笠原雅弘 Kasahara Masahiro

研究者番号	60376605
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2020年度 – 2024年度: 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 2018年度: 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 2016年度 – 2018年度: 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 講師 2012年度 – 2015年度: 東京大学, 新領域創成科学研究科, 講師 2014年度: 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 講師 … もっと見る 2009年度 – 2012年度: 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 講師 2009年度: 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 特任准教授 2008年度: 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 特任助教 2005年度: 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 研究拠点形成特任教員隠す
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43060:システムゲノム科学関連 / 中区分62:応用情報学およびその関連分野 / 生命・健康・医療情報学 / 生体生命情報学 / 生物系研究代表者以外生物系 / 生物系
キーワード	研究代表者アルゴリズム / ゲノム / ロングリード / ゲノムアセンブリ / 人類遺伝学 / 関連解析 / ゲノムブラウザ / ヒトゲノム / 構造多型 / アラインメント … もっと見る / パンゲノム / グラフゲノム / 長鎖DNAシークエンサー / 植物ゲノム / 反復配列 / 染色体 / 遺伝子 / Ｈｉ－Ｃ / 配列検索 / ゲノムデータベース / 配列アラインメント / ＳＳＤ / 不揮発メモリー / ハイパフォーマンス・コンピューティング / ソフトウエア開発効率化・安定化 / ゲノム解析 / ハイパフォーマンスコンピューティング / 並列分散計算 / ゲノム科学 / パイプライン / 並列計算 / コンテナ仮想化 / 再現性 / ワークフロー / 遺伝学的地図 / ショットガン法 / ゲノムアセンブラ / 計算機システム … もっと見る研究代表者以外ゲノム / メタゲノム / エピゲノム / リシーケンシング / RNA-seq / 次世代DNAシーケンサー / 次世代シーケンサー / バイオインフォマティクス / スーパーコンピュータ / 空間的オミックス解析 / RNA解析 / ゲノム・メタゲノム / シングルセル解析 / オミックス解析 / ゲノムアノテーション / ゲノム多型 / ゲノムアッセンブル / スーパーコンピューター / メタゲノム解析 / 1細胞解析 / RNA-Seq / 新規ゲノム配列決定 / 遺伝子発現変動 / アブラムシ / ヒメツリガネゴケ / 一塩基多 / 発現定量 / トランスクリプトーム解析 / 単分子シーケンサー / ゲノムアセンブリー / 計数比較 / 遺伝学的地図 / ゲノムアセンブリ / 遺伝子発現比較 / トランスクリプトーム / アセンブリー / 次世代DNAシーケンサ / インフォームドコンセント / GWAS / 個人ゲノム / de novo配列決定 / ChIP-seq / ソフトウエア / 疾患関連遺伝子変異 / 塩基置換 / 構造多型 / パーソナルゲノム / 異常リピート配列検出 / 構造変異 / アルゴリズム / 家系解析 / 脳疾患 / エキソーム解析 / 全ゲノム解析 / ゲノムライブラリ / ハイスループット解析 / バイオテクノロジー / 配列決定 / ライブラリ / 次世代シークエンシング / 遺伝学 / 遺伝子 / ゲノム科学 / マイクロアレイ / 染色体 / ゲノム情報 / 比較ゲノム隠す

パンゲノム多様性を包摂するグラフゲノム解析エコシステムの創成研究代表者
- 研究代表者
  
  笠原雅弘
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43060:システムゲノム科学関連
- 研究機関
  東京大学
先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 研究代表者
  
  黒川顕
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2027
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成)
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
不揮発メモリーを用いたゲノム情報学の新展開研究代表者
- 研究代表者
  
  笠原雅弘
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  東京大学
植物の巨大なゲノムを解読・解析する手法研究代表者
- 研究代表者
  
  笠原雅弘
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43060:システムゲノム科学関連
- 研究機関
  東京大学
大規模ゲノム情報解析を加速する並列計算システム研究代表者
- 研究代表者
  
  笠原雅弘
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  東京大学
先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 研究代表者
  
  小原雄治
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2021
- 研究種目
  
  新学術領域研究（研究領域提案型）『学術研究支援基盤形成』
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
脳疾患パーソナルゲノム多様性を分析する情報学の創成
- 研究代表者
  
