中村佳司 Nakamura Keiji

研究者番号	60706216
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 九州大学, 医学研究院, 講師
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2024年度: 九州大学, 医学研究院, 講師 2018年度 – 2021年度: 九州大学, 医学研究院, 助教 2017年度: 九州大学, 大学院医学研究院, 研究員 2016年度 – 2017年度: 九州大学, 医学研究院, 学術研究員 2016年度: 九州大学, 大学院・医学研究院, 学術研究員 2014年度 – 2015年度: 大阪大学, 微生物病研究所, 特任研究員(常勤)
審査区分/研究分野	研究代表者小区分49050:細菌学関連 / 細菌学(含真菌学) 研究代表者以外細菌学(含真菌学)
キーワード	研究代表者腸管出血性大腸菌 / 気管支敗血症菌 / 志賀毒素転換ファージ / ファージ誘導 / 志賀毒素産生性大腸菌 / 比較ゲノム解析 / Sequence type / 血清型変換 / O抗原・H抗原 / 大腸菌 … もっと見る / ヘルパー/サテライトファージ / バクテリオファージ (ファージ) / Stx2ファージ / 志賀毒素(Stx)ファージ / 志賀毒素（Stx）ファージ / ヘルパーファージ / サテライトファージ / 志賀毒素ファージ / 感染動物モデル / 実験動物モデル / 発作性咳嗽 / 百日咳 / 付着因子 / I型分泌機構 / 二成分制御系 / バイオフィルム / ボルデテラ属細菌 … もっと見る研究代表者以外気管支敗血症菌 / 百日咳菌 / 百日咳 / ゲノムアノテーション / メタゲノム / ゲノム多型 / ゲノムアッセンブル / スーパーコンピューター / メタゲノム解析 / 1細胞解析 / RNA-Seq / エピゲノム / リシーケンシング / 新規ゲノム配列決定 / 次世代DNAシーケンサー / 咳発作隠す

腸管出血性大腸菌における自発的プロファージ誘導の抑制機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  中村佳司
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分49050:細菌学関連
- 研究機関
  九州大学
大規模ゲノム情報を利用した大腸菌における血清型変換の全貌解明研究代表者
- 研究代表者
  
  中村佳司
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分49050:細菌学関連
- 研究機関
  九州大学
腸管出血性大腸菌におけるプロファージ間相互作用と宿主菌進化へのインパクトの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  中村佳司
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分49050:細菌学関連
- 研究機関
  九州大学
百日咳における発作性咳嗽に関連する菌側遺伝子の機能解析研究代表者
- 研究代表者
  
  中村佳司
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2017
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  細菌学(含真菌学)
- 研究機関
  九州大学
長鎖DNA断片導入による、汎用実験動物に感染する百日咳菌の作出
- 研究代表者
  
  堀口安彦
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2017
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  細菌学(含真菌学)
- 研究機関
  大阪大学
先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 研究代表者
  
  小原雄治
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2021
- 研究種目
  
  新学術領域研究（研究領域提案型）『学術研究支援基盤形成』
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
気管支敗血症菌の新規病原因子の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  中村佳司
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2015
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  細菌学(含真菌学)
- 研究機関
  大阪大学
百日咳における咳嗽発作の発症メカニズムの解明
- 研究代表者
  
  堀口安彦
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  細菌学(含真菌学)
- 研究機関
  大阪大学

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すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] Methods in Molecular Biology, Gene Prediction2019
- 著者名/発表者名
  Yasuhiro Tanizawa, Takatomo Fujisawa, Masanori Arita, Yasukazu Nakamura
- ページ
  215-226
- 総ページ数
  284
- 出版者
  Springer Nature.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[図書] Gene Prediction Methods and Protocols2019
- 著者名/発表者名
  Tanizawa Y, Fujisawa T, Arita M, Nakamura Y.
- ページ
  215-226
- 総ページ数
  283
- 出版者
  Humana, New York, NY
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[図書] 次世代シークエンサーDRY解析教本改訂第2版2019
- 著者名/発表者名
  谷澤靖洋、中村保一
- ページ
  246-273
- 総ページ数
  384
- 出版者
  学研プラス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[図書] もっとよくわかる! 腸内細菌叢～健康と疾患を司る“もう1つの臓器”(実験医学別冊もっとよくわかる! シリーズ)2019
- 著者名/発表者名
  中村祐哉、山田拓司(福田真嗣編集)
- ページ
  107-111
- 総ページ数
  147
- 出版者
  羊土社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Global population structure, genomic diversity and carbohydrate fermentation characteristics of clonal complex 119 (CC119), an understudied Shiga toxin-producing E. coli (STEC) lineage including O165:H25 and O172:H252023
- 著者名/発表者名
  Nakamura Keiji、Seto Kazuko、Lee Kenichi、Ooka Tadasuke、Gotoh Yasuhiro、Taniguchi Itsuki、Ogura Yoshitoshi、Mainil Jacques Georges、Pi?rard Denis、Harada Tetsuya、Etoh Yoshiki、Ueda Saori、Hamasaki Mitsuhiro、Isobe Junko、Kimata Keiko、Narimatsu Hiroshi、Yatsuyanagi Jun、Ohnishi Makoto、Iyoda Sunao、Hayashi Tetsuya
- 雑誌名
  
  Microbial Genomics
  
  巻: 9 号: 3 ページ: 000959-000959
- DOI
  10.1099/mgen.0.000959
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K07506, KAKENHI-PROJECT-21K07006, KAKENHI-PROJECT-20H03486, KAKENHI-PROJECT-20K21527
[雑誌論文] Integrated Population Genomic Analysis and Numerical Simulation to Estimate Larval Dispersal of Acanthaster cf. solaris Between Ogasawara and Other Japanese Regions2022
- 著者名/発表者名
  Horoiwa Mizuki、Nakamura Takashi、Yuasa Hideaki、Kajitani Rei、Ameda Yosuke、Sasaki Tetsuro、Taninaka Hiroki、Kikuchi Taisei、Yamakita Takehisa、Toyoda Atsushi、Itoh Takehiko、Yasuda Nina
- 雑誌名
  
  Frontiers in Marine Science
  
  巻: 8 ページ: 688139-688139
- DOI
  10.3389/fmars.2021.688139
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19J21342, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] A meta-analysis of genome-wide association studies using Japanese and Taiwanese has revealed novel loci associated with gout susceptibility2022
- 著者名/発表者名
  Chang Shun-Jen、Toyoda Yu、Kawamura Yusuke、Nakamura Takahiro、Nakatochi Masahiro、Nakayama Akiyoshi、et al.
- 雑誌名
  
  Human Cell
  
  巻: 35 号: 2 ページ: 767-770
- DOI
  10.1007/s13577-021-00665-2
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K23152, KAKENHI-PROJECT-20H00566, KAKENHI-PROJECT-20H00568, KAKENHI-PROJECT-21KK0173, KAKENHI-PROJECT-16H06277, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-23K21618, KAKENHI-PROJECT-22H04923
[雑誌論文] Genomic Signatures for Species-Specific Adaptation in Lake Victoria Cichlids Derived from Large-Scale Standing Genetic Variation2021
- 著者名/発表者名
  Nakamura Haruna、Aibara Mitsuto、Kajitani Rei、Mrosso Hillary D J、Mzighani Semvua I、Toyoda Atsushi、Itoh Takehiko、Okada Norihiro、Nikaido Masato
- 雑誌名
  
  Molecular Biology and Evolution
  
  巻: in press 号: 8 ページ: 3111-3125
- DOI
  10.1093/molbev/msab084
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20KK0167, KAKENHI-PROJECT-20J13861, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] The global population structure and evolutionary history of the acquisition of major virulence factor-encoding genetic elements in Shiga toxin-producing Escherichia coli O121:H192021
- 著者名/発表者名
  Nishida Ruriko、Nakamura Keiji、Taniguchi Itsuki、et al.
- 雑誌名
  
  Microbial Genomics
  
  巻: 7 号: 12 ページ: 000716-000716
- DOI
  10.1099/mgen.0.000716
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00530, KAKENHI-PROJECT-20H03486, KAKENHI-PROJECT-20K07506, KAKENHI-PROJECT-21K07006, KAKENHI-PROJECT-20K21527
[雑誌論文] Liquid Biopsy Cell-free DNA Biomarkers in Patients With Oligometastatic Colorectal Cancer Treated by Ablative Radiotherapy2021
- 著者名/発表者名
  MASAKI NAKAMURA, SHUN-ICHIRO KAGEYAMA, MASAHIDE SEKI, AYAKO SUZUKI, MASAYUKI OKUMURA, HIDEHIRO HOJO, ATSUSHI MOTEGI and TETSUO AKIMOTO
- 雑誌名
  
  ANTICANCER RESEARCH
  
  巻: 41 号: 2 ページ: 829-834
- DOI
  10.21873/anticanres.14835
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K15611, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Aberrant mucosal immunoreaction to tonsillar microbiota in immunoglobulin A nephropathy2021
- 著者名/発表者名
  Hiroki Yamaguchi, Shin Goto, Nao Takahashi, Masafumi Tsuchida, Hirofumi Watanabe, Suguru Yamamoto, Yoshikatsu Kaneko, Koichi Higashi, Hiroshi Mori, Yukio Nakamura, Arata Horii, Ken Kurokawa, Ichiei Narita
- 雑誌名
  
  Nephrol Dial Transplant.
  
