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中村 春木  NAKAMURA Haruki

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 80134485
その他のID
外部サイト
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2011年度 – 2017年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 教授
2015年度: 大阪大学, 蛋白質研究所, 教授
2013年度: 大阪大学, 蛋白質研究所, 教授
2009年度 – 2011年度: 大阪大学, 蛋白質研究所, 教授
2005年度 – 2008年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 … もっと見る
2004年度 – 2007年度: 大阪大学, 蛋白質研究所, 教授
2000年度 – 2003年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 教授
1999年度 – 2002年度: 大阪大学, 蛋白質研究所, 教授
1999年度: 大阪大学, 蛋白質研究所・附属生体分子解析研究センター, 教授
1987年度: 東京大学, 工学部・物理工学科, 助手
1987年度: 蛋白工学研究所, 研究員
1986年度: 東京大学, 工学部, 助手 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
生物物理学 / 生物系 / 生物物理学 / 生物系
研究代表者以外
生物系 / 生物物理学 / 生物系 / 神経化学・神経薬理学 / 計算科学 / 生体物性学 / 病態検査学 / 応用物性 / 物理化学
キーワード
研究代表者
分子動力学 / 分子シミュレーション / 生物物理 / 蛋白質 / シミュレーション計算 / 生体分子 / マルチカノニカル統計 / 蛋白質間相互作用 / データベース / プロテオーム … もっと見る / 量子化学計算 / 構造探索 / Molecular dynamics / Simulation Computation / Molecular Recognition / Molecular Dynamics / 分子認識 / 分子動力学計算 / バイオインフォマティクス / 量子化学 / 酵素反応 / 生体生命情報学 / ペプチド構造 / 蛋白質相互作用 / 天然変性 / 理論生物学 / Reaction free energy / Electron state / Molecular simulation / Quantum chemistry / Biological macromolecules / Enzymatic reaction / Biophysics / 反応自由エネルギー / 電子状態 / Algorithm of molecular simulation / MM calculation / Hybrid-QM / Link atom / Localized molecular orbital / Simulation calculation / Electron state of protein molecule / Quantum chemical calculation / QM / 分子計算アルゴリズム / MM-連成計算 / OM / リンク原子 / 局在化分子軌道 / 蛋白質の電子状態計算 / Multicanonical ensemble / Tsallis Statistics / Disordered Structure / Quantum Chemistry / Conformation Sampling / Peptide Conformation / 水素結合 / β-ヘアピン / Tsallis統計 / 不規則構造 / Drug Design / Docking / Free Energy Calculation / Van X / Intein / Segmental Isotope Labeling / ドラッグデザイン / ドッキング / 自由エネルギー計算 / VanX酵素 / インテイン / 区分標識法NMR / Database / Brownian Dynamics / Molecular Surface / Supramolecular Structure / Simulation / Homology Modeling / ループ構造 / チャネル蛋白質 / ブラウニアン・ダイナミクス / 分子表面 / 超分子立体構造 / ホモロジーモデリング / ヌクレオソーム / ポリメラーゼ / 遺伝子 / 転写因子 / 構造予測 / 構造エネルギー / 構造・機能予測 / 蛋白質の構造・機能予測 / 生体超分子複合体 / ドッキング計算 / 蛋白質ループ構造 / 構造アンサンブル予測 / 相互作用 / クリーク探索 / 分子表面電位 / 分子表面形状 / ゲノム情報 … もっと見る
研究代表者以外
NMR / CD / DSC / MHC / TCR / 転写因子 / 密度汎関数法 / 立体構造 / 蛋白質 / 生体高分子 / タンパク質立体構造 / 立体構造予測 / SUMO化 / 翻訳後修飾 / 酸化ストレス / 活性酸素種 / パーキンソン病 / ユビキチン化 / 遺伝子導入 / パーキンソン病モデル / 遺伝子変異マウス / PGC-1α / 神経変性疾患 / ミトコンドリア / 生存能 / エネルギー代謝 / ニューロン / Necdin / 計算科学 / 数値計算 / サンプリング / 数値積分 / 運動方程式 / 力学系 / 相互作用計算 / 分子動力学 / Biopolymers / Coaxial cell / 4-Terminal electrode cell / パソコン駆動 / 誘電分散 / 同軸型電極 / 四端子電極 / phage display / repertoire / affinity maturation / antibody / 抗原結合部位 / CDRループ / ファージディスプレイ / レパートリー / 親和性成熟 / 抗体 / folding / entropy / enthalpy / peptide exchange / アンタゴニスト / アゴニスト / 熱測定 / 酸性小胞 / 熱安定性 / ペプチド交換 / フォールディング / エントロピー / エンタルピー / ピプチド交換 / X-ray crystallography / chromatin / protein structure / transcription / 蛋白質の立体構造 / 蛋白質-蛋白質相互作用 / X線 / 水素結合 / G蛋白質共役受容体 / DNA結 / クロマチン / 基本転写因子 / 遺伝子修復 / 転写 / X線結晶構造解析 / DNAメチル化 / 核磁気共鳴法 / 蛋白質構造 / DNA結合蛋白質 / 揺らぎの流体力学 / 低周波における異常粘性 / ずり粘性率 / 層圧縮弾性率 / 低周波粘弾性率 / スメティック液晶 / 液晶 / 1分子計測 / 分子認識 / 生体生命情報学 / 発現制御 / 遺伝子 / 転写サイクル / ラジカル機構 / p450 / UB3LYP / MRCC / CaMn405クラスター / 反応機構 / 光合成活性中心 / 遷移状態計算 / 酸素添加反応 / メタンモノオキシゲネース / 水分解反応 / 光合成PSII / OEC / CaMn_4O_5クラスター / p-450 / MMO, OEC, PSII / p. 450 / 理論的研究 / 機能発現 / 化学反応性 / 電子構造 / 生体内多核遷移金属錯体 / タンパク質のダイナミクス / ハブタンパク質 / ダイナミクス / タンパク質のゆらぎ / X線小角散乱 / 核内タンパク質 / 高速AFM / X線小角散乱 / 天然変性タンパク質 / 化学結合 / 自然軌道解析 / 電子状態計算 / 金属タンパク質 / 分子軌道法 / 分子動力学法 / モノアミン酸化酵素A / チトクロムc酸化酵素 / ドッキングシュミレーション / 静電ポテンシャル / リガンド結合部位 / 分子表面 / シグナル伝達 / トランスポーター / 分子間相互作用 / バイオインフォマティクス / トランスポートゾーム / タンパク質問相互作用 / 蛋白質立体構造 / 共発現 / 膜分子輸送複合体 / タンパク質間相互作用 / 遺伝子共発現 / DNAマイクロアレイ / トランスポートソーム / 膜輸送複合体 / 水と生体分子のダイナミクス / 蛋白質の物性 / 蛋白質の構造 / 蛋白質の機能 / 分子シミュレーション / 水の構造と物性 / 蛋白質フォールディング / プロテオミックス / プロテオーム / 機能ゲノミックス / 構造ゲノミックス / ゲノム情報 / 構造生物学 / 計算生物学 隠す
  • 研究課題

    (28件)
  • 研究成果

    (531件)
  • 共同研究者

    (87人)
  •  翻訳後修飾された蛋白質天然変性領域におけるマルチステリーの計算科学研究研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2017
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  分子動力学計算を速く正確に安定に実行するための基盤技術の開発

    • 研究代表者
      福田 育夫
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      計算科学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  「転写サイクル」領域の総括

    • 研究代表者
      山口 雄輝
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2016
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      東京工業大学
  •  計算・情報科学による転写サイクルにおける情報変換機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2016
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  Necdinによるニューロン生存能の強化機構

    • 研究代表者
      吉川 和明
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      神経化学・神経薬理学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  動的構造に基づく定量的な蛋白質間相互作用システムの計算・情報科学研究研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2013
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  蛋白質の分子動力学計算のための高次構造に依存する新規力場関数の開発と検証研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2012
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現

    • 研究代表者
      佐藤 衛
    • 研究期間 (年度)
      2009 – 2013
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      横浜市立大学
  •  生体内多核遷移金属錯体の電子構造、化学反応性および機能発現に関する理論的研究

    • 研究代表者
      山口 兆
    • 研究期間 (年度)
      2009 – 2011
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      物理化学
    • 研究機関
      公益財団法人豊田理化学研究所
      財団法人豊田理化学研究所
  •  分子シミュレーションによる生体超分子複合体の構造機能相関の理論的研究

    • 研究代表者
      鷹野 優
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2009
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  構造インタラクトームの計算・情報科学による研究研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2010
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  分子シミュレーション支援による生体超分子複合体の構造機能相関の理論的研究

    • 研究代表者
      鷹野 優
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  電子状態計算と分子構造探索計算の連成による生体高分子の自由エネルギーの理論的研究研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  構造プロテオミクスに基づく蛋白質間相互作用の解析と予測研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2005
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  分子シミュレーション支援による生体超分子複合体の構造・機能解析研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2005
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  トランポートソームを対象とした分子実態を伴った相互作用ネットワークの解析に関する研究

    • 研究代表者
      木下 賢吾
    • 研究期間 (年度)
      2005 – 2009
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      東北大学
  •  タンパク質と溶媒分子の効果をあらわに取り入れた生体電子伝達系の理論的研究研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2003 – 2004
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  蛋白質フォールディング研究の企画調査

    • 研究代表者
      桑島 邦博
    • 研究期間 (年度)
      2001
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      東京大学
  •  自由エネルギー地形計算に基づく蛋白質のモデル構造データベースの構築と応用研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2000
    • 研究種目
      特定領域研究(C)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  チャネル蛋白相互作用の分子構造基盤研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2000 – 2004
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  高親和性抗体を用いた臨床検査用プロテインチップの開発

    • 研究代表者
      古川 功治
    • 研究期間 (年度)
      2000 – 2002
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      病態検査学
    • 研究機関
      独立行政法人産業技術総合研究所
      東京理科大学
  •  区分標識法NMRと自由エネルギー計算による蛋白質阻害薬剤の迅速探索法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2000 – 2001
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  自由エネルギー地形計算による蛋白質のフォールド予測とフォールディング過程の解析研究代表者

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2000 – 2001
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  プロテオーム時代の計算情報生物学

    • 研究代表者
      郷 通子
    • 研究期間 (年度)
      1999
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  核内シグナル伝達における蛋白質間相互作用の役割

    • 研究代表者
      白川 昌宏
    • 研究期間 (年度)
      1998 – 2001
    • 研究種目
      特定領域研究(A)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      横浜市立大学
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  TCRとそのリガンド、及び、それらの分子間相互作用の物理化学的解析

    • 研究代表者
      小園 晴生
    • 研究期間 (年度)
      1998 – 1999
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      東京理科大学
  •  液晶の低周波ずり粘弾性の研究

    • 研究代表者
      岡野 光治
    • 研究期間 (年度)
      1987
    • 研究種目
      一般研究(C)
    • 研究分野
      応用物性
    • 研究機関
      東京大学
  •  生体高分子の誘電率測定用電極の開発

    • 研究代表者
      南方 陽
    • 研究期間 (年度)
      1985 – 1987
    • 研究種目
      試験研究
    • 研究分野
      生体物性学
    • 研究機関
      浜松医科大学

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すべて 雑誌論文 学会発表 図書 その他

  • [図書] 生命のメカニズム - 美しいイメージで学ぶ構造生命科学入門2015

    • 著者名/発表者名
      中村春木(監訳)、工藤高裕、西川建、中村春木(訳)
    • 総ページ数
      168
    • 出版者
      シナジー
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [図書] 生命のメカニズム - 美しいイメージで学ぶ構造生命科学入門 -2015

    • 著者名/発表者名
      中村春木(監訳)、工藤高裕、西川建、中村春木(訳)
    • 総ページ数
      168
    • 出版者
      シナジー
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [図書] 生命科学から創薬へのイノベーション2014

    • 著者名/発表者名
      米田悦啓、堤康央、石井健(編)、中村春木他45名
    • 総ページ数
      202
    • 出版者
      南山堂
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [図書] 見てわかる構造生命科学 - 生命科学研究へのタンパク質構造の利用 -2014

    • 著者名/発表者名
      中村春木(編)、中村春木他9名
    • 総ページ数
      326
    • 出版者
      化学同人
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [図書] 見てわかる構造生命科学 - 生命科学研究へのタンパク質構造の利用 -2014

    • 著者名/発表者名
      中村春木(編)、中村春木他9名
    • 総ページ数
      326
    • 出版者
      化学同人
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [図書] 生命科学から創薬へのイノベーション2014

    • 著者名/発表者名
      米田悦啓、堤康央、石井健(編)、中村春木他45名
    • 総ページ数
      202
    • 出版者
      南山堂
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [図書] "Prediction of Protein-Protein Complex Structures" in Biomolecular Forms and Functions : A Celebration of 50 years of the Ramachandran Map(Eds. Manju Bansal & N. Srinivasan)2013

    • 著者名/発表者名
      Kanamori E, Murakami Y, Sarmiento J, Liang S, Standley DM, Shirota M, Kinoshita K, Tsuchiya Y, Higo J, Nakamura H
    • 出版者
      World Scientific Publishing
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [図書] Biomolecular Forms and Functions: A Celebration of 50 years of the Ramachandran Map(Eds. Manju Bansal & N. Srinivasan)2013

    • 著者名/発表者名
      Kanamori E., Murakami Y., Sarmiento J., Liang S., Standley D. M., Shirota M., Kinoshita K., Tsuchiya Y., Higo J., Nakamura H.
    • 総ページ数
      502
    • 出版者
      World Scientific Publishing
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [図書] やさしい原理からはいるタンパク質科学実験法:タンパク質のはたらきを知る・分子機能と生体作用・(長谷・高尾・高木編)2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 総ページ数
      171
    • 出版者
      化学同人
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [図書] タンパク質計算科学2009

    • 著者名/発表者名
      神谷成敏・肥後順一・福西快文・中村春木
    • 総ページ数
      251
    • 出版者
      共立出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [図書] やさしい原理からはいるタンパク質科学実験法:タンパク質のはたらきを知る-分子機能と生体作用-(「タンパク質のデータベースとインフォマティクス」)(長谷・高尾・高木編)第7章2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 出版者
      化学同人
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [図書] 医学を学ぶための生物学 : VI2004

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 総ページ数
      510
    • 出版者
      南江堂
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12144206
  • [図書] Forefront of New Drug Development Strategies2004

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki 他 (Takeuchi, Masahiro, Lagakos, Stephen W 編)
    • 総ページ数
      327
    • 出版者
      (有)デジタルプレス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12144206
  • [図書] Biology to learn medicine : VI.2003

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H.
    • 総ページ数
      29
    • 出版者
      Tokyo-Kagaku-Dojin.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12144206
  • [図書] 情報生物学講義2タンパク質構造と情報科学2003

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 総ページ数
      28
    • 出版者
      財団法人国際高等研究所
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12144206
  • [図書] Protein structure and scientific information.2003

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H.
    • 総ページ数
      28
    • 出版者
      Kokusai-Koto-Kenkyusyo.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12144206
  • [図書] 基礎生化学実験法第3巻タンパク質II2001

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 総ページ数
      242
    • 出版者
      日本生化学会
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12144206
  • [図書] タンパク質立体構造のデザイン2001

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 総ページ数
      248
    • 出版者
      共立出版
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12144206
  • [図書] バイオサイエンスの新世紀、第3巻「タンパク質の分子設計」(後藤祐児、谷澤克行編)2001

    • 著者名/発表者名
      古川功治, 中村春木
    • 総ページ数
      13
    • 出版者
      共立出版(東京)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12557239
  • [図書] Design of protein structures.2001

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H.
    • 総ページ数
      248
    • 出版者
      Kyoritsu publishers.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12144206
  • [図書] Experimental protocols for basis biochemistry Vol. III.2001

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H.
    • 総ページ数
      242
    • 出版者
      Japanese Biochemical Society.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12144206
  • [雑誌論文] Phosphorylation of an intrinsically disordered region of Ets1 shifts a multi-modal interaction ensemble to an out-inhibitory state.2018

    • 著者名/発表者名
      Kota Kasahara, Masaaki Shiina, Junichi Higo, Kazuhiro Ogata, Haruki Nakamura.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 46 号: 5 ページ: 2243-2251

    • DOI

      10.1093/nar/gkx1297

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K05517, KAKENHI-PROJECT-16K18526, KAKENHI-PROJECT-16K14711, KAKENHI-PROJECT-18K19305, KAKENHI-PROJECT-16H03293
  • [雑誌論文] Molecular mechanisms of cooperative binding of transcription factors Runx1-CBFβ-Ets1 on the TCRα gene enhancer2017

    • 著者名/発表者名
      Kasahara K, Shiina M, Fukuda I, Ogata K, Nakamura H
    • 雑誌名

      PloS One

      巻: 12 号: 2 ページ: e0172654-e0172654

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0172654

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118005, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-26330331, KAKENHI-PROJECT-16K18526, KAKENHI-PROJECT-16K14711, KAKENHI-PROJECT-16H03293
  • [雑誌論文] Multi-dimensional virtual system introduced to enhance canonical sampling.2017

    • 著者名/発表者名
      Junichi Higo, Kota Kasahara, Haruki Nakamura.
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 147 号: 13 ページ: 134102-134102

    • DOI

      10.1063/1.4986129

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K05517, KAKENHI-PROJECT-16K18526, KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [雑誌論文] Accurate prediction of complex structure and affinity for a flexible protein receptor and its inhibitor2017

    • 著者名/発表者名
      G.-J. Bekker, N. Kamiya, M. Araki, I. Fukuda, Y. Okuno, H. Nakamura
    • 雑誌名

      J. Chem. Theory Comput.

      巻: 13 号: 6 ページ: 2389-2399

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.6b01127

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07331, KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [雑誌論文] Enhancement of canonical sampling by virtual-state transitions2017

    • 著者名/発表者名
      Junichi Higo, Kota Kasahara, Bhaskar Dasgupta, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 146 号: 4 ページ: 44104-44104

