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黒川 顕  Kurokawa Ken

ORCIDORCID連携する *注記
… 別表記

黒川 ケン  KUROKAWA Ken

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研究者番号 20343246
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2021年度 – 2024年度: 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授
2018年度 – 2019年度: 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授
2016年度 – 2018年度: 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授
2014年度 – 2015年度: 東京工業大学, 学内共同利用施設等, 教授
2013年度 – 2015年度: 東京工業大学, 地球生命研究所, 教授 … もっと見る
2014年度: 東京工業大学, 地球生命研究所, 准教授
2012年度 – 2013年度: 東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授
2009年度 – 2012年度: 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授
2011年度: 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究所, 教授
2008年度 – 2010年度: 東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授
2007年度: 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 准教授
2004年度 – 2006年度: 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助教授
2005年度: 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究所, 助教授
2002年度 – 2003年度: 大阪大学, 微生物病研究所, 助手 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
理工系 / 生物系 / ゲノム生物学 / 基礎ゲノム科学 / 細菌学(含真菌学)
研究代表者以外
基礎ゲノム科学 / 形態系基礎歯科学 / 細菌学(含真菌学) / 植物栄養学・土壌学 / 理工系 / 環境農学(含ランドスケープ科学) / 環境農学 / 生物系
キーワード
研究代表者
ゲノム / 惑星起源・進化 / 生命起源 / 化学進化 / 原始地球 / 地球起源 / バイオインフォマティクス / 自己組織化地図法 / 比較ゲノム / スーパーコンピュータ … もっと見る / 空間的オミックス解析 / エピゲノム / RNA解析 / ゲノム・メタゲノム / 次世代シーケンサー / シングルセル解析 / オミックス解析 / メタゲノム / 核様体 / ゲノム構造多様性 / 微生物ゲノム / SOM / エフェクター蛋白質 / III型分泌装置 / エフェクター / 3型分泌装置 / 病原性データベース / CodonViewer / ゲノム構造 / コドン使用頻度 … もっと見る
研究代表者以外
メタゲノム / 細菌 / ゲノム / メタゲノム解析 / 腸内細菌叢 / 分解酵素遺伝子 / 環境汚染 / リシーケンシング / 次世代DNAシーケンサー / 進化 / 各プラットフォーム間の連携 / 先進ゲノム解析研究推進 / 先端モデル動物支援 / 先端バイオイメージング支援 / コホート・生体試料支援 / 生命科学連携推進協議会 / ゲノムアノテーション / ゲノム多型 / ゲノムアッセンブル / スーパーコンピューター / 1細胞解析 / RNA-Seq / エピゲノム / 新規ゲノム配列決定 / 腸管免疫 / IgA抗体 / 腸内細菌 / 抗体 / 粘膜免疫 / 土壌学 / 土壌微生物 / 鉄還元菌 / デルタプロテオバクテリア / 窒素固定反応 / DNRA反応 / 脱窒反応 / 脱窒 / DNRA / 窒素固定 / メタン生成・消去 / メタトランスクリプトーム解析 / 水田土壌 / Unculturable bacteria / Metagenome / Genome / Gut microbiota / Genetics / 難培養性 / 難培養性細菌 / 遺伝学 / 独立栄養微生物 / 難培養微生物 / ゲノムインフォマティックス / 原始地球 / 人工生命体 / 初期エネルギー代謝 / 難培養性微生物 / 化学進化 / ゲノム解析 / ミニマムゲノム / 微生物初期進化 / 共生 / アルカリ環境 / 古細菌 / 原始生命体 / 生命進化 / 特殊環境微生物 / ATPase / 人工生命系 / Wood-Ljungdahl 経路 / エネルギー代謝 / OD1 / 原始エネルギー代謝 / 嫌気性微生物 / 未知未培養微生物 / 蛇紋岩熱水系 / 生命の誕生場 / 生命の起源 / 冥王代 / 外来因子 / 細菌叢解析 / 微生物生態学 / CRISPR / バクテリオファージ / 細菌集団 / 環境汚染物質分解 / 高速シーケンサー / 細菌ゲノム / 口腔細菌叢 / 恒常性 / 新型シーケンサー / 細菌叢 / 次世代DNAシーケンサ / インフォームドコンセント / GWAS / 個人ゲノム / de novo配列決定 / ChIP-seq / RNA-seq / 感染症 / 微生物 / ChIP-seq解析 / ChIP-chip解析 / 転写制御システム / 病原性大腸菌 / 大腸菌 / 転写ネットワーク / Zur / H-NS / Fur / ChAP-chip / 転写制御ネットワーク / ChIP-chip / ゲノム進化・再編 / 発現制御 / 発現解析 / 遺伝子 / モデル化 隠す
  • 研究課題

    (24件)
  • 研究成果

    (195件)
  • 共同研究者

    (158人)
  •  生命科学連携推進協議会

    • 研究代表者
      武川 睦寛
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2027
    • 研究種目
      学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成)
    • 研究機関
      東京大学
  •  先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム研究代表者

    • 研究代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2027
    • 研究種目
      学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成)
    • 研究機関
      国立遺伝学研究所
  •  専門書「冥王代生命学」の出版研究代表者

    • 研究代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2019
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      国立遺伝学研究所
  •  先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

    • 研究代表者
      小原 雄治
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2021
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)『学術研究支援基盤形成』
    • 研究機関
      国立遺伝学研究所
  •  冥王代生命学の国際研究ネットワーク展開研究代表者

    • 研究代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2019
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      国立遺伝学研究所
      東京工業大学
  •  腸管IgA抗体による腸内細菌選別機構の解明

    • 研究代表者
      新藏 礼子
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2017
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      細菌学(含真菌学)
    • 研究機関
      東京大学
      奈良先端科学技術大学院大学
      長浜バイオ大学
  •  冥王代類似環境微生物

    • 研究代表者
      鎌形 洋一
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2018
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
  •  冥王代生命学の創成領域代表者

    • 領域代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2018
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
  •  冥王代生命学の創成研究代表者

    • 研究代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2018
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      国立遺伝学研究所
      東京工業大学
  •  芳香族系汚染物質添加環境での微生物集団応答様式の包括的研究

    • 研究代表者
      津田 雅孝
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      環境農学(含ランドスケープ科学)
    • 研究機関
      東北大学
  •  ヒト第二のゲノムである常在細菌叢の「記憶」と「老化」の制御と再構築

    • 研究代表者
      丸山 史人
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2014
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      形態系基礎歯科学
    • 研究機関
      京都大学
      東京医科歯科大学
  •  水田メタゲノミクス:持続的生産を支える土壌-根圏微生物とその機能の全貌解明

    • 研究代表者
      妹尾 啓史
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      植物栄養学・土壌学
    • 研究機関
      東京大学
  •  核様体タンパク質結合部位解析に基づく染色体多様化機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2013
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      ゲノム生物学
    • 研究機関
      東京工業大学
  •  ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援

    • 研究代表者
      小原 雄治
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2015
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 研究機関
      国立遺伝学研究所
  •  環境汚染物質添加土壌での微生物集団応答様式の研究

    • 研究代表者
      津田 雅孝
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2012
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      環境農学
    • 研究機関
      東北大学
  •  高解像度細菌叢解析による口腔微生物環境の恒常性維持メカニズムの解明

    • 研究代表者
      丸山 史人
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2012
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      形態系基礎歯科学
    • 研究機関
      東京医科歯科大学
  •  ChIP-chipによる3種の大腸菌を用いた転写因子結合部位の多様性の解析

    • 研究代表者
      小笠原 直毅
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2010
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      基礎ゲノム科学
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  新世代DNA塩基配列決定技術を用いた大腸菌pan-genomeの解明

    • 研究代表者
      林 哲也
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2010
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      基礎ゲノム科学
    • 研究機関
      宮崎大学
  •  腸管の粘膜表層に常在する細菌群のゲノム解析

    • 研究代表者
      林 哲也
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      基礎ゲノム科学
    • 研究機関
      宮崎大学
  •  共生、相互作用など複雑なゲノム構成系を解析するための情報基盤研究

    • 研究代表者
      久原 哲
    • 研究期間 (年度)
      2005 – 2009
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州大学
  •  病原細菌におけるIII型分泌装置のエフェクター蛋白質の情報解析的予測研究代表者

    • 研究代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2005 – 2006
    • 研究種目
      若手研究(A)
    • 研究分野
      基礎ゲノム科学
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  病原遺伝子データベースの構築およびゲノム全遺伝子の相互比較による相関解析研究代表者

    • 研究代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2004
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  病原性データベースの構築およびゲノム全遺伝子の相互比較による相関解析研究代表者

    • 研究代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2003
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  大腸菌O157の病原遺伝子発現における外来性tRNA遺伝子の役割研究代表者

    • 研究代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2002 – 2003
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      細菌学(含真菌学)
    • 研究機関
      大阪大学

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すべて 雑誌論文 学会発表 図書 産業財産権

  • [図書] よくわかるバイオインフォマティクス入門2018

    • 著者名/発表者名
      黒川顕, 森宙史, 東光一
    • ページ
      123-136
    • 総ページ数
      208
    • 出版者
      講談社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [図書] 微生物統合データベースによる微生物と環境の研究への貢献, 難培養微生物研究の最新技術 III―微生物の生き様に迫り課題解決へ―2015

    • 著者名/発表者名
      森宙史、東光一、山田拓司、黒川顕
    • 総ページ数
      216
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [図書] メタゲノム解析技術の最前線2010

    • 著者名/発表者名
      森宙史, 丸山史人, 黒川顕
    • 総ページ数
      231
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [図書] メタゲノムデータベース,メタゲノム解析技術の最前線2010

    • 著者名/発表者名
      森宙史,丸山史人,黒川顕
    • 出版者
      シーエムシー出版,東京.
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [図書] 難培養微生物研究の最新技術II2010