  巻: ３６号: 1 ページ: 75-86
- DOI
  10.1093/ndt/gfaa223
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K09372, KAKENHI-PROJECT-20K08628, KAKENHI-PROJECT-18K08234, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-19H03674
[雑誌論文] CTCF looping is established during gastrulation in medaka embryos2021
- 著者名/発表者名
  Ryohei Nakamura, Yuichi Motai, Masahiko Kumagai, Candice L. Wike, Haruyo Nishiyama, Yoichiro Nakatani, Neva C. Durand, Shinichi Morishita, Hiroyuki Takeda, et al.
- 雑誌名
  
  Genome Research
  
  巻: 31 号: 6 ページ: 968-980
- DOI
  10.1101/gr.269951.120
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Collective nuclear behavior shapes bilateral nuclear symmetry for subsequent left-right asymmetric morphogenesis in Drosophila2021
- 著者名/発表者名
  Shin Dongsun、Nakamura Mitsutoshi、Morishita Yoshitaka、Eiraku Mototsugu、Yamakawa Tomoko、Sasamura Takeshi、Akiyama Masakazu、Inaki Mikiko、Matsuno Kenji
- 雑誌名
  
  Development
  
  巻: 148 号: 18 ページ: 1-12
- DOI
  10.1242/dev.198507
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H02488, KAKENHI-PROJECT-21K06188, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Sparsely methylated mitochondrial cell free DNA released from cardiomyocytes contributes to systemic inflammatory response accompanied by atrial fibrillation2021
- 著者名/発表者名
  Yamazoe Masahiro、Sasano Tetsuo、Ihara Kensuke、Takahashi Kentaro、Nakamura Wakana、Takahashi Naomi、Komuro Hiroaki、Hamada Satomi、Furukawa Tetsushi
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 11 号: 1 ページ: 5837-5837
- DOI
  10.1038/s41598-021-85204-7
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08536, KAKENHI-PROJECT-18H02803, KAKENHI-PROJECT-20J13923, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Prophages integrating into prophages: a mechanism to accumulate type III secretion effector genes and duplicate Shiga toxin-encoding prophages in Escherichia coli2021
- 著者名/発表者名
  Nakamura K, Ogura Y, Gotoh Y, Hayashi T.
- 雑誌名
  
  PLoS Pathogens
  
  巻: -
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K07116
[雑誌論文] Elucidation of the speciation history of three sister species of crown-of-thorns starfish (Acanthaster spp.) based on genomic analysis2021
- 著者名/発表者名
  Hideaki Yuasa, Rei Kajitani, Yuta Nakamura, Kazuki Takahashi, Miki Okuno, Fumiya Kobayashi, Takahiro Shinoda, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Nalinee Thongtham, Zac Forsman, Omri Bronstein, Davide Seveso, Enrico Montalbetti, Coralie Taquet, Gal Eyal, Nina Yasuda, Takehiko Itoh
- 雑誌名
  
  DNA Research
  
  巻: 28 号: 4
- DOI
  10.1093/dnares/dsab012
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03206, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Insights into the genomic evolution of insects from cricket genomes2021
- 著者名/発表者名
  Guillem Ylla, Taro Nakamura, Takehiko Itoh, Rei Kajitani, Atsushi Toyoda, Sayuri Tomonari, Tetsuya Bando, Yoshiyasu Ishimaru, Takahito Watanabe, Masao Fuketa, Yuji Matsuoka, Austen A. Barnett, Sumihare Noji, Taro Mito & Cassandra G. Extavour
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 4 号: 1 ページ: 733-733
- DOI
  10.1038/s42003-021-02197-9
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06184, KAKENHI-PROJECT-19K06691, KAKENHI-PROJECT-21K06121, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Identification of the sex-determining factor in the liverwort Marchantia polymorpha reveals unique evolution of sex chromosomes in a haploid system2021
- 著者名/発表者名
  Miyuki Iwasaki Katsuyuki T. Yamato John L. Bowman Takayuki Kohchi et al
- 雑誌名
  
  Current Biology
  
  巻: 31 号: 24 ページ: 5522-5532.e7
- DOI
  10.1016/j.cub.2021.10.023
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16166, KAKENHI-PUBLICLY-20H04884, KAKENHI-ORGANIZER-20H05778, KAKENHI-PLANNED-20H05780, KAKENHI-PROJECT-21J15550, KAKENHI-PROJECT-21K06228, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-17H07424, KAKENHI-PROJECT-22KJ1701, KAKENHI-ORGANIZER-19H05670, KAKENHI-PLANNED-19H05675
[雑誌論文] Exchange of endogenous and heterogeneous yeast terminators in Pichia pastoris to tune mRNA stability and gene expression2020
- 著者名/発表者名
  Ito Yoichiro、Terai Goro、Ishigami Misa、Hashiba Noriko、Nakamura Yasuyuki、Bamba Takahiro、Kumokita Ryota、Hasunuma Tomohisa、Asai Kiyoshi、Ishii Jun、Kondo Akihiko
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 48 号: 22 ページ: 13000-13012
- DOI
  10.1093/nar/gkaa1066
- NAID
  120006954873
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K15734, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Staphylococcus Agr virulence is critical for epidermal colonization and associates with atopic dermatitis development2020
- 著者名/発表者名
  Nakamura Y, Takahashi H, Takaya A, Inoue Y, Katayama Y, Kusuya Y, Shoji T, Takada S, Nakagawa S, Oguma R, Saito N, Ozawa N, Nakano T, Yamaide F, Dissanayake E, Suzuki S, Villaruz A, Varadarajan S, Matsumoto M, Kobayashi T, Kono M, Sato Y, Akiyama M, Otto M, Matsue H, Nunez G, Shimojo N.
- 雑誌名
  
  Sci Transl Med.
  
  巻: 8 号: 551 ページ: 4068-4068
- DOI
  10.1126/scitranslmed.aay4068
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K16138, KAKENHI-PROJECT-18K07102, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-20H03701
[雑誌論文] Dysfunctional missense variant of OAT10/SLC22A13 decreases gout risk and serum uric acid levels.2020
- 著者名/発表者名
  Higashino T, Morimoto K, Nakaoka H, Toyoda Y, Kawamura Y, Shimizu S, Nakamura T, Hosomichi K, Nakayama A, Ooyama K, Ooyama H, Shimizu T, Ueno M, Ito T, Tamura T, Naito M, Nakashima H, Kawaguchi M, Takao M, Kawai Y, Osada N, Ichida K, Yamamoto K, Suzuki H, Shinomiya N, Inoue I, Takada T, Matsuo H.
- 雑誌名
  
  Ann Rheum Dis.
  
  巻: 79(1) 号: 1 ページ: 164-166
- DOI
  10.1136/annrheumdis-2019-216044
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18KK0247, KAKENHI-PUBLICLY-19H05344, KAKENHI-PROJECT-16H01808, KAKENHI-PROJECT-17H04128, KAKENHI-PROJECT-18H02685, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PLANNED-18H05511
[雑誌論文] Differential dynamics and impacts of prophages and plasmids on the pangenome and virulence factor repertoires of Shiga toxin-producing Escherichia coli O145:H282020
- 著者名/発表者名
  Nakamura K., Murase K., Sato MP., Toyoda A., Itoh T., Mainil JG., Pierard D., Yoshino S., Kimata K., Isobe J., Seto K., Etoh Y., Narimatsu H., Saito S., Yatsuyanagi J., Lee K., Iyoda S., Ohnishi M., Ooka T., Gotoh Y., Ogura Y., Hayashi T.
- 雑誌名
  
  Microbial Genomics
  
  巻: 6 号: 1
- DOI
  10.1099/mgen.0.000323
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K07116, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Combination of KRAS and SMAD4 mutations in formalin‐fixed paraffin‐embedded tissues as a biomarker for pancreatic cancer2020
- 著者名/発表者名
  Yokose Takahiro、Kitago Minoru、Matsuda Sachiko、Sasaki Yasushi、Masugi Yohei、Nakamura Yuki、Shinoda Masahiro、Yagi Hiroshi、Abe Yuta、Oshima Go、Hori Shutaro、Yusuke Fujita、Nakano Yutaka、Endo Yutaka、Abe Kodai、Tokino Takashi、Kitagawa Yuko
- 雑誌名
  
  Cancer Science
  
  巻: 111 号: 6 ページ: 2174-2182
- DOI
  10.1111/cas.14425
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K07645, KAKENHI-PROJECT-20K08390, KAKENHI-PROJECT-17K09354, KAKENHI-PROJECT-18K08552, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Whole-exome sequencing of 79 xenografts as a potential approach for the identification of genetic variants associated with sensitivity to cytotoxic anticancer drugs2020
- 著者名/発表者名
  Udagawa Chihiro、Sasaki Yasushi、Tanizawa Yasuhiro、Suemizu Hiroshi、Ohnishi Yasuyuki、Nakamura Yasukazu、Tokino Takashi、Zembutsu Hitoshi
- 雑誌名
  