    • DOI

      10.1063/1.4974087

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-16K14711, KAKENHI-PROJECT-16K18526, KAKENHI-PROJECT-16K05517
  • [雑誌論文] myPresto/omegagene: a GPU-accelerated molecular dynamics simulator tailored for enhanced conformational sampling methods with a non-Ewald electrostatic scheme2016

    • 著者名/発表者名
      Kota Kasahara, Benson Ma, Kota Goto, Bhaskar Dasgupta, Junichi Higo, Ikuo Fukuda, Tadaaki Mashimo, Yutaka Akiyama, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 13 号: 0 ページ: 209-216

    • DOI

      10.2142/biophysico.13.0_209

    • NAID

      130007041560

    • ISSN
      2189-4779
    • 言語
      英語
    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-16K05517, KAKENHI-PROJECT-16K18526
  • [雑誌論文] Identification of aryl hydrocarbon receptor signaling pathways altered in TCDD- treated red seabream embryos by transcriptome analysis2016

    • 著者名/発表者名
      Midori Iida, Satoshi Fujii, Masaya Uchida, , Hiroshi Nakamura, Yoshihiro Kagami, Tetsuro Agusa, Masashi Hirano, Su-Min Bak, Eun-Young Kim, Hisato Iwata
    • 雑誌名

      Aquatic Toxicology

      巻: 177 ページ: 156-170

    • DOI

      10.1016/j.aquatox.2016.05.014

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-26220103, KAKENHI-PROJECT-16H05887, KAKENHI-PROJECT-26550083, KAKENHI-PROJECT-15K21204
  • [雑誌論文] Revisiting Antibody Modeling Assessment for CDR-H3 loop2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Nishigami, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      Protein Engineering, Design and Selection

      巻: 29 号: 11 ページ: 477-484

    • DOI

      10.1093/protein/gzw028

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-16K07331, KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [雑誌論文] mDCC_tools: Characterizing Multi-modal Atomic Motions in Molecular Dynamics Trajectories2016

    • 著者名/発表者名
      Kota Kasahara, Neetha Mohan, Ikuo Fukuda, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 32 号: 16 ページ: 2531-2533

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btw129

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [雑誌論文] A critical appraisal of the zero-multipole method: Structural, thermodynamic, dielectrid, and dynamical properties of a water system2016

    • 著者名/発表者名
      Wang H, Nakamura H, Fukuda I
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 144 号: 11 ページ: 114503-114503

    • DOI

      10.1063/1.4943956

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [雑誌論文] Omokage search: shape similarity search service for biomolecular structures in both the PDB and EMDB.2016

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Suzuki, Takeshi Kawabata, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 32 号: 4 ページ: 619-620

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btv614

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26440078, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [雑誌論文] Density functional study of molecular interactions in secondary structures of proteins2016

    • 著者名/発表者名
      Takano Y, Kusaka A, Nakamura H
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 13 号: 0 ページ: 27-35

    • DOI

      10.2142/biophysico.13.0_27

    • NAID

      130005126232

    • ISSN
      2189-4779
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-ORGANIZER-26105001, KAKENHI-PLANNED-26105012
  • [雑誌論文] Elastic properties of dynein motor domain obtained from all-atom molecular dynamics simulations2016

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      Protein Engineering, Design and Selection

      巻: 29 号: 8 ページ: 317-325

    • DOI

      10.1093/protein/gzw022

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-26291014, KAKENHI-PROJECT-26291034, KAKENHI-PROJECT-16K07331
  • [雑誌論文] Variation of Free-Energy Landscape of the p53 C-terminal Domain Induced by Acetylation: Enhanced Conformational Sampling2016

    • 著者名/発表者名
      Shinji Iida, Tadaaki Mashimo, Takashi Kurosawa, Hironobu Hojo, Hiroya Muta, Yuji Goto, Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura, Junichi Higo
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem.

      巻: 37 号: 31 ページ: 2687-2700

    • DOI

      10.1002/jcc.24494

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-16H04180, KAKENHI-PROJECT-16K05517
  • [雑誌論文] Pathogenic Variants in PIGG Cause Intellectual Disability with Seizures and Hypotonia2016

    • 著者名/発表者名
      Makrythanasis P, Kato M, Zaki MS, Saitsu H, Nakamura K, Santoni FA, Miyatake S, Nakashima M, Issa MY, Guipponi M, Letourneau A, Logan CV, Roberts N, Parry DA, Johnson CA, Matsumoto N, Hamamy H, Sheridan E, Kinoshita T, Antonarakis SE, Murakami Y.
    • 雑誌名

      Am J Hum Genet

      巻: 98 号: 4 ページ: 615-626

    • DOI

      10.1016/j.ajhg.2016.02.007

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26860781, KAKENHI-PROJECT-25293085, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118007, KAKENHI-PROJECT-16K19626
  • [雑誌論文] Development of Massive Multilevel Molecular Dynamics Simulation Program, Platypus (PLATform for dYnamic Protein Unified Simulation), for the Elucidation of Protein2016

    • 著者名/発表者名
      Takano Y, Nakata K, Yonezawa Y, Nakamura H
    • 雑誌名

      Journal of Computational Chemistry

      巻: 37 号: 12 ページ: 1125-1132

    • DOI

      10.1002/jcc.24318

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-ORGANIZER-26105001, KAKENHI-PLANNED-26105012
  • [雑誌論文] Identification of diphtheria toxin R domain mutants with enhanced inhibitory activity against HB-EGF2015

    • 著者名/発表者名
      Suzuki K, Mizushima H, Abe H, Iwamoto R, Nakamura H, Mekada E
    • 雑誌名

      J Biochem

      巻: mvu079 号: 5 ページ: 331-343

    • DOI

      10.1093/jb/mvu079

    • NAID

      40020461422

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23570227, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-26460525, KAKENHI-PROJECT-15K07046, KAKENHI-PROJECT-24570212, KAKENHI-PROJECT-26250033
  • [雑誌論文] Virtual-system coupled adaptive umbrella sampling to compute free-energy landscape for flexible molecular docking2015

    • 著者名/発表者名
      Higo J, Dasgupta B, Mashimo T, Kasahara K, Fukunishi Y, Nakamura H
    • 雑誌名

      Journal of Computational Chemistry

      巻: 36 号: 20 ページ: 1489-1501

    • DOI

      10.1002/jcc.23948

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [雑誌論文] Identification of HOXD4 Mutations in Spinal Extradural Arachnoid Cyst2015

    • 著者名/発表者名
      Ogura Y, Miyake N, Kou I, Iida A, Nakajima M, Takeda K, Fujibayashi S, Shiina M, Okada E, Toyama Y, Iwanami A, Ishii K, Ogata K, Asahara H, Matsumoto N, Nakamura M, Matsumoto M, Ikegawa S
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10(11) 号: 11 ページ: e0142126-e0142126

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0142126

    • NAID

      120005763410

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26330331, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118005, KAKENHI-PLANNED-24118007, KAKENHI-PROJECT-25293235
  • [雑誌論文] Computational Study of Drug Binding Affinity to Influenza A Neuraminidase Using Smooth Reaction Path Generation (SRPG) Method2015

    • 著者名/発表者名
      Nguyen H, Tran T, Fukunishi Y, Higo J, Nakamura H, Le L
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Information and Modeling

      巻: 55 号: 9 ページ: 1936-1943

    • DOI

      10.1021/acs.jcim.5b00319

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [雑誌論文] High-resolution modeling of antibody structures by a combination of bioinformatics, expert knowledge, and molecular simulations.2014

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Shirai, Kazuyoshi Ikeda, Kazuo Yamashita, Yuko Tsuchiya, Jamica Sarmiento, Shide Liang, Tatsuaki Morokata, Kenji Mizuguchi, Junichi Higo, Daron M. Standley, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: 印刷中 号: 8 ページ: 1624-1635

    • DOI

      10.1002/prot.24591

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-25430186
  • [雑誌論文] Structure of the entire stalk region of the dynein motor domain2014

    • 著者名/発表者名
      Yosuke Nishikawa, Takuji Oyama, Narutoshi Kamiya, Takahide Kon, Yoko Y. Toyoshima, Haruki Nakamura, Genji Kurisu
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 426 号: 19 ページ: 3232-3245

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2014.06.023

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-24370046, KAKENHI-PUBLICLY-25113504, KAKENHI-PUBLICLY-25117503, KAKENHI-PROJECT-25280109, KAKENHI-PROJECT-25291031, KAKENHI-PROJECT-25440070, KAKENHI-PROJECT-26291014, KAKENHI-PROJECT-26291034, KAKENHI-PROJECT-26440023
  • [雑誌論文] Density functional study of the phosphodiester hydrolysis of RNA in RNA/DNA hybrid by RNase H2014

    • 著者名/発表者名
      Kita M, Nakamura H, Takano Y
    • 雑誌名

      Mol. Phys

      巻: 112 号: 3-4 ページ: 355-364

    • DOI

      10.1080/00268976.2013.820854

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103, KAKENHI-PUBLICLY-25104717
  • [雑誌論文] Blind prediction of interfacial water positions in CAPRI2014

    • 著者名/発表者名
      Lensink MF, et al
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: 82 号: 4 ページ: 620-632

    • DOI

      10.1002/prot.24439

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22136005, KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-PROJECT-24570176
  • [雑誌論文] Specific non-local interactions are not necessary for recovering native protein dynamics2014

    • 著者名/発表者名
      Dasgupta B, Kasahara K, Kamiya N, Nakamura H, Kinjo AR
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 号: 3 ページ: e91347-e91347

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0091347

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-PROJECT-25440070
  • [雑誌論文] AKT3 and PIK3R2 mutations in two patients with megalencephaly-related syndromes2014

    • 著者名/発表者名
      Nakamura K, Kato M, Tohyama J, Shiohama T, Hayasaka K, Nishiyama K, Kodera H, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Matsumoto N, Saitsu H.
    • 雑誌名

      Clin Genet

      巻: 85(4) 号: 4 ページ: 396-398

    • DOI

      10.1111/cge.12188

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118007, KAKENHI-PROJECT-24249019, KAKENHI-PROJECT-26860816
  • [雑誌論文] Kotai Antibody Builder: Automated, high-resolution structural modeling of antibodies2014

    • 著者名/発表者名
      Kazuo Yamashita, Kazuyoshi Ikeda, Karlou Amada, Shide Liang, Yuko Tsuchiya,Haruki Nakamura, Hiroki Shirai, Daron M Standley
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 30 (22) ページ: 3279-3280

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [雑誌論文] Rigid-body motions of interacting proteins dominate multi-specific binding of Ubiquitin in a shape-dependent manner2014

    • 著者名/発表者名
      Dasgupta B, Nakamura H, Kinjo AR
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: 82 号: 1 ページ: 77-89

    • DOI

      10.1002/prot.24371

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] 3D flexible alignment using 2D maximum common substructure: dependence of prediction accuracy on target-reference chemical similarity2014

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Kawabata, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Information and Modeling

      巻: 54 (7) 号: 7 ページ: 1850-1863

    • DOI

      10.1021/ci500006d

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [雑誌論文] The Zero-multipole summation method for estimating electrostatic interactions in molecular dynamics : analysis of the accuracy and application to liquid systems2014

    • 著者名/発表者名
      Fukuda I, Kamiya N, Nakamura H
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys

      巻: 140 号: 19 ページ: 194307-194307

    • DOI

      10.1063/1.4875693

    • NAID

      120005596268

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-25390156, KAKENHI-PROJECT-25440070
  • [雑誌論文] A Novel Approach of Dynamic Cross Correlation Analysis on Molecular Dynamics Simulations and its Application to Ets1 dimer–DNA Complex2014

    • 著者名/発表者名
      Kota Kasahara, Ikuo Fukuda, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9 (11) 号: 11 ページ: e112419-e112419

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0112419

    • NAID

      120005596267

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [雑誌論文] Exhaustive comparison and classification of ligand-binding surfaces in proteins2013

    • 著者名/発表者名
      Murakami Y, Kinoshita K, Kinjo AR, Nakamura H
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 22 号: 10 ページ: 1379-1391

    • DOI

      10.1002/pro.2329

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulations Accelerated by GPU for Biological Macromolecules with a Non-Ewald Scheme for Electrostatic Interactions2013

    • 著者名/発表者名
      Mashimo T, Fukunishi Y, Kamiya N, Takano Y, Fukuda I, Nakamura H
    • 雑誌名

      J. Chem. Theory Comput

      巻: 9 号: 12 ページ: 5599-5609

    • DOI

      10.1021/ct400342e

    • NAID

      120005604144

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-PROJECT-23657103, KAKENHI-PUBLICLY-25104717, KAKENHI-PROJECT-25390156, KAKENHI-PROJECT-25440070
  • [雑誌論文] Quantum chemical study of conformational preferences in intermediates and transition states of the hydrolysis of dimethyl phosphate.2013

    • 著者名/発表者名
      Yu Takano, Makoto Kita, Haruki Nakamura, Haruki
    • 雑誌名

      J. Phys. Conf. Ser.

      巻: 454 ページ: 12058-12058

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [雑誌論文] LigandBox: A database for 3D structures of chemical compounds2013

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Kawabata, Yusuke Sugihara, Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      BIOPHYSICS

      巻: 9 号: 0 ページ: 113-121

    • DOI

      10.2142/biophysics.9.113

    • NAID

      130003366038

    • ISSN
      1349-2942
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [雑誌論文] Community-wide evaluation of methods forpredicting the effect of mutations on protein–protein interactions.2013

    • 著者名/発表者名
      Rocco Moretti, …, Eiji Kanamori, Yuko Tsuchiya, Haruki Nakamura, et al.
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: 81 号: 11 ページ: 1980-1987

    • DOI

      10.1002/prot.24356

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] De Novo Mutations in GNAO1, Encoding a Gαo Subunit of Heterotrimeric G Proteins, Cause Epileptic Encephalopathy.2013

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, K., et al.,
    • 雑誌名

      Am. J. Hum. Genet.

      巻: 93 号: 3 ページ: 496-505

    • DOI

      10.1016/j.ajhg.2013.07.014

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23500444, KAKENHI-PROJECT-23612008, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118005, KAKENHI-PLANNED-24118007, KAKENHI-PROJECT-24249019, KAKENHI-PROJECT-24659508, KAKENHI-PROJECT-25293052, KAKENHI-PROJECT-25293085, KAKENHI-PROJECT-25293235, KAKENHI-PROJECT-25860915
  • [雑誌論文] Whole genome sequencing in patients with retinitis pigmentosa reveals pathogenic DNA structural changes and NEK2 as a new disease gene2013

    • 著者名/発表者名
      Nishiguchi KM, Tearle RG, Liu YP, Oh EC, Miyake N, Benaglio P, Harper S, Koskiniemi-Kuendig H, Venturini G, Sharon D, Koenekoop RK, Nakamura M, Kondo M, Ueno S, Yasuma TR, Beckmann JS, Ikegawa S, Matsumoto N, Terasaki H, Berson EL, Katsanis N, Rivolta C
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A

      巻: 110 号: 40 ページ: 16139-16144

    • DOI

      10.1073/pnas.1308243110

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23592603, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118007, KAKENHI-PROJECT-24249019, KAKENHI-PROJECT-25293235
  • [雑誌論文] Mutational and Structural Analyses of Caldanaerobius polysaccharolyticus Man5B Reveal Novel Active Site Residues for Family 5 Glycoside Hydrolases2013

    • 著者名/発表者名
      Takuji Oyama, George E Schmitz, Dylan Dodd, Yejun Han, Alanna Burnett, Naoko Nagasawa, Roderick I Mackie, Haruki Nakamura, Kosuke Morikawa, & Isaac Cann
    • 雑誌名

      PLoS ONE.

      巻: 8 号: 11 ページ: e80448-e80448

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0080448

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23247016, KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-PROJECT-24370046
  • [雑誌論文] Computational study of conformational preferences in intermediates and transition states of the hydrolysis of dimethyl phosphate2013

    • 著者名/発表者名
      Takano, Y., Kita, M., Nakamura, H.
    • 雑誌名

      IOP Journal of Physics: Conference Series

      巻: 未定

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [雑誌論文] A virtual-system coupled multicanonical molecular dynamics simulation : Principles and applications to free-energy landscape of protein-protein interaction with an all-atom model in explicit solvent2013

    • 著者名/発表者名
      J. Higo, K. Umezawa, H. Nakamura
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 138 号: 18 ページ: 184106-184106

    • DOI

      10.1063/1.4803468

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-13J07605, KAKENHI-ORGANIZER-21113001, KAKENHI-PLANNED-21113006, KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [雑誌論文] Application of zero-dipole summation method to molecular dynamics2013

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett.

