• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

井元 清哉  Imoto Seiya

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 10345027
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 東京大学, 医科学研究所, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2015年度 – 2025年度: 東京大学, 医科学研究所, 教授
2007年度 – 2015年度: 東京大学, 医科学研究所, 准教授
2008年度: 東京大学, 医科学研究所・ヒトゲノム解析センター, 准教授
2007年度: 東京大学, 医科学研究所, 助教
2007年度: 東京大学, 医科学研究所・ヒトゲノム研究系, 准教授 … もっと見る
2006年度: 東京大学, 医科学研究所, 助教授
2005年度 – 2006年度: 東京大学, 医科学研究所・ヒトゲノム解析センター, 助手
2003年度 – 2005年度: 東京大学, 医科学研究所, 助手 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
統計科学 / 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 生命・健康・医療情報学 / 生体生命情報学
研究代表者以外
生体生命情報学 / 複合領域 / 生物系 / 小区分56030:泌尿器科学関連 / 小区分49020:人体病理学関連 / 中区分54:生体情報内科学およびその関連分野 … もっと見る / 中区分56:生体機能および感覚に関する外科学およびその関連分野 / 小区分49030:実験病理学関連 / 小区分55020:消化器外科学関連 / 統計科学 / 中区分53:器官システム内科学およびその関連分野 / 複雑系疾病論 / 生命・健康・医療情報学 / 知能情報学 / 統計科学 隠す
キーワード
研究代表者
ベイズモデル / HLA / 多変量解析 / ベイジアンネットワーク / ノンパラメトリック回帰 / メタゲノム診断AI / ショットガンメタゲノム解析 / 宿主寄生体感染関係 / 腸内ウイルス叢 / 腸内細菌叢 … もっと見る / AI / メタゲノム解析 / ネオ抗原 / 免疫システム / シークエンスデータ / 階層ベイズモデル / 免疫ゲノム / マルコフ連鎖モンテカルロ / がんゲノム / HLA遺伝子型 / 遺伝子ネットワーク / 遺伝子発現 / データ統合 / オミックス解析 / システム的解析 / トランスクリプトーム / オミクスデータ解析 / 漢方薬効 / システム数理解析 / パンデミック / インフルエンザ / 数理モデル / ジョイントモデル / エージェントシミュレーション / マクロシミュレーション / 感染症拡大の数理モデル / 予防 / エージェントベースシミュレーション / 予測モデル / 感染症シミュレーション / 階層モデル / 情報統合 / ヘテロデータ / 超高次元データ / ロバスト / ベイズ統計 / 異種データ統合 / 高次元データ解析 / 確立ネットワーク / ゲノム情報 / バイオ統計 / バイオマーカー / 確率ネットワーク / タンパク質間相互作用データ / データ同化 / マイクロアレイデータ / クラスタ分析 / グラフィカルモデル / ベイズアプローチ / 情報量規準 / 関数データ解析 / 高次元データ / クラスタリング / ベイジアンモデリング … もっと見る
研究代表者以外
遺伝子ネットワーク / がん / シミュレーション / ベイジアンネットワーク / マイクロアレイ / システム生物学 / ゲノム / マイクロアレイ解析 / タンパク質相互作用 / simulation / gene network / ペトリネット / 統計的モデリング / バイオインフォマティクス / プロテオーム / 状態空間モデル / システムバイオロジー / タンパク質ネットワーク / パスウェイモデリング / cfDNA / 次世代シークエンシング / 残存微小がん / 肺癌 / NGS / 分子ネットワークモデル / バクテリオファージ / メタゲノム / 改変ファージ / 次世代ファージ療法 / メタゲノム解析 / ファージ療法 / シークエンシング / モデル / クロナリティ / オミクス解析 / マルチオミクス / 全ゲノム / エンハンサー / 全ゲノム解析 / 有毛細胞白血病 / Virtual dissection / PDXマウス / 膵癌 / がん微小環境 / Virtual dissectionモデル / 統計数学 / データサイエンス / 高次元データ / がんゲノム / 多層オミックス / ゲノム解析 / RNA / 免疫 / 腫瘍免疫 / 分子標的治療 / 分子分類 / オミックス解析 / 肝胆膵がん / 情報科学 / 体組成 / 遺伝子発現 / グルココルチコイド / 多臓器連関 / エネルギー代謝 / 数理科学 / 糖尿病 / 生活習慣病 / オミクス / 内分泌学 / 代謝学 / 性差 / 骨格筋 / サルコペニア / 肥満 / 臓器連関 / グルココルチコイド受容体 / 代謝 / 複雑系 / 人工知能 / シリコンシークエンサー / 血液腫瘍 / 消化器癌 / シリコン・シークエンサー / 個別化ゲノム医療 / メディカルインフォマティクス / pathway modeling / protein-RNA interaction prediction / protein-protein interaction / protein network / パスウェイシミュレーション / タンパク質-RNA相互作用予測 / タンパク質相互作用情報 / search algorithm / systems biology / Petri net / microarray analysis / nonparametric regression / Bayesian network / 探索技法 / ノンパラメトリック回帰 / Bayesiamネットワーク / 薬剤応答パスウェィ / ベトリネット / パスウェイ解析 / パ スウェイ解析 / 動的モデル / 薬剤応答パスウェイ / シークエンス解析 / スーパーコンピュータ / 遺伝統計学 / ゲノム科学 / 高速相関係数推定 / 少数事例データ / 因果ネットワーク / 大規模変数次元データ / 遺伝子発現度測定データ / 独立成分分析 / 統計的因果推論 / 遺子機能 / グラフマイニング / 知識ベース / 遺伝子機能 / データマイニング / 因果推論 / 大規模次元 / 自己分泌パスウェイ / 漢方薬 / Gefitinib / Fenofibrate / 創薬ターゲット遺伝子 / 遺伝子発現マイクロアレイデータ / ソフトコンピューティング / モデル化 / スペクトル判別 / カルバックライブラーカーネル / マイクロアレイデータ / グラフィカルモデル / 階層ベイズ / Petriネット / CSML / モデリング 隠す
  • 研究課題

    (28件)
  • 研究成果

    (359件)
  • 共同研究者

    (99人)
  •  微小残存がんを検出する次世代シークエンシングを用いた革新的手法の開発と検証研究

    • 研究代表者
      植村 元秀
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分56030:泌尿器科学関連
    • 研究機関
      福島県立医科大学
  •  HFLACの有用な分子を抽出するためのネットワーク解析法の確立

    • 研究代表者
      笠島 理加
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2026
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分49020:人体病理学関連
    • 研究機関
      地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター(臨床研究所)
  •  時空間内包型数理的解析手法によるがん細胞のクロナリティの新たな理解

    • 研究代表者
      植村 元秀
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2024
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 審査区分
      中区分56:生体機能および感覚に関する外科学およびその関連分野
    • 研究機関
      福島県立医科大学
  •  腸内pathobiontを標的としたファージ療法開発のための基盤研究

    • 研究代表者
      植松 智
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2025
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分54:生体情報内科学およびその関連分野
    • 研究機関
      大阪公立大学
  •  全ゲノム-マルチオミクス情報に基づく日本型有毛白血病の分子病態解明と標的治療開発

    • 研究代表者
      横山 和明
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2023
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分49030:実験病理学関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  疾患メタゲノム解析による腸内微生物叢の臓器機能評価のための情報基盤技術の開発研究代表者

    • 研究代表者
      井元 清哉
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2023
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  がん微小環境情報を考慮したがんゲノム解析モデルの開発

    • 研究代表者
      笠島 理加
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2022
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分55020:消化器外科学関連
    • 研究機関
      地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター(臨床研究所)
  •  エネルギー代謝ネットワーク異常による疾患の分子基盤解明

    • 研究代表者
      田中 廣壽
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      複雑系疾病論
    • 研究機関
      慶應義塾大学
      東京大学
  •  肝胆膵がんの多元的オミックス解析による分子機構の解明

    • 研究代表者
      中川 英刀
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2020
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分53:器官システム内科学およびその関連分野
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  ベイズモデルによるがんと免疫のシステム的統合理解と免疫逃避機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      井元 清哉
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2020
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  階層ベイズによる高多様性領域HLAゲノムシークエンス解析法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      井元 清哉
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2017
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生命・健康・医療情報学
    • 研究機関
      東京大学
  •  スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2019
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      東京大学
  •  大規模複雑データの理論と方法論の総合的研究

    • 研究代表者
      青嶋 誠
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2019
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      統計科学
    • 研究機関
      筑波大学
  •  パーソナルゲノム医療に向けたメディカルインフォマティクスの情報基盤研究

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生命・健康・医療情報学
    • 研究機関
      東京大学
  •  オミックス解析とシステム数理科学による漢方薬効の統合理解研究代表者

    • 研究代表者
      井元 清哉
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2014
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      東京大学
  •  統計数理モデリングに基づく感染症拡大予測と科学的政策決定研究代表者

    • 研究代表者
      井元 清哉
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2013
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      統計科学
    • 研究機関
      東京大学
  •  計算とシミュレーションによるがんシステム学の創成

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2014
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      東京大学
  •  ネットワーク解析による薬剤応答パスウェイの解析法の研究

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2012
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      東京大学
  •  確率ネットワークモデルに基づく高次情報バイオマーカー探索多変量統計手法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      井元 清哉
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2010
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      統計科学
    • 研究機関
      東京大学
  •  超高次元複雑ヘテロデータ解析に基づく柔軟かつ頑健な非線形統計的モデリングの研究研究代表者

    • 研究代表者
      井元 清哉
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2010
    • 研究種目
      若手研究(A)
    • 研究分野
      統計科学
    • 研究機関
      東京大学
  •  大規模変数次元データの因果構造マイニング手法開発と遺伝子機能関係知識ベースの作成

    • 研究代表者
      鷲尾 隆
    • 研究期間 (年度)
      2007 – 2009
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      知能情報学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  遺伝子ネットワークによる創薬ターゲットパスウェイのイン・シリコ探索技術

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2008
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      東京大学
  •  イン・シリコ生命ネットワーク構築のための遺伝子ネットワーク推定とシミュレーション

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2005 – 2009
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      東京大学
  •  階層的統計モデルに基づく異種ゲノム情報の統合手法に関する総合研究

    • 研究代表者
      樋口 知之
    • 研究期間 (年度)
      2005 – 2008
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      統計科学
    • 研究機関
      統計数理研究所
  •  ベイズ型統計モデルによる複数異種形式データ解析の理論と方法論の研究研究代表者

    • 研究代表者
      井元 清哉
    • 研究期間 (年度)
      2005 – 2007
    • 研究種目
      若手研究(A)
    • 研究分野
      統計科学
    • 研究機関
      東京大学
  •  高次元データによる複雑非線形現象解明のための柔軟な統計モデルの理論・方法論の研究研究代表者

    • 研究代表者
      井元 清哉
    • 研究期間 (年度)
      2003 – 2004
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      統計科学
    • 研究機関
      東京大学
  •  遺伝子ネットワーク解析のための情報技術に関する研究

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2003 – 2004
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      東京大学
  •  プロテオーム解析データからの知識発見に関する情報科学的基礎付け

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2003 – 2005
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      東京大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010 2009 2008 2007 2006 2005 2004 2003 2000 その他

すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] 日本内科学会誌2021

    • 著者名/発表者名
      井元清哉
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      日本内科学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [図書] Precision Medicine2020

    • 著者名/発表者名
      井元清哉
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      ニュー・サイエンス社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [図書] 遺伝統計学と疾患ゲノムデータ解析(第2章-6: T細胞受容体レパトア解析)2018

    • 著者名/発表者名
      井元清哉、長谷川嵩矩、山口類
    • 総ページ数
      272
    • 出版者
      メディカルドゥ
    • ISBN
      9784944157631
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H02775
  • [図書] T細胞受容体レパトア解析2018

    • 著者名/発表者名
      井元清哉, 長谷川嵩矩, 山口類
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      メディカルドゥ
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [図書] 実験医学 がん免疫療法×ゲノミクスで変わるがん治療2017

    • 著者名/発表者名
      井元清哉、山口類、水野晋一、中川英刀
    • 総ページ数
      137
    • 出版者
      羊土社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H02775
  • [図書] Computational Drug Target Pathway Discovery : A Bayesian Network Approach. (Handbook of Computational Statistics : Statistical Bioinformatics)(in H.Lu, B.Schokop, H.Zhao (Eds.))2010

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto, Y.Tamada, H.Araki, S.Miyano
    • 出版者
      Springer-Varlag. in press.
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [図書] 生命システムネットワークを明らかにするための統計的モデリング, (統計学会75周年記念出版,「21世紀の統計科学II 自然・生物・健康の統計科学」小西貞則, 国友直人(編))2008

    • 著者名/発表者名
      井元 清哉
    • 出版者
      東京大学出版会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [図書] Gene Networks: Estimation, Modeling and Simulation In Computational Systems Biology (Book Chapter)2005

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto, H.Matsuno, S.Miyano
    • 総ページ数
      409
    • 出版者
      Academic Press
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Targeted lysis of Staphylococcus hominis linked to axillary osmidrosis using bacteriophage-derived endolysin2024

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Miki、Uematsu Miho、Fujimoto Kosuke、Hara Takeshi、Yamamoto Mako、Miyaoka Daichi、Yokota Chieko、Kamei Yukari、Sugimoto Akira、Kawasaki Natsuko、Yabuno Takato、Sato Noriaki、Sato Shintaro、Yamaguchi Kiyoshi、Furukawa Yoichi、Tsuruta Daisuke、Okada Fumihiro、Imoto Seiya、Uematsu Satoshi
    • 雑誌名

      Journal of Investigative Dermatology

      巻: - 号: 11 ページ: 2577-2581

    • DOI

      10.1016/j.jid.2024.03.039

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [雑誌論文] Preemptive Intravenous Human Immunoglobulin G Suppresses BK Polyomavirus Replication and Spread of Infection In Vitro2023

    • 著者名/発表者名
      Sato Noriaki、Shiraki Atsuko、Mori Keita P.、Sakai Kaoru、Takemura Yoshinori、Yanagita Motoko、Imoto Seiya、Tanabe Kazunari、Shiraki Kimiyasu
    • 雑誌名

      American Journal of Transplantation

      巻: - 号: 5 ページ: 862-866

    • DOI

      10.1016/j.ajt.2023.11.007

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K18321, KAKENHI-PROJECT-21H03538, KAKENHI-PROJECT-23K27616
  • [雑誌論文] Imputing time-series microbiome abundance profiles with diffusion model2023

    • 著者名/発表者名
      Seki Misato、Zhang Yao-Zhong、Imoto Seiya
    • 雑誌名

      IEEE Xplore

      巻: BIBM 2023 ページ: 914-919

    • DOI

      10.1109/bibm58861.2023.10385703

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K12104, KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [雑誌論文] Investigation of the BERT model on nucleotide sequences with non-standard pre-training and evaluation of different k-mer embeddings2023

    • 著者名/発表者名
      Zhang Yao-zhong、Bai Zeheng、Imoto Seiya
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 39 号: 10 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btad617

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K12104, KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [雑誌論文] Impact of neoadjuvant therapy on gut microbiome in patients with resectable/borderline resectable pancreatic ductal adenocarcinoma2023

    • 著者名/発表者名
      Takaori Ayaka、Hashimoto Daisuke、Ikeura Tsukasa、Ito Takashi、Nakamaru Koh、Masuda Masataka、Nakayama Shinji、Yamaki So、Yamamoto Tomohisa、Fujimoto Kosuke、Matsuo Yoshiyuki、Akagawa Shohei、Ishida Mitsuaki、Yamaguchi Kiyoshi、Imoto Seiya、Hirota Kiichi、Uematsu Satoshi、Satoi Sohei、Sekimoto Mitsugu、Naganuma Makoto
    • 雑誌名

      Pancreatology

      巻: - 号: 4 ページ: 367-376

    • DOI

      10.1016/j.pan.2023.04.001

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K16032, KAKENHI-PROJECT-21H03538, KAKENHI-PROJECT-22K16057, KAKENHI-PROJECT-22K16329, KAKENHI-PROJECT-22K09106, KAKENHI-PROJECT-22H00477
  • [雑誌論文] Explainable AI for Estimating Pathogenicity of Genetic Variants Using Large-Scale Knowledge Graphs.2023

    • 著者名/発表者名
      Abe S, Tago S, Yokoyama K, Ogawa M, Takei T, Imoto S, Fuji M.
    • 雑誌名

      Cancers (Basel)

      巻: 15 号: 4 ページ: 1118-1118

    • DOI

      10.3390/cancers15041118

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H02711
  • [雑誌論文] Definition of a Dietary Pattern Expressing the Intake of Vegetables and Fruits and Its Association with Intestinal Microbiota2023

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi Toshitaka、Koyama Naoko、Hirai Ayumi、Suganuma Hiroyuki、Suzuki Shigenori、Murashita Koichi、Mikami Tatsuya、Tamada Yoshinori、Sato Noriaki、Imoto Seiya、Itoh Ken、Nakaji Shigeyuki
    • 雑誌名

      Nutrients

      巻: 15 号: 9 ページ: 2104-2104

    • DOI

      10.3390/nu15092104

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [雑誌論文] ggkegg: analysis and visualization of KEGG data utilizing the grammar of graphics.2023

    • 著者名/発表者名
      Sato N, Uematsu M, Fujimoto K, Uematsu S, Imoto S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 39 号: 10

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btad622

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15733, KAKENHI-PROJECT-22K16329, KAKENHI-PROJECT-19K18321, KAKENHI-PROJECT-22H00477, KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [雑誌論文] Zero-shot-capable identification of phage?host relationships with whole-genome sequence representation by contrastive learning2023

    • 著者名/発表者名
      Zhang Yao-zhong、Liu Yunjie、Bai Zeheng、Fujimoto Kosuke、Uematsu Satoshi、Imoto Seiya
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: 24 号: 5 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1093/bib/bbad239

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K16329, KAKENHI-PROJECT-21K12104, KAKENHI-PROJECT-22H00477, KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [雑誌論文] Microbial Gene Ontology informed deep neural network for microbe functionality discovery in human diseases2023

    • 著者名/発表者名
      Liu Yunjie、Zhang Yao-zhong、Imoto Seiya
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 18 号: 8 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0290307

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K12104, KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [雑誌論文] Prime-boost-type PspA3 +2 mucosal vaccine protects cynomolgus macaques from intratracheal challenge with pneumococci.2023