  PLOS ONE
  
  巻: 15 号: 9 ページ: e0239614-e0239614
- DOI
  10.1371/journal.pone.0239614
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K07645, KAKENHI-PROJECT-20K08390, KAKENHI-PROJECT-17K09354, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Chromatin Organization in Early Land Plants Reveals an Ancestral Association between H3K27me3, Transposons, and Constitutive Heterochromatin2020
- 著者名/発表者名
  Montgomery SA, Tanizawa Y, Galik B, Wang N, Ito T, Mochizuki T, Akimcheva S, Bowman JL, Cognat V, Drouard L, Ekker H, Houng SF, Kohchi T, Lin SS, Liu LYD, Nakamura Y, Valeeva LR, Shakirov EV, Shippen DE, Wei WL, Yagura M, Yamaoka S, Yamato KT, Liu C, Berger F.
- 雑誌名
  
  Current Biology
  
  巻: 30 号: 4 ページ: 573-588
- DOI
  10.1016/j.cub.2019.12.015
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06285, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PUBLICLY-19H04860, KAKENHI-PLANNED-19H05675, KAKENHI-PROJECT-17H07424
[雑誌論文] Characteristics of induced mutations in offspring derived from irradiated mouse spermatogonia and mature oocytes2020
- 著者名/発表者名
  Yasunari Satoh, Jun-ichi Asakawa, Mayumi Nishimura, Tony Kuo, Norio Shinkai, Harry M. Cullings, Yohei Minakuchi, Jun Sese, Atsushi Toyoda, Yoshiya Shimada, Nori Nakamura, Arikuni Uchimura
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 37-37
- DOI
  10.1038/s41598-019-56881-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19340, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Maternal almondex, a neurogenic gene, is required for proper subcellular Notch distribution in early Drosophila embryogenesis.2020
- 著者名/発表者名
  Das P., Salazar J. L., Li-Kroeger D., Yamamoto S., Nakamura M., Sasamura T., Inaki M., Masuda W., Kitagawa M., Yamakawa T., Matsuno K.
- 雑誌名
  
  Development, Growth & Differentiation
  
  巻: 62 号: 1 ページ: 80-93
- DOI
  10.1111/dgd.12639
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K07374, KAKENHI-INTERNATIONAL-15K21726, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-16K08577
[雑誌論文] Escherichia coli O8:H8 Carrying a Novel Variant of the Heat-Labile Enterotoxin LT2 Gene Caused Outbreaks of Diarrhea2020
- 著者名/発表者名
  Ishimaru Kai、Sasaki Mari、Narimatsu Hiroshi、Arimizu Yoko、Gotoh Yasuhiro、Nakamura Keiji、Hayashi Tetsuya、Ogura Yoshitoshi
- 雑誌名
  
  Open Forum Infectious Diseases
  
  巻: 7 号: 1
- DOI
  10.1093/ofid/ofaa021
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04077, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] E and ID proteins regulate cell chirality and left-right asymmetric development in Drosophila.2019
- 著者名/発表者名
  Ishibashi, T., Hatori, R., Maeda, R., Nakamura, M., Matsuyama, Y., and Matsuno, K.
- 雑誌名
  
  Genes to Cells
  
  巻: 24 (3) 号: 3 ページ: 214-230
- DOI
  10.1111/gtc.12669
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-15H05856, KAKENHI-PROJECT-16J01027, KAKENHI-INTERNATIONAL-15K21726, KAKENHI-PLANNED-15H05863, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Comparison of the sequencing bias of currently available library preparation kits for Illumina sequencing of bacterial genomes and metagenomes.2019
- 著者名/発表者名
  Sato MP, Ogura Y, Nakamura K, Nishida R, Gotoh Y, Hayashi M, Hisatsune J, Sugai M, Takehiko I, Hayashi T.
- 雑誌名
  
  DNA Res.
  
  巻: 26 号: 5 ページ: 391-398
- DOI
  10.1093/dnares/dsz017
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Malignant paraganglioma of posterior mediastinum; a case report with genetic analysis2019
- 著者名/発表者名
  Adachi Y, Mita H, Sasaki Y, Himori R, Onodera K, Nakamura M, Kikuchi T, Yamashita K, Yukinari Yoshida Y, Ishii Y, Endo T
- 雑誌名
  
  Mol Clin Oncol
  
  巻: 10 ページ: 10-16
- DOI
  10.3892/mco.2018.1758
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K09354, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia albertii: their diversity and similarity to Escherichia coli gene clusters and the development of an O-genotyping method.2019
- 著者名/発表者名
  Ooka T, Seto K, Ogura Y, Nakamura K, Iguchi A, Gotoh Y, Honda M, Etoh Y, Ikeda T, Sugitani W, Konno T, Kawano K, Imuta N, Yoshiie K, Hara-Kudo Y, Murakami K, Hayashi T, Nishi J
- 雑誌名
  
  Microb Genom
  
  巻: 5（11）号: 11
- DOI
  10.1099/mgen.0.000314
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K10118, KAKENHI-PROJECT-16H05845, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Lack of whey acidic protein (WAP) four-disulfide core domain protease inhibitor 2 (WFDC2) causes neonatal death from respiratory failure in mice.2019
- 著者名/発表者名
  Nakajima K, Ono M, Radovic U, Dizdarevic S, Tomizawa SI, Kuroha K, Nagamatsu G, Hoshi I, Matsunaga R, Shirakawa T, Kurosawa T, Miyazaki Y, Seki M, Suzuki Y, Koseki H, Nakamura M, Suda T, Ohbo K.
- 雑誌名
  
  Disease Models & Mechanisms
  
  巻: 12 ページ: 40139-40139
- DOI
  10.1242/dmm.040139
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06261, KAKENHI-PROJECT-19K23831, KAKENHI-PROJECT-18H05284, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Large-scale genome analysis of bovine commensal Escherichia coli reveals that bovine-adapted E. coli lineages are serving as evolutionary sources of the emergence of human intestinal pathogenic strains.2019
- 著者名/発表者名
  Arimizu Y, Kirino Y, Sato MP, Uno K, Sato T, Gotoh Y, Auvray F, Brugere H, Oswald E, Mainil JG, Anklam KS, Dopfer D, Yoshino S, Ooka T, Tanizawa Y, Nakamura Y, Iguchi A, Morita-Ishihara T, Ohnishi M, Akashi K, Hayashi T, Ogura Y
- 雑誌名
  
  Genome Research
  
  巻: 29 号: 9 ページ: 1495-1505
- DOI
  10.1101/gr.249268.119
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K09183, KAKENHI-PROJECT-17H04077, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] DFAST : a flexible prokaryotic genome annotation pipeline for faster genome publication2018
- 著者名/発表者名
  Y Tanizawa, T Fujisawa, Y Nakamura
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 34 号: 6 ページ: 1037-1039
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btx713
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Increasing canopy photosynthesis in rice can be achieved without a large increase in water use-a model based on free-air CO2 enrichment2018
- 著者名/発表者名
  Ikawa, H., Chen, C.P., Sikma, M., Yoshimoto, M., Sakai, H., Tokida, T., Usui, Y., Nakamura, H., Ono, K., Maruyama, M., Watanabe, T., Kuwagata, T., and Hasegawa, T.
- 雑誌名
  
  Global Change Biology
  
  巻: 24 号: 3 ページ: 1321-1341
- DOI
  10.1111/gcb.13981
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H03896, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Genomic Characterization of β-Glucuronidase?Positive Escherichia coli O157:H7 Producing Stx2a2018
- 著者名/発表者名
  Ogura Yoshitoshi、Seto Kazuko、Morimoto Yo、Nakamura Keiji、Sato Mitsuhiko P.、Gotoh Yasuhiro、Itoh Takehiko、Toyoda Atsushi、Ohnishi Makoto、Hayashi Tetsuya
- 雑誌名
  
  Emerging Infectious Diseases
  
  巻: 24 号: 12 ページ: 2219-2227
- DOI
  10.3201/eid2412.180404
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04077, KAKENHI-PROJECT-17K17933, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Genomic characterization reconfirms the taxonomic status of Lactobacillus parakefiri2017
- 著者名/発表者名
  Yasuhiro TANIZAWA, Hisami KOBAYASHI, Eli KAMINUMA, Mitsuo SAKAMOTO, Moriya OHKUMA, Yasukazu NAKAMURA, Masanori ARITA, Masanori TOHNO
- 雑誌名
  
  Biosci Microbiota Food Health.
  