    • 著者名/発表者名
      森宙史, 丸山史人, 黒川顕
    • 総ページ数
      287
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [図書] 難培養微生物研究の最新技術II2010

    • 著者名/発表者名
      森宙史, 丸山史人, 黒川顕
    • 総ページ数
      287
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [図書] 難培養微生物研究の最新技術II-ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望-2010

    • 著者名/発表者名
      森宙史, 丸山史人, 黒川顕
    • 総ページ数
      287
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [図書] メタゲノムインフォマティクス,難培養微生物研究の最新技術II2010

    • 著者名/発表者名
      森宙史,丸山史人,黒川顕
    • 出版者
      シーエムシー出版,東京.
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [図書] 第8章メタゲノムインフォマティクス.難培養微生物研究の最新技術 II - ゲノ ム解析を中心とした最前線と将来展望- Current Technology and Perspectives for Yet-uncultivated Microbial Resources2010

    • 著者名/発表者名
      森宙史、丸山史人、黒川顕
    • 出版者
      CMC 出版,東京
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22592032
  • [図書] メタゲノム解析技術の最前線2010

    • 著者名/発表者名
      森宙史, 丸山史人, 黒川顕
    • 総ページ数
      231
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [図書] 第2章メタゲノムデータベース. メタゲノム解析技術の最前線. Metagenomics:a new frontier of bacterial community researches2010

    • 著者名/発表者名
      森宙史、丸山史人、*黒川顕
    • 出版者
      CMC 出版,東京
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22592032
  • [図書] 実験医学4月増刊号「バイオデータベースとソフトウェア最前線」2008

    • 著者名/発表者名
      黒川顕, 他
    • 総ページ数
      225
    • 出版者
      羊土社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [図書] 実験医学4月増刊号「バイオインフォマティクスツールの開発と生命研究への応用の最前線」2008

    • 著者名/発表者名
      黒川顕、服部正平
    • 総ページ数
      226
    • 出版者
      羊土社,東京
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [図書] 細胞工学別冊「比較ゲノム学から読み解く生命システム」2007

    • 著者名/発表者名
      黒川 顕, 服部 正平
    • 出版者
      秀潤社,東京
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [図書] バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法(改訂第2版)2007

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 総ページ数
      254
    • 出版者
      羊土社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [図書] バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法(改訂第2版)2007

    • 著者名/発表者名
      黒川 顕
    • 出版者
      羊土社
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [図書] 細胞工学 別冊「比較ゲノム学から読み解く生命システム」2007

    • 著者名/発表者名
      黒川顕、服部正平
    • 総ページ数
      196
    • 出版者
      秀潤社,東京
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [図書] 実験医学4月増刊号「バイオインフォマティクスツールの開発と生命研究への応用の最前線」2007

    • 著者名/発表者名
      黒川 顕, 服部 正平
    • 出版者
      羊土社,東京
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [図書] The Biology of Vibrios2006

    • 著者名/発表者名
      T. Iida, K. Kurokawa
    • 出版者
      ASM Press.Washington,D.C.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [図書] The Biology of Vibrios. (ASM Press)2006

    • 著者名/発表者名
      T.Iida, K.Kurokawa
    • 出版者
      Comparative genomics : the genome configuration and the driving forces in the evolution of vibrios.
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [図書] Biology of Vibrios2006

    • 著者名/発表者名
      Iida, T., Kurokawa, K.
    • 出版者
      ASM press
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17681024
  • [図書] 微生物はなぜ病気を起こすか.ゲノムの特徴2004

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 総ページ数
      206
    • 出版者
      林英生
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16013230
  • [雑誌論文] Chromatin organization and behavior in HRAS-transformed mouse fibroblasts2024

    • 著者名/発表者名
      A. Otsuka, K. Minami, K. Higashi, A. Kawaguchi, S. Tamura, S. Ide, M.J. Hendzel, K. Kurokawa, and K. Maeshima
    • 雑誌名

      Chromosoma

      巻: - 号: 2 ページ: 14-14

    • DOI

      10.1007/s00412-024-00817-x

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KJ0998, KAKENHI-PROJECT-23K05798, KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [雑誌論文] Metagenomic Thermometer2023

    • 著者名/発表者名
      Masaomi Kurokawa、Koichi Higashi、Keisuke Yoshida、Tomohiko Sato、Shigenori Maruyama、Hiroshi Mori、Ken Kurokawa
    • 雑誌名

      DNA Research

      巻: 30(6) 号: 6

    • DOI

      10.1093/dnares/dsad024

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [雑誌論文] Transcriptome profile of subsynaptic myonuclei at the neuromuscular junction in embryogenesis2023

    • 著者名/発表者名
      Bisei Ohkawara、Masaomi Kurokawa、Akinori Kanai、Kiyomi Imamura、Guiying Chen、Ruchen Zhang、Akio Masuda、Koichi Higashi、Hiroshi Mori、Yutaka Suzuki、Ken Kurokawa、Kinji Ohno
    • 雑誌名

      Journal of Neurochemistry

      巻: 168 号: 4 ページ: 342-354

    • DOI

      10.1111/jnc.16013

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [雑誌論文] Further notice of omics profiles of fecal and oral microbiota change in irritable bowel syndrome patients with diarrhea and symptom exacerbation2023

    • 著者名/発表者名
      Yukari Tanaka、Riu Yamashita、Junko Kawashima、Hiroshi Mori、Ken Kurokawa、Shinji Fukuda、Yasuhiro Gotoh、Keiji Nakamura、Tetsuya Hayashi、Yoshiyuki Kasahara、Yukuto Sato、Shin Fukudo
    • 雑誌名

      Journal of Gastroenterology

      巻: 58 号: 4 ページ: 427-428

    • DOI

      10.1007/s00535-022-01951-y

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [雑誌論文] Condensed but liquid-like domain organization of active chromatin regions in living human cells2023

    • 著者名/発表者名
      Nozaki Tadasu、Shinkai Soya、Ide Satoru、Higashi Koichi、Tamura Sachiko、Shimazoe Masa A.、Nakagawa Masaki、Suzuki Yutaka、Okada Yasushi、Sasai Masaki、Onami Shuichi、Kurokawa Ken、Iida Shiori、Maeshima Kazuhiro
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 9 号: 14 ページ: 1-19

    • DOI

      10.1126/sciadv.adf1488

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05763, KAKENHI-PROJECT-23K21326, KAKENHI-PROJECT-23KJ0996, KAKENHI-PUBLICLY-23H04297, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-22H00406
  • [雑誌論文] Omics profiles of fecal and oral microbiota change in irritable bowel syndrome patients with diarrhea and symptom exacerbation2022

    • 著者名/発表者名
      Yukari Tanaka、Riu Yamashita、Junko Kawashima、Hiroshi Mori、Ken Kurokawa、Shinji Fukuda、Yasuhiro Gotoh、Keiji Nakamura、Tetsuya Hayashi、Yoshiyuki Kasahara、Yukuto Sato、Shin Fukudo
    • 雑誌名

      Journal of Gastroenterology

      巻: 57 号: 10 ページ: 748-760

    • DOI

      10.1007/s00535-022-01888-2

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [雑誌論文] PZLAST : an ultra-fast sequence similarity search tool implemented on a MIMD processor2021

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Ishikawa, Hiroshi Mori, Koichi Higashi, Yoshiaki Kato, Tomofumi Sakai, Toshikazu Ebisuzaki, Ken Kurokawa
    • 雑誌名

      2021 Ninth International Symposium on Computing and Networking (CANDAR)

      ページ: 102-107

    • DOI

      10.1109/candar53791.2021.00021

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] Aberrant mucosal immunoreaction to tonsillar microbiota in immunoglobulin A nephropathy2021

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Yamaguchi, Shin Goto, Nao Takahashi, Masafumi Tsuchida, Hirofumi Watanabe, Suguru Yamamoto, Yoshikatsu Kaneko, Koichi Higashi, Hiroshi Mori, Yukio Nakamura, Arata Horii, Ken Kurokawa, Ichiei Narita
    • 雑誌名

      Nephrol Dial Transplant.

      巻: 36 号: 1 ページ: 75-86

    • DOI

      10.1093/ndt/gfaa223

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K09372, KAKENHI-PROJECT-20K08628, KAKENHI-PROJECT-18K08234, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-19H03674
  • [雑誌論文] PZLAST : an ultra-fast amino acid sequence similarity search server against public metagenomes2021

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Mori, Hitoshi Ishikawa, Koichi Higashi, Yoshiaki Kato, Toshikazu Ebisuzaki, Ken Kurokawa
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 37 号: 21 ページ: 3944-3946

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btab492

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] Leaf Bleaching in Rice: A New Disease in Vietnam Caused by <i>Methylobacterium indicum</i>, Its Genomic Characterization and the Development of a Suitable Detection Technique2021

    • 著者名/発表者名
      Lai Khoa、Nguyen Ngoc Thai、Yasuda Michiko、Dastogeer Khondoker M.G.、Toyoda Atsushi、Higashi Koichi、Kurokawa Ken、Nguyen Nga Thi Thu、Komatsu Ken、Okazaki Shin
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 36 号: 4 ページ: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME21035

    • NAID

      130008113077

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20J40199, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] RNA-binding motifs of hnRNP K are critical for induction of antibody diversification by activation-induced cytidine deaminase2020

    • 著者名/発表者名
      Ziwei Yin, iMaki Kobayashi, Wenjun Hu, Koichi Higashi, Nasim A Begum, Ken Kurokawa, Tasuku Honjo
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      巻: in press 号: 21 ページ: 11624-11635

    • DOI

      10.1073/pnas.1921115117

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06485, KAKENHI-PROJECT-19H01027, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] Metagenomic and metabolomic analyses reveal distinct stage-specific phenotypes of the gut microbiota in colorectal cancer2019