      巻: 568-569 ページ: 26-32

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2013.03.014

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22570160, KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-PROJECT-23657103, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-25390156, KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [雑誌論文] Molecular dynamics simulations of a double-stranded DNA in an explicit solvent model with zero-dipole summation method2013

    • 著者名/発表者名
      Arakawa T, Kamiya N, Nakamura H, Fukuda I
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 8 号: 10 ページ: e76606-e76606

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0076606

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-PROJECT-25390156, KAKENHI-PROJECT-25440070
  • [雑誌論文] Gas-phase structure of the histone multimers characterized by ion mobility mass spectrometry and molecular dynamics simulation2013

    • 著者名/発表者名
      Saikusa K, Fuchigami S, Takahashi K, Asano Y, Nagadoi A, Tachiwana H, Kurumizaka H, Ikeguchi M, Nishimura Y, Akashi S
    • 雑誌名

      Anal Chem

      巻: 85 号: 8 ページ: 4165-4171

    • DOI

      10.1021/ac400395j

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20227009, KAKENHI-ORGANIZER-21113001, KAKENHI-PLANNED-21113003, KAKENHI-PROJECT-22570120
  • [雑誌論文] A virtual-system coupled multicanonical molecular dynamics simulation: Principles and applications to free-energy landscape of protein–protein interaction with an all-atom model in explicit solvent2013

    • 著者名/発表者名
      Higo, J., Umezawa, K., Nakamura, H.
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 138

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] GIRAF: a method for fast search and flexible alignment of ligand binding interfaces in proteins at atomic resolution2012

    • 著者名/発表者名
      Kinjo AR, Nakamura H
    • 雑誌名

      BIOPHYSICS

      巻: 8 号: 0 ページ: 79-94

    • DOI

      10.2142/biophysics.8.79

    • NAID

      130002061589

    • ISSN
      1349-2942
    • 言語
      英語
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22770149, KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] Enhanced and effective conformational sampling of protein molecular systems for their free energy landscapes2012

    • 著者名/発表者名
      Higo, J., Ikebe, J., Kamiya, N., Nakamura, H
    • 雑誌名

      Biophysical Rev

      巻: 4 号: 1 ページ: 27-44

    • DOI

      10.1007/s12551-011-0063-6

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21113006, KAKENHI-PROJECT-22570160, KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] Density functional studies of the structural variety of the Cu2S2 core of the Cu-A site2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Takano
    • 雑誌名

      International Journal of Quantum Chemistry

      巻: 112 号: 24 ページ: 3756-3762

    • DOI

      10.1002/qua.24214

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22685003, KAKENHI-PROJECT-23657103, KAKENHI-PUBLICLY-23104506
  • [雑誌論文] Composite structural motifs of binding sites for delineating biological functions of proteins2012

    • 著者名/発表者名
      Kinjo AR, Nakamura H
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 7 号: 2 ページ: e31437-e31437

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0031437

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22770149, KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] Electron density based interaction energy estimation of the special pair in the photosynthetic reaction center2012

    • 著者名/発表者名
      Yamasaki H, Nakamura H
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett

      巻: 536 ページ: 129-135

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2012.03.087

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [雑誌論文] Counterbalance of ligand- and self-coupled motions characterizes multispecificity of ubiquitin2012

    • 著者名/発表者名
      Dasgupta B, Nakamura H, Kinjo AR
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 22 号: 2 ページ: 168-178

    • DOI

      10.1002/pro.2195

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] Functions of homo- and hetero-oligomers of human Nucleoplasmin/Nucleophosmin family proteins NPM1, NPM2, and NPM3 during sperm chromatin remodeling2012

    • 著者名/発表者名
      Okuwaki M, Sumi A, Hisaoka M, Saotome-Nakamura A, Akashi S, Nishimura Y, Nagata K
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 40 号: 11 ページ: 4861-4878

    • DOI

      10.1093/nar/gks162

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20227009, KAKENHI-ORGANIZER-21113001, KAKENHI-PLANNED-21113003, KAKENHI-PLANNED-21113005, KAKENHI-PROJECT-22570120, KAKENHI-PROJECT-22570132, KAKENHI-PLANNED-24115002
  • [雑誌論文] Simple and Accurate Scheme to Compute Electrostatic Interactions: Zero-dipole Summation Technique for Molecular System and Application to Bulk Water.2012

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Yasushige Yonezawa, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 137 号: 5 ページ: 54314-54314

    • DOI

      10.1063/1.4739789

    • NAID

      120005647641

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [雑誌論文] Conformational Ensembles of an Intrinsically Disordered Protein pKID with and without a KIX Domain in Explicit Solvent Investigated by All-Atom Multicanonical Molecular Dynamics2012

    • 著者名/発表者名
      Umezawa, K., Ikebe, J., Takano, M., Nakamura, H., Higo, J
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 2 号: 1 ページ: 104-121

    • DOI

      10.3390/biom2010104

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21113006, KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] Computer-aided antibody design.2012

    • 著者名/発表者名
      Kuroda, D., Shirai, H., Jacobson, M. P., Nakamura, H.
    • 雑誌名

      Protein Engineering, Design and Selection

      巻: 25 号: 10 ページ: 507-521

    • DOI

      10.1093/protein/gzs024

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] Non-Ewald methods : Theory and Applications to Molecular Systems2012

    • 著者名/発表者名
      Fukuda I, Nakamura H
    • 雑誌名

      Biophysical Reviews

      巻: 4 号: 3 ページ: 161-170

    • DOI

      10.1007/s12551-012-0089-4

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071, KAKENHI-PLANNED-24118008, KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [雑誌論文] Community-Wide Assessment of Protein-Interface Modeling Suggests Improvements to Design Methodology2011

    • 著者名/発表者名
      Fleishman SJ, 他(研究代表者含む,全96人)
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 414 号: 2 ページ: 289-302

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2011.09.031

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-11J08750, KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] HitPredict : a database of quality assessed protein-protein interactions in 9 species.2011

    • 著者名/発表者名
      A.Patil, K.Nakai, H.Nakamura
    • 雑誌名

      Nucl.Acids Res 39

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [雑誌論文] Distinct roles of overlapping and non-overlapping regions of hub protein interfaces in recognition of multiple partners2011

    • 著者名/発表者名
      Dasgupta B, Nakamura H, Kinjo AR
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 411 号: 3 ページ: 713-727

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2011.06.027

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22770149, KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] Ab initio simulation of a 57-residue protein in explicit solvent reproduces the native conformation in the lowest free-energy cluster.2011

    • 著者名/発表者名
      J.Ikebe, D.M.Standley, H.Nakamura, J.Higo
    • 雑誌名

      Protein Science 20

      ページ: 187-196

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [雑誌論文] Labile electronic and spin states of the CaMn4O5 cluster in the PSII system refined to the 1.9A X-ray resolution UB3LYP computational results2011

    • 著者名/発表者名
      K. Kanda, S. Yamanaka, T. Saito, Y. Umena, K. Kawakami, J. R. Shen, N. Kamiya, M. Okumura, H. Nakamura, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett

      巻: 506 号: 1-3 ページ: 98-103

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2011.02.030

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21550014, KAKENHI-PROJECT-23550016
  • [雑誌論文] Possible Mechanisms for the O-O Bond Formation in Oxygen Evolution Reaction at the CaMn4O5(H2O) 4 Cluster of PSII refined to 1.9A X-ray Resolution2011

    • 著者名/発表者名
      S. Yamanaka, H. Isobe, K. Kanda, T. Saito, Y. Umena, K. Kawakami, J. R. Shen, N. Kamiya, M. Okumura, H. Nakamura, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett

      巻: 511 号: 1-3 ページ: 138-145

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2011.06.021

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21550014, KAKENHI-PROJECT-23550016
  • [雑誌論文] Theory for trivial trajectory parallelization of multicanonical molecular dynamics and application to a polypeptide in water.2011

    • 著者名/発表者名
      J.Ikebe, K.Umezawa, N.Kamiya, T.Sugihara, Y.Yonezawa, Y.Takano, H.Nakamura, J.Higo
    • 雑誌名

      J.Comput.Chem. 32

      ページ: 1286-1297

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [雑誌論文] Free-energy Landscape for Coupled Folding and Binding of an Intrinsically Disordered Protein in Explicit Solvent from Detailed All-atom Computations2011

    • 著者名/発表者名
      Higo J, Nishimura Y, Nakamura H
    • 雑誌名

      J Am Chem Soc

      巻: 133 号: 27 ページ: 10448-10458

    • DOI

      10.1021/ja110338e

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20227009, KAKENHI-PLANNED-21113003, KAKENHI-PLANNED-21113006, KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [雑誌論文] Electronic structures of heme a of cytochrome c oxidase in the redox states -Roles of Propionate and Formyl Groups in Electron Transfer-2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Takano, H.Nakamura
    • 雑誌名

      Journal of Computational Chemistry 31

      ページ: 954-962

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [雑誌論文] Structural properties of hubs in protein-protein interaction networks.2010

    • 著者名/発表者名
      A.Patil, K.Kinoshita, H.Nakamura
    • 雑誌名

      Int.J.Mol.Sci. 11

      ページ: 1930-1943

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [雑誌論文] Geometric similarities of protein-protein interfaces at atomic resolution are only observed within homologous families : An exhaustive structural classification study.2010

    • 著者名/発表者名
      A.R.Kinjo, H.Nakamura
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 399

      ページ: 526-540

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [雑誌論文] Domain distribution and intrinsic disorder in hubs in the human protein-protein interaction network.2010

    • 著者名/発表者名
      A.Patil, K.Kinoshita, H.Nakamura
    • 雑誌名

      Protein Science 19

      ページ: 1461-1468

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [雑誌論文] 光合成反応中心スペシャルペアの電子非対称性の構造的起源 量子化学計算とバイオインフォマティクスによるアプローチ2009

    • 著者名/発表者名
      山崎秀樹、鷹野優、中村春木
    • 雑誌名

      生物物理 49

      ページ: 84-85

    • NAID

      10025975513

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [雑誌論文] Density functional study of roles of porphyrin ring in electronic structures of heme.2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Takano, H.Nakamura
    • 雑誌名

      International Journal of Quantum Chemistry 109

      ページ: 3583-3591

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [雑誌論文] Classification of heterodimer interfaces using docking models and construction of scoring functions for the complex structure prediction.2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Tsuchiya, E.Kanamori, H.Nakamura, K.Kinoshita
    • 雑誌名

      Adv.Appl.Bioinfo.Chem. 2

      ページ: 79-10

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [雑誌論文] Resonating Broken-Symmetry Configuration Interaction Approach for Double Exchange Magnetic Systems2009

    • 著者名/発表者名
      S. Nishihara, S. Yamanaka, K. Kusakabe, K. Nakata, Y. Yonezawa, H. Nakamura, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      J. Phys. Condens. Matter

      巻: 21 号: 6 ページ: 64227-64227

    • DOI

      10.1088/0953-8984/21/6/064227

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21550014
  • [雑誌論文] Classification of hetero-dimer interfaces using docking models and construction of scoring functions for the complex structure prediction2009

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, E Kanamori, H Nakamura, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Adv. Appl. Bioinfo. Chem 2,1

      ページ: 79-100

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Classification of hetero-dimer interfaces using docking models and construction of scoring functions for the complex structure prediction2009

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, E Kanamori, H Nakamura, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Adv.Appl.Bioinfo.Chem. 2

      ページ: 79-100

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Resonating Coupled-Cluster CI Approach to Ion-Radical Systems : Comparison with the unrestricted Coupled-Cluster Approach2009

    • 著者名/発表者名
      S. Yamanaka, S. Nishihara, K. Nakata, Y. Yonezawa, M. Okumura, T. Takada, H. Nakamura, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Int. J. Quant. Chem

      巻: 109 号: 15 ページ: 3811-3818

    • DOI

      10.1002/qua.22441

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21550014
  • [雑誌論文] Membrane attachment facilitates ligand access to active site in monoamme oxidase A.2009

    • 著者名/発表者名
      R.Apostolov, Y.Yonezawa, D.M.Standley, G.Kikugawa, Y.Takano, H.Nakamura
    • 雑誌名

      Biochemistry 48

      ページ: 5864-5873

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [雑誌論文] Application of MDGRAPE-3, a special purpose board for molecular dynamics simulations, to periodic biomolecular systems2008

    • 著者名/発表者名
      G., Kikugawa, R., Apostolov, N., Kamiya, M., Taiji, R., Himeno, H., Nakamura, Y., Yonezawa
    • 雑誌名

      Journal of Computational Chemistry 29 (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Discrimination between biological interfaces and crystal-packing contacts.2008

    • 著者名/発表者名
      Y.Tsuchiya, H.Nakamura, K.Kinoshita
    • 雑誌名

      Comput.Biol.Chem. 1

      ページ: 99-113

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [雑誌論文] Protein-inhibitor flexible docking by a multicanonical sampling : Native complex structure with the lowest free energy and a free-energy barrier distrinsuishing the native complex from the others2008

    • 著者名/発表者名
      N., Kamiya, Y., Yonezawa, H., Nakamura, J., Higo
    • 雑誌名

      PROTEINS 70 (1)

      ページ: 41-53

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Discrimination between biological interfaces and crystal-packing contacts2008

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, H Nakamura, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Adv. Appl. Bioinfo. Chem 1,1

      ページ: 99-113

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Discrimination between biological interfaces and crystalpacking contacts2008

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, H Nakamura and K Kinoshita
    • 雑誌名

      Compt Biol Chem 1

      ページ: 99-113

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Mutational analysis of block and facilitation of HERG current by a class III anti-arrhythmic agent, nifekalant2007

    • 著者名/発表者名
      Y Hosaka, M Iwata, N Kamiya, M Yamada, K Kinoshita, Y Fukunishi, K Tsujimae, H Hibino, Y Aizawa, A Inanobe, H Nakamura and Y Kurachi
    • 雑誌名

      Channels 1

      ページ: 198-208

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] eF-seek: prediction of the functional sites of proteins by searching for similar electrostatic potential and molecular surface shape2007

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita, Y Murakami, H Nakamura
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 35

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] The role of charged surface residues in the binding ability of small hubs in protein-protein interaction networks2007

    • 著者名/発表者名
      A., Patil, H., Nakamura
    • 雑誌名

      Biophysics 3 (1)

      ページ: 27-35

    • NAID

      130000091817

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] eF-seek: prediction of the functional sites of proteins by searching for similar electrostatic potential and molecular surface shape2007

    • 著者名/発表者名
      K Kinoshita, Y Murakami and H Nakamura
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 35

      ページ: 398-402

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Conformational sampling of a 40-residue protein consisting of α and β secondary-structure elements in explicit solvent2007

    • 著者名/発表者名
      J., Ikebe, N., Kamiya, H., Shindo, H., Nakamura, J., Higo
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 443 (4-6)

      ページ: 364-368

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Docking of protein molecular surfaces with evolutionary trace analysis2007

    • 著者名/発表者名
      E Kanamori, Y Murakami, Y Tsuchiya, DM Standley, H Nakamura and K Kinoshita
    • 雑誌名

      Proteins 69

      ページ: 832-838

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Docking of protein molecular surfaces with evolutionary trace analysis2007

    • 著者名/発表者名
      E Kanamori, Y Murakami, Y Tsuchiya, DM Standley, H Nakamura, K Kinoshita
    • 雑誌名

      Proteins 69,4

      ページ: 832-838

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Mutational analysis of block and facilitation of HERG current by a class III anti-arrhythmic agent, nifekalant2007

    • 著者名/発表者名
      Y Hosaka, M Iwata, N Kamiya, M Yamada, K Kinoshita, Y Fukunishi, K Tsujimae, H Hibino, Y Aizawa, A Inanobe, H Nakamura, Y Kurachi
    • 雑誌名

      Channels 1,1

      ページ: 198-208

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Theoretical analysis of the electronic asymmetry of the special pair in the photosynthetic reaction center : Effect of the protein environment and structural asymmetry2007

    • 著者名/発表者名
      H., Yamasaki, H., Nakamura, Y., Takano
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 447 (4-6)

      ページ: 324-329

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Effect of Hunter Disease mutations on molecular phenotypes of iduronate-2-sulfonate : Enzymatic activity, protein processing and structural analysis.2006

    • 著者名/発表者名
      K.Sukegawa-Hayasaka, Z.Kato, H.Nakamura, S.Tomatsu, T.Fukao, K.Kawata, T.Orii, N.Knodo
    • 雑誌名

      Journal of Inherited Metabolic Disease Vol. 29

      ページ: 755-761

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Pre BI: Prediction of biological interfaces of proteins in crystals2006

    • 著者名/発表者名
      Yuko Tsuchiya, Kengo Kinoshita, Nobutoshi Ito, Haruki Nakamura,
    • 雑誌名

      Nuc Acid Res, 34

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Analyses of homo-oligomer interfaces of proteins from the complementarity of molecular surface, electrostatic potential and hydrophobicity.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Tsuchiya, K.Kinoshita, H.Nakamura
    • 雑誌名

      Protein Engineering, Design and Screening Vol. 19, No. 9

      ページ: 421-429

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulation Study on Water Associated with π-electrons of Benzene by using QM/MM Potential2006

    • 著者名/発表者名
      Y., Yonezawa, K, Nakata, T., Takada, H., Nakamura
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 428 (1-3)

      ページ: 73-77

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Utilization of methyl proton resonances in cross-saturation measurement for determining the interfaces of large protein-protein complexes.2006

    • 著者名/発表者名
      H.Takahashi, M.Miyazawa, Y.Ina, Y.Fukunishi, Y.MIzukoshi, H.Nakamura, I.Shimada
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular NMR Vol. 34, No. 3

      ページ: 167-177

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Analyses of homo-oligomer interfaces of proteins from the complementarity of molecular surface, electrostatic potential and hydrophobicity2006

    • 著者名/発表者名
      Y., Tsuchiya, K., Kinoshita, H., Nakamura
    • 雑誌名

      Protein Engineering, Design and Screening 19 (9)

      ページ: 421-429

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] PreBI: prediction of biological interfaces of proteins in crystals2006

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, K Kinoshita, N Ito, H Nakamura
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 34

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Quantum mechanical study of the proton transfer via a peptide bond in the novel proton translocation pathway of cytochrome c oxidase.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Takano, H.Nakamura
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters Vol. 430, No. 1-3

      ページ: 149-155

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Utilization of methyl proton resonances in cross-saturation measurement for determining the interfaces of large protein-protein complexes2006

    • 著者名/発表者名
      H., Takahashi, M., Miyazawa, Y., Ina, Y., Fukunishi, Y., MIzukoshi, H., Nakamura, I., Shimada
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular NMR 34 (12)

      ページ: 167-177

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Quantum mechanical study of the proton transfer via a peptide bond in the novel proton translocation pathway of cytochrome c oxidase.2006

    • 著者名/発表者名
      Takano, Y., Nakamura, H.
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 430

      ページ: 149-155

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18054013
  • [雑誌論文] Analyses of homo-oligomer interfaces of proteins from the complementarity of molecular surface, electrostatic potential and hydrophobicity2006

    • 著者名/発表者名
      Y Tsuchiya, K Kinoshita, H Nakamura
    • 雑誌名

      Protein Eng Des Sel 19,9

      ページ: 421-429

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] PreBI : Prediction of biological interfaces of proteins in crystals.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Tsuchiya, K.Kinoshita, N.Ito, H.Nakamura
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research Vol. 34, Web Service issue

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] PreBI : Prediction of biological interfaces of proteins in crystals2006

