  Hideaki Yuasa, Rei Kajitani, Kazuki Takahashi, Dai Yoshimura, Takehiko Itoh, Yoshitoshi Ogura, Tetuya Hayashi, Zac Forsman, Nalinee Thongtham, Niphon Phongsuwan, Coralie Taquet, Marc Taquet, Nina Yasuda
- 学会等名
  The Third Asia Marine Biology Symposium
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] PacBioおよびIlluminaシークエンサを用いた新規アセンブル手法の開発2017
- 著者名/発表者名
  番匠康雄，梶谷嶺，伊藤武彦
- 学会等名
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- 発表場所
  慶応義塾大学　湘南藤沢キャンパス
- 年月日
  2017-03-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04719
[学会発表] Platanus2: a de novo haplotype assembler enabling comprehensive accesses to divergent heterozygous region.2017
- 著者名/発表者名
  梶谷嶺，吉村大，奥野未来，豊田敦，伊藤武彦
- 学会等名
  第6回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2017）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04719
[学会発表] Molecular mechanism and evolution of female-limited and polymorphic Batesain mimicry in Papilio polytes.2017
- 著者名/発表者名
  Fujiwara, H., Nishikawa, H., Iijima, T., Kajitani, R. and Ito, T.
- 学会等名
  19th Annual Meeting of the Society of Evolutionary Studiies
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279

1. 小椋義俊 (40363585)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 4件
2. 伊藤武彦 (90501106)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 24件
3. 豊田敦 (10267495)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 10件
4. 小原雄治 (70135292)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 加藤和人 (10202011)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 川嶋実苗 (00396706)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 鈴木穣 (40323646)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
8. 三井純 (70579862)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 林哲也 (10173014)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
10. 時野隆至 (40202197)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 黒川顕 (20343246)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 中村保一 (60370920)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
13. 野口英樹 (50333349)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 岩崎渉 (50545019)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 森下真一 (90292854)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 浅井潔 (30356357)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 笠原雅弘 (60376605)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 山田拓司 (10437262)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 久原哲 (00153320)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 高橋弘喜 (60548460)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
21. 榊原康文 (10287427)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 浜田道昭 (00596538)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 高木利久 (30110836)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. 瀬々潤 (40361539)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
25. 位田隆一 (40127543)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. 山縣然太朗 (10210337)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
27. 増井徹 (50150082)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
28. 武藤香織 (50345766)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
29. 児玉聡 (80372366)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
30. 瀬戸山晃一 (00379075)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
31. 小門穂 (20706650)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
32. 大橋範子 (50739430)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
33. 藤山秋佐夫 (60142311)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
34. 井ノ上逸朗 (00192500)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
35. 中岡博史 (70611193)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
36. 菅野純夫 (60162848)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
37. 辻省次 (70150612)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
38. 後藤恭宏 (20558358)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
39. 中村佳司 (60706216)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
40. 奥野未来 (30814462)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
41. 仲瀬裕志 (60362498)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
42. 佐々木泰史 (70322328)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
43. 井戸川雅史 (00404749)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
44. 丹下正一朗 (40571211)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
45. 森宙史 (40610837)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
46. 小笠原理 (00435512)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
47. 谷澤靖洋 (90836511)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
48. 近藤伸二 (30415161)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
49. 木立尚孝 (80415778)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
50. 田代康介 (00192170)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
51. フリスマーティン (40462832)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
52. 平川英樹 (80372746)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
53. 鈴木拓 (20381254)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
54. 能正勝彦 (10597339)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
55. 甲斐正広 (80260777)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
56. 小林郁雄 (20576293)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
57. 星野辰彦 (30386619)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
58. 安田仁奈

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
59. 二階堂雅人

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
60. 板東哲哉

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
61. 矢野健太郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
62. 三浦郁夫

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

梶谷 嶺 Kajitani Rei

研究課題

研究成果

共同研究者

プログラム済みゲノム再構成 複数系統調査から探るその進化的意義研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

海底下の「静かな」微生物進化

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

多個体ハプロタイプ解析による超高ヘテロ接合性生物圏の実態解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

腸管出血性大腸菌の出現機構の全容解明ー制御法開発のための基盤構築

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ハプロタイプ配列群に基づくアレル特異的ゲノム動態解析手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

大規模比較ゲノム解析による腸管出血性大腸菌出現プロセスの解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ハプロタイプを区別する新規ゲノムアセンブラの開発および超多様化ゲノム領域の解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

多倍体生物の全ゲノム配列構築手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Integrated Population Genomic Analysis and Numerical Simulation to Estimate Larval Dispersal of Acanthaster cf. solaris Between Ogasawara and Other Japanese Regions2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Genomic Signatures for Species-Specific Adaptation in Lake Victoria Cichlids Derived from Large-Scale Standing Genetic Variation2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Elucidation of the speciation history of three sister species of crown-of-thorns starfish (Acanthaster spp.) based on genomic analysis2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] MetaPlatanus: a metagenome assembler that combines long-range sequence links and species-specific features2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Insights into the genomic evolution of insects from cricket genomes2021

著者名/発表者名

雑誌名

梶谷嶺 Kajitani Rei

プログラム済みゲノム再構成　複数系統調査から探るその進化的意義研究代表者