  森下真一
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2014
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学
ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援
- 研究代表者
  
  小原雄治
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2015
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
次世代DNAシークエンサーを用いたゲノム解読のためのアルゴリズム開発研究代表者
- 研究代表者
  
  笠原雅弘
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2012
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  東京大学
非モデル生物におけるゲノム解析法の確立
- 研究代表者
  
  西山智明
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2015
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  金沢大学
ポリモルフィズムに強い全ゲノムショットガン配列アセンブラの開発研究代表者
- 研究代表者
  
  笠原雅弘
- 研究期間 (年度)
  2005
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学
比較ゲノム解析による進化・多様性のゲノム基盤の解明支援
- 研究代表者
  
  藤山秋佐夫
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2009
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  国立情報学研究所

[図書] 次世代シーケンサー活用術「１分子シーケンサーを用いた非モデル生物の de novo ゲノム解読」2015
- 著者名/発表者名
  柴田朋子、笠原雅弘、重信秀治、西山智明、長谷部光泰
- 総ページ数
  212
- 出版者
  化学同人
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-221S0002
[雑誌論文] Decreased Proteasomal Function Exacerbates Endoplasmic Reticulum Stress-Induced Chronic Inflammation in Obese Adipose Tissue2024
- 著者名/発表者名
  Nakagawa S, Fukui-Miyazaki A, Yoshida T, Ishii Y, Murata E, Taniguchi K, Ishizu A, Kasahara M, Tomaru U
- 雑誌名
  
  The American Journal of Pathology
  
  巻: - 号: 6 ページ: 1033-1046
- DOI
  10.1016/j.ajpath.2024.02.007
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03758, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-23K27669
[雑誌論文] Sperm-specific histone H1 in highly condensed sperm nucleus of Sargassum horneri2024
- 著者名/発表者名
  Takeuchi Y, Sato S, Nagasato C, Motomura T, Okuda S, Kasahara M, Takahashi F, Yoshikawa S
- 雑誌名
  
  Sci Rep
  
  巻: 14 号: 1 ページ: 3387-3387
- DOI
  10.1038/s41598-024-53729-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06692, KAKENHI-PLANNED-21H05309, KAKENHI-PROJECT-22H04925
[雑誌論文] A divergent RWP-RK transcription factor determines mating type in heterothallic Closterium2023
- 著者名/発表者名
  Sekimoto, H., Komiya, A., Tsuyuki, N., Kawai, J., Kanda, N., Ootsuki, R., Suzuki, Y., Toyoda, A., Fujiyama, A., Kasahara, M., Abe, J., Tsuchikane, Y., Nishiyama, T.
- 雑誌名
  
  New Phytologist
  
  巻: 237 号: 5 ページ: 1636-1651
- DOI
  10.1111/nph.18662
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21451, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-21H02549, KAKENHI-PROJECT-19K06827, KAKENHI-PROJECT-18K19365, KAKENHI-PROJECT-19K22448, KAKENHI-PLANNED-22H05177
[雑誌論文] Further notice of omics profiles of fecal and oral microbiota change in irritable bowel syndrome patients with diarrhea and symptom exacerbation2023
- 著者名/発表者名
  Yukari Tanaka、Riu Yamashita、Junko Kawashima、Hiroshi Mori、Ken Kurokawa、Shinji Fukuda、Yasuhiro Gotoh、Keiji Nakamura、Tetsuya Hayashi、Yoshiyuki Kasahara、Yukuto Sato、Shin Fukudo
- 雑誌名
  
  Journal of Gastroenterology
  
  巻: 58 号: 4 ページ: 427-428
- DOI
  10.1007/s00535-022-01951-y
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[雑誌論文] Somatic mutation rates scale with time not growth rate in long-lived tropical trees2023
- 著者名/発表者名
  Akiko Satake、Ryosuke Imai、Takeshi Fujino、Sou Tomimoto、Kayoko Ohta、Mohammad Na’iem、Sapto Indrioko、 Widiyatno、Susilo Purnomo、Almudena Molla-Morales、Viktoria Nizhynska、Naoki Tani、Yoshihisa Suyama、Eriko Sasaki、Masahiro Kasahara
- 雑誌名
  
  eLife
  
  巻: －
- DOI
  10.7554/elife.88456.2
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[雑誌論文] NKG2D Ligand Expression Induced by Oxidative Stress Mitigates Cutaneous Ischemia-Reperfusion Injury2023
- 著者名/発表者名
  Keishi Makita、Noriyuki Otsuka、Utano Tomaru、Koji Taniguchi、Masanori Kasahara
- 雑誌名
  