    • 著者名/発表者名
      Y., Tsuchiya, K., Kinoshita, N., Ito, H., Nakamura
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research, 34 (Web Service issue)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Quantum mechanical study of the proton transfer via a peptide bond in the novel proton translocation pathway of cytochrome c oxidase2006

    • 著者名/発表者名
      Y., Takano, H., Nakamura
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 430 (1-3)

      ページ: 149-155

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Utilization of methyl proton resonances in cross-saturation measurement for determining the interfaces of large protein-protein complexes.2006

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, H., Miyazawa, M., Ina, Y., Fukunishi, Y., Mizukoshi, Y., Nakamura, H., Shimada, I.
    • 雑誌名

      Journal of biomolecular NMR 273

      ページ: 2730-2748

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18054013
  • [雑誌論文] Analysis of homo-oligomer interfaces of proteins from the complementarity of molecular surface, electrostatic potential and hydrophobicity2006

    • 著者名/発表者名
      Yuko Tsuchiya, Kengo Kinoshita, Haruki Nakamura
    • 雑誌名

      Protein Eng Des Sel. 19

      ページ: 421-429

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] PreBI : Prediction of biological interfaces of proteins in crystals.2006

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya, Y., Kinoshita, K., Ito, N., Nakamura, H.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 34

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18054013
  • [雑誌論文] Effect of Hunter Disease mutations on molecular phenotypes of iduronate-2-sulfonate : Enzymatic activity, protein processing and structural analysis2006

    • 著者名/発表者名
      K., Sukegawa-Hayasaka, Z., Kato, H., Nakamura, S., Tomatsu, T., Fukao, K., Kawata, T., Orii, N., Kondo
    • 雑誌名

      Journal of Inherited Metabolic Disease 29 (6)

      ページ: 755-761

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulation Study on Water Associated with π-electrons of Benzene by using QM/MM Potential.2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Yonezawa, K, Nakata, T.Takada, H.Nakamura
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters Vol. 428, No. 1-3

      ページ: 73-77

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [雑誌論文] Disordered domains and high surface charge confer hubs with the ability to interact with multiple proteins in interaction networks2006

    • 著者名/発表者名
      Patil A, Nakamura H
    • 雑誌名

      FEBS Letters in press

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [雑誌論文] Molecular dynamics simulation study on water associated with π-electrons of benzene by using QM/MM potential.2006

    • 著者名/発表者名
      Yonezawa, Y., Nakata, K., Takada, T., Nakamura, H.
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 428

      ページ: 73-77

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18054013
  • [雑誌論文] A challenge towards next-generation research infrastructure for advanced life science2004

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 雑誌名

      New Generation Comput. 22(2)

      ページ: 157-166

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15570134
  • [雑誌論文] A Challenge towards Next-Generation Research Infrastructure for Advanced Life Science2004

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 雑誌名

      New Generation Comput. vol.22 No.2

      ページ: 157-166

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15570134
  • [雑誌論文] Molecular simulation and structure based drug design2003

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 雑誌名

      Igaku-no-Ayumi 205(7)

      ページ: 463-465

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15570134
  • [雑誌論文] 分子薬物相互作用のシミュレーションとStructure-Based Drug Design2003

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 雑誌名

      医学のあゆみ vol.205 No.7

      ページ: 463-465

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15570134
  • [雑誌論文] A Role of the Third Complementarity Determining Region in the Affinity Maturation of an Antibody.2001

    • 著者名/発表者名
      Furukawa K., Shirai H., Azuma T, Nakamura H
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 276

      ページ: 27622-27628

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12557239
  • [雑誌論文] Protein Structure Databases with new web services for structural biology and biomedical research

    • 著者名/発表者名
      S Daron, A Kinjo, K Kinoshita, H Nakamura
    • 雑誌名

      Brief. Bioinform (in press)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [学会発表] Prediction of complex structure and affinity between cyclin-dependent kinase 2 and its inhibitor using multicanonical molecular dynamics and thermodynamic integration simulations2018

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Mitsugu Araki, Ikuo Fukuda, Yasushi Okuno, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 61st annual meeting of the Biophysical Society, New Orleans (USA)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Oct4の2つのDNA結合サブドメインを結ぶLinker領域の構造多様性2017

    • 著者名/発表者名
      速水智教、高田彰二、笠原浩太、中村春木、肥後順一
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Flexible docking and affinity calculation between CDK2 and its inhibitor CS3 using multicanonical MD and thermodynamic integration.2017

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Mitsugu Araki, Ikuo Fukuda, Yasushi Okuno, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Beyond Classical In-silico Drug Docking by Data Science and Molecular Simulation2017

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 15th Chinese Biophysics CongressShanghai (China)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Oct4の2つのDNA結合サブドメインを結ぶLinker領域の構造多様性2017

    • 著者名/発表者名
      速水智教、高田彰二、笠原浩太、中村春木、肥後順一
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] In-Silico Drug Development Using Data Science and Computational Chemistry2017

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Kickoff Meeting (JSPS Symposium) for the ZIAM/GBB and ISIR/IPR Collaboration, Groningen (Netherlands)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] ホメオドメインタンパク質によるジベレリン生合成遺伝子の転写制御機構の解析2017

    • 著者名/発表者名
      中村駿志,深澤壽太郎,高橋陽介
    • 学会等名
      第74回中国四国植物学会
    • 発表場所
      高知大学(高知県高知市)
    • 年月日
      2017-05-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Complex structure and Affinity of CDK2 and its Inhibitor Using McMD and TI Simulations2017

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Mitsugu Araki, Ikuo Fukuda, Yasushi Okuno, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      19th IUPAB congress, Edinburgh (U.K.)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Flexible Docking between cyclin-dependent kinase 2 and its inhibitor CS3 using multicanonical MD and thermodynamic integration simulations.2017

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Mitsugu Araki, Ikuo Fukuda, Yasushi Okuno, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Enhanced Sampling for Analysis and Prediction of Protein-Ligand Interactions2017

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Seminar at Science for Life LaboratoryStockholm (Sweden)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Accurate Prediction of Complex Structure and Affinity for a Flexible Protein Receptor and its Inhibitor2017

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The Trilateral Workshop for Frontier Protein Studies, Shanghai (China)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Accurate Prediction of Complex Structure and Affinity for a Flexible Protein Receptor and its Inhibitor2017

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Mini-Symposium, Astbury Centre, Leeds University (U. K.)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Non-Ewald method for accurately and efficiently calculating electrostatic interactions in molecular simulations2017

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Kota Kasahara, Han Wang, Shun Sakuraba, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      “Conformational Ensembles from Experimental Data and Computer Simulations” meeting sponsored by the Biophysical Society
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] 巨大生体分子の長時間 MD シミュレーションの開発と生体分子の構造機能相関の解明2016

    • 著者名/発表者名
      鷹野 優、Neetha Mohan、草鹿 あゆみ、川端 猛、笠原 浩太、真下 忠彰、神谷 成敏、中村 春木
    • 学会等名
      第8回「学際計算科学による新たな知の発展・統合・創出」 シンポジウム
    • 発表場所
      筑波大学計算科学研究センター(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-10-17
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational Approaches to Coupled Folding and Binding in Protein-Protein Interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      21st Biophysics Conference
    • 発表場所
      Hsinchu (Taiwan)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Molecular mechanism for modulation of a multiple transcription factor complex formed on enhancer site up on phosphorylation2016

    • 著者名/発表者名
      Ogata K, Shiina M, Kasahara K, Higo J, Hamada K, Nakamura H
    • 学会等名
      5th International Conference and Exhibition on Metabolomics
    • 発表場所
      ハイアットリージェンシー大阪(大阪府大阪市)
    • 年月日
      2016-05-16
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational Approaches to Protein Interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Japan-Slovenia JSPS Bilateral scientific exchange
    • 発表場所
      Koper (Slovenia)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Computational Approaches to Coupled Folding and Binding in Protein-Protein Interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      21st Biophysics Conference
    • 発表場所
      Hsinchu (台湾)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Oct4の2つのDNA結合サブドメインを結ぶ柔軟なlinker領域の自由エネルギー地形2016

    • 著者名/発表者名
      速水 智教、高田 彰二、中村 春木、肥後 順一
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県、つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Computational Approaches to Protein Interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Japan-Slovenia JSPS Bilateral scientific exchange
    • 発表場所
      Koper(スロベニア)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] New Methods for Structure Guided Drug Development2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      JCUP VII
    • 発表場所
      大手町サンスカイルーム朝日生命大手町ビル(東京都、千代田区)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 天然変性領域の過渡的な相互作用による転写制御の分子機構2016

    • 著者名/発表者名
      笠原 浩太、椎名 政昭、肥後 順一、緒方 一博、中村 春木
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県、福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] An efficient new methodology for path elucidation and binding free energy calculation2016

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県、福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Computational Approaches to Protein Interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Japan-Slovenia JSPS Bilateral scientific exchange
    • 発表場所
      Koper (Slovenia)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] BigData to Knowledge to Wisdom2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Data Sharing Symposium
    • 発表場所
      一橋大学一橋講堂(東京都千代田区)
    • 年月日
      2016-02-29
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 計算・情報科学による 転写サイクルにおける情報変換機構の解明2016

    • 著者名/発表者名
      笠原 浩太、Neetha Mohan、中村 春木
    • 学会等名
      転写サイクル合同班会議2016
    • 発表場所
      松島一の坊(宮城県宮城郡松島町)
    • 年月日
      2016-09-05
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] p53 C末端ドメインのアセチル化およびヒスチジンの荷電状態の変化がその立体構造集団に及ぼす影響2016

    • 著者名/発表者名
      飯田 慎仁, 牟田 寛弥, 後藤 祐児, 北條 裕信, 中村 春木, 肥後 順一
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational approaches to analyze and predict protein-protein interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      IPR International Workshop
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所 (大阪府)
    • 年月日
      2016-02-02
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Oct4の2つのDNA結合サブドメインを結ぶ柔軟なlinker領域の自由エネルギー地形2016

    • 著者名/発表者名
      速水 智教、高田 彰二、中村 春木、肥後 順一
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Insights Derived from Molecular Dynamics Simulations into the Subunit Assembly and Clamp Motions of Thermococcus kodakarensis RNA Polymerase2016

    • 著者名/発表者名
      Neetha Mohan, Kota Kasahara, Akira Hirata, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県、福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Insights Derived from Molecular Dynamics Simulations into the Subunit Assembly and Clamp Motions of Thermococcus kodakarensis RNA Polymerase2016

    • 著者名/発表者名
      Neetha Mohan, Kota Kasahara, Akira Hirata, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Flexible docking between cyclin-dependent kinase 2 and its inhibitor using multicanonical MD2016

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Mitsugu Araki, Yasushi Okuno, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県、つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] New Methods for Structure Guided Drug Development2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      JCUP VII
    • 発表場所
      大手町サンスカイルーム朝日生命大手町ビル(東京都千代田区)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Oct4の2つのDNA結合サブドメインを結ぶ柔軟なlinker領域の自由エネルギー地形2016

    • 著者名/発表者名
      速水智教、高田彰二、中村春木、肥後順一
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県、つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Computational Approaches to Coupled Folding and Binding in Protein-Protein Interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 11th International Symposium of the Protein Society of Thailand
    • 発表場所
      Bangkok (タイ)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 天然変性領域の過渡的な相互作用による転写制御の分子機構2016

    • 著者名/発表者名
      笠原 浩太、椎名 政昭、肥後 順一、緒方 一博、中村 春木
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 分子シミュレーションにおける静電相互作用計算法:零多重極子法の理論と実際2016

    • 著者名/発表者名
      福田 育夫, Wang Han, 神谷 成敏, 笠原 浩太, 寺田 透, 櫻庭 俊, 中村 春木
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県、つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Computational Approaches to Coupled Folding and Binding in Protein-Protein Interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 11th International Symposium of the Protein Society of Thailand
    • 発表場所
      Bangkok (Thailand)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Molecular behavior of a higher-order complex of multiple transcription factors on enhancer site upon phosphorylation2016

    • 著者名/発表者名
      Ogata K, Shiina M, Kasahara K, Higo J, Hamada K, Nakamura H
    • 学会等名
      6th International Conference on Structural Biology (Structural Biology 2016)
    • 発表場所
      Hilton New Orleans Airport Hotel (米国ルイジアナ州)
    • 年月日
      2016-08-22
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Flexible docking between cyclin-dependent kinase 2 and its inhibitor using multicanonical MD2016

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Mitsugu Araki, Yasushi Okuno, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県、つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] 零多重極子和法による静電相互作用計算: 理論と実際2016

    • 著者名/発表者名
      福田育夫,神谷成敏,笠原浩太,寺田透,Han Wang,桜庭俊,中村春木
    • 学会等名
      日本物理学会第71回年次大会
    • 発表場所
      東北学院大学
    • 年月日
      2016-03-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [学会発表] BigData to Knowledge to Wisdom2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Data Sharing Symposium
    • 発表場所
      一橋講堂(東京)
    • 年月日
      2016-02-29
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 分子シミュレーションにおける静電相互作用計算法:零多重極子法の理論と実際2016

    • 著者名/発表者名
      福田 育夫, Wang Han, 神谷 成敏, 笠原 浩太, 寺田 透, 櫻庭 俊, 中村 春木
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Flexible docking between cyclin-dependent kinase 2 and its inhibitor using multicanonical MD2016

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Mitsugu Araki, Yasushi Okuno, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 分子シミュレーションにおける静電相互作用計算法:零多重極子法の理論と実際2016

    • 著者名/発表者名
      福田育夫, Wang Han, 神谷成敏, 笠原浩太, 寺田透, 櫻庭俊, 中村春木
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県、つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14711
  • [学会発表] Computational analysis on electrostatic properties of protein and Protein-Protein Interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Asia Pacific Protein Association (APPA), IPR International Seminar
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所(大阪府吹田市)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational Approaches to Coupled Folding and Binding in Protein-Protein Interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 11th International Symposium of the Protein Society of Thailand
    • 発表場所
      Bangkok (Thailand)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] An efficient new methodology for path elucidation and binding free energy calculation2016

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 計算・情報科学による 転写サイクルにおける情報変換機構の解明2016

    • 著者名/発表者名
      笠原 浩太、Neetha Mohan、中村 春木
    • 学会等名
      転写サイクル合同班会議2016
    • 発表場所
      松島一の坊(宮城県宮城郡)
    • 年月日
      2016-09-05
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 巨大生体分子の長時間 MD シミュレーションの開発と生体分子の構造機能相関の解明2016

    • 著者名/発表者名
      鷹野 優、Neetha Mohan、草鹿 あゆみ、川端 猛、笠原 浩太、真下 忠彰、神谷 成敏、中村 春木
    • 学会等名
      第8回「学際計算科学による新たな知の発展・統合・創出」シンポジウム
    • 発表場所
      筑波大学計算科学研究センター(茨城県、つくば市)
    • 年月日
      2016-10-17
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Computational analysis on electrostatic properties of protein and Protein-Protein Interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Asia Pacific Protein Association (APPA), IPR International Seminar
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所(大阪府、吹田市)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 転写因子Ets1の天然変性領域のリン酸化によるDNA結合制御機構の速度論的解析2016

    • 著者名/発表者名
      椎名政昭,笠原浩太,肥後順一,馬場しほ,内山晃子,岡田千佳子,浜田恵輔,佐藤 光,中村春木,緒方一博
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-11-30
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational approaches to analyze and predict protein-protein interactions2016

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      IPR International Workshop
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所 (大阪府吹田市)
    • 年月日
      2016-02-02
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] p53 C末端ドメインのアセチル化およびヒスチジンの荷電状態の変化がその立体構造集団に及ぼす影響2016

    • 著者名/発表者名
      飯田 慎仁, 牟田 寛弥, 後藤 祐児, 北條 裕信, 中村 春木, 肥後 順一
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県、福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] A novel method to determine the optimal unbinding path between receptor and ligand using advanced molecular dynamics simulation2015

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, 神谷成敏, 中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] FRET法とRAMD法を用いた核内受容体PPARγのリガンド結合に関する実験・理論的研究2015

    • 著者名/発表者名
      神谷成敏, Gert-Jan Bekker, 白木琢磨, 中村春木
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] ヘムの構造歪みが酸化還元電位に与える影響の計算科学的研究2015

    • 著者名/発表者名
      今田康博, 中村春木, 鷹野優
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 分子シミュレーションにおける静電相互作用計算のための新規非エバルト法2015

    • 著者名/発表者名
      福田育夫, 神谷成敏, Han Wang, 笠原浩太、中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 低解像度密度マップへの複数のサブユニットのあてはめ計算-実験情報による拘束の利用-2015

    • 著者名/発表者名
      川端猛, 鈴木博文, 中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] EMDBとPDBを対象とした形状類似性検索:Omokage検索2015

    • 著者名/発表者名
      鈴木博文, 川端猛, 中村春木
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Prediction of protein-protein and protein-ligand interactions, and application to drug discovery2015

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 9th Asian Biophysics Association Symposium (ABA2015
    • 発表場所
      Hangzhou, China
    • 年月日
      2015-05-10
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Molecular Tailoring Approachによるタンパク質の二次構造に働く相互作用の量子化学的解析2015

    • 著者名/発表者名
      鷹野優, 草鹿あゆみ, 中村春木
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] ヘムの構造歪みが酸化還元電位に与える影響の計算科学的研究2015

    • 著者名/発表者名
      今田康博, 中村春木, 鷹野優
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] On the convergence of binding free-energy landscape calculation by improved virtual-system coupled adaptive umbrella sampling2015

    • 著者名/発表者名
      Bhaskar Dasgupta, 肥後順一, 中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational approach to find a specific interaction among many IDR relating fuzzy complexes2015

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      International Symposium on Structure and Folding of Disease Related Proteins
    • 発表場所
      ソウル(韓国)
    • 年月日
      2015-12-04
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] EMDBとPDBデータの形状類似検索:Omokage検索2015

    • 著者名/発表者名
      鈴木博文, 川端猛, 中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 抗体CDR-H3ループ領域の立体構造予測2015