  巻: 36 号: 3 ページ: 129-134
- DOI
  10.12938/bmfh.16-026
- NAID
  130005759236
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome.2017
- 著者名/発表者名
  Bowman J, Kouchi T,..(106名）..Yokoyama R, ..(4名)
- 雑誌名
  
  Cell
  
  巻: 171 号: 2 ページ: 287-304
- DOI
  10.1016/j.cell.2017.09.030
- NAID
  120006353839
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07389, KAKENHI-PROJECT-16K07398, KAKENHI-PROJECT-16K14742, KAKENHI-PROJECT-17K19374, KAKENHI-PROJECT-17K19412, KAKENHI-PROJECT-17K17595, KAKENHI-PROJECT-15KK0254, KAKENHI-INTERNATIONAL-15K21750, KAKENHI-PLANNED-15H05956, KAKENHI-PUBLICLY-16H01229, KAKENHI-PUBLICLY-16H01460, KAKENHI-PUBLICLY-17H05441, KAKENHI-PUBLICLY-17H05845, KAKENHI-WRAPUP-17H06066, KAKENHI-PLANNED-17H06472, KAKENHI-PLANNED-25113005, KAKENHI-PLANNED-25113009, KAKENHI-PROJECT-25221103, KAKENHI-PROJECT-17H01437, KAKENHI-PROJECT-15H04382, KAKENHI-PROJECT-15H04386, KAKENHI-PROJECT-15H04391, KAKENHI-PROJECT-15H04628, KAKENHI-PROJECT-17H07333, KAKENHI-PROJECT-16J04519, KAKENHI-PROJECT-15K07104, KAKENHI-PROJECT-16K13087, KAKENHI-INTERNATIONAL-15K21758, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PUBLICLY-17H05841, KAKENHI-PROJECT-17H03691, KAKENHI-PROJECT-17H03967
[雑誌論文] Protective effects of in vivo-expressed autotransporters against Bordetella pertussis infection2017
- 著者名/発表者名
  Suzuki Koichiro、Shinzawa Naoaki、Ishigaki Keisuke、Nakamura Keiji、Abe Hiroyuki、Fukui-Miyazaki Aya、Ikuta Kazuyoshi、Horiguchi Yasuhiko
- 雑誌名
  
  Microbiology and Immunology
  
  巻: 61 号: 9 ページ: 371-379
- DOI
  10.1111/1348-0421.12504
- NAID
  40021326030
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K19124, KAKENHI-PROJECT-16K19125
[雑誌論文] Comprehensive genetic exploration of selective tooth agenesis of mandibular incisors by exome sequencing2017
- 著者名/発表者名
  Yamaguchi T, Hosomichi K, Yano K, Kim Y, Nakaoka H, Kimura R, Otsuka H, Nonaka N, Haga S, Takahashi M, Shirota T, Kikkawa Y, Yamada A, Kamijo R, Park SB, Nakamura M, Maki K, Inoue I
- 雑誌名
  
  Hum Genome Variation
  
  巻: 印刷中号: 1 ページ: 17005-17005
- DOI
  10.1038/hgv.2017.5
- NAID
  120006891152
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06502, KAKENHI-PROJECT-15H02373, KAKENHI-PROJECT-15H05016, KAKENHI-PROJECT-26430195, KAKENHI-PROJECT-15K20367, KAKENHI-PROJECT-15K11051, KAKENHI-PROJECT-16K15782, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-17K19804, KAKENHI-PROJECT-17K17089, KAKENHI-PROJECT-25251043, KAKENHI-PROJECT-16K15843
[雑誌論文] Unlinking the methylome pattern from nucleotide sequence, revealed by large-scale in vivo genome engineering and methylome editing in medaka fish2017
- 著者名/発表者名
  Napo K. M. Cheung, Ryohei Nakamura, Ayako Uno, Masahiko Kumagai, Hiroto S, Fukushima, Shinichi Morishita, Hiroyuki Takeda
- 雑誌名
  
  PLOS Genetics
  
  巻: 13 号: 12 ページ: e1007123-e1007123
- DOI
  10.1371/journal.pgen.1007123
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Centromere evolution and CpG methylation during vertebrate speciation2017
- 著者名/発表者名
  Kazuki Ichikawa, Shingo Tomioka, Yuta Suzuki, Ryohei Nakamura, Koichiro Doi, Jun Yoshimura, Masahiko Kumagai, Yusuke Inoue, Yui Uchida, Naoki Irie, Hiroyuki Takeda* & Shinich Morishita*
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 1833 号: 1 ページ: 1722-1730
- DOI
  10.1038/s41467-017-01982-7
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06387, KAKENHI-PROJECT-15H05603, KAKENHI-PROJECT-15J03645, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Hypomethylated domain-enriched DNA motifs prepattern the accessible nucleosome organization in teleosts2017
- 著者名/発表者名
  Nakamura Ryohei、Uno Ayako、Kumagai Masahiko、Morishita Shinichi、Takeda Hiroyuki
- 雑誌名
  
  Epigenetics & Chromatin
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 44-44
- DOI
  10.1186/s13072-017-0152-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K20975, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] The bvg-repressed gene brtA, encoding biofilm-associated surface adhesin, is expressed during host infection by Bordetella bronchiseptica.2016
- 著者名/発表者名
  Nishikawa S, Shinzawa N, Nakamura K, Ishigaki K, Abe H, Horiguchi Y.
- 雑誌名
  
  Microbiol Immunol.
  
  巻: 60 号: 2 ページ: 93-105
- DOI
  10.1111/1348-0421.12356
- NAID
  40020747667
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860286, KAKENHI-PROJECT-26860288, KAKENHI-PROJECT-26293096, KAKENHI-PROJECT-26460525
[雑誌論文] <b>次世代シーケンサーデータの解析手法第 6 回ゲノムアセンブリ </b>2016
- 著者名/発表者名
  谷澤靖洋、神沼英里、中村保一、清水謙多郎、門田幸二
- 雑誌名
  
  日本乳酸菌学会誌
  
  巻: 27 号: 1 ページ: 41-52
- DOI
  10.4109/jslab.27.41
- NAID
  130005628247
- ISSN
  1343-327X, 2186-5833
- 言語
  日本語
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Assessing Cell-to-Cell DNA Methylation Variability on Individual Long Reads.2016
- 著者名/発表者名
  Qu W, Tsukahara T, Nakamura R, Yurino H, Hashimoto S, Tsuji S, Takeda H, Morishita S.
- 雑誌名
  
  Sci Rep.
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 21317-21317
- DOI
  10.1038/srep21317
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] DFAST and DAGA: web-based integrated genome annotation tools and resources2016
- 著者名/発表者名
  Tanizawa Y, Fujisawa T, Kamimuma E, Nakamura Y, Arita M.
- 雑誌名
  
  Bioscience of Microbiota, Food and Health
  
  巻: 35 号: 4 ページ: 173-184
- DOI
  10.12938/bmfh.16-003
- NAID
  130005250038
- ISSN
  2186-3342
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Polymorphisms Influencing Expression of Dermonecrotic Toxin in Bordetella bronchiseptica.2015
- 著者名/発表者名
  Okada K, Abe H, Ike F, Ogura Y, Hayashi T, Fukui-Miyazaki A, Nakamura K, Shinzawa N, Horiguchi Y.
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 10 号: 2 ページ: e0116604-e0116604
- DOI
  10.1371/journal.pone.0116604
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25670212, KAKENHI-PROJECT-26293096, KAKENHI-PROJECT-26460525, KAKENHI-PROJECT-26670217, KAKENHI-PROJECT-26860286
[雑誌論文] Detection of genes expressed in Bordetella bronchiseptica colonizing rat trachea by in vivo expressed-tag immunoprecipitation method.2015
- 著者名/発表者名
  Abe H, Kamitani S, Fukui-Miyazaki A, Shinzawa N, Nakamura K, and Horiguchi Y.
- 雑誌名
  