    • 著者名/発表者名
      Yokota C, Fujimoto K, Yamakawa N, Kono M, Miyaoka D, Shimohigoshi M, Uematsu M, Watanabe M, Kamei Y, Sugimoto A, Kawasaki N, Yabuno T, Okamura T, Kuroda E, Hamaguchi S, Sato S, Hotomi M, Akeda Y, Ishii KJ, Yasutomi Y, Sunami K, Uematsu S.
    • 雑誌名

      Inflammation and Regeneration

      巻: 43 号: 1 ページ: 55-55

    • DOI

      10.1186/s41232-023-00305-2

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15733, KAKENHI-PROJECT-22K16329, KAKENHI-PROJECT-22H00477, KAKENHI-PROJECT-23K27420
  • [雑誌論文] Identification of bacteriophage genome sequences with representation learning2022

    • 著者名/発表者名
      Bai Zeheng、Zhang Yao-zhong、Miyano Satoru、Yamaguchi Rui、Fujimoto Kosuke、Uematsu Satoshi、Imoto Seiya
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 38 号: 18 ページ: 4264-4270

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btac509

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K12104, KAKENHI-PROJECT-22H00477, KAKENHI-PROJECT-21H03538, KAKENHI-PROJECT-21K19495
  • [雑誌論文] 【自己免疫疾患 層別化する新時代へ 臨床検体のマルチオミクス解析、腸内細菌によって見えてきた免疫経路の全容】(第1章)精密医療を目指したマルチオミクス解析によるアプローチ メタゲノム解析からの層別化医療への展望2022

    • 著者名/発表者名
      藤本 康介, 植松 智, 井元 清哉
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 40(18) ページ: 2374-2379

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H00477
  • [雑誌論文] Two Blautia Species Associated with Visceral Fat Accumulation: A One-Year Longitudinal Study2022

    • 著者名/発表者名
      Ozato Naoki、Yamaguchi Tohru、Mori Kenta、Katashima Mitsuhiro、Kumagai Mika、Murashita Koichi、Katsuragi Yoshihisa、Tamada Yoshinori、Kakuta Masanori、Imoto Seiya、Ihara Kazushige、Nakaji Shigeyuki
    • 雑誌名

      Biology

      巻: 11 号: 2 ページ: 318-318

    • DOI

      10.3390/biology11020318

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [雑誌論文] いま知りたい!!ファージ療法は多剤耐性菌への切り札となるか 1 概論-ファージ療法の利点と課題.2022

    • 著者名/発表者名
      植松 智,井元 清哉
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 40(18) ページ: 2983-2985

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H00477
  • [雑誌論文] Characterization of the human gut virome in metabolic and autoimmune diseases2022

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto Kosuke、Miyaoka Daichi、Uematsu Satoshi
    • 雑誌名

      Inflammation and Regeneration

      巻: 42 号: 1 ページ: 32-32

    • DOI

      10.1186/s41232-022-00218-6

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K16329, KAKENHI-PROJECT-22H00477, KAKENHI-PROJECT-21K19495
  • [雑誌論文] Anti-inflammatory effects of ruxolitinib on chronic neutrophilic leukemia harboring CSF3R-T618I mutation with bilateral renal abscesses.2022

    • 著者名/発表者名
      Sahara N, Yokoyama K, Matsunaga T, Kitahara S, Fujii T, Kobayashi S, Yusa N, Shimizu E, Imoto S, Tojo A, Ohno N.
    • 雑誌名

      Leuk Res Rep.

      巻: 18 ページ: 100348-100348

    • DOI

      10.1016/j.lrr.2022.100348

    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H02711
  • [雑誌論文] Phage therapy for Clostridioides difficile infection2022

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto Kosuke、Uematsu Satoshi
    • 雑誌名

      Frontiers in Immunology

      巻: 13 ページ: 1057892-1057892

    • DOI

      10.3389/fimmu.2022.1057892

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K16329, KAKENHI-PROJECT-22H00477, KAKENHI-PROJECT-21K19495
  • [雑誌論文] Bronchoalveolar lavage fluid reveals factors contributing to the efficacy of PD-1 blockade in lung cancer2022

    • 著者名/発表者名
      Masuhiro Kentaro、Tamiya Motohiro、Fujimoto Kosuke
    • 雑誌名

      JCI Insight

      巻: 1 号: 9 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1172/jci.insight.157915

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K08650, KAKENHI-PROJECT-21K07252, KAKENHI-PROJECT-21K07112, KAKENHI-PROJECT-22K08283, KAKENHI-PROJECT-18H05282, KAKENHI-PROJECT-22H00477, KAKENHI-PROJECT-21H03538, KAKENHI-PROJECT-21K19495
  • [雑誌論文] Repeated Lineage Switches in an Elderly Case of Refractory B-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia With MLL Gene Amplification: A Case Report and Literature Review2022

    • 著者名/発表者名
      Takeda Reina、Yokoyama Kazuaki、Fukuyama Tomofusa、Kawamata Toyotaka、Ito Mika、Yusa Nozomi、Kasajima Rika、Shimizu Eigo、Ohno Nobuhiro、Uchimaru Kaoru、Yamaguchi Rui、Imoto Seiya、Miyano Satoru、Tojo Arinobu
    • 雑誌名

      Frontiers in Oncology

      巻: 12

    • DOI

      10.3389/fonc.2022.799982

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H02711
  • [雑誌論文] Discovering microbe functionality in human disease with a gene-ontology-aware model2021

    • 著者名/発表者名
      Liu Y, Zhang Y-Z, Imoto S.
    • 雑誌名

      Proc. Biological Ontologies and Knowledge Bases

      巻: - ページ: 1873-1880

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [雑誌論文] Oral MucoRice-CTB vaccine for safety and microbiota-dependent immunogenicity in humans: a phase 1 randomised trial2021

    • 著者名/発表者名
      Yuki Yoshikazu、Nojima Masanori、Hosono Osamu、Tanaka Hirotoshi、Kimura Yasumasa、Satoh Takeshi、Imoto Seiya、Uematsu Satoshi、Kurokawa Shiho、Kashima Koji、Mejima Mio、Nakahashi-Ouchida Rika、Uchida Yohei、Marui Takanori、Yoshikawa Noritada、Nagamura Fumitaka、Fujihashi Kohtaro、Kiyono Hiroshi
    • 雑誌名

      The Lancet Microbe

      巻: 2 号: 9 ページ: 30196-8

    • DOI

      10.1016/s2666-5247(20)30196-8

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03538, KAKENHI-PROJECT-21K10298
  • [雑誌論文] Dysbiotic Fecal Microbiome in HIV-1 Infected Individuals in Ghana2021

    • 著者名/発表者名
      Parbie Prince Kofi、Mizutani Taketoshi、Ishizaka Aya、Kawana-Tachikawa Ai、Runtuwene Lucky Ronald、Seki Sayuri、Abana Christopher Zaab-Yen、Kushitor Dennis、Bonney Evelyn Yayra、Ofori Sampson Badu、Uematsu Satoshi、Imoto Seiya、Kimura Yasumasa、Kiyono Hiroshi、Ishikawa Koichi、Ampofo William Kwabena、Matano Tetsuro
    • 雑誌名

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      巻: 11 ページ: 646467-646467

    • DOI

      10.3389/fcimb.2021.646467

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H02745, KAKENHI-PROJECT-21H03538, KAKENHI-PROJECT-21K19495, KAKENHI-PROJECT-18H05280
  • [雑誌論文] Role of Circulating Tumor DNA in Hematological Malignancy2021

    • 著者名/発表者名
      Ogawa Miho、Yokoyama Kazuaki、Imoto Seiya、Tojo Arinobu
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 13 号: 9 ページ: 2078-2078

    • DOI

      10.3390/cancers13092078

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H02711
  • [雑誌論文] Comprehensive molecular analysis of genomic profiles and PD-L1 expression in lung adenocarcinoma with a high-grade fetal adenocarcinoma component2021

    • 著者名/発表者名
      Masaki Suzuki, Rika Kasajima, Tomoyuki Yokose, Hiroyuki Ito, Eigo Shimizu, Seira Hatakeyama, Kazuaki Yokoyama, Rui Yamaguchi, Yoichi Furukawa, Satoru Miyano, Seiya Imoto, Emi Yoshioka, Kota Washimi, Yoichiro Okubo, Kae Kawachi, Shinya Sato, Yohei Miyagi
    • 雑誌名

      Translational Lung Cancer Research

      巻: 10 号: 3 ページ: 1292-1304

    • DOI

      10.21037/tlcr-20-1158

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K09422, KAKENHI-PROJECT-18K15111, KAKENHI-PROJECT-18H03328, KAKENHI-PROJECT-19K16605, KAKENHI-PROJECT-21H02711
  • [雑誌論文] Whole genome sequencing with long-reads reveals complex structure and origin of structural variation in human genetic variations and somatic mutations in cancer.2021

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto A, Wong JH, Yoshii Y, Akiyama S, Tanaka A, Yagi H, Shigemizu D, Nakagawa H, Mizokami M, and Shimada M.
    • 雑誌名

      Genome Medicine

      巻: 13 号: 1 ページ: 65-65

    • DOI

      10.1186/s13073-021-00883-1

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H04049, KAKENHI-PROJECT-18K19426, KAKENHI-PROJECT-19K16740, KAKENHI-PLANNED-18H05511, KAKENHI-PROJECT-18J40119, KAKENHI-PROJECT-21K19400
  • [雑誌論文] Ovariectomy-Induced Dysbiosis May Have a Minor Effect on Bone in Mice2021

    • 著者名/発表者名
      Kosaka Satoshi、Nadatani Yuji、Higashimori Akira、Otani Koji、Fujimoto Kosuke、Nagata Yuki、Ominami Masaki、Fukunaga Shusei、Hosomi Shuhei、Kamata Noriko、Tanaka Fumio、Nagami Yasuaki、Taira Koichi、Imoto Seiya、Uematsu Satoshi、Watanabe Toshio、Fujiwara Yasuhiro
    • 雑誌名

      Microorganisms

      巻: 9 号: 12 ページ: 2563-2563

    • DOI

      10.3390/microorganisms9122563

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03538, KAKENHI-PROJECT-21K19495
  • [雑誌論文] Functional Restoration of Bacteriomes and Viromes by Fecal Microbiota Transplantation2021

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto, Kosuke, et al.
    • 雑誌名

      Gastroenterology

      巻: - 号: 6 ページ: 400-405

    • DOI

      10.1053/j.gastro.2021.02.013

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K12215, KAKENHI-PROJECT-19K17028, KAKENHI-PROJECT-19K17932, KAKENHI-PROJECT-18H02571, KAKENHI-PROJECT-18H05280, KAKENHI-PROJECT-21H03538, KAKENHI-PROJECT-21K19495, KAKENHI-PROJECT-20K07563
  • [雑誌論文] Halcyon: an accurate basecaller exploiting an encoder?decoder model with monotonic attention2020

    • 著者名/発表者名
      Konishi Hiroki、Yamaguchi Rui、Yamaguchi Kiyoshi、Furukawa Yoichi、Imoto Seiya
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: online first 号: 9 ページ: 1211-1217

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btaa953

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H03328, KAKENHI-PROJECT-20K07563
  • [雑誌論文] Comprehensive Analysis of Indels in Whole-genome Microsatellite Regions and Microsatellite Instability across 21 Cancer Types2020

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto A*, Fujita M, Hasegawa T, Wong JH, Maejima K, Oku-Sasaki A, Nakano K, Shiraishi Y, Miyano S, Yamamoto G, Akagi K, Imoto S, and Nakagawa H
    • 雑誌名

      Genome Research

      巻: 30 号: 3 ページ: 334-34

    • DOI

      10.1101/gr.255026.119

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K19426, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PLANNED-18H05511, KAKENHI-PROJECT-18H04049, KAKENHI-PROJECT-18H02680, KAKENHI-PROJECT-18H03328, KAKENHI-PROJECT-19K09206
  • [雑誌論文] Nanopore base-calling from a perspective of instance segmentation2020

    • 著者名/発表者名
      Zhang Y-Z, Akdemir A, Tremmel G, Imoto S, Miyano S, Shibuya T, Yamaguchi R.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 23;21(Suppl 3) 号: S3 ページ: 136-136

    • DOI

      10.1186/s12859-020-3459-0

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-17H01693, KAKENHI-PROJECT-17K20023
  • [雑誌論文] Classification of primary liver cancer with immunosuppression mechanisms and correlation with genomic alterations.2020

    • 著者名/発表者名
      Fujita M, Yamaguchi R, Hasegawa T, Shimada S, Arihiro K, Hayashi S, Maejima K, Nakano K, Fujimoto A, Ono A, Aikata H, Ueno M, Hayami S, Tanaka H, Miyano S, Yamaue H, Chayama K, Kakimi K, Tanaka S, Imoto S, Nakagawa H.
    • 雑誌名

      EBioMedicine

      巻: 53 ページ: 102659-102659

    • DOI

      10.1016/j.ebiom.2020.102659

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K10675, KAKENHI-PROJECT-18K19426, KAKENHI-PROJECT-18H04049, KAKENHI-PROJECT-19H01055, KAKENHI-PROJECT-18H02680, KAKENHI-PROJECT-18H02696, KAKENHI-PROJECT-18H03328, KAKENHI-PROJECT-17H06269, KAKENHI-PROJECT-17K09426, KAKENHI-PROJECT-18K19575, KAKENHI-PLANNED-18H05511, KAKENHI-PROJECT-19K09206
  • [雑誌論文] Global gene network exploration based on explainable artificial intelligence approach2020

    • 著者名/発表者名
      Park Heewon、Maruhashi Koji、Yamaguchi Rui、Imoto Seiya、Miyano Satoru
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 15 号: 11 ページ: e0241508-e0241508

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0241508

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K20402, KAKENHI-PROJECT-18H03328, KAKENHI-PROJECT-18H03329
  • [雑誌論文] Neoantimon: A multifunctional R package for identification of tumor-specific neoantigens.2020

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa T, Hayashi S, Nakagawa H, Miyano S, and Imoto S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 36 号: 18 ページ: 4813-4816

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btaa616

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H04049, KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [雑誌論文] Variant analysis of prostate cancer in Japanese patients and a new attempt to predict related biological pathways2020

    • 著者名/発表者名
      Kasajima R, Yamaguchi R, Shimizu E, Tamada Y, Niida A, Tremmel G, Kishida T,Aoki I, Imoto S, Miyano S, Uemura H, Miyagi Y
    • 雑誌名

      Oncol Rep.

      巻: 43(3) ページ: 943-952

    • DOI

      10.3892/or.2020.7481

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Theoretical foundation of the performance of phylogeny-based somatic variant detection2020

    • 著者名/発表者名
      Moriyama T, Imoto S, Miyano S, Yamaguchi R.
    • 雑誌名

      Proc. 2nd International Symposium on Mathematical and Computational Oncology

      巻: 12508 ページ: 87-101

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [雑誌論文] A Bayesian model integration for mutation calling through data partitioning2019

    • 著者名/発表者名
      Moriyama T, Imoto S, Hayashi S, Shiraishi Y, Miyano S, Yamaguchi R
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 35(21) 号: 21 ページ: 4247-4254

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btz233

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Massively parallel sequencing of tenosynovial giant cell tumors reveals novel CSF1 fusion transcripts and novel somatic CBL mutations2019

    • 著者名/発表者名
      Tsuda Yusuke、Matsubara Daisuke (5th) etc
    • 雑誌名

      International Journal of Cancer

      巻: 145 号: 12 ページ: 3276

    • DOI

      10.1002/ijc.32421

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07441, KAKENHI-PROJECT-19K12215, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-16H02676, KAKENHI-PROJECT-17H03596, KAKENHI-PROJECT-18H02933, KAKENHI-PROJECT-19H03444, KAKENHI-PROJECT-16K08672, KAKENHI-PROJECT-18K15303
  • [雑誌論文] Accurate and Flexible Bayesian Mutation Call from Multi-regional Tumor Samples2019

    • 著者名/発表者名
      Moriyama T, Imoto s, Miyano S, Yamaguchi R
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Computer Science

      巻: 11826 ページ: 47-61

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] The first case of elderly TCF3-HLF-positive B-cell acute lymphoblastic leukemia.2019

    • 著者名/発表者名
      Takeda R, Yokoyama K (corresponding author), Ogawa M, Kawamata T, Tomofusa F, Kondoh K, Tomomi T, Nakamura S, Ito M, Yusa N, Shimizu E, Ohno N, Uchimaru K, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, and Tojo A.
    • 雑誌名

      Leuk lymphoma.

      巻: 60 号: 11 ページ: 2821-2824

    • DOI

      10.1080/10428194.2019.1602267

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K16605, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-18H03329
  • [雑誌論文] Robust sample-specific stability selection with effective reror control2019

    • 著者名/発表者名
      Park H, Yamada M, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      J Comput Biol

      巻: 26(3) 号: 3 ページ: 202-217

    • DOI

      10.1089/cmb.2018.0180

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-16H06299
  • [雑誌論文] ALPHLARD-NT: Bayesian Method for Human Leukocyte Antigen Genotyping and Mutation Calling through Simultaneous Analysis of Normal and Tumor Whole-Genome Sequence Data2019

    • 著者名/発表者名
      Hayashi S, Moriyama T, Yamaguchi R, Mizuno S, Komura M, Miyano S, Nakagawa H, Imoto S
    • 雑誌名

      J Comput Biol.

      巻: 26(9) 号: 9 ページ: 923-937

    • DOI

      10.1089/cmb.2018.0224

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [雑誌論文] Capturing the differences between humoral immunity in the normal and tumor environments from repertoire-seq of B-cell receptors using supervised machine learning2019

    • 著者名/発表者名
      Konishi H, Komura D, Katoh H, Atsumi S, Koda H, Yamamoto A, Seto Y, Fukayama M, Yamaguchi R, Imoto S, Ishikawa S.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 20(1) 号: 1 ページ: 267-267

    • DOI

      10.1186/s12859-019-2853-y

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [雑誌論文] Development of an MSI-positive colon tumor with aberrant DNA methylation in a PPAP patient2019

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi K, Shimizu E, Yamaguchi R, Imoto S, Komura M, Hatakeyama S, Noguchi R, Takane K, Ikenoue T, Gohda Y, Yano H, Miyano S, Furukawa Y
    • 雑誌名

      J Hum Genet.