    • 著者名/発表者名
      西上博士, Gert-Jan Bekker, 神谷成敏, 肥後順一, 中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] ヘムの構造歪みが酸化還元電位に与える影響の計算科学的研究2015

    • 著者名/発表者名
      今田康博, 中村春木, 鷹野優
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] p53蛋白質C末端天然変性領域の構造探索2015

    • 著者名/発表者名
      飯田慎仁, 神谷成敏, 北條裕信, 中村春木, 肥後順一
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Kinetic characterization of a DNA binding activity of the transcription factor Ets1 and its regulation by phosphorylation in an intrinsically disordered region2015

    • 著者名/発表者名
      Shiina M, Kasahara K, Higo J, Baba S, Hamada K, Uchiyama A, Suzuki K, Sato K, Nakamura H, Ogata K
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Molecular Tailoring Approach法による蛋白質二次構造内に働く相互作用の量子化学的研究2015

    • 著者名/発表者名
      草鹿あゆみ, 中村春木, 鷹野優
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] EMDBとPDBを対象とした形状類似性検索:Omokage検索2015

    • 著者名/発表者名
      鈴木博文, 川端猛, 中村春木
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 転写因子Ets1とパートナー転写因子の協調的結合によるDNA結合活性制御機構の計算科学的検討2015

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太, 福田育夫, 中村春木
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Novel non-Ewald methods for calculating electrostatic interactions in molecular simulations2015

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Han Wang, Kota Kasahara, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      ,金沢大学
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [学会発表] Computational analysis on electrostatic properties of proteins and their assembly2015

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The first trilateral workshop for frontier protein studies
    • 発表場所
      北京(中国)
    • 年月日
      2015-04-23
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 分子シミュレーションにおける静電相互作用計算のための新規非エバルト法2015

    • 著者名/発表者名
      福田育夫, 神谷成敏, Han Wang, 笠原浩太、中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] A specific interaction among many fuzzy complexes regulated by phosphorylation: Molecular simulation approach2015

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      RSC/IPR Joint Symposium “Protein Structure and Function”
    • 発表場所
      Australian National University (Canberra)
    • 年月日
      2015-11-14
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 転写因子Ets1とパートナー転写因子の協調的結合によるDNA結合活性制御機構の計算科学的検討2015

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太, 福田育夫, 中村春木
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] On the convergence of binding free-energy landscape calculation by improved virtual-system coupled adaptive umbrella sampling2015

    • 著者名/発表者名
      Bhaskar Dasgupta, 肥後順一, 中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 転写因子Ets1天然変性領域のリン酸化によるDNA認識阻害メカニズムの検討2015

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太、肥後順一、椎名政昭、緒方一博、中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 抗体CDR-H3ループ領域の立体構造予測2015

    • 著者名/発表者名
      西上博士, Gert-Jan Bekker, 神谷成敏, 肥後順一, 中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] A specific interaction among many fuzzy complexes regulated by phosphorylation: Molecular simulation approach2015

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      RSC/IPR Joint Symposium “Protein Structure and Function”
    • 発表場所
      キャンベラ(オーストラリア)
    • 年月日
      2015-11-14
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Prediction of protein-protein and protein-ligand interactions, and application to drug discovery2015

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 9th Asian Biophysics Association Symposium (ABA2015)
    • 発表場所
      瀋陽(中国)
    • 年月日
      2015-05-10
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 天然変性領域であるp53C末端ドメインの構造と物性にアセチル化が及ぼす影響2015

    • 著者名/発表者名
      飯田慎仁, 北條裕信, 中村春木, 肥後順一
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 低解像度密度マップへの複数のサブユニットのあてはめ計算-実験情報による拘束の利用-2015

    • 著者名/発表者名
      川端猛, 鈴木博文, 中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 分子シミュレーションから解き明かす転写因子Ets1のDNA結合調節機構2015

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太、Neetha Mohan、肥後順一、福田育夫、中村春木
    • 学会等名
      転写サイクル合同班会議2015
    • 発表場所
      ホテル暖香園(静岡県伊東市)
    • 年月日
      2015-08-03
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Interaction of two subunits of D/L hetero dimer with catalytic subunits in archaeal RNA polymerase: Insights from MD simulations2015

    • 著者名/発表者名
      Neetha Mohan, 笠原浩太、平田章、中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Computational Approaches to Coupled Folding and Binding in Protein-Protein Interactions2015

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      19th KPPS (Korean Peptide Protein Symposium) Symposium
    • 発表場所
      Resom Ocean Castle Resort, Korea
    • 年月日
      2015-07-07
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Molecular Tailoring Approach法による蛋白質二次構造内に働く相互作用の量子化学的研究2015

    • 著者名/発表者名
      草鹿あゆみ, 中村春木, 鷹野優
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] HOMCOSサーバを用いた複合体立体構造の進化的保存性の解析2015

    • 著者名/発表者名
      川端猛, 中村春木
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 転写因子Ets1天然変性領域のリン酸化によるDNA認識阻害メカニズムの検討2015

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太、肥後順一、椎名政昭、緒方一博、中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Development and application of novel non-Ewald methods for calculating electrostatic interactions in molecular simulations2015

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Han Wang, Kota Kasahara, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      29th Annual Symposium of The Protein Society
    • 発表場所
      Barcelona, Spain
    • 年月日
      2015-07-22
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [学会発表] ヘムの構造歪みが酸化還元電位に与える影響の計算科学的研究2015

    • 著者名/発表者名
      今田康博, 中村春木, 鷹野優
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] FRET法とRAMD法を用いた核内受容体PPARγのリガンド結合に関する実験・理論的研究2015

    • 著者名/発表者名
      神谷成敏, Gert-Jan Bekker, 白木琢磨, 中村春木
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Interaction of two subunits of D/L hetero dimer with catalytic subunits in archaeal RNA polymerase: Insights from MD simulations2015

    • 著者名/発表者名
      Neetha Mohan, 笠原浩太、平田章、中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] p53蛋白質C末端天然変性領域の構造探索2015

    • 著者名/発表者名
      飯田慎仁, 神谷成敏, 北條裕信, 中村春木, 肥後順一
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational approach to find a specific interaction among many IDR relating fuzzy complexes2015

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      International Symposium on Structure and Folding of Disease Related Proteins
    • 発表場所
      Seoul National University (韓国)
    • 年月日
      2015-12-04
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] A novel method to determine the optimal unbinding path between receptor and ligand using advanced molecular dynamics simulation2015

    • 著者名/発表者名
      Gert-Jan Bekker, 神谷成敏, 中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational Approaches to Coupled Folding and Binding in Protein-Protein Interactions2015

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      19th KPPS (Korean Peptide Protein Symposium) Symposium
    • 発表場所
      泰安郡(韓国)
    • 年月日
      2015-07-07
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 分子シミュレーションから解き明かす転写因子Ets1のDNA結合調節機構2015

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太、Neetha Mohan、肥後順一、福田育夫、中村春木
    • 学会等名
      転写サイクル合同班会議2015
    • 発表場所
      ホテル暖香園(静岡県伊東市)
    • 年月日
      2015-08-03
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 天然変性領域であるp53C末端ドメインの構造と物性にアセチル化が及ぼす影響2015

    • 著者名/発表者名
      飯田慎仁, 北條裕信, 中村春木, 肥後順一
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Molecular Tailoring Approachによるタンパク質の二次構造に働く相互作用の量子化学的解析2015

    • 著者名/発表者名
      鷹野優, 草鹿あゆみ, 中村春木
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Molecular Mechanism of Inhibition of Transcription Factor Ets1-DNA Binding, Induced by Phosphorylation on a Disordered Region2015

    • 著者名/発表者名
      Kasahara Kota, Higo Junichi, Shiina Masaaki, Fukuda Ikuo, Ogata Kazuhiro, Nakamura Haruki
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [学会発表] HOMCOSサーバを用いた複合体立体構造の進化的保存性の解析2015

    • 著者名/発表者名
      川端猛, 中村春木
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] EMDBとPDBデータの形状類似検索:Omokage検索2015

    • 著者名/発表者名
      鈴木博文, 川端猛, 中村春木
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational analysis on electrostatic properties of proteins and their assembly.2015

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The first trilateral workshop for frontier protein studies
    • 発表場所
      Peking University, China
    • 年月日
      2015-04-23
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Contact number diffusion model for the normal mode analysis of protein structure2014

    • 著者名/発表者名
      Bhaskar Dasgupta, Kota Kasahara, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura, Akira Kinjo
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2014-09-26
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] New Approach to Electrostatic Properties of Proteins and Protein-Protein Interactions2014

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H
    • 学会等名
      The 4th Asia Pacific Protein Association (APPA) Conference
    • 発表場所
      ICC Jeju, Korea
    • 年月日
      2014-05-18
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Molecular dynamics study on enhancer recognitions by cooperative binding of Ets1 and partner transcription factors2014

    • 著者名/発表者名
      Kota Kasahara, Ikuo Fukuda, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 4th Asia Pacific Protein Association (APPA 2014)
    • 発表場所
      ICC Jeju, Korea
    • 年月日
      2014-05-18
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 蛋白質の二次構造形成に関わる相互作用に関する理論的研究2014

    • 著者名/発表者名
      鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-06-25
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Elastic properties of dynein motor domain obatined from all-atom molecular dynamics simulations in explicit water2014

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2014-09-25
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Molecular dynamics study on cooperative binding of Ets1 and partner transcription factors on regulatory elements2014

    • 著者名/発表者名
      Kota Kasahara, Ikuo Fukuda, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2014-09-25
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Segmentation & fitting algorithm for multiple submit fitting into a low resolution density map2014

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Kawabata, Hirofumi Suzuki, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Free-energy landscape of the C-terminal negative regulatory domain of p532014

    • 著者名/発表者名
      Sinji Iida, Haruki Nakamura, Junichi Higo
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜、横浜市
    • 年月日
      2014-06-25
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーション解析のためのMulti-modal Dynamic Cross Correlation法の開発と応用2014

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太、福田育夫、中村春木
    • 学会等名
      第3回生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2014-10-02
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 分子動力学法に基づいた新しい動的相関解析手法の開発と転写因子Ets-1-DNA結合機構解析への応用2014

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太、福田育夫、中村春木
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-06-25
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 分子動力学法に基づいた新しい動的相関解析手法の開発と転写因子Ets-1-DNA結合機構解析への応用2014

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太、福田育夫、中村春木
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜、横浜市
    • 年月日
      2014-06-25
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Contact number diffusion model for the normal mode analysis of protein structure2014

    • 著者名/発表者名
      Bhaskar Dasgupta, Kota Kasahara, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura, Akira Kinjo
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-26
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Density functional study of local and nonlocal molecular interactions in secondary structure2014

    • 著者名/発表者名
      Takano Y, Nakamura H
    • 学会等名
      54th Sanibel Symposium
    • 発表場所
      The King and Prince Golf & Beach Resort, Georgia, USA
    • 年月日
      2014-02-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] New Approach to Electrostatic Properties of Proteins and Protein-Protein Interactions2014

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 4th Asia Pacific Protein Association (APPA 2014)
    • 発表場所
      済州島(韓国)
    • 年月日
      2014-05-18
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Zero-multipole summation法による効率的静電相互作用計算2014

    • 著者名/発表者名
      福田 育夫, 神谷成敏,中村春木
    • 学会等名
      日本物理学会第69回年次大会
    • 発表場所
      東海大学 湘南キャンパス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [学会発表] New Approach to Electrostatic Properties of Proteins and Protein-Protein Interactions2014

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 4th Asia Pacific Protein Association (APPA 2014) (Plenary Lecture)
    • 発表場所
      ICC Jeju, Korea
    • 年月日
      2014-05-18
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 転写因子Ets1のDNA結合制御に関する分子シミュレーション研究2014

    • 著者名/発表者名
      笠原 浩太,福田 育夫,中村 春木
    • 学会等名
      冬の若手ワークショップ2014
    • 発表場所
      舌切雀のお宿 磯部ガーデン(群馬県)
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Free-energy landscape of the C-terminal negative regulatory domain of p532014

    • 著者名/発表者名
      Sinji Iida, Haruki Nakamura, Junichi Higo
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-06-25
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Theoretical analysis of molecular interactions in secondary structures of proteins2014

    • 著者名/発表者名
      Yu Takano, Ayumi Kusaka, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational study of the electronic structures of hemes in cytochrome c32014

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Imada, Haruki Nakamura, Yu Takano
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2014-09-25
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] A new non-Ewald scheme for molecular dynamics simulation and its application to a free energy landscape for protein-protein interaction.2014

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      2nd International Conference on Computational Science and Engineering (ICCSE 2014)
    • 発表場所
      Ho Chi Minh, Vietnam
    • 年月日
      2014-08-23
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] fkcombu:2D-MCSを用いた鋳型ベースの低分子化合物ドッキング法の開発2014

    • 著者名/発表者名
      川端猛、中村春木
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-06-27
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Molecular dynamics study on enhancer recognitions by cooperative binding of Ets1 and partner transcription factors2014

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太、福田育夫、中村春木
    • 学会等名
      The 4th Asia Pacific Protein Association (APPA 2014)
    • 発表場所
      済州島(韓国)
    • 年月日
      2014-05-18
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] New Non-Ewald Scheme for Molecular Dynamics Simulation and Application to Free Energy Calculation2014

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Bioinformatics in Torun 2014 (BIT14)
    • 発表場所
      Torun(Poland)
    • 年月日
      2014-06-12
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Free-energy landscape of C-terminal negative regulatory domain of p532014

    • 著者名/発表者名
      Shinji Iida, Haruki Nakamura, Junini Higo
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2014-09-25
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Transcriptome analysis of red seabream (Pagrus major) embryos treated with 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD)2014

    • 著者名/発表者名
      M. Iida, S. Fujii, M. Uchida, H. Nakamura, Y. Kagami, S.M. Bak, E.Y. Kim, Y. Shima, H. Iwata
    • 学会等名
      Society of Toxicology
    • 発表場所
      Phoenix Convention Center(米国アリゾナ州)
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Density functional study of molecular interactions in secondary structures of proteins2014

    • 著者名/発表者名
      Takano Y, Nakamura H
    • 学会等名
      The 4th Asia Pacific Protein Association (APPA) Conference
    • 発表場所
      ICC Jeju, Korea
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] Cytochrome c3中のヘムの電子構造制御に関する計算科学的研究2014

    • 著者名/発表者名
      今田康博、中村春木、鷹野優
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-06-26
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] A new non-Ewald scheme for molecular dynamics simulation and its application to a free energy landscape for protein-protein interaction2014

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      2nd International Conference on Computational Science and Engineering (ICCSE 2014)
    • 発表場所
      ホーチミン(ベトナム)
    • 年月日
      2014-08-23
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Molecular dynamics study on cooperative binding of Ets1 and partner transcription factors on regulatory elements2014

    • 著者名/発表者名
      Kota Kasahara, Ikuo Fukuda, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Free-energy landscape of C-terminal negative regulatory domain of p532014

    • 著者名/発表者名
      Shinji Iida, Haruki Nakamura, Junini Higo
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Elastic properties of dynein motor domain obatined from all-atom molecular dynamics simulations in explicit water2014

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 抗原抗体ドッキングのデコイセット評価法2014

    • 著者名/発表者名
      榛葉教子、神谷成敏、中村春木
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-06-26
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 二次構造形成に関する局所および非局所相互作用に関する計算化学的研究2014

    • 著者名/発表者名
      鷹野 優, 中村 春木
    • 学会等名
      スーパーコンピュータ・ワークショップ2013
    • 発表場所
      自然科学研究機構・岡崎コンファレンスセンター(岡崎市)
    • 年月日
      2014-01-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] New Non-Ewald Scheme for Molecular Dynamics Simulation and Application to Free Energy Calculation2014

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Bioinformatics in Torun 2014 (BIT14)
    • 発表場所
      Torun, Poland
    • 年月日
      2014-06-12
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] The zero-dipole summation method and its application to molecular simulation with homogenous and inhomogeneous systems2013

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Kota Kasahara, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 12th Asia Pacific Physics Conference (APPC12)
    • 発表場所
      幕張メッセ(千葉県)
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] All-atom molecular dynamics simulations of dynein motor domain in explicit water2013

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Protein Society the 27th Annual Symposium
    • 発表場所
      Boston(USA)
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Prediction of Protein-Protein Interactions: Structural Approaches.2013

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 2nd HD Physiology International Symposium
    • 発表場所
      丸の内MY PLAZAホール(東京)
    • 年月日
      2013-06-28
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] GPUを利用したZero-dipole summation法による静電相互作用計算の高速化2013

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      2013年ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学(東京)
    • 年月日
      2013-01-15
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] New Approaches to Dynamic Properties of Proteins and their Applications to Drug Discover of GPCR2013

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H
    • 学会等名
      CADD'13
    • 発表場所
      Institut Teknologi Bandung, Bandung, Indonesia
    • 年月日
      2013-12-12
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Quantum chemical study of intra- and inter- molecular interactions in secondary structures2013

    • 著者名/発表者名
      鷹野 優, 中村 春木
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都国際会議場(京都市)
    • 年月日
      2013-10-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] Gene Expression Changes Exposed to 2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD) in Early Developmental Stage Embryos of Red Seabream (Pagrus major)2013

    • 著者名/発表者名
      M. Iida, Y. Murakami, Y. Shima, H. Nakamura, Y. Kagami, S. Fujii, A. Srai, H. Iwata
    • 学会等名
      転写サイクル合同班会議
    • 発表場所
      ホテルおかだ(神奈川県)
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Zero-dipole summation method for evaluating eletrostatic interaction in molecular simulation of biomolecular system2013

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都市)
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] A new non-Ewald scheme : The zero-dipole summation method and its applications to molecular dynamics simulations for homogeneous and inhomogeneous biomolecular systems2013

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H
    • 学会等名
      National Symposium on Frontiers of Biophysics, Biotechnology & Bioinformatics and 37'th Annual Meeting of Indian Biophysical Society
    • 発表場所
      University of Mumbai, India
    • 年月日
      2013-01-14
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] The zero-dipole summation method and its application to molecular simulation with homogenous and inhomogeneous systems2013