  Journal of Histochemistry & Cytochemistry
  
  巻: 71 号: 2 ページ: 61-72
- DOI
  10.1369/00221554221147582
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-15K21775, KAKENHI-PROJECT-20H03758, KAKENHI-PROJECT-23K24099
[雑誌論文] The molecular clock in long-lived tropical trees is independent of growth2023
- 著者名/発表者名
  Satake, A., Imai, R., Fujino, T., Tomimoto, S., Ohta K., Na’iem, M., Indrioko, S., Widiyatno, Purnomo, S., Molla Morales, A., Nizhynska, V., Tani, N., Suyama, Y., Sasaki, E., Kasahara, M.
- 雑誌名
  
  eLife
  
  巻: 12
- DOI
  10.7554/elife.88456.1
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23KJ1722, KAKENHI-PROJECT-22H04925
[雑誌論文] Omics profiles of fecal and oral microbiota change in irritable bowel syndrome patients with diarrhea and symptom exacerbation2022
- 著者名/発表者名
  Yukari Tanaka、Riu Yamashita、Junko Kawashima、Hiroshi Mori、Ken Kurokawa、Shinji Fukuda、Yasuhiro Gotoh、Keiji Nakamura、Tetsuya Hayashi、Yoshiyuki Kasahara、Yukuto Sato、Shin Fukudo
- 雑誌名
  
  Journal of Gastroenterology
  
  巻: 57 号: 10 ページ: 748-760
- DOI
  10.1007/s00535-022-01888-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[雑誌論文] LPMX : a pure rootless composable container system2022
- 著者名/発表者名
  Xu Yang, Masahiro Kasahara
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: 23 号: 1 ページ: 112-112
- DOI
  10.1186/s12859-022-04649-3
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Inflammation-Induced Tumorigenesis and Metastasis2021
- 著者名/発表者名
  Sana Hibino, Tetsuro Kawazoe, Hidenori Kasahara, Shinji Itoh, Takatsugu Ishimoto, Mamiko Sakata-Yanagimoto and Koji Taniguchi
- 雑誌名
  
  International Journal of Molecular Sciences
  
  巻: 22 号: 11 ページ: 5421-5421
- DOI
  10.3390/ijms22115421
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19J00502, KAKENHI-PROJECT-15K21775, KAKENHI-PROJECT-16H06276, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Long-read sequencing for non-small-cell lung cancer genomes2020
- 著者名/発表者名
  Sakamoto Y, Xu L, Seki M, Yokoyama TT, Kasahara M, Kashima Y, Ohashi A, Shimada Y, Motoi N, Tsuchihara K, Kobayashi SS, Kohno T, Shiraishi Y, Suzuki A, Suzuki Y.
- 雑誌名
  
  Genome Res
  
  巻: 30 号: 9 ページ: 1243-57
- DOI
  10.1101/gr.261941.120
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K07036, KAKENHI-PROJECT-20H00545, KAKENHI-PROJECT-16K21746, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Long read sequencing for non-small cell lung cancer genomes2020
- 著者名/発表者名
  Yoshitaka Sakamoto, Liu Xu, Masahide Seki, Toshiyuki T. Yokoyama, Masahiro Kasahara, Yukie Kashima, Akihiro Ohashi, Yoko Shimada, Noriko Motoi, Katsuya Tsuchihara, Susumu S. Kobayashi, Takashi Kohno, Yuichi Shiraishi, Ayako Suzuki, Yutaka Suzuki
- 雑誌名
  