    • 著者名/発表者名
      Yachida Shinichi、Mizutani Sayaka、Shiroma Hirotsugu、Shiba Satoshi、Nakajima Takeshi、Sakamoto Taku、Saito Yutaka、Fukuda Shinji、Shibata Tatsuhiro、Yamada Takuji
    • 雑誌名

      Nature Medicine

      巻: 25 号: 6 ページ: 968-976

    • DOI

      10.1038/s41591-019-0458-7

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K08416, KAKENHI-PROJECT-18K15800, KAKENHI-PUBLICLY-18H04805, KAKENHI-PROJECT-16H06373, KAKENHI-PROJECT-19J40249, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] Arsenate and microbial dynamics in different phosphorus regimes of the subtropical Pacific Ocean2019

    • 著者名/発表者名
      Hashihama Fuminori、Suwa Shuhei、Kanda Jota、Ehama Makoto、Sakuraba Ryousuke、Kinouchi Shinko、Sato Mitsuhide、Yamaguchi Tamaha、Saito Hiroaki、Ogura Yoshitoshi、Hayashi Tetsuya、Mori Hiroshi、Kurokawa Ken、Suzuki Shotaro、Hamasaki Koji
    • 雑誌名

      Progress in Oceanography

      巻: 176 ページ: 102115-102115

    • DOI

      10.1016/j.pocean.2019.05.007

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02562, KAKENHI-PROJECT-15H02802, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] Local structural changes of the influenza A virus ribonucleoprotein complex by single mutations in the specific residues involved in efficient genome packaging.2019

    • 著者名/発表者名
      Takizawa N, Ogura Y, Fujita Y, Noda T, Shigematsu H, Hayashi T, Kurokawa K
    • 雑誌名

      Virology

      巻: 531 ページ: 126-140

    • DOI

      10.1016/j.virol.2019.03.004

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-18K06172, KAKENHI-PROJECT-19K07598, KAKENHI-PROJECT-19K22529, KAKENHI-PROJECT-17H04082
  • [雑誌論文] Essential cellular modules for the proliferation of the primitive cell2018

    • 著者名/発表者名
      Higashi Koichi、Kawai Yoshikazu、Baba Tomoya、Kurokawa Ken、Oshima Taku
    • 雑誌名

      Geoscience Frontiers

      巻: 9 号: 4 ページ: 1155-1161

    • DOI

      10.1016/j.gsf.2016.11.013

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-26106004
  • [雑誌論文] VITCOMIC2: Visualization tool for the phylogenetic composition of microbial communities based on 16S rRNA gene amplicons and metagenomic shotgun sequencing.2018

    • 著者名/発表者名
      Mori H, Maruyama T, Yano M, Yamada T, Kurokawa K
    • 雑誌名

      BMC Syst. Biol.

      巻: 12 号: S2 ページ: 30-30

    • DOI

      10.1186/s12918-018-0545-2

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-26106004, KAKENHI-PROJECT-17H01854, KAKENHI-PROJECT-15K07214, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] Latent environment allocation of microbial community data2018

    • 著者名/発表者名
      Higashi K, Suzuki S, Kurosawa S, Mori H, Kurokawa K.
    • 雑誌名

      PLoS Comput Biol.

      巻: 14 号: 6 ページ: e1006143-e1006143

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1006143

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H04139, KAKENHI-PROJECT-17H01854, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of the Nonheterocystous Cyanobacterium Pseudanabaena sp. ABRG5-32018

    • 著者名/発表者名
      Tajima Naoyuki、Kanesaki Yu、Sato Shusei、Yoshikawa Hirofumi、Maruyama Fumito、Kurokawa Ken、Ohta Hiroyuki、Nishizawa Tomoyasu、Asayama Munehiko、Sato Naoki
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 6 号: 6

    • DOI

      10.1128/genomea.01608-17

    • NAID

      120006457123

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-26106004, KAKENHI-PROJECT-16H01782, KAKENHI-PROJECT-17H03715, KAKENHI-PROJECT-15K07368, KAKENHI-PROJECT-15K07557
  • [雑誌論文] Phylogenomics and morphology of extinct paleognaths reveal the origin and evolution of the ratites2017

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Yonezawa, Takahiro Segawa, Hiroshi Mori, Paula F. Campos, Yuichi Hongoh et al.,
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 27 号: 1 ページ: 68-77

    • DOI

      10.1016/j.cub.2016.10.029

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26281017, KAKENHI-PROJECT-16K15057, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-15H03262, KAKENHI-PROJECT-16H01824, KAKENHI-PROJECT-16H02788
  • [雑誌論文] Differently localized lysophosphatidic acid acyltransferases crucial for triacylglycerol biosynthesis in the oleaginous alga Nannochloropsis2017

    • 著者名/発表者名
      Nobusawa Takashi、Hori Koichi、Mori Hiroshi、Kurokawa Ken、Ohta Hiroyuki
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 90 号: 3 ページ: 547-559

    • DOI

      10.1111/tpj.13512

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-26106004
  • [雑誌論文] Comprehensive microbiome analysis of tonsillar crypts in IgA nephropathy2017

    • 著者名/発表者名
      Watanabe H, Goto S, Mori H, Higashi K, Hosomichi K, Aizawa N, Takahashi N, Tsuchida M, Suzuki Y, Yamada T, Horii A, Inoue I, Kurokawa K, Narita I.
    • 雑誌名

      Nephrol Dial Transplant

      巻: in press ページ: 2072-2079

    • DOI

      10.1093/ndt/gfw343

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26293201, KAKENHI-PROJECT-26670429, KAKENHI-PROJECT-15K09250, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-15H02373
  • [雑誌論文] Intestinal IgA as a modulator of the gut microbiota.2017

    • 著者名/発表者名
      Okai S, Usui F, Ohta M, Mori H, Kurokawa K, Matsumoto S, Kato T, Miyauchi E, Ohno H, Shinkura R.
    • 雑誌名

      Gut Microbes

      巻: - 号: 5 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1080/19490976.2017.1310357

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04732, KAKENHI-PROJECT-16K18711
  • [雑誌論文] High-affinity monoclonal IgA regulates gut microbiota and prevents colitis in mice.2016

    • 著者名/発表者名
      Okai S, Usui F, Yokota S, Hori-I Y, Hasegawa M, Nakamura T, Kurosawa M, Okada S, Yamamoto K, Nishiyama E, Mori H, Yamada T, Kurokawa K, Matsumoto S, Nanno M, Naito T, Watanabe Y, Kato T, Miyauchi E, Ohno H, Shinkura R.
    • 雑誌名

      Nature Microbiology

      巻: 1 号: 9 ページ: 16103-16103

    • DOI

      10.1038/nmicrobiol.2016.103

    • NAID

      120005818448

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25112006, KAKENHI-PLANNED-26106004, KAKENHI-PROJECT-15H04732, KAKENHI-PROJECT-16H05207, KAKENHI-PROJECT-16J11295, KAKENHI-PROJECT-16K18711, KAKENHI-ORGANIZER-25112001
  • [雑誌論文] H-NS Facilitates Sequence Diversification of Horizontally Transferred DNAs during Their Integration in Host Chromosomes2016

    • 著者名/発表者名
      Higashi K., Tobe T., Kanai A., Uyar E., Ishikawa S., Suzuki Y., Ogasawara N., Kurokawa K., and Oshima T
    • 雑誌名

      PLoS genetics

      巻: 12 号: 1 ページ: e1005796-e1005796

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1005796

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26450090, KAKENHI-PROJECT-15K16125, KAKENHI-PLANNED-26106004, KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [雑誌論文] A key genetic factor for fucosyllactose utilization affects infant gut microbiota development2016

    • 著者名/発表者名
      Matsuki T, Yahagi K, Mori H, Matsumoto H, Hara T, Tajima S, Ogawa E, Kodama H, Yamamoto K, Yamada T, Matsumoto S, Kurokawa K
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 7 号: 1 ページ: 11939-11939

    • DOI

      10.1038/ncomms11939

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-26106004
  • [雑誌論文] Ecophysiology of Thioploca ingrica as revealed by the complete genome sequence supplemented with proteomic evidence2015

    • 著者名/発表者名
      Kojima H, Ogura Y, Yamamoto N, Togashi T, Mori H, Watanabe T, Nemoto F, Kurokawa K, Hayashi T, Fukui M.
    • 雑誌名

      ISME Journal

      巻: in press 号: 5 ページ: 1166-1176

    • DOI

      10.1038/ismej.2014.209

    • NAID

      120005667717

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] 冥王代生命学の創成2015

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 雑誌名

      Japan Geoscience Letters

      巻: 11(3) ページ: 5-7

    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-26106001
  • [雑誌論文] DomSign: a top-down annotation pipeline to enlarge enzyme space in the protein universe.2015

    • 著者名/発表者名
      Wang T, Mori H, Zhang C, Kurokawa K, Xing X, Yamada T
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 16 号: 1 ページ: 96-96

    • DOI

      10.1186/s12859-015-0499-y

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770015, KAKENHI-PUBLICLY-25108708, KAKENHI-PROJECT-25710016, KAKENHI-PROJECT-26670717, KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PLANNED-26106004
  • [雑誌論文] FuncTree: Functional Analysis and Visualization for Large-Scale Omics Data.2015

    • 著者名/発表者名
      Uchiyama T, Irie M, Mori H, Kurokawa K, Yamada T.
    • 雑誌名

      PLoS One.