  Microbiology and Immunology
  
  巻: 印刷中号: 5 ページ: 249-261
- DOI
  10.1111/1348-0421.12247
- NAID
  40020479086
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25460529, KAKENHI-PROJECT-26460525, KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] 下気道におけるM細胞の分化機構の解明2022
- 著者名/発表者名
  木村俊介, 山田恭央, 中村有孝, 河合真悟, 長谷耕二
- 学会等名
  第6回日本骨免疫学会ウィンタースクール
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 卵を食べるシクリッドの系統的起源2022
- 著者名/発表者名
  今本南, 中村遥奈, 相原光人, 伊藤武彦, 二階堂雅人
- 学会等名
  日本動物学会関東支部第74回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 肥厚した唇を持つヴィクトリア湖シクリッドの進化史推定2022
- 著者名/発表者名
  中村遥奈, 相原光人, 伊藤武彦, 二階堂雅人
- 学会等名
  日本動物学会関東支部第74回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 微生物統合データベースMicrobeDB. jpを用いたマイクロバイオーム研究への応用2022
- 著者名/発表者名
  森宙史, 藤澤貴智, 西出浩世, 矢口貴志, 高橋弘喜, 中川善一, 山田拓司, 内山郁夫, 中村保一, 黒川顕
- 学会等名
  第16回日本ゲノム微生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Repeated translocation of a supergene underlying rapid sex chromosome turnover(転移型の性決定領域が性染色体の急速な置換をもたらす)2022
- 著者名/発表者名
  Ahammad Kabir, Risa Ieda, Sho Hosoya, Daigaku Fujikawa, Kazufumi Atsumi, Shota Tajima, Aoi Nozawa, Takashi Koyama, Shotaro Hirase, Osamu Nakamura, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Shigehiro Kuraku, Yasukazu Nakamura, Hisato Kobayashi, Atsushi Toyoda, Satoshi Tasumi, Kiyoshi Kikuchi
- 学会等名
  令和4年度日本水産学会春季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 染色体レベルゲノムアセンブルとそのDB2021
- 著者名/発表者名
  中村保一
- 学会等名
  第4回植物インフォマティクス研究会・年会(2021)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ユーストマの全ゲノム解読とDNAマーカー開発2021
- 著者名/発表者名
  川勝恭子, 豊田敦, 永野惇, 川勝泰二, 中野善公, 今村仁, 福田直子, 久松完, 山口博康, 望月孝子, 谷澤靖洋, 坂本美佳, 中村保一
- 学会等名
  日本育種学会第139回講演会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 卵泥棒の起源からシクリッドの適応放散を探る2021
- 著者名/発表者名
  今本南, 中村遥奈, 相原光人, 伊藤武彦, 二階堂雅人
- 学会等名
  第23回日本進化学会年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 菌血症における病原菌の患者内多様性の解明に向けた解析パイプラインの構築2021
- 著者名/発表者名
  園田大輝, 後藤恭宏, 西田留梨子, 下野信行, 中村佳司, 林哲也
- 学会等名
  第94回日本細菌学会総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] The genome biology of Parmales (Bolidophyceae), a sister group of diatomsThe genome biology of Parmales (Bolidophyceae), a sister group of diatoms.2021
- 著者名/発表者名
  伴広輝, 佐藤晋也, 吉川伸哉, 山田和正, 中村洋路, 一宮睦雄, 遠藤寿, Romain Blanc-Mathieu, 桑田晃, 緒方博之
- 学会等名
  Molecular life of diatoms 6
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] シリカ被殻を持つ真核藻類 : パルマ藻・珪藻の比較ゲノム解析2021
- 著者名/発表者名
  伴広輝、桑田晃、中村洋路、佐藤晋也、吉川伸哉、山田和正、一宮睦雄、緒方博之
- 学会等名
  日本藻類学会第45回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] プロファージ内プロファージによる大腸菌への3型分泌エフェクターと志賀毒素遺伝子の蓄積メカニズム2021
- 著者名/発表者名
  中村佳司、小椋義俊、後藤恭弘、林哲也
- 学会等名
  第94回日本細菌学会総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K07116
[学会発表] バイオエコノミーに資する染色体レベルゲノム情報の提供2021
- 著者名/発表者名
  中村保一
- 学会等名
  第38回日本植物バイオテクノロジー学会(つくば)大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Marpolbase : development of the genome and expression database for the liverwort Marchantia polymorphaMarpolbase : ゼニゴケのための遺伝子情報および発現量データベースの開発2021
- 著者名/発表者名
  谷澤靖洋, 川村昇吾, 矢倉勝, 坂本美佳, 望月孝子, 山岡尚平, 西浜竜一, 大和勝幸, 河内孝之, Liu, Chang, Berger, Frédéric, 中村保一
- 学会等名
  第62回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 腸管出血性大腸菌O26:H11におけるStxファージのゲノム多様性とダイナミクス2021
- 著者名/発表者名
  矢野文悟、中村佳司、谷口愛樹、後藤恭弘、小椋義俊、林哲也
- 学会等名
  第94回日本細菌学会総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K07116
[学会発表] 全ゲノムから迫るビクトリア湖産シクリッドHaplochromis sp. “matumbi hunter”の集団史2021
- 著者名/発表者名
  今本南, 中村遥奈, 相原光人, 伊藤武彦, 二階堂雅人
- 学会等名
  日本遺伝学会第93回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] プロファージ内プロファージによる大腸菌への3型分泌エフェクターと志賀毒素遺伝子の蓄積メカニズム2021
- 著者名/発表者名
  中村佳司、小椋義俊、後藤恭弘、林哲也
- 学会等名
  第15回日本ゲノム微生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K07116
[学会発表] Evolutionary history of egg hunting cichlids in Lake Victoria2021
- 著者名/発表者名
  Imamoto, M., Nakamura, H., Aibara, M., Ito, Takehiko. and Nikaido, M.
- 学会等名
  The 2nd AsiaEvo Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 宿主ショウジョウバエの発生を操作する内部寄生蜂Asobara japoniraの毒の同定を目指して2021
- 著者名/発表者名
  島田裕子, 上山拓己, 森一葉, 藤井美月, 清家和樹, 片山南美, 竹股ひとみ, 谷直紀, 中村輝, 田中裕之, 豊田敦, 伊藤武彦, 丹羽隆介
- 学会等名
  第67回トキシンシンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 微生物統合データベース MicrobeDB. jp version 3とマイクロバイオーム解析2021
- 著者名/発表者名
  森宙史、藤澤貴智、西出浩世、矢口貴志、高橋弘喜、中川善一、山田拓司、内山郁夫、中村保一、黒川顕
- 学会等名
  第15回日本ゲノム微生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 黄色ブドウ球菌はAgrのサイレンシングにより院内感染でのパーシステンスとコンピテンシーを獲得する2021
- 著者名/発表者名
  山崎由里子, 田中麻里, 楠屋陽子, 青山礼華, 大曽根義輝, 高橋弘喜, 中村悠美, 高屋明子
- 学会等名
  第94回日本細菌学会総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ユーストマの全ゲノム解読とDNAマーカー開発(学会のプレスリリース課題に選定されたとのことhttps://www.nacos.com/jsb/06/06press.html)2021
- 著者名/発表者名
  川勝恭子、豊田敦、永野惇、川勝泰二、中野善公、今村仁、福田直子、久松完、山口博康、望月孝子、谷澤靖洋、坂本美佳、中村保一
- 学会等名
  日本育種学会第139回講演会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] A hijack strategy of an endoparasitoid wasp on Drosophila larvae : Toward the Identification of venom components in Asobara japonica2021
- 著者名/発表者名
  Shimada, Yuko, Kamiyama, Takumi, Tani, Naoki, Mori, Hitoha, Katayama, Minami, Takemata, Hitomi, Fujii, Mitsuki, Kuwabara, Takayoshi, Seike, Kazuki, Nakamura, Akira, Niwa, Ryusuke
- 学会等名
  第14回日本ショウジョウバエ研究集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 様々なヘテロ接合度の生物を用いたハプロイドセット構築のためのゲノムアセンブリ手法の評価2021
- 著者名/発表者名
  望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Complete genomes of plants for smart agriculture.2021
- 著者名/発表者名
  中村保一
- 学会等名
  International Congress on Emerging Fields and Exploratory Research in Optics and Photonics 2021
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ヴィクトリア湖固有シクリッド Haplochromis sp. “matumbi hunter”の遺伝的多様性2020
- 著者名/発表者名
  今本南、中村遥奈、相原光人、伊藤武彦、二階堂雅人
- 学会等名
  日本進化学会第22回オンライン大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ヴィクトリア湖固有シクリッドHaplochromis sp. “matumbi hunter”の遺伝的多様性2020
- 著者名/発表者名
  今本南、中村遥奈、相原光人、伊藤武彦、二階堂雅人
- 学会等名
  日本進化学会第22回オンライン大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 珪藻の進化・繁栄の謎を握る未知の藻類 : パルマ藻のゲノム解析2020
- 著者名/発表者名
  桑田晃、中村洋路、斉藤憲治、伴広輝、緒方博之、佐藤晋也、吉川伸哉、一宮睦雄
- 学会等名
  日本藻類学会第44回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 志賀毒素産生性大腸菌O145:H28におけるプロファージとプラスミドのダイナミクス2020
- 著者名/発表者名
  中村佳司、村瀬一典、佐藤光彦、後藤恭宏、小椋義俊、林哲也
- 学会等名
  第14回日本ゲノム微生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K07116
[学会発表] 染色体レベルのゼニゴケ参照ゲノムの構築とゲノムデータベースの開発2020
- 著者名/発表者名
  谷澤靖洋, 矢倉勝, 坂本美佳, 望月孝子, Montgomery, Sean A., Galik, Bence, 山岡尚平, 西浜竜一, 大和勝幸, 河内孝之, Berger, Frédéric, Liu, Chang, 中村保一
- 学会等名
  第61回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 放線菌Streptomyces avermitilisのカルコフォア生産制御機構の解析2020
- 著者名/発表者名
  萩谷祥、Salvatore Cosentino、按田瑞恵、後藤恭宏、中村佳司、林哲也、岩崎渉、上田賢志、髙野英晃
- 学会等名
  日本農芸化学会2020年度大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 全ゲノム解析によるヴィクトリア湖産シクリッドにおける種特有の適応パターンの解明2020
- 著者名/発表者名
  中村遥奈、相原光人、豊田敦、伊藤武彦、二階堂雅人
- 学会等名
  日本遺伝学会第92回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Identification of Cell-Free DNA profile in oligometastatic colorectal cancer2020
- 著者名/発表者名
  Masaki Nakamura
- 学会等名
  ESTRO 2020
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ヴィクトリア湖産シクリッドHaplochromis chilotesの全ゲノム配列解析による分集団における適応過程の解明2020
- 著者名/発表者名
  中村遥奈、畑島諒、相原光人、豊田敦、伊藤武彦、二階堂雅人
- 学会等名
  日本進化学会第22回オンライン大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Chromosome-level assembly of liverwort Marchantia polymorpha and updates of the genome database MarpolBase.2020
- 著者名/発表者名
  Yasuhiro Tanizawa, Masaru Yagura, Mika Sakamoto, Takako Mochizuki, Sean A. Montgomery, Bence Galik, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama, Katsuyuki T. Yamato, Takayuki Kohchi, Yasukazu Nakamura, Chang Liu, and Freédéric Berger
- 学会等名
  Plant and Animal Genomics 2020
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Genetic factor which aggravates hyperuricemia into gout was identified by genome-wide association study2019
- 著者名/発表者名
  Yusuke Kawamura, Hirofumi Nakaoka, Akiyoshi Nakayama, Yukinori Okada, Ken Yamamoto, Hiroshi Ooyama, Shimizu Seiko, Mayuko Nakajima, Takahiro Nakamura, Masahiro Nakatochi, Mitsuhiro Yokota, TakadaTappei, Kamatani Yoichiro, Takahashi Atushi, Kenji Wakai, Michiaki Kubo, Kimiyoshi Ichida, Inoue Ituro, Nariyoshi Shinomiya, Hirotaka Matsuo
- 学会等名
  日本人類遺伝学会第64回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ゼニゴケゲノムのアップデートにまつわるetc.2019
- 著者名/発表者名
  谷澤靖洋, 矢倉勝, 望月孝子, 坂本美佳, 山岡尚平, 西浜竜一, Sean A. Montgomery, Chang Liu, Bence Galik, Frederic Berger, 大和勝幸, 河内孝之, 中村保一
- 学会等名
  第2回植物インフォマティクス研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ゼニゴケMarchantiapolymorphaと珪藻Nitzschiasp. NIES4239のゲノム解析2019
- 著者名/発表者名
  望月孝子、谷沢靖洋、中村保一, 他
- 学会等名
  第60回植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Streptomyces griseusにおけるSigK-RskA制御系を介した光誘導機構の解析2019
- 著者名/発表者名
  長束千尋, Salvatore Cosentino, 按田瑞恵, 角悟, 後藤恭宏, 中村佳司, 林哲也, 岩崎渉, 上田賢志, 髙野英晃
- 学会等名
  2019年度(第34回)日本放線菌学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] DFAST : Prokaryotic Genome Annotation Pipeline for Faster Data Submission to Public Sequence Database2019
- 著者名/発表者名
  Yasuhiro Tanizawa, Takatomo Fujisawa, Masanori Arita, and Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  ASM Microbe 2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Update of MarpolBase to accommodate ver. 5.1 gene annotation.2019
- 著者名/発表者名
  Yasuhiro Tanizawa, Masaru Yagura, Mika Sakamoto, Takako Mochizuki, Sean A. Montgomery, Bence Galik, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama, Katsuyuki T. Yamato, Takayuki Kohchi, Yasukazu Nakamura, Chang Liu, and Frédéric Berger
- 学会等名
  Marchantia Workshop 2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Intracellular evolution through loss of photosynthesis and adaptation to a heterotrophic lifestyle revealed by the genome analysis of a non-photosynthetic diatom2019
- 著者名/発表者名
  Ryoma Kamikawa, Takuro Nakayama, Daniel Moog, Takayuki Fujiwara, Ryo Onuma, Shin-ya Miyagishima, Keitaro Kume, Ugo Cenci, Bernard Henrissat, Kaori Oyama, Misako Kato, Hideaki Miyashita, Goro Tanifuji, Yasuhiro Tanizawa, Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  14th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis, Lille, France
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Mutation spectrum in the genome of offspring derived from irradiated mouse spermatogonia and mature oocytes2019
- 著者名/発表者名
  Yasunari Satoh, Mayumi Nishimura, Tony Kuo, Norio Shinkai, Harry M. Cullings, Yohei Minakuchi, Jun Sese, Atsushi Toyoda, Yoshiya Shimada, Nori Nakamura, Arikuni Uchimura
- 学会等名
  日本放射線影響学会第62回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ゼニゴケ・高密度な実験情報の集約によるモデル植物化の加速2019
- 著者名/発表者名
  中村保一
- 学会等名
  「データ駆動型植物科学最前線」第37回日本植物細胞分子生物学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 微生物ゲノムアノテーションツールDFASTの開発2019
- 著者名/発表者名
  谷沢靖洋、藤澤貴智、有田正規、中村保一
- 学会等名
  第13回ゲノム微生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Chromosome-scale assemblies are coming back.2019
- 著者名/発表者名
  Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  The Asian Bioinformatics Consortium (ABC) Symposium
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ゼニゴケMarchantia polymorphaと珪藻Nitzschia sp. NIES4239のゲノム解析2019
- 著者名/発表者名
  望月孝子, 谷澤靖洋, 山岡尚平, 西浜竜一, 金澤建彦, 上田貴志, 大和勝幸, 河内孝之, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一
- 学会等名
  第60回日本植物生理学会年会(名古屋)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 放線菌Streptomyces griseusにおけるSigK-RskA制御系を介した光誘導機構2019
- 著者名/発表者名
  長束千尋, Salvatore Cosentino, 按田瑞恵, 角悟, 後藤恭宏, 中村佳司, 林哲也, 岩崎渉, 上田賢志, 髙野英晃
- 学会等名
  第18回微生物研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 珪藻のゲノム解析支援 : ゲノムアセンブリからデータベース公開まで2019
- 著者名/発表者名
  坂本美佳, 望月孝子, 谷澤靖洋, 矢倉勝, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一
- 学会等名
  第2回植物インフォマティクス研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Database for the Chromosome-Level Assembly for a Liverwort Marchantia polymorpha2019
- 著者名/発表者名
  Nakamura, Y., Tanizawa, Y., Mochizuki, T., et al.
- 学会等名
  Plant and Animal Genomics 2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] We are ready to 10 k microbe genomes.2019
- 著者名/発表者名
  Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  A high-level CODATA data policy meeting, Beijing
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Induced mutations in offspring derived from irradiated mouse spermatogonia and mature oocytes2019
- 著者名/発表者名
  Yasunari Satoh, Jun-ichi Asakawa, Mayumi Nishimura, Harry M. Cullings, Yoshiya Shimada, Nori Nakamura, Arikuni Uchimura