      巻: 64(8) 号: 8 ページ: 729-740

    • DOI

      10.1038/s10038-019-0611-7

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-17H03575, KAKENHI-PROJECT-17K16530, KAKENHI-PROJECT-17K07214
  • [雑誌論文] Quantifying immune-based counterselection of somatic mutations.2019

    • 著者名/発表者名
      Yang F, Kim DK, Nakagawa H, Hayashi S, Imoto S, Stein L, and Roth F
    • 雑誌名

      PLoS Genet

      巻: 15 号: 7 ページ: e1008227-e1008227

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1008227

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H04049, KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [雑誌論文] Antigen delivery targeted to tumor-associated macrophages overcomes tumor immune resistance2019

    • 著者名/発表者名
      Muraoka Daisuke、Seo Naohiro、Hayashi Tae、Tahara Yoshiro、Fujii Keisuke、Tawara Isao、Miyahara Yoshihiro、Okamori Kana、Yagita Hideo、Imoto Seiya、Yamaguchi Rui、Komura Mitsuhiro、Miyano Satoru、Goto Masahiro、Sawada Shin-ichi、Asai Akira、Ikeda Hiroaki、Akiyoshi Kazunari、Harada Naozumi、Shiku Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Clinical Investigation

      巻: 129 号: 3 ページ: 1278-1294

    • DOI

      10.1172/jci97642

    • NAID

      120006987781

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K07222, KAKENHI-PROJECT-18K19584, KAKENHI-PROJECT-18H02559, KAKENHI-PROJECT-18H02872, KAKENHI-PROJECT-18H03328, KAKENHI-PROJECT-18K19474, KAKENHI-PROJECT-16H06369, KAKENHI-PROJECT-16K07168
  • [雑誌論文] Integrated exome and RNA sequencing of dedifferentiated liposarcoma2019

    • 著者名/発表者名
      Hirata Makoto、Matsubara Daisuke (21th) etc
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1038/s41467-019-13286-z

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07441, KAKENHI-PROJECT-19K07791, KAKENHI-PROJECT-19K09206, KAKENHI-PROJECT-19K12215, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-16H02676, KAKENHI-PROJECT-17H03596, KAKENHI-PROJECT-18H02933, KAKENHI-PROJECT-19H03444, KAKENHI-PROJECT-16K08672
  • [雑誌論文] Prognostic impact of circulating tumor DNA status post-allogeneic hematopoietic stem cell transplantation in AML and MDS.2019

    • 著者名/発表者名
      Nakamura S, Yokoyama K (co-1st and co-corresponding author), Shimizu E, Yusa N, Kondoh K, Ogawa M, Takei T, Kobayashi A, Ito M, Isobe M, Konuma T, Kato S, Kasajima R, Wada Y, Inoue-Nagamura T, Yamaguchi R, Takahashi S, Imoto S, Miyano S, and Tojo A.
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 133 号: 25 ページ: 2682-2695

    • DOI

      10.1182/blood-2018-10-880690

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K16605, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-18H03329
  • [雑誌論文] Effects of long-term intake of a yogurt fermented with Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus 2038 and Streptococcus thermophilus 1131 on mice2018

    • 著者名/発表者名
      Usui Yuki、Kimura Yasumasa、Satoh Takeshi、Takemura Naoki、Ouchi Yasuo、Ohmiya Hiroko、Kobayashi Kyosuke、Suzuki Hiromi、Koyama Satomi、Hagiwara Satoko、Tanaka Hirotoshi、Imoto Seiya、Eberl G?rard、Asami Yukio、Fujimoto Kosuke、Uematsu Satoshi
    • 雑誌名

      International Immunology

      巻: 30 号: 7 ページ: 319-331

    • DOI

      10.1093/intimm/dxy035

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0017, KAKENHI-PROJECT-16K19148, KAKENHI-PROJECT-16H05330, KAKENHI-PROJECT-17H04257, KAKENHI-PROJECT-18H02571, KAKENHI-PROJECT-17K19543, KAKENHI-PROJECT-17K07212, KAKENHI-PROJECT-17KK0189
  • [雑誌論文] Cell-lineage level-targeted sequencing to identify acute myeloid leukemia with myelodysplasia-related changes2018

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama K, Shimizu E, Yokoyama N, Nakamura S, Kasajima R, Ogawa M, Takei T,Ito M, Kobayashi A, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, Tojo A
    • 雑誌名

      Blood Adv

      巻: 2(19) 号: 19 ページ: 2513-2521

    • DOI

      10.1182/bloodadvances.2017010744

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Adaptive NetworkProfiler for Identifying Cancer Characteristic-Specific Gene Regulatory Networks2018

    • 著者名/発表者名
      Park H, Shimamura T, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      J Comput Biol

      巻: 25(2) 号: 2 ページ: 130-145

    • DOI

      10.1089/cmb.2017.0120

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Phenotype-Based Gene Analysis Allowed Successful Diagnosis of X-Linked Neutropenia Associated with a Novel Wasp Mutation.2018

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi M, Yokoyama K, Shimizu E, Yusa N, Ito M, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, and Tojo A.
    • 雑誌名

      Ann Hematol

      巻: 97 号: 2 ページ: 367-369

    • DOI

      10.1007/s00277-017-3134-3

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K21012, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-16J02129, KAKENHI-PROJECT-16H00660
  • [雑誌論文] ALPHLARD: a Bayesian method for analyzing HLA genes from whole genome sequence data2018

    • 著者名/発表者名
      Hayashi S, Yamaguchi R, Mizuno S, Komura M, Miyano S, Nakagawa H, Imoto S
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 19(1) 号: 1 ページ: 790-790

    • DOI

      10.1186/s12864-018-5169-9

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [雑誌論文] Genomic Heterogeneity Within Individual Prostate Cancer Foci Impacts Predictive Biomarkers of Targeted Therapy2018

    • 著者名/発表者名
      VanderWeele DJ, Finney R, Katayama K, Gillard M, Paner G, Imoto S, Yamaguchi R, Wheeler D, Lack J, Cam M, Pontier A, Nguyen YTM, Maejima K, Sasaki-Oku A, Nakano K, Tanaka H, Vander Griend D, Kubo M, Ratain MJ, Miyano S, Nakagawa H
    • 雑誌名

      Eur Urol Focus

      巻: pii: S2405-4569(18) 号: 3 ページ: 30007-5

    • DOI

      10.1016/j.euf.2018.01.006

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-19K12215
  • [雑誌論文] Targeting Tyro3 ameliorates a model of PGRN-mutant FTLD-TDP via tau-mediated synaptic pathology2018

    • 著者名/発表者名
      Fujita Kyota、Chen Xigui、Homma Hidenori、Tagawa Kazuhiko、Amano Mutsuki、Saito Ayumu、Imoto Seiya、Akatsu Hiroyasu、Hashizume Yoshio、Kaibuchi Kozo、Miyano Satoru、Okazawa Hitoshi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 9 号: 1 ページ: 433-433

    • DOI

      10.1038/s41467-018-02821-z

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K07383, KAKENHI-PROJECT-17K08725, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-17H05561, KAKENHI-PUBLICLY-17H05693, KAKENHI-PROJECT-16H02655, KAKENHI-PROJECT-16H06277
  • [雑誌論文] Azacitidine effectively reduces TP53-mutant leukemic cell burden in secondary acute myeloid leukemia after cord blood transplantation2018

    • 著者名/発表者名
      Takei Tomomi、Yokoyama Kazuaki、Shimizu Eigo、Konuma Takaaki、Takahashi Satoshi、Yamaguchi Rui、Imoto Seiya、Miyano Satoru、Tojo Arinobu
    • 雑誌名

      Leukemia & Lymphoma

      巻: In press 号: 11 ページ: 1-2

    • DOI

      10.1080/10428194.2018.1443335

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K19570, KAKENHI-PROJECT-16H06277, KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Circulating tumor DNA dynamically predicts response and/or relapse in patients with hematological malignancies2018

    • 著者名/発表者名
      Nakamura S, Yokoyama K, Yusa N, Ogawa M, Takei T, Kobayashi A, Ito M, Shimizu E, Kasajima R, Wada Y, Yamaguchi R, Imoto S, Nagamura-Inoue T, Miyano S, Tojo A
    • 雑誌名

      Int J Hematol

      巻: 108(4) 号: 4 ページ: 402-410

    • DOI

      10.1007/s12185-018-2487-2

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-18H03329
  • [雑誌論文] Characterization of the B-cell receptor repertoires in peanut allergic subjects undergoing oral immunotherapy2018

    • 著者名/発表者名
      Kiyotani K, Mai TH, Yamaguchi R, Yew PY, Kulis M, Orgel K, Imoto S, Miyano S, Burks AW, Nakamura Y
    • 雑誌名

      J Hum Genet

      巻: 63(2) 号: 2 ページ: 239-248

    • DOI

      10.1038/s10038-017-0364-0

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H02775, KAKENHI-PROJECT-15K00399
  • [雑誌論文] A novel adaptive penalized logistic regression for uncovering biomarker associated with anti-cancer drug sensitivity2017

    • 著者名/発表者名
      Park H, Shiraishi Y, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      EEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform

      巻: - 号: 4 ページ: 771-782

    • DOI

      10.1109/tcbb.2016.2561937

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Interaction-based feature selection for uncovering cancer driver genes through copy number-driven expression level2017

    • 著者名/発表者名
      Park H, Niida A, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      J Comput Biol

      巻: 24(2) 号: 2 ページ: 138-152

    • DOI

      10.1089/cmb.2016.0140

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Identification of an immunogenic neo-epitope encoded by mouse sarcoma using CXCR3 ligand mRNAs as sensors2017

    • 著者名/発表者名
      Fujii K, Miyahara Y, Harada N, Muraoka D, Komura M, Yamaguchi R, Yagita H, Nakamura J, Sugino S, Okumura S, Imoto S, Miyano S, Shiku H
    • 雑誌名

      OncoImmunology

      巻: 印刷中 号: 5 ページ: e1306617-e1306617

    • DOI

      10.1080/2162402x.2017.1306617

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H02775, KAKENHI-PROJECT-16K07168
  • [雑誌論文] Different Clonal Dynamics of Chronic Myeloid Leukaemia between Bone Marrow and the Central Nervous System.2017

    • 著者名/発表者名
      Ogawa M, Yokoyama K, Hirano M, Jimbo K, Ochi K, Kawamata T, Ohno N, Shimizu E, Yokoyama N, Yamaguchi R, Imoto S, Uchimaru K, Takahashi N, Miyano S, Imai Y, and Tojo A.
    • 雑誌名

      Br J Haematol

      巻: - 号: 5 ページ: 842-845

    • DOI

      10.1111/bjh.15065

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K21012, KAKENHI-PROJECT-16H06277, KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Identification of a p53-repressed gene module in breast cancer cells2017

    • 著者名/発表者名
      Miyamoto T, Tanikawa C, Yodsurang V, Zhang YZ, Imoto S, Yamaguchi R, Miyano S, Nakagawa H, Matsuda K
    • 雑誌名

      Oncotarget

      巻: 8(34) 号: 34 ページ: 55821-55836

    • DOI

      10.18632/oncotarget.19608

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01566
  • [雑誌論文] The Transcriptional Landscape of p53 Signalling Pathway2017

    • 著者名/発表者名
      Tanikawa C, Zhang YZ, Yamamoto R, Tsuda Y, Tanaka M, Funauchi Y, Mori J, Imoto S, Yamaguchi R, Nakamura Y, Miyano S, Nakagawa H, Matsuda K
    • 雑誌名

      EBioMedicine

      巻: 20 ページ: 109-119

    • DOI

      10.1016/j.ebiom.2017.05.017

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01566
  • [雑誌論文] Whole genome sequencing discriminates hepatocellular carcinoma with intrahepatic metastasis from multi-centric tumors2017

    • 著者名/発表者名
      Furuta M, Ueno M, Fujimoto A, Hayami S, Yasukawa S, Kojima F, Arihiro K, Kawakami Y, Wardell CP, Shiraishi Y, Tanaka H, Nakano K, Maejima K, Sasaki-Oku A, Tokunaga N, Boroevich KA, Abe T, Aikata H, Ohdan H, Gotoh K, Kubo M, Tsunoda T, Miyano S, Chayama K, Yamaue H, Nakagawa H
    • 雑誌名

      J Hepatol

      巻: 66(2) 号: 2 ページ: 363-373

    • DOI

      10.1016/j.jhep.2016.09.021

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-26293308, KAKENHI-PROJECT-15K19915, KAKENHI-PROJECT-17K10675, KAKENHI-PROJECT-26430196, KAKENHI-PROJECT-15H04814
  • [雑誌論文] Sequence-specific bias correction for RNA-seq data using recurrent neural networks2017

    • 著者名/発表者名
      Zhang Y-Z, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 18(Suppl 1) 号: S1 ページ: 1044-1044

    • DOI

      10.1186/s12864-016-3262-5

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-16H02676
  • [雑誌論文] Identification of a p53 target, CD137L, that mediates growth suppression and immune response of osteosarcoma cells2017

    • 著者名/発表者名
      Tsuda Y, Tanikawa C, Miyamoto T, Hirata M, Yodsurang V, Zhang YZ, Imoto S, Yamaguchi R, Miyano S, Takayanagi H, Kawano H, Nakagawa H, Tanaka S, Matsuda K
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 7 号: 1 ページ: 10739-10739

    • DOI

      10.1038/s41598-017-11208-x

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01566, KAKENHI-PROJECT-16H02676, KAKENHI-PROJECT-17H03596, KAKENHI-PROJECT-15H05703
  • [雑誌論文] Genome-wide screening of DNA methylation associated with lymph node metastasis in esophageal squamous cell carcinoma2017

    • 著者名/発表者名
      Nagata Hiroaki、Kozaki Ken-Ichi、Muramatsu Tomoki、Hiramoto Hidekazu、Tanimoto Kousuke、Fujiwara Naoto、Imoto Seiya、Ichikawa Daisuke、Otsuji Eigo、Miyano Satoru、Kawano Tatsuyuki、Inazawa Johji
    • 雑誌名

      Oncotarget

      巻: 8 号: 23 ページ: 37740-37750

    • DOI

      10.18632/oncotarget.17147

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05908, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-16K14630
  • [雑誌論文] The hypusine cascade promotes cancer progression and metastasis through the regulation of RhoA in squamous cell carcinoma.2016

    • 著者名/発表者名
      Muramatsu T, Kozaki KI, Imoto S, Yamaguchi R, Tsuda H, Kawano T, Fujiwara N, Morishita M, Miyano S, Inazawa J.
    • 雑誌名

      Oncogene

      巻: - 号: 40 ページ: 5304-5316

    • DOI

      10.1038/onc.2016.71

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K18401, KAKENHI-PLANNED-15H05908, KAKENHI-PROJECT-25250019, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-16K14630
  • [雑誌論文] Adaptive penalized logistic regression for uncovering biomarker associated with anti-cancer drug sensitivity2016

    • 著者名/発表者名
      Park, H., Shiraishi, Y., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      IEEE IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      巻: 印刷中

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H01678
  • [雑誌論文] Genomic Landscape of Esophageal Squamous Cell Carcinoma in a Japanese Population.2016

    • 著者名/発表者名
      G. Sawada (他43名, 山本21番目)
    • 雑誌名

      Gastroenterology

      巻: 150 号: 5 ページ: 1171-1182

    • DOI

      10.1053/j.gastro.2016.01.035

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K05577, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-14J10908, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-26670608, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26861003, KAKENHI-PROJECT-25290043, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-15H05791, KAKENHI-PROJECT-16H04692, KAKENHI-PROJECT-26293303, KAKENHI-PROJECT-26461994, KAKENHI-PROJECT-15K15496
  • [雑誌論文] Whole genome mutational landscape and characterization of non-coding and structural mutations in liver cancer.2016

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto A et al.
    • 雑誌名

      Nat Genet

      巻: 48 号: 5 ページ: 500-509

    • DOI

      10.1038/ng.3547

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26114721, KAKENHI-PROJECT-15H04814, KAKENHI-PROJECT-26293308, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-15K08987, KAKENHI-PROJECT-26430196
  • [雑誌論文] OVarCall: Bayesian mutation calling method utilizing overlapping paired-end reads2016

    • 著者名/発表者名
      Moriyama, T., Shiroishi, Y., Chiba, K., Yamaguchi, R., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Bioinformatics

      巻: 印刷中

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H01678
  • [雑誌論文] Reduced expression of APC-1B but not APC-1A by the deletion of promoter 1B is responsible for familial adenomatous polyposis2016

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi K, Nagayama S, Shimizu E, Komura M, Yamaguchi R, Shibuya T, Arai M, Hatakeyama S, Ikenoue T, Ueno M, Miyano S, Imoto S, Furukawa Y
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 6 号: 1 ページ: 26011-26011

    • DOI

      10.1038/srep26011

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01569
  • [雑誌論文] Characterization of T-cell receptor repertoire in inflamed tissues of patients with crohn's disease through deep sequencing2016

    • 著者名/発表者名
      Chapman CG, Yamaguchi R, Tamura K, Weidner J, Imoto S, Kwon J, Fang H, Yew PY, Marino SR, Miyano S, Nakamura Y, Kiyotani K
    • 雑誌名

      Inflamm Bowel Dis

      巻: 22(6) 号: 6 ページ: 1275-1285

    • DOI

      10.1097/mib.0000000000000752

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H02775
  • [雑誌論文] Variegated RHOA mutations in adult T-cell leukemia/lymphoma2016

    • 著者名/発表者名
      Nagata Y, Kontani K, Enami T, Kataoka K, Ishii R, Totoki Y, Kataoka TR, Hirata M, Aoki K, Nakano K, Kitanaka A, Sakata-Yanagimoto M, Egami S, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Shiozawa Y, Yoshizato T, (9名), Miyano S, Nureki O, Shibata T, Haga H, Shimoda K, Katada T, Chiba S, Watanabe T, Ogawa S
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 127 号: 5 ページ: 596-604

    • DOI

      10.1182/blood-2015-06-644948

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-26893127, KAKENHI-PROJECT-14J03784, KAKENHI-PROJECT-26650029, KAKENHI-PROJECT-26290053, KAKENHI-PROJECT-26291038, KAKENHI-PROJECT-25461407, KAKENHI-PROJECT-23229001
  • [雑誌論文] Gene set differential analysis of time course expression profiles via sparse estimation in functional logistic model with application to time-dependent biomarker detection2016

    • 著者名/発表者名
      Kayano M, Matsui H, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      Biostatistics

      巻: 17 号: 2 ページ: 235-248

    • DOI

      10.1093/biostatistics/kxv037

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H02670, KAKENHI-PROJECT-24700290, KAKENHI-PROJECT-25730017, KAKENHI-PROJECT-25250017
  • [雑誌論文] OVarCall: bayesian mutation calling method utilizing overlapping paired-end reads2016

    • 著者名/発表者名
      Moriyama T, Shiraishi Y, Chiba K, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      IEEE Trans Nanobioscience

      巻: 14 号: 2 ページ: 1-6

    • DOI

      10.1109/tnb.2017.2670601

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-16H02676
  • [雑誌論文] Whole-genome mutational landscape of liver cancers displaying biliary phenotype reveals hepatitis impact and molecular diversity2015

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto A, Furuta M, Shiraishi Y, Gotoh K, Kawakami Y, Arihiro K, Nakamura T, Ueno M, Ariizumi SI, Hai Nguyen H, Shigemizu D, Abe T, Boroevich KA, Nakano K, Sasaki A, Kitada R, Maejima K, Yamamoto Y, Tanaka H, Shibuya T, Shibata T, Ojima H, Shimada K, Hayami S, Shigekawa Y, Aikata H, Ohdan H, Marubashi S, et al.
    • 雑誌名

      Nat Commun.