      巻: 10 号: 5 ページ: e0126967-e0126967

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0126967

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26670717, KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PLANNED-26106004, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-25710016
  • [雑誌論文] Time-series metagenomic analysis reveals robustness of soil microbiome against chemical disturbance.2015

    • 著者名/発表者名
      Kato H, Mori H, Maruyama F, Toyoda A, Oshima K, Endo R, Fuchu G, Miyakoshi M, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Hattori M, Fujiyama A, Kurokawa K, Tsuda M
    • 雑誌名

      DNA Research

      巻: 22 号: 6 ページ: 413-424

    • DOI

      10.1093/dnares/dsv023

    • NAID

      120005850199

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [雑誌論文] Identification of a gene cluster responsible for hydrogen evolution in Vibrio tritonius strain AM2 with transcriptional analyses.2015

    • 著者名/発表者名
      Yuta Matsumura, Hidayu Al-saari, Sayaka Mino, Satoshi Nakagawa, Fumito Maruyama, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Ken Kurokawa, Toko Sawabe, Tomoo Sawabe.
    • 雑誌名

      Int. J. Hydrogen Energy

      巻: 40 ページ: 9137-9146

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of a phenanthrene degrader, Mycobacterium sp. strain EPa45 (NBRC 110737), isolated from a phenanthrene-degrading consortium.2015

    • 著者名/発表者名
      Kato H, Ogawa N, Ohtsubo Y, Oshima K, Toyoda A, Mori H, Nagata Y, Kurokawa K, Hattori M, Fujiyama A, Tsuda M
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 3 号: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00782-15

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [雑誌論文] Origin of methane in serpentinite-hosted hydrothermal systems: The CH4-H2-H2O hydrogen isotope systematics of the Hakuba Happo hot spring2014

    • 著者名/発表者名
      Suda, K., Ueno, Y., Yoshizaki, M., Nakamura, H., Kurokawa, K., Nishiyama, E., Yoshino, K., Hongoh, Y., Kawachi, K., Omori, S., Yamada, K., Yoshida, N., Maruyama, S.
    • 雑誌名

      Earth and Planetary Science Letters

      巻: 386 ページ: 112-125

    • DOI

      10.1016/j.epsl.2013.11.001

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21109004, KAKENHI-PLANNED-21109006, KAKENHI-PROJECT-23224013, KAKENHI-PROJECT-23244084, KAKENHI-PROJECT-25400524, KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PLANNED-26106002
  • [雑誌論文] A novel small regulatory RNA enhances cell motility in enterohemorrhagic <i>Escherichia coli</i>2014

    • 著者名/発表者名
      Sudo N, Soma A, Muto A, Iyoda S, Suh M, Kurihara N, Abe H, Tobe T, Ogura Y, Hayashi T, Kurokawa K,Ohinishi M, Sekine Y
    • 雑誌名

      The Journal of General and Applied Microbiology

      巻: 60 号: 1 ページ: 44-50

    • DOI

      10.2323/jgam.60.44

    • NAID

      130004802264

    • ISSN
      0022-1260, 1349-8037
    • 言語
      英語
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23310131, KAKENHI-PROJECT-26460525, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] Analysis of the complete plastid genome of the unicellular red alga Porphyridium purpureum2014

    • 著者名/発表者名
      Tajima N, Sato S,Maruyama F,Kurokawa K,Ohta H, Tabata S, Sekine K, Moriyama T, Sato N
    • 雑誌名

      J Plant Res

      巻: 127 号: 3 ページ: 389-397

    • DOI

      10.1007/s10265-014-0627-1

    • NAID

      40020051727

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23310131, KAKENHI-PROJECT-25870155, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] 生命誕生場の謎に挑む冥王代生命学の創成2014

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 32(16) ページ: 2656-2656

    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-26106001
  • [雑誌論文] ヒトメタゲノムの大規模コホート研究2014

    • 著者名/発表者名
      森宙史,山田拓司,黒川顕
    • 雑誌名

      生物の科学「遺伝」

      巻: 67(3) ページ: 279-282

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] Klebsormidium flaccidum genome reveals primary factors for plant terrestrial adaptation.2014

    • 著者名/発表者名
      Hori, Koichi, et al.
    • 雑誌名

      Nature communications

      巻: 5 号: 1 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1038/ncomms4978

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-14J12093, KAKENHI-PROJECT-24570042, KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [雑誌論文] CLAST: CUDA implemented large-scale alignment search tool.2014

    • 著者名/発表者名
      Yano M, Mori H, Akiyama Y, Yamada T, Kurokawa K
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 15 号: 1 ページ: 406-406

    • DOI

      10.1186/s12859-014-0406-y

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770015, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PLANNED-26106004, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] Updating the Vibrio clades defined by multilocus sequence phylogeny : Proposal of eight new clades, and the description of Vibrio tritonius sp. Nov.2013

    • 著者名/発表者名
      Sawabe T, Ogura Y, Matsumura Y, Gao F, Amin A, Mino S, Nakagawa S, Sawabe T, Kumar R, Fukui Y, Satomi M, Matsushima R,Thompson F, Gomez -Gil B, Christen R,Maruyama F,Kurokawa K, Hayashi T
    • 雑誌名

      Frontiers in Aquatic Microbiol

      巻: 4 ページ: 1-14

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23310131
  • [雑誌論文] Updating the vibrio phylogeny defined by multilocus sequence phylogeny2013

    • 著者名/発表者名
      T. Sawabe, Y. Ogura, Y. Matsumura et al.
    • 雑誌名

      Front. Microbiol.

      巻: 4 ページ: 414-414

    • DOI

      10.3389/fmicb.2013.00414

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292122, KAKENHI-PROJECT-25305013, KAKENHI-PROJECT-23310131
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of Propionibacterium acnes isolate from sarcoidosis patient2013

    • 著者名/発表者名
      K. Minegishi, C. Aikawa, A.Furukawa, T. Watanabe, T. Nakano, Y. Ogura, Y. Ohtsubo, K. Kurokawa, T. Hayashi, F. Maruyama, I. Nakagawa,Y. Eishi
    • 雑誌名

      Genome Announc

      巻: 1

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22592032
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of a Propionibacterium acnes isolate from a sarcoidosis patient.2013

    • 著者名/発表者名
      Minegishi K, Aikawa C, Furukawa A, Watanabe T, Nakano T, Ogura Y, Ohtsubo Y, Kurokawa K, Hayashi T, Maruyama F, Nakagawa I, Eishi Y
    • 雑誌名

      Genome Announcement

      巻: 1 号: 1 ページ: 16-12

    • DOI

      10.1128/genomea.00016-12

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12J05796, KAKENHI-PROJECT-12J06919, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23310131, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23790478, KAKENHI-PROJECT-24659402, KAKENHI-PUBLICLY-25125708, KAKENHI-PROJECT-25293370, KAKENHI-PROJECT-25305013, KAKENHI-PROJECT-25670775, KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PUBLICLY-23125511
  • [雑誌論文] Updating the Vibrio clades defined by multilocus sequence phylogeny: Proposal of eight new clades, and the description of Vibrio tritonius sp. nov.2013

    • 著者名/発表者名
      Sawabe T, Ogura Y, Matsumura Y, Gao F, Amin A, Mino S, Nakagawa S, Sawabe T, Kumar R, Fukui Y, Satomi M, Matsushima R, Thompson F, Gomez-Gil B, Christen R, Maruyama F, Kurokawa K, Hayashi T
    • 雑誌名

      Frontiers in Aquatic Microbiol.

      巻: 4 ページ: 1-14

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] Design and experimental application of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013

    • 著者名/発表者名
      Mori H, Maruyama F, Kato H, Toyoda A, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Fujiyama A, Tsuda M Kurokawa K
    • 雑誌名

      DNA Res

      巻: 21 号: 2 ページ: 217-227

    • DOI

      10.1093/dnares/dst052

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23310131, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-24770015, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-25305013, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] Whole-genome sequence of the purple photosynthetic bacterium Rhodovulum sulfidophilum strainW42013

    • 著者名/発表者名
      Masuda M, Hori K, Maruyama F, Ren S, Sugimoto S, Yamamoto N, Mori H, Yamada T, Sato S, Tabata S, Ohta H, Kurokawa K
    • 雑誌名

      Genome Announc

      巻: 1(4) 号: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00577-13

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23310131, KAKENHI-PUBLICLY-25117508, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-25305013, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of the serotype k Streptococcus mutans LJ232012

    • 著者名/発表者名
      C. Aikawa, N. Furukawa, T. Watanabe, K. Minegishi, A. Furukawa, Y. Eishi,K. Oshima, K. Kurokawa, M. Hattori,K. Nakano, *F. Maruyama, I. Nakagawa and T. Ooshima
    • 雑誌名

      J. Bacteriol

      巻: 194 ページ: 2754-2754

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22592032
  • [雑誌論文] GHOSTM: A GPU-Accelerated Homology Search Tool for Metagenomics2012

    • 著者名/発表者名
      Suzuki S, Ishida T, Kurokawa K, Akiyama Y
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 7 号: 5 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0036060

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12J08766, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23310131, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] Novel conjugative transferable multiple drug resistance plasmid pAQU1 from Photobacterium damselae subsp. damselae isolated from marine aquaculture environment2012

    • 著者名/発表者名
      L. Nonaka, F. Maruyama, M.Miyamoto, M. Miyakoshi, K. Kurokawa, M. Masuda
    • 雑誌名

      Microb.Environ

      巻: 27 ページ: 263-272

    • NAID

      10030869338

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22592032
  • [雑誌論文] Ehrlich, and Bork: Enterotypes of the human gut microbiome2011

    • 著者名/発表者名
      M. Arumugam, 18人, K. Kurokawa, 19人, MetaHIT Consortium, J. Weissenbach, S. D
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 473 ページ: 174-180

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of the Periodontogenic Bacterium Porphyromonas gingivalis TDC602011

    • 著者名/発表者名
      F. Maruyama, T. Watanabe, T. Nozawa, A. Aoki, S. Okano, Y. Shibata, K. Oshima, K. Kurokawa, M. Hattori, I. Nakagawa, Y. Abiko
    • 雑誌名