- 学会等名
  The 16th International Congress of Radiation Research 2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 気管支敗血症菌を用いたボルデテラ属細菌の発咳機構の解析2018
- 著者名/発表者名
  篠田典子、中村佳司、神谷重樹、新澤直明、堀口安彦
- 学会等名
  人獣共通感染症研究拠点シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K19124
[学会発表] 精原細胞期と成熟卵母細胞期のマウス生殖細胞への放射線照射は子どものゲノムに小さなサイズの欠失とマルチサイト変異を誘発する2018
- 著者名/発表者名
  佐藤康成、Kuo Tony、瀬々潤、西村まゆみ、島田義也、中村典、内村有邦
- 学会等名
  日本放射線影響学会第61回大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ライブラリ調製キット間におけるシーケンスバイアスの比較2018
- 著者名/発表者名
  佐藤光彦, 小椋義俊, 中村佳司, 西田留梨子, 後藤恭宏, 林将大, 久恒順三, 菅井基行, 伊藤武彦, 林哲也
- 学会等名
  第12回日本ゲノム微生物学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ゼニゴケ・珪藻のゲノム解析支援 : ゲノムアセンブリからデータベース公開まで2018
- 著者名/発表者名
  望月孝子、谷沢靖洋、中村保一
- 学会等名
  第1回植物インフォマティックス研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 網羅的遺伝子構造予測自動アノテーションパイプラインの開発2018
- 著者名/発表者名
  篠田恭寛, 梶谷嶺, 小林史弥, 高橋和希, 中村優太, 湯淺英知, 伊藤武彦
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Both common and rare genetic variants of ABCG2 are risks for gout2018
- 著者名/発表者名
  Higashino T, Takada T, Nakaoka H, Toyoda Y, Stiburkova B, Miyata H, Ikebuchi Y, Nakashima H, Shimizu S, Kawaguchi M, Sakiyama M, Nakayama A, Akashi A, Tanahashi Y, Kawamura Y, Nakamura T, Wakai K, Okada R, Yamamoto K, Hosomichi K, Hosoya T, Ichida K, Ooyama H, Suzuki H, Inoue I, Merriman TR, Shinomiya N, Matsuo H.
- 学会等名
  European Human Genetics Conference 2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] O157堺株Stx2ファージの形態形成に必須な遺伝子の同定2018
- 著者名/発表者名
  金宗鉉、中村佳司、後藤恭宏、小椋義俊、林哲也
- 学会等名
  第22回腸管出血性大腸菌大腸菌感染症研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K07116
[学会発表] Genome diversity of EHEC O145:H28 and genome-wide search of high Stx2 producibility-associated genes2018
- 著者名/発表者名
  Keiji Nakamura, Kazunori Murase, Atsushi Toyoda, Takehiko Itoh, Jacques Georges Mainil, Shuji Yoshino, Keiko Kimata, Junko Isobe, Kazuko Seto, Yoshiki Etoh, Hiroshi Narimatsu, Shioko Saito, Jun Yatsuyanagi, Sunao Iyoda, Makoto Ohnishi, Tadasuke Ooka, Yasuhiro Gotoh, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi
- 学会等名
  10th International symposium on Shiga Toxin producing Escherichia coli Infections (VTEC2018)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K07116
[学会発表] 微生物ゲノムアノテーションツールDFASTの開発2018
- 著者名/発表者名
  谷沢靖洋、藤澤貴智、中村保一
- 学会等名
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Marpolbase : Construction of the Marchantia polymorpha Genome Database2018
- 著者名/発表者名
  Takako Mochizuki, Yasuhiro Tanizawa, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama, Takehiko Kanazawa, Takashi Ueda, Katsuyuki T, Yamato, Takayuki Kohchi, and Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  EMBO Workshop
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] MarpolBase : Construction of the Marchantia polymorpha Genome Database2018
- 著者名/発表者名
  Takako Mochizuki, Yasuhiro Tanizawa, Hideki Nagasaki, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama, Takehiko Kanazawa, Takashi Ueda, Katsuyuki T. Yamato, Takayuki Kohchi, and Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  Plant and Animal Genome XXVI
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Development of Marchantia Gene Nomenclature Database2018
- 著者名/発表者名
  Yasuhiro Tanizawa, Takako Mochizuki, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama, Takehiko Kanazawa, Takashi Ueda, Katsuyuki T. Yamato, Takayuki Kohchi, and Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  EMBO Workshop
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Screening for the Bordetella dermonecrotic toxin receptor2018
- 著者名/発表者名
  照屋志帆乃、福井理、中村佳司、新澤直明、堀口安彦
- 学会等名
  第91回日本細菌学会総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K19124
[学会発表] THE COMPLETE GENOME OF A NON-PHOTOSYNTHETIC DIATOM AND ITS PLASTIDAL SULFOLIPID BIOSYNTHESIS2018
- 著者名/発表者名
  Kamikawa R, Oyama K, Tanizawa Y, Mochizuki T, Nakayama T, Tanifuji, G, Nakamura Y, Kato M, Miyashita H
- 学会等名
  ISOP/PSA
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ライブラリ調製キット間におけるシーケンスバイアスの比較2018
- 著者名/発表者名
  佐藤光彦, 小椋義俊, 中村佳司, 西田留梨子, 後藤恭宏, 林将大, 久恒順三, 菅井基行, 伊藤武彦, 林哲也
- 学会等名
  第91回日本細菌学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] MarpolBase : ゼニゴケゲノムデータベースの構築2018
- 著者名/発表者名
  望月孝子、谷澤靖洋、長崎英樹、山岡尚平、西浜竜一、金澤建彦、上田貴志、大和勝幸、河内孝之、中村保一
- 学会等名
  第59回日本植物生理学会年会(札幌)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Towards Better Genome Annotation.2017
- 著者名/発表者名
  Yasuhiro Tanizawa and Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  Symposium on "Genome Evolution at Mishima"(GEM)
- 発表場所
  三島
- 年月日
  2017-03-27
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Biology of a picoeukaryotic phytoplankton, Parmales(Bolidophyceae), a sister group of diatoms2017
- 著者名/発表者名
  桑田晃, 一宮睦雄, 吉川伸哉, 山田和正, 河地正伸, Mary-Hélène Noël, 斉藤憲治, 中村洋路, 沢田健, Adriana Lopes dos Santos, Daniel Vaulot
- 学会等名
  The IVth International Conference "Molecular Life of Diatoms"
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Morphological and transcriptome analysis in cell wall formation of Triparma laevis2017
- 著者名/発表者名
  吉川伸哉, 佐藤晋也, 山崎誠司, 山田和正, 一宮睦雄, 斉藤憲治, 中村洋路, 佐藤直樹, 桑田晃
- 学会等名
  The IVth International Conference "Molecular Life of Diatoms"
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Bacterial genome annotation web-platform DFAST : Toward faster genome publication2017
- 著者名/発表者名
  Y Tanizawa, T Fujisawa, M Arita, Y Nakamura
- 学会等名
  NIG International Symposium 2017 Commemorationg the 30th Anniversary of DDBJ. Life, Environment, and Evolution Revealed by Genomes
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] DFAST : a flexible prokaryotic genome annotation pipeline for faster genome publication2017
- 著者名/発表者名
  Y Tanizawa, T Fujisawa, Y Nakamura
- 学会等名
  The 28th International Conference on Genome Informatics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] MarpolBase : Genome Database for Marchantia polymorpha2017
- 著者名/発表者名
  Y Tanizawa, T Mochizuki, Y Nakamura
- 学会等名
  The 65th NIBB Conference : Renaissance of Marchantia polymorpha
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] パルマ藻Triparma Iaevisの細胞壁形成機構の解析2017
- 著者名/発表者名
  吉川伸哉, 佐藤晋也, 山崎誠司, 一柳紀凛, 山田和正, 一宮睦雄, 斉藤憲治, 中村洋路, 佐藤直樹, 桑田晃
- 学会等名
  日本植物学会第81回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Genome-wide association study of clinically defined gout and subtypes identifies multiple susceptibility loci including transporter genes.2017
- 著者名/発表者名
  Hirotaka Matsuo, Nakayama Akiyoshi, Hirofumi Nakaoka, Ken Yamamoto, Masayuki Sakiyama, Amara Shaukat, Yu Toyoda, Yukinori Okada, Yoichiro Kamatani, Masahiro Nakatochi, Takahiro Nakamura, Tappei Takada, Katsuhisa Inoue, Hiroshi Nakashima, Seiko Shimizu, Kawaguchi Makoto, Asahi Hishida, Kenji Wakai, Blanka Stiburkova, Lisa K. Stamp, Nicola Dalbeth, Tatsuo Hosoya, Ituro Inoue, Atsushi Takahashi, Michiaki Kubo, Hiroshi Ooyama, Toru Shimizu, Kimiyoshi Ichida, Tony R. Merriman, Nariyoshi Shinomiya
- 学会等名
  67th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ライブラリ調製キットNextera XTによるシーケンスバイアスと細菌のGC含量の関係2017
- 著者名/発表者名
  佐藤光彦, 小椋義俊, 中村佳司, 西田留梨子, 後藤恭宏, 久恒順三, 菅井基行, 伊藤武彦, 林哲也
- 学会等名
  NGS現場の会第5回研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Bacterial genome annotation web-platform DFAST-Toward faster genome publication.2017
- 著者名/発表者名
  Yasuhiro Tanizawa and Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  Advanced Genome Science International Symposium “The Start of New Genomics”
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2017-01-10
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ボルデテラ壊死毒（DNT）の細胞受容体同定2017
- 著者名/発表者名
  照屋志帆乃、福井理、中村佳司、新澤直明、堀口安彦
- 学会等名
  第70回日本細菌学会関西支部総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K19124
[学会発表] in vivo RNA-seq reveals novel antigens against Bordetella pertussis infection2017
- 著者名/発表者名
  鈴木孝一朗、新澤直明、元岡大祐、中村昇太、石垣佳祐、生田和良、山西弘一、堀口安彦
- 学会等名
  第90回日本細菌学会総会
- 発表場所
  仙台市、宮城県
- 年月日
  2017-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] 百日咳の病態発生機序解明に向けた感染動物モデルの確立2016
- 著者名/発表者名
  中村佳司、神谷重樹、安倍裕順、新澤直明、堀口安彦
- 学会等名
  第89回日本細菌学会総会
- 発表場所
  大阪府大阪市　大阪国際交流センター
- 年月日
  2016-03-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860288
[学会発表] 百日咳菌が産生するアデニレートサイクラーゼ毒素は気道の組織障害を引き起こす2016
- 著者名/発表者名
  福井理、戸嶋ひろ野、新澤直明、中村佳司、安倍裕順、堀口安彦
- 学会等名
  第89回日本細菌学会総会
- 発表場所
  大阪（大阪国際交流センター）
- 年月日
  2016-03-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] In vivo RNA-seq revealed infection-linked expression pattern of Bordetella pertussis within host2016
- 著者名/発表者名
  新澤直明、鈴木孝一朗、元岡大祐、中村昇太、堀口安彦
- 学会等名
  第89回日本細菌学会総会
- 発表場所
  大阪（大阪国際交流センター）
- 年月日
  2016-03-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] アデニレートサイクラーゼ毒素（ACT）の作用がボルデテラ属細菌の感染に及ぼす影響2016
- 著者名/発表者名
  福井理、戸嶋ひろ野、新澤直明、中村佳司、安倍裕順、堀口安彦
- 学会等名
  第63回トキシンシンポジウム
- 発表場所
  天童市、山形県
- 年月日
  2016-07-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] 百日咳の病態発生機序解明に向けた感染動物モデルの確立2016
- 著者名/発表者名
  中村佳司、神谷重樹、安倍裕順、新澤直明、堀口安彦
- 学会等名
  第89回日本細菌学会総会
- 発表場所
  大阪（大阪国際交流センター）
- 年月日
  2016-03-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] 百日咳菌が産生するアデニレートサイクラーゼ毒素は気道の組織障害を引き起こす2016
- 著者名/発表者名
  福井理、戸嶋ひろ野、新澤直明、中村佳司、安倍裕順、堀口安彦
- 学会等名
  第89回日本細菌学会総会
- 発表場所
  大阪府大阪市　大阪国際交流センター
- 年月日
  2016-03-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860288
[学会発表] Analysis of roles of pertussis toxin in infection2016
- 著者名/発表者名
  新居祐規、中村佳司、鈴木孝一朗、安倍裕順、新澤直明、堀口安彦
- 学会等名
  第89回日本細菌学会総会
- 発表場所
  大阪府大阪市　大阪国際交流センター
- 年月日
  2016-03-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860288
[学会発表] Analysis of roles of pertussis toxin in infection2016
- 著者名/発表者名
  新居祐規、中村佳司、鈴木孝一朗、安倍裕順、新澤直明、堀口安彦
- 学会等名
  第89回日本細菌学会総会
- 発表場所
  大阪（大阪国際交流センター）
- 年月日
  2016-03-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] Seeking novel antigens against Bordetella pertussis infection2016
- 著者名/発表者名
  鈴木孝一朗、新澤直明、中村佳司、堀口安彦
- 学会等名
  第89回日本細菌学会総会
- 発表場所
  大阪府大阪市　大阪国際交流センター
- 年月日
  2016-03-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860288
[学会発表] Seeking novel antigens against Bordetella pertussis infection2016
- 著者名/発表者名
  鈴木孝一朗、新澤直明、中村佳司、堀口安彦
- 学会等名
  第89回日本細菌学会総会
- 発表場所
  大阪（大阪国際交流センター）
- 年月日
  2016-03-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] 気管支敗血症菌のバイオフィルム関連付着因子brtAはBvg抑制遺伝子でありながら宿主感染時に発現している2015
- 著者名/発表者名
  西川明芳、新澤直明、中村佳司、石垣佳祐、安倍裕順、堀口安彦
- 学会等名
  第68回日本細菌学会関西支部総会
- 発表場所
  京都府京都市　京都薬科大学
- 年月日
  2015-11-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860288
[学会発表] 気管支敗血症菌のバイオフィルム関連付着因子brtAはBvg抑制遺伝子でありながら宿主感染時に発現している2015
- 著者名/発表者名
  西川明芳、新澤直明、中村佳司、石垣佳祐、安倍裕順、堀口安彦
- 学会等名
  第9回細菌学若手コロッセウム
- 発表場所
  鹿児島県鹿児島市　KKRホテル敬天閣
- 年月日
  2015-11-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860288
[学会発表] 百日咳の病態発生機序解明に向けた感染動物モデルの確立2015
- 著者名/発表者名
  中村佳司、神谷重樹、安倍裕順、新澤直明、堀口安彦
- 学会等名
  第9回細菌学若手コロッセウム
- 発表場所
  鹿児島県鹿児島市　KKRホテル敬天閣
- 年月日
  2015-11-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860288
[学会発表] Adenylate cyclase toxin from B. pertussis but not B. bronchiseptica causes tracheal tissue damage during infection2015
- 著者名/発表者名
  A. Fukui-Miyazaki, H. Toshiba, N. Shinzawa, K. Nakamura, H. Abe, Y. Horiguchi
- 学会等名
  第68回日本細菌学会関西支部総会
- 発表場所
  京都（京都薬科大学）
- 年月日
  2015-11-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] 気管支敗血症菌のバイオフィルム関連付着因子brtAはBvg抑制遺伝子でありながら宿主感染時に発現している2015
- 著者名/発表者名
  西川明芳、新澤直明、中村佳司、石垣佳祐、安倍裕順、堀口安彦
- 学会等名
  第9回細菌学若手コロッセウム
- 発表場所
  鹿児島県（KKRホテル敬天閣）
- 年月日
  2015-11-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] 気管支敗血症菌のバイオフィルム関連付着因子brtAはBvg抑制遺伝子でありながら宿主感染時に発現している2015
- 著者名/発表者名
  西川明芳、新澤直明、中村佳司、石垣佳祐、安倍裕順、堀口安彦
- 学会等名
  第68回日本細菌学会関西支部総会
- 発表場所
  京都（京都薬科大学）
- 年月日
  2015-11-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] Adenylate cyclase toxin from B. pertussis but not B. bronchiseptica causes tracheal tissue damage during infection2015
- 著者名/発表者名
  A. Fukui-Miyazaki, H. Toshima, N. Shinzawa, K. Nakamura, H. Abe, Y. Horiguchi
- 学会等名
  第68回日本細菌学会関西支部総会
- 発表場所
  京都府京都市　京都薬科大学
- 年月日
  2015-11-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860288
[学会発表] 百日咳の病態発生機序解明に向けた感染動物モデルの確立2015
- 著者名/発表者名
  中村佳司
- 学会等名
  第9回細菌学若手コロッセウム
- 発表場所
  鹿児島県（KKRホテル敬天閣）
- 年月日
  2015-11-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096
[学会発表] ボルデテラ壊死毒（DNT）の細胞受容体探索
- 著者名/発表者名
  照屋志帆乃中村佳司福井理安倍裕順新澤直明堀口安彦
- 学会等名
  第88回日本細菌学会総会
- 発表場所
  岐阜県（長良川国際会議場）
- 年月日
  2015-03-26 – 2015-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293096