      巻: 6 ページ: 6120-6120

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Attenuated familial adenomatous polyposis with desmoids by an APC mutation2015

    • 著者名/発表者名
      Ikenoue T, Yamaguchi K, Komura M, Imoto S, Yamaguchi R, Shimizu E, Kasuya S, Shibuya T, Hatakeyama S, Miyano S, Furukawa Y
    • 雑誌名

      Human Genome Variation

      巻: 2 号: 1 ページ: 15011-15011

    • DOI

      10.1038/hgv.2015.11

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280105
  • [雑誌論文] Genomic data assimilation using a higher moment filtering technique for restoration of gene regulatory networks2015

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi R, Shimamura T, Miyano S, Imoto S, Akutsu T
    • 雑誌名

      MC Syst Biol

      巻: 9(1) ページ: 14-14

    • NAID

      120005749949

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Oncogenic roles of TOPK and MELK, and effective growth suppression by small molecular inhibitors in kidney cancer cells2015

    • 著者名/発表者名
      T. Kato, H. Inoue, S. Imoto, Y. Tamada, T. Miyamoto, Y. Matsuo, Y. Nakamura and J.H. Park
    • 雑誌名

      Oncotarget

      巻: 7 号: 14 ページ: 17652-17664

    • DOI

      10.18632/oncotarget.7755

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K20965, KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Genomic data assimilation using a higher moment filtering technique for restoration of gene regulatory networks2015

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi R, Shimamura T, Miyano S, Imoto S, Akutsu T.
    • 雑誌名

      BMC Systems Biology

      巻: 9 号: 1 ページ: 14-14

    • DOI

      10.1186/s12918-015-0154-2

    • NAID

      120005749949

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300111, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [雑誌論文] Genomon ITDetector: A tool for somatic internal tandem duplication detection from cancer genome sequencing data2015

    • 著者名/発表者名
      Chiba K, Shiraishi Y, Nagata Y, Yoshida K, Imoto S, Ogawa S, Miyano S
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 30(1) ページ: 116-118

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280105
  • [雑誌論文] A novel APC mosaicism in a patient with familial adenomatous polyposis.2015

    • 著者名/発表者名
      Moriya Iwaizumi, Ken Sugimoto, et al.
    • 雑誌名

      Hum Genome Var

      巻: 10 号: 1 ページ: 15057-15057

    • DOI

      10.1038/hgv.2015.57

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25460948, KAKENHI-PROJECT-25860530, KAKENHI-PROJECT-26860206, KAKENHI-PROJECT-25280105
  • [雑誌論文] Sparse overlapping group lasso for integrative multi-omics analysis2015

    • 著者名/発表者名
      Park H, Niida A, Miyano S, Imoto S.
    • 雑誌名

      Journal of Computational Biology

      巻: 22 号: 2 ページ: 73-84

    • DOI

      10.1089/cmb.2014.0197

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300111
  • [雑誌論文] A likelihood-free filtering method via approximate Bayesian computation in evaluating biological simulation models2015

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa T, Niida A, Mori T, Shimamura T, Yamaguchi R, Miyano S, Akutsu T, Imoto S
    • 雑誌名

      Computational Statistics & Data Analysis

      巻: 94 ページ: 63-74

    • DOI

      10.1016/j.csda.2015.08.003

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H06008, KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [雑誌論文] Detection of APC mosaicism by next-generation sequencing in an FAP patient.2015

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi K, Komura M, Yamaguchi R, Imoto S, Shimizu E, Kasuya S, Shibuya T, Hatakeyama S, Takahashi N, Ikenoue T, Hata K, Tsurita G, Shinozaki M, Suzuki Y, Sugano S, Miyano S, Furukawa Y
    • 雑誌名

      J Hum Genet

      巻: 60(5) 号: 5 ページ: 227-231

    • DOI

      10.1038/jhg.2015.14

    • NAID

      40020462565

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26860206, KAKENHI-PROJECT-25280105
  • [雑誌論文] Binary Contingency Table Method for Analyzing Gene Mutation in Cancer Genome2015

    • 著者名/発表者名
      Ayada E, Niida A, Hasegawa T, Miyano S, Imoto S
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Computer Science

      巻: 9096 ページ: 12-23

    • DOI

      10.1007/978-3-319-19048-8_2

    • ISBN
      9783319190471, 9783319190488
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Quantitative characterization of T-cell repertoire in allogeneic hematopoietic stem cell transplant recipients2015

    • 著者名/発表者名
      Yew PY, Alachkar H, Yamaguchi R, Kiyotani K, Fang H, Yap KL, Liu HT, Wickrema A, Artz A, van Besien K, Imoto S, Miyano S, Bishop MR, Stock W, Nakamura Y
    • 雑誌名

      Bone Marrow Transplantation

      巻: 50 号: 9 ページ: 1227-1234

    • DOI

      10.1038/bmt.2015.133

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K00399, KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Genomon ITDetector: A tool for somatic internal tandem duplication detection from cancer genome sequencing data. Bioinformatics2015

    • 著者名/発表者名
      Chiba K, Shiraishi Y, Nagata Y, Yoshida K, Imoto S, Ogawa S, Miyano S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 31(1) ページ: 116-118

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Recursive random lasso (RRLasso) for identifying anti-cancer drug targets2015

    • 著者名/発表者名
      Park H, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10 号: 11 ページ: 147-152

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0141869

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H05707
  • [雑誌論文] Elevated β-catenin pathway as a novel target for patients with resistance to EGF receptor targeting drugs2015

    • 著者名/発表者名
      Nakata A, Yoshida R, Yamaguchi R, Yamauchi M, Tamada Y, Fujita A, Shimamura T, Imoto S, Higuchi T, Nomura M, Kimura T, Nokihara H, Higashiyama M, Kondoh K, Nishihara H, Tojo A, Yano S, Miyano S, Gotoh N
    • 雑誌名

      Scientific Report

      巻: 5 号: 1 ページ: 13076-13076

    • DOI

      10.1038/srep13076

    • NAID

      120005764206

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15K18426, KAKENHI-PROJECT-15K20965, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H04294, KAKENHI-PROJECT-26640072, KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [雑誌論文] A feature selection method using fixed-point algorithm for DNA microarray gene expression data2014

    • 著者名/発表者名
      Sharma A, Paliwal KK, Imoto S, Miyano S, Sharma V, Ananthanarayanan R
    • 雑誌名

      International Journal of Knowledge Based and Intelligent Engineering Systems

      巻: 18(1) ページ: 55-59

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Lung adenocarcinoma subtypes definable by lung development-related miRNA expression profiles in association with clinicopathologic features2014

    • 著者名/発表者名
      Arima C, Kajino T, Tamada Y, Imoto S, Shimada Y, Nakatochi M, Suzuki M, Isomura H, Yatabe Y, Yamaguchi T, Yanagisawa K, Miyano S, Takahashi T
    • 雑誌名

      Carcinogenesis

      巻: 35(10) ページ: 2224-2231

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] A feature selection method using improved regularized linear discriminant analysis2014

    • 著者名/発表者名
      Sharma A, Paliwal KK, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      Mach Vis Appl.

      巻: 25(3) ページ: 775-786

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Overexpression of cohesion establishment factor DSCC1 through E2F in colorectal cancer.2014

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi K, Rui Yamaguchi R, Takahashi N, Ikenoue T, Fujii T, Shinozaki M, Tsurita G, Hata K, Niida A, Imoto S, Miyano S, Nakamura Y, Furukawa Y
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 号: 1 ページ: e85750-e85750

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0085750

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23310137, KAKENHI-PROJECT-25280105
  • [雑誌論文] HapMuC: somatic mutation calling using heterozygous germline variants near candidate mutations2014

    • 著者名/発表者名
      Usuyama N, Shiraishi Y, Sato Y, Kume H, Homma Y, Ogawa S, Miyano S, Imoto S
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 30(23) ページ: 3302-3309

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Cost-effective length and timing of school closure during an influenza pandemic depend on the severity2014

    • 著者名/発表者名
      H. Nishiura, K. Ejima, K. Mizumoto, S. Nakaoka, H. Inaba, S. Imoto, R. Yamaguchi, M.M. Saito
    • 雑誌名

      Theoretical Biology and Medical Modelling

      巻: 11 ページ: 5-5

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143
  • [雑誌論文] Allelic Imbalance at an 8q24 Oncogenic SNP is involved in activating MYC in human colorectal cancer2014

    • 著者名/発表者名
      Sugimachi K, Niida A, Yamamoto K, Shimamura T, Imoto S, Iinuma H, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Watanabe M, Tanaka J, Kudo S, Hase K, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Sugihara K, Maehara Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
    • 雑誌名

      Ann Surg Oncol

      巻: 21 Suppl 4 ページ: 515-521

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] An Efficient Data Assimilation Schema for Restoration and Extension of Gene Regulatory Networks Using Time-course Observation Data2014

    • 著者名/発表者名
      T. Hasegawa, T. Mori, R. Yamaguchi, S. Miyano, T. Akutsu
    • 雑誌名

      Journal of Computational Biology

      巻: 21 号: 11 ページ: 785-798

    • DOI

      10.1089/cmb.2014.0171

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12J09639, KAKENHI-PROJECT-24300111
  • [雑誌論文] Somatic RHOA mutation in angioimmunoblastic T cell lymphoma2014

    • 著者名/発表者名
      Sakata-Yanagimoto M, Enami T, Yoshida K, Shiraishi Y, Ishii R, Miyake Y, Muto H, Tsuyama N, Sato-Otsubo A, Okuno Y, Sakata S, Kamada Y, Nakamoto-Matsubara R, et. al.
    • 雑誌名

      Nat Genet.

      巻: 46(2) ページ: 171-175

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Analysis of Questionnaire for Traditional Medicine and Development of Decision Support System2014

    • 著者名/発表者名
      Kotoe Katayama, Rui Yamaguchi, Seiya Imoto, Kenji Watanabe and Satoru Miyano
    • 雑誌名

      Evidence-Based Complementary and Alternative Medicine

      巻: 2014 号: 1 ページ: 974139-974139

    • DOI

      10.1155/2014/974139

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300111
  • [雑誌論文] An efficient data assimilation schema for restoration and extension of gene regulatory networks using time-course observation data2014

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, Akutsu T
    • 雑誌名

      J Comput Biol

      巻: 21(11) ページ: 785-798

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Integrated analysis of whole genome and transcriptome sequencing reveals diverse transcriptomic aberrations driven by somatic genomic changes in liver cancers2014

    • 著者名/発表者名
      Shiraishi Y, Fujimoto A, Furuta M, Tanaka H, Chiba K, Boroevich KA, Abe T, Kawakami Y, Ueno M, Gotoh K, Ariizumi S, Shibuya T, Nakano K, Sasaki A, Maejima K, Kitada R, Hayami S, Shigekawa Y, Marubashi S, Yamada T, Kubo M, et. al.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9(12)

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Robust prediction of anti-cancer drug sensitivity and sensitivity-specific biomarker2014

    • 著者名/発表者名
      Park H, Shimamura T, Miyano S, Imoto S
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9(1)

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] HapMuC: somatic mutation calling using heterozygous germline variants near candidate mutations2014

    • 著者名/発表者名
      Usuyama N, Shiraishi Y, Sato Y, Kume H, Homma Y, Ogawa S, Miyano S, Imoto S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 30(23) ページ: 3302-3309

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280105
  • [雑誌論文] An efficient method of exploring simulation models by assimilating literature and biological observational data2014

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa T, Nagasaki M, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      Biosystems

      巻: 121 ページ: 54-66

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] The rs6983267 SNP is associated with MYC transcription efficiency, which promotes progression and worsens prognosis of colorectal cancer2013

    • 著者名/発表者名
      Takatsuno Y, Mimori K, Yamamoto K, Sato T, Niida A, Inoue H, Imoto S, Kawano S, Yamaguchi R, Toh H, Iinuma H, Ishimaru S, Ishii H, Suzuki S, Tokudome S, Watanabe M, Tanaka JI, Kudo SE, Mochizuki H, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Moriya Y, Miyano S, Sugihara K, Mori M
    • 雑誌名

      Ann Surg Oncol.

      巻: 20(4) ページ: 1395-1402

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Principal component analysis using QR decomposition2013

    • 著者名/発表者名
      Sharma A, Paliwal KK, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      International J Machine Learning and Cybernetics

      巻: 4(6) ページ: 679-683

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Multi-omics approach for estimating metabolic networks using low-order partial correlations2013

    • 著者名/発表者名
      Kayano M, Imoto S, Yamaguchi R, Miyano S.
    • 雑誌名

      J Comput Biol.

      巻: 20(8) ページ: 571-582

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Vasohibin-1 is identified as a master-regulator of endothelial cell apoptosis using gene network analysis2013

    • 著者名/発表者名
      Affara M, Sanders D, Araki H, Tamada Y, Dunmore B, Humphreys S, Imoto S, Savoie C, Miyano S, Kuhara S, Print C, Charnock-Jones DS
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 14(1) 号: 1 ページ: 23-23

    • DOI

      10.1186/1471-2164-14-23

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300099, KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Molecular features of triple negative breast cancer cells by genome-wide gene expression profiling analysis.2013

    • 著者名/発表者名
      Komatsu M, Yoshimaru T, Matsuo T, Kiyotani K, Miyoshi Y, Tanahashi T, Rokutan K, Yamaguchi R, Saito A, Imoto S, Miyano S, Nakamura Y, Sasa M, Shimada M, Katagiri T.
    • 雑誌名

      Int J Oncol.

      巻: 42(2) 号: 2 ページ: 478-506

    • DOI

      10.3892/ijo.2012.1744

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21119003, KAKENHI-PROJECT-22390146, KAKENHI-PROJECT-24501342, KAKENHI-PROJECT-25670352, KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PUBLICLY-23134504
  • [雑誌論文] Integrated molecular analysis of clear-cell renal cell carcinoma2013

    • 著者名/発表者名
      Sato Y, Yoshizato T, Shiraishi Y, Maekawa S, Okuno Y, Kamura T, Shimamura T, Sato-Otsubo A, Nagae G, Suzuki H, Nagata Y, Yoshida K, Kon A, Suzuki Y, Chiba K, Tanaka H, Niida A, Fujimoto A, Tsunoda T, Morikawa T, Maeda D, Kume H, Sugano S, Fukayama M, Aburatani H, Sanada M, Miyano S, Homma Y, Ogawa S.
    • 雑誌名

      Nature Genet.

      巻: 45(8) ページ: 860-867

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Plastin3 is a novel marker for circulating tumor cells undergoing the epithelial-mesenchymal transition and is associated with colorectal cancer prognosis2013

    • 著者名/発表者名
      Yokobori T, Iinuma H, Shimamura T, Imoto S, Sugimachi K, Ishii H, Iwatsuki M, Ota D, Ohkuma M, Iwaya T, Nishida N, Kogo R, Sudo T, Tanaka F, Shibata K, Toh H, Sato T, Barnard GF, Fukagawa T, Yamamoto S, Nakanishi H, Sasaki S, Miyano S, Watanabe T, Kuwano H, Mimori K, Pantel K, Mori M
    • 雑誌名

      Cancer Res.

      巻: 73(7) ページ: 2059-2069

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] A strategy to select suitable physicochemical attributes of amino acids for protein fold recognition2013

    • 著者名/発表者名
      Sharma A, Paliwal KK, Dehzangi A, Lyons J, Imoto S, Miyano S.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 14(1) ページ: 233-233

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Multilayer cluster heat map visualizing biological tensor data2013

    • 著者名/発表者名
      Niida A, Tremmel G, Imoto S, Miyano S.
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Bioinformatics

      巻: 8213 ページ: 116-125

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Recurrent mutations in multiple components of the cohesin complex in myeloid neoplasms2013

    • 著者名/発表者名
      Kon A, Shih LY, Sanada M, Shiraishi Y, Okuno Y, Nagae G, Nishimoto A, Nowak D, Sato Y, Shimamura T, Tanaka H, Chiba K, Yamaguchi T, Otsu M, Obara N, Nakamaki T, Ishiyama K, Nolte F, Hofmann WK, Miyawaki S, Chiba S, Mori H, Nakauchi H, Koeffler HP, Aburatani H, Haferlach T, Shirahige K, Miyano S, Ogawa S.
    • 雑誌名

      Nature Genet.

      巻: 45(10) ページ: 1232-1237

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Extension and verification of the SEIR model on the 2009 influenza A (H1N1) pandemic in Japan2013

    • 著者名/発表者名
      M.M. Saito, S. Imoto, R. Yamaguchi, H. Sato, H. Nakada, M. Kami, S. Miyano, T. Higuchi
    • 雑誌名

      Mathematical Biosciences

      巻: 246(1) ページ: 47-54

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143
  • [雑誌論文] The Tumor-suppressive mir-497-195 cluster targets multiple cell-cycle regulators in hepatocellular carcinoma.2013

    • 著者名/発表者名
      Furuta M
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8 号: 3 ページ: e60155-e60155

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0060155

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-22130001, KAKENHI-PLANNED-22134002, KAKENHI-PROJECT-22240090, KAKENHI-PROJECT-23390077, KAKENHI-PROJECT-25250019, KAKENHI-PROJECT-25253081, KAKENHI-PROJECT-25640062, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Enhancement of collective immunity by selective vaccination against emerging influenza pandemic2013

    • 著者名/発表者名
      M.M. Saito, S. Imoto, R. Yamaguchi, M. Tsubokura, M. Kami, H. Nakada, H. Sato, S. Miyano, T. Higuchi
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 8(9)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143
  • [雑誌論文] Extension and verification of the SEIR model on the 2009 influenza A (H1N1) pandemic in Japan2013

    • 著者名/発表者名
      Saito MM, Imoto S, Yamaguchi R, Sato H, Nakada H, Kami M, Miyano S, Higuchi T.
    • 雑誌名

      Math Biosci.