      J. Bacteriol

      巻: 193 ページ: 4259-4260

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22592032
  • [雑誌論文] CRISPR inhibition of prophage acquisition in Streptococcus pyogenes2011

    • 著者名/発表者名
      T. Nozawa, N. Furukawa, C. Aikawa, T. Watanabe, B. Haobam, K. Kurokawa, *F. Maruyama, I. Nakagawa
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 6

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22592032
  • [雑誌論文] Genomic structure of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 strain GT-S2011

    • 著者名/発表者名
      N. Tajima, S. Sato, F. Maruyama, N.Kaneko, V. Sasaki, K. Kurokawa, H.Ohta, Y. Kanesaki, H. Yoshikawa, S. Tabata, M. Ikeuchi and *N. Sato
    • 雑誌名

      DNA Res

      巻: 18 ページ: 393-399

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22592032
  • [雑誌論文] RNA polymerase trafficking in Bacillus subtilis cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa S, Oshima T, Kurokawa K, Kusuya Y, Ogasawara N.
    • 雑誌名

      J Bacteriol 192

      ページ: 5778-5787

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20241045
  • [雑誌論文] VITCOMIC : visualization tool for taxonomic compositions of microbial communities based on 16S rRNA gene sequences2010

    • 著者名/発表者名
      Mori, H., Maruyama, F., Kurokawa, K.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 11 ページ: 332-332

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of the wild-type commensal Escherichia coil strain SE15, belonging to phylogenetic group B2.2010

    • 著者名/発表者名
      H.Toh, K.Oshima, A.Toyoda, Y.Ogura, T.Ooka, (他3名) K.Kurokawa, (他3名) T.Hayashi, M.Hattori
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 192(4)

      ページ: 1165-1166

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [雑誌論文] VITCOMIC: visualization tool for taxonomic compositions of microbial communities based on 16S rRNA gene sequences2010

    • 著者名/発表者名
      H. Mori, F. Maruyama and K. Kurokawa
    • 雑誌名

      BMC Bioinfo

      巻: 11 号: 1 ページ: 332-332

    • DOI

      10.1186/1471-2105-11-332

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [雑誌論文] visualization tool for taxonomic compositions of microbial communities based on 16S rRNA gene sequences2010

    • 著者名/発表者名
      H. Mori, F. Maruyama, K. Kurokawa.VITCOMIC
    • 雑誌名

      BMC Biofinfo

      巻: 11 ページ: 332-332

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22592032
  • [雑誌論文] The complete genome sequence and comparative genome analysis of enteropathogenic E. coli 0127:H6 strain E2348/69.2009

    • 著者名/発表者名
      A.Iguchi, N.R.Thomson, Y.Ogura, D.Saunders, T.Ooka, 他, K.Kurokawa, 他, T.Hayashi, J.Parkhill, G.Frankel
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 191(1)

      ページ: 347-354

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [雑誌論文] Development of a multiplex PCR-based rapid typing method for enterohemorrhagic Escherichia 0157 strains.2009

    • 著者名/発表者名
      T.Ooka, (他3名), K.Kurokawa, Y.Ogura, (他6名), T.Hayashi
    • 雑誌名

      J.Clin.Microbiol. 47(9)

      ページ: 2888-2894

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [雑誌論文] J Bacteriol2009

    • 著者名/発表者名
      Uyar E, Kurokawa K, Yoshimura M, Ishikawa S, Ogasawara N, Oshima T.
    • 雑誌名

      Differential binding profiles of StpA in wild-type and h-ns mutant cells : a comparative analysis of cooperative partners by chromatin immunoprecipitation-microarray analysis. 191

      ページ: 2388-2391

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20241045
  • [雑誌論文] メタゲノム研究の最前線-454とメタゲノム解析-2009

    • 著者名/発表者名
      森宙史, 林哲也, 黒川顕
    • 雑誌名

      蛋白質 核酸 酵素 54

      ページ: 1264-1270

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [雑誌論文] Comparative genomics reveal the mechanism of the parallel evolution of 0157 and non-0157 enterohemorrhagic Escherichia coli.2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Ogura, T.Ooka, (他7名), K.Kurokawa, T.Tobe, M.Hattori, T.Hayashi
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 106(42)

      ページ: 17939-17944

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [雑誌論文] Systematic identification and sequence analysis of the genomic islands of the enteropathogenic Escherichia coli strain B171-8 by the combined use of Whole Genome PCR Scanning and fosmid mapping.2008

    • 著者名/発表者名
      Y.Ogura, 他, K.Kurokawa, 他, T.Ooka, 他, T.Hayashi
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 190(21)

      ページ: 6948-6960

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [雑誌論文] Complete DNA sequence and analysis of the transferable multiple drug resistance plasmids(R-plasmids) from Photobacterium damselae subsp. Piscicida isolated in Japan and USA2008

    • 著者名/発表者名
      Kim, MJ., Hirono, I., Kurokawa, K., Maki, T., Hawke, J., Kondo, H., Santos, M., Aoki, T
    • 雑誌名

      Antimicrob. Agents Chemother 52

      ページ: 606-611

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Comparative genomic analysis using microarray demonstrates strong correlation between presence of Vp-PAI and pathogenicity in Kanagawa phenomenon-positive Vibrio parahaemolyticus2008

    • 著者名/発表者名
      Izutsu, K., Kurokawa, K., Tashiro, K., Kuhara, S., Hayashi, T., Honda, T., Iida, T
    • 雑誌名

      Infect. Immun. 76(3)

      ページ: 1016-1023

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Comparative genomic analysis using microayyay demonstrates a strong correlation between the presence of the 80-kilobase pathogenicity island pathogenicity in Kanagawa phenomenon-positive Vibro parahamolyticus strains2008

    • 著者名/発表者名
      Izutsu, K・Kurokawa, K・Tashiro, K・Kuhara, S・Hayashi, T・Honda, T・Iida, T
    • 雑誌名

      Infect. Immun 76(3)

      ページ: 1016-1023

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17018026
  • [雑誌論文] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes.2007

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa K., et. al.
    • 雑誌名

      DNA Res. 14

      ページ: 169-181

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] メタゲノミクスのバイオインフォマティクス2007

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 雑誌名

      化学と生物 45

      ページ: 495-501

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Distribution of stable DnaA-binding sites on the Bacillus Subtilis genome detected using a modified ChIP-chip method2007

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, S., Ogura, Y., Yoshimura, M., Okumura, H., Cho, E., Kawai, Y., Kurokawa, K., Oshima, T., Ogasawara, N
    • 雑誌名

      DNA Res 14

      ページ: 169-181

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Vibrionaceae : versatile bacterial family with evolutionaly conserved variability.2007

    • 著者名/発表者名
      Dryselius, R., Kurokawa, K., Iida, T.
    • 雑誌名

      Res. Microbiol. (In press)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17681024
  • [雑誌論文] Vibrionaceae versatile bacterial family with evolutionary conserved variability2007

    • 著者名/発表者名
      Dryselius, R., Kurokawa, K., Iida, T.
    • 雑誌名

      Res. Microbiol 158

      ページ: 479-486

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes2007

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa K., et. al.
    • 雑誌名

      DNA Res. 14

      ページ: 169-181

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes.2007

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, K., et. al.
    • 雑誌名

      DNA Res 14

      ページ: 169-181

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17018026
  • [雑誌論文] Extensive genomic diversity and selective conservation of virulence-determinants in enterohaemorrhagic Escherichia coli strains of O157 and non-O157 serotypes2007

    • 著者名/発表者名
      Ogura, Y., Ooka Asadulghani., A., Terajima, J, Nougayrede, J-R., Kurokawa, K., Tashiro, K., Tobe, T., Nakayama, K., Kuhara, S., Oswald, E., Watanabe, H., Hayashi, T
    • 雑誌名

      DNARes 14

      ページ: 155-168

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] メタゲノミクスのバイオインフォマティクス2007

    • 著者名/発表者名
      黒川 顕
    • 雑誌名

      化学と生物 45

      ページ: 495-501

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes2007

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, K., Itoh, T., Kuwahara, T., Oshima, K., Toh, H., Toyoda, A., Takami, H., Morita, H., Sharma, VK., Srivastava, TR, Taylor, TD., Noguchi, D., Mori, H., Ogura, Y., Ehrlich, DS., Itoh, K., Takagi, T., Sakaki, Y., Hayashi, T., Hattori, M
    • 雑誌名

      Anaerobe 13

      ページ: 220-227

    • NAID

      120007121875

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] The entire organization of transcription unites on the Bacillus subtilis genome2007

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, H., Akitomi, J., Fujii, N., Kobayashi, K, Amin, M.A., Kurokawa, K., Ogasawara, N., Kanaya, S
    • 雑誌名

      BMC Genomics 8

      ページ: 197-201

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Analysis of invariant sequences in 266 complete genomes2007

    • 著者名/発表者名
      Goto, N., Kurokawa, K., Yasunaga, T
    • 雑誌名

      Gene 401

      ページ: 172-180

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Comparative genomics : genome configuration and the driving forces in the evolution of vibrios2007

    • 著者名/発表者名
      Iida, T., Kurokawa, K
    • 雑誌名

      Clin. Microbiol. Infect 13

      ページ: 48-54

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes.2007

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, K., et al.
    • 雑誌名

      DNA Res. 14

      ページ: 169-181

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17018026
  • [雑誌論文] Prediction of protein functions based on protein-protein interaction networks : A min-cut approach2006

    • 著者名/発表者名
      Altaf-Ul-Amin, M., Koma, T., Kurokawa, K., Kanaya, S
    • 雑誌名

      BMC Bioinfo 7

      ページ: 207-220

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Complexity of the genomic diversity of enterohaemorrhagic Escherichia coli O157 revealed by the combinational use of the O157 Sakai oligo DNA microarray and the Whole Genome PCR Scanning2006