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Kota Kasahara, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 12th Asia Pacific Physics Conference (APPC12)
    • 発表場所
      幕張メッセ(千葉市)
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Free-energy Landscape of Coupled Folding and Binding of IDP-partner Systems in an Explicit Solvent Investigated by All-atom Multicanonical Molecular Dynamics2013

    • 著者名/発表者名
      Junichi Higo, Koji Umezawa, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Protein Society the 27th Annual Symposium
    • 発表場所
      Boston Marriott, Boston, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] All-atomic molecular dynamics simulations of dynein motor domain in explicit water2013

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館(鳥取市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Theoretical study of local- and nonlocal-molecular interactions in secondary structures2013

    • 著者名/発表者名
      Yu Takano, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      5th JCS (Japan, Czech, Slovakia) International Symposium on Theoretical Chemistry
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良市)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] The zero-dipole summation method and its application to molecular simulation with homogenous and inhomogeneous systems2013

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Kota Kasahara, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      APPC12 The 12th Asia Pacific Physics Conference of AAPPS, ASEPS3 The third Asia-Europe Physics Summit
    • 発表場所
      International Conference Halls, Makuhari Messe Chiba, Japan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [学会発表] Zero-dipole summation method for evaluating eletrostatic interaction in molecular simulation of biomolecular system2013

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府)
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Theoretical study of local- and nonlocal- molecular interactions in secondary structures2013

    • 著者名/発表者名
      Takano Y, Nakamura H
    • 学会等名
      5th JCS (Japan, Czech, Slovakia) International Symposium on Theoretical Chemistry
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良市)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] Computational protein science: structural bioinformatics and molecular simulations2013

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      CDAST symposium
    • 発表場所
      Jember University(インドネシア・ジャワ)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Prediction of Protein-Protein Interactions: Structural Approaches2013

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 2nd HD Physiology International Symposium
    • 発表場所
      丸の内MY PLAZAホール(東京都)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational Prediction and Analysis of Protein-Protein Interactions: Qualitative and Quantitative Approaches2013

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Special Seminar at Academia Sinica
    • 発表場所
      Academia Sinica, Shanghai
    • 年月日
      2013-01-18
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] ゲノム情報(1D)から蛋白質の動的構造情報(4D)へ2013

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本学術会議公開シンポジウム
    • 発表場所
      日本学術会議講堂(東京)
    • 年月日
      2013-09-17
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Towards quantitative analysis and prediction of protein-protein interactions2013

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H
    • 学会等名
      5th JCS (Japan, Czech, Slovakia) International Symposium on Theoretical Chemistry
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良市)
    • 年月日
      2013-12-03
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] All-atom molecular dynamics simulations of dynein motor domain in explicit water2013

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Protein Society the 27th Annual Symposium
    • 発表場所
      Boston Marriott, Boston, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] ゲノム情報(1D)から蛋白質の動的構造情報(4D)へ2013

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 学会等名
      日本学術会議公開シンポジウム
    • 発表場所
      日本学術会議講堂(東京都)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] TCDD曝露したマダイ胚のトランスクリプトーム解析2013

    • 著者名/発表者名
      飯田 緑, 藤井 聡, 内田 雅也, 中村 浩, 鏡 良弘, Bak, Su-Min, 金 恩英, 島 康洋, 岩田久人
    • 学会等名
      日本内分泌撹乱化学物質学会
    • 発表場所
      東京大学(東京都)
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] All-atomic molecular dynamics simulations of dynein motor domain in explicit water2013

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館(鳥取県)
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] 生命科学における情報科学・計算科学2013

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第6回三大学連携シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学統合研究拠点
    • 年月日
      2013-02-22
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Drug Development for a GPCR with in-silico screening2013

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H
    • 学会等名
      Nagoya symposium : Frontiers in Structural Physiology
    • 発表場所
      名古屋大学豊田講堂
    • 年月日
      2013-01-24
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Zero-dipole summation method for evaluating electrostatic interaction in molecular simulation of biomolecular system2013

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都国際会館
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [学会発表] New Approaches to Dynamic Properties of Proteins and their Applications to Drug Discover of GPCR.2013

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      CADD’13
    • 発表場所
      Institut Teknologi Bandung, Indonesia
    • 年月日
      2013-12-12
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Prediction of protein-protein complex structures2013

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H
    • 学会等名
      International Conference on Biomolecular Forms and Functions
    • 発表場所
      Indian Institute of Science Bangalore, India
    • 年月日
      2013-01-10
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Zero-dipole summation method for evaluating eletrostatic interaction in molecular simulation of biomolecular system2013

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Prediction of protein-protein complex structures2013

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      International Conference on Biomolecular Forms and Functions
    • 発表場所
      Indian Institute of Science Bangalore, India
    • 年月日
      2013-01-10
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Drug Development for a GPCR with in-silico screening2013

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Nagoya Symposium, Frontiers in Structural Physiology
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知)
    • 年月日
      2013-01-24
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Computational Protein Science: Structural Bioinformatics and Molecular Simulations2013

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      CDAST symposium
    • 発表場所
      Jember University, Indonesia
    • 年月日
      2013-12-14
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] New approaches to dynamic properties of proteins and their applications to drug discovery of GPCR2013

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      CADD’13
    • 発表場所
      Institut Teknologi Bandung(インドネシア・バンドン)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] All-atom molecular dynamics simulations of dynein motor domain in explicit water2013

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Protein Society the 27th Annual Symposium
    • 発表場所
      Boston Marriott, Copley Place(米国マサチューセッツ州)
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] A new non-Ewald scheme: The zero-dipole summation method and its applications to molecular dynamics simulations for homogeneous and inhomogeneous biomolecular systems2013

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      National Symposium on Frontiers of Biophysics, Biotechnology Bioinformatics and 37'th Annual Meeting of Indian Biophysical Society
    • 発表場所
      University of Mumbai, India
    • 年月日
      2013-01-14
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] ゲノム情報(1D)から蛋白質の動的構造情報(4D)へ2013

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 学会等名
      日本学術会議公開シンポジウム
    • 発表場所
      日本学術会議講堂(東京)
    • 年月日
      2013-09-17
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] GPUを利用したZero-dipole summation法をによる静電相互作用の高速計算2012

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Prediction of protein-protein complex structures2012

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, H.
    • 学会等名
      International Conference on Biomolecular Forms and Functions
    • 発表場所
      Indian Institute of Science, Bangalore, India
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] A new non-Ewald scheme: The zero-dipole summation method and its applications to molecular dynamics simulations for homogeneous and inhomogeneous biomolecular systems2012

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, H.
    • 学会等名
      National Symposium on Frontiers of Biophysics, Biotechnology & Bioinformatics and 37'th Annual Meeting of Indian Biophysical Society
    • 発表場所
      University of Mumbai, Mumbai, India
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Computational Prediction and Analysis of Protein-Protein Interactions: Qualitative and Quantitative Approaches2012

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, H.
    • 学会等名
      Special Seminar at Academia Sinica
    • 発表場所
      Academia Sinica, Shanghai, China
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Atoms in molecules 法によるタンパク質α へリックス, β シートの水素結合相互作用の理論解析2012

    • 著者名/発表者名
      山崎 秀樹, 中村 春木
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学東山キャンパス(名古屋市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulations of Ets1-DNA complexes using Zero-Dipole Summation Method2012

    • 著者名/発表者名
      Takamasa Arakawa, Masaaki Shiina, Kazuhiro Ogata, Narutoshi Kamiya, Ikuo Fukuda, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] A simple non-Ewald scheme: the zero-dipole summation method and its application to molecular systems2012

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Takamasa Arakawa, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Conference on Computational Physics (CCP2012)
    • 発表場所
      ニチイ学館・神戸ポートアイランドセンター
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 蛋白質の自由エネルギー地形2012

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      スーパーコンピュータ・ワークショップ2012
    • 発表場所
      自然科学研究機構・岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2012-01-25
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Drug Development for a GPCR with in-silico screening2012

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, H.
    • 学会等名
      Nagoya Symposium
    • 発表場所
      名古屋大学 豊田講堂
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulations of Ets1-DNA complexes using Zero-Dipole Summation Method2012

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知)
    • 年月日
      2012-09-24
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24118001
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulations of Ets1-DNA complexes using Zero-Dipole Summation Method2012

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学東山キャンパス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] 抗原抗体相互作用における親和性創出機構の精密解析2012

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Prediction of Protein-Protein Complex Structures Using a Docking Server, surFit2012

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, H.
    • 学会等名
      The 26th Annual Symposium of the Protein Society
    • 発表場所
      Manchester Grand Hyatt, San Diego, California, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] A simple non-Ewald scheme: the zero-dipole summation method and its application to molecular systems2012

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, H.
    • 学会等名
      Conference on Computational Physics (CCP2012)
    • 発表場所
      Nichii Gakkan, Kobe
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Atoms in molecules法によるタンパク質αへリックス、βシートの水素結合相互作用の理論解析2012

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学・東山キャンパス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] 蛋白質-蛋白質ドッキングのためのスコア関数の開発:抗原抗体の場合2012

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Zero-dipole summation法を用いた、DNAおよびタンパク質-DNA複合体の分子動力学シミュレーション2012

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Structural properties of hub proteins in interaction networks and its implications on interaction promiscuity2011

    • 著者名/発表者名
      中村 春木
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪千里
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Intrinsically Disordered Proteins and Development of Corresponding Drugs2011

    • 著者名/発表者名
      Nakamura H
    • 学会等名
      CADD2011 (Plenary Lecture)
    • 発表場所
      Penang, Malaysia
    • 年月日
      2011-12-05
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Simple and easy application of Wang-Landau method to molecular dynamics simulations2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第48回生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学、仙台
    • 年月日
      2010-09-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 補因子Fe_4S_4クラスターの酸化還元反応における電子構造の理論的研究2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター・札幌
    • 年月日
      2010-06-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 大量データと大規模計算機による蛋白質の構造・機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会 シンポジウム 「蛋白質研究法先進計測・解析技術の新展開」
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター・札幌(招待講演)
    • 年月日
      2010-06-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Study on 4'-Phosphopantetheinyl Transfer Reactions to Acyl Carrier Protein : the Preliminary Processes of Human Fatty Acid Synthesis2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第48回生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学、仙台
    • 年月日
      2010-09-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] PDBj : Protein structural database and query system for protein functions2010

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      International CD and Bioinformatics Conference
    • 発表場所
      Warwick University, UK(招待講演)
    • 年月日
      2010-12-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] High-throughput and Low-resolution structure comparison of 3D electron microscopy data2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第48回生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学、仙台
    • 年月日
      2010-09-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 光合成反応中心スペシャルペアの電子構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      山崎秀樹、鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      スーパーコンピューターワークショップ2010
    • 発表場所
      分子科学研究所
    • 年月日
      2010-01-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] ProMode-Elastic : database of elastic-network-model based normal mode analysis2010

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)
    • 発表場所
      早稲田大学、東京
    • 年月日
      2010-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Structural modeling for protein complexes using small angle x-ray scattering2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第48回生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学、仙台
    • 年月日
      2010-09-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Electronic structures of the novel [4F-4S] cluster in dark-operative protochlorophyllide oxidoreductase2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第48回生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学、仙台
    • 年月日
      2010-09-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] QM/MM分子動力学シミュレーションによる脂肪酸合成に関わるアシルキャリアー蛋白質のホスフォパンテティン化酵素反応の研究2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター・札幌
    • 年月日
      2010-06-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 自然免疫蛋白質の機能アノテーション2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター・札幌
    • 年月日
      2010-06-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 大量データと大規模計算機による蛋白質の構造・機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2010-06-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Bioinformatics and computational approaches to structural features in protein interactions for in-silico drug development.2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      The 1st international conference on frontiers of regenerative medicine and biomedical science.
    • 発表場所
      Jinan University, Guangzhoue(China)
    • 年月日
      2010-05-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 粗視化モデルによる脂肪酸合成酵素の構造変化シミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター・札幌
    • 年月日
      2010-06-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Charge density migration of the propionate groups of heme a of cytochrome c oxidase in the redox reaction2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Takano, H.Nakamura
    • 学会等名
      The 2nd Biosupercomputing Symposium
    • 発表場所
      MY PLAZA Hall, Tokyo
    • 年月日
      2010-03-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] X線小角散乱を用いたタンパク質複合体の構造モデリングを目指して2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター・札幌
    • 年月日
      2010-06-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 低分解能3次元電子顕微鏡データのハイスループット構造比較2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター・札幌
    • 年月日
      2010-06-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Domain distribution and intrinsic disorder in hubs in the human protein-protein interaction network2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター・札幌
    • 年月日
      2010-06-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Structural Bioinformatics : Databases and Analyses2010

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 9th China-Japan-Korea Bioinformatics Training Course and Bioinformatics Symposium
    • 発表場所
      Shanghai Institutes for Biological Sciences Chinese Academy of Sciences, Shanghai, China(招待講演)
    • 年月日
      2010-04-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 光合成反応中心スペシャルペアの電子構造の蛋白質依存性2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター・札幌
    • 年月日
      2010-06-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Conformational transition in the CDRH3 region of the anti-dansyl monoclonal antibody by molecular dynamics simulations2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第48回生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学、仙台
    • 年月日
      2010-09-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Theoretical study on the electronic structure of the special pair in the photosynthetic reaction2010

    • 著者名/発表者名
      H.Yamasaki, Y.Takano, H.Nakamura
    • 学会等名
      The 2nd Biosupercomputing Symposium
    • 発表場所
      MY PLAZA Hall, Tokyo
    • 年月日
      2010-03-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] 計算科学によるタンパク質間相互作用の予測と解析2010

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      蛋白質立体構造解析NEDO特別講座、創薬シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学薬学部,東京
    • 年月日
      2010-03-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Bioinformatics and Computational Approaches to Structural Features in Protein Interactions for in-silico Drug Development2010

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 1st International Conference on Frontier4s of Regenerative Medicine and Biomedical Science
    • 発表場所
      Jinan University, Guangzhoue, China(招待講演)
    • 年月日
      2010-05-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 粗視化モデルを用いた全原子モデルの効率化2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ、熊本
    • 年月日
      2009-05-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] チトクロムc酸化酵素のArg38のpK_aに対するheme aの制御機構の理論的研究2009

    • 著者名/発表者名
      鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子構造」第6回公開シンポジウム
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2009-12-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] Theoretical analysis of the side group rotamers of chlorophyll2009

    • 著者名/発表者名
      山崎秀樹、鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      次世代生命体統合PJ分子スケールワークショップ:「ペタフロップスコンピューティングに向けた生体高分子シミュレーションの最前線」
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所
    • 年月日
      2009-08-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] 天然変性蛋白質pKIDとKIXドメイン複合体形成における結合と折り畳みが共役した相互作用の計算科学による解析2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま、徳島
    • 年月日
      2009-10-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 原子構造から電子構造の解析へ2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま、徳島
    • 年月日
      2009-10-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Protein Functional Annotation from Structures2009

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      NEDO International Symposium
    • 発表場所
      The Univ. Tokyo (Japan)
    • 年月日
      2009-01-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] シトクロムc酸化酵素CuAサイトの電子状態解析2009

    • 著者名/発表者名
      小泉健一、鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      第9回蛋白質科学会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ
    • 年月日
      2009-05-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] Ligand coordination effects on the electronic structures of the models of hemocyanin2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Takano, K.Yamaguchi, H.Nakamura
    • 学会等名
      Diradicals and Multiradicals : Theory and Experiment
    • 発表場所
      FUNDP, Namur, Belgium
    • 年月日
      2009-07-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] 反応中心スペシャルペアの電子非対称性の理論解析2009

    • 著者名/発表者名
      山崎秀樹、鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      第9回日本光合成研究会公開シンポジウム「植物の生産性を支える多様な側面」
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2009-05-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] ヘムエリスリンの活性中心の電子構造への蛋白場の影響2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ、熊本
    • 年月日
      2009-05-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] シミュレーションとデータベース検索によるヒトラミニレ活性発現のために重要な立体構造の検討2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ、熊本
    • 年月日
      2009-05-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] シトクロムc酸化酵素CuAサイトの電子状態解析2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ、熊本
    • 年月日
      2009-05-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 粗視化モデルを用いた全原子シミュレーションの効率化2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま、徳島
    • 年月日
      2009-10-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] シトクロム酸化酵素CuAサイトの酸化還元電位に及ぼす周辺残基の効果についての理論的研究2009

    • 著者名/発表者名
      小泉健一、鷹野優、重田育照、神谷克政、中村春木、押山淳
    • 学会等名
      第3回分子科学討論会2009名古屋
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] スーパーコンピューティングによる蛋白質電子状態及び反応機構の解明に向けて2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま、徳島
    • 年月日
      2009-10-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Electronic structures of biological molecules with their dynamic environments2009

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      International Conference on Physics Biology Interface(ICPBI-2009)
    • 発表場所
      Saha Institute of Nulear Physics, Kolkata, India
    • 年月日
      2009-12-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 蛋白質構造データバンク事業と国際的な展開2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      統合データベースプロジェクト「データベースが拓くこれからのライフサイエンス」
    • 発表場所
      東京大学武田ホール、東京
    • 年月日
      2009-06-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 光合成反応中心の色素配置に関する理論研究2009

    • 著者名/発表者名
      山崎秀樹、鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      第9回蛋白質科学会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ
    • 年月日
      2009-05-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] ポルフィリン側鎖のヘムの電子構造への影響に関する理論的研究2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま、徳島
    • 年月日
      2009-10-30
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Bioinformatics and computational approaches to structural features in protein-protein interactions2009

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Bose Institute Seminar
    • 発表場所
      Bose Institute, Kolkata, India
    • 年月日
      2009-12-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] マルチカノニカル分子動力学シミュレーションによる57残基蛋白質の天然構造の再現2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ、熊本
    • 年月日
      2009-05-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Protein Function Annotation from Sequences and Structures with Tools at PDBj2009