      巻: 246 号: 1 ページ: 47-54

    • DOI

      10.1016/j.mbs.2013.08.009

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143
  • [雑誌論文] Multi-omics approach for estimating metabolic networks using low-order partial correlations2013

    • 著者名/発表者名
      Kayano M, Imoto S, Yamaguchi R, Miyano S
    • 雑誌名

      Journal of Computational Biology

      巻: 20 号: 8 ページ: 571-582

    • DOI

      10.1089/cmb.2013.0043

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300111, KAKENHI-PROJECT-24700290
  • [雑誌論文] Targeting BIG3-PHB2 interaction to overcome tamoxifen resistance in breast cancer cells2013

    • 著者名/発表者名
      Yoshimaru T, Komatsu M, Matsuo T, Chen YA, Murakami Y, Mizuguchi K, Mizohata E, Inoue T, Akiyama M, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, Miyoshi Y, Sasa M, Nakamura Y, Katagiri T
    • 雑誌名

      Nature Commun.

      巻: 4 ページ: 2443-2013

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Enhancement of Collective Immunity in Tokyo Metropolitan Area by Selective Vaccination against an Emerging Influenza Pandemic2013

    • 著者名/発表者名
      Masaya M. Saito mail, Seiya Imoto, Rui Yamaguchi, Masaharu Tsubokura, Masahiro Kami, Haruka Nakada, Hiroki Sato, Satoru Miyano, Tomoyuki Higuchi
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 8 号: 9 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0072866

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143, KAKENHI-PROJECT-25730181
  • [雑誌論文] Cell cycle gene networks are associated with melanoma prognosis2012

    • 著者名/発表者名
      Wang L, Hurley D, Watkins W, Araki H, Tamada Y, Muthukaruppan A, Ranjard L, Derkac E, Imoto S, Miyano S, Crampin E, Print C
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 7(4) 号: 4 ページ: e34247-e34247

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0034247

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300099, KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] A top-r feature selection algorithm for microarray gene expression data2012

    • 著者名/発表者名
      Sharma A, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      巻: 9(3) 号: 3 ページ: 754-764

    • DOI

      10.1109/tcbb.2011.151

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Computational gene network analysis reveals TNF-induced angiogenesis2012

    • 著者名/発表者名
      Ogami K, Yamaguchi R, Imoto S, Tamada Y, Araki H, Print C, Miyano S
    • 雑誌名

      BMC Systems Biology

      巻: 6(Supple 2) 号: S2

    • DOI

      10.1186/1752-0509-6-s2-s12

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24700292, KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Statistical model-based testing to evaluate the recurrence of genomic aberrations2012

    • 著者名/発表者名
      Niida A, Imoto S, Shimamura T, Miyano S
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 28(12) 号: 12 ページ: i115-i120

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/bts203

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Identifiability of local transmissibility parameters in agent-based pandemic simulation2012

    • 著者名/発表者名
      M. Saito, S. Imoto, R. Yamaguchi, S. Miyano, T. Higuchi
    • 雑誌名

      Proc. 14th International Conference on Information FUSION

      ページ: 2466-2471

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143
  • [雑誌論文] Parallel agent-based simulator for inuenza pandemic2012

    • 著者名/発表者名
      M. Saito, S. Imoto, R. Yamaguchi, S. Miyano, T. Higuchi
    • 雑誌名

      Lecture Note in Computer Science

      巻: 7068 ページ: 361-370

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143
  • [雑誌論文] Epidermal growth factor receptor tyrosine kinase defines critical prognostic genes of stage I lung adenocarcinoma2012

    • 著者名/発表者名
      後藤 典子
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 7 号: 9 ページ: e43923-e43923

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0043923

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22130009, KAKENHI-PROJECT-22300099, KAKENHI-PROJECT-23390062, KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Identifying Gene pathways associated with cancer characteristics via sparse statistical methods2012

    • 著者名/発表者名
      Kawano S, Shimamura T, Niida A, Imoto S, Yamaguchi R, Nagasaki M, Yoshida R, Print C, Miyano S
    • 雑誌名

      IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      巻: 9(4) 号: 4 ページ: 966-972

    • DOI

      10.1109/tcbb.2012.48

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Increased Risk for CRC in Diabetic Patients with the Nonrisk Allele of SNPs at 8q242012

    • 著者名/発表者名
      Ishimaru S, Iinuma H, et al
    • 雑誌名

      Ann Surg Oncol

      巻: 21(in press) 号: 9 ページ: 21-21

    • DOI

      10.1245/s10434-012-2278-6

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21591734, KAKENHI-PROJECT-21592014, KAKENHI-PROJECT-22570172, KAKENHI-PROJECT-23390199, KAKENHI-PROJECT-24591984, KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PUBLICLY-23112514
  • [雑誌論文] Gene network inference and visualization tools for biologists: application to new human transcriptome datasets2012

    • 著者名/発表者名
      Hurley D, Araki H, Tamada Y, (4名), Imoto S, Yasuda K, Tomiyasu Y, Tashiro K, Savoie C, Cho V, Smith S, Kuhara S, Miyano S, Charnock-Jones DS, Crampin EJ, Print CG
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 40(6) 号: 6 ページ: 2377-2398

    • DOI

      10.1093/nar/gkr902

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Whole-genome sequencing of liver cancers identifies etiological influences on mutation patterns and recurrent mutations in chromatin regulators.2012

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto A, Totoki Y, Abe T, Boroevich KA, Hosoda F, Nguyen HH, Aoki M, Hosono N, Kubo M, Miya F, Arai Y, Takahashi H, Shirakihara T, Nagasaki M, Shibuya T, Nakano K, Watanabe-Makino K, Tanaka H, Nakamura H, Kusuda J, Ojima H, Shimada K, Okusaka T, Ueno M, Shigekawa Y, Kawakami Y, Arihiro K, Ohdan H, Gotoh K, Ishikawa O, Ariizumi S, Yamamoto M, Yamada T, Chayama K, Kosuge T, Yamaue H, Kamatani N, Miyano S, Nakagama H, Nakamura Y, Tsunoda T, Shibata T, Nakagawa H
    • 雑誌名

      Nature Genetic

      巻: 44 号: 7 ページ: 760-764

    • DOI

      10.1038/ng.2291

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22310123, KAKENHI-PROJECT-24659368, KAKENHI-PLANNED-22116010, KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PLANNED-22134008
  • [雑誌論文] A between-class overlapping filter-based method for transcriptome data analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Sharma A, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      J Bioinformatics and Computational Biology

      巻: 10(5) 号: 05 ページ: 1250010-1250010

    • DOI

      10.1142/s0219720012500102

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Parallel agent-based simulator for inuenza pandemic, Proc. DOCMAS, Lecture Note in Computer Science2012

    • 著者名/発表者名
      M.M. Saito, S. Imoto, R. Yamaguchi, S. Miyano, T. Higuchi
    • 雑誌名

      Springer-Verlag

      巻: 7068 ページ: 361-370

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143
  • [雑誌論文] Identifying regulational alterations in gene regulatory networks by state space representation of vector autoregressive models and variational annealing2012

    • 著者名/発表者名
      後藤 典子
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: Suppl. 1, 号: S1

    • DOI

      10.1186/1471-2164-13-s1-s6

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22130009, KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PROJECT-23390062
  • [雑誌論文] N-cadherin expression is a potential survival mechanism of gefitinib-resistant lung cancer cells2011

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi M, Yoshino I, Yamaguchi R, Shimamura T, Nagasaki M, Imoto S, Niida A, Koizumi F, Kohno T, Yokota J, Miyano S, Gotoh N
    • 雑誌名

      Am J Cancer Res

      巻: 1(7) ページ: 828-833

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Comprehensive pharmacogenomic pathway screening by data assimilation2011

    • 著者名/発表者名
      T.Hasegawa, R.Yamaguchi, M.Nagasaki, S.Imoto, S.Miyano
    • 雑誌名

      LNCS (Springer-Verlag) in press.

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Comprehensive pharmacogenomic pathway screening by data assimilation2011

    • 著者名/発表者名
      T.Hasegawa, R.Yamaguchi, M.Nagasaki, S.Imoto, S.Miyano
    • 雑誌名

      Proc.7th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications(査読付き国際会議論文)

      巻: (印刷中)(掲載確定)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] SiGN : large-scale gene network estimation environment for high performance computing2011

    • 著者名/発表者名
      Tamada Y, Shimamura T, Yamaguchi R, Imoto S, Nagasaki M, Miyano S
    • 雑誌名

      Genome Informatics

      巻: 25 ページ: 40-52

    • NAID

      130004567842

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Frequent pathway mutations of splicing machinery in myelodysplasia2011

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Yoshida
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 478 号: 7367 ページ: 64-69

    • DOI

      10.1038/nature10496

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22130002, KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PROJECT-22390191, KAKENHI-PROJECT-22659058, KAKENHI-PROJECT-22790895, KAKENHI-PLANNED-23106004, KAKENHI-PUBLICLY-23118503, KAKENHI-PROJECT-23390269, KAKENHI-PROJECT-23659482, KAKENHI-PROJECT-23659533, KAKENHI-PROJECT-23791068, KAKENHI-PROJECT-23791075
  • [雑誌論文] A novel network profiling analysis reveals system changes in epithelial-mesenchymal transition2011

    • 著者名/発表者名
      Shimamura, T., Imoto, S., Shimada, Y., Hosono, Y., Niida, A., Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Takahashi, T., Miyano, S
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 6 号: 6 ページ: e20804-e20804

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0020804

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21249037, KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PLANNED-22134005
  • [雑誌論文] Searching optimal Bayesian network structure on constraint search space:super-structure approach02011

    • 著者名/発表者名
      Imoto S, Kojima K, Perrier E, Tamada Y, Miyano S
    • 雑誌名

      LectureNotes in Computer Science

      巻: 6797 ページ: 210-218

    • DOI

      10.1007/978-3-642-25655-4_19

    • ISBN
      9783642256547, 9783642256554
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300099
  • [雑誌論文] Parallel algorithm for learning optimal Bayesian network structure2011

    • 著者名/発表者名
      Tamada Y, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      J Machine Learning Research

      巻: 12 ページ: 2437-2459

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Estimating genome-wide gene networks using nonparametric Bayesian network models on massively parallel computers2011

    • 著者名/発表者名
      Tamada Y, Imoto S, Araki H, Nagasaki M, Print C, Charnock-Jones DS, Miyano S
    • 雑誌名

      IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      巻: 8(3) 号: 3 ページ: 683-697

    • DOI

      10.1109/tcbb.2010.68

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Comprehensive pharmacogenomic pathway screening by data assimilation2011

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa T, Yamaguchi R, Nagasaki M, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Bioinformatics

      巻: 6674 ページ: 160-171

    • DOI

      10.1007/978-3-642-21260-4_18

    • ISBN
      9783642212598, 9783642212604
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PROJECT-22300099
  • [雑誌論文] SiGN-SSM : open source parallel software for estimating gene networks with state space models2011

    • 著者名/発表者名
      Tamada Y, Yamaguchi R, Imoto S, Hirose O, Yoshida R, Nagasaki M, Miyano S
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 27(8) 号: 8 ページ: 1172-1173

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btr078

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PROJECT-22300099, KAKENHI-PROJECT-22700308, KAKENHI-PROJECT-23700346
  • [雑誌論文] Whole-genome sequencing and comprehensive variant analysis of a Japanese individual using massively parallel sequencing2010

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto, A., Nakagawa, H., Hosono, N., Nakano, K., Abe, G., Boroevich, K.A., Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Shibuya, T., Kubo, M., Miyano, S., Nakamura, Y., Tsunoda, T.
    • 雑誌名

      Nature Genetics

      巻: 42 ページ: 931-936

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Model-free unsupervised gene set screening based on information enrichment in expression profiles2010

    • 著者名/発表者名
      A.Niida, S.Imoto, R.Yamaguchi, M.Nagasaki, A.Fujita, T.Shimamura, S.Miyano
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 26 ページ: 3090-3097

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Identifying hidden confounders in gene networks by Bayesian networks2010

    • 著者名/発表者名
      Higashigaki, T., Kojima, K., Yamaguchi, R., Inoue, M., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc.10th IEEE Bioinformatics and Bioengineering

      ページ: 168-173

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Gene set-based module discovery decodes cis-regulatory codes governing diverse gene expression across human multiple tissues2010

    • 著者名/発表者名
      A.Niida, S.Imoto, R.Yamaguchi, M.Nagasaki, S.Miyano
    • 雑誌名

      PLoS One 5(6)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Inferring dynamic gene networks under varying conditions for transcriptomic network comparison2010

    • 著者名/発表者名
      T.Shimamura, S.Imoto, R.Yamaguchi, M.Nagasaki, S.Miyano
    • 雑誌名

      Bioinformatics 26

      ページ: 1064-1072

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Discovering functional gene pathways associated with cancer heterogeneity via sparse supervised learning2010

    • 著者名/発表者名
      Kawano, S., Shimamura, T., Niida, A., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Yoshida, R., Print, C., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc.IEEE 10th International Symposium on Bioinformatics & Bioengineering

      ページ: 253-258

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Discovery of exogenous variables in data with more variables than observations2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Sogawa, S.Shimizu, A.Hyvarinen, T.Washio, T.Shimamura, S.Imoto
    • 雑誌名

      Proc.20th International Conference on Artificial Neural Networks(査読付き国際会議論文)

      ページ: 67-76

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20650039
  • [雑誌論文] Discovering Functional Gene Pathways Associated with Cancer Heterogeneity via Sparse Supervised Learning2010

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Kawano, Teppei Shimamura, Atsushi Niida, Seiya Imoto, Rui Yamaguchi, Masao Nagasaki, Ryo Yoshida, Criatin Print, Satoru Miyano
    • 雑誌名

      Proc.IEEE International Conference on Bioinorrmatics and Biomedicine(査読付き国際会議論文)

      ページ: 253-258

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20650039
  • [雑誌論文] Model-free unsupervised gene set screening based on information enrichment in expression profiles2010

    • 著者名/発表者名
      Niida, S.Imoto, R.Yamaguchi, M.Nagasaki, A.Fujita, T.Shimamura, S.Miyano
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      ページ: 3090-3097

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Optimal search on clustered structural constraint for learning Bayesian network structure2010

    • 著者名/発表者名
      K.Kojima, E.Perrier, S.Imoto, S.Miyano
    • 雑誌名

      Journal of Machine Learning Research 11

      ページ: 285-310

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Network-based predictions and simulations by biological state space mo dels : Search for drug mode of action2010

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, R., Imoto, S., Miyan o, S.
    • 雑誌名

      J.Computer Science and Technology

      巻: 25(1) ページ: 131-153

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300099
  • [雑誌論文] Gene set-based module discovery decodes cis-regulatory codes governing diverse gene expression across human multiple tissues2010

    • 著者名/発表者名
      Niida, A., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Miyano, S.
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 5(6):e10910(掲載確定)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Identifying hidden confounders in gene networks by Bayesian networks2010

    • 著者名/発表者名
      Higashigaki, T., Kojima, K., Yamaguchi, R., Inoue, M., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc.10th IEEE Bioinformatics and Bioengineering

      ページ: 168-173

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300099
  • [雑誌論文] Gene regulatory network clustering for graph layout based on microarray gene expression data2010

    • 著者名/発表者名
      Kojima, K., Imoto, S., Nagasaki, M., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics

      巻: 24 ページ: 84-95

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Discovering functional gene pathways associated with cancer heterogeneity via sparse supervised learning2010

    • 著者名/発表者名
      S.Kawano, T.Shimamura, A.Niida, S.Imoto, R.Yamaguchi, M.Nagasaki, R.Yoshida, C.Print, S.Miyano
    • 雑誌名

      IEEE Bioinformatics and Biomedicine

      ページ: 253-258

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Collocation-based sparse estimation for constructing dynamic gene networks2010

    • 著者名/発表者名
      Shimamura, T., Imoto, S., Nagasaki, M., Yamauchi, M., Yamaguchi, R., Fujita, A., Tamada, Y, Gotoh, N., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics

      巻: 24 ページ: 164-178

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Inferring dynamic gene networks under varying conditions for transcriptomic network comparison.2010

    • 著者名/発表者名
      T.Shimamura, S.Imoto, R.Yamaguchi, M.Nagasaki, S.Miyano
    • 雑誌名

      Bioinformatics 26(8)

      ページ: 1064-1072

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Inferring dynamic gene networks under varying conditions for transcriptomic network comparison2010

    • 著者名/発表者名
      Shimamura, T., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 26(8) ページ: 1064-1072

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Network-based predictions and simulations by biological state space models: Search for drug mode of action. J2010

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      Computer Science and Technology

      巻: 25(1) 号: 1 ページ: 131-153

    • DOI

      10.1007/s11390-010-9311-7

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300099
  • [雑誌論文] Model-free unsupervised gene set screening based on information enrichment in expression profiles2010

    • 著者名/発表者名
      Niida, A., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Fujita, A., Shimamura, T., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 26(24) ページ: 3090-3097

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Gene set-based module discovery decodes cis-regulatory codes governing diverse gene expression across human multiple tissues2010

    • 著者名/発表者名
      A.Niida, S.Imoto, R.Yamaguchi, M.Nagasaki, S.Miyano
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 5(電子ジャーナル)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Identifying hidden confounders in gene networks by Bayesian networks. Proc.2010

    • 著者名/発表者名
      Higashigaki T, Kojima K, Yamaguchi R, Inoue M, Imoto S, Miyano S.
    • 雑誌名

      10th IEEE Bioinformatics and Bioengineering

      ページ: 168-173

    • URL

      http://doi.ieeecomputersociety.org/10.1109/BIBE.2010.35

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300099
  • [雑誌論文] Gene regulatory network clustering for graph layout based on microarray gene expression data2010

    • 著者名/発表者名
      Kojima, K., Imoto, S., Nagasaki, M., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics

      巻: 24 ページ: 84-95

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300099
  • [雑誌論文] A state space representation of VAR models with sparse learning for dynamic gene networks2009

    • 著者名/発表者名
      Kojima, K., Yamaguchi, R., Imoto, S., Yamauchi, M., Nagasaki, M., Yoshida, R., Shimamura, T., Ueno, K., Higuchi, T., Gotoh, N., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 22