    • 著者名/発表者名
      Ogura, Y., Kurokawa, K., Ooka, T., Tashiro, K., Tobe, T., Ohnishi, M., Nakayama, K., Morimoto, T., Terajima, J., Watanabe, H., Kuhara, S., Hayashi, T
    • 雑誌名

      DNA Res 13

      ページ: 3-14

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Bioinformatics tool for genomic era ; A step towards the in silico experiments - focused on molecular cloning2006

    • 著者名/発表者名
      Ohyama, A., Kurokawa, K., Enai, K., Saitoh, H., Kanaya, S., Altaf-Ul-Amin, M., Ogasawara, N
    • 雑誌名

      J. Comp. Aid. Chem 7

      ページ: 102-115

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Elucidating conservation of genes in multiple genomes based on graphs con figured by bidirectional best-hit relationships2006

    • 著者名/発表者名
      Maeno, H., Altaf-Ul-Amin, M., Shinbo, Y., Kurokawa, K., Ogasawara, N., Kanaya, S
    • 雑誌名

      Trans. Bioinformat 47

      ページ: 1-11

    • NAID

      110004862622

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Complexity of the genomic diversity in enterhemorrhagic Escherichia coli 0157 revealed bye the combinational use of the 0157 Sakai.2006

    • 著者名/発表者名
      Ogura, Y., Kurokawa, K., et al.
    • 雑誌名

      DNA Res. 13

      ページ: 3-14

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17681024
  • [雑誌論文] DPClus : A density-periphery based graph clustering software mainly focused on detection of protein complexes in interaction networks2006

    • 著者名/発表者名
      Altaf-Ul-Amin, M., Tuji, H., Kurokawa, K., Asahi, H., Shnbo, Y., Kanaya, S
    • 雑誌名

      The Biology of Vibrios (ASM press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Comparison of protein complexes predicted from PPI networks by DPClus and Newman clustering algorithms2006

    • 著者名/発表者名
      Tuji, H., Altaf-Ul-Amin, M., Arita, M., Nishio, H., Shinbo, Y., Kurokawa, K., Kanaya, S
    • 雑誌名

      Trans. Bioinformat 47

      ページ: 31-41

    • NAID

      110004862625

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Sperical SOM and arrangement of neurons using herix on sphere2006

    • 著者名/発表者名
      Nishio, H., Altaf-Ul-Amin, M., Kurokawa, K., Kanaya, S
    • 雑誌名

      IPSJ Transactions on Mathematical Modeling and Its Applications 47, 14

      ページ: 56-60

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] PimE is a polyprenol-phosphate-mannose-dependent mannosyltransferase that transfers the fifth mannose of phosphatidylinositol mannoside in Mycobacteria2006

    • 著者名/発表者名
      Morita, Y., Sena, C., Waller, R., Kurokawa, K., Semee, M., Nakatani, F., Haites, R., Billman-Jacobe, H., McConville, M., Maeda, Y., Kinoshita, T
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 281

      ページ: 25143-25155

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Escherichia coli histone-like protein H-NS preferentially binds to horizontally acquired DNA in association with RNA polymerase2006

    • 著者名/発表者名
      Oshima, T., Ishikawa, S., Kurokawa, K., Aiba, H., Ogasawara, N
    • 雑誌名

      J. Comp. Aid. Chem 7

      ページ: 150-156

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [雑誌論文] Comparative genomics : genome configuration and the driving forces in the evolution of vibrios.2006

    • 著者名/発表者名
      Iida, T., Kurokawa.K.
    • 雑誌名

      Biology of Vibrios (In press)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17018026
  • [産業財産権] 情報処理システム、情報処理方法、及びプログラム2017

    • 発明者名
      黒川顕、東光一、森宙史
    • 権利者名
      黒川顕、東光一、森宙史
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2017
    • 外国
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-26106004
  • [産業財産権] 情報処理システム、情報処理方法、及びプログラム2017

    • 発明者名
      黒川顕、東光一、森宙史
    • 権利者名
      大学共同利用機関法人情報・システム研究機構
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2017-012340
    • 出願年月日
      2017-01-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [産業財産権] 微生物の識別方法、及び該方法に使用するプライマー並びに識別キット2006

    • 発明者名
      大岡唯祐, 林哲也, 小椋義俊, 中山恵介, 黒川顕, 寺嶋淳, 渡邊治雄
    • 権利者名
      大岡唯祐, 林哲也
    • 産業財産権番号
      2006-155279
    • 出願年月日
      2006-06-02
    • 取得年月日
      2006-06-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [産業財産権] 微生物の識別方法、及び該方法に使用するプライマー並びに識別キット2006

    • 発明者名
      大岡 唯祐, 林 哲也, 小椋 義俊, 中山 恵介, 黒川 顕, 寺嶋 淳, 渡辺 治雄
    • 権利者名
      大岡 唯祐, 林 哲也
    • 産業財産権番号
      2006-155279
    • 取得年月日
      2006-06-13
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [産業財産権] 微生物の識別方法、及び該方法に使用するプライマー並びに識別キット2006

    • 発明者名
      大岡 唯祐, 林 哲也, 小椋 義俊, 中山 恵介, 黒川 顕, 寺嶋 淳, 渡辺 治雄
    • 権利者名
      大岡 唯祐, 林 哲也
    • 産業財産権番号
      2006-155279
    • 出願年月日
      2006-06-02
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] 神経損傷により惹起された炎症関連細胞の時空間的解析2023

    • 著者名/発表者名
      永田 健一 、杏夕采、元岡 大祐、東 光一、黒川 顕、木山 博資
    • 学会等名
      第128回日本解剖学会総会・全国学術集会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 微生物統合データベースMicrobeDB. jpを用いたマイクロバイオーム研究への応用2022

    • 著者名/発表者名
      森宙史, 藤澤貴智, 西出浩世, 矢口貴志, 高橋弘喜, 中川善一, 山田拓司, 内山郁夫, 中村保一, 黒川顕
    • 学会等名
      第16回日本ゲノム微生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [学会発表] 微生物統合データベース MicrobeDB. jp version 3とマイクロバイオーム解析2021

    • 著者名/発表者名
      森宙史、藤澤貴智、西出浩世、矢口貴志、高橋弘喜、中川善一、山田拓司、内山郁夫、中村保一、黒川顕
    • 学会等名
      第15回日本ゲノム微生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [学会発表] VITCOMIC2 and MicrobeDB. jp : Analyzing and comparing microbial community sequencing data2019

    • 著者名/発表者名
      Mori H, Kurokawa K.
    • 学会等名
      Frontiers of Genome Science 2019
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [学会発表] VITCOMIC2 : Visualization and analysis tool for the phylogenetic composition of microbial communities based on 16S rRNA gene sequences2018

    • 著者名/発表者名
      Mori H, Kurokawa K.
    • 学会等名
      ASM Microbe 2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [学会発表] Integrated database for microbe “MicrobeDB. jp”2018

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa K
    • 学会等名
      JSME2018&10thASME
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [学会発表] VITCOMIC2 : Visualization tool for the phylogenetic composition of microbial communities based on 16S rRNA gene amplicons and metagenomic shotgun sequencing2017

    • 著者名/発表者名
      Mori H, Maruyama T, Yano M, Yamada T, Kurokawa K.
    • 学会等名
      GIW 2017
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [学会発表] 大量データに対応した微生物群集の系統組成推定・描画ツールVITCOMIC22017

    • 著者名/発表者名
      森宙史, 丸山貴之, 矢野雅大, 黒川顕
    • 学会等名
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [学会発表] VITCOMIC2 : visualization of the phylogenetic composition of microbial communities based on 16S rRNA gene amplicons and metagenomic shotgun sequencing2017

    • 著者名/発表者名
      Mori H, Maruyama T, Yano M, Yamada T, Kurokawa K.
    • 学会等名
      ProkaGenomics 2017
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [学会発表] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016

    • 著者名/発表者名
      渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-03-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] 環境試料RNAの大量シーケンシングと経時解析による有用遺伝子の大規模検索2016

    • 著者名/発表者名
      中村祐哉、森宙史、黒川顕、中島信孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2016-03-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] 微生物統合データベースを高度化する微生物環境オントロジーと解析アプリケーションの開発2016

    • 著者名/発表者名
      鈴木真也、山本希、森宙史、黒川顕
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-03-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016

    • 著者名/発表者名
      加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-03-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] 微生物統合データベー MicrobeDB.jpの検索システムの高度化と新解析パイプライン2016

    • 著者名/発表者名
      森宙史、藤澤貴智、千葉啓和、山本希、内山郁夫、菅原秀明、中村保一、黒川顕、MicrobeDB.jpプロジェクトチーム
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-03-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] 冥王代生命学の創成2016

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2016-03-04
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-26106001
  • [学会発表] 大規模オミックスデータの可視化・解析ツール「FuncTree」の開発2016

    • 著者名/発表者名
      山手雄太、森宙史、黒川顕、山田拓司
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-03-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] 土壌微生物のノトバイオロジー2016

    • 著者名/発表者名
      加藤広海、森宙史、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2016-03-27
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] The mechanisms of Copper acquisition and detoxification in Aspergillus fumigatus.2015

    • 著者名/発表者名
      Kusuya Y, Kurokawa K, Takahashi H.
    • 学会等名
      ISHAM 2015
    • 発表場所
      Melbourne, Australia
    • 年月日
      2015-05-04
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] R-Spondin1 promotes Paneth cell growth, maintains intestinal microbial ecology, and ameliorates graft-versus-host disease2015

    • 著者名/発表者名
      Hayase E, Hashimoto D, Nakamura K, Ogura Y, Hayashi T, Kurokawa K, Ayabe T, and Teshima T.
    • 学会等名
      57th ASH Annual Meeting
    • 発表場所
      Orlando, FL, USA
    • 年月日
      2015-12-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] Asian Microbiome Project: 次世代シーケンサーを用いたアジア人腸内細菌叢のプロファイル化2014