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      AsCA'09
    • 発表場所
      Jingyi Hotel, Beijing,中国
    • 年月日
      2009-10-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] クロロフィル側鎖の回転に伴う電子構造変化の理論的研究2009

    • 著者名/発表者名
      山崎秀樹、鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      第12回理論化学討論会
    • 発表場所
      東京大学武田先端知ビル武田ホール
    • 年月日
      2009-05-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] Structural modeling of proteins : Principle and application to an ion channel2009

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 36th Congress of the International Union of Physiological Sciences
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都
    • 年月日
      2009-07-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] クロロフィル側鎖回転異性体の理論解析2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま、徳島
    • 年月日
      2009-11-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Prediction of function and protein-protein interaction by structural bioinformatics approach2009

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      IISc Seminar
    • 発表場所
      Indian Institute of Science, Bangalore, India
    • 年月日
      2009-12-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Density Functional Study of Roles of Porphyrin Ring in Electronic Structures of Heme2009

    • 著者名/発表者名
      鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島文理大学・アスティとくしま
    • 年月日
      2009-10-30
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] 光合成反応中心の色素配置に関する理論研究2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ、熊本
    • 年月日
      2009-05-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによる蛋白質周辺における水分子の集団的運動の解析2009

    • 著者名/発表者名
      梅澤公二、森河良太、鷹野優、中村春木、肥後順一
    • 学会等名
      「特定領域研究」生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構第5回ワークショップ
    • 発表場所
      湘南国際村センター国際会議場
    • 年月日
      2009-07-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] 単純並列化によるマルチカノニカル分子動力学法のサンプリング効率の向上2009

    • 著者名/発表者名
      池部仁善、梅澤公二、肥後順一、神谷成敏、杉原崇憲、米澤康滋、鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子構造」第6回公開シンポジウム
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2009-12-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによる、蛋白質周辺における水分子の協調的な動きの解析2009

    • 著者名/発表者名
      梅澤公二、森河良太、鷹野優、中村春木、肥後順一
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子構造」第6回公開シンポジウム
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2009-12-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] Theoretical analysis of the side group rotamers of chlorophyll2009

    • 著者名/発表者名
      山崎秀樹、鷹野優、中村春木
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島文理大学・アスティとくしま
    • 年月日
      2009-11-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] surFit : A Docking server of protein molecular surfaces2009

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      4th CAPRI Evaluation Meeting
    • 発表場所
      Barcelona, Spain
    • 年月日
      2009-12-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Ab initio QM/MDシミュレーションによるプロリンcis-trans異性化の自由エネルギー地形と水和の影響2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ、熊本
    • 年月日
      2009-05-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Rhodobacter sphaeroides活性中心のAb initio QM/MMによる研究2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま、徳島
    • 年月日
      2009-10-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] シミュレーション計算によって57残基蛋白質の天然構造をアミノ酸情報だけから再現する2009

    • 著者名/発表者名
      池部仁善、Daron M.Standley、鷹野優、中村春木、肥後順一
    • 学会等名
      「特定領域研究」生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構第5回ワークショップ
    • 発表場所
      湘南国際村センター国際会議場
    • 年月日
      2009-07-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] ヘムエリスリンの活性中心の電子構造への蛋白場の影響2009

    • 著者名/発表者名
      鷹野優、小泉健一、山口兆、中村春木
    • 学会等名
      第9回蛋白質科学会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ
    • 年月日
      2009-05-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20051013
  • [学会発表] あらわな溶媒と膜分子モデルによるダイナミックな効果を取り入れた光合成活性中心の電子状態計算2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ、熊本
    • 年月日
      2009-05-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 単純並列化によるマルチカノニカル分子動力学法のサンプリング効率の向上2009

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま、徳島
    • 年月日
      2009-10-30
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] ウシシトクロムc酸化酵素のヘムaの酸化還元状態における電子構造2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2008「大規模計算と分子のダイナミクス」
    • 発表場所
      分子科学研究所,岡崎
    • 年月日
      2008-02-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] PiRaNha : 蛋白質配列からのRNA結合残基予測2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 年月日
      2008-12-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Protein functional annotation from pattern recognition for 3D structures.2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      Pattern Recognition in Bioinformatics 2008
    • 発表場所
      Novotel St Kilda, Melbourne(Australia)
    • 年月日
      2008-10-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] ウシシトクロムc酸化酵素のヘムaの酸化還元状態における電子構造2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本化学会第88回春期年会
    • 発表場所
      立教大学,東京
    • 年月日
      2008-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] 光合成反応中心スペシャルペアの電子非対称性の理論解析2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2008「大規模計算と分子のダイナミクス」
    • 発表場所
      分子科学研究所,岡崎
    • 年月日
      2008-02-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] 光合成反応中心スペシャルペアの電子非対称性の理論解析2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2008「大規模計算と分子のダイナミクス」
    • 発表場所
      分子科学研究所(岡崎)
    • 年月日
      2008-02-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] 粗視化モデルを用いた全原子シミュレーションの効率化2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 年月日
      2008-12-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] A theoretical analysis of electronic asymmetry of the special pari in photosynthetic reaction center2008

    • 著者名/発表者名
      H., Yamasaki, Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      Supercomputer Workshop 2008 : Large-scale computation and molecular dynamics
    • 発表場所
      Institute for Molecular Science, Okazaki
    • 年月日
      2008-02-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Pattern recognition for protein 3D structures2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      情報処理学会バイオ情報学研究会
    • 発表場所
      大阪大学(豊中・大阪)
    • 年月日
      2008-12-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Theoretical study of the roles of heme side chains and axial ligands2008

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      48th Sanibel Symposium
    • 発表場所
      The King and Prince Golf & Beach Resort, Georgia,米国
    • 年月日
      2008-02-26
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] ウシシトクロムc酸化の酵素のヘムαの酸化還元状態における電子構造2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2008 「大規模計算と分子のダイナミクス」
    • 発表場所
      分子科学研究所(岡崎)
    • 年月日
      2008-02-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] マルチカノニカル分子動力学法によるアミロイドペプチド4本鎖の会合シミュレーション2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(東京)
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Development of a scoring method for predicting protein complex structures2008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      2^<nd> Pacific Rim International Conference on Protein Science
    • 発表場所
      Cairns Convention Centre, Australia
    • 年月日
      2008-06-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 抗体相補性決定領域の網羅的構造分類2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(東京)
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Quantum chemical study of the spin density distribution of the special paircation radical in the photosynthetic reaction center2008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 1st International Global COE Symposium on Bio-Environmental Chemistry
    • 発表場所
      Hotel Hankyu EXPO Park, Osaka
    • 年月日
      2008-01-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Development of scoring functions for predicting protein complex structures2008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Japan-UK Symposium on Protein InformaticS toward Interactome Analysis
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター(大阪)
    • 年月日
      2008-09-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Standardization, Validation and Integration of Protein 3D Structure Information2008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      4'th International Symposium on StandardReference Data
    • 発表場所
      Daejeon Convention Center, Daejeon (Korea)
    • 年月日
      2008-10-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] H3-rules, Progress report 20072008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      2^<nd> Pacific Rim International Conference on Protein Science
    • 発表場所
      Cairns Convention Centre, Australia
    • 年月日
      2008-06-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] ウシシトクロムc酸化酵素のヘムαの酸化還元状態における電子構造2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本化学会第88回春期年会
    • 発表場所
      立教大学(東京)
    • 年月日
      2008-03-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Quantum chemical study of the spin density distribution of the special pair cation radical in the photosynthetic reaction center2008

    • 著者名/発表者名
      H., Yamasaki, Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      The 1st International Global COE Symposium on Bio-Environmental Chemistry
    • 発表場所
      Hotel Hankyu EXPO park, Osaka
    • 年月日
      2008-01-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Dynamical Aspects of MAOA funcfion: Membrane Attachment Facilitates Ligand Access,2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      Perspective in Structural Biology of Membrane Proteins and Biological Macromolecules
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所,大阪
    • 年月日
      2008-03-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Protein functional annotation from pattern recognition for 3Dstructures2008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Pattern Recognition in Bioinformatics 2008
    • 発表場所
      Novotel St Kilda, Melbourne (Australia)
    • 年月日
      2008-10-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Quantum chemical study of the spin density distribution of the special pair cation radical in the photosynthetic reaction center2008

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      The lst International Global COE Symposium on Bio-Environmental Chemistry
    • 発表場所
      ホテル阪急EXPOパーク,大阪
    • 年月日
      2008-01-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Electronic structure of heme a in bovine cytochrome c oxidase in the redox state2008

    • 著者名/発表者名
      Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      Supercomputer Workshop 2008 : Large-scale computation and molecular dynamics
    • 発表場所
      Institute for Molecular Science, Okazaki
    • 年月日
      2008-02-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Flexible protein-protein docking by Monte Carlo plus Minimization of an all-atom field2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(東京)
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] アルファ/ベーダ両二次構造を含む40残基蛋白質の立体構造サンプリング2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(東京)
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 抗体カノニカル構造再訪2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 年月日
      2008-12-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 蛋白質複合体構造予測のための評価法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(東京)
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] PiRaNhA : A Server for the Prediction of RNA-binding Residues in Protein Sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      International Conference on Bioinformatics, 2008
    • 発表場所
      National Yang Ming University (Taiwan)
    • 年月日
      2008-10-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 蛋白質周辺における水の協調的な流れの分子動力学シミュレーションによる解析2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(東京)
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] IG-Base : immunoglobulin structural database for antibody engineenng2008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 3^<rd> MEI International Symposium
    • 発表場所
      Hyatt Regency San-FranciSCO(U.S.A.)
    • 年月日
      2008-12-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Dynamical Aspects of MAOA function: Membrane Attachment Facilitates Ligand Access2008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Perspective in Structural Biology of Membrane Proteins and Biological Macromolecules
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所(大阪)
    • 年月日
      2008-03-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Theoretical study of the roles of heme side chains and axial ligands2008

    • 著者名/発表者名
      Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      48'th Sanibel Symposium
    • 発表場所
      The King and Prince Golf & Beach Resort, Georgia, U.S.A
    • 年月日
      2008-02-26
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Electronic structure of heme a in bovine cytochrome c oxidase in the redox state2008

    • 著者名/発表者名
      Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      88'th Spring Meeting of The Chemical Society of Japan
    • 発表場所
      Rikkyo University, Tokyo
    • 年月日
      2008-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Theoretical study of the roles of heme side chains and axial ligands2008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      48th Sanibel Symposium
    • 発表場所
      The King and Prince Golf& Beach Resort, Georgia, USA
    • 年月日
      2008-02-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] ヘテロタイマーの多様性 : 蛋白質複合体構造予測の研究から得られた知見2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 年月日
      2008-12-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] Assembly simulation of four peptide chains in explicit waterby multicanonical molecular dynamics2008

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      2^<nd> Pacific Rim International Conference on Protein Science
    • 発表場所
      Cairns Convention Centre, Australia
    • 年月日
      2008-06-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] リゾチーム周辺における水分子の流れパターン(順流、渦流、Dry/Wet流れ)に関する分子シミュレーションによる解析2008

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 年月日
      2008-12-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20370061
  • [学会発表] 大腸菌エンドヌクレアーゼ の基質認識機構の計算化学的研究2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜,横浜
    • 年月日
      2007-12-13
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Molecular simulations of protein-ligand structures constructed by computational doking2007

    • 著者名/発表者名
      A., Oda, Y., Takano, H., Nakamura, N., Yamaotsu, S., Hirono, O., Takahashi, H., Matsuzaki
    • 学会等名
      45'th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      Pacifico Yokohama, Yokohama
    • 年月日
      2007-12-21
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] マルチカノニカル分子動力学法による酵素-阻害剤間のフレキシブルドッキング2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター(仙台)
    • 年月日
      2007-05-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Computational studies of the substrate recognition mechanism of Escherichia coil endonuclease III2007

    • 著者名/発表者名
      K., Manabe, Y., Takano, K., Hitomi, J.A., Tainer, H., Nakamura, N., Iwai
    • 学会等名
      BMB 2007
    • 発表場所
      Pacifico Yokohama, Yokohama
    • 年月日
      2007-12-13
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] タンパク質-リガンド複合体予測構造の分子シミュレーションによる評価2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Structural Features of Hubs in Protein-Protein Interaction Networks2007

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      上海大学セミナー
    • 発表場所
      上海大学 Institute of Systems Biology,上海
    • 年月日
      2007-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Flexible docking between enzyme and inhibitor by multicanonical molecular dynamics2007

    • 著者名/発表者名
      N., Kamiya, Y., Yonezawa, H., Nakamura, J., Higo
    • 学会等名
      7'th Annual Meeting of Protein Science Society of Japan
    • 発表場所
      Sendai International Center, Sendai
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] マルチカノニカル分子動力学法による酵素-阻害剤間のフレキシブルドッキング2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター,仙台
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] プロリン異性化酵素Pin1のQM/MM錬成計算シミュレーション研究2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター,仙台
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Structural Features of Hubs in Protein-Protein Interaction Networks2007

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      PROTEIN ASSEMBLY, DYNAMICS AND FUNCTION
    • 発表場所
      Institut des Haute Etudes Scientifiques,パリ
    • 年月日
      2007-01-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Electronic structure of heme a in cytochrome c oxidase in the redox state2007

    • 著者名/発表者名
      Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      7'th Annual Meeting of Protein Science Society of Japan
    • 発表場所
      Sendai International Center, Sendai
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] タンパク質-リガンド複合体予測構造の分子シミュレーションによる評価2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜,横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] アルファとベータの二次構造を含む40残基の蛋白質H-NSのfolding simulation2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜,横浜
    • 年月日
      2007-12-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] チトクロムc酸化酵素のheme aの酸化還元における電子構造変化とプロトン移動との関係2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第1回分子科学討論会2007仙台
    • 発表場所
      東北大学川内北キャンパス
    • 年月日
      2007-09-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] 光合成活性中心スペシャルペアカチオンラジカルのスピン密度分布に関する理論的研究2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜,横浜
    • 年月日
      2007-12-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] 大腸菌エンドヌクレアーゼIIIの基質認識機構の計算化学的研究2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      分子生物学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2007-12-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] QM/MMシミュレーションによるPinl蛋白質のCis-Trans異性化酵素活性研究2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A theoretical approach to a novel proton transfer pathway of cytochrome c oxidase2007

    • 著者名/発表者名
      Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      45'th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      Pacifico Yokohama, Yokohama
    • 年月日
      2007-12-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A QM/MM molecular dynamics study on peptidyl-prolyl isomerase Pinl2007

    • 著者名/発表者名
      Y., Yonezawa, N., Kamiya, T., Takada, H., Nakamura
    • 学会等名
      7'th Annual Meeting of Protein Science Society of Japan
    • 発表場所
      Sendai International Center, Sendai
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A Computational Study of Monoamine Oxidase A Dynamics2007

    • 著者名/発表者名
      R., Apostolov, Y., Yonezawa, H., Nakamura
    • 学会等名
      7'th Annual Meeting of Protein Science Society of Japan
    • 発表場所
      Sendai International Center, Sendai
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] 光合成活性中心スペシャルペアカチオンラジカルのスピン密度分布に関する理論的研究2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2007-12-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] チトクロムc酸化酵素のheme aの酸化還元状態における電子構造2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター(仙台)
    • 年月日
      2007-05-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A Computational Study of Monoamine Oxidase A Dynamics2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Prediction of protein-protein interaction using evolutionary trance method and molecular surface complementarity2007

    • 著者名/発表者名
      E Kanamori, Y Murakami, Y Tsuchiya, D Standley, K Kinoshita, H Nakamura
    • 学会等名
      CAPRI evaluation meeting
    • 発表場所
      Canada
    • 年月日
      2007-04-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [学会発表] Quantum chemical study of the spin density distribution of the special pair cation radical in the bacterial photosynthetic reaction center2007

    • 著者名/発表者名
      H., Yamasaki, Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      45'th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      Pacifico Yokohama, Yokohama
    • 年月日
      2007-12-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] チトクロムc酸化酵素のheme αの酸化還元状態における電子構造2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター,仙台
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Structural Features of Hubs in Protein-Protein Interaction Networks2007

    • 著者名/発表者名
      H., Nakamura
    • 学会等名
      PROTEIN ASSEMBLY, DYNAMICS AND FUNCTION
    • 発表場所
      Institut des Haute Etudes Scientifiques, Paris
    • 年月日
      2007-01-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A theoretical approach to a novel proton transfer pathway of cytochromc coxidase2007

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      International Symposium on Molecular Theory for Real Systems
    • 発表場所
      京都大学桂キャンパス,京都
    • 年月日
      2007-07-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] チトクロムc酸化酵素の新しいプロトン輸送機構への理論的アプローチ-heme αの酸化還元における電子構造とペプチドを介したプロトン移動の関係-2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜,横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Molecular orbital study of the proton transfer through a peptide bond-A theoretical approach to a novel pathway of proton translocation of cytochrome c oxidase-2007

    • 著者名/発表者名
      Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      ICCMSE2007
    • 発表場所
      Marbella Corfu Hotel, Greece
    • 年月日
      2007-09-26
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] チトクロムc酸化酵素のheme αの酸化還元における電子構造変化とプロトン移動との関係2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第1回分子科学討論会2007仙台
    • 発表場所
      東北大学川内北キャンパス,仙台
    • 年月日
      2007-09-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Structural Features of Hubs in Protein-Protein Interaction Networks2007

    • 著者名/発表者名
      H., Nakamura
    • 学会等名
      Shanghai University Seminar
    • 発表場所
      Institute of Systems Biology, Shanghai University, Shanghai
    • 年月日
      2007-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A Computational Study of Monoamine Oxidase A Dynamics2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜,横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] QM/MMシミュレーションによるPinl蛋白質のCis-Trans異性化酵素活性研究2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜,横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A theoretical approach to a novel proton transfer pathway of cytochrome c oxidase2007

    • 著者名/発表者名
      Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      International Symposium on Molecular Theory for Real Systems
    • 発表場所
      Kyoto University
    • 年月日
      2007-07-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Relationship between electronic structural change and proton transfer of heme a in cytochrome c oxidase in the redox state2007