      ページ: 56-68

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Unraveling dynamic activities of autocrine pathways that control drug-response transcriptome networks2009

    • 著者名/発表者名
      Y. Tamada, H. Araki, S. Imoto, et al.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing Vol. 14

      ページ: 251-263

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] A novel meta-analysis approach of cancer transcriptomes reveals prevailing transcriptional networks in cancer cells2009

    • 著者名/発表者名
      A.Niida, S.Imoto, M.Nagasaki, R.Yamaguchi, S.Miyano
    • 雑誌名

      Genome Informatics 22

      ページ: 121-131

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Unraveling dynamic activities of autoacine pathways that control drug-response transcriptome networks2009

    • 著者名/発表者名
      Y. Tamada^*, H. Araki^*, S. Imoto^* et.al. (16人中3番目, *Equqally confiibution)
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing 14

      ページ: 251-262

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Unraveling dynamic activities of autoacine pathways that control drug-response transcriptome networks2009

    • 著者名/発表者名
      H.Araki, Y.Tamada, S.Imoto, et al., その他13人
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing 14

      ページ: 251-263

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20650039
  • [雑誌論文] Recursive regularization for inferring gene networks from time-course gene expression profiles2009

    • 著者名/発表者名
      Shimamura, T., Imoto, S., Yamaguchi, R., Fujita, A., Nagasaki, M., Miyano, S.
    • 雑誌名

      BMC Systems Biology 3

      ページ: 41-41

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Unraveling dynamic activities of autoacine pathways that control drug-response transcriptome networks2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Tamada, H.raki, S.Imoto, M.Nagasaki, A.Doi, Y.Nakinishi, Y.Tomiyasu, K.Yasuda, B.Dunmore, D.Sanders, S.Humphries, C.Print, D.S.Charnock-Jones, K.Tashiro, S.Kuhara, S.Miyano
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing 14

      ページ: 251-263

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Orengedokuto and berberine improve indomethacin-induced small intestinal injury via adenosine2009

    • 著者名/発表者名
      Watanabe-Fukuda, Y., Yamamoto, M., Miura, N., Fukutake, M., Ishige, A., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Saito, A., Imoto, S., Miyano, S., Takeda, J., Watanabe, K.
    • 雑誌名

      J.Gastroenterology 44(5)

      ページ: 380-389

    • NAID

      10025174631

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Unraveling dynamic activities of autocrine pathways that control drug-esponse transcriptome networks2009

    • 著者名/発表者名
      Tamada, Y., Araki, H., Imoto, S., Nagasaki, M., Doi, A., Nakanishi, Y. Tomiyasu, Y., Yasuda, K., Dunmore, B., Sanders, D., Humphreys, S., Print, C., Charnock-Jones, D. S., Tashiro, K., Kuhara, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing 14

      ページ: 251-263

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Unraveling dynamic activities of autocrine pathways that control drug-response transcriptome networks2009

    • 著者名/発表者名
      Y. Tamada, H. Araki, S. Imoto, M. Nagasaki, A. Doi, Y. Nakanishi, Y. Tomiyasu, K. Yasuda, B. Dunmore, D. Sanders, S. Humphries, C. Print, D.S. Charnock-Jones, K. Tashiro, S. Kuhara, S. Miyano
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing Vol.14

      ページ: 251-263

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Orengedokuto and berberine improve indomethacin-induced small intestinal injury via adenosine2009

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, Y., Yamamoto, M., Miura, N., Fukutake, M., Ishige, A., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Saito, A., Imoto, S., Miyano, S., Takeda, J., Watanabe, K.
    • 雑誌名

      J. Gastroenterology (印刷中)

    • NAID

      10025174631

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] A novel meta-analysis approach of cancer transcriptomes reveals prevailing transcriptional networks in cancer cells2009

    • 著者名/発表者名
      Niida, A., Imoto, S., Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 22

      ページ: 121-131

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] BFL: a node and edge betweenness based fast layout algorithm for large scale networks2009

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto, T.B., Nagasaki, M., Kojima, K., Miyano, S.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 10

      ページ: 19-19

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Gene set-based module discovery in the breast cancer transcriptome2009

    • 著者名/発表者名
      A.Niida, A.D.Smith, S.Imoto, S.Tsutsumi, H.Aburatani, M.Q.Zhang, T.kiyama
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 10

      ページ: 71-71

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Unraveling dynamic activities of autocrine pathways that control drug-response transcriptome networks2009

    • 著者名/発表者名
      Tamada, Y., Araki, H., Imoto, S., Nagasaki, M., Doi, A., Nakanishi, Y., Tomiyasu, Y., Yasuda, K., Dunmore, B., Sanders, D., Humphreys, S., Print, C., Charnock-Jones, D.S., Tashiro, K., Kuhara, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing 14

      ページ: 251-263

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Analysis of PPAR alpha-dependent and PPAR alpha-independent transcript regulation following fenofibrate treatment of human endothelial cells2009

    • 著者名/発表者名
      H.Araki, Y.Tamada, S.Imoto, et al., その他13人
    • 雑誌名

      Angiogenesis 12

      ページ: 221-229

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20650039
  • [雑誌論文] BFL : a node and edge betweenness based fast layout algorithm for large scale networks2009

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto, T.B., Nagasaki, M., Kojima, K., Miyano, S.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 10

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Gene set-based module discovery in the breast cancer transcriptome2009

    • 著者名/発表者名
      A. Niida, A.D. Smith, S. Imoto, S. Tsutsumi, H. Aburatani, M. Q. Zhang and T. Akiyama
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 10(電子ジャーナルのため頁なし)

      ページ: 71-71

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Bayesian learning of biological pathways on genomic data assimilation2008

    • 著者名/発表者名
      R. Yoshida, M. Nagasaki, R. Yamaguchi, S. Imoto, S. Miyano, T. Higuchi
    • 雑誌名

      Bioinformatics 24

      ページ: 2562-2601

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Statistical inference of transcriptional module-based gene networks from time course gene expression profiles by using state space models2008

    • 著者名/発表者名
      Hirose, O., Yoshida, R., Imoto, S., Yamaguchi, R., Higuchi, T., Charnock-Jones, D.S., Print, C., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 24(7)

      ページ: 932-942

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Predicting differences in gene regulatory systems by state space models2008

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, R., Imoto, S., Yamauchi, M., Nagasaki, M., Yoshida, R., Shimamura, T., Hatanaka, Y., Ueno, K., Higuchi, T., Gotoh, N., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 21

      ページ: 101-113

    • NAID

      130003997534

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Statistical inference of transcriptional module-based gene networks from time course gene expression profiles by using state space models2008

    • 著者名/発表者名
      O. Hirose, R. Yoshida, S. Imoto, R. Yamaguchi, T. Higuchi, D.S. Charnock-Jones, C. Print, S. Miyano
    • 雑誌名

      Bioinformatics Vol.24,No.7

      ページ: 932-942

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Estimation of nonlinear gene regulatory networks via Ll regularized NVAR from time series gene expression data2008

    • 著者名/発表者名
      Kojima, K., Fujita, A., Shi mamura, T., Imoto, S. Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 20

      ページ: 357-360

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] ExonMiner: Web service for analysis of GeneChip exon array data2008

    • 著者名/発表者名
      Numata, K., Yoshida, R., Nagasaki, M., Saito, S., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 9

      ページ: 494-494

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Partial, order-based Bayesian network learning algorithm for estimating gene networks2008

    • 著者名/発表者名
      Numata, K. Imoto, S. , Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc. IEEE Bioinformatics and Biomedicine 2008

      ページ: 357-360

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Analyzing time course gene expression data with biological and technical replicates to estimate gene networks by state space models2008

    • 著者名/発表者名
      Hirose, O., Yoshida, R., Yamaguchi, R. Imoto, S. Higuchi, T., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc. 2nd Asia International Conference on Modelling & Simulation 2

      ページ: 940-946

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Predicting differences in gene regulatory systems by state space models2008

    • 著者名/発表者名
      R. Yamaguchi, S. Imoto, M. Yamauchi, M. Nagasaki, R. Yoshida, T. Shimamura, Y. Hatanaka, K. Ueno, T. Higuchi, N. Gotoh, S. Miyano
    • 雑誌名

      Genome Informatics Vol.21

      ページ: 101-113

    • NAID

      130003997534

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Predicting differences in gene regulatory systems by state space models2008

    • 著者名/発表者名
      R. Yamaguchi, S. Imoto, et al.
    • 雑誌名

      Genome Informatics Vol. 21

      ページ: 101-113

    • NAID

      130003997534

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Estimation of nonlinear gene regulatory networks via L1 regularized NVAR from time series gene expression data2008

    • 著者名/発表者名
      K. Kojima, A. Fujita, T. Shimamura, S. Imoto, S. Miyano
    • 雑誌名

      Genome Informatics Vol. 20

      ページ: 37-51

    • NAID

      130003997510

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Statistical inference of transcriptional module-based gene networks from time course gene expression profiles by using state space models2008

    • 著者名/発表者名
      O. Hirose, R. Yoshida, S. Imoto, R. Yamaguchi, T. Higuchi, D. S. Charnock-Jones, C. Print, S. Miyano
    • 雑誌名

      Bioinformatics Vol. 24, No.7

      ページ: 932-942

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Bayesian learning of biological pathways on genomic data assimilation2008

    • 著者名/発表者名
      R. Yoshida, M. Nagasaki, R. Yamaguchi, S. Imoto, S. Miyano, T. Higuchi
    • 雑誌名

      Bioinformatics Vol.24, No.22

      ページ: 2592-2601

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Finding optimal Bayesian network given a super-structure2008

    • 著者名/発表者名
      E. Perrier, S. Imoto, S. Miyano
    • 雑誌名

      Journal of Machine Learning Research Vol.9

      ページ: 2251-228

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Bayesian learning of biological pathways on genomic data assimilation2008

    • 著者名/発表者名
      R. Yoshida, M. Nagasaki, R. Yamaguchi, S. Imoto, S. Miyano, T. Higuchi
    • 雑誌名

      Bioinformatics Vol.24,No.22

      ページ: 592-2601

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Bayesian learning of biological pathways on genomic data assimilation2008

    • 著者名/発表者名
      R.Yoshida, M.Nagasaki, R.Yamaguchi, S.Imoto, S.Miyano, T.Higuchi
    • 雑誌名

      Bioinformatics 24(22)

      ページ: 2592-2601

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [雑誌論文] Partial order-based Bayesian network learning algorithm for estimating gene networks2008

    • 著者名/発表者名
      K. Numata, S. Imoto, S. Miyano
    • 雑誌名

      Proc. IEEE Bioinformatics and Biomedicine

      ページ: 357-360

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Predicting differences in gene regulatory systems by state space models2008

    • 著者名/発表者名
      R. Yamaguchi, S. Imoto, M, Yamauchi, M. Nagasaki, R. Yosida, T. Shimamura, Y. Hatanaka, K. Ueno, T. Higuchi, N. Gotoh, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 21

      ページ: 101-113

    • NAID

      130003997534

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20650039
  • [雑誌論文] Estimation of nonlinear gene regulatory networks via L1 regularized NVAR from time series gene expression data2008

    • 著者名/発表者名
      K. Kojima, A. Fujita, T. Shimamura, S. Imoto, S. Miyano
    • 雑誌名

      Genome Informatics Vol.20

      ページ: 37-51

    • NAID

      130003997510

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Finding optimal Bayesian network given a super-structure2008

    • 著者名/発表者名
      E. Perrier, S. Imoto, S. Miyano
    • 雑誌名

      Journal of Machine Learning Research Vol. 9

      ページ: 2251-2286

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Finding optimal Bayesian network given a super-structure2008

    • 著者名/発表者名
      E. Perrier, S. Imoto, S. Miyano
    • 雑誌名

      Journal of Machine Learning Research 9

      ページ: 2251-2286

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20650039
  • [雑誌論文] Estimation of nonlinear gene regulatory networks via L1 regularized NVAR from time series gene expression data2008

    • 著者名/発表者名
      Kojima, K., Fujita, A., Shimamura, T., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 20

      ページ: 37-51

    • NAID

      130003997510

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Predicting differences in gene regulatory systems by state space models2008

    • 著者名/発表者名
      R. Yamaguchi, S. Imoto, M. Yamauchi, M. Nagasaki, R. Yoshida, T. Shimamura, Y. Hatanaka, K. Ueno, T. Higuchi, N. Gotoh, S. Miyano
    • 雑誌名

      Genome Informatics 21:

      ページ: 101-113

    • NAID

      130003997534

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Statistical inference of transcriptional module-based gene networks from time course gene expression profiles by using state space models2008

    • 著者名/発表者名
      Hirose, O., Yoshida, R., Imoto, S. Yamaguchi, R. Higuchi, T., Charnock Jones, D. S. Print, C. Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 24(7)

      ページ: 932-942

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Finding module-based gene networks with state-space models? Mining high-dimensional and short time-course gene expression data.2007

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, R., Yoshida, T., Imoto, S., Higuchi, T., Miyano, S.
    • 雑誌名

      IEEE Signal Processing Magazine. 24(1)

      ページ: 37-46

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] A structure learning algorithm for inference of gene networks from microarray gene express ion data using Bayesian networks2007

    • 著者名/発表者名
      Numata, K., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc. IEEE 7th International Symposium on Bioinformatics & Bioengineering 7

      ページ: 1280-1284

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Statistical absolute evaluation of gene ontology terms with gene expression data2007

    • 著者名/発表者名
      P.K. Gupta, R. Yoshida, S. Imoto, R. Yamaguchi and S. Miyano
    • 雑誌名

      Lecture Note in Bioinformatics 4463

      ページ: 146-157

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Identification of activated transcription factors from microarray gene expression data of Kampo-medicine treated mice2007

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, R., Yamamoto, M., Imoto, S., Nagasaki, M., Yoshida, R., Tsujii, K., Ishiga, A., Asou, H., Watanabe, K., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 18

      ページ: 119-129

    • NAID

      130003812136

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Understanding endothelial cell apoptosis:What can the transcriptome glycome and proteome reveal?2007

    • 著者名/発表者名
      Affara, M., Dunmore, B., Savoie, CJ., Imoto, S., Tamada, Y., Araki, H., Charnock-Jones, D.S., Miano, S., Print, C.
    • 雑誌名

      Philosophical Transactions of Royal Society B 362(1484)

      ページ: 1469-1487

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Identification of activated transcription factors from microarray gene expression data of Kampo-medicine treated mice2007

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, R., Yamamoto, M., Imoto, S., Nagasaki, M. Ybshida, R., Tsujii, K., Ishiga, A., Asou, H., Watanabe, K., Miano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 18

      ページ: 119-129

    • NAID

      130003812136

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Understanding endothelial cell apoptosis : What can the transcriptome glycome and proteome reveal2007

    • 著者名/発表者名
      Affara, M., Dunmore, B., Savoie, C.J., Imoto, S., Tamada, Y., Araki, H., Charnock-Jones, D.S., Miyano, S., Print, C.
    • 雑誌名

      Philosophical Transactions of Royal Society 362(1484)

      ページ: 1469-1487

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] グラフマイニングとその統計的モデリングへの応用2007

    • 著者名/発表者名
      鷲尾隆, 樋口知之, 井元清哉, 玉田嘉紀, 佐藤健, 元田浩
    • 雑誌名

      予測と発見 Vol.54,No.2

      ページ: 315-331

    • NAID

      120006019046

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Computational discovery of aberrant splice variations with genome-wide exon expression profiles2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, R., Numata, K., Imoto, S., Nagasaki, M., Doi, A., Ueno, K., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc. IEEE 7th International Symposium on Bioinformatics & Bioengineering 7

      ページ: 715-722

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Weighted lasso in graphical Gaussian modeling for large gene network estimation based on microarray data2007

    • 著者名/発表者名
      T. Shimamura, R. Yamaguchi, S. Imoto and S. Miyano
    • 雑誌名

      Genome Informatics 19

      ページ: 142-153

    • NAID

      130003812157

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Statistical absolute evaluation of gene ontology terms with gene expression data2007

    • 著者名/発表者名
      Gupta, P.K., Yoshida, R., Imoto, S., Yamaguchi, R., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Bioinformatics 4463

      ページ: 146-157

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Clustering with time course gene expression profiles and the mixture of state space models2007

    • 著者名/発表者名
      Hirose. O., Yoshida, R., Yamaguchi, R., Imoto, S., Higuchi, T., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 18

      ページ: 258-266

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Finding module-based gene networks with state-space models-Mining high-dimensional and short time-course gene expression data, Special Issue on Signal Processing Methods in Genomics and Proteomics2007

    • 著者名/発表者名
      R. Yamaguchi, R. Yoshida, S. Imoto, T. Higuchi, S. Miyano
    • 雑誌名

      IEEE Signal Processing Magazine Vol.24,No.1

      ページ: 37-46

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [雑誌論文] Analysis of gene networks for drug target discovery and validation2007

    • 著者名/発表者名
      Imoto, S., Tamada, Y., Savoie, C.J., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology 360

      ページ: 33-56

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Clustering with time course gene expression profiles and the mixture of state space models2007

    • 著者名/発表者名
      Hirose, O., Yoshida, R., Yamaguchi, R., Imoto, S., Higuchi, T., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 18

      ページ: 258-266

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Finding module-based gene networks with state-space models? Mining high-dimensional and short time-course gene expression data2007

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, R., Yoshida, T., Imoto, S., Higuchi, T., Miyano, S.
    • 雑誌名

      IEEE Signal Processing Magazine 24・1

      ページ: 37-46

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] ArrayCluster: an analytic tool for clustering, data visualization and module finder on gene expression profiles2006

    • 著者名/発表者名
      R. Yoshida, T. Higuchi, S. Imoto, S. Miyano
    • 雑誌名

      Bioinformatics 22

      ページ: 1538-1539

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] ArrayCluster : an analytic tool for clustering, data visualization and module finder on gene expression profiles2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, R., Higuchi, T., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 22・12

      ページ: 1538-1539

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] ArrayCluster: an analytic tool for clustering, data visualization and module finder on gene expression profiles2006

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, R., Higuchi, T., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 22(12)

      ページ: 1538-1539

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Statistical model selection method to analyze combinatorial effects of SNPs and environmental factors for binary disease2006

    • 著者名/発表者名
      R.Nakamichi, S.Imoto, S.Miyano
    • 雑誌名

      International Journal on Artificial Intelligence Tools 15・5

      ページ: 711-724

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Estimating gene networks from gene expression data utilizing biological information2006