  Genome Research
- 説明
  未定 in press
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] MoMI-G: modular multi-scale integrated genome graph browser2019
- 著者名/発表者名
  Toshiyuki T. Yokoyama, Yoshitaka Sakamoto, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Masahiro Kasahara
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: 20 号: 1 ページ: 548-548
- DOI
  10.1186/s12859-019-3145-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19J21608, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Visualization tools for human structural variations identified by whole-genome sequencing2019
- 著者名/発表者名
  Toshiyuki T. Yokoyama, Masahiro Kasahara
- 雑誌名
  
  Journal of Human Genetics
  
  巻: 65 号: 1 ページ: 49-60
- DOI
  10.1038/s10038-019-0687-0
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19J21608, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Introducing difference recurrence relations for faster semi-global alignment of long sequences2018
- 著者名/発表者名
  Hajime Suzuki and Masahiro Kasahara.
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: 19 号: Suppl 1 ページ: 45-45
- DOI
  10.1186/s12859-018-2014-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] ナノポアリードのアライメントツール2018
- 著者名/発表者名
  鈴木創, 笠原雅弘
- 雑誌名
  
  実験医学
  
  巻: 36 号: 1
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Performance comparison of second- and third-generation sequencers using a bacterial genome with two chromosomes.2014
- 著者名/発表者名
  Miyamoto M, Motooka D, Gotoh K, Imai T, Yoshitake K, Goto N, Iida T, Yasunaga T, Horii T, Arakawa K, Kasahara M, Nakamura S.
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 15 号: 1 ページ: 699-699
- DOI
  10.1186/1471-2164-15-699
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25670271, KAKENHI-PROJECT-26870328, KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PLANNED-22128008
[雑誌論文] Segmental duplications in the silkworm genome.2013
- 著者名/発表者名
  Zhao Q, Zhu Z, Kasahara M, Morishita S, Zhang Z.
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 14(1) ページ: 521-521
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-221S0002
[雑誌論文] Cost-effective sequencing of full-length cDNA clones powered by a de novo-reference hybrid assembly.2010
- 著者名/発表者名
  Kuroshu RM, Watanabe J, Sugano S, Morishita S, Suzuki Y, Kasahara M.
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 5(5)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22129008
[雑誌論文] The medaka draft genome and insights into vertebrate genome evolution2007
- 著者名/発表者名
  Kasahara M, et. al. including Fujiyama, To yoda and Kuroki
- 雑誌名
  