    • 著者名/発表者名
      Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      1'st meeting of Japan Society of Molecular Science 2007 at Sendai
    • 発表場所
      Tohoku University
    • 年月日
      2007-09-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A Computational Study of Monoamine Oxidase A Dynamics2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター,仙台
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] チトクロムc酸化酵素の新しいプロトン輸送機構への理論的アプローチ -heme αの酸化還元における電子構造とペプチドを介したプロトン移動の関係-2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Molecular orbital study of the proton transfer through a peptide bond-A theoretical approach to a novel pathway of proton translocation of cytochrome coxidase-2007

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      ICCMSE2007
    • 発表場所
      Marbella Corfu Hotel,ギリシャ
    • 年月日
      2007-09-26
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A Computational Study of Monoamine Oxidase A Dynamics2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター(仙台)
    • 年月日
      2007-05-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] プロリン異性化酵素PinlのQM/MM錬成計算シミュレーション研究2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター(仙台)
    • 年月日
      2007-05-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] アルファとベータの二次構造を含む40残基の蛋白質H-NSのfolding simulation2007

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 年月日
      2007-12-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A theoretical approach to a novel proton transfer pathway of cytochrome coxidase2007

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      International Symposium on Molecular Theory for Real Systems
    • 発表場所
      Kyoto University (Katsuracampus)
    • 年月日
      2007-07-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] A Computational Study of Monoamine Oxidase A Dynamics2007

    • 著者名/発表者名
      R., Apostolov, Y., Yonezawa, H., Nakamura
    • 学会等名
      45'th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      Pacifico Yokohama, Yokohama
    • 年月日
      2007-12-21
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] QM/MM simulation study on the mechanism of cis-trans isomerization of human Pinl protein2007

    • 著者名/発表者名
      Y., Yonezwa, N., Kamiya, H., Nakamura
    • 学会等名
      45'th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      Pacifico Yokohama, Yokohama
    • 年月日
      2007-12-21
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Folding simulation of a 40-residue protein, H-NS, involving alpha and beta secondary structures in explicit water2007

    • 著者名/発表者名
      J., Higo, J., Ikebe, N., Kamiya, H., Nakamura, H., Shindo
    • 学会等名
      45'th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      Pacifico Yokohama, Yokohama
    • 年月日
      2007-12-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Prediction of protein-protein interaction using evolutionary trance method and molecular surface complementarity2007

    • 著者名/発表者名
      E Kanamori, Y Murakami, Y Tsuchiya, D Standley, K Kinoshita, H Nakamura
    • 学会等名
      CAPRI evaluation meeting
    • 発表場所
      Toronto Canada
    • 年月日
      2007-04-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17081003
  • [学会発表] Theoretical analysis of electronic asymmetry of the special pair in the photosynthetic reaction center: Effect of protein environment2006

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      EABS & BSJ 2006
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター沖縄県宜野湾市
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] QM/MM study on catalytic mechanism of PPIase protein Pin12006

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      EABS & BSJ 2006
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター沖縄県宜野湾市
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Large-scale molecular dynamics simulations with the pariwise electrostatic interaction method for protein-solvent systems2006

    • 著者名/発表者名
      G., Kikugwa, Y., Yonezawa, H., Nakamura, R., Himeno
    • 学会等名
      EABS &BSJ
    • 発表場所
      Okinawa Convention Center, Ginowan, Okinawa
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Theoretical analysis of electronic asymmetry of the special pair in the photosynthetic reaction center : Effect of protein environment2006

    • 著者名/発表者名
      H., Yamasaki, Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      EABS &BSJ
    • 発表場所
      Okinawa Convention Center, Ginowan, Okinawa
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Protein function analyses from structural bioinformatics approach2006

    • 著者名/発表者名
      H., Nakamura
    • 学会等名
      EABS &BSJ
    • 発表場所
      Okinawa Convention Center, Ginowan, Okinawa
    • 年月日
      2006-11-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Quantum mechanical study of the proton transfer via a peptide bond in the novel pathway of proton translocation of cytochrome c oxidase2006

    • 著者名/発表者名
      Y., Takano, H., Nakamura
    • 学会等名
      EABS &BSJ
    • 発表場所
      Okinawa Convention Center, Ginowan, Okinawa
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] QM/MM study on catalytic mechanism of PPIase protein Pinl2006

    • 著者名/発表者名
      Y., Yonezawa, N., Kamiya, H., Nakamura
    • 学会等名
      EABS &BSJ
    • 発表場所
      Okinawa Convention Center, Ginowan, Okinawa
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Protein fhnction analyses from structural bioinformatics approach2006

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      EABS & BSJ 2006
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター沖縄県宜野湾市
    • 年月日
      2006-11-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Quantum mechanical study of the proton transfer via a peptide bond in the novel pathway of proton translocation of cytochrome c oxidase2006

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      EABS & BSJ 2006
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター沖縄県宜野湾市
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Large-scale molecular dynamics simulations with the pariwise electrostatic interaction method for protein-solvent systems2006

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, Haruki
    • 学会等名
      EABS & BSJ 2006
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター沖縄県宜野湾市
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーション解析のためのMulti-modal Dynamic Cross Correlation法の開発と応用

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太, 福田育夫, 中村春木
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      仙台国際センター
    • 年月日
      2014-10-02 – 2014-10-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [学会発表] Prediction of Protein-Protein Interactions: Structural Approaches

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 2nd HD Physiology International Symposium
    • 発表場所
      丸の内MY PLAZAホール(東京)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Dynamical Aspects of MAOA function : Membrane Attachment Facilitates Ligand Access

    • 著者名/発表者名
      R., Apostolov, Y., Yonezawa, H., Nakamura
    • 学会等名
      Perspective in Structural Biology of Membrane Proteins and Biological Macromolecules
    • 発表場所
      Osaka University, Osaka
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18370063
  • [学会発表] Towards quantitative analysis and prediction of protein-protein interactions

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      5th JCS (Japan, Czech, Slovakia) International Symposium on Theoretical Chemistry
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター(奈良市)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] A simple non-Ewald scheme for calculating electrostatic interactions of charged particle systems: the zero-dipole summation method and the application to molecular systems

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Takamasa Arakawa, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      2013年ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学 蔵前会館
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 蛋白質の二次構造形成に関わる相互作用に関する理論的研究

    • 著者名/発表者名
      鷹野優・中村春木
    • 学会等名
      文部科学省科学研究費新学術領域「コンピューティクスによる物質デザイン:複合相関と非平衡ダイナミクス」平成25年度第2回研究会
    • 発表場所
      東京大学 本郷キャンパス 工学部6号館
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] A new non-Ewald scheme: The zero-dipole summation method and its applications to molecular dynamics simulations for homogeneous and inhomogeneous biomolecular systems

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      National Symposium on Frontiers of Biophysics, Biotechnology & Bioinformatics and 37'th Annual Meeting of Indian Biophysical Society
    • 発表場所
      University of Mumbai, India
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] GPU-accelerated calculation of electrostatic interactions with zero-dipole summation method

    • 著者名/発表者名
      Tadaaki Mashimo, Yoshifumi Fukunishi, Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Yu Takano, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      2013年ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学 蔵前会館
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Molecular dynamics study on enhancer recognitions by cooperative binding of Ets1 and partner transcription factors

    • 著者名/発表者名
      Kota Kasahara, Ikuo Fukuda, and Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 4th Asia Pacific Protein Association Conference
    • 発表場所
      Jeju, Korea
    • 年月日
      2014-05-17 – 2014-05-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [学会発表] TCDD曝露したマダイ胚のトランスクリプトーム解析

    • 著者名/発表者名
      飯田 緑, 藤井 聡, 内田 雅也, 中村 浩, 鏡 良弘, Bak, Su-Min, 金 恩英, 島 康洋, 岩田久人
    • 学会等名
      日本内分泌撹乱化学物質学会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2013-12-12 – 2013-12-13
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] RNaseHIのRNA加水分解反応機構に関する計算科学的研究

    • 著者名/発表者名
      鷹野優・喜多真琴・中村春木
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館(鳥取市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] Computational Prediction and Analysis of Protein-Protein Interactions: Qualitative and Quantitative Approaches

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Special Seminar at Academia Sinica
    • 発表場所
      Academia Sinica, Shanghai
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Computational Protein Science: Structural Bioinformatics and Molecular Simulations

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      CDAST symposium
    • 発表場所
      Jember University, Indonesia
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] Prediction of protein-protein complex structures

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      International Conference on Biomolecular Forms and Functions
    • 発表場所
      Indian Institute of Science Bangalore, India
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] All-atomic molecular dynamics simulations of dynein motor domain in explicit water

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館(鳥取市)
    • 年月日
      2013-06-12 – 2013-06-14
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] SGDDによるGPCRに対する非ペプチド性アゴニストの開発

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第12回 プロテインモール関西情報交流セミナー
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター(大阪)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] 分子シミュレーションにおける新しい静電相互作用計算法の開発と応用

    • 著者名/発表者名
      福田育夫, Han Wang,中村春木
    • 学会等名
      日本物理学会第70回年次大会
    • 発表場所
      早稲田大学
    • 年月日
      2015-03-21 – 2015-03-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25390156
  • [学会発表] Gene Expression Changes Exposed to 2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD) in Early Developmental Stage Embryos of Red Seabream (Pagrus major)

    • 著者名/発表者名
      M. Iida, Y. Murakami, Y. Shima, H. Nakamura, Y. Kagami, S. Fujii, A. Srai, H. Iwata
    • 学会等名
      転写サイクル合同班会議
    • 発表場所
      ホテルおかだ(箱根湯本温泉)
    • 年月日
      2013-08-05 – 2013-08-07
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Transcriptome Analysis of Red Seabream (Pagrus major) Embryos Treated with 2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-Dioxin (TCDD)

    • 著者名/発表者名
      M. Iida, S. Fujii, M. Uchida, H. Nakamura, Y. Kagami, S.M. Bak, E.Y. Kim, Y. Shima, H. Iwata
    • 学会等名
      Society of Toxicology
    • 発表場所
      Phoenix Convention Center, Arizona, USA
    • 年月日
      2014-03-23 – 2014-03-27
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] A new non-Ewald scheme: The zero-dipole summation method and its applications to molecular dynamics simulations for homogeneous and inhomogeneous biomolecular systems

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      National Symposium on Frontiers of Biophysics, Biotechnology & Bioinformatics and 37'th Annual Meeting of Indian Biophysical Society
    • 発表場所
      University of Mumbai, India
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] All-atom molecular dynamics simulations of dynein motor domain in explicit water

    • 著者名/発表者名
      Narutoshi Kamiya, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Takahide Kon, Genji Kurisu, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      Protein Society the 27th Annual Symposium
    • 発表場所
      Boston Marriott, Copley Place, Boston, USA
    • 年月日
      2013-07-20 – 2013-07-23
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] リボヌクレアーゼHIの RNA加水分解反応機構に関する計算化学的研究

    • 著者名/発表者名
      鷹野優・喜多真琴・中村春木
    • 学会等名
      第7回分子科学討論会2013京都
    • 発表場所
      京都テルサ(京都市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] The zero-dipole summation method and its application to molecular simulation with homogenous and inhomogeneous systems

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Kota Kasahara, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      The 12th Asia Pacific Physics Conference (APPC12)
    • 発表場所
      幕張メッセ(千葉市) 大手町サンスカイルーム(東京)
    • 年月日
      2013-07-15 – 2013-07-16
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Prediction of protein-protein complex structures

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      International Conference on Biomolecular Forms and Functions
    • 発表場所
      Indian Institute of Science Bangalore, India
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] GPU-accelerated calculation of electrostatic interactions with zero-dipole summation method

    • 著者名/発表者名
      Tadaaki Mashimo, Yoshifumi Fukunishi, Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Yu Takano, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      2013年ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学 蔵前会館
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] ゲノム情報(1D)から蛋白質の動的構造情報(4D)へ

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      日本学術会議公開シンポジウム
    • 発表場所
      日本学術会議講堂(東京)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーション解析のためのMulti-modal Dynamic Cross Correlation法の開発と応用

    • 著者名/発表者名
      笠原浩太、福田育夫、中村春木
    • 学会等名
      第3回生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      仙台国際センター、仙台市
    • 年月日
      2014-10-02 – 2014-10-04
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] 二次構造形成に関する局所および非局所相互作用に関する計算化学的研究

    • 著者名/発表者名
      鷹野優・中村春木
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2013
    • 発表場所
      自然科学研究機構 岡崎コンファレンスセンター
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] Zero-dipole summation method for evaluating eletrostatic interaction in molecular simulation of biomolecular system.

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都市)
    • 年月日
      2013-10-28 – 2013-10-30
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] A simple non-Ewald scheme for calculating electrostatic interactions of charged particle systems: the zero-dipole summation method and the application to molecular systems

    • 著者名/発表者名
      Ikuo Fukuda1, Narutoshi Kamiya, Takamasa Arakawa, Tadaaki Mashimo, Yu Takano, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      2013年ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学 蔵前会館
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • [学会発表] 転写因子Ets1のDNA結合制御に関する分子シミュレーション研究

    • 著者名/発表者名
      笠原 浩太,福田 育夫,中村 春木
    • 学会等名
      冬の若手ワークショップ 2014
    • 発表場所
      舌切雀のお宿 磯部ガーデン(軽井沢東 磯部温泉)
    • 年月日
      2014-01-30 – 2014-02-01
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Quantum chemical study of intra- and inter-molecular interactions in secondary structures

    • 著者名/発表者名
      鷹野優・中村春木
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会
    • 発表場所
      京都国際会議場(京都市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] 生命科学における情報科学・計算科学

    • 著者名/発表者名
      中村春木
    • 学会等名
      第6回三大学連携シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学統合研究拠点
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Density functional study of local and nonlocal molecular interactions in secondary structure

    • 著者名/発表者名
      Yu Takano, Haruki Nakamura
    • 学会等名
      54th Sanibel Symposium
    • 発表場所
      The King and Prince Golf & Beach Resort, Georgia, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657103
  • [学会発表] New Approaches to Dynamic Properties of Proteins and their Applications to Drug Discover of GPCR.

    • 著者名/発表者名
      Haruki Nakamura
    • 学会等名
      CADD’13
    • 発表場所
      Bandung, Indonesia
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370071
  • []

  • 1.  中島 伸介 (60324852)
    共同の研究課題数: 7件
    共同の研究成果数: 0件
  • 2.  米澤 康滋 (40248753)
    共同の研究課題数: 5件
    共同の研究成果数: 13件
  • 3.  神谷 成敏 (80420462)
    共同の研究課題数: 5件
    共同の研究成果数: 36件
  • 4.  肥後 順一 (80265719)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 14件
  • 5.  鷹野 優 (30403017)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 56件
  • 6.  木下 賢吾 (60332293)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 21件
  • 7.  木寺 紹紀 (00186280)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  西村 善文 (70107390)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 3件
  • 9.  大島 勘二 (40437330)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  古川 功治 (00297631)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 2件
  • 11.  佐藤 衛 (60170784)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  柴田 武彦 (70087550)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 13.  太田 元規 (40290895)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  明石 知子 (10280728)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 15.  石野 良純 (30346837)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  藤井 義明 (00098146)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 17.  石川 冬木 (30184493)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 18.  森川 耿右 (80012665)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 19.  山口 兆 (80029537)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 20.  神谷 信夫 (60152865)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 21.  沈 建仁 (60261161)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 22.  奥村 光隆 (40356712)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 23.  山中 秀介 (10324865)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 24.  川上 貴資 (30321748)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 25.  北河 康隆 (60362612)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 26.  金城 玲 (30370117)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 6件
  • 27.  山口 雄輝 (50345360)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 28.  河野 秀俊 (40291918)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 29.  笠原 浩太 (90634965)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 18件
  • 30.  白川 昌宏 (00202119)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 31.  堀越 正美 (70242089)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 32.  藤田 尚志 (10156870)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 33.  片平 正人 (70211844)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 34.  小園 晴生 (80287482)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 35.  東 隆親 (00028234)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 36.  山崎 俊夫 (60273710)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 37.  南方 陽 (10107823)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 38.  西尾 卓広 (90172626)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 39.  福田 育夫 (40643185)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 10件
  • 40.  森次 圭 (80599506)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 41.  吉川 和明 (30094452)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 42.  長谷川 孝一 (20546783)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 43.  藤原 一志郎 (80638495)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 44.  望月 秀樹 (90230044)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 45.  郷 通子 (70037290)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 46.  美宅 成樹 (10107542)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 47.  西川 建 (10093288)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 48.  梅山 秀明 (20050619)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 49.  桑島 邦博 (70091444)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 50.  後藤 祐児 (40153770)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 51.  新井 宗仁 (90302801)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 52.  平田 文男 (90218785)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 53.  塩生 くらら (20403016)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 54.  十川 久美子 (20291073)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 55.  松本 直通 (80325638)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 56.  高橋 陽介 (90183855)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 57.  緒方 一博 (90260330)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 8件
  • 58.  伊藤 敬 (90306275)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 59.  藤井 聡 (40452825)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 60.  皿井 明倫 (20221286)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 61.  岡野 光治 (60010716)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 62.  松尾 浩 (60304052)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 63.  梅園 和彦 (50183752)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 64.  中川 敦史 (20188890)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 65.  石井 俊輔
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 7件
  • 66.  田中 亀代次
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 67.  広瀬 進
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 68.  塩見 春彦
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 69.  佐藤 文俊
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 70.  飯田 緑
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 8件
  • 71.  小嶋 雅晴
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 72.  有國 尚
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 73.  中井 孝尚
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 74.  守川 壮一
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 75.  山本 英夫
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 76.  高田 俊和
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 77.  水島 寛人
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 78.  鈴木 博文
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 79.  椎名 政昭
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 80.  上野 真治
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 81.  中村 和幸
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 82.  目加田 英輔
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 83.  川端 猛
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 84.  近藤 峰生
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 85.  寺崎 浩子
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 86.  高野 光則
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 87.  長土居 有隆
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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