1. 堀口安彦 (00183939)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 12件
2. 新澤直明 (10583015)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 12件
3. 小椋義俊 (40363585)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 6件
4. 小原雄治 (70135292)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 加藤和人 (10202011)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
6. 川嶋実苗 (00396706)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 豊田敦 (10267495)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 9件
8. 鈴木穣 (40323646)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
9. 三井純 (70579862)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 林哲也 (10173014)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 9件
11. 時野隆至 (40202197)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
12. 黒川顕 (20343246)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
13. 中村保一 (60370920)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 80件
14. 野口英樹 (50333349)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 岩崎渉 (50545019)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
16. 森下真一 (90292854)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
17. 浅井潔 (30356357)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 笠原雅弘 (60376605)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 伊藤武彦 (90501106)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 20件
20. 山田拓司 (10437262)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 9件
21. 久原哲 (00153320)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 高橋弘喜 (60548460)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
23. 榊原康文 (10287427)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. 浜田道昭 (00596538)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
25. 高木利久 (30110836)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. 瀬々潤 (40361539)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
27. 位田隆一 (40127543)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
28. 山縣然太朗 (10210337)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
29. 増井徹 (50150082)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
30. 武藤香織 (50345766)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
31. 児玉聡 (80372366)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
32. 瀬戸山晃一 (00379075)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
33. 小門穂 (20706650)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
34. 大橋範子 (50739430)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
35. 藤山秋佐夫 (60142311)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
36. 井ノ上逸朗 (00192500)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
37. 中岡博史 (70611193)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
38. 菅野純夫 (60162848)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
39. 辻省次 (70150612)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
40. 後藤恭宏 (20558358)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 8件
41. 奥野未来 (30814462)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
42. 仲瀬裕志 (60362498)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
43. 佐々木泰史 (70322328)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
44. 井戸川雅史 (00404749)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
45. 丹下正一朗 (40571211)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
46. 森宙史 (40610837)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 8件
47. 小笠原理 (00435512)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
48. 谷澤靖洋 (90836511)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 28件
49. 近藤伸二 (30415161)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
50. 木立尚孝 (80415778)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
51. 梶谷嶺 (40756706)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
52. 田代康介 (00192170)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
53. フリスマーティン (40462832)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
54. 平川英樹 (80372746)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
55. 鈴木拓 (20381254)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
56. 能正勝彦 (10597339)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
57. 甲斐正広 (80260777)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
58. 澤口朗 (30336292)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
59. 安倍裕順

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
60. 中野泰至

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
61. 桑形恒男

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
62. 松尾洋孝

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
63. 笹野哲郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
64. 細道一善

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
65. 大岡唯祐

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
66. 永松剛

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
67. 入江直樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
68. 石原朋子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
69. 中村泰之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
70. 二階堂雅人

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
71. 中村匡希

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
72. 横山隆亮

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
73. 中山昌喜

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
74. 松野健治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
75. 伊豫田淳

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
76. 伊川浩樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
77. 高田龍平

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
78. 豊田優

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
79. 市田公美

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
80. 堀井新

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
81. 高橋奈央

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
82. 西順一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
83. 藺牟田直子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
84. 山岡尚平

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
85. 内村有邦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
86. 中村遼平

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
87. 板東哲哉

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
88. 神谷重樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
89. 北川元生

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
90. 増田渉

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

中村 佳司 Nakamura Keiji

研究課題

研究成果

共同研究者

腸管出血性大腸菌における自発的プロファージ誘導の抑制機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

大規模ゲノム情報を利用した大腸菌における血清型変換の全貌解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

腸管出血性大腸菌におけるプロファージ間相互作用と宿主菌進化へのインパクトの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

百日咳における発作性咳嗽に関連する菌側遺伝子の機能解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

長鎖DNA断片導入による、汎用実験動物に感染する百日咳菌の作出

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

気管支敗血症菌の新規病原因子の解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

百日咳における咳嗽発作の発症メカニズムの解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] Methods in Molecular Biology, Gene Prediction2019

著者名/発表者名

ページ

総ページ数

出版者

データソース

[図書] Gene Prediction Methods and Protocols2019

著者名/発表者名

ページ

総ページ数

出版者

データソース

[図書] 次世代シークエンサーDRY解析教本 改訂第2版2019

著者名/発表者名

ページ

総ページ数

出版者

データソース

[図書] もっとよくわかる! 腸内細菌叢～健康と疾患を司る“もう1つの臓器”(実験医学別冊 もっとよくわかる! シリーズ)2019

著者名/発表者名

ページ

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] Global population structure, genomic diversity and carbohydrate fermentation characteristics of clonal complex 119 (CC119), an understudied Shiga toxin-producing E. coli (STEC) lineage including O165:H25 and O172:H252023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

中村佳司 Nakamura Keiji

[図書] 次世代シークエンサーDRY解析教本改訂第2版2019

[図書] もっとよくわかる! 腸内細菌叢～健康と疾患を司る“もう1つの臓器”(実験医学別冊もっとよくわかる! シリーズ)2019