    • 著者名/発表者名
      Tamada, Y., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proceedings of The Institute of Statistical Mathematics 54(2)

      ページ: 333-356

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Error tolerant model for incorporating biological knowledge with expression data in estimating gene networks Statistical Methodology2006

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto, T.Higuchi, T.Goto, S.Miyano
    • 雑誌名

      Statistical Methodology 3

      ページ: 1-16

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Genomic Data Assimilation for Estimating Hybrid Functional Petri Net from Time-course Gene Expression Data2006

    • 著者名/発表者名
      M. Nagasaki, R. Yamaguchi, R. Yoshida, S. Imoto, A. Doi, Y. Tamada, H. Matsuno, S. Miyano, T. Higuchi
    • 雑誌名

      Genome Informatics(IBSB2006) 17, (1)

      ページ: 46-61

    • NAID

      130003812105

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Genomic data assimilation for estimating hybrid functional Petri net from time-course gene expression data2006

    • 著者名/発表者名
      Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Yoshida, R., Imoto, S., Doi, A., Tamada, Y., Matsuno, H., Miyano, S., Higuchi, T.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 17(1)

      ページ: 46-61

    • NAID

      130003812105

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Analysis of Gene Networks for Drug Target Discovery and Validation2006

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto, Y.Tamada, C.J.Savoie, S.Miyano
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology 360・1

      ページ: 33-56

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Error tolerant model for incorporating biological knowledge with expression data in estimating gene networks2006

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto, T.Higuchi, T.Goto, S.Miyano
    • 雑誌名

      Statistical Methodology 3・1

      ページ: 1-16

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Genomic data assimilation for estimating hybrid functional Petri net from time-course gene expression data2006

    • 著者名/発表者名
      Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Yoshida, R., Imoto, S., Doi, A., Tamada, Y., Matsuno, H., Miyano, S., Higuchi, T.
    • 雑誌名

      Genome Informatics 17・1

      ページ: 46-61

    • NAID

      130003812105

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] ArrayCluster : an analytic tool for clustering, data visualization and module finder on gene expression profiles2006

    • 著者名/発表者名
      R.Yoshida, T.Higuchi, S.Imoto, S.Miyano
    • 雑誌名

      Bioinformatics 22・12

      ページ: 1538-1539

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Utilizing heterogeneous genomic data to estimate gene networks2006

    • 著者名/発表者名
      Tamada, Y., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proceedings of The Institute of Statistical Mathematics 54・2

      ページ: 315-332

    • NAID

      120006019063

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300097
  • [雑誌論文] Genomic data assimilation for estimating hybrid functional petri net from time-course gene expression data2006

    • 著者名/発表者名
      M.Nagasaki, R.Yamaguchi, R.Yoshida, S.Imoto, A.Doi, Y.Tamada, H.Matsuno, S.Miyano, T.Higuchi
    • 雑誌名

      Genome Informatics 17・1

      ページ: 46-61

    • NAID

      130003812105

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Error tolerant model for incorporating biological knowledge with expression data in estimating gene networks Statistical Methodology2006

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto, T.Higuchi, T.Goto, S. Miyano
    • 雑誌名

      Statistical Methodology 3

      ページ: 1-16

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Estimating gene regulatory networks and protein-protein interactions of Saccharomyces cerevisiae from multiple genome-wide data2005

    • 著者名/発表者名
      Nariai, N., Tamada, Y., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 21・Suppl 2

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300099
  • [雑誌論文] Estimating gene regulatory networks and protein-protein interactions of Saccharomyces cerevisiae from multiple genome-wide data2005

    • 著者名/発表者名
      N.Nariai, Y.Tamada, S.Imoto, S.Miyano
    • 雑誌名

      Bioinformatics 21・S2

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] A Penalized Likelihood Estimation on Transcriptional Module-based Clustering2005

    • 著者名/発表者名
      R.Yoshida, S.Imoto, T.Higuchi
    • 雑誌名

      Proceedings of 2005 International Workshop on Data Mining and Bioinformatics 3482

      ページ: 389-401

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Utilizing evolutionary information and gene expression data for estimating gene networks with Bayesian network models2005

    • 著者名/発表者名
      Tamada, Y., Bannai, H., Imoto, S., Katayama, T., Kanehisa, M., Miyano, S.
    • 雑誌名

      J.Bioinformatics and Computational Biology 3・6

      ページ: 1295-1313

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Estimating gene networks from expression data and binding location data via boolean networks2005

    • 著者名/発表者名
      O.Hirose, N.Nariai, Y.Tamada, H.Bannai, S.Imoto, S.Miyano
    • 雑誌名

      Lecture Note in Comupter Science 3482

      ページ: 349-356

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Estimating gene regulatory networks and protein-protein interactions of Saccharomyces cerevisiae from multiple genome-wide data2005

    • 著者名/発表者名
      Nariai, N., Tamada, Y., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics. 21

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300099
  • [雑誌論文] Estimating Time-Dependent Gene Networks from Time Series Microarray Data by Dynamic Linear Models with Markov Switching2005

    • 著者名/発表者名
      R.Yoshida, S. Imoto, T. Higuchi
    • 雑誌名

      Proceedings of Computational Systems Bioinformatics Conference(CSB2005)

      ページ: 289-298

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Estimating gene regulatory networks and protein-protein interactions of Saccharomyces cerevisiae from multiple genom-wide data2005

    • 著者名/発表者名
      Nariai, N., Tamada, Y., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 21・Suppl2

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Gene networks : estimation, modeling and simulation2005

    • 著者名/発表者名
      Imoto, S., Matsuno, H., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Computational Systems Biology(R.Eils and A.Kriete (Eds.))(Academic Press)

      ページ: 205-228

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300099
  • [雑誌論文] A penalized likelihood estimation on transcriptional module-based clustering2005

    • 著者名/発表者名
      R.Yoshida, S.Imoto, T.Higuchi
    • 雑誌名

      Lecture Note in Comupter Science 3482

      ページ: 389-401

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Utilizing evolutionary information and gene expression data for estimating gene networks with Bayesian network models2005

    • 著者名/発表者名
      Tamada, Y., Bannai, H., Imoto, S., Katayama, T., Kanehisa, M., Miyano, S.
    • 雑誌名

      J. Bioinformatics and Computational Biology 3(6)

      ページ: 1295-1313

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Estimating time-dependent gene networks from time series microarray data by dynamic linear models with Markov switching2005

    • 著者名/発表者名
      R.Yoshida, S.Imoto, T.Higuchi
    • 雑誌名

      Computational Systems Bioinformatics 4

      ページ: 289-298

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] A Penalized Likelihood Estimation on Transcriptional Module-based Clusterintg2005

    • 著者名/発表者名
      R.Yoshida, S. Imoto, T. Higuchi
    • 雑誌名

      Proceedings of 2005 International Workshop on Data Mining and Bioinformatics 3482

      ページ: 389-401

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Estimating gene networks from expression data and binding location data via Boolean networks2005

    • 著者名/発表者名
      Hirose, O., Nariai, N., Tamada, Y., Bannai, H., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Computer Science. 3482

      ページ: 349-356

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Identifying drug active pathways from gene networks estimated by gene expression data2005

    • 著者名/発表者名
      Y.Tamada, S.Imoto, K.Tashiro, S.Kuhara, S.Miyano
    • 雑誌名

      Genome Informatics 16・1

      ページ: 182-191

    • NAID

      130003997387

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Residual Bootstrapping and Median Filtering for Robust Estimation of Gene Networks from Microarray Data2005

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto, T.Higuchi, S.Kim, E.Jeong, S.Miyano
    • 雑誌名

      Proceedings of Computational Methods in Systems Biology 3082

      ページ: 149-160

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Residual Bootstrapping and Median Filtering for Robust Estimation of Gene Networks from Microarray Data2005

    • 著者名/発表者名
      S. Imoto, T. Higuchi, S. Kim, E. Jeong, S. Miyano
    • 雑誌名

      Proceedings of Computational Methods in Systems Biology 3082

      ページ: 149-160

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Estimating Time-Dependent Gene Networks from Time Series Microarray Data by Dynamic Linear Models with Markov Switching2005

    • 著者名/発表者名
      R.Yoshida, S.Imoto, T.Higuchi
    • 雑誌名

      Proceedings of Computational Systems Bioinformatics Conference (CSB2005)

      ページ: 289-298

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [雑誌論文] Utilizing evolutionary information and gene expression data for estimating gene regulations with Bayesian network models2005

    • 著者名/発表者名
      Y.Tamada, H.Bannai S.Imoto, T.Katayama, M.Kanehisa, S.Miyano
    • 雑誌名

      Journal of Bioinformatics and Computational Biology 3・6

      ページ: 1295-1313

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [雑誌論文] Estimating gene regulatory networks and protein-protein interactions of Saccharomyces cerevisiae from multiple genome-wide data2005

    • 著者名/発表者名
      Nariai, N., Tamada, Y., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 21

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017008
  • [雑誌論文] Estimating gene regulatory networks and protein-protein interactions of Saccharomyces cerevisiae from multiple genome-wide data2005

    • 著者名/発表者名
      Nariai, N., Tamada, Y., Imoto, S., hliyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 21

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300099
  • [雑誌論文] Residual bootstrapping and median filtering for robust estimation of gene networks from microarray data2005

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto et al.
    • 雑誌名

      Lecture Note in Bioinformatics 3082

      ページ: 149-160

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15700231
  • [雑誌論文] Predicting the operon structure of Bacillus subtilis using operon length, intergene distance, and gene expression information2004

    • 著者名/発表者名
      De Hoon, M.J., Imoto, S., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing 9

      ページ: 276-287

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Open source clustering software2004

    • 著者名/発表者名
      De Hoon, M.J.L., Imoto, S., Nolan, J., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics. 20(9)

      ページ: 1453-1454

    • NAID

      130003997165

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Using protein-protein interactions for refining gene networks estimated from microarray data by Bayesian networks2004

    • 著者名/発表者名
      Nariai, N., Kim, S., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing. 9

      ページ: 336-347

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Dynamic Bayesian network and nonparametric regression for nonlinear modeling of gene networks from time series gene expression data2004

    • 著者名/発表者名
      Kim, S., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Biosystems 75(1-3)

      ページ: 57-65

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Combining microarrays and biological knowledge for estimating gene networks via Bayesian networks2004

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto et al.
    • 雑誌名

      Journal of Bioinformatics and Computational Biology 2(1)

      ページ: 77-98

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15700231
  • [雑誌論文] Functional discrimination analysis for time-series gene expression data via radial basis function expansion2004

    • 著者名/発表者名
      Y.Araki, S.Konishi, S.Imoto
    • 雑誌名

      Proc.COMPSTAT 2004

      ページ: 613-620

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15700231
  • [雑誌論文] Dynamic Bayesian network and nonparametric regression for nonlinear modeling of gene networks from time series gene expression data2004

    • 著者名/発表者名
      Kim, S., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Biosystems. 75(1-3)

      ページ: 57-65

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Combining microarrays and biological knowledge for estimating gene networks via Bayesian networks2004

    • 著者名/発表者名
      Imoto, S.., Higuchi, T., Goto, T., Tashiro, K., Kuhara, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 2(1)

      ページ: 77-98

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Bayesian network and radial basis function network regression for nonlinear modeling of genetic network2004

    • 著者名/発表者名
      Ando, T., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc. Third International Conference on Information 3

      ページ: 561-564

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Predicting the operon structure of Bacillus subtilis using operon length, intergene distance, and gene expression information2004

    • 著者名/発表者名
      De Hoon, M.J., Imoto, S., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing. 9

      ページ: 276-287

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Functional data analysis of the dynamics of gene regulatory networks2004

    • 著者名/発表者名
      Ando, T., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc. Knowledge Exploration in Life Science Informatics KELSI2004. Lecture Notes in Artificial Intelligence 3303

      ページ: 69-83

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Using protein-protein interactions for refining gene networks estimated from microarray data by Bayesian networks2004

    • 著者名/発表者名
      Nariai, N., Kim, S., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing 9

      ページ: 336-347

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300099
  • [雑誌論文] Functional data analysis of the dynamics of gene regulatory networks2004

    • 著者名/発表者名
      Ando, T., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc. Knowledge Exploration in Life Science Informatics KELSI2004. Lecture Notes in Artificial Intelligence. 3303

      ページ: 69-83

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Predicting gene regulation by sigma factors in Bacillus subtilis from genome-wide data2004

    • 著者名/発表者名
      De Hoon, M.J.L., Makita, Y., Imoto, S., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Nakai, K., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 20 (Suppl.1)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] A mixed factors model for dimension reduction and extraction of a group structure in gene expression data2004

    • 著者名/発表者名
      R.Yoshida, T.Higuchi, S.Imoto
    • 雑誌名

      Proc.3rd IEEE Computational Systems Bioinformatics

      ページ: 161-172

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15700231
  • [雑誌論文] Using protein-protein interactions for refining gene networks estimated from microarray data by Bayesian networks2004

    • 著者名/発表者名
      Nariai, N., Kim, S., Imoto, S., Miyano S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing 9

      ページ: 336-347

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Bayesian network and radial basis function network regression for nonlinear modeling of genetic network2004

    • 著者名/発表者名
      Ando, T., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc. Third International Conference on Information.

      ページ: 561-564

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Combining microarrays and biological knowledge for estimating gene networks via Bayesian networks2004

    • 著者名/発表者名
      Imoto, S., Higuchi, T., Goto, T., Tashiro, K., Kuhara, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      J.Bioinformatics and Computational Biology 2・1

      ページ: 77-98

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Finding optimal models for small gene networks2004

    • 著者名/発表者名
      Ott, S., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing 9

      ページ: 557-567

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Open source clustering software2004

    • 著者名/発表者名
      De Hoon, M.J.L., Imoto, S., Nolan, J., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 20(9)

      ページ: 1453-1454

    • NAID

      130003997165

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Finding optimal models for small gene networks2004

    • 著者名/発表者名
      Ott, S., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing. 9

      ページ: 557-567

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Functional data analysis of the dynamics of gene regulatory networks2004

    • 著者名/発表者名
      Ando, T., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Artificial Intelligence 3303

      ページ: 69-83

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Combining microarrays and biological knowledge for estimating gene networks via Bayesian networks2004

    • 著者名/発表者名
      Imoto, S., Higuchi, T., Goto, T., Tashiro, K., Kuhara, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Journal of Bioinformatics and Computational Biology 2(1)

      ページ: 77-98

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Using protein-protein interactions for refining gene networks estimated from microarray data by Bayesian networks.2004

    • 著者名/発表者名
      Nariai, N., Kim, S., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing. 9

      ページ: 336-347

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300099
  • [雑誌論文] Predicting gene regulation by sigma factors in Bacillus subtilis from genome-wide data2004

    • 著者名/発表者名
      De Hoon, M.J.L., Makita, Y., Imoto, S., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Nakai, K., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics. 20 (Supp1.1)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Bayesian information criteria and smoothing parameter selection in radial basis function networks2004

    • 著者名/発表者名
      S.Konishi, T.Ando, S.Imoto
    • 雑誌名

      Biometrika 91(1)

      ページ: 27-43

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15700231
  • [雑誌論文] Inferring gene networks from time series microarray data using dynamic Bayesian networks2003

    • 著者名/発表者名
      Kim, S., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics 4(3)

      ページ: 228-235

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Inferring gene regulatory networks from time-ordered gene expression data of Bacillus subtilis using differential equations2003

    • 著者名/発表者名
      De Hoon, M., Imoto, S., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing. 8

      ページ: 17-28

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Inferring gene regulatory networks from time-ordered gene expression data of Bacillus subtilis using differential equations2003

    • 著者名/発表者名
      De Hoon, M., Imoto, S., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Pacific Symposium on Biocomputing 8

      ページ: 17-28

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Bayesian network and nonparametric heteroscedastic regression for nonlinear modeling of genetic network2003

    • 著者名/発表者名
      Imoto, S., Kim, S., Goto, T., Aburatani, S., Tashiro, K., Kuhara, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Journal of Bioinformatics and Computational Biology 1(2)

      ページ: 231-252

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Estimating gene networks from gene expression data by combining Bayesian network model with promoter element detection2003

    • 著者名/発表者名
      Tamada, Y., Kim, S., Bannai, H., Imoto, S., Tashiro, K., Kuhara, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics 19 (Suppl. 2)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Inferring gene networks from time series microarray data using dynamic Bayesian networks2003

    • 著者名/発表者名
      Kim, S., Imoto, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics. 4(3)

      ページ: 228-235

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Bayesian network and nonparametric heteroscedastic regression for nonlinear modeling of genetic network2003

    • 著者名/発表者名
      Imoto, S., Kim, S., Goto, T., Aburatani, S., Tashiro, K., Kuhara, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 1(2)

      ページ: 231-252

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Estimating gene networks from gene expression data by combining Bayesian network model with promoter element detection2003

    • 著者名/発表者名
      Tamada, Y., Kim, S., Bannai, H., Imoto, S., Tashiro, K., Kuhara, S., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics. 19(Supp1.2)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15014205
  • [雑誌論文] Mixed factors analysis: Unsupervized statistical discrimination with kernel feature extraction2000

    • 著者名/発表者名
      R. Yoshida, T. Higuchi, S. Imoto, S. Miyano
    • 雑誌名

      Proceedings of The International Workshop on Data-Mining and Statistical Science (DMSS2007) No.25

      ページ: 71-88

    • NAID

      130008079498

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [学会発表] Human Genomics and Metagenomics for Creating Future Medicine2023

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      Science Forum Microsoft Research AI4Science
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [学会発表] Metagenomics: a Paradigm Shift in Health/Medical Care2022

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      RIEC International Symposium
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [学会発表] Prediction of specific pathways in high grade fetal lung adenocarcinoma using gene network analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Rika Kasajima, Masaki Suzuki,Eigo Shimizu, Yoshinori Tamada, Atsushi Niida, Rui Yamaguchi, Yoichi Furukawa, Satoru Miyano, Seiya Imoto,Tomoyuki Yokose, Yohei Miyagi
    • 学会等名
      第80回日本癌学会学術総会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K09068
  • [学会発表] Metagenome Analysis Leads a Paradigm Shift in Health/Medical Care2021

    • 著者名/発表者名
      井元清哉
    • 学会等名
      日本免疫学会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03538
  • [学会発表] Cancer Immunogenomics Analysis of ICGC/PCAWG2018

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      The 77th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [学会発表] Immuno-genomics pancancer landscape reveals diverse immune escape mechanisms and immune-editing histories2018