    • 著者名/発表者名
      東佳那子、百田理恵、山本麻寿紗、林 哲也、小椋義俊、黒川 顕、豊田敦、加藤和人、AMP study group、園元謙二、渡辺幸一、Lee Yuan Kun、中山二郎
    • 学会等名
      日本生物工学会 第21回九州支部熊本大会
    • 発表場所
      熊本大学
    • 年月日
      2014-12-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] 土壌微生物の移植メタゲノム2014

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回 日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京農業大学 世田谷キャンパス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] メタゲノム解析の現状と将来2013

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      社団法人企業研究会CAMMフォーラム
    • 発表場所
      東京
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] Deciphering ancient ecosystems with environmental genomics and “Earth-Life DB”2013

    • 著者名/発表者名
      Ken Kurokawa
    • 学会等名
      The 1st ELSI International Symposium
    • 発表場所
      Tokyo
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] Time series metagenomic analysis of soil microbial community2013

    • 著者名/発表者名
      M. Tsuda and K. Kurokawa
    • 学会等名
      International Symposium on Genome Science "Expanding Frontiers of Genome Science"
    • 発表場所
      Tokyo
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] 微生物統合データベース「MicrobeDB.jp」2013

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンターシンポジウム「トーゴーの日シンポジウム2013 -ここまできたライフサイエンスデータベースの統合-」
    • 発表場所
      東京
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] Comparative analysis of H-NS binding profiles of three E.coli strains suggests H-NS binding contributes to sequence diversification of E.coli genome2012

    • 著者名/発表者名
      Higashi K, Oshima T, Kurokawa K.
    • 学会等名
      ASM the 112th General Meeting, San Francisco
    • 発表場所
      California (USA)
    • 年月日
      2012-06-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23310131
  • [学会発表] 環境メタゲノミクス2012

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都(招待講演)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] 環境メタゲノミクス2012

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年大会
    • 発表場所
      京都
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] メタゲノミクスの現状と未来2012

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      情報・システム研究機構シンポジウム2012「生命科学のビッグデータ革命」
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2012-11-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] メタゲノミクスの現状と未来2012

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      情報・システム研究機構シンポジウム2012「生命科学のビッグデータ革命」
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2012-11-09
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] Development of an integrated analysis system for metagenomics and a global microbial database MicrobeDB.jp2012

    • 著者名/発表者名
      K. Kurokawa
    • 学会等名
      第28回日本微生物生態学会
    • 発表場所
      豊橋
    • 年月日
      2012-09-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] 環境メタゲノミクス2012

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会シンポジウム
    • 発表場所
      京都(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] Development of an integrated analysis system for metagenomics and its applications for soil metagenome analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, K.
    • 学会等名
      BiWO2011
    • 発表場所
      東京(招待講演)
    • 年月日
      2012-01-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] Metagenomic Analysis of Microbial Community in Soil Contaminated with Aromatic Pollutants2012

    • 著者名/発表者名
      M. Tsuda, 5 人, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, A. Fujiyama, and K. Kurokawa
    • 学会等名
      Japan-Finland Biotechnology Symposium2012
    • 発表場所
      Sendai
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] Development of an integrated analysis system for metagenomics and its applications for soil metagenome analysis2012

    • 著者名/発表者名
      K.Kurokawa
    • 学会等名
      BiWO2011
    • 発表場所
      東京(招待講演)
    • 年月日
      2012-01-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] 生態系の理解に向けたゲノム情報の解析と活用2011

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      農業環境技術研究所公開セミナー
    • 発表場所
      つくば(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] 大島拓核様体タンパク質H-NS結合位置の大腸菌株間比較解析2011

    • 著者名/発表者名
      東光一, 戸邉亨, 鈴木穣, 菅野純夫, 石川周, 小笠原直毅, 黒川顕
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2011-03-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20241045
  • [学会発表] 生態系の理解に向けたゲノム情報の解析と活用2011

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      農業環境技術研究所公開セミナー
    • 発表場所
      つくば(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23310131
  • [学会発表] 新型シーケンサーによるメタゲノム解析2011

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      第63回生物工学会大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2011-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] 新型シーケンサーによるメタゲノム解析2011

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      第63回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      京都(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] ゲノムからメタゲノムへ2011

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      CBI/JSBi2011合同大会
    • 発表場所
      神戸(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] ゲノムからメタゲノムへ2011

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      CBI/JSBi2011合同大会
    • 発表場所
      神戸(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] 新型シーケンサーによるメタゲノム解析2011

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      第63回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      東京(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] Hydrogen evolution of Vibrio tritonius sp.nov.2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Matsumura, S.Nakagawa, F.Maruyama, Y.Ogura, T.Hayashi, K.Kurokawa, T.Sawabe
    • 学会等名
      VIBRIO 2011
    • 発表場所
      Santiago de Compostela-Spain
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] ゲノムからメタゲノムへ2010

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      第12回日本進化学会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-08-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [学会発表] ゲノムからメタゲノムへ2010

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      日本進化学会
    • 発表場所
      東京(招待講演)
    • 年月日
      2010-08-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] ゲノムからメタゲノムへ2010

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      日本ブドウ球菌研究会
    • 発表場所
      東京(招待講演)
    • 年月日
      2010-07-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] ゲノムからメタゲノムへ2010

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      第55回日本ブドウ球菌研究会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-07-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [学会発表] Fluctuation of gene pools of soil microbiota induced by contamination with aromatic hydrocarbons2010

    • 著者名/発表者名
      H. Kato, 2 人, Y. Ohtsubo, 5 人, Y. Nagata, A. Fujiyama, K. Kurokawa and M. Tsuda
    • 学会等名
      13th International Society for Microbial Ecology Conference
    • 発表場所
      Seattle, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [学会発表] ゲノムからメタゲノムへ2010

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      千里ライフサイエンスセミナー
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-10-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [学会発表] ゲノム情報立脚型社会2010

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      日本生体医工学会バイオメクフォーラム
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-12-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [学会発表] ゲノム情報立脚型社会2010

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      日本生体医工学会バイオメクフォーラム
    • 発表場所
      大阪(招待講演)
    • 年月日
      2010-12-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] ゲノムからメタゲノムへ2010

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      千里ライフサイエンスセミナー
    • 発表場所
      大阪(招待講演)
    • 年月日
      2010-10-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [学会発表] Metagenomics analysis using Next-generation sequencing technology2009

    • 著者名/発表者名
      K.Kurokawa
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会シンポジウム
    • 発表場所
      横浜
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [学会発表] メタゲノムインフォマティクス2009

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      日本農芸化学会2009年大会シンポジウム
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [学会発表] 次世代シークエンサーによるメタゲノム解析の可能性2008

    • 著者名/発表者名
      黒川顕
    • 学会等名
      第288回CBI学会研究講演会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-08-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [学会発表] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in Human intestine.2008

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, K., et al.
    • 学会等名
      The Biology of Genomes
    • 発表場所
      CSHL アメリカ ニューヨーク
    • 年月日
      2008-05-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20310116
  • [学会発表] メタゲノムインフォマティクス2007

    • 著者名/発表者名
      黒川 顕
    • 学会等名
      第2回放射線防御研究センターシンポジウム
    • 発表場所
      千葉
    • 年月日
      2007-12-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] ヒト腸内フローラのメタゲノム解析2007

    • 著者名/発表者名
      黒川 顕
    • 学会等名
      日本乳酸菌学会
    • 発表場所
      相模原
    • 年月日
      2007-07-05
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] Metagenomics of microbial community in human intestine2007

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, K., et. al.
    • 学会等名
      The Biology of Genomes
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Laboratory, NY, U.S.A
    • 年月日
      2007-05-07
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] ゲノム解析からメタゲノム解析へ2007

    • 著者名/発表者名
      黒川 顕
    • 学会等名
      第3回アグリバイオインフォマティクスシンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-03-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes2007

    • 著者名/発表者名
      Kuwahara, T., Kurokawa, K., Itoh, T., Oshima, K., Toh, H., Toyoda, A., Takami, H., Morita, H., Sharma, V. K., Srivastava, T.P., Taylor, T. D., Noguchi, H., Mori, H., Ogura, Y., Ehrlich, D. S., Itoh, K., Takagi, T., Sakaki, Y., Hayashi, T., Hattori, M
    • 学会等名
      The 7th International Workshop on Advanced Genomics
    • 発表場所
      Tpkyo
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] ヒト腸内フローラのメタゲノム解析2007

    • 著者名/発表者名
      黒川 顕
    • 学会等名
      新化学発展協会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-10-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] Metagenomics of microbial community in human intestine2007

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, K., Oshima, K., Toh, H., Toyoda, A., Itoh, T., Noguchi, H., Yamakura, K., Itoh, T., Kuwahara, H., Morita, H., Takami, T., Hayashi, G., Hattori, M
    • 学会等名
      The Biology of Genomes
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Laboratory, NY, U.S.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] Metagenomics of microbial community in human intestine2007

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, K., et. al.
    • 学会等名
      The Biology of Genomes
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Laboratory,NY,U.S.A
    • 年月日
      2007-05-07
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] Metagenomics of microbial community in human intestine2006

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa, K., Oshima, K., Toh, H., Toyoda, A., Itoh, T., Noguchi, H., Yamakura, K., Itoh, K., Kuwahara, T., Morita, H., Takami, H.,Hayashi', T., Hattori., T
    • 学会等名
      The Biology of Genomes
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Laboratory, NY,U.S.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] Comparative genome analysis of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli strains using the whole genome PCR scanning and the O157 oligoDNA microarray2006