  Nature 447
  
  ページ: 714-719
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018030
[学会発表] For the development of a PCR primer design pipeline for detection of contamination in foods2023
- 著者名/発表者名
  Yoritaka Harazono、Keisuke Soga、Masahiro Kasahara
- 学会等名
  Genome Informatics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] スギ（Cryptomeria japonica D. Don）の全ゲノム配列の決定2023
- 著者名/発表者名
  藤野　健・山口勝司・横山稔之・濵中俊哉・原薗陛正・鎌田寛彬・小林航・伊原徳子・内山憲太郎・松本麻子・伊津野彩子・津村義彦・豊田敦・重信秀治・森口喜成・上野真義・笠原雅弘
- 学会等名
  2023年度日本森林学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03239
[学会発表] 動物死体における甲虫相および微生物叢の遷移パターンはウジを排除すると変わるのか?2022
- 著者名/発表者名
  橋詰茜, 松島義治, 山中康如, 幸田良介, 笠原康裕, 大館智志, 中島啓裕
- 学会等名
  第69回日本生態学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 長寿命植物Shorea laevisにおける幹細胞突然変異速度と分布について2022
- 著者名/発表者名
  今井亮介、佐々木江理子、藤野健、笠原雅弘、谷尚樹、陶山佳久、佐竹暁子
- 学会等名
  日本進化学会第24回沼津大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] メダカ地域集団を用いたアルツハイマー病関連遺伝子と新奇性追及との関連性の検証2022
- 著者名/発表者名
  木村文昭、笠原麗美、太田博樹、小川元之、竹内秀明、勝村啓史
- 学会等名
  第76回日本人類学会大会・第38回日本霊長類学会大会連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] 新奇性追求の遺伝基盤とその進化的意義の解明に向けた取り組み2022
- 著者名/発表者名
  木村文昭、笠原麗美、太田博樹、小川元之、竹内秀明、勝村啓史
- 学会等名
  日本進化学会第24回沼津大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] 長寿命植物Shorea laevisの体細胞突然変異の蓄積パターンについて2022
- 著者名/発表者名
  今井亮介, 佐々木江理子, 笠原雅弘, 藤野健, 谷尚樹, 陶山佳久, 佐竹暁子
- 学会等名
  第69回日本生態学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Shorea laevisの体細胞突然変異について2021
- 著者名/発表者名
  今井亮介, 佐々木江理子, 笠原雅弘, 藤野健, 谷尚樹, 陶山佳久, 佐竹暁子
- 学会等名
  第53回種生物学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ゲノムモザイクとしての植物の個体性2021
- 著者名/発表者名
  佐竹暁子, 富本創, 今井亮介, 佐々木江理子, 笠原雅弘, 藤野健, 谷尚樹, 陶山佳久
- 学会等名
  日本植物学会第85回大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Genetic mosaicism in long-lived treesゲノムモザイクとしての長寿命樹木の生き方2021
- 著者名/発表者名
  佐竹暁子, 富本創, 今井亮介, 佐々木江理子, 笠原雅弘, 藤野健, 谷尚樹, 陶山佳久
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 動物の死骸は誰のもの? : 死肉食性昆虫と雑食性食肉目の消費型競争2021
- 著者名/発表者名
  橋詰茜、松島義治、幸田良介、笠原康裕、大舘智志、中島啓裕
- 学会等名
  日本生態学会第68回全国大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] イネ染色体添加系統におけるゲノムの高次構造解析2020
- 著者名/発表者名
  保坂碧, 真弓彩夏, 鈴木創, 笠原雅弘, 野々村賢一, 安井秀, 辻寛之
- 学会等名
  日本育種学会第137回講演会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] LPMX: Local Package Manager X edition & taw: Tiny Amazon Wrapper2019
- 著者名/発表者名
  Masahiro Kasahara
- 学会等名
  第23回オープンバイオ研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K16145
[学会発表] 10 Simple Reasons Why Graph Genome is Needed2019
- 著者名/発表者名
  笠原雅弘
- 学会等名
  第10回Genome Graph研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Things that Docker does not Provide for Genome Informatics2018
- 著者名/発表者名
  Masahiro Kasahara
- 学会等名
  Biohackathon 2018 Symposium
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K16145
[学会発表] ゲノム解析へのグラフ構造の応用～ゲノムグラフの今～2018
- 著者名/発表者名
  笠原雅弘
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会(IIBMP2018)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Local Package Manager―Database of genome analysis tools with installation procedures2014
- 著者名/発表者名
  Masahiro Kasahara
- 学会等名
  Genome Informatics
- 発表場所
  Churchill College, Cambridge, UK
- 年月日
  2014-09-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-221S0002
[学会発表] Yet Another ShortRead AlignmentTool2011
- 著者名/発表者名
  Masahiro Kasahara, YASRAT
- 学会等名
  The Biology of Genomes
- 発表場所
  The United States of America
- 年月日
  2011-05-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700307
[学会発表] YASRAT : Yet Another Short Read Alignment Tool2011
- 著者名/発表者名
  Masahiro Kasahara
- 学会等名
  The Biology of Genomes
- 発表場所
  Cold Spring Harbor, New York
- 年月日
  2011-05-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700307
[学会発表] New Alignment Algorithm without Realignment for More Accurate Indel Detection2011
- 著者名/発表者名
  Masahiro Kasahara
- 学会等名
  The 34th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
- 発表場所
  Pacifico Yokohama, Yokohama, JAPAN
- 年月日
  2011-12-24
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22129008
[学会発表] YASRAT : Yet-Another Sequence Alignment Tool2010
- 著者名/発表者名
  Masahiro Kasahara
- 学会等名
  Joint Cold Spring Harbor Laboratory/Wellcome Trust Conference on Genome Informatics
- 発表場所
  Hinxton, The United Kingdom
- 年月日
  2010-09-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700307
[学会発表] Yet-Another Sequence Alignment Tool2010
- 著者名/発表者名
  Masahiro Kasahara, YASRAT
- 学会等名
  Joint Cold Spring Harbor Laboratory/Wellcome Trust Conference on Genome Informatics
- 発表場所
  Hinxton, The United Kingdom
- 年月日
  2010-09-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700307
[学会発表] 立襟鞭毛虫Monosiga ovataゲノムプロジェクト : I. ゲノム2008
- 著者名/発表者名
  隈啓一, 岩部直之, 加藤和貴, 藤博幸, 廣瀬希, 菅裕, 宮田隆, 鈴木穣, 笠原雅弘, 新井理, 大石加寿子, 鹿児島浩, 豊田敦, 黒木陽子, 菅野純夫, 森下真一, 小原雄治, 藤山秋佐夫
- 学会等名
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会(BMB2008)
- 発表場所
  神戸(兵庫)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018030
[学会発表] Computer system design for efficient data-driven discovery using next-generation sequencers2008
- 著者名/発表者名
  Masahiro Kasahara and Shinichi Morishita
- 学会等名
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会(BMB2008)
- 発表場所
  神戸(兵庫)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018030
[学会発表] 立襟鞭毛虫Monosiga ovataゲノムプロジェクト : II. 動物の初期進化における遺伝子多様化2008
- 著者名/発表者名
  岩部直之, 隈啓一, 加藤和貴, 藤博幸, 廣瀬希, 佐々木剛, 菅裕, 宮田隆, 鈴木穣, 笠原雅弘, 新井理, 大石加寿子, 鹿児島浩, 豊田敦, 黒木陽子, 菅野純夫, 森下真一, 小原雄治, 藤山秋佐夫
- 学会等名
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会(BMB2008)
- 発表場所
  神戸(兵庫)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018030
[学会発表] ゲノムに刻まれた食虫植物の進化
- 著者名/発表者名
  (12)福島健児, Likai Mao, 今井飛将, 西山智明, 野澤昌文, 住川直美, 笠原雅弘, 柴田朋子, 重信秀治, Xiaodong Fang, 長谷部光泰
- 学会等名
  NGS現場の会第三回研究会
- 発表場所
  神戸国際会議場
- 年月日
  2013-09-04 – 2013-09-05
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22128008
[学会発表] Incorporation of Long-Read Technologies into Hybrid-de novo Genome Sequencing Strategy: An Assessment on PacBio and Moleculo Read
- 著者名/発表者名
  Asao Fujiyama, Masahiro Kasahara, Atsushi Toyoda
- 学会等名
  PLANT & ANIMAL GENOME ASIA 2014
- 発表場所
  SINGAPORE
- 年月日
  2014-05-19 – 2014-05-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-221S0002
[学会発表] 第二世代シークエンサーによる高密度の遺伝学的地図作成法ヒメツリガネゴケへの適用例
- 著者名/発表者名
  鎌田寛彬, 笠原雅弘, 長谷部光泰, 西山智明
- 学会等名
  NGS現場の会第三回研究会
- 発表場所
  神戸国際会議場
- 年月日
  2013-09-04 – 2013-09-05
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22128008