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      Biomedical Sciences in the Era of Big Data
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H03328
  • [学会発表] Immuno-Genomic Landscape of PanCancer2017

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      The 13th ICGC Scientific Workshop
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H02775
  • [学会発表] がん免疫ゲノムの計算科学的解析2017

    • 著者名/発表者名
      井元清哉
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H02775
  • [学会発表] コグニティブ・コンピューティングの造血器腫瘍臨床シーケンスへの試験的導入2016

    • 著者名/発表者名
      横山和明、遊佐 希、伊藤美香、小林真之、小川弥穂、竹田玲奈、武井智美、越智清純、川俣豊隆、小沼貴晶、加藤せい子、清水英悟、小山尚彦、大野伸広、高橋聡、内丸薫、山口 類、井元清哉、古川洋一、宮野 悟、東條有伸
    • 学会等名
      第78回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-10-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280105
  • [学会発表] MYD88 L265P Mutated Splenic Marginal Zone Lymphoma associated with Cold Agglutinin Disease2016

    • 著者名/発表者名
      越智清純、横山和明、遊佐 希、伊藤美香、小林真之、小川弥穂、竹田玲奈、武井智美、川俣豊隆、福山朋房、大野伸広、高橋聡、山口 類、内丸薫、井元清哉、古川洋一、宮野 悟、東條有伸
    • 学会等名
      第78回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-10-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280105
  • [学会発表] Computational Methods for Cancer Immunogenomics2016

    • 著者名/発表者名
      井元清哉
    • 学会等名
      The 25th KOGO Annual Conference
    • 発表場所
      ソウル、韓国
    • 年月日
      2016-09-05
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H02775
  • [学会発表] WASPの一アミノ酸変異に起因するX連鎖重症好中球減少症の本邦第一例2016

    • 著者名/発表者名
      小林真之、横山和明、遊佐 希、川俣豊隆、大野伸広、清水英悟、山口 類、井元清哉、古川洋一、宮野 悟、東條有伸
    • 学会等名
      第78回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-10-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280105
  • [学会発表] がんゲノムビッグデータ解析から生命科学・医療へ2015

    • 著者名/発表者名
      井元清哉
    • 学会等名
      第9回スーパーコンピュータ「京」と創薬・医療の産学連携セミナー
    • 発表場所
      ステーションコンファレンス東京501(東京都千代田区)
    • 年月日
      2015-12-18
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H02775
  • [学会発表] Bayesian Method for HLA Genotyping from Whole-Genome Sequencing Data2015

    • 著者名/発表者名
      Shuto Hayashi, Rui Yamaguchi, Shinichi Mizuno, Mitsuhiro Komura, Satoru Miyano, Hidewaki Nakagawa, Seiya Imoto
    • 学会等名
      2015 International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology
    • 発表場所
      Boston, USA
    • 年月日
      2015-07-19
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H02775
  • [学会発表] Bayesian Method for HLA Genotyping from Whole-Genome Sequencing Data2015

    • 著者名/発表者名
      Hayashi, S., Yamaguchi, R., Mizuno, S., Komura, M., Miyano, S., Nakagawa, H., Imoto, S.
    • 学会等名
      2015 International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology
    • 発表場所
      Boston (U.S.A.)
    • 年月日
      2015-07-21
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H01678
  • [学会発表] がんゲノムビッグデータ解析から生命科学・医療へ2015

    • 著者名/発表者名
      井元清哉
    • 学会等名
      第9回スーパーコンピュータ「京」と創薬・医療の産学連携セミナー
    • 発表場所
      ステーションコンファレンス東京(東京都千代田区)
    • 年月日
      2015-12-18
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H01678
  • [学会発表] 個別化医療時代の漢方2014

    • 著者名/発表者名
      井元清哉
    • 学会等名
      NPO健康医療開発機構 第7回シンポジウム
    • 発表場所
      学士会館, 東京都
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300111
  • [学会発表] インフルエンザ介入政策における集団免疫を高めるワクチン接種対象群の選択2012

    • 著者名/発表者名
      斎藤正也、井元清哉、山口類、坪倉正治、上昌広、中田はる佳、佐藤弘樹、宮野悟、樋口知之
    • 学会等名
      統計関連学会連合大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143
  • [学会発表] NetworkProfiler: UncoveringCancer Heterogeneity in TranscriptomeData2011

    • 著者名/発表者名
      Imoto S
    • 学会等名
      The 4th International Conference of the ERCIM WG on COMPUTING & STATISTICS
    • 発表場所
      London, UK
    • 年月日
      2011-12-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300099
  • [学会発表] NetworkProfiler : Uncovering Cancer Heterogeneity in Transcriptome Data2011

    • 著者名/発表者名
      Imoto S
    • 学会等名
      The 4th International Conference of the ERCIMWG on COMPUTING & STATISTICS
    • 発表場所
      London, UK(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300099
  • [学会発表] Estimation of macroscopic parameter in agent-based pandemic simulation2011

    • 著者名/発表者名
      M. Saito, S. Imoto, R. Yamaguchi, S. Miyano, T. Higuchi
    • 学会等名
      13th International Conference on Information Fusion
    • 発表場所
      シカゴ、米国
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143
  • [学会発表] 統計科学と実験システム生物学の融合が実現するバイオマーカー探索2010

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      第25回システムバイオロジー研究会
    • 発表場所
      理研横浜
    • 年月日
      2010-01-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20650039
  • [学会発表] Transcriptomic Network Comparison Unravels Key Differences in Gene Regulatory Networks Characterizing Cell Conditions2010

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto
    • 学会等名
      Probability and Statistics with Applications in Systems Biology (招待講演)
    • 発表場所
      Taiwan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [学会発表] Statistical Modeling of Dynamic Gene Networks in Cancer2010

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      Winter School in Mathematical and Computational Biology
    • 発表場所
      オーストラリア、クイーンズランド大学
    • 年月日
      2010-07-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [学会発表] Constraint Optimal 5earch on Learning Bayesian Network Structure2010

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      The 1st International Workshop on Advanced Methodologies for Bayesian Networks
    • 発表場所
      東京キャンパスイノベーションセンター
    • 年月日
      2010-11-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20650039
  • [学会発表] Statistical Modeling of Dynamic Gene Networks in Cancer2010

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto
    • 学会等名
      Winter School in Mathematical and Computational Biology (招待講演)
    • 発表場所
      University of Queensland, Australia
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [学会発表] Computational Biomarker Identification by Analyzing Time-Course Microarray Gene Expression Data2009

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto
    • 学会等名
      International Symposium of Case Studies involving Statistics and Operations Research for Decision Making : Solving Human Problems in Business, Society, and Scientific Areas, Institute of Mathematical Statistics (招待講演)
    • 発表場所
      Japan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [学会発表] Statistical Inference of Gene Networks for Computational Drug Target Pathway Discovery2009

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      2009 WINTER SCHOOL IN MATHEMATICAL AND COMPUTATIONAL BIOLOGY
    • 発表場所
      オーストラリア、クイ-ンズランド大学、ブリスベン
    • 年月日
      2009-07-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [学会発表] Statistical inference of gene networks for computational drug-target pathway discovery2009

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto
    • 学会等名
      Winter School in Mathematical and Computational Biology (招待講演)
    • 発表場所
      University of Queensland, Australia
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [学会発表] 独立成分分析を用いた外生的発現遺伝子同定解析2009

    • 著者名/発表者名
      十河泰弘, 清水昌平, 鷲尾隆, 井元清哉
    • 学会等名
      人工知能学会第23回全国大会(JSAI 2009)
    • 発表場所
      サンポートホール高松(香川県)
    • 年月日
      2009-06-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [学会発表] Unraveling dynamics of biological networks towards computational drug target discovery2008

    • 著者名/発表者名
      S.Imoto
    • 学会等名
      Statistical Computation and Visualization 2008 (招待講演)
    • 発表場所
      Academia Sinica, Taiwan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [学会発表] Unraveling dynamics of biological networks towards computational drug target discovery2008

    • 著者名/発表者名
      S. Imoto
    • 学会等名
      Statistical Computation and Visualization 2008
    • 発表場所
      Academia Sinica, Taiwan
    • 年月日
      2008-12-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20680016
  • [学会発表] 生命体データ同化 : 生体内パスウェイシミュレーションと計測データを融合する確率的枠組み2008

    • 著者名/発表者名
      井元 清哉
    • 学会等名
      科研費特定領域「情報統計力学の深化と展開」平成20年度公開シンポジウム(Invited)
    • 発表場所
      北海道札幌市
    • 年月日
      2008-12-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [学会発表] Predicting differences in gene regulatory systems by state space models2008

    • 著者名/発表者名
      R. Yamaguchi, S. Imoto, M. Yamauchi,M. Nagasaki, R. Yoshida, T. Shimamura, Y. Hatanaka, K. Ueno, T. Higuchi,N. Gotoh, S. Miyano
    • 学会等名
      The 19th International Conference on Genome Informatics (GIW2008)
    • 発表場所
      Gold Coast ,Australia
    • 年月日
      2008-12-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [学会発表] Temporal and Spatial Modeling in Systems Biology and Pharmacogenomics2008

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      The Applied Statistics Workshop 2008(Invited)
    • 発表場所
      Tokyo, Japan
    • 年月日
      2008-11-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [学会発表] バイオマーカー・分子標的探索のための動的ネットワークを予測する計算科学的方法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      井元清哉
    • 学会等名
      分子生物学会BMB2008シンポジュウム
    • 発表場所
      神戸ポートピアホテル
    • 年月日
      2008-12-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20650039
  • [学会発表] Unraveling dynamics of biological networks towards computational drug target discovery2008

    • 著者名/発表者名
      Seiya Imoto
    • 学会等名
      Statistical Computation and Visualization 2008 (SCV2008)(lnvited)
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan
    • 年月日
      2008-12-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [学会発表] 動的ネットワーク構造探索の計算イニシアティブ2008

    • 著者名/発表者名
      井元 清哉
    • 学会等名
      分子生物学会BMB2008シンポジウム(Invited)
    • 発表場所
      兵庫県神戸市
    • 年月日
      2008-12-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [学会発表] バイオマーカー・分子標的探索のための動的ネットワークを 予測する計算科学的方法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      井元 清哉
    • 学会等名
      分子生物学会BMB2008シンポジウム(Invited)
    • 発表場所
      兵庫県神戸市
    • 年月日
      2008-12-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [学会発表] Partial order-based Bayesian network learning algorithm for estimating gene networks2008

    • 著者名/発表者名
      K. Numata, S. Imoto, S. Miyano
    • 学会等名
      Proc. of IEEE Bioinformatics and Biomedicine 2008
    • 発表場所
      Philadelphia, Pennsylvania (USA)
    • 年月日
      2008-12-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [学会発表] Clustering with time course gene expression profiles and the mixture of state spase models2007

    • 著者名/発表者名
      O. Hirose*, R. Yoshida, R. Yamaguchi,S. Imoto, T. Higuchi, S. Miyano
    • 学会等名
      The Seventh Annual International Worksyop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB2007)
    • 発表場所
      東京大学医科学研究所
    • 年月日
      2007-08-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [学会発表] Bioinformatics approach towards drug target gene discovery2007

    • 著者名/発表者名
      井元清哉
    • 学会等名
      Regional Biometric Conference 2007
    • 発表場所
      東京大学弥生講堂
    • 年月日
      2007-12-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17680024
  • [学会発表] DIGDAG, a first algorithm to mine closed frequent embedded sub-DAGs2007

    • 著者名/発表者名
      A. Termier, Y. Tamada, K. Numata, S. Imoto, T. Washio, Tomoyuki Higuchi
    • 学会等名
      Proc. of MLG Workshop 2007, Mining and Learning with Graphs
    • 発表場所
      Firenze(Italy)
    • 年月日
      2007-08-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19200013
  • [学会発表] Genomic Data Assimilation for Estimating Hybrid Functional Petri Net from Time-course Gene Expression Data2006

    • 著者名/発表者名
      M. Nagasaki, R. Yamaguchi*, R. Yoshida, S. Imoto, A. Doi, Y. Tamada, H. Matsuno, S. Miyano, T. Higuchi
    • 学会等名
      The Sixth International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB2006)
    • 発表場所
      Boston,MA USA
    • 年月日
      2006-07-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [学会発表] Estimating Time-Dependent Gene Networks from Time Series Microarray Data by Dynamic Linear Models with Markov Switching2005

    • 著者名/発表者名
      R. Yoshida, S. Imoto, T. Higuchi*
    • 学会等名
      Computational Systems Bioinformatics Conference(CSB2005)
    • 発表場所
      Stanford, CA USA
    • 年月日
      2005-08-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17200020
  • [学会発表] インフルエンザ介入政策における集団免疫を高めるワクチン接種対象群の選択

    • 著者名/発表者名
      斎藤正也, 井元清哉, 山口類, 坪倉正治, 上昌広, 中田はる佳, 佐藤弘樹, 宮野悟, 樋口知之
    • 学会等名
      2012統計関連学会連合大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23650143
  • [学会発表] Identification of Oncogenic Co-regulators using Infinite Relational Models

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Chikahara, Atsushi Niida, Rui Yamaguchi, Seiya Imoto, Satoru Miyano
    • 学会等名
      The 15th International Conference on Systems Biology (ICSB) 2014
    • 発表場所
      メルボルン(オーストラリア)
    • 年月日
      2014-09-14 – 2014-09-18
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [学会発表] Integrated understanding for Hochuekkito on microarray expression data

    • 著者名/発表者名
      Kotoe Katayama, Kaori Munakata, Katsuaki Dan, Rui Yamaguchi ,Seiya Imoto, Kenji Watanabe, Satoru Miyano
    • 学会等名
      Pacific Symposium on Biocomputing
    • 発表場所
      Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-01-04 – 2015-01-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300111
  • 1.  山口 類 (90380675)
    共同の研究課題数: 9件
    共同の研究成果数: 57件
  • 2.  宮野 悟 (50128104)
    共同の研究課題数: 8件
    共同の研究成果数: 149件
  • 3.  長崎 正朗 (90396862)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 31件
  • 4.  坂内 英夫 (20323644)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 3件
  • 5.  玉田 嘉紀 (80435495)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 11件
  • 6.  片山 琴絵 (40581195)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 1件
  • 7.  ターミエ アレックス (60435823)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 1件
  • 8.  渡 賢治 (70191757)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 2件
  • 9.  樋口 知之 (70202273)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 18件
  • 10.  吉田 亮 (70401263)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 17件
  • 11.  上野 玄太 (40370093)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 2件
  • 12.  染谷 博司 (00333518)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 13.  猪口 明博 (70452456)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  白石 友一 (70516880)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 12件
  • 15.  島村 徹平 (00623943)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 17件
  • 16.  後藤 典子 (10251448)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 6件
  • 17.  中川 英刀 (50361621)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 3件
  • 18.  笠島 理加 (20630875)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 1件
  • 19.  植松 智 (50379088)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 5件
  • 20.  植村 元秀 (40631015)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 21.  松野 浩嗣 (10181744)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 22.  川崎 能典 (70249910)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 23.  石垣 司 (20469597)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 24.  日紫喜 光良 (30324271)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 25.  鷲尾 隆 (00192815)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 26.  狩野 裕 (20201436)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 11件
  • 27.  大原 剛三 (30294127)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 28.  清水 昌平 (10509871)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 29.  河原 吉伸 (00514796)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 30.  茅野 光範 (20590095)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 31.  大海 忍 (20160046)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 32.  阿久津 達也 (90261859)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 33.  東條 有伸 (00211681)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 34.  古川 洋一 (20272560)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 5件
  • 35.  田中 廣壽 (00171794)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 36.  青嶋 誠 (90246679)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 37.  横山 和明 (00647498)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 8件
  • 38.  水野 晋一 (40569430)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 39.  PARK HEEWON (70756642)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 6件
  • 40.  新井田 厚司 (00772493)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 41.  張 耀中 (60817138)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 8件
  • 42.  山上 裕機 (20191190)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 43.  相方 浩 (30403512)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 44.  中村 透 (70645796)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 45.  二階堂 愛 (00383290)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 46.  宇野 力 (20282155)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 47.  金森 敬文 (60334546)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 48.  蛭川 潤一 (10386617)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 49.  矢田 和善 (90585803)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 50.  廣瀬 慧 (40609806)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 51.  星野 伸明 (00313627)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 52.  柳原 宏和 (70342615)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 53.  小森 理 (60586379)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 54.  竹之内 高志 (50403340)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 55.  松井 秀俊 (90633305)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 56.  植木 優夫 (10515860)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 57.  鈴木 大慈 (60551372)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 58.  廣島 幸彦 (60718021)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 59.  木村 晋也 (80359794)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 60.  石井 敬人 (90814294)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 61.  湯上 伸弘 (30417183)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 62.  宮城 洋平 (00254194)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 63.  鈴木 理樹 (00770108)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 64.  山口 貴世志 (50466843)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 65.  小林 恭 (00642406)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 66.  野々村 祝夫 (30263263)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 67.  小島 祥敬 (60305539)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 68.  寺田 直樹 (60636637)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 69.  星 誠二 (70813137)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 70.  土井 敦
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 71.  DE Hoon Michiel J.L.
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 8件
  • 72.  HOON Michiel J.I. de
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 8件
  • 73.  DE Hoon L.J.Michiel
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 8件
  • 74.  DEHOON L. J. Michiel
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 75.  池上 恒雄
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 76.  上野 昌樹
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 77.  杉本 健
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 78.  細田 文恵
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 79.  十時 泰
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 80.  佐藤 慎哉
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 81.  鷲見 公太
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 82.  松原 大祐
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 83.  村松 智輝
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 84.  藤本 明洋
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 85.  佐藤 憲明
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 86.  山本 健
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 87.  俣野 哲朗
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 88.  藤本 康介
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 3件
  • 89.  高橋 隆
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 90.  六反 一仁
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 91.  速水 晋也
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 92.  飯沼 久恵
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 93.  天野 睦紀
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 94.  柴田 龍弘
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 95.  植松 未帆
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 96.  小沼 貴晶
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 97.  村岡 大輔
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 98.  谷本 幸介
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 99.  稲澤 譲治
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

URL: 

この研究者とORCID iDの連携を行いますか?
※ この処理は、研究者本人だけが実行できます。

Are you sure that you want to link your ORCID iD to your KAKEN Researcher profile?
* This action can be performed only by the researcher himself/herself who is listed on the KAKEN Researcher’s page. Are you sure that this KAKEN Researcher’s page is your page?

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi