玉田嘉紀 Tamada Yoshinori

研究者番号	80435495
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 弘前大学, 医学研究科, 教授 2025年度: 京都大学, 医学研究科, 特定准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2024年度: 弘前大学, 医学研究科, 教授 2019年度: 東京大学, 情報理工学(系)研究科, 助教 2016年度: 東京大学, 医科学研究所, 特任講師 2015年度: 東京大学, 大学院情報理工学系研究科, 助教 2012年度 – 2015年度: 東京大学, 情報理工学(系)研究科, 助教 2014年度: 東京大学, 大学院情報理工学研究科, 助教 2011年度: 東京大学, 情報理工学系研究科, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 知能情報学研究代表者以外複合領域 / 小区分63040:環境影響評価関連 / 小区分58080:高齢者看護学および地域看護学関連 / 小区分58030:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含まない
キーワード	研究代表者ベイジアンネットワーク / 遺伝子ネットワーク推定 / 連合学習 / MCMC / ベイジアンネットワーク推定 / 大規模並列計算 / 最適DAG探索アルゴリズム / 並列アルゴリズム / グラフ探索アルゴリズム研究代表者以外機械学習 … もっと見る / 人工知能 / 統計的モデリング / バイオインフォマティクス / システム生物学 / がん / 予測手法 / 発生毒性 / 因果探索 / 化学物質 / 行動変容 / ヘルスリテラシー / 非アルコール性脂肪性肝疾患 / アルコール性肝疾患 / 予兆モデル / スクリーニング / 縦断調査 / NAFLD / ALD / 特定健診項目 / 脂肪肝 / 非侵襲的スクリーニング / 横断調査 / 疫学調査 / MRI / 疫学 / 変形性膝関節症 / 予後予測 / 早期 / 変経性膝関節症 / シークエンス解析 / 遺伝子ネットワーク / スーパーコンピュータ / 遺伝統計学 / ゲノム科学隠す

機械学習を用いた因果探索による化学物質の発生毒性の革新的な予測手法の開発
- 研究代表者
  
  福田秀子 (曽根秀子)
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分63040:環境影響評価関連
- 研究機関
  横浜薬科大学
人工知能による予後予測精度の高い早期変形性膝関節症診断基準作成にむけた疫学研究
- 研究代表者
  
  佐々木英嗣
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分58030:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含まない
- 研究機関
  弘前大学
ヘルスリテラシーを高め行動変容を促すALD・NAFLD予兆モデルの社会実装試行
- 研究代表者
  
  本村純
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分58080:高齢者看護学および地域看護学関連
- 研究機関
  名桜大学
連合学習による生体分子ネットワーク推定法の研究研究代表者
- 研究代表者
  
  玉田嘉紀
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  弘前大学
大規模ベイジアンネットワーク構造探索並列アルゴリズムの研究研究代表者
- 研究代表者
  
  玉田嘉紀
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2016
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  知能情報学
- 研究機関
  東京大学
スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索
- 研究代表者
  
  宮野悟
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2019
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  東京大学
計算とシミュレーションによるがんシステム学の創成
- 研究代表者
  
  宮野悟
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2014
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  東京大学

すべて 2023 2022 2020 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Variant analysis of prostate　cancer in Japanese patients and a new attempt to predict related biological　pathways2020
- 著者名/発表者名
  Kasajima R, Yamaguchi R, Shimizu E, Tamada Y, Niida A, Tremmel G, Kishida T,Aoki I, Imoto S, Miyano S, Uemura H, Miyagi Y
- 雑誌名
  
  Oncol Rep.
  
  巻: 43(3) ページ: 943-952
- DOI
  10.3892/or.2020.7481
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912
[雑誌論文] 「京」を使った大規模データ解析によるがんのシステム異常の網羅的解析2016
- 著者名/発表者名
  宮野悟, 伊東聰, Heewon Park, 白石友一, 島村徹平, 玉田嘉紀, 井元清哉
- 雑誌名
  
  実験医学増刊
  
  巻: 34 ページ: 733-738
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20965
[雑誌論文] Efficient Parallel Algorithm for Optimal DAG Structure Search on Parallel Computer with Torus Network2016
- 著者名/発表者名
  H. Honda, Y. Tamada, R. Suda
- 雑誌名
  
  Lecture Notes in Computer Science
  
  巻: 10048 ページ: 483-502
- DOI
  10.1007/978-3-319-49583-5_37
- ISBN
  9783319495828, 9783319495835
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20965
[雑誌論文] The hnRNP-Htt axis regulates necrotic cell death induced by transcriptional repression through impaired RNA splicing2016
- 著者名/発表者名
  Y. Mao, T. Tamura, Y. Yuki, D. Abe, Y. Tamada, S. Imoto, H. Tanaka, H. Homma, K. Tagawa, S. Miyano and H. Okazawa
- 雑誌名
  