1. 豊田敦 (10267495)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 3件
2. 鈴木穣 (40323646)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 6件
3. 森下真一 (90292854)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 2件
4. 伊藤武彦 (90501106)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
5. 藤山秋佐夫 (60142311)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 4件
6. 久原哲 (00153320)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
7. 林哲也 (10173014)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 2件
8. 黒川顕 (20343246)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 2件
9. 中村保一 (60370920)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 2件
10. 岩崎渉 (50545019)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
11. 瀬々潤 (40361539)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
12. 高橋弘喜 (60548460)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
13. 浅井潔 (30356357)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
14. 小椋義俊 (40363585)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
15. 平川英樹 (80372746)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
16. 野口英樹 (50333349)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
17. 浜田道昭 (00596538)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
18. 増井徹 (50150082)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
19. 黒木陽子 (10344037)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
20. 小原雄治 (70135292)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
21. 加藤和人 (10202011)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
22. 菅野純夫 (60162848)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
23. 辻省次 (70150612)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
24. 井ノ上逸朗 (00192500)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
25. 榊原康文 (10287427)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
26. 山縣然太朗 (10210337)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
27. 武藤香織 (50345766)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
28. 位田隆一 (40127543)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
29. 高木利久 (30110836)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
30. 徳永勝士 (40163977)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
31. 桑野良三 (20111734)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
32. 小笠原直毅 (10110553)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
33. 川嶋実苗 (00396706)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
34. 山田拓司 (10437262)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
35. 森宙史 (40610837)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
36. フリスマーティン (40462832)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
37. 堀寛 (60116663)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
38. 岸野洋久 (00141987)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
39. 遠藤秀紀 (30249908)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
40. 石田貴文 (20184533)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
41. 山本健 (60274528)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
42. 田畑哲之 (70197549)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
43. 矢田哲士 (10322728)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
44. 服部正平 (70175537)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
45. 大橋順 (80301141)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
46. 松岡聡 (20221583)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
47. 中村建介 (20212095)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
48. 金谷重彦 (90224584)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
49. 西山智明 (50390688)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
50. 重信秀治 (30399555)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
51. 門田幸二 (60392221)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
52. 三井純 (70579862)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
53. 時野隆至 (40202197)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
54. 児玉聡 (80372366)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
55. 瀬戸山晃一 (00379075)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
56. 小門穂 (20706650)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
57. 大橋範子 (50739430)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
58. 中岡博史 (70611193)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
59. 後藤恭宏 (20558358)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
60. 中村佳司 (60706216)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
61. 奥野未来 (30814462)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
62. 仲瀬裕志 (60362498)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
63. 佐々木泰史 (70322328)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
64. 井戸川雅史 (00404749)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
65. 丹下正一朗 (40571211)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
66. 小笠原理 (00435512)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
67. 谷澤靖洋 (90836511)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
68. 近藤伸二 (30415161)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
69. 木立尚孝 (80415778)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
70. 梶谷嶺 (40756706)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
71. 田代康介 (00192170)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
72. 鈴木拓 (20381254)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
73. 能正勝彦 (10597339)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
74. 甲斐正広 (80260777)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
75. 西村祐貴 (20783012)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
76. 中谷明弘 (60301149)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
77. 波江野洋 (70706754)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
78. 島村徹平 (00623943)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
79. 熊谷雄太郎 (00528408)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
80. 栗山真理子