    • 著者名/発表者名
      Ogura, Y., Ooka, K., Kurokawa, K., Terajima, J., Nakayama, K., Watanabe, H., Tobe, T., Hayashi., T
    • 学会等名
      VTEC 2006 Melbourne(6th International Symposium on Shiga Toxin(Verocyt otoxin)-Producing Escherichia coli Infections)
    • 発表場所
      Melbourne
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] Metagenomics of microbial community in human intestine2006

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa K., et. al.
    • 学会等名
      The Biology of Genomes
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Laboratory,NY,U.S
    • 年月日
      2006-05-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] The mechanism of genomic diversification in Enterohemorrhagic E. coli O157 : H72006

    • 著者名/発表者名
      Ooka, T, Ogura, Y., Nakayama, K., Kurokawa, K., Ohnishi, M., Terajima, J., Watanabe, H., Hayashi., T
    • 学会等名
      VTEC 2006 Melbourne(6th International Symposium on Shiga Toxin(Verocyt otoxin) -Producing Escherichia coli Infections)
    • 発表場所
      October, Melbourne.
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18310132
  • [学会発表] 微生物統合データベース「MicrobeDB.jp」

    • 著者名/発表者名
      森宙史、藤澤貴智、千葉啓、山本希、鈴木真也、菅原秀明、内山郁夫、中村保一、黒川顕
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会2014
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] 微生物統合データベースの超高度化推進のための微生物の生息環境オントロジーと 解析アプリケーションの開発

    • 著者名/発表者名
      鈴木真也、山本希、森宙史、黒川顕
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] 細菌群集構造可視化ツール「VITCOMIC2」

    • 著者名/発表者名
      森宙史、丸山貴之、矢野雅大、山田拓司、黒川 顕
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] Transplantation of soil microbiota: establishment process of microbial community in sterilized soil

    • 著者名/発表者名
      Masataka Tsuda, Hiromi Kato, Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Atsushi Toyoda, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Asao Fujiyama, Ken Kurokawa
    • 学会等名
      International Symposium on Genome Science 2015 "Expanding Frontiers of Genome Science II"
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2015-01-20 – 2015-01-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] 土壌における微生物コミュニティの形成過程について

    • 著者名/発表者名
      加藤広海、森宙史、丸山史人、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会2014
    • 発表場所
      浜松
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] VITCOMIC2 analysis system: visualization tool for taxonomic composition of microbial communities

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Mori, Takayuki Maruyama, Masahiro Yano, Takuji Yamada, Ken Kurokawa
    • 学会等名
      International Symposium on Genome Science 2015 "Expanding Frontiers of Genome Science II"
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2015-01-20 – 2015-01-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [学会発表] 移植された土壌微生物の定着過程とその安定性について

    • 著者名/発表者名
      加藤広海、森宙史、丸山史人、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • 1.  平川 英樹 (80372746)
    共同の研究課題数: 5件
    共同の研究成果数: 0件
  • 2.  林 哲也 (10173014)
    共同の研究課題数: 5件
    共同の研究成果数: 23件
  • 3.  小椋 義俊 (40363585)
    共同の研究課題数: 5件
    共同の研究成果数: 18件
  • 4.  鈴木 穣 (40323646)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 2件
  • 5.  森 宙史 (40610837)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 21件
  • 6.  久原 哲 (00153320)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 1件
  • 7.  伊藤 武彦 (90501106)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 3件
  • 8.  小笠原 直毅 (10110553)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 3件
  • 9.  加藤 和人 (10202011)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 6件
  • 10.  豊田 敦 (10267495)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 4件
  • 11.  森下 真一 (90292854)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  中村 保一 (60370920)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 5件
  • 13.  岩崎 渉 (50545019)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  瀬々 潤 (40361539)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 15.  高橋 弘喜 (60548460)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 3件
  • 16.  浅井 潔 (30356357)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 17.  笠原 雅弘 (60376605)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 2件
  • 18.  野口 英樹 (50333349)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 19.  浜田 道昭 (00596538)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 20.  津田 雅孝 (90172022)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 12件
  • 21.  丸山 史人 (30423122)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 13件
  • 22.  鎌形 洋一 (70356814)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 23.  戎崎 俊一 (10183021)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 24.  大岡 唯祐 (50363594)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 9件
  • 25.  増井 徹 (50150082)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 26.  内山 郁夫 (90243089)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 27.  大島 拓 (50346318)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 4件
  • 28.  小原 雄治 (70135292)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 29.  菅野 純夫 (60162848)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 30.  辻 省次 (70150612)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 31.  井ノ上 逸朗 (00192500)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 32.  榊原 康文 (10287427)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 33.  山縣 然太朗 (10210337)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 34.  武藤 香織 (50345766)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 35.  位田 隆一 (40127543)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 1件
  • 36.  高木 利久 (30110836)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 37.  藤山 秋佐夫 (60142311)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 3件
  • 38.  服部 正平 (70175537)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 2件
  • 39.  徳永 勝士 (40163977)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 40.  桑野 良三 (20111734)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 41.  永田 裕二 (30237531)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 7件
  • 42.  大坪 嘉行 (40342761)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 7件
  • 43.  中川 一路 (70294113)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 4件
  • 44.  川嶋 実苗 (00396706)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 2件
  • 45.  山田 拓司 (10437262)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 5件
  • 46.  フリス マーティン (40462832)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 47.  丸山 茂徳 (50111737)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 48.  クリーヴス ヘンダーソン (60723608)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 49.  磯崎 行雄 (90144914)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 50.  青野 真士 (00391839)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 51.  原 正彦 (50181003)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 52.  澤木 佑介 (00635063)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 53.  戸邉 亨 (70207596)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 54.  饗場 浩文 (60211687)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 55.  黒木 陽子 (10344037)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 56.  山本 健 (60274528)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 57.  田畑 哲之 (70197549)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 58.  矢田 哲士 (10322728)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 59.  大橋 順 (80301141)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 60.  松岡 聡 (20221583)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 61.  中村 建介 (20212095)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 62.  金谷 重彦 (90224584)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 63.  桜井 敦朗 (90431759)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 64.  三室 仁美 (80396887)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 65.  中山 恵介 (10347057)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 66.  桑原 知巳 (60263810)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 67.  妹尾 啓史 (40206652)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 68.  高見 英人 (70359165)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 69.  新藏 礼子 (50362471)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 70.  三井 純 (70579862)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 71.  時野 隆至 (40202197)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 72.  児玉 聡 (80372366)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 73.  瀬戸山 晃一 (00379075)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 74.  小門 穂 (20706650)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 75.  大橋 範子 (50739430)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 76.  中岡 博史 (70611193)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 77.  後藤 恭宏 (20558358)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 78.  中村 佳司 (60706216)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 79.  奥野 未来 (30814462)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 80.  仲瀬 裕志 (60362498)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 81.  佐々木 泰史 (70322328)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 82.  井戸川 雅史 (00404749)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 83.  丹下 正一朗 (40571211)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 84.  小笠原 理 (00435512)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 85.  谷澤 靖洋 (90836511)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 86.  近藤 伸二 (30415161)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 87.  木立 尚孝 (80415778)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 88.  梶谷 嶺 (40756706)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 89.  田代 康介 (00192170)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 90.  鈴木 拓 (20381254)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 91.  能正 勝彦 (10597339)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 92.  甲斐 正広 (80260777)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 93.  玉木 秀幸 (00421842)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 94.  西原 秀典 (10450727)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 95.  鈴木 志野 (10557002)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 96.  柿澤 茂行 (10588669)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 97.  大塚 重人 (10313074)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 98.  磯部 一夫 (30621833)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 99.  金井 昭夫 (60260329)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 100.  佐藤 友彦 (80714831)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 101.  武川 睦寛 (30322332)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 102.  鍋倉 淳一 (50237583)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 103.  醍醐 弥太郎 (30345029)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 104.  中西 真 (40217774)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 105.  阿形 清和 (70167831)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 106.  井上 純一郎 (70176428)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 107.  中村 卓郎 (00180373)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 108.  高田 昌彦 (00236233)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 109.  清宮 啓之 (50280623)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 110.  根本 知己 (50291084)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 111.  上野 直人 (40221105)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 112.  村上 善則 (30182108)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 113.  若井 建志 (50270989)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 114.  村山 繁雄 (50183653)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 115.  山梨 裕司 (40202387)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 116.  西村 祐貴 (20783012)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 117.  中谷 明弘 (60301149)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 118.  波江野 洋 (70706754)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 119.  島村 徹平 (00623943)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 120.  熊谷 雄太郎 (00528408)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 121.  栗山 真理子
    共同の研究課題数: 1件
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  • 122.  安西 祐一郎
    共同の研究課題数: 1件
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  • 123.  岡田 清孝
    共同の研究課題数: 1件
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  • 124.  榊 佳之
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 125.  高久 史麿
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 126.  豊島 久真男
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 127.  中村 桂子
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 128.  堀田 凱樹
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 129.  米澤 明憲
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 130.  吉川 寛
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 131.  吉田 光昭
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 132.  猪子 英俊
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 133.  戸田 達史
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 134.  稲澤 譲治
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 135.  五條掘 孝
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 136.  漆原 秀子
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 137.  武田 洋幸
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 138.  城石 俊彦
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 139.  伊藤 隆司
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 140.  佐藤 矩行
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 141.  松田 秀雄
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 142.  五斗 進
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 143.  瀬川 高弘
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 144.  大森 聡一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 145.  中村 肇伸
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 146.  石川 周
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 147.  新海 創也
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 148.  渡辺 博文
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 149.  小林 牧
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 150.  戸邊 享
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 151.  澤辺 智雄
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 152.  堀井 新
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 153.  高橋 奈央
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 154.  水谷 紗弥佳
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 155.  濱さき 恒二
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 156.  成田 一衛
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 157.  後藤 眞
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 158.  新蔵 礼子
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