  Cell Death and Disease
  
  巻: 7 号: 4 ページ: e2207-e2207
- DOI
  10.1038/cddis.2016.101
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20965, KAKENHI-PROJECT-16H02655
[雑誌論文] Oncogenic roles of TOPK and MELK, and effective growth suppression by small molecular inhibitors in kidney cancer cells2015
- 著者名/発表者名
  T. Kato, H. Inoue, S. Imoto, Y. Tamada, T. Miyamoto, Y. Matsuo, Y. Nakamura and J.H. Park
- 雑誌名
  
  Oncotarget
  
  巻: 7 号: 14 ページ: 17652-17664
- DOI
  10.18632/oncotarget.7755
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20965, KAKENHI-PLANNED-15H05912
[雑誌論文] Elevated β-catenin pathway as a novel target for patients with resistance to EGF receptor targeting drugs2015
- 著者名/発表者名
  Nakata A, Yoshida R, Yamaguchi R, Yamauchi M, Tamada Y, Fujita A, Shimamura T, Imoto S, Higuchi T, Nomura M, Kimura T, Nokihara H, Higashiyama M, Kondoh K, Nishihara H, Tojo A, Yano S, Miyano S, Gotoh N
- 雑誌名
  
  Scientific Report
  
  巻: 5 号: 1 ページ: 13076-13076
- DOI
  10.1038/srep13076
- NAID
  120005764206
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15K18426, KAKENHI-PROJECT-15K20965, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H04294, KAKENHI-PROJECT-26640072, KAKENHI-PROJECT-25730173
[雑誌論文] Lung adenocarcinoma subtypes definable by lung development-related miRNA expression profiles in association with clinicopathologic features2014
- 著者名/発表者名
  Arima C, Kajino T, Tamada Y, Imoto S, Shimada Y, Nakatochi M, Suzuki M, Isomura H, Yatabe Y, Yamaguchi T, Yanagisawa K, Miyano S, Takahashi T
- 雑誌名
  
  Carcinogenesis
  
  巻: 35(10) ページ: 2224-2231
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Vasohibin-1 is identified as a master-regulator of endothelial cell apoptosis using gene network analysis2013
- 著者名/発表者名
  Affara M, Sanders D, Araki H, Tamada Y, Dunmore B, Humphreys S, Imoto S, Savoie C, Miyano S, Kuhara S, Print C, Charnock-Jones DS
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 14(1) 号: 1 ページ: 23-23
- DOI
  10.1186/1471-2164-14-23
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22300099, KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Cell cycle gene networks are associated with melanoma prognosis2012
- 著者名/発表者名
  Wang L, Hurley D, Watkins W, Araki H, Tamada Y, Muthukaruppan A, Ranjard L, Derkac E, Imoto S, Miyano S, Crampin E, Print C
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 7(4) 号: 4 ページ: e34247-e34247
- DOI
  10.1371/journal.pone.0034247
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22300099, KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Gene network inference and visualization tools for biologists: application to new human transcriptome datasets2012
- 著者名/発表者名
  Hurley D, Araki H, Tamada Y, （４名）, Imoto S, Yasuda K, Tomiyasu Y, Tashiro K, Savoie C, Cho V, Smith S, Kuhara S, Miyano S, Charnock-Jones DS, Crampin EJ, Print CG
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res
  
  巻: 40(6) 号: 6 ページ: 2377-2398
- DOI
  10.1093/nar/gkr902
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Computational gene network analysis reveals TNF-induced angiogenesis2012
- 著者名/発表者名
  Ogami K, Yamaguchi R, Imoto S, Tamada Y, Araki H, Print C, Miyano S
- 雑誌名
  
  BMC Systems Biology
  
  巻: 6(Supple 2) 号: S2
- DOI
  10.1186/1752-0509-6-s2-s12
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700292, KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] SiGN : large-scale gene network estimation environment for high performance computing2011
- 著者名/発表者名
  Tamada Y, Shimamura T, Yamaguchi R, Imoto S, Nagasaki M, Miyano S
- 雑誌名
  
  Genome Informatics
  
  巻: 25 ページ: 40-52
- NAID
  130004567842
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] SiGN-SSM : open source parallel software for estimating gene networks with state space models2011
- 著者名/発表者名
  Tamada Y, Yamaguchi R, Imoto S, Hirose O, Yoshida R, Nagasaki M, Miyano S
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 27(8) 号: 8 ページ: 1172-1173
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btr078
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PROJECT-22300099, KAKENHI-PROJECT-22700308, KAKENHI-PROJECT-23700346
[雑誌論文] Parallel algorithm for learning optimal Bayesian network structure2011
- 著者名/発表者名
  Tamada Y, Imoto S, Miyano S
- 雑誌名
  
  J Machine Learning Research
  
  巻: 12 ページ: 2437-2459
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Estimating genome-wide gene networks using nonparametric Bayesian network models on massively parallel computers2011
- 著者名/発表者名
  Tamada Y, Imoto S, Araki H, Nagasaki M, Print C, Charnock-Jones DS, Miyano S
- 雑誌名
  
  IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
  
  巻: 8(3) 号: 3 ページ: 683-697
- DOI
  10.1109/tcbb.2010.68
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Collocation-based sparse estimation for constructing dynamic gene networks2010
- 著者名/発表者名
  Shimamura, T., Imoto, S., Nagasaki, M., Yamauchi, M., Yamaguchi, R., Fujita, A., Tamada, Y, Gotoh, N., Miyano, S.
- 雑誌名
  
  Genome Informatics
  
  巻: 24 ページ: 164-178
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[学会発表] INGOR / SiGN-BN - Gene Network Estimation Software2023
- 著者名/発表者名
  玉田嘉紀, 中澤麻衣, 太田可純, 原田陽平, 藤本健二, 鎌田真由美, 奥野恭史
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 (IIBMP 2023)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12238
[学会発表] A novel method for gene knockdown simulation using Markov chain Monte Carlo methods (MCMC)2023
- 著者名/発表者名
  中澤麻衣, 玉田嘉紀, 奥野恭史
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 (IIBMP 2023)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12238
[学会発表] シングル・サンプル遺伝子ネットワーク推定＆解析技術2022
- 著者名/発表者名
  Yoshinori Tamada
- 学会等名
  第11回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP 2022)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12238
[学会発表] Cancer Genome Research with Gene Network Analysis using Bayesian Networks2015
- 著者名/発表者名
  Y. Tamada
- 学会等名
  The second Workshop on Advanced Methodologies for Bayesian Networks
- 発表場所
  Hiyoshi Campus, Keio University, 神奈川県横浜市
- 年月日
  2015-11-18
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20965
[学会発表] The Cancer Network Galaxy: A Database of Cancer Gene Networks Estimated by SiGN-BN with K2015
- 著者名/発表者名
  Y. Tamada, G. Tremmel, A. Niida, R. Yamaguchi, S. Imoto, and S. Miyano
- 学会等名
  Supercomputational Life Science 2015
- 発表場所
  Takeda Hall, The University of Tokyo, 東京都文京区
- 年月日
  2015-10-20
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20965

1. 宮野悟 (50128104)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 10件
2. 井元清哉 (10345027)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 10件
3. 山口類 (90380675)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 6件
4. 白石友一 (70516880)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
5. 島村徹平 (00623943)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
6. 長崎正朗 (90396862)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
7. 樋口知之 (70202273)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 茅野光範 (20590095)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 後藤典子 (10251448)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
10. PARK HEEWON (70756642)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 新井田厚司 (00772493)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
12. 片山琴絵 (40581195)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 張耀中 (60817138)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 佐々木英嗣 (60587038)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 中路重之 (10192220)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 千葉大輔 (70587055)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 石橋恭之 (80292142)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 石橋恭太 (80898388)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 本村純 (50632999)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 奥野恭史 (20283666)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 花城和彦 (20284961)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 池松真也 (40442488)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 神谷義人 (50812830)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. 砂川昌範 (70325835)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
25. 奥本正 (70330727)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. 立津慶幸 (70833911)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
27. 島康貴 (60838556)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
28. 内野詠一郎 (20820905)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
29. 中澤麻衣 (90971599)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
30. 福田秀子 (60280715)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
31. 加藤毅 (40401236)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

玉田 嘉紀 Tamada Yoshinori

研究課題

研究成果

共同研究者

機械学習を用いた因果探索による化学物質の発生毒性の革新的な予測手法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

人工知能による予後予測精度の高い早期変形性膝関節症診断基準作成にむけた疫学研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ヘルスリテラシーを高め行動変容を促すALD・NAFLD予兆モデルの社会実装試行

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

連合学習による生体分子ネットワーク推定法の研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

大規模ベイジアンネットワーク構造探索並列アルゴリズムの研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

計算とシミュレーションによるがんシステム学の創成

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Variant analysis of prostate cancer in Japanese patients and a new attempt to predict related biological pathways2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 「京」を使った大規模データ解析によるがんのシステム異常の網羅的解析2016

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Efficient Parallel Algorithm for Optimal DAG Structure Search on Parallel Computer with Torus Network2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISBN

データソース

[雑誌論文] The hnRNP-Htt axis regulates necrotic cell death induced by transcriptional repression through impaired RNA splicing2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Oncogenic roles of TOPK and MELK, and effective growth suppression by small molecular inhibitors in kidney cancer cells2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Elevated β-catenin pathway as a novel target for patients with resistance to EGF receptor targeting drugs2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Lung adenocarcinoma subtypes definable by lung development-related miRNA expression profiles in association with clinicopathologic features2014

著者名/発表者名

雑誌名

玉田嘉紀 Tamada Yoshinori

[雑誌論文] Variant analysis of prostate　cancer in Japanese patients and a new attempt to predict related biological　pathways2020