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
81. 安西祐一郎

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
82. 岡田清孝

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
83. 榊佳之

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
84. 高久史麿

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
85. 豊島久真男

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
86. 中村桂子

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
87. 堀田凱樹

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
88. 米澤明憲

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
89. 吉川寛

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
90. 吉田光昭

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
91. 猪子英俊

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
92. 戸田達史

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
93. 稲澤譲治

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
94. 五條掘孝

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
95. 漆原秀子

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
96. 武田洋幸

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
97. 城石俊彦

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
98. 伊藤隆司

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
99. 佐藤矩行

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
100. 松田秀雄

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
101. 五斗進

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
102. 津田雅孝

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
103. 山口勝司

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
104. 中村昇太

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
105. 高橋文雄

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
106. 関本弘之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
107. 元井紀子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
108. 谷口浩二

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
109. 笠原賢洋

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

笠原 雅弘 Kasahara Masahiro

研究課題

研究成果

共同研究者

パンゲノム多様性を包摂するグラフゲノム解析エコシステムの創成研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

不揮発メモリーを用いたゲノム情報学の新展開研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

植物の巨大なゲノムを解読・解析する手法研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

大規模ゲノム情報解析を加速する並列計算システム研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

脳疾患パーソナルゲノム多様性を分析する情報学の創成

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

次世代DNAシークエンサーを用いたゲノム解読のためのアルゴリズム開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

非モデル生物におけるゲノム解析法の確立

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ポリモルフィズムに強い全ゲノムショットガン配列アセンブラの開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

比較ゲノム解析による進化・多様性のゲノム基盤の解明支援

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] 次世代シーケンサー活用術「１分子シーケンサーを用いた非モデル生物の de novo ゲノム解読」2015

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] Decreased Proteasomal Function Exacerbates Endoplasmic Reticulum Stress-Induced Chronic Inflammation in Obese Adipose Tissue2024

著者名/発表者名

笠原雅弘 Kasahara